单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27747 篇文献，本页显示第 8181 - 8200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8181 | 2024-09-30 |
Spatial Transcriptomics: Technical Aspects of Recent Developments and Their Applications in Neuroscience and Cancer Research
2023-06, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202206939
PMID:37026425
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综述 | 本文综述了空间转录组学的最新进展及其在神经科学和癌症研究中的应用 | 空间转录组学从传统生物学研究转向“原位”生物学，提供了转录组规模的空间信息 | NA | 探讨空间转录组学的技术进展及其在生物医学领域的应用 | 空间转录组学技术及其在神经科学和癌症研究中的应用 | 生物信息学 | 癌症 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 8182 | 2024-09-30 |
Identification of potential resistance mechanisms and therapeutic targets for the relapse of BCMA CAR-T therapy in relapsed/refractory multiple myeloma through single-cell sequencing
2023-May-08, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-023-00402-5
PMID:37158921
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了BCMA CAR-T治疗后复发/难治性多发性骨髓瘤患者的骨髓免疫微环境，识别潜在的耐药机制和治疗靶点 | 本研究首次通过单细胞RNA测序深入分析了BCMA CAR-T治疗后复发的耐药机制，并探索了新的治疗靶点 | 研究结果需要进一步的实验验证 | 深入分析BCMA CAR-T治疗后复发的耐药机制，并探索新的治疗靶点 | 复发/难治性多发性骨髓瘤患者的骨髓免疫微环境 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA数据 | 复发/难治性多发性骨髓瘤患者的骨髓CD45+细胞 |
| 8183 | 2024-09-30 |
Novel Human Meningioma Organoids Recapitulate the Aggressiveness of the Initiating Cell Subpopulations Identified by ScRNA-Seq
2023-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202205525
PMID:36994665
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术识别出高级别脑膜瘤中的独特起始细胞亚群，并通过建立患者来源的脑膜瘤类器官模型，验证了该亚群的侵袭性，并发现了一种潜在的治疗药物 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别出高级别脑膜瘤中的独特起始细胞亚群，并建立了患者来源的脑膜瘤类器官模型来验证其侵袭性 | NA | 揭示高级别脑膜瘤恶性进展和复发的机制，并寻找新的治疗靶点 | 高级别脑膜瘤中的独特起始细胞亚群及其在肿瘤进展和复发中的作用 | 数字病理学 | 脑膜瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 8184 | 2024-09-30 |
Enabling Single-Cell Drug Response Annotations from Bulk RNA-Seq Using SCAD
2023-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202204113
PMID:36762572
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研究论文 | 本文提出了一种转移学习模型，利用批量RNA测序数据推断单细胞水平的药物敏感性 | 本文首次提出了一种转移学习模型，通过学习大量公共数据集中的细胞系群体转录组谱和药物基因组信息，推断单细胞水平的药物疗效 | 本文的局限性在于依赖于预临床细胞系数据，可能无法完全反映临床实际情况 | 研究目的是通过单细胞水平的药物敏感性推断，理解抗癌反应异质性和药物抗性的机制 | 研究对象是单细胞和批量RNA测序数据中的药物敏感性 | 生物信息学 | 癌症 | RNA测序 | 转移学习模型 | 基因表达数据 | 大量公共数据集中的细胞系群体 |
| 8185 | 2024-09-30 |
Complex Analysis of Single-Cell RNA Sequencing Data
2023-Feb, Biochemistry. Biokhimiia
DOI:10.1134/S0006297923020074
PMID:37072324
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据分析的不同方法，讨论了生物信息学工具的优缺点，并提供了成功应用的示例和改进建议 | 强调了创建新的多组学协议以更全面地理解单个细胞的必要性 | 讨论了现有生物信息学工具的优缺点 | 探讨单细胞RNA测序数据分析的方法及其在临床和研究中的应用 | 单细胞RNA测序数据及其在疾病分子机制分析中的应用 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 8186 | 2024-09-30 |
A marker gene-based method for identifying the cell-type of origin from single-cell RNA sequencing data
2023, MethodsX
IF:1.6Q2
DOI:10.1016/j.mex.2023.102196
PMID:37424758
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研究论文 | 本文介绍了一种基于标记基因的单细胞RNA测序数据细胞类型识别方法Sargent | Sargent是一种无需转换和聚类的单细胞注释算法，能够快速准确地识别细胞类型起源，并保留了基于聚类的手动注释的灵活性和生物可解释性 | NA | 开发一种能够快速准确识别单细胞RNA测序数据中细胞类型起源的方法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括模拟数据和来自人体器官（如PBMC、心脏、肾脏和肺）的单细胞RNA测序数据 |
| 8187 | 2024-09-30 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Longevity Immune Remodeling Features Shared by Centenarians and Their Offspring
2022-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202204849
PMID:36354175
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组分析揭示了百岁老人及其后代共享的长寿免疫重塑特征 | 首次通过单细胞转录组分析揭示了百岁老人及其后代在免疫细胞群和功能上的共同特征 | 样本量较小，可能影响结果的普遍性 | 探究百岁老人及其后代共享的长寿相关免疫特征 | 百岁老人、百岁老人的后代及其配偶或邻居的外周血单核细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 共22个样本，包括7个百岁老人、6个百岁老人的后代和9个对照组 |
| 8188 | 2024-09-30 |
SOTIP is a versatile method for microenvironment modeling with spatial omics data
2022-11-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-34867-5
PMID:36443314
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SOTIP的多任务分析方法，用于整合空间组学数据中的微环境及其相互关系，并进行空间异质性量化、空间域识别等下游任务 | SOTIP方法创新地将微环境及其相互关系整合到一个统一的图中，能够进行多种下游分析任务，并揭示了空间异质性模式 | NA | 开发一种能够整合空间组学数据中微环境及其相互关系的多任务分析方法 | 小鼠大脑皮层和人类三阴性乳腺癌的空间转录组和蛋白质组数据 | 空间组学 | 三阴性乳腺癌 | 空间组学 | 图模型 | 空间组学数据 | 两个独立的小鼠大脑皮层空间转录组数据集和人类三阴性乳腺癌空间蛋白质组数据集 |
| 8189 | 2024-09-30 |
Single-Nucleus RNA Sequencing and Spatial Transcriptomics Reveal the Immunological Microenvironment of Cervical Squamous Cell Carcinoma
2022-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202203040
PMID:35986392
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研究论文 | 使用单核RNA测序和空间转录组学技术研究宫颈鳞状细胞癌的免疫微环境 | 首次结合单核RNA测序和空间转录组学技术，揭示了宫颈鳞状细胞癌中免疫抑制基因的表达模式及特定细胞群的分布特征 | 研究样本量较小，且仅限于宫颈鳞状细胞癌，结果可能不适用于其他类型的癌症 | 探讨宫颈鳞状细胞癌的免疫微环境，为晚期宫颈癌的治疗提供新思路 | 宫颈鳞状细胞癌的免疫微环境及癌症相关成纤维细胞的功能 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单核RNA测序（snRNA-seq）和空间增强分辨率组学测序（Stereo-seq） | NA | 基因表达数据 | 少量样本，具体数量未明确提及 |
| 8190 | 2024-09-30 |
Cell-type modeling in spatial transcriptomics data elucidates spatially variable colocalization and communication between cell-types in mouse brain
2022-01-19, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2021.09.004
PMID:34626538
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研究论文 | 本文开发了一种神经网络模型STANN，用于空间转录组数据中的细胞类型建模，并揭示了小鼠大脑中细胞类型的空间变异共定位和通信机制 | 本文提出了STANN模型，解决了单细胞空间转录组数据与单细胞RNA测序数据整合的难题，揭示了小鼠嗅球中细胞类型的空间变异特征 | NA | 研究单细胞空间转录组数据中的细胞类型建模及其在复杂组织中的应用 | 小鼠嗅球中的细胞类型及其空间变异特征 | 生物信息学 | NA | 单细胞空间转录组技术 | 神经网络模型 | 转录组数据 | 小鼠嗅球样本 |
| 8191 | 2024-09-30 |
Transcriptional census of epithelial-mesenchymal plasticity in cancer
2022-Jan-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abi7640
PMID:34985957
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序数据，研究了八种不同癌症类型中上皮-间质可塑性的转录特征 | 通过大规模单细胞RNA测序数据，揭示了肿瘤内上皮-间质可塑性的表达模式及其多样性 | NA | 研究上皮-间质可塑性在癌症中的分子特征及其对治疗和免疫逃逸的影响 | 八种不同癌症类型的266个肿瘤样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 266个肿瘤样本 |
| 8192 | 2024-09-30 |
Probing transient memory of cellular states using single-cell lineages
2022, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2022.1050516
PMID:36824587
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综述 | 本文综述了利用单细胞谱系研究细胞状态瞬时记忆的最新进展 | 提出了一种基于波动的方法，通过时间点测量揭示细胞状态转换，特别适用于导致细胞死亡或不可逆生理变化的测量 | NA | 探讨细胞状态瞬时遗传性的建模方法及其在不同生物系统中的应用 | 单细胞在不同状态间的动态转换 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8193 | 2024-09-30 |
Recent Technical Advances in Accelerating the Clinical Translation of Small Animal Brain Imaging: Hybrid Imaging, Deep Learning, and Transcriptomics
2022, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2022.771982
PMID:35402436
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综述 | 本文综述了加速小动物脑成像临床转化的最新技术进展，重点介绍了混合成像、深度学习和转录组学 | 本文介绍了单细胞转录组学和PET示踪剂细胞来源鉴定方法的发展，以及基于深度学习的图像分析技术，以增强成像协议的量化和优化 | 本文讨论了从小动物脑成像向临床转化过程中存在的几个主要障碍，包括生物物种间的内在差异和成像技术上的挑战 | 本文旨在总结小动物神经成像领域的最新进展，以提高其临床转化能力 | 本文主要研究小动物脑成像技术及其临床转化 | 计算机视觉 | NA | 混合成像、深度学习、转录组学 | 深度学习 | 图像 | 小动物（如啮齿动物）脑部样本 |
| 8194 | 2024-09-30 |
[Liuwei Buqi capsule modulates immune function by targeting multiple immune cell subsets in lung tissue of patients with COPD]
2021-Oct-20, Nan fang yi ke da xue xue bao = Journal of Southern Medical University
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研究论文 | 研究了慢性阻塞性肺疾病（COPD）患者肺组织中免疫细胞亚群的特征，并探讨了六味补气胶囊调节COPD免疫和炎症失衡的机制 | 首次构建了六味补气胶囊-免疫细胞亚群-靶基因网络，并通过KEGG富集分析确定了关键基因和信号通路 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据和动物模型，缺乏人体临床试验数据 | 探讨COPD患者肺组织中免疫细胞亚群的特征及六味补气胶囊的免疫调节机制 | COPD患者肺组织中的免疫细胞亚群及六味补气胶囊的作用机制 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | COPD患者和健康对照组的肺组织样本，以及COPD大鼠模型 |
| 8195 | 2024-09-30 |
Maximizing single cell dissociation protocol for individual zebrafish embryo
2024-Dec, MethodsX
IF:1.6Q2
DOI:10.1016/j.mex.2024.102958
PMID:39329153
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研究论文 | 本文介绍了一种优化的小鱼胚胎单细胞分离协议 | 提出了针对小鱼胚胎的高质量单细胞悬液分离方法 | NA | 优化单细胞分离技术，以研究细胞异质性和细胞状态 | 小鱼胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 单个小鱼胚胎 |
| 8196 | 2024-09-30 |
Natural hydrogen gas and engineered microalgae prevent acute lung injury in sepsis
2024-Oct, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2024.101247
PMID:39328786
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研究论文 | 研究探讨了天然氢气和工程微藻在预防脓毒症引起的急性肺损伤中的作用 | 提出了DQB@C作为一种新型生物纳米系统，具有治疗脓毒症相关急性肺损伤的巨大潜力 | NA | 整合氢气和生物纳米微藻，扩展脓毒症的治疗选择 | 研究氢气和微藻在预防脓毒症引起的急性肺损伤中的作用 | 生物医学工程 | 脓毒症 | 磷酸蛋白质组学、代谢组学和蛋白质组学分析 | NA | 蛋白质组学数据 | 小鼠样本 |
| 8197 | 2024-09-30 |
Integrated single-cell and bulk RNA sequencing analysis reveal immune-related biomarkers in postmenopausal osteoporosis
2024-Sep-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38022
PMID:39328516
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研究论文 | 研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据，揭示了绝经后骨质疏松症中的免疫相关生物标志物 | 首次整合单细胞和批量RNA测序数据，识别出六个免疫相关差异表达基因（IR-DEGs），并构建了绝经后骨质疏松症的分子亚型和诊断模型 | 研究主要基于公共数据库中的数据，缺乏临床样本的验证 | 探讨绝经后骨质疏松症的免疫调节机制和早期诊断生物标志物 | 绝经后骨质疏松症患者的外周血单核细胞 | 生物信息学 | 骨质疏松症 | RNA测序 | 随机森林（RF）、支持向量机递归特征消除（SVM-RFE）和LASSO回归模型 | RNA | 训练组使用GSE56815数据集，验证组使用GSE2208数据集，涉及单细胞RNA测序数据分析11个不同的细胞簇 |
| 8198 | 2024-09-30 |
NOX2 mediates NLRP3/ROS facilitating nasal mucosal epithelial inflammation in chronic rhinosinusitis with nasal polyps
2024-Sep-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38029
PMID:39328569
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研究论文 | 本研究探讨了NOX2在慢性鼻窦炎伴鼻息肉（CRSwNP）中通过NLRP3/ROS途径促进鼻黏膜上皮炎症的机制 | 首次利用单细胞RNA测序数据揭示了NOX2在CRSwNP中通过ROS积累和NLRP3炎症小体激活的关键作用 | 研究主要基于体外实验和单细胞RNA测序数据，缺乏体内实验验证 | 探讨氧化应激在慢性鼻窦炎伴鼻息肉（CRSwNP）鼻黏膜上皮细胞中的机制 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉（CRSwNP）的鼻黏膜上皮细胞 | NA | 慢性鼻窦炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | HRA000772数据集中的单细胞RNA测序数据 |
| 8199 | 2024-09-30 |
Non-thermal atmospheric pressure plasma induces selective cancer cell apoptosis by modulating redox homeostasis
2024-Sep-26, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-024-01810-8
PMID:39327567
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研究论文 | 研究非热等离子体通过调节氧化还原稳态诱导选择性癌细胞凋亡的机制 | 首次详细探讨了非热等离子体通过调节氧化还原稳态诱导选择性癌细胞凋亡的机制 | 研究仅限于HT1080纤维肉瘤细胞和人类正常成纤维细胞，未涵盖其他类型的癌细胞 | 探索非热等离子体诱导选择性细胞死亡的机制及其在癌症治疗中的应用 | HT1080纤维肉瘤细胞和人类正常成纤维细胞 | NA | NA | 非热等离子体处理、单细胞RNA测序、Western blotting、免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据、图像 | HT1080纤维肉瘤细胞和人类正常成纤维细胞 |
| 8200 | 2024-09-30 |
Beyond the bulk: overview and novel insights into the dynamics of muscle satellite cells during muscle regeneration
2024-Sep-26, Inflammation and regeneration
IF:5.0Q1
DOI:10.1186/s41232-024-00354-1
PMID:39327631
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综述 | 本文综述了肌肉卫星细胞在肌肉再生过程中的动态变化，并介绍了单细胞技术在研究中的应用 | 利用单细胞RNA测序和单核RNA测序技术，揭示了肌肉再生过程中肌肉卫星细胞的动态异质性 | NA | 综述肌肉卫星细胞在肌肉再生中的作用，并探讨单细胞技术带来的新见解 | 肌肉卫星细胞及其在肌肉再生中的动态变化 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | RNA | NA |