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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 601 | 2026-03-25 |
Multiomic characterisation of the clinical efficacy of guselkumab induction therapy in ulcerative colitis
2026-Mar-23, BMJ open gastroenterology
IF:3.3Q2
DOI:10.1136/bmjgast-2025-002153
PMID:41871904
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研究论文 | 本文详细评估了古塞奇尤单抗治疗中重度活动性溃疡性结肠炎患者的细胞和分子变化 | 首次描述了通过抑制IL-23p19亚基实现临床疗效的分子变化,并整合了多组学数据(包括bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq和血清蛋白质组学)来全面分析治疗反应 | 研究样本量相对有限(单细胞RNA-seq仅52例),且仅关注诱导治疗阶段(至第12周),缺乏长期随访数据 | 评估古塞奇尤单抗在溃疡性结肠炎治疗中的临床疗效及其分子机制 | 中重度活动性溃疡性结肠炎患者 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | bulk RNA测序、单细胞RNA测序、流式细胞术、血清蛋白质组学分析 | NA | RNA测序数据、蛋白质组学数据、流式细胞术数据 | 313名患者参与随机分组,其中257例进行bulk RNA-seq,52例进行单细胞RNA-seq,30例进行流式细胞术分析,302例进行血清蛋白质组学分析 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 602 | 2026-03-25 |
Dynamic changes of the immune microenvironment in ovarian cancer following neoadjuvant chemotherapy
2026-Mar-23, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-026-03070-6
PMID:41872134
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研究论文 | 本研究通过分析单细胞RNA测序数据并结合体外和体内实验,揭示了卵巢癌新辅助化疗后前列腺素介导的免疫抑制微环境形成是化疗耐药的关键机制 | 首次系统揭示了前列腺素在卵巢癌新辅助化疗后免疫抑制微环境形成中的核心作用,并验证了联合使用顺铂和前列腺素特异性抑制剂可恢复CD8T细胞功能并提高疗效 | 研究主要基于已发表的单细胞测序数据,临床样本验证和前瞻性临床试验数据尚待补充 | 探索卵巢癌新辅助化疗后肿瘤微环境的动态变化及化疗耐药机制 | 高级别浆液性卵巢癌患者样本、卵巢癌细胞系及动物模型 | 单细胞组学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 基于已发表的高级别浆液性卵巢癌患者单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 603 | 2026-03-25 |
Giant cell tumor of bone inhibits osteoblastogenesis via WNT5B
2026-Mar-23, Journal of bone and mineral metabolism
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s00774-026-01713-3
PMID:41872383
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研究论文 | 本研究揭示了骨巨细胞瘤通过表达WNT5B抑制成骨细胞生成,从而拮抗骨形成 | 首次发现骨巨细胞瘤通过WNT5B抑制成骨细胞分化,扩展了对该肿瘤骨破坏机制的理解 | 研究主要基于体外细胞系实验,缺乏体内验证;样本来源有限,仅使用单一细胞系 | 探究骨巨细胞瘤对骨形成的影响机制 | 人骨巨细胞瘤细胞系(NCC-GCTB1-C1)和人脂肪来源干细胞(ADSCs) | 数字病理学 | 骨巨细胞瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组分析,CRISPR/Cas9基因敲除 | NA | RNA测序数据,空间转录组数据 | 使用人骨巨细胞瘤细胞系和人脂肪来源干细胞进行共培养实验 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium FFPE(针对骨巨细胞瘤石蜡切片进行空间转录组分析) |
| 604 | 2026-03-25 |
Tissue-restricted secondary TCR engagement drives the transition from stem-like to CD200+ Egr2hi arthritogenic Th17 cells
2026-Mar-23, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-026-02447-0
PMID:41872507
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和T细胞受体分析,揭示了关节炎致病性T17细胞的异质性及其向高度致病状态转变的关键调控机制 | 首次发现关节组织中限制性的次级TCR信号是驱动T17细胞从干细胞样状态向CD200+ Egr2hi高度致病状态选择性转变的关键决定因素,而非炎症信号的默认进程 | 研究基于小鼠自身免疫性关节炎模型,其在人体中的普适性仍需验证 | 探究自身免疫性关节炎中致病性T17细胞的异质性、发育轨迹及其增强致病性的机制 | 关节组织中的CD4 T细胞,特别是白介素-17产生的辅助T细胞和调节性T细胞 | 单细胞组学 | 自身免疫性关节炎 | 单细胞RNA测序,谱系追踪,T细胞受体库分析 | NA | 单细胞转录组数据,TCR序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 605 | 2026-03-25 |
kUncited referencesCo-localization analysis of spatial transcriptomics in ligand-receptor pairs from tumor microenvironment
2026-Mar-21, Critical reviews in oncology/hematology
DOI:10.1016/j.critrevonc.2026.105288
PMID:41871724
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综述 | 本文综述了基于空间转录组学的共定位分析在肿瘤微环境中配体-受体对研究中的应用、计算方法和未来前景 | 系统性地整合了空间原位信息以提升配体-受体对分析的准确性,并探讨了人工智能技术在该领域的应用潜力 | 作为一篇综述文章,未提出新的实验方法或模型,主要基于现有文献进行总结和展望 | 探讨空间转录组学共定位分析在识别肿瘤微环境中细胞间相互作用(特别是配体-受体对)中的应用价值 | 肿瘤微环境中的细胞间相互作用及配体-受体对 | 空间转录组学 | 肿瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 606 | 2026-03-25 |
Human Single-cell Atlas Analysis Reveals Heterogeneous Endothelial Signaling
2026-Mar-20, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzag025
PMID:41863304
|
研究论文 | 本研究通过整合超过三百万个单细胞RNA-seq数据,系统分析了15种人体组织中内皮细胞的异质性及其在细胞间通讯中的作用 | 首次在血管类型和组织微环境的双重背景下,系统研究内皮细胞异质性,并利用主题建模识别了组织特异性的细胞间通讯模式 | 研究依赖于现有单细胞RNA-seq数据集,可能受数据质量和覆盖范围的限制,且未进行实验验证 | 探究内皮细胞在不同组织和血管类型中的异质性及其微环境调控机制 | 人体15种组织中的内皮细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA-seq | 主题建模 | 单细胞RNA-seq数据 | 超过三百万个单细胞,来自15种人体组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 607 | 2026-03-25 |
Gene regulatory network determinants of rapid recall in human memory CD4+ T cells
2026-Mar-20, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117103
PMID:41865369
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研究论文 | 本文利用单核多组学测序技术,研究了人类记忆CD4+ T细胞快速回忆反应的基因调控网络机制 | 首次结合单核多组学测序(基因表达与染色质可及性)来动态分析CD4 T细胞激活响应,并识别出记忆相关转录因子(如MAF、PRDM1、RUNX2、SMAD3和KLF6)在快速回忆中的调控作用 | 未在摘要中明确提及具体局限性 | 探究人类记忆CD4+ T细胞快速回忆反应的基因调控网络决定因素 | 人类记忆CD4+ T细胞 | 单细胞组学 | 免疫介导疾病 | 单核多组学测序(基因表达与染色质可及性)、染色质免疫沉淀测序、单细胞RNA测序 | 基因调控网络重建 | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单核多组学测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 608 | 2026-03-25 |
Single-cell RNA sequencing reveals the characteristics of porcine viral diseases, development, and immune repertoires: Current status and challenges
2026-Mar-20, Infection, genetics and evolution : journal of molecular epidemiology and evolutionary genetics in infectious diseases
DOI:10.1016/j.meegid.2026.105929
PMID:41865947
|
综述 | 本文系统综述了单细胞RNA测序技术在猪研究中的应用进展,包括解码疾病机制、探索发育生物学和分析免疫学特征,并讨论了该技术面临的挑战与未来应用前景 | 首次系统性地从疾病机制、发育生物学和免疫学特征三个维度综述了scRNA-seq技术在猪研究中的应用,并分析了该领域特有的技术挑战(如猪参考基因组注释不完整) | 本文为综述文章,未涉及原始实验数据;技术挑战部分主要基于现有文献分析,未提出具体解决方案 | 总结scRNA-seq技术在猪病毒性疾病、发育和免疫研究中的应用现状,分析技术挑战并展望未来应用前景 | 猪(作为农业经济动物和人类疾病模型) | 单细胞组学 | 病毒性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 609 | 2026-03-25 |
Heterogeneity of lymphoid cells in PBMCs in the acute phase of SFTS: Single-cell transcriptome profiling
2026-Mar-19, Journal of biomedical research
IF:2.2Q3
DOI:10.7555/JBR.39.20250250
PMID:40685857
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和生物信息学分析,探讨了SFTS急性期淋巴细胞功能异常的机制以及糖皮质激素治疗对淋巴样细胞的影响 | 首次在SFTS急性期患者中应用单细胞转录组测序技术,系统性地揭示了淋巴样细胞的异质性及其在疾病进程中的作用,并评估了糖皮质激素治疗的免疫调节效果 | 样本量较小(仅16名参与者),且研究设计为观察性,未能进行随机对照试验以验证糖皮质激素治疗的最佳方案 | 阐明SFTS急性期免疫功能障碍的机制,并评估糖皮质激素治疗对淋巴样细胞功能的影响 | 健康志愿者和急性SFTS患者的外周血单个核细胞中的淋巴样细胞 | 数字病理学 | 病毒感染性疾病 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 16名参与者(3名健康志愿者和13名急性SFTS患者) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 捕获mRNA的3'端转录本 |
| 610 | 2026-03-25 |
IFN-I-Mediated Transcriptional Reprogramming Drives Myeloid-Skewed Hematopoiesis in Sickle Cell Anemia
2026-Mar-19, American journal of hematology
IF:10.1Q1
DOI:10.1002/ajh.70277
PMID:41853894
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和功能实验,揭示了镰状细胞贫血中I型干扰素信号驱动造血干细胞向髓系分化的转录重编程机制 | 首次发现镰状细胞贫血中I型干扰素信号异常激活导致造血干细胞转录重编程,并揭示其对G-CSF的意外响应性 | 研究主要基于体外实验和单细胞测序数据,体内验证和临床转化仍需进一步探索 | 阐明镰状细胞贫血中病理性髓系生成和慢性炎症的内在机制 | 镰状细胞贫血患者的造血干细胞和多能祖细胞 | 单细胞组学 | 镰状细胞贫血 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 611 | 2026-03-20 |
Single-cell RNA sequencing uncovers neutrophil clusters associated with autoimmune neuroinflammation
2026-Mar-18, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-026-03772-9
PMID:41851894
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 612 | 2026-03-25 |
Integrated single-cell and spatial analysis reveals context-dependent myeloid-T cell interactions in response to immune checkpoint blockade in head and neck cancer
2026-Mar-16, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-2300
PMID:41837744
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间组学数据,系统评估了头颈癌患者在接受免疫检查点阻断治疗后的肿瘤浸润免疫细胞间相互作用 | 结合Visium空间转录组学和CosMx SMI单细胞空间组学技术,首次揭示了头颈癌中髓系细胞与T细胞相互作用的上下文依赖性,并识别了新的ICB响应标记物 | 样本量相对有限(23例单细胞数据,8例空间数据),且主要基于生物信息学分析,需要进一步实验验证 | 评估头颈癌患者免疫检查点阻断治疗后的细胞间相互作用,以识别响应标记物和治疗靶点 | 头颈鳞状细胞癌患者的肿瘤浸润免疫细胞 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 蛋白质组学 | 生物信息学分析 | 单细胞RNA和蛋白质数据, 空间RNA-seq数据 | 23例患者的522,399个单细胞,以及8例接受ICB治疗患者的空间RNA-seq数据 | 10x Genomics, NanoString | 空间转录组学, 单细胞空间组学 | 10x Visium, CosMx SMI | Visium spot-based空间转录组学, CosMx SMI单细胞空间组学(包含64-plex蛋白质面板和1000基因RNA面板) |
| 613 | 2026-03-25 |
Size-Modulated Mesoderm-Endoderm Divergence and Myocardial Cavitation in Micropatterned Cardioids
2026-Mar-16, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202515661
PMID:41837870
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研究论文 | 本研究利用微图案化心脏类器官、CRISPR工程报告hiPSCs、深层组织成像和单细胞RNA测序,探索了中胚层-内胚层协同发育,揭示了尺寸调控对细胞组成、类器官腔化及信号互作的影响 | 整合微图案化心脏类器官与scRNA-seq技术,首次系统解析中胚层-内胚层互作在心脏发育中的协同作用,并发现微图案尺寸可调控类器官腔化模拟早期心腔形成 | 研究基于体外类器官模型,可能无法完全模拟体内胚胎发育的复杂微环境;scRNA-seq数据仅提供静态转录组快照 | 探究中胚层与内胚层在早期心脏发育中的协同发育机制及信号互作 | 人类诱导多能干细胞(hiPSCs)衍生的微图案化心脏类器官 | 发育生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、CRISPR基因编辑、深层组织成像 | 微图案化心脏类器官模型 | 单细胞转录组数据、成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 614 | 2026-03-25 |
Selective Impact on Regulatory T cell with Sustained Functional Phenotype by the IL-2 Mutein VIS171 in a Nonhuman Primate Model
2026-Mar-16, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons
IF:8.9Q1
DOI:10.1016/j.ajt.2026.03.007
PMID:41850490
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研究论文 | 本研究评估了IL-2突变体VIS171在非人灵长类动物模型中,与雷帕霉素联用,选择性扩增调节性T细胞(Tregs)并维持其功能表型的能力 | VIS171被设计为延长半衰期并增强对高表达三聚体IL-2受体的Tregs的选择性结合和扩增,结合雷帕霉素使用,在非人灵长类模型中实现了对Tregs的稳健、选择性和持久性扩增,同时不影响细胞毒性T淋巴细胞(CTLs) | 研究仅基于非人灵长类动物模型,未涉及人类临床试验,且样本量有限,长期效应和安全性需进一步验证 | 评估VIS171在非人灵长类动物中扩增Tregs并增强移植耐受性的策略 | 非人灵长类动物(恒河猴)的免疫细胞群体,特别是调节性T细胞(Tregs) | 免疫学 | 移植耐受 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 615 | 2026-03-25 |
Unannotated noncoding transcripts as a source of intratumor heterogeneity in malignant cell states
2026-Mar-16, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-025-3273-6
PMID:41870780
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研究论文 | 本研究通过分析单细胞RNA-seq数据,发现未注释的非编码转录本作为恶性细胞状态中肿瘤内异质性的来源 | 首次鉴定出数千个代表未注释转录本3'末端的poly(A)位点峰,并揭示其表达与恶性细胞状态的广泛关联,提出表观遗传激活这些转录本是肿瘤内异质性的新机制 | 研究主要基于3'标签单细胞RNA-seq数据,可能未全面覆盖所有转录本类型;功能实验仅针对两个非编码UPTs进行验证,需进一步扩展 | 探究肿瘤内异质性的分子机制,特别是未注释非编码转录本在恶性细胞状态多样性中的作用 | 12种常见癌症类型的单细胞RNA-seq数据,包括肺癌细胞系和肿瘤样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA-seq, 多组学数据整合 | NA | 单细胞RNA-seq数据, 多组学数据 | 覆盖12种常见癌症类型的单细胞RNA-seq队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 3'标签单细胞RNA-seq |
| 616 | 2026-03-25 |
IDH2 Clonal Hematopoiesis and IKAROS Loss Cooperate in a B-ALL Subtype after Lenalidomide Therapy for Multiple Myeloma
2026-03-13, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025031047
PMID:41824395
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研究论文 | 本研究对来那度胺治疗多发性骨髓瘤后相关的B细胞前体急性淋巴细胞白血病(LenB-ALL)进行了全面的分子特征分析,揭示了其独特的分子亚型 | 首次系统性地定义了IDH2突变型LenB-ALL这一独特的分子亚型,并揭示了来那度胺通过促进IDH2突变克隆性造血和下调IKAROS表达,协同导致B细胞前体阶段成熟停滞的发病机制 | 样本量相对有限(57例患者),且为观察性研究,需要更大规模的前瞻性研究验证 | 阐明来那度胺治疗多发性骨髓瘤后诱发继发性B-ALL的分子机制和特征 | 57例来那度胺相关B-ALL(LenB-ALL)患者 | 血液肿瘤学 | B细胞急性淋巴细胞白血病,多发性骨髓瘤 | 荧光激活细胞分选,单细胞RNA测序,转录组分析,DNA甲基化分析 | NA | 基因组数据,转录组数据,表观遗传数据,单细胞数据 | 57例LenB-ALL患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 617 | 2026-03-25 |
Spatial transcriptomics reveals altered communities and drivers of aberrant epithelia and pro-fibrotic fibroblasts in interstitial lung diseases
2026-Mar-11, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.101066
PMID:41576947
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研究论文 | 本研究利用单核RNA测序和空间转录组学技术,揭示了间质性肺疾病中远端肺的细胞网络变化,并识别了纤维化过程中的关键分子驱动因素 | 通过整合单核RNA测序和空间转录组学数据,首次全面描绘了间质性肺疾病中远端肺的细胞网络变化,并识别了异常上皮细胞和促纤维化成纤维细胞共定位的致病生态位 | NA | 探究间质性肺疾病中肺纤维化的细胞和分子机制 | 间质性肺疾病患者的远端肺组织 | 空间转录组学 | 间质性肺疾病 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 618 | 2026-03-25 |
AGPAT3 reshapes tumor cell vulnerability to IFNγ-mediated ferroptosis and enhances immunotherapy efficacy through lipid remodeling
2026-Mar-10, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013305
PMID:41807033
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研究论文 | 本研究揭示了IFN-γ通过IRF1上调AGPAT3表达,驱动脂质重塑并增强肿瘤细胞对铁死亡的敏感性,从而提升免疫检查点抑制剂疗效 | 首次发现IFN-γ-IRF1-AGPAT3轴通过脂质重塑调控铁死亡敏感性,并构建了基于铁死亡相关基因的机器学习模型预测免疫治疗反应 | 未明确AGPAT3在不同肿瘤类型中的普适性,且临床样本验证需进一步扩大 | 探究铁死亡在增强免疫检查点抑制剂疗效中的作用机制 | 肿瘤细胞、单细胞RNA测序数据集、临床患者样本 | 机器学习 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序、脂质组学、转录组学、ChIP-seq、CUT&Tag分析 | 机器学习预测模型 | 基因表达数据、脂质组数据、转录组数据 | 大规模单细胞RNA测序数据集及临床患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 619 | 2026-03-25 |
scGPT: end-to-end protocol for fine-tuned retinal cell type annotation
2026-03, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01220-1
PMID:40665101
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研究论文 | 本文提供了一个针对单细胞RNA测序数据中细胞类型分类的scGPT模型微调完整指南 | 提出了一套端到端的scGPT微调协议,实现了自动化数据处理、模型微调和评估,并在视网膜数据集上达到99.5%的F1分数 | 需要用户具备基本的生物信息学知识,对Python和Linux有最低要求 | 解决单细胞研究中高分辨率细胞类型注释的挑战,特别是针对大规模数据集和罕见细胞群体 | 单细胞RNA测序数据中的视网膜细胞类型 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序 | Transformer (scGPT) | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 620 | 2026-03-25 |
An integrative multi-omics study reveals glutamine metabolism dysregulation connecting Alzheimer's disease and age-related macular degeneration
2026-Mar, Journal of Alzheimer's disease : JAD
DOI:10.1177/13872877261418263
PMID:41603341
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研究论文 | 本研究采用整合多组学策略,揭示了谷氨酰胺代谢失调是连接阿尔茨海默病和年龄相关性黄斑变性的共同机制 | 首次通过整合孟德尔随机化、转录组学和靶向代谢组学,系统性地揭示了AD与AMD之间共享的谷氨酰胺代谢通路异常 | 研究主要基于动物模型(APP/PS1小鼠)和遗传推断数据,需要在人类临床样本中进行进一步验证 | 探索阿尔茨海默病与年龄相关性黄斑变性之间的共享代谢特征和通路 | 阿尔茨海默病(AD)和年龄相关性黄斑变性(AMD)两种神经退行性疾病 | 多组学整合分析 | 阿尔茨海默病, 年龄相关性黄斑变性 | 孟德尔随机化, 转录组学, 单细胞RNA测序, 靶向代谢组学 | 孟德尔随机化模型, 差异表达分析 | 遗传数据, 转录组数据, 代谢组数据 | APP/PS1小鼠模型(5月龄) | NA | 单细胞RNA-seq, 靶向代谢组学 | NA | NA |