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当前共找到 32755 篇文献，本页显示第 521 - 540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2025-11-14 |
Spatiotemporal gene expression and cellular dynamics of the developing human heart
2025-Nov, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02352-6
PMID:41162788
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研究论文 | 通过结合空间和单细胞转录组学技术，揭示了人类早期心脏发育的分子景观和细胞动态 | 首次提供了人类早期心脏发育的高分辨率转录组图谱，揭示了心脏起搏传导系统、心脏瓣膜和房间隔的形成机制，以及心脏间充质细胞的意外多样性 | 研究时间窗口仅限于孕后5.5至14周，可能无法覆盖心脏发育的完整过程 | 探索人类心脏发育过程中的基因表达时空模式和细胞动态 | 人类早期发育心脏组织 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 空间转录组学，单细胞RNA测序，成像验证 | NA | 空间转录组数据，单细胞转录组数据，图像数据 | 孕后5.5至14周的人类心脏发育样本 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 522 | 2025-11-14 |
Single-cell transcriptional decoding of iron deficiency responses in maize root tips
2025-Nov-01, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-025-03649-w
PMID:41175233
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序解析玉米根尖对铁缺乏胁迫的细胞类型特异性响应机制 | 首次在单细胞分辨率构建玉米根尖转录图谱，发现铁缺乏响应通过分布式调控网络协调，其中中柱作为转录调控枢纽整合信号 | 研究仅针对V3阶段初生根，未涵盖其他发育阶段或根区 | 解析玉米根尖对铁缺乏胁迫的细胞类型特异性响应机制 | 玉米根尖细胞 | 植物生物学 | 营养缺乏症 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 | NA | 基因表达数据 | 15,306个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 523 | 2025-11-14 |
Osteoarthritis year in review 2025: Genetics, genomics, and epigenetics
2025-Nov, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2025.08.004
PMID:40848985
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综述 | 本文回顾了2024-2025年间骨关节炎在遗传学、基因组学和表观遗传学领域的研究进展 | 整合了迄今最大规模的骨关节炎遗传学研究，并融合了染色质可及性图谱、单细胞RNA测序和空间转录组学等多种方法 | 仅关注顶级风湿病学期刊的出版物，可能遗漏其他重要研究 | 总结骨关节炎在遗传学、基因组学和表观遗传学领域的最新研究进展 | 骨关节炎相关研究文献 | 基因组学 | 骨关节炎 | 文献检索与综述 | NA | 文献数据 | 从2240篇文献中筛选出42篇进行重点讨论 | NA | 染色质可及性图谱,单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 524 | 2025-11-14 |
Multi-modal spatial characterization of tumor immune microenvironments identifies targetable inflammatory niches in diffuse large B cell lymphoma
2025-Nov, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02353-5
PMID:41120574
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研究论文 | 本研究通过多模态空间技术分析弥漫性大B细胞淋巴瘤的肿瘤免疫微环境，识别出七个不同的细胞生态位 | 首次结合空间转录组学、蛋白质组学和基因组分析，系统描绘DLBCL肿瘤免疫微环境的细胞生态位结构 | 样本量相对有限（78个肿瘤），且主要关注DLBCL特定亚型 | 揭示弥漫性大B细胞淋巴瘤肿瘤免疫微环境的细胞组成和空间组织结构 | 78个弥漫性大B细胞淋巴瘤肿瘤样本 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 基因组分析 | NA | 空间转录组数据, 蛋白质组数据, 基因组数据 | 78个DLBCL肿瘤样本 | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 525 | 2025-11-14 |
Integrated Multiomics Analysis and Mendelian Randomization Identify SIRT1 as a Pivotal Aging-Associated Gene in Meningioma
2025-Nov, IUBMB life
IF:3.7Q2
DOI:10.1002/iub.70072
PMID:41208649
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析和孟德尔随机化方法，揭示了SIRT1作为脑膜瘤中与衰老相关的关键基因 | 首次将衰老相关基因与脑膜瘤发病机制联系起来，并通过多种算法和单细胞RNA测序验证了SIRT1的关键作用 | 研究主要基于公共数据库的转录组数据集，需要进一步实验验证 | 探索脑膜瘤中与衰老相关的分子机制 | 脑膜瘤组织和健康组织 | 生物信息学 | 脑膜瘤 | 转录组测序,单细胞RNA测序,qRT-PCR,Western blot | LASSO,SVM,MCODE,ssGSEA | 基因表达数据,单细胞数据 | 多个GEO数据集(GSE43290,GSE54934,GSE77259,GSE183655) | NA | 单细胞RNA-seq,转录组测序 | NA | NA |
| 526 | 2025-11-14 |
Img2ST-Net: efficient high-resolution spatial omics prediction from whole-slide histology images via fully convolutional image-to-image learning
2025-Nov, Journal of medical imaging (Bellingham, Wash.)
DOI:10.1117/1.JMI.12.6.061410
PMID:41210922
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研究论文 | 提出Img2ST-Net框架，通过全卷积图像到图像学习从全切片组织学图像高效预测高分辨率空间转录组数据 | 将高分辨率空间转录组数据建模为超像素表示，将任务重新定义为具有数百或数千个输出通道的超内容图像生成问题，并引入专门针对高分辨率ST分析的SSIM-ST评估指标 | NA | 开发能够从常规组织学图像高效预测高分辨率空间转录组数据的计算方法 | 乳腺癌和结直肠癌数据集 | 计算机视觉 | 乳腺癌,结直肠癌 | 空间转录组学 | 全卷积网络 | 图像 | 两个公共Visium HD数据集 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium HD | 8μm和16μm分辨率的Visium HD平台 |
| 527 | 2025-11-14 |
A machine learning framework using urinary biomarkers for pancreatic ductal adenocarcinoma prediction with post hoc validation via single-cell transcriptomics
2025-Nov-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf583
PMID:41212589
|
研究论文 | 开发基于尿液生物标志物和人口统计学数据的机器学习框架用于胰腺导管腺癌预测，并通过单细胞转录组学进行验证 | 首次结合尿液生物标志物与人口统计学数据构建PDAC预测模型，并利用单细胞RNA测序验证生物标志物的表达特征 | 需要不同数据集验证框架的普适性，尚未整合其他组学数据 | 开发早期准确诊断胰腺导管腺癌的预测工具 | 胰腺导管腺癌患者尿液生物标志物和人口统计学数据 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 机器学习, 深度学习 | 深度学习, 机器学习 | 基因表达数据, 人口统计学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 528 | 2025-11-14 |
ProjectSVR: mapping single-cell RNA-seq data to reference atlases by supported vector regression
2025-Nov-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf586
PMID:41212590
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研究论文 | 提出基于支持向量回归的单细胞RNA测序数据参考图谱映射方法ProjectSVR | 将参考图谱映射重新定义为多目标回归任务，采用集成支持向量回归方法实现平台无关和集成独立的映射 | 需要依赖构建良好的参考图谱，在参考图谱质量不佳时可能影响映射效果 | 开发单细胞RNA测序数据到参考图谱的映射方法 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 支持向量回归(SVR) | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 529 | 2025-11-14 |
Injury-induced connexin 43 expression regulates endothelial wound healing
2025-Nov-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00153.2025
PMID:41060772
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研究论文 | 本研究探讨了连接蛋白43在血管内皮细胞损伤修复中的调控作用 | 首次证明机械性损伤会诱导大动脉内皮细胞表达连接蛋白43，并揭示其通过调控细胞迁移和增殖促进伤口愈合的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 阐明连接蛋白43在内皮细胞损伤修复中的分子机制 | 小鼠颈动脉内皮细胞 | 分子生物学 | 血管疾病 | RNA-seq，单细胞RNA-seq，基因敲除，点突变 | 基因敲除小鼠模型，点突变小鼠模型 | 基因表达数据，蛋白质表达数据 | 10,829个细胞（来自野生型和Cx43敲除小鼠颈动脉） | NA | RNA-seq，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 530 | 2025-11-14 |
A Review of Regulation of Leaf Margin Development: Integrating Genetic, Hormonal, and Environmental Controls
2025 Nov-Dec, Physiologia plantarum
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/ppl.70627
PMID:41219798
|
综述 | 本文综述了叶片边缘发育的调控机制，整合了遗传、激素和环境控制因素 | 整合了发育与环境视角，提供了叶片形态多样性的概念框架，并指出空间转录组学和基因组编辑等新兴工具的应用前景 | 作为综述文章，不包含原始实验数据，主要基于已有研究进行综合分析和讨论 | 探讨叶片边缘发育的调控机制及其在植物适应和作物改良中的潜在应用 | 叶片边缘形态发育过程及相关调控因子 | 植物发育生物学 | NA | 空间转录组学、基因组编辑 | NA | 文献资料 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 531 | 2025-11-14 |
Swimming Through Dendritic Cell Biology: Insights From Fish Models
2025-Nov, Immunological reviews
IF:7.5Q1
DOI:10.1111/imr.70067
PMID:41222184
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综述 | 本文总结了鱼类树突状细胞的研究进展，特别关注斑马鱼模型在揭示树突状细胞进化起源和功能多样性方面的价值 | 整合进化免疫学与单细胞转录组学技术，系统揭示鱼类特有树突状细胞群体的进化保守性和物种特异性特征 | 主要依赖斑马鱼模型，其他鱼类树突状细胞研究相对缺乏 | 探索树突状细胞在非哺乳类脊椎动物中的进化发展和免疫功能 | 鱼类树突状细胞，特别是斑马鱼模型中的树突状细胞群体 | 免疫学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 532 | 2025-11-14 |
Distinct Layer 6b transcriptomic subtypes parcellate the cortical mantle
2025-Nov, Progress in neurobiology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.pneurobio.2025.102841
PMID:41083138
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、多重荧光原位杂交和单细胞空间转录组学技术，全面表征了大脑皮层第6b层神经元的细胞类型特性、分子异质性和空间分布 | 发现了多个具有独特分子特征的L6b亚型，并首次提供了迄今为止最广泛的L6b亚型空间分布图谱，揭示了L6b亚型在大脑皮层中的拼图式分布模式 | NA | 解析L6b神经元的细胞类型特异性特征和空间组织模式 | 大脑皮层第6b层神经元 | 空间转录组学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序, 多重荧光原位杂交, 单细胞空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 450,496个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 533 | 2025-11-14 |
Collection of Human Follicular Fluid, Follicle Somatic Cells, and Immature Oocytes from Individuals Undergoing In Vitro Fertilization
2025-Oct-24, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/69122
PMID:41212768
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研究论文 | 本文提出了一种从接受体外受精个体中系统收集和处理卵泡内容物的标准化方案 | 开发了无需酶解剥离的卵丘细胞分离方法，保持转录组完整性；建立了从新鲜卵泡液中制备单细胞悬液用于单细胞RNA测序的逐步方案 | NA | 利用废弃的生殖组织进行人类生育力和生殖生物学的转化研究 | 人类卵巢卵泡内容物，包括卵泡液、卵母细胞、卵丘细胞和体细胞 | 生殖生物学 | 生育障碍 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq)，体外成熟培养 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 534 | 2025-11-14 |
Exploring Sex Differences in Type 2 Diabetes via a Male-Dominant Beta-Cell Cluster from Single-Cell Pancreatic Sequencing of Public Datasets
2025-Oct, Endocrinology and metabolism (Seoul, Korea)
DOI:10.3803/EnM.2025.2297
PMID:40389209
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研究论文 | 通过分析公共单细胞数据集发现男性主导的β细胞簇，揭示2型糖尿病性别差异的分子机制 | 首次在2型糖尿病患者中鉴定出男性主导的β细胞亚群，该亚群具有独特的基因表达模式和细胞通讯特征 | 基于公共数据集进行二次分析，样本来源和数量受原始数据限制 | 探索2型糖尿病性别差异的分子基础 | 2型糖尿病患者的胰腺β细胞 | 单细胞基因组学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序，轨迹推断，差异基因表达分析，基因集富集分析，细胞通讯分析 | NA | 单细胞RNA测序数据，批量RNA测序数据 | 来自四个公共数据集的2型糖尿病患者胰腺样本 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 535 | 2025-11-14 |
Expression of marker genes to assess the spermatogenic capacity in patients with idiopathic non-obstructive azoospermia
2025-Oct, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-025-03584-5
PMID:40681857
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研究论文 | 本研究开发了一种基于单细胞RNA测序的定量方法，用于评估特发性非梗阻性无精子症患者的睾丸生精能力 | 利用单细胞RNA测序技术开发了生精能力评分系统，并鉴定了与生精潜能相关的关键基因标记物 | 样本量相对较小（18名iNOA患者），需要在更大群体中进一步验证 | 开发评估特发性非梗阻性无精子症患者睾丸生精能力的可靠定量方法 | 特发性非梗阻性无精子症患者 | 单细胞测序分析 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR | 模糊聚类, 基因表达趋势分析 | 单细胞基因表达数据 | 18名iNOA患者，近4000个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 536 | 2025-11-14 |
Hepatocyte-Specific MET Deletion Exacerbates Acetaminophen-Induced Hepatotoxicity in Mice
2025-Sep-30, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2025.09.010
PMID:41038273
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研究论文 | 本研究通过肝细胞特异性MET基因敲除小鼠模型，揭示了MET在乙酰氨基酚诱导肝损伤中的保护作用机制 | 首次阐明MET在乙酰氨基酚肝损伤模型中的具体作用机制，发现MET通过抑制JNK线粒体转位和细胞死亡信号通路减轻肝毒性 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性仍需进一步验证 | 明确MET在乙酰氨基酚诱导肝损伤中的具体作用机制 | 肝细胞特异性MET基因敲除小鼠和乙酰氨基酚肝损伤模型 | 分子病理学 | 药物性肝损伤 | RNA测序,免疫印迹,单核RNA测序,空间转录组学 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,蛋白质表达数据 | 基因敲除小鼠模型及人类急性肝衰竭患者数据 | NA | RNA测序,单核RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 537 | 2025-11-14 |
Tick Extracellular Vesicles Alter Epidermal Keratinocyte Function
2025-Sep-05, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.08.037
PMID:40915408
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研究论文 | 本研究揭示蜱类通过细胞外囊泡改变表皮角质形成细胞功能，破坏皮肤伤口愈合机制以维持吸血行为的策略 | 首次发现蜱类通过细胞外囊泡调控宿主伤口愈合通路的新机制，涉及PI3K活性、角质形成细胞GF1和TGF-β水平的改变 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，在人类系统中的适用性需要进一步验证 | 探索吸血节肢动物如何通过细胞外囊泡调控宿主伤口愈合机制以维持吸血生存 | 三种医学相关蜱种（包括肩板硬蜱）及其与宿主表皮角质形成细胞的相互作用 | 分子生物学 | 节肢动物传播疾病 | 单细胞RNA测序, 小鼠遗传学, 体外划痕实验 | NA | 基因表达数据, 细胞功能数据 | 野生型动物模型和体外角质形成细胞培养 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 538 | 2025-11-14 |
Squidiff: Predicting cellular development and responses to perturbations using a diffusion model
2025-Aug-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.16.623974
PMID:40909548
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研究论文 | 提出基于扩散模型的生成框架Squidiff，用于预测细胞在不同环境变化下的转录组变化 | 首次将扩散模型应用于预测细胞转录组变化，能够学习瞬态细胞状态并预测高分辨率转录组景观 | NA | 预测细胞在环境变化下的转录组变化，促进精准医学发展 | 细胞分化、基因扰动、药物反应、血管类器官发育、中子辐射和生长因子反应 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 扩散模型 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 539 | 2025-11-14 |
CD38+ Endothelial Remodeling Defines Spatially Diverse Vasculopathy Programs in Rapidly Advancing Oral Inflammation
2025-Aug-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.29.667333
PMID:40766487
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间蛋白质组学揭示了快速进展性口腔炎症中CD38+内皮细胞重塑的空间特异性血管病变模式 | 首次发现CD38+内皮细胞在快速进展性口腔炎症中的空间特异性重塑模式，并开发了三重空间分析方法 | 样本量相对有限，需要更大规模研究验证 | 揭示快速进展性口腔炎症的细胞机制和空间结构特征 | 种植体周围炎和重度牙周炎患者的口腔组织样本 | 单细胞生物学 | 口腔炎症疾病 | 单细胞RNA测序, 空间蛋白质组学, 激光捕获显微切割, 微生物组分析 | NA | 单细胞转录组数据, 空间蛋白质组数据, 微生物组数据 | 总计59个样本，包括36个scRNA-seq样本(121,395个细胞)，15个空间蛋白质组学样本(337,260个细胞)，8个黏膜活检样本(225,137个细胞) | NA | 单细胞RNA测序, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 540 | 2025-11-14 |
CellSP: Module discovery and visualization for subcellular spatial transcriptomics data
2025-Apr-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.12.632553
PMID:39868198
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研究论文 | 提出CellSP计算框架，用于识别、可视化和表征亚细胞空间转录组数据中的功能相关模式 | 引入“基因-细胞模块”新概念，能够识别多个细胞中具有协调亚细胞转录分布模式的基因集 | NA | 开发用于亚细胞空间转录组数据分析的计算工具 | 小鼠脑组织、肾脏癌和健康样本、阿尔茨海默病小鼠模型 | 空间转录组学 | 肾脏癌,阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | 计算框架 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |