单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27747 篇文献，本页显示第 8121 - 8140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8121 | 2024-10-02 |
DSP-0509, a TLR7 agonist, exerted synergistic anti-tumor immunity combined with various immune therapies through modulating diverse immune cells in cancer microenvironment
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1410373
PMID:39346737
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研究论文 | 研究了TLR7激动剂DSP-0509与多种免疫疗法联合使用对肿瘤微环境中免疫细胞的调节作用 | 首次合成了可系统注射的TLR7激动剂DSP-0509，并研究了其与IDO1抑制剂、抗PD-1抗体和AXL抑制剂联合使用对肿瘤微环境中免疫细胞的影响 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证其疗效 | 探讨TLR7激动剂DSP-0509与多种免疫疗法联合使用对肿瘤微环境中免疫细胞的调节作用，以增强抗肿瘤免疫效果 | TLR7激动剂DSP-0509、IDO1抑制剂、抗PD-1抗体、AXL抑制剂以及肿瘤微环境中的免疫细胞 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 小鼠肿瘤模型 |
| 8122 | 2024-10-02 |
Transcriptional bursting dynamics in gene expression
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1451461
PMID:39346775
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综述 | 本文综述了基因表达中的转录爆发动力学机制，并比较了不同基因表达模型的优缺点 | 提供了关于转录爆发的关键指标的详细总结，并探讨了跨物种的转录爆发时间动态及其分子机制 | 缺乏一个全面的定量模型来研究转录爆发 | 指导研究人员选择最适合其研究背景的基因表达模型，并深入理解细胞过程、细胞命运决定和癌症诊断 | 基因表达模型、转录爆发动力学、细胞表型多样性 | NA | NA | 单细胞测序、多组学整合 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 8123 | 2024-10-02 |
Unraveling the role of ADAMs in clinical heterogeneity and the immune microenvironment of hepatocellular carcinoma: insights from single-cell, spatial transcriptomics, and bulk RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1461424
PMID:39346916
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研究论文 | 本研究探讨了ADAM基因家族在肝细胞癌临床异质性和免疫微环境中的作用，通过单细胞、空间转录组学和批量RNA测序技术揭示了ADAM家族基因的分子特征及其对HCC发展和预后的影响 | 首次报道了ADAM家族信号在肝细胞癌肿瘤微环境中的有害影响和预后意义 | NA | 探讨ADAM基因家族在肝细胞癌中的作用及其对临床预后的影响 | 肝细胞癌中的ADAM基因家族及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序、空间转录组学、批量RNA测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | NA |
| 8124 | 2024-10-02 |
A telencephalon cell type atlas for goldfish reveals diversity in the evolution of spatial structure and cell types
2023-11-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adh7693
PMID:37910612
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，系统比较了金鱼端脑的细胞类型，揭示了其分子神经解剖学的分区 | 首次构建了金鱼端脑的细胞类型图谱，发现了神经元基因表达的多样性和模块化特征，并提出了金鱼端脑中存在海马结构的可能性 | NA | 研究金鱼端脑的细胞类型多样性及其在进化中的空间结构变化 | 金鱼端脑的细胞类型及其分子特征 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 金鱼端脑的多个细胞样本 |
| 8125 | 2024-10-02 |
Spatially Resolved Transcriptomics Technology Facilitates Cancer Research
2023-10, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202302558
PMID:37632718
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综述 | 本文综述了空间转录组学技术在癌症研究中的应用及其在揭示基因表达和细胞功能空间位置方面的主要成就 | 空间转录组学技术（SRT）能够探索特定细胞与其空间背景之间的关系，弥补了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在空间信息上的不足 | NA | 旨在通过深入理解肿瘤细胞与周围非恶性细胞的相互作用，开发更有效的临床治疗策略 | 肿瘤细胞及其周围非恶性细胞的空间位置与功能 | 数字病理学 | 癌症 | 下一代测序（NGS） | NA | 转录组数据 | NA |
| 8126 | 2024-10-02 |
Lepr-Expressing PDLSCs Contribute to Periodontal Homeostasis and Respond to Mechanical Force by Piezo1
2023-10, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202303291
PMID:37553778
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研究论文 | 研究揭示了Lepr+ PDLSCs在牙周稳态中的作用及其对机械力的响应机制 | 首次通过单细胞RNA测序和谱系追踪技术鉴定出Lepr+ PDLSCs，并发现Piezo1介导了Lepr+ PDLSCs的机械感应 | NA | 探讨Lepr+ PDLSCs在牙周稳态中的作用及其对机械力的响应机制 | Lepr+ PDLSCs及其在牙周组织修复和稳态维持中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 8127 | 2024-10-02 |
Simultaneous estimation of gene regulatory network structure and RNA kinetics from single cell gene expression
2023-Sep-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.21.558277
PMID:37790443
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研究论文 | 开发了一种深度学习模型，通过单细胞RNA测序数据同时推断基因调控网络结构和RNA动力学参数 | 首次将深度学习模型应用于同时推断基因调控网络结构和RNA动力学参数，并展示了其在预测基因表达状态和模拟转录因子变化效果方面的优越性 | NA | 构建一个完整的、预测性的生物物理模型，用于基因表达调控 | 基因调控网络结构和RNA动力学参数 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习模型 | 基因表达数据 | 175,000个单细胞 |
| 8128 | 2024-10-02 |
Single-Nucleus RNA-Seq: Open the Era of Great Navigation for FFPE Tissue
2023-Sep-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241813744
PMID:37762049
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综述 | 本文综述了单核RNA测序（snRNA-seq）在福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）组织中的应用及其技术进展 | snRNA-seq技术减少了离子化转录偏差，适用于更丰富的样本，为深入探索FFPE组织提供了新机会 | 本文总结了snRNA-seq在FFPE样本中的局限性和潜在技术发展 | 探讨单核RNA测序技术在福尔马林固定石蜡包埋组织中的应用 | 单核RNA测序技术及其在FFPE组织中的应用 | 基因组学 | NA | 单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 8129 | 2024-10-02 |
Integrative single-cell RNA-seq and ATAC-seq analysis of myogenic differentiation in pig
2023-02-01, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-023-01519-z
PMID:36726129
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和ATAC测序分析了猪骨骼肌分化的分子和细胞动态 | 首次在猪胚胎发育过程中对骨骼肌分化进行了单细胞分辨率的基因表达和染色质可及性分析 | 研究仅限于猪胚胎发育阶段，未涵盖成年猪或人类 | 深入理解猪胚胎骨骼肌分化的分子和细胞动态 | 猪胚胎的骨骼肌分化过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和ATAC测序 | NA | 基因表达数据和染色质可及性数据 | 猪胚胎的骨骼肌细胞 |
| 8130 | 2024-10-02 |
A Zinc- and Calcium-Rich Lysosomal Nanoreactor Rescues Monocyte/Macrophage Dysfunction under Sepsis
2023-02, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202205097
PMID:36596693
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研究论文 | 本文研究了一种富含锌和钙的溶酶体纳米反应器在脓毒症中恢复单核细胞/巨噬细胞功能的作用 | 开发了一种名为Alpha-MOFs的纳米颗粒，通过释放溶酶体敏感的离子来提升单核细胞/巨噬细胞的吞噬能力 | NA | 研究脓毒症中单核细胞/巨噬细胞功能失调的机制，并开发新的治疗方法 | 脓毒症中的单核细胞/巨噬细胞及其吞噬功能 | NA | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 外周血单核细胞 |
| 8131 | 2024-10-02 |
Macrophage HIF-1α Is an Independent Prognostic Indicator in Kidney Cancer
2020-09-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-19-3890
PMID:32586940
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研究论文 | 研究探讨了巨噬细胞中的HIF-1α在肾癌中的独立预后作用 | 首次全面评估了HAF/HIFs在透明细胞肾细胞癌中的临床相关性，并发现巨噬细胞中的HIF-1α与肿瘤进展和抗血管生成治疗的耐药性相关 | 研究样本量有限，且未涵盖所有可能的临床相关性 | 评估HAF/HIFs在透明细胞肾细胞癌中的临床相关性 | 透明细胞肾细胞癌患者的肿瘤组织 | NA | 肾癌 | 单细胞mRNA测序（scRNA-seq），RNA原位杂交（RNA-ISH），免疫组化（IHC） | NA | 组织 | 380名患者的肿瘤组织，72名患者的验证样本，57名接受抗血管生成治疗的患者 |
| 8132 | 2024-10-01 |
Exposure to BaA inhibits trophoblast cell invasion and induces miscarriage by regulating the DEC1/ARHGAP5 axis and promoting ubiquitination-mediated degradation of MMP2
2024-Nov-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.135594
PMID:39191013
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研究论文 | 研究探讨了苯并[a]蒽暴露通过调节DEC1/ARHGAP5轴和促进MMP2的泛素化降解，抑制滋养层细胞侵袭并导致流产的机制 | 首次揭示了苯并[a]蒽通过调节DEC1/ARHGAP5轴和MID1/MMP2途径导致流产的具体分子机制 | 研究主要基于细胞和小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 探讨苯并[a]蒽暴露导致复发性流产的分子机制 | 滋养层细胞和流产模型小鼠 | NA | 生殖系统疾病 | RNA测序、单细胞RNA测序、甲基化分析 | NA | 基因表达数据 | 包括来自复发性流产女性的绒毛组织和苯并[a]蒽暴露的滋养层细胞 |
| 8133 | 2024-10-01 |
Ependymal cells undergo astrocyte-like reactivity in response to neuroinflammation
2024-Oct, Journal of neurochemistry
IF:4.2Q2
DOI:10.1111/jnc.16120
PMID:38702968
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组学分析，比较了在自身免疫介导的神经炎症模型中，反应性室管膜细胞和星形胶质细胞的转录组特征 | 揭示了在多种神经炎症背景下，室管膜细胞和星形胶质细胞反应性状态的保守基因特征 | 尚未探索驱动室管膜细胞反应性的机制及其下游功能后果 | 研究室管膜细胞在神经炎症中的反应性状态及其与星形胶质细胞反应性的相似性 | 室管膜细胞和星形胶质细胞在神经炎症中的反应性转录组特征 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 8134 | 2024-10-01 |
Exploring the heterogeneity of interstitial cells of Cajal and their properties in gastrointestinal mesenchymal tumors applying single-cell RNA sequencing analysis
2024-Sep-27, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01372-8
PMID:39331193
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析探索胃肠间质瘤中间质细胞Cajal的异质性及其特性 | 揭示了胃肠间质瘤中间质细胞Cajal的异质性和干细胞特性，并发现了潜在的治疗靶点 | NA | 研究胃肠间质瘤中间质细胞Cajal的特性和分子机制 | 胃肠间质瘤中的间质细胞Cajal | 数字病理学 | 胃肠间质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 34,861个细胞 |
| 8135 | 2024-10-01 |
Exploring copper metabolism-induced cell death in gastric cancer: a single-cell RNA sequencing study and prognostic model development
2024-Sep-27, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01374-6
PMID:39331287
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索胃癌中铜代谢诱导的细胞死亡，并开发基于铜代谢相关基因表达的预后模型 | 首次在单细胞水平上研究铜代谢在胃癌中的作用，并开发了基于铜代谢相关基因的预后模型 | NA | 研究胃癌中铜代谢的作用，并开发预后模型 | 胃癌组织和正常组织的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归和随机生存森林 | RNA | NA |
| 8136 | 2024-10-01 |
Identification of immune patterns in idiopathic pulmonary fibrosis patients driven by PLA2G7-positive macrophages using an integrated machine learning survival framework
2024-Sep-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-73625-z
PMID:39333367
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研究论文 | 本研究通过集成机器学习生存框架，识别特发性肺纤维化患者中由PLA2G7阳性巨噬细胞驱动的免疫模式 | 首次通过免疫相关风险评分（IRS）识别PLA2G7作为特发性肺纤维化的新型生物标志物，并验证了塞来昔布与PLA2G7的有效结合 | NA | 识别特发性肺纤维化患者中的新免疫模式和生物标志物，以改善早期诊断和干预 | 特发性肺纤维化患者及其免疫微环境 | 机器学习 | 肺病 | 单细胞测序 | 集成机器学习框架 | 基因数据 | NA |
| 8137 | 2024-10-01 |
Deciphering the role of sphingolipid metabolism in the immune microenvironment and prognosis of esophageal cancer via single-cell sequencing and bulk data analysis
2024-Sep-27, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01379-1
PMID:39333432
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和批量数据分析，揭示了鞘脂代谢在食管癌免疫微环境和预后中的作用 | 结合单细胞和转录组数据，提供了与鞘脂代谢相关的可靠预后模型，并为食管鳞状细胞癌的免疫治疗和药物治疗提供了遗传学层面的指导 | NA | 探讨鞘脂代谢在食管鳞状细胞癌中的作用及其对预后的影响 | 食管鳞状细胞癌的鞘脂代谢相关基因及其在免疫微环境中的作用 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用来自GEO和TCGA的数据，分析了97个基因在食管鳞状细胞癌上皮细胞中的表达 |
| 8138 | 2024-10-01 |
Introducing synthetic thermostable RNase inhibitors to single-cell RNA-seq
2024-Sep-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52717-4
PMID:39333520
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研究论文 | 介绍了一种合成的热稳定RNase抑制剂用于单细胞RNA测序 | 合成的RNase抑制剂SEQURNA在单细胞RNA测序中表现出与普遍使用的蛋白质重组RNase抑制剂（RRIs）相等或更优的质量，并提供了更高的可重复性和通量，支持新的实验流程，包括在整个热循环过程中保留RNase抑制 | NA | 改进单细胞RNA测序中的RNA完整性保护 | 单细胞RNA测序中的RNA完整性 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 8139 | 2024-10-01 |
Construction of store-operated calcium entry-related gene signature for predicting prognosis and indicates immune microenvironment infiltration in stomach adenocarcinomas
2024-Sep-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-73324-9
PMID:39333689
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研究论文 | 研究构建了与存储操作钙进入相关的基因签名，用于预测胃腺癌的预后并指示免疫微环境浸润 | 首次系统研究了存储操作钙进入（SOCE）在胃腺癌（STAD）中的预后和免疫学价值 | NA | 开发一个风险模型，探索SOCE签名与临床特征、预后、肿瘤微环境（TME）以及对免疫治疗、化疗和靶向药物反应的相关性 | 胃腺癌（STAD）患者的SOCE相关基因 | 数字病理学 | 胃癌 | RNA测序 | Cox比例风险回归模型 | mRNA表达数据 | 使用了TCGA、GEO（GSE84437和GSE159929）、cBioPortal和TIMER数据库中的数据 |
| 8140 | 2024-10-01 |
scGAA: a general gated axial-attention model for accurate cell-type annotation of single-cell RNA-seq data
2024-Sep-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-73356-1
PMID:39333739
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scGAA的新型细胞类型注释模型，用于单细胞RNA测序数据的准确注释 | 提出了基于transformer框架的轴向注意力机制，将传统的自注意力机制分解为水平和垂直注意力，显著提高了计算效率，并集成了门控单元以增强基因间关系的捕捉 | NA | 开发一种高效的细胞类型注释模型，以应对单细胞RNA测序数据的高维度和稀疏性挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | transformer | 基因表达数据 | NA |