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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2026-01-09 |
YAP Overcomes Mechanical Barriers to Induce Mitotic Rounding and Adult Cardiomyocyte Division
2025-Jan-07, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究探讨了YAP5SA如何克服机械障碍,诱导成年心肌细胞进行有丝分裂圆化和分裂 | 揭示了YAP5SA通过克服心肌微环境的机械约束,促进成年心肌细胞重新进入细胞周期并进行分裂的新机制 | 研究主要基于YAP5SA过表达模型,可能未完全反映生理条件下的调控机制 | 探究成年哺乳动物心肌细胞细胞周期停滞的维持机制及YAP诱导的再进入机制 | 成年哺乳动物心肌细胞 | 细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、克隆分析、标记基因分析 | NA | RNA测序数据、功能研究数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 422 | 2026-01-09 |
Stem Cell Niche: iPSC-Based Assembloids for Modeling Human Hematopoiesis
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/7651_2025_629
PMID:40459837
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研究论文 | 本文介绍了一种基于诱导多能干细胞生成模拟骨髓微环境的3D组装体协议,用于研究人类造血调控和疾病建模 | 开发了患者特异性3D骨髓模拟组装体,可精确控制细胞组成和遗传背景,成功模拟了骨髓增殖性肿瘤的关键特征 | NA | 研究人类造血调控机制和骨髓微环境重塑 | 诱导多能干细胞、人类原代间充质基质细胞、骨髓模拟3D组装体 | 数字病理学 | 骨髓增殖性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 423 | 2026-01-09 |
High-resolution single-cell RNA sequencing using canFam4 reveals novel immune subsets and checkpoint programs in healthy dogs
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1680437
PMID:41488614
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研究论文 | 本研究利用10x Genomics平台和canFam4基因组,通过单细胞RNA测序构建了健康小型犬外周白细胞的单细胞图谱,揭示了新的免疫亚群和检查点程序 | 首次使用canFam4基因组进行高分辨率单细胞RNA测序,识别出51个独特的免疫亚群,包括在canFam3.1研究中未被充分代表的细胞类型,并揭示了免疫检查点机制在健康犬免疫稳态中的作用 | 研究仅基于六只健康小型犬,样本量较小,且未涵盖不同品种或健康状况的犬只,可能限制结果的普遍性 | 旨在通过单细胞RNA测序高分辨率分析健康犬的免疫异质性,识别新的免疫亚群并功能表征免疫检查点程序 | 六只健康小型犬的外周白细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 六只健康小型犬,共30,040个高质量转录组 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics平台用于单细胞RNA测序 |
| 424 | 2026-01-09 |
Pan-Cancer Analysis of Enhancer-Induced PAN3-AS1 and Experimental Validation as a WFDC13-Promoting Factor in Colon Cancer
2025, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2025.069274
PMID:41502505
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研究论文 | 本研究通过泛癌分析揭示了长链非编码RNA PAN3-AS1的致癌特性,并在结肠癌中实验验证了其通过竞争性结合miR-423-5p促进WFDC13表达的机制 | 首次在泛癌水平系统分析PAN3-AS1的诊断、预后价值及其与免疫微环境的关系,并揭示了增强子活性调控PAN3-AS1表达的新机制 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内实验验证;药物筛选部分仅为虚拟预测,未进行实验验证 | 探究PAN3-AS1在泛癌中的致癌特性及其在结肠癌中的具体调控机制 | PAN3-AS1长链非编码RNA及其在多种癌症(特别是结肠癌)中的表达与功能 | 生物信息学 | 结肠癌 | 单细胞转录组学、染色质免疫沉淀、荧光素酶活性测定、RNA免疫沉淀、虚拟筛选、分子对接 | NA | 转录组数据、单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 425 | 2026-01-09 |
AGPAT3 Regulates Immune Microenvironment in Osteosarcoma via Lysophosphatidic Acid Metabolism
2025, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2025.070558
PMID:41502512
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研究论文 | 本研究探讨了AGPAT3通过溶血磷脂酸代谢调控骨肉瘤免疫微环境的作用 | 首次将AGPAT3与骨肉瘤预后及免疫微环境调控联系起来,并发现其通过LPA-TAM-LPAR6轴抑制细胞毒性T细胞功能 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内实验验证 | 探索甘油脂代谢在骨肉瘤中的作用及其对免疫微环境的调控机制 | 骨肉瘤细胞、肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)及免疫细胞 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序、LASSO回归、虚拟筛选 | NA | RNA测序数据、单细胞数据 | 来自TARGET数据库的骨肉瘤样本及单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 426 | 2026-01-09 |
ETV4-Mediated PD-L1 Upregulation Promotes Immune Evasion and Predicts Poor Immunotherapy Response in Melanoma
2025, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2025.070180
PMID:41502516
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研究论文 | 本研究揭示了转录因子ETV4通过上调PD-L1促进黑色素瘤免疫逃逸,并预测免疫治疗反应不良 | 首次发现ETV4作为关键转录因子调控PD-L1表达,介导黑色素瘤免疫逃逸,并可作为免疫治疗反应的预测生物标志物 | 研究主要聚焦于黑色素瘤和肝细胞癌,其他癌症类型中的ETV4功能尚未验证 | 阐明ETV4在肿瘤免疫逃逸中的作用及其作为免疫治疗预测生物标志物的潜力 | 黑色素瘤和肝细胞癌患者样本、肿瘤细胞、免疫细胞及小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序、功能研究、小鼠模型 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 未明确指定样本数量,但包括黑色素瘤和肝细胞癌患者样本及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 427 | 2026-01-09 |
STC2+ Malignant Cell State Associated with EMT, Tumor Microenvironment Remodeling, and Poor Prognosis Revealed by Single-Cell and Spatial Transcriptomics in Colorectal Cancer
2025, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2025.070143
PMID:41502509
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学,在结直肠癌中鉴定出一种与上皮-间质转化、肿瘤微环境重塑及不良预后相关的STC2+恶性细胞亚群 | 整合多组学方法识别了空间富集于肿瘤区域且代谢重编程的STC2+恶性细胞亚群,揭示了其作为信号枢纽及潜在治疗靶点的新作用 | NA | 旨在识别结直肠癌中利用缺氧和果糖代谢等替代代谢途径改变肿瘤微环境的恶性亚群,并解析其细胞间信号网络和空间组织 | 结直肠癌组织样本,包括肝转移样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,多组学整合分析 | NA | RNA测序数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 428 | 2026-01-09 |
ELK4 Promotes Vasculogenic Mimicry in Oral Squamous Cell Carcinoma via Driving DHFR Transcriptional Activation
2025, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2025.069612
PMID:41502523
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研究论文 | 本研究揭示了ELK4通过驱动DHFR转录激活促进口腔鳞状细胞癌中血管生成拟态形成的机制 | 首次发现ELK4/DHFR轴在口腔鳞状细胞癌血管生成拟态中的关键调控作用,并阐明其表观遗传机制 | 研究主要基于体外实验和生物信息学分析,缺乏体内动物模型验证 | 阐明口腔鳞状细胞癌中血管生成拟态的调控机制 | 口腔鳞状细胞癌细胞 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, H3K27ac ChIP-seq, ChIP-qPCR | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据 | 来自TCGA和GEO数据库的样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 染色质免疫沉淀测序 | NA | NA |
| 429 | 2026-01-09 |
Characterization of cell states in biliary tract cancers identifies mechanisms of therapeutic resistance in a phase II trial of DKN-01/nivolumab
2024-Oct-08, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.10.08.24315092
PMID:39417106
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析胆道癌患者活检样本,鉴定了五种恶性细胞状态,并揭示了DKN-01/nivolumab联合治疗中免疫抑制机制与治疗抵抗的新见解 | 首次系统分类胆道癌中功能注释的细胞状态,并描述了神经样和内皮样状态在胆道癌中的新发现,这些状态在其他癌症中与治疗抵抗相关 | 研究为单臂二期临床试验,样本量有限,未观察到客观治疗反应,且机制分析基于配对活检,可能受样本异质性影响 | 探索胆道癌治疗抵抗机制,特别是针对DKN-01/nivolumab联合免疫疗法的失败原因 | 晚期胆道癌患者的配对治疗前和治疗中活检样本 | 数字病理学 | 胆道癌 | scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 二期临床试验中的患者配对活检样本(具体数量未在摘要中明确) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 430 | 2026-01-09 |
Improved characterization of single-cell RNA-seq libraries with paired-end avidity sequencing
2024-Jul-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.10.602909
PMID:39026715
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研究论文 | 本研究评估了Element Biosciences的亲和性测序技术在单细胞RNA-seq文库中准确测序通过同聚物引物区域的能力,并分析了其对读段比对和多聚腺苷酸化位点定量分析的影响 | 首次系统评估Element亲和性测序技术在单细胞RNA-seq中测序通过胸腺嘧啶同聚物的准确性,并开发了改进的接头修剪和比对流程 | 与单端比对相比,配对端比对并未持续提高读段映射率,且未排除其他新兴平台可能具有类似性能的可能性 | 评估新型测序技术在单细胞RNA-seq中的应用效果,特别是对多聚腺苷酸化位点分析的改进 | 单细胞RNA-seq文库 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 测序数据 | NA | Element Biosciences, Illumina | 单细胞RNA-seq | Element Aviti, Illumina测序平台 | Element Aviti仪器使用亲和性碱基化学测序技术 |
| 431 | 2026-01-09 |
Deep analysis of CD4 T cells in the rhesus CNS during SIV infection
2023-12, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1011844
PMID:38060615
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了SIV感染期间恒河猴中枢神经系统中CD4 T细胞的分布、反应及病毒存在情况 | 首次在SIV感染模型中详细描述了CCR5+ CD4 T细胞在中枢神经系统多个组织中的分布,并揭示了其在急性感染期的高病毒载量和免疫激活状态 | 研究样本量较小(仅10只恒河猴),且ART模拟方案为非最优依从性,可能无法完全反映人类HIV感染情况 | 探究SIV感染期间中枢神经系统中CD4 T细胞的分布、对感染的反应以及ART启动后的潜在恢复情况 | SIVmac251感染的恒河猴中枢神经系统组织 | 单细胞组学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 10只SIV感染的恒河猴(4只急性期,6只慢性期) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 432 | 2026-01-09 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals rich pituitary-Immune interactions under systemic inflammation
2023-12, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002403
PMID:38109308
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了系统性炎症下小鼠垂体内分泌细胞与免疫系统之间广泛的相互作用 | 首次在单细胞分辨率上揭示了系统性炎症如何调控垂体内分泌细胞的转录组谱,并发现了非经典生物活性分子(如Nptx2)在调节免疫稳态中的作用 | 研究仅基于小鼠模型,尚未在人体中得到验证;单细胞测序技术本身存在技术限制,如基因捕获效率等 | 探究系统性炎症对垂体内分泌细胞转录组谱的调控机制及其与免疫系统的相互作用 | 小鼠垂体组织 | 单细胞组学 | 炎症性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量,但涉及小鼠垂体组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 433 | 2026-01-09 |
Gleaning Euglenozoa-specific DNA polymerases in public single-cell transcriptome data
2023-12, Protist
IF:1.9Q4
DOI:10.1016/j.protis.2023.125997
PMID:38039844
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研究论文 | 本研究通过分析公共单细胞转录组数据,发现了眼虫门中16个新的家族A DNA聚合酶序列,并探讨了这些酶在眼虫门中的多样性和进化 | 利用单细胞转录组数据填补了眼虫门深支系中家族A DNA聚合酶序列的空白,首次从基础分支物种中获取了相关序列数据 | 研究仅基于转录组数据,可能未覆盖所有DNA聚合酶基因;样本数量有限,可能无法完全代表眼虫门的多样性 | 探究眼虫门中家族A DNA聚合酶的多样性和进化历史 | 眼虫门中的吞噬性眼虫和共生虫类 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 33个吞噬性眼虫和2个共生虫类 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 434 | 2026-01-09 |
The murine meninges acquire lymphoid tissue properties and harbour autoreactive B cells during chronic Trypanosoma brucei infection
2023-11, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002389
PMID:37983289
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和质谱流式细胞术,揭示了慢性布氏锥虫感染如何诱导小鼠脑膜形成异位淋巴聚集体,并产生自身反应性B细胞和自身抗体 | 首次发现慢性布氏锥虫感染可诱导脑膜获得淋巴组织特性,形成包含成纤维网状细胞、滤泡树突状细胞、滤泡辅助T样细胞和GC样B细胞的异位淋巴聚集体,并产生识别脑抗原的高亲和力自身抗体 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;自身抗体在疾病进展中的具体作用机制尚未完全阐明 | 探究慢性布氏锥虫感染对脑膜免疫景观的影响,特别是异位淋巴聚集体形成和自身免疫反应的机制 | 小鼠脑膜组织、人类脑脊液样本、布氏锥虫寄生虫 | 数字病理学 | 非洲锥虫病(昏睡病) | 单细胞转录组学、质谱流式细胞术(CyTOF)、中通量筛选、体内干预 | NA | 单细胞RNA测序数据、质谱流式细胞数据、蛋白质筛选数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 435 | 2026-01-09 |
The miR-221/222 cluster regulates hematopoietic stem cell quiescence and multipotency by suppressing both Fos/AP-1/IEG pathway activation and stress-like differentiation to granulocytes
2023-11, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002015
PMID:37983263
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研究论文 | 本研究探讨了miR-221/222簇在调控造血干细胞静息状态和多能性中的作用,通过抑制Fos/AP-1/IEG通路激活和应激样粒细胞分化 | 首次揭示miR-221/222通过抑制Fos/AP-1/IEG通路和应激样粒细胞分化来维持造血干细胞静息与多能性,为改善骨髓移植提供了新靶点 | 研究主要基于小鼠模型,人类HSC中miR-221/222的具体调控机制需进一步验证 | 探究miR-221/222在应激条件下对造血干细胞功能调控的分子机制 | 小鼠造血干细胞和多能祖细胞 | 分子生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序,条件性基因敲除 | NA | 转录组数据 | C57BL/6J小鼠的造血干细胞和祖细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 436 | 2026-01-09 |
A Drosophila glial cell atlas reveals a mismatch between transcriptional and morphological diversity
2023-10, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002328
PMID:37862379
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了果蝇中枢神经系统中的胶质细胞,揭示了胶质细胞形态多样性与转录特征之间的不匹配关系 | 发现了果蝇腹神经索中一个新的形态和转录上独特的表面胶质细胞群体,并证明胶质细胞在形态水平上比转录水平上表现出更多样性 | 许多胶质细胞形态类别在转录上无法区分,且转录多样性可能受限于特定神经纤维层位置 | 探索果蝇胶质细胞形态多样性与转录特征之间的关系 | 果蝇中枢神经系统中的胶质细胞,包括胚胎腹神经索和成体视叶组织 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 果蝇胚胎腹神经索和成体视叶组织中的胶质细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 437 | 2026-01-09 |
Virally encoded interleukin-6 facilitates KSHV replication in monocytes and induction of dysfunctional macrophages
2023-10, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1011703
PMID:37883374
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了卡波西肉瘤相关疱疹病毒(KSHV)如何利用其编码的病毒白介素-6(vIL-6)促进病毒在单核细胞中的复制,并诱导功能障碍的巨噬细胞分化 | 首次在单细胞水平上阐明KSHV的vIL-6通过激活STAT1/3信号通路,不仅维持病毒裂解复制,还驱动受感染单核细胞增殖并分化为具有免疫抑制功能的巨噬细胞,揭示了病毒逃避免疫监视的新机制 | 研究主要基于体外实验,缺乏体内模型验证;对vIL-6如何精确调控病毒长链非编码RNA(PAN RNA)表达的分子机制尚未完全阐明 | 探究KSHV病毒编码的vIL-6在病毒感染单核细胞、维持病毒复制及诱导免疫功能障碍巨噬细胞中的作用机制 | 卡波西肉瘤相关疱疹病毒(KSHV)、人CD14+单核细胞、重组KSHV病毒(vIL-6缺失型与回复型) | 病毒学与免疫学 | 卡波西肉瘤、淋巴增生性疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、重组病毒构建、转录组分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量,使用原代单核细胞进行实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 438 | 2026-01-09 |
CD4 T cell Responses in the CNS during SIV infection
2023-Aug-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.24.554055
PMID:37662237
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研究论文 | 本研究通过模拟亚优依从性的抗逆转录病毒疗法(ART)方案,在SIVmac251感染的恒河猴中,探究了CD4 T细胞在中枢神经系统(CNS)中的分布、对感染的反应以及ART启动后的潜在恢复情况 | 首次在SIV感染模型中,利用单细胞RNA测序技术揭示了CNS中CD4 T细胞与病毒转录本的共定位,以及T细胞内抗病毒分子和特定效应程序的显著激活,强调了CD4 T细胞在CNS病毒感染中的功能性参与 | 研究样本量较小(仅10只恒河猴),且ART方案模拟的是亚优依从性,可能无法完全反映人类HIV感染的最佳治疗情况 | 探究SIV感染期间CD4 T细胞在中枢神经系统中的反应、分布及ART后的恢复潜力,以增进对Neuro-HIV病理机制的理解 | SIVmac251感染的恒河猴,包括急性期(4只)和慢性期(6只)的动物 | 免疫学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 10只SIVmac251感染的恒河猴 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 439 | 2026-01-08 |
A protocol for high-quality single-cell RNA sequencing with cell surface protein quantification
2026-Mar, Blood science (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/BS9.0000000000000254
PMID:41488013
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研究论文 | 本文提出了一种标准化协议,用于结合细胞表面蛋白定量进行高质量单细胞RNA测序 | 通过CITE-seq技术实现转录组和蛋白质组数据的同步分析,提供了一种兼容现有工作流程、成本高效且增强细胞类型分类分辨率的标准化方法 | NA | 开发一种标准化协议,以整合多模态单细胞数据,精确表征罕见细胞亚群 | 单细胞水平的转录组和蛋白质组数据 | 数字病理学 | NA | CITE-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 440 | 2026-01-08 |
Unravelling cell heterogeneity and gene regulation mechanisms in multiple myeloma through single-cell RNA-seq
2026-Feb, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2025.11.006
PMID:41253222
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研究论文 | 本文通过整合分析多个多发性骨髓瘤单细胞RNA-seq数据集,揭示了细胞异质性并预测了调控网络 | 整合多个公共单细胞RNA-seq数据集,首次在多发性骨髓瘤中系统识别24个细胞簇并预测651个调控子,为理解异质性调控机制提供新参考 | 研究依赖公共数据集,可能受限于样本来源和技术平台的差异,且未进行实验验证调控子的功能 | 探究多发性骨髓瘤的细胞异质性和基因调控机制 | 多发性骨髓瘤细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞RNA-seq数据 | 四个数据集,分别包含597、172、477和51,840个细胞,总计约53,086个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |