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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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481 | 2025-10-05 |
Multi-omics integration reveals key miRNAs, immune inflammation, and signaling pathways in Alzheimer's disease: Implications for targeted therapy
2025-Sep-24, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.147874
PMID:41005404
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研究论文 | 通过多组学整合分析揭示阿尔茨海默病中关键miRNAs、免疫炎症和信号通路的作用机制 | 整合三种组学数据集识别出AD相关关键miRNAs和信号通路,并提出免疫调节与神经再生相结合的治疗框架 | 候选miRNAs对成熟神经元标志物影响有限,需要合适的神经元环境才能诱导神经分化 | 阐明阿尔茨海默病的分子机制并探索靶向治疗策略 | 阿尔茨海默病患者的多组学数据和神经元细胞 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | miRNA-seq, RNA-seq, 单细胞转录组学, 多组学整合分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 三种miRNA-seq数据集和血液RNA-seq数据集 | NA | 单细胞转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
482 | 2025-10-05 |
Amyloid-β-driven Alzheimer's disease reshapes the colonic immune system in mice
2025-Sep-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116109
PMID:40885186
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示阿尔茨海默病如何重塑小鼠结肠免疫系统 | 首次在淀粉样蛋白β驱动的小鼠模型中系统揭示肠道免疫系统变化与大脑免疫细胞迁移的关联 | 研究基于小鼠模型,人类相关性需要进一步验证 | 探索阿尔茨海默病中肠道-大脑轴的免疫学特征 | 5XFAD淀粉样蛋白β小鼠模型的结肠免疫细胞 | 单细胞生物学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 光谱调谐流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据 | 5XFAD小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
483 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing in high-burden viral respiratory infections: Decoding immune cell subsets and immune-related differential gene expression
2025-Sep-23, Infection, genetics and evolution : journal of molecular epidemiology and evolutionary genetics in infectious diseases
DOI:10.1016/j.meegid.2025.105834
PMID:40998072
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在高负担病毒性呼吸道感染中解析免疫细胞亚群和免疫相关差异基因表达的研究进展 | 系统总结了scRNA-seq在揭示COVID-19和流感等病毒感染中新型免疫细胞亚群和关键生物标志物的最新发现 | 在其他微生物来源的呼吸道感染中应用scRNA-seq的研究仍然有限 | 解析高负担病毒性呼吸道感染的免疫景观和分子机制 | 人类外周血、支气管肺泡灌洗液、小鼠肺组织及外植体 | 单细胞组学 | 呼吸道感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
484 | 2025-10-05 |
A multi-omic analysis to investigate the causal associations between circulating proteins and risk of spontaneous abortion and their potential implications
2025-Sep-22, JBRA assisted reproduction
DOI:10.5935/1518-0557.20250031
PMID:40674570
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研究论文 | 通过孟德尔随机化和多组学分析研究循环蛋白与自然流产风险的因果关系 | 首次结合顺式和反式pQTLs作为工具变量,并整合单细胞转录组分析识别子宫内易感细胞类型 | 排除了性别间差异表达的蛋白质,可能遗漏部分相关蛋白 | 探索循环蛋白与自然流产风险的因果关系及其分子机制 | 自然流产风险相关的遗传变异和循环蛋白 | 生物信息学 | 自然流产 | 孟德尔随机化, pQTL分析, KEGG通路富集, 单细胞转录组分析 | 孟德尔随机化模型 | 遗传变异数据, 蛋白质表达数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
485 | 2025-10-05 |
Orlistat Confers Neuroprotection in Traumatic Brain Injury by Modulating Microglial Lipid Metabolism
2025-Sep-19, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14181469
PMID:41002434
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研究论文 | 研究奥利司他通过调节小胶质细胞脂质代谢在创伤性脑损伤中发挥神经保护作用 | 首次发现奥利司他通过直接抑制小胶质细胞中脂蛋白脂肪酶(LPL)介导的神经炎症发挥神经保护作用 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证 | 探讨奥利司他在创伤性脑损伤中的神经保护潜力及作用机制 | 小鼠创伤性脑损伤模型及小胶质细胞 | 神经科学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序, 分子对接, 转录组学, 代谢组学 | NA | 基因表达数据, 代谢物数据, 行为学数据, 组织学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
486 | 2025-10-05 |
Astrocytes in Fear Memory Processing: Molecular Mechanisms Across the Amygdala-Hippocampus-Prefrontal Cortex Network
2025-Sep-16, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14181444
PMID:41002409
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综述 | 本文综述了星形胶质细胞在恐惧记忆处理中的分子机制及其在杏仁核-海马体-前额叶皮层网络中的作用 | 挑战了传统的以神经元为中心的恐惧记忆观点,揭示了星形胶质细胞在不同脑区特异性功能和与神经元的动态相互作用 | NA | 探讨星形胶质细胞在恐惧记忆获取、巩固、消退和提取过程中的分子机制 | 星形胶质细胞在杏仁核-海马体-前额叶皮层网络中的功能 | 神经科学 | 创伤后应激障碍(PTSD)和焦虑症 | 空间转录组学, 光遗传学, 化学遗传学 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
487 | 2025-10-05 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals Cell Heterogeneity and Altered Signaling Pathways in Jellyfish Sting Patients
2025-Sep-15, Marine drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/md23090358
PMID:41003327
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示水母蜇伤患者免疫细胞异质性和信号通路改变 | 首次在单细胞分辨率下揭示水母蜇伤后的免疫失调图谱,发现MMP9+单核细胞和S100A12+中性粒细胞的关键作用 | 仅分析一名严重患者样本,样本量较小 | 探究水母蜇伤后的免疫机制和信号通路变化 | 水母蜇伤患者和健康对照者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 中毒性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 一名严重患者和健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
488 | 2025-10-05 |
Morphological and Transcriptomic Analyses of the Adrenal Gland in Acomys cahirinus: A Novel Model for Murine Adrenal Physiology
2025-Sep-12, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14181431
PMID:41002397
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研究论文 | 本研究通过形态学和转录组学分析比较了Acomys cahirinus与小鼠的肾上腺结构与基因表达差异 | 首次在Acomys cahirinus中发现明确的网状带结构,其肾上腺基因表达谱与人类肾上腺皮质高度相似 | 需要进一步进行单细胞转录组学和功能验证实验来充分评估其转化潜力 | 评估Acomys cahirinus作为人类肾上腺疾病模型的适用性 | Acomys cahirinus和小鼠的肾上腺组织 | 转录组学 | 肾上腺疾病 | RNA-seq, qRT-PCR, CAGE-seq, 通路分析 | NA | 转录组数据, 形态学数据 | NA | NA | 转录组测序 | NA | NA |
489 | 2025-10-05 |
Comprehensive Characterization of Long Non-Coding RNAs in Porcine Tissues: Expression Patterns and Functional Insights During Oocyte Development
2025-Sep-09, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14181409
PMID:41002376
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研究论文 | 本研究系统表征了猪组织中长链非编码RNA的表达模式及其在卵母细胞发育中的功能 | 首次系统分析14种猪组织的lncRNA表达谱,并鉴定卵母细胞发育过程中的关键lncRNA | 研究主要基于表达谱分析,功能验证实验相对有限 | 阐明猪组织中lncRNA的表达特征及其在生殖生物学中的功能 | 猪多种组织样本及卵母细胞发育不同阶段的单细胞数据 | 生物信息学 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | RNA测序数据 | 607个组织RNA-seq数据集,63个单细胞RNA-seq数据集,以及37个人鼠比较数据集 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
490 | 2025-10-05 |
Piezo1 promotes M1 macrophage polarization and impairs osteogenic differentiation in bone infection
2025-Sep-07, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2025.168042
PMID:40925468
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研究论文 | 本研究探讨Piezo1在骨感染中促进巨噬细胞M1极化并损害成骨分化的机制 | 首次揭示Piezo1在骨感染微环境中调控巨噬细胞极化并通过PANoptosis影响成骨分化的新机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验,需要进一步临床验证 | 探究Piezo1在骨感染过程中对巨噬细胞极化和成骨分化的调控作用 | 大鼠骨感染模型、人类感染骨组织、小鼠单核巨噬细胞和骨髓间充质干细胞 | 骨生物学 | 骨感染 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 细胞共培养 | NA | RNA测序数据, 细胞实验数据 | 大鼠模型和人类组织样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
491 | 2025-10-05 |
Dissecting microbial communities with single-cell transcriptome analysis
2025-Sep-04, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adp6252
PMID:40906858
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综述 | 本文综述了单细胞转录组分析技术在微生物群落研究中的应用进展与挑战 | 将单细胞基因表达分析技术从人类生物学领域拓展应用于微生物群落功能解析 | 在微生物群落应用中仍面临技术挑战 | 探讨单细胞转录组技术在微生物群落功能研究中的应用 | 微生物群落及其亚群 | 单细胞组学 | 肠道微生物相关疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
492 | 2025-10-05 |
Single-cell analysis of human fibrous dysplasia bone reveals a fibrotic transcriptome and GNAS variants in endothelial, perivascular, and stromal cells
2025-Sep-04, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2025.07.018
PMID:40848713
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人类纤维性发育不良骨组织,揭示纤维化转录组特征和GNAS变异在多种细胞类型中的表达 | 首次在骨骼基质谱系外的内皮细胞和周细胞中发现GNAS c.602G>A和c.601C>T变异,并识别出跨FD细胞谱系的共同纤维化转录组特征 | 样本量有限,仅分析了非造血细胞 | 研究体细胞嵌合对纤维性发育不良疾病机制的细胞和分子影响 | 人类纤维性发育不良和非纤维性发育不良骨组织中的非造血细胞 | 单细胞组学 | 纤维性发育不良 | 单细胞RNA测序,GNAS基因分型,BaseScope检测 | NA | 单细胞RNA测序数据 | FD和非FD人类骨组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
493 | 2025-10-05 |
Tenascin-C Expression in Relation to Tumor-Stroma Interaction in Ameloblastoma
2025-Sep-03, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
DOI:10.1016/j.labinv.2025.104237
PMID:40912374
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研究论文 | 本研究探讨了Tenascin-C在成釉细胞瘤肿瘤-基质相互作用中的表达及其对肿瘤进展的影响 | 首次发现成釉细胞瘤细胞通过肿瘤-基质相互作用分泌TN-C蛋白,并证实TN-C促进肿瘤细胞迁移 | 研究主要基于体外实验和有限的组织样本,需要更大规模的临床验证 | 阐明TN-C在成釉细胞瘤进展中的作用机制 | 成釉细胞瘤组织标本和AM-1细胞系 | 数字病理学 | 成釉细胞瘤 | 免疫组织化学, RNA原位杂交, 空间转录组学 | 细胞共培养模型 | 图像, 基因表达数据 | 成釉细胞瘤组织标本和细胞系 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
494 | 2025-10-05 |
GreenCells: A comprehensive resource for single-cell analysis of plant lncRNAs
2025-Sep-03, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110678
PMID:40912654
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研究论文 | 开发了一个专门用于单细胞水平研究植物lncRNA的综合数据库GreenCells | 首个专门针对植物lncRNAs的单细胞分析数据库,填补了现有植物单细胞转录组数据库主要关注蛋白质编码基因而忽略lncRNAs的空白 | NA | 在单细胞分辨率下研究植物lncRNA的表达和功能 | 8种植物物种的lncRNA和蛋白质编码基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 8种植物物种 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
495 | 2025-10-05 |
Glioblastoma shift from bulk to infiltrative growth is guided by plexin-B2-mediated microglia alignment in invasive niches
2025-Sep, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-025-00985-4
PMID:40442367
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研究论文 | 本研究揭示了胶质母细胞瘤从团块生长向浸润性生长转变的机制,发现小胶质细胞通过plexin-B2介导的排列引导肿瘤细胞侵袭 | 首次发现小胶质细胞在肿瘤侵袭前沿形成'癌流'结构引导集体迁移,并鉴定plexin-B2在解决细胞碰撞和细胞外基质重构中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探究胶质母细胞瘤侵袭性生长的细胞和分子机制 | 胶质母细胞瘤细胞、肿瘤相关小胶质细胞和巨噬细胞(TAMs) | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | 免疫活性小鼠模型 | 基因表达数据、组织学图像 | 小鼠模型和人类胶质母细胞瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
496 | 2025-10-05 |
A Human Immuno-Lung Organoid Model to Study Macrophage-Mediated Lung Cell Senescence Upon SARS-CoV-2 Infection
2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202503932
PMID:40712141
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研究论文 | 本研究开发了免疫-肺类器官模型,研究SARS-CoV-2感染后巨噬细胞介导的肺细胞衰老机制 | 建立了包含hPSC来源肺泡和气道类器官与巨噬细胞共培养的免疫-肺类器官模型,并首次发现THBS1-(ITGA3+ITGB1)信号轴在驱动肺细胞衰老中的作用 | NA | 研究SARS-CoV-2感染后巨噬细胞介导的肺损伤机制 | 非COVID和COVID-19肺组织外植体和尸检样本,免疫-肺类器官模型 | 数字病理 | COVID-19 | 空间转录组测序 | 类器官模型 | 空间转录组数据 | 非COVID和COVID-19肺组织样本 | NanoString | 空间转录组学 | CosMx | NanoString CosMx空间分子成像平台 |
497 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptional analysis of murine mesenteric lymph nodes following oral lyso-phosphatidylserine nanoparticle administration reveals cellular heterogeneity in tolerance features
2025-Sep, Journal of pharmaceutical sciences
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.xphs.2025.103919
PMID:40712826
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析口服含溶血磷脂酰丝氨酸纳米颗粒后小鼠肠系膜淋巴结的免疫细胞反应 | 首次利用单细胞RNA测序技术揭示LysoPS纳米颗粒通过TGF-β反应诱导B细胞、T细胞和NK细胞耐受性特征的分子机制 | 研究仅限于小鼠模型,人体内的生物过程和细胞通讯机制仍不明确 | 阐明LysoPS介导的口服耐受性中的免疫细胞相互作用和潜在耐受机制 | 小鼠肠系膜淋巴结中的免疫细胞(B细胞、T细胞、NK细胞) | 单细胞组学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
498 | 2025-10-05 |
SmartImpute is a targeted imputation framework for single-cell transcriptome data
2025-Aug-18, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2025.101122
PMID:40763742
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研究论文 | 提出一种针对单细胞转录组数据的靶向插补框架SmartImpute | 采用改进的生成对抗插补网络(GAIN)与多任务判别器,专注于预定义标记基因,在填补缺失值的同时保留真实生物零值 | NA | 提高单细胞RNA测序数据的生物学相关性和计算效率 | 头颈鳞状细胞癌、人骨髓和肺癌的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 头颈癌, 骨髓疾病, 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 生成对抗网络(GAIN) | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 超过一百万细胞的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
499 | 2025-10-05 |
Cannabidiol exerts anti-inflammatory effects but maintains T effector memory cell differentiation: A Single-Cell Study in Humans
2025-Jul-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.30.667742
PMID:40766582
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研究论文 | 通过单细胞研究探讨大麻二酚在人类中的抗炎作用及其对T效应记忆细胞分化的影响 | 首次在人体研究中结合单细胞RNA测序和流式细胞术分析大麻二酚对免疫细胞的调节作用 | 样本量较小(23名参与者),缺乏长期随访数据 | 评估大麻二酚对人类外周免疫细胞分布的调节作用 | 23名接受口服大麻二酚的健康参与者 | 免疫学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 细胞因子检测, 串联质谱法 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据, 蛋白质浓度数据 | 23名参与者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
500 | 2025-10-05 |
From injury to recovery: Spatiotemporal dynamics of the visual pathway during spontaneous structural and functional regeneration after optic nerve transection in zebrafish
2025-07-18, Zoological research
IF:4.0Q1
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研究论文 | 本研究系统揭示了斑马鱼视神经横断后视觉通路自发再生过程中的时空动态变化 | 首次在成年斑马鱼中系统描绘了从视网膜到视神经再到大脑的完整视觉通路再生时空动态,并建立了结构与功能恢复的关联 | 研究仅限于斑马鱼模型,在哺乳动物中的适用性需要进一步验证 | 阐明斑马鱼视觉系统自发再生的时空协调机制 | 成年斑马鱼的视觉通路(视网膜、视神经、大脑) | 神经科学 | 视神经损伤 | 苏木精-伊红染色,免疫组织化学,透射电子显微镜,单细胞RNA测序,视动反应行为评估 | NA | 组织切片图像,基因表达数据,行为数据 | 成年斑马鱼在5周时间内的系列观察 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |