单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 5201 - 5220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5201 | 2025-10-06 |
Imputation for Single-cell RNA-seq Data with Non-negative Matrix Factorization and Transfer Learning
2023-12, Journal of bioinformatics and computational biology
IF:0.9Q4
DOI:10.1142/S0219720023500294
PMID:38248911
|
研究论文 | 提出一种结合非负矩阵分解和迁移学习的方法来填补单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 首次将迁移学习与非负矩阵分解相结合用于scRNA-seq数据填补，通过引入图正则化项和迁移项来保持数据固有几何结构并提高表达值估计精度 | NA | 开发更准确的单细胞RNA测序数据填补方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解, 迁移学习 | 基因表达矩阵 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5202 | 2025-10-06 |
Enhanced microglial dynamics and paucity of tau seeding in the amyloid plaque microenvironment contributes to cognitive resilience in Alzheimer's disease
2023-Jul-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.27.550884
PMID:37546928
|
研究论文 | 研究无症状阿尔茨海默病患者大脑中淀粉样斑块微环境的特征及其与认知弹性的关系 | 首次发现无症状AD患者斑块微环境中小胶质细胞具有高效肌动蛋白运动机制和tau蛋白播种活性降低的特征 | 基于尸检样本的回顾性研究，无法确定因果关系 | 探究阿尔茨海默病认知弹性的潜在机制 | 无症状阿尔茨海默病患者的尸检脑组织 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | 组织样本，转录组数据 | 无症状AD患者尸检脑组织队列 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5203 | 2025-10-06 |
Kidney diseases and single-cell sequencing research: a bibliometric analysis from 2015 to 2024
2025-Dec, Renal failure
IF:3.0Q1
DOI:10.1080/0886022X.2025.2521457
PMID:40545992
|
文献计量分析 | 对2015-2024年间肾脏疾病与单细胞测序研究的文献计量分析 | 首次系统分析肾脏疾病单细胞测序领域的研究格局和新兴趋势 | 仅基于Web of Science数据库，可能存在文献收录不全的局限性 | 评估单细胞RNA测序在肾脏疾病研究中的应用现状和发展趋势 | 肾脏疾病研究领域的科学出版物 | 生物信息学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 文献元数据 | 1,210篇出版物，涉及8,984位作者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5204 | 2025-10-06 |
Deciphering the Regulatory Networks of the Migrasome-Associated Cell Subpopulation in Heterotopic Ossification via Multi-Omics Analysis
2025-Jun-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202500965R
PMID:40540299
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示异位骨化中迁移体相关细胞亚群的调控网络 | 首次识别出间充质谱系细胞作为关键的迁移体相关细胞亚型，并确定Ppib和Tagln为关键分子，构建了其调控网络和空间分布模式 | 研究主要基于公共数据库数据，实验验证可能有限 | 阐明异位骨化的关键生物分子网络和调控机制 | 异位骨化组织样本 | 生物信息学 | 异位骨化 | 单细胞转录组测序, 批量转录组测序, 空间转录组测序, 多组学分析 | 高维加权基因共表达网络分析, 机器学习 | 转录组数据, 空间转录组数据 | 来自GEO数据库的多个数据集和临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 5205 | 2025-10-06 |
Integrating Single-Cell and Experimental Analyses Uncover Macrophage Ferroptosis Is a Key Event in the Development of Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2025-Jun-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202501120R
PMID:40542598
|
研究论文 | 通过整合单细胞测序和实验分析，揭示巨噬细胞铁死亡是慢性阻塞性肺疾病发展的关键事件 | 首次结合单细胞测序和实验验证，系统阐明香烟烟雾通过诱导巨噬细胞铁死亡促进COPD发展的机制 | 研究主要基于公共数据库和小鼠模型，需要进一步人类样本验证 | 探究香烟烟雾诱导的巨噬细胞铁死亡在COPD发病机制中的作用 | COPD患者肺组织、RAW264.7细胞系、BMDM细胞、COPD小鼠模型 | 单细胞生物学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 免疫组化, qRT-PCR, western blotting | NA | 单细胞测序数据, 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 公共数据库GSE171541和GSE173896的单细胞数据，体外和体内细胞系实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5206 | 2025-10-06 |
Imbalances in adrenal hormones and their effects on bone metabolism
2025-Jun-21, Endocrine journal
IF:1.3Q4
DOI:10.1507/endocrj.EJ25-0117
PMID:40545362
|
综述 | 探讨肾上腺激素失衡对骨代谢的影响及其机制 | 通过现代类固醇分析和单细胞转录组技术揭示多种激素共同作用机制，并关注年龄相关激素变化对骨骼的影响 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据验证 | 系统阐述肾上腺激素失衡与骨代谢异常的关联机制 | 肾上腺激素失衡相关的病理状态（自主皮质醇分泌、原发性醛固酮增多症、嗜铬细胞瘤/副神经节瘤）及年龄相关激素变化 | 内分泌代谢研究 | 骨质疏松症 | 类固醇分析，单细胞转录组分析 | NA | 文献资料 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5207 | 2025-10-06 |
Quantitative measurement of phenotype dynamics during cancer drug resistance evolution using genetic barcoding
2025-Jun-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59479-7
PMID:40541962
|
研究论文 | 提出一种通过遗传谱系追踪和种群规模数据推断癌症耐药性动态的数学框架 | 无需直接测量耐药表型即可推断耐药性动态的数学框架 | 未直接测量耐药表型，依赖推断方法 | 理解癌症耐药性进化机制 | 结直肠癌细胞系SW620和HCT116 | 计算生物学 | 结直肠癌 | 遗传条形码技术、单细胞RNA测序、单细胞DNA测序 | 数学框架 | 遗传谱系追踪数据、种群规模数据 | 两种结直肠癌细胞系 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞DNA测序 | NA | NA |
| 5208 | 2025-10-06 |
ISCU-p53 axis orchestrates macrophage polarization to dictate immunotherapy response in esophageal squamous cell carcinoma
2025-Jun-20, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07787-7
PMID:40541964
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示食管鳞状细胞癌中ISCU-p53轴通过调控巨噬细胞极化影响免疫治疗反应的机制 | 首次发现ISCU通过胞质滞留p53促进M2巨噬细胞极化的新机制，并证明靶向ISCU可增强抗PD-1抗体疗效 | NA | 探索食管鳞状细胞癌免疫治疗反应差异的分子机制 | 食管鳞状细胞癌患者的肿瘤微环境细胞 | 单细胞生物学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 接受PD-1抑制剂治疗的部分缓解、疾病稳定患者及未接受术前治疗的手术患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5209 | 2025-10-06 |
The critical role of PDGFRa + Sca1 + fibroblasts in angiogenesis and vascular repair in the corpus cavernosum
2025-Jun-20, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04434-y
PMID:40542354
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了阴茎海绵体中PDGFRa+Sca1+成纤维细胞在血管生成和修复中的关键作用 | 首次发现并鉴定了一个独特的PDGFRa+Sca1+成纤维细胞亚群，该亚群具有分化为内皮细胞和平滑肌细胞的潜力，并参与血管修复过程 | 研究主要基于动物模型，尚未在人类样本中得到验证 | 探究成纤维细胞在勃起功能障碍发病机制中的作用 | 糖尿病性ED和海绵体神经损伤性ED动物模型中的阴茎海绵体组织 | 单细胞生物学 | 勃起功能障碍 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据 | ED动物模型组织 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5210 | 2025-10-06 |
Human induced neural progenitor cells generated from three-dimensional aggregate-based culture significantly improve post-stroke recovery in tMCAO mice
2025-Jun-20, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04433-z
PMID:40542444
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于3D聚集体培养的高效诱导神经祖细胞生产方法，并验证其在脑卒中小鼠模型中的治疗效果 | 开发了可扩展的3D悬浮培养系统，避免了有害的细胞解离和重铺过程，并通过单细胞RNA测序揭示了iNPC的亚群特征 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未进行人体临床试验 | 开发高效的iNPC生产方法并评估其在脑卒中恢复中的治疗潜力 | 诱导多能干细胞来源的神经祖细胞和tMCAO小鼠模型 | 再生医学 | 脑卒中 | 单细胞RNA测序，3D细胞培养 | NA | 基因表达数据，细胞表型数据 | 3个iPSC细胞系，tMCAO小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5211 | 2025-10-06 |
Integrating multi-omics data to optimize immunotherapy in endometrial cancer: a comprehensive study
2025-Jun-20, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02978-2
PMID:40540226
|
研究论文 | 通过整合多组学数据研究子宫内膜癌患者对免疫治疗反应的分子机制和肿瘤微环境特征 | 首次综合运用多组学数据和多种计算框架系统分析子宫内膜癌免疫治疗反应差异，特别关注肿瘤相关巨噬细胞亚型的作用 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 优化子宫内膜癌免疫治疗策略 | 子宫内膜癌患者 | 生物信息学 | 子宫内膜癌 | 多组学分析,单细胞RNA测序,体细胞突变分析,拷贝数变异分析 | TIDE,EaSIeR,ImmunoPhenoScore,ESTIMATE,TIMER,EPIC,Scissor算法 | 基因组学数据,转录组学数据,单细胞测序数据 | 来自公共数据库的子宫内膜癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 5212 | 2025-10-06 |
Sequence Diversity and Encoded Enzymatic Differences of Monocistronic L1 ORF2 mRNA Variants in the Aged Normal and Alzheimer's Disease Brain
2025-Jun-18, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.2298-24.2025
PMID:40368603
|
研究论文 | 本研究通过功能分析和长读长测序揭示了阿尔茨海默病和正常衰老大脑中L1逆转录转座子ORF2 mRNA的序列多样性及其编码的酶活性差异 | 首次在大脑中发现大量单顺反子ORF2 mRNA变体，其序列多样性远超人类参考基因组，并证实这些变体具有不同的逆转录酶和核酸内切酶活性 | 样本量相对有限（31个大脑样本），且主要关注大脑皮层区域 | 探究人类大脑中内源性逆转录酶活性的来源和L1 mRNA的多样性 | 阿尔茨海默病患者和正常衰老捐赠者的大脑皮层样本 | 基因组学 | 阿尔茨海默病 | PacBio HiFi长读长测序, 空间转录组学, 酶功能分析 | NA | RNA序列数据, 酶活性数据, 空间表达数据 | 31个大脑样本（阿尔茨海默病和正常衰老捐赠者，包含两性） | PacBio | 长读长测序, 空间转录组学 | PacBio HiFi | PacBio HiFi长读长测序技术 |
| 5213 | 2025-10-06 |
In mice, discrete odors can selectively promote the neurogenesis of sensory neuron subtypes that they stimulate
2025-Jun-18, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.96152
PMID:40531183
|
研究论文 | 研究发现特定气味能选择性促进小鼠嗅觉感觉神经元亚型的神经发生 | 首次证明离散气味能特异性加速对其敏感的嗅觉神经元亚型的生成速率 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在其它哺乳动物验证 | 探究嗅觉刺激如何影响特定嗅觉感觉神经元亚型的神经发生 | 小鼠嗅觉感觉神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 亚型特异性神经元出生日期标记 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5214 | 2025-10-06 |
The spatial and single-cell landscape of skin: Charting the multiscale regulation of skin immune function
2025-06, Seminars in immunology
IF:7.4Q1
DOI:10.1016/j.smim.2025.101958
PMID:40267702
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序和空间转录组学技术在揭示皮肤免疫系统多尺度异质性方面的应用 | 整合单细胞和空间技术系统解析皮肤免疫景观的多尺度调控机制 | NA | 探讨皮肤免疫功能的分子和细胞特征及其空间调控机制 | 皮肤组织中的先天性和适应性免疫细胞 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5215 | 2025-10-06 |
Selective inhibition of stromal mechanosensing suppresses cardiac fibrosis
2025-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08945-9
PMID:40307543
|
研究论文 | 本研究通过抑制基质机械感受机制联合TGFβ通路调控，实现心脏成纤维细胞向静息状态的转化并缓解心脏纤维化 | 首次发现SRC激酶作为成纤维细胞富集的机械感受器，联合抑制SRC机械感受与TGFβ信号可产生协同抗纤维化效应 | 研究主要基于小鼠模型和工程化心脏组织，尚未在人类临床试验中验证 | 开发治疗心血管纤维化的机械治疗策略 | 心脏成纤维细胞和肌成纤维细胞 | 分子细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞测序分析，药理学抑制，工程化心脏组织模型 | 小鼠心力衰竭模型 | 转录组数据，形态学数据，代谢数据 | 公共人类和小鼠单细胞测序数据集的荟萃分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5216 | 2025-10-06 |
Low-dose interleukin-2 induces clonal expansion of BACH2-repressed effector regulatory T cells following acute coronary syndrome
2025-Jun, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-025-00652-y
PMID:40461772
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和T细胞受体分析，揭示低剂量IL-2在急性冠脉综合征患者中诱导效应调节性T细胞克隆性扩张的机制 | 首次发现低剂量IL-2能克隆性扩张BACH2抑制的效应调节性T细胞，并揭示其绕过BACH2调控的机制 | 研究样本量有限，需要更大规模研究验证 | 探索低剂量IL-2对急性冠脉综合征患者T细胞免疫调节的作用机制 | 急性冠脉综合征患者的T细胞 | 免疫学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序, T细胞受体分析 | NA | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据 | 急性冠脉综合征患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5217 | 2025-10-06 |
NKG7 is a Stable Marker of Cytotoxicity Across Immune Contexts and Within the Tumor Microenvironment
2025-Jun, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202551885
PMID:40538191
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序图谱全面分析免疫细胞毒性，发现NKG7是比传统标志物更可靠的细胞毒性稳定标志物 | 首次系统证明NKG7在多种免疫环境和肿瘤微环境中作为细胞毒性的稳定标志物，其可靠性超过传统标志物GZMB和PRF1 | 主要基于公开数据库的单细胞RNA测序数据，缺乏实验验证和功能机制研究 | 探索细胞毒性免疫反应的新型可靠标志物 | 免疫细胞亚群和组织中的细胞毒性功能 | 生物信息学 | 肿瘤免疫 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 大型公开单细胞RNA测序图谱数据库 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5218 | 2025-10-06 |
Multitissue single-cell analysis reveals differential cellular and molecular sensitivity between fructose and high-fat high-sucrose diets
2025-May-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115690
PMID:40349341
|
研究论文 | 通过多组织单细胞分析比较果糖和高脂高糖饮食对代谢综合征的细胞和分子敏感性差异 | 首次在多组织水平系统比较不同饮食模式的细胞类型特异性反应，发现mt-Rnr2作为共同调节因子通过刺激产热缓解代谢综合征 | 研究仅基于小鼠模型，人类相关性需进一步验证 | 阐明不同饮食诱导代谢综合征的组织和细胞类型特异性作用机制 | 小鼠的下丘脑、肝脏、脂肪组织和小肠 | 单细胞组学 | 代谢综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个组织的小鼠样本（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5219 | 2025-10-06 |
Immunosuppressive microenvironment of liver restrains chemotherapeutic efficacy in triple-negative breast cancer
2025-Mar-06, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010871
PMID:40050043
|
研究论文 | 本研究揭示了三阴性乳腺癌肝转移灶化疗疗效减弱的免疫微环境机制 | 首次通过单细胞RNA测序比较肝转移灶与原发灶免疫微环境差异，发现巨噬细胞活化不足导致CD8+T细胞浸润受阻是肝转移灶化疗耐药的关键机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床样本验证有限；免疫抑制机制可能涉及更多未探索的细胞类型和信号通路 | 探究三阴性乳腺癌肝转移灶化疗疗效减弱的免疫微环境机制 | 三阴性乳腺癌肝转移灶和原发灶的肿瘤微环境 | 单细胞测序分析 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学，伤口愈合实验，集落形成实验，流式细胞术 | 小鼠肿瘤模型 | 单细胞RNA测序数据，组织切片图像，流式细胞数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5220 | 2025-10-06 |
Decoding the blueprints of embryo development with single-cell and spatial omics
2025-03, Seminars in cell & developmental biology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.semcdb.2025.01.002
PMID:39889540
|
综述 | 深入探讨单细胞和空间组学技术在胚胎发育研究中的最新进展与应用前景 | 系统梳理单细胞测序技术和空间转录组学在胚胎发育研究中的独特优势与创新应用策略 | NA | 解析胚胎发育过程中细胞分化和形态发生的分子机制 | 胚胎发育过程 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序, 空间转录组学, 多组学技术 | NA | 转录组数据, 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |