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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 681 | 2026-01-03 |
Identification of key ferroptosis-related targets in colorectal cancer: A transcriptomics-driven study via machine learning and AUcell analysis of single-cell RNA-sequencing
2026, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.114522
PMID:41438584
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研究论文 | 本研究通过机器学习和AUcell分析,识别了结直肠癌中铁死亡相关的关键基因,并探讨了其分子机制和治疗潜力 | 结合机器学习(LASSO和SVM-RFE)与单细胞RNA测序的AUcell分析,系统识别结直肠癌中铁死亡的核心生物标志物,并构建了竞争性内源RNA网络和药物候选库 | qRT-PCR验证中AQP8和NR5A2的表达未显示预期差异,且研究依赖于公共数据库数据,需进一步实验验证 | 阐明结直肠癌中铁死亡相关的关键基因和分子机制,以指导治疗策略和预后评估 | 结直肠癌患者样本及相关基因数据 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,qRT-PCR,免疫组织化学 | LASSO,SVM-RFE | 转录组数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 682 | 2026-01-03 |
Genetic Association Between Polymyositis/Dermatomyositis and Epilepsy: Insights From Mendelian Randomization and Bioinformatic Analyses
2026-Jan, Brain and behavior
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/brb3.71148
PMID:41466027
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化和生物信息学分析,探讨了多发性肌炎/皮肌炎与癫痫之间的遗传关联及免疫介导机制 | 首次结合孟德尔随机化与单细胞转录组学,揭示多发性肌炎与癫痫之间的因果关联及免疫细胞浸润模式 | 研究未发现皮肌炎与癫痫的显著关联,且样本主要基于公开数据库,需进一步实验验证 | 探索多发性肌炎/皮肌炎与癫痫之间的潜在因果联系及免疫机制 | 多发性肌炎、皮肌炎和癫痫患者及小鼠模型的遗传与转录组数据 | 生物信息学 | 多发性肌炎、皮肌炎、癫痫 | GWAS、孟德尔随机化、转录组分析、单细胞转录组学、PCR | NA | 遗传数据、转录组数据 | 基于公开GWAS数据库(如finn-b-M13_POLYMYO、finn-b-DERMATOPOLY_FG、ebi-a-GCST90018840)及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 683 | 2026-01-03 |
Spatial Transcriptomics Unveils Landscape of Resistance to Concurrent Chemo-Radiotherapy in Hypopharyngeal Squamous Cell Carcinoma: The Role of SPP1+ Macrophages
2026-Jan, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71493
PMID:41466485
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术,揭示了下咽鳞状细胞癌患者对同步放化疗产生耐药性的肿瘤微环境特征,并明确了SPP1+巨噬细胞在其中的关键作用 | 首次利用空间转录组学技术,在空间维度上解析了下咽鳞状细胞癌对同步放化疗耐药的肿瘤微环境,并识别出SPP1+巨噬细胞通过CD44和ITGB1介导的配体-受体相互作用促进耐药的新机制 | 研究样本量有限,且为观察性研究,需要更大规模的前瞻性队列和功能实验验证SPP1+巨噬细胞在耐药中的因果作用 | 探究下咽鳞状细胞癌对同步放化疗产生耐药的肿瘤微环境机制,以寻找预测性生物标志物和开发靶向治疗策略 | 晚期下咽鳞状细胞癌患者的组织样本,包括对同步放化疗耐药的患者和未接受同步放化疗的患者 | 空间转录组学 | 下咽鳞状细胞癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 未明确具体样本数量,但涉及对同步放化疗耐药和未接受同步放化疗的晚期下咽鳞状细胞癌患者组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 684 | 2026-01-03 |
Identification and Validation of the Prognostic Value of PTTG1-Related Genes in Hepatocellular Carcinoma by Mendelian Randomization and Single-Cell Transcriptome Analysis
2026-Jan, Iranian journal of biotechnology
IF:1.6Q4
DOI:10.30498/ijb.2025.543634.4221
PMID:41472935
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研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化、转录组分析和单细胞测序方法,评估了PTTG1相关基因在肝细胞癌中的预后价值 | 首次结合孟德尔随机化、转录组分析和单细胞测序方法,系统评估PTTG1相关基因在肝细胞癌中的预后价值,并识别出CDC45和CENPE作为新的潜在治疗靶点 | 孟德尔随机化分析显示CDC45和CENPE与HCC的因果关联虽显著但效应较弱,表明这些基因在HCC发病机制中可能起微妙调控作用而非强直接因果作用 | 评估PTTG1相关基因在肝细胞癌中的预后价值 | 肝细胞癌(HCC) | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 孟德尔随机化,转录组分析,单细胞测序 | 单变量Cox回归,机器学习方法 | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 685 | 2026-01-03 |
Single-Cell 3' mRNA Sequencing with 10× Chromium Gel Beads-in-Emulsion (GEM) Kits
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4901-5_35
PMID:41478996
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研究论文 | 本文介绍了使用10× Genomics的Chromium Next GEM Single Cell 3'试剂盒进行单细胞3' mRNA测序的详细协议 | 基于微流控分区和条形码技术,通过GEMs封装单细胞实现高通量单细胞转录组分析 | 依赖于特定试剂盒和平台,需参考官方指南以确保实验准确性,可能受技术更新影响 | 提供单细胞RNA测序的实验方法,用于研究细胞异质性、基因表达动态和稀有细胞群 | 单细胞转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 数千个单个细胞 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium, Illumina sequencing platforms | 10x Chromium Single Cell 3' Reagent Kits (v3.1-Dual Index) |
| 686 | 2026-01-03 |
Exploring Chronic Rejection in Organ Transplantation Through Computational Modeling
2026, Results and problems in cell differentiation
DOI:10.1007/978-3-032-07686-1_3
PMID:41479021
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综述 | 本章探讨了计算模型在理解实体器官移植慢性排斥反应机制、提高诊断精度和识别新治疗靶点方面的应用 | 综述了多种计算建模方法(包括人工智能、机器学习、微分方程、基于代理的模型和基因网络分析)在肾、肝、心、肺移植慢性排斥研究中的整合应用,并展望了单细胞转录组学和空间基因组学等新兴技术的潜力 | 面临数据质量、标准化和临床验证方面的挑战,需要更全面的纵向研究和结合多种计算技术的混合模型来弥合差距 | 通过计算建模理解慢性排斥机制,提高诊断精度,识别新治疗靶点,以改善移植器官长期存活率 | 实体器官移植(肾、肝、心、肺)中的慢性排斥反应 | 机器学习 | 器官移植排斥 | 单细胞转录组学,空间基因组学,多组学数据整合 | 人工智能,机器学习,常微分方程,偏微分方程,基于代理的模型,基因网络分析 | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞转录组学,空间基因组学 | NA | NA |
| 687 | 2026-01-03 |
LIPA-driven reprogramming of tumor-associated macrophages shapes an immunosuppressive microenvironment in osteosarcoma
2025-Dec-31, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.116110
PMID:41477996
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研究论文 | 本研究揭示了LIPA驱动的肿瘤相关巨噬细胞重编程在骨肉瘤免疫抑制微环境形成中的关键作用 | 首次将LIPA与骨肉瘤中免疫抑制性巨噬细胞表型及T细胞抑制功能直接关联,并通过虚拟筛选发现FDA已批准药物Glecaprevir作为潜在LIPA抑制剂 | 研究主要基于小鼠模型和有限临床样本,需进一步在更大规模人类队列中验证LIPA的临床意义 | 探究甘油三酯代谢在骨肉瘤进展中的作用机制及潜在治疗靶点 | 骨肉瘤小鼠模型、人类骨肉瘤样本、患者来源异种移植模型 | 肿瘤免疫学 | 骨肉瘤 | 单细胞测序、结构虚拟筛选、功能验证实验 | 风险评分模型 | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 小鼠模型、人类样本及PDX模型的多物种验证 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 688 | 2026-01-03 |
Endometrial immune profile: A predictor of pregnancy success
2025-Dec-31, Reproductive biology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.repbio.2025.101174
PMID:41478129
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综述 | 本文综述了子宫内膜免疫谱作为妊娠成功预测因子的作用,探讨了免疫细胞在健康与病理状态下的组成和功能,以及诊断和治疗策略 | 整合了从传统免疫组织化学到高分辨率单细胞转录组学等新兴诊断方法,并评估了子宫内膜微生物组对免疫谱的影响,为个性化诊断和靶向免疫治疗提供了临床导向框架 | 作为综述文章,未涉及原始研究数据,可能受限于现有文献的覆盖范围和证据质量 | 评估子宫内膜免疫谱在预测妊娠成功中的作用,并探讨免疫失调如何影响不孕相关疾病 | 子宫内膜免疫细胞(如巨噬细胞、树突状细胞、子宫自然杀伤细胞、调节性T细胞)及其在健康与病理条件下的动态变化 | 生殖医学 | 不孕症(包括反复植入失败、反复妊娠丢失、子宫内膜异位症、多囊卵巢综合征) | 免疫组织化学、流式细胞术、单细胞转录组学 | NA | 文本综述 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 689 | 2026-01-03 |
Mechanistic insights from transcript analysis of long-term pig to non-human primate kidney xenografts
2025-Dec-30, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2025.11.018
PMID:41478397
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研究论文 | 本研究通过转录分析探讨了猪到非人灵长类动物肾脏异种移植物的长期存活机制 | 揭示了异种移植物中供体内皮转录本丢失和受体内皮转录本及蛋白意外获得的新过程 | 研究样本量有限,仅涉及58个样本,且主要基于非人灵长类动物模型,可能无法完全反映人类临床情况 | 探究猪肾脏异种移植物在非人灵长类动物中长期存活的分子机制 | eGenesis猪肾脏异种移植物在猕猴中的样本 | 数字病理学 | NA | 转录分析,空间转录组学 | NA | 转录组数据,蛋白质表达数据 | 58个样本,包括供体、灌注后、协议和终末样本 | NA | 空间转录组学 | GeoMx Immune Pathways Panel | 使用Banff人类器官移植面板和35个猪特异性探针进行转录分析,GeoMx免疫通路面板用于肾小球区域分析 |
| 690 | 2026-01-03 |
Single-cell transcriptome analysis reveals the association between ketone body synthesis and morphogenic profile of intestinal epithelia in neonatal mice
2025-Dec-30, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2025.12.005
PMID:41478463
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了新生小鼠肠道上皮细胞中酮体合成与细胞形态发生特征之间的关联 | 首次在新生小鼠肠道上皮细胞中发现酮体合成相关基因的上调与细胞形态发生基因的高表达相关,而非主要作为能量来源,这为理解早期肠道上皮成熟提供了新视角 | 研究仅针对小鼠模型,且样本年龄范围有限(仅10天和21天),微生物条件的影响可能未完全阐明 | 探究新生期肠道上皮细胞的成熟特征及其与微生物定植的关系 | 新生(10天)和幼年(21天)小鼠的肠道上皮细胞 | 单细胞转录组学 | 肠道疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 新生和幼年小鼠的肠道上皮细胞(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 691 | 2026-01-03 |
PET/CT-Guided Management of Immune Checkpoint Blockade and Post-Treatment Multi-Modal Profiling in Long-Term Responders with Metastatic Lung Cancer in the National Network Genomic Medicine Lung Cancer Germany (nNGM)
2025-Dec-30, Annals of oncology : official journal of the European Society for Medical Oncology
IF:56.7Q1
DOI:10.1016/j.annonc.2025.12.011
PMID:41478526
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研究论文 | 本研究评估了基于PET/CT指导的免疫检查点阻断(ICB)停药策略在长期应答的转移性肺癌患者中的安全性和有效性,并分析了停药后肿瘤的分子特征 | 首次提出并评估了基于PET/CT影像学指导的ICB结构化停药策略,并通过多组学分析揭示了长期应答后停药患者肿瘤的获得性耐药机制与第二原发肺癌的特征差异 | 本研究为回顾性队列研究,可能存在选择偏倚;需要前瞻性随机试验进一步验证 | 探索转移性肺癌患者长期接受ICB治疗后的最佳治疗持续时间及停药策略 | 来自德国国家网络基因组医学肺癌(nNGM)21个中心的455名接受一线ICB治疗且疾病控制≥2年的转移性肺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 综合基因组分析、组织学TIL定量、空间转录组学 | NA | 影像数据(PET/CT)、基因组数据、转录组数据、组织病理数据 | 455名患者(队列A:126名,队列B:329名),并对队列A中疾病持续或进展的患者进行了匹配的治疗前后肿瘤样本分析 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 692 | 2026-01-03 |
Single-cell RNA-seq analysis of longitudinal CD4+ T cell samples reveals cell-type-specific changes during early stages of type 1 diabetes
2025-Dec-29, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-025-01574-x
PMID:41462339
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了1型糖尿病早期阶段CD4+ T细胞中细胞类型特异性的转录变化和基因调控网络 | 首次对1型糖尿病早期阶段的CD4+ T细胞进行纵向单细胞转录组分析,识别了与疾病进展相关的细胞类型特异性基因表达模式和调控网络变化 | 样本量相对较小(N=22),且仅关注CD4+ T细胞,未涵盖其他免疫细胞类型 | 探究1型糖尿病早期阶段CD4+ T细胞的转录组变化和基因调控网络,以理解早期免疫失调机制 | 来自后续发展为1型糖尿病的儿童(N=11)及其匹配对照(N=11)的纵向CD4+ T细胞样本 | 单细胞转录组学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 73个纵向CD4+ T细胞样本,来自22名儿童(11名病例,11名对照),分析超过99,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 693 | 2026-01-03 |
Multi-omics analysis reveals shared diagnostic and therapeutic targets in endometriosis and recurrent implantation failure
2025-Dec-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-28877-8
PMID:41462508
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研究论文 | 本研究通过多组学数据分析,揭示了子宫内膜异位症和反复种植失败在影响子宫内膜容受性方面的共享分子机制 | 首次利用多组学数据结合加权基因共表达网络分析,识别出子宫内膜异位症和反复种植失败共有的15个枢纽基因,并验证了其高诊断准确性 | 研究依赖于公共数据库的数据,可能受限于样本异质性和批次效应,且需要进一步的体内外实验验证 | 阐明影响子宫内膜容受性在子宫内膜异位症和反复种植失败中的共享分子机制 | 子宫内膜异位症和反复种植失败相关的基因表达数据 | 生物信息学 | 子宫内膜异位症 | 多组学数据分析,加权基因共表达网络分析,单细胞测序,免疫荧光 | 加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 694 | 2026-01-03 |
Centromere Protein I, a Cell Cycle Checkpoint Gene, Accelerates Tumor Progression via the Hippo Pathway and Mediates Immune Escape in Hepatocellular Carcinoma
2025-Dec-28, Journal of clinical and translational hepatology
IF:3.1Q2
DOI:10.14218/JCTH.2025.00127
PMID:41473255
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研究论文 | 本研究探讨了细胞周期检查点相关基因在肝细胞癌中的预后意义,并揭示了CENPI通过Hippo通路促进肿瘤进展及免疫逃逸的机制 | 首次将CENPI鉴定为肝细胞癌的关键枢纽基因,阐明其通过抑制YAP磷酸化增强核转位驱动恶性进展,并揭示其通过破坏肿瘤抗原呈递和趋化因子介导的CD8+ T细胞趋化作用促进免疫逃逸的新机制 | 研究主要基于公共数据库和体外实验,临床样本验证和体内机制深度探索有待加强,免疫逃逸机制的具体信号通路细节需进一步阐明 | 探索细胞周期检查点相关基因在肝细胞癌中的预后价值及其促进肿瘤进展的分子机制 | 肝细胞癌患者数据集、HCC细胞系、动物模型及患者来源的HCC组织标本 | 肿瘤生物学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学、体外功能实验、动物实验 | 预后模型(Kaplan-Meier、nomogram、决策曲线分析、ROC分析) | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、临床病理数据 | 来自TCGA和ICGC的HCC数据集、GSE149614单细胞RNA测序数据、患者来源的HCC标本及细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 695 | 2026-01-03 |
PDK4 Regulates Inflammatory Injury in Acute-on-chronic Liver Failure by Phosphorylating STAT1-mediated M1 Polarization of Macrophages
2025-Dec-28, Journal of clinical and translational hepatology
IF:3.1Q2
DOI:10.14218/JCTH.2025.00343
PMID:41473257
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研究论文 | 本研究探讨了丙酮酸脱氢酶激酶4(PDK4)在慢加急性肝衰竭(ACLF)中通过磷酸化STAT1介导巨噬细胞M1极化来调节炎症损伤的作用机制 | 首次揭示了PDK4在ACLF中作为关键促炎调节因子,通过激活STAT1信号通路促进巨噬细胞M1极化的新机制 | 研究主要基于体外实验和动物模型,临床验证尚不充分,且PDK4抑制剂的具体临床应用潜力需进一步评估 | 探究PDK4在ACLF中的作用机制,以寻找调节巨噬细胞功能、缓解ACLF进展的治疗靶点 | 健康与ACLF肝组织、ACLF患者外周血单个核细胞、LO2肝细胞、ACLF小鼠模型 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞RNA测序、转录组学分析、体外实验、体内验证 | NA | RNA测序数据、转录组数据 | 来自数据库的单细胞RNA测序数据、ACLF患者外周血单个核细胞转录组数据(GSE168048)、体外细胞实验、ACLF小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 696 | 2026-01-03 |
Integrating CyTOF with scRNA-seq reveals that Cyclovirobuxine D inhibits HCC progression through hepatic immune microenvironment remodeling
2025-Dec-28, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157751
PMID:41477977
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研究论文 | 本研究通过整合CyTOF与scRNA-seq技术,揭示了环维黄杨星D通过重塑肝脏免疫微环境来抑制肝细胞癌进展的机制 | 首次结合CyTOF和scRNA-seq技术系统评估CVB-D对HCC肿瘤免疫微环境的影响,并发现其通过增强CD8+T细胞功能、调节巨噬细胞极化及减少恶性上皮细胞丰度来重塑免疫微环境 | 研究基于小鼠异位HCC模型,结果在人类HCC中的直接适用性需进一步验证;未详细探讨CVB-D的长期疗效或潜在副作用 | 探究CVB-D抑制HCC进展的作用及机制,以识别潜在治疗靶点并为HCC治疗提供新科学依据 | C57BL/6小鼠的异位HCC模型(通过Hepa1-6细胞植入建立) | 数字病理学 | 肝细胞癌 | CyTOF, scRNA-seq, 多重免疫荧光染色, 血清细胞因子检测 | NA | 单细胞蛋白质组数据, 单细胞转录组数据, 图像数据, 血清蛋白数据 | C57BL/6小鼠的异位HCC模型,经不同剂量CVB-D处理14天后收集新鲜肿瘤组织 | NA | 单细胞RNA-seq, 质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 697 | 2026-01-03 |
Single-cell analysis identifies inflammatory and tissue remodeling tumor-associated macrophages distinct from M1/M2 paradigm
2025-Dec-26, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiaf176
PMID:41347255
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研究论文 | 本文通过整合分析公开的单细胞RNA测序数据,识别了乳腺癌中七种与M1/M2范式不同的肿瘤相关巨噬细胞亚群,揭示了其功能异质性 | 首次在单细胞水平上系统识别了乳腺癌中七种转录特征不同的肿瘤相关巨噬细胞亚群,这些亚群不遵循传统的M1/M2极化分类,并发现了与组织修复和干扰素反应相关的独特功能特征 | 研究主要基于公开数据集进行生物信息学分析,实验验证部分仅在小规模墨西哥患者队列中进行初步验证,样本代表性可能有限 | 深入表征乳腺癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性,探索其功能亚群与患者预后的关系 | 乳腺癌患者及健康个体的血液、肿瘤和非肿瘤乳腺组织中的单细胞RNA测序数据 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 生物信息学整合分析 | 单细胞转录组数据 | 来自公共数据库的多个乳腺癌患者和健康个体样本,具体数量未明确说明,但包含血液、肿瘤及非肿瘤组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 698 | 2026-01-03 |
Endoplasmic reticulum stress exacerbates ischemia-reperfusion-induced pulmonary endothelial barrier dysfunction by activating TXNDC5
2025-Dec-26, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.12.039
PMID:41456650
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研究论文 | 本研究探讨了内质网应激通过激活TXNDC5加剧肺缺血再灌注损伤中肺内皮屏障功能障碍的机制 | 首次揭示了内质网应激通过ATF6-TXNDC5轴调控肺内皮屏障功能,并构建了基于TXNDC5的LIRI早期预警模型 | 研究主要基于动物和细胞模型,临床验证样本量有限,需进一步多中心验证 | 探究TXNDC5在肺缺血再灌注损伤诱导的肺内皮屏障破坏中的作用及其机制与治疗潜力 | 大鼠肺缺血再灌注损伤模型、人脐静脉内皮细胞、LIRI患者血浆样本 | 基础医学研究 | 肺缺血再灌注损伤 | 单细胞RNA测序、ChIP-seq、血浆蛋白质组学、AAV-shRNA敲低 | NA | 基因表达数据、蛋白质组数据、临床数据 | 动物模型、细胞模型及LIRI患者血浆样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序、蛋白质组学 | NA | NA |
| 699 | 2026-01-03 |
Copper-linked metabolic stress as a potential contributor to gastric epithelial transformation and metastasis
2025-Dec-26, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000046590
PMID:41465895
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA-seq数据和孟德尔随机化分析,探讨了铜相关代谢应激在胃上皮细胞转化和转移中的潜在作用 | 首次在单细胞水平识别了胃上皮从正常到恶性的过渡表型,并结合遗传学证据(孟德尔随机化)系统性地将循环铜水平与胃肿瘤风险联系起来 | 研究结果虽支持铜的因果作用假说,但并非确证;需要正交组织验证、铜处理/铜死亡通路的功能扰动实验以及扩展的遗传分析(如多变量/共定位分析)来进一步证实 | 阐明胃上皮从正常到恶性转化及转移过程中的分子事件,特别关注铜相关代谢应激的作用 | 胃组织(来自公共数据库)、循环铜水平(遗传代理变量)、良性胃肿瘤和胃癌(GWAS数据) | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA-seq, 孟德尔随机化 | 基于典型相关分析的批次校正, 伪时间推断(Monocle; 自然样条模型), 通路活性评分(GSVA/GSEA) | 基因表达数据(单细胞RNA-seq), 遗传关联数据(GWAS) | 两个公共单细胞RNA-seq数据集(来源:GEO数据库),以及来自FinnGen和GWAS Catalog的汇总统计数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 700 | 2026-01-03 |
TLR2, CCR1, IRF8, and CCL4 as biomarkers for atherosclerosis progression and therapy response: A multi-omics study
2025-Dec-26, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000046647
PMID:41465914
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研究论文 | 本研究通过多组学分析识别出TLR2、CCR1、IRF8和CCL4作为动脉粥样硬化进展和治疗反应的新型生物标志物 | 结合WGCNA、机器学习、单细胞RNA-seq和分子对接,首次系统鉴定出与免疫通路相关的四个关键生物标志物,并构建了用于风险预测的列线图模型 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,缺乏前瞻性临床队列验证,且分子对接结果需实验验证 | 寻找动脉粥样硬化的新型诊断标志物和靶向治疗策略 | 动脉粥样硬化相关基因表达数据和单细胞数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA-seq,分子对接 | LASSO,随机森林,人工神经网络 | 基因表达数据,单细胞数据 | 基于GSE28829和GSE159677数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |