单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 38047 篇文献,本页显示第 441 - 460 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
441 2026-03-30
Paradoxes in the Ontological Classification of Glia-Evidence for an Important New Class of Brain Cells with Primary Functions in Iron Regulation
2026-Mar-13, Cells IF:5.1Q2
研究论文 本文提出了一种新的脑细胞类别——铁胶质细胞(ferriglia),挑战了传统的胶质细胞分类,并强调了其在铁调节中的主要功能 识别了当前胶质细胞分类中的矛盾,并基于经验、进化和实用视角,提出了一类新的铁调节为主的胶质细胞,命名为铁胶质细胞,这重新定义了脑细胞的功能分类 NA 探讨脑细胞(特别是胶质细胞)的重新分类,并研究铁胶质细胞在神经精神疾病和神经系统疾病中的作用 脑细胞,特别是胶质细胞,包括铁胶质细胞 神经科学 阿尔茨海默病、神经退行性疾病、脑卒中、脑癌、神经免疫疾病等 电生理学、单细胞转录组学、超高分辨率光谱学 NA 分子谱、功能数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
442 2026-03-30
Integrated Genome-wide Association and Single-cell Transcriptomic Analysis Identifies OAT as Therapeutic Targets for Periodontitis
2026-Mar-11, Inflammation IF:4.5Q2
研究论文 本研究通过整合全基因组关联分析和单细胞转录组学,发现鸟氨酸氨基转移酶(OAT)是牙周炎的关键致病因子和潜在治疗靶点 首次将全基因组关联分析与单细胞转录组技术相结合,系统揭示了OAT在牙周炎成纤维细胞表型转化和代谢重编程中的核心作用 研究主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平和功能验证实验 鉴定牙周炎的致病机制和潜在治疗靶点 牙周炎患者的牙周组织 单细胞转录组学 牙周炎 单细胞RNA测序 伪时间分析 单细胞转录组数据 未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
443 2026-03-30
Single-cell RNA sequencing identifies long non-coding RNAs enriched in psoriatic epidermal subsets
2026-Mar-10, Journal of dermatological science IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序构建了健康与银屑病表皮中长链非编码RNA的表达图谱,并识别了与疾病相关的细胞状态特异性lncRNA 首次在单细胞水平上系统性地描绘了银屑病表皮中lncRNA的表达景观,并揭示了LINC01137和LINC00892等lncRNA在疾病相关细胞状态中的特异性富集及其功能 研究主要基于测序数据的分析,功能验证仅限于少数lncRNA,且样本量相对有限 构建健康与银屑病表皮的单细胞lncRNA表达图谱,并识别与疾病相关的细胞状态特异性lncRNA 来自健康对照和银屑病皮损/非皮损皮肤的CD45⁺和CD45⁻表皮细胞 单细胞转录组学 银屑病 单细胞RNA测序(Smart-seq2)、RT-qPCR、单分子原位杂交(RNAscope)、免疫荧光、siRNA敲低 NA 单细胞RNA测序数据 来自健康对照和银屑病患者的表皮细胞(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq Smart-seq2 Smart-seq2单细胞RNA测序技术
444 2026-03-30
MSTN and TCF12 as Candidate Immunometabolic Signatures in Glioma-Associated Foam Cells: Insights from Integrated Multi-Omics Analysis
2026-Mar-09, Current issues in molecular biology IF:2.8Q3
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,解析了胶质瘤微环境中的细胞组成,并鉴定了肿瘤相关泡沫细胞及其特征基因MSTN和TCF12作为与免疫抑制和代谢重编程相关的候选免疫代谢标志物 首次通过整合单细胞和空间转录组学技术,在胶质瘤微环境中鉴定出肿瘤相关泡沫细胞作为中心连接亚型,并发现MSTN和TCF12这两个基因与M2巨噬细胞浸润、胆固醇稳态改变和免疫抑制信号传导相关 样本量相对较小(单细胞RNA测序11个样本,空间转录组学2个样本),且研究主要基于计算分析和体外验证,需要进一步的体内实验验证 解析胶质瘤微环境的异质性,鉴定关键的细胞亚型和分子标志物,以理解肿瘤进展和治疗抵抗机制 胶质瘤组织样本 数字病理学 胶质瘤 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫荧光 逻辑回归, 伪时间轨迹分析, 调控网络分析 单细胞RNA测序数据, 空间转录组学数据, 临床数据 单细胞RNA测序11个样本, 空间转录组学2个样本 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
445 2026-03-30
Intercellular communication landscape and its working mechanism in systemic sclerosis-associated interstitial lung disease
2026-Mar-05, Rheumatology (Oxford, England)
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和ATAC测序分析,揭示了系统性硬化症相关间质性肺病中细胞间通讯的景观及其工作机制 首次在SSc-ILD中系统描绘了细胞间通讯的全景图,并鉴定了SPP1-CD44/ITGB1、MIF-CD74和MDK-SDC2等关键配体-受体对在疾病中的核心作用 样本量相对有限(17例正常和17例SSc-ILD肺组织),动物模型仅使用博来霉素诱导,可能无法完全模拟人类疾病复杂性 阐明SSc-ILD中促纤维化因子的作用机制和细胞间通讯网络 人类SSc-ILD肺组织、SSc患者血清样本、博来霉素诱导的肺纤维化动物模型 数字病理学 间质性肺病 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, ELISA, 免疫荧光, 免疫组织化学 CellChat, Monocle3, Signac 单细胞转录组数据, 表观基因组数据, 血清蛋白数据, 组织图像数据 34例肺组织(17正常+17 SSc-ILD),55例SSc患者血清(32例伴ILD,23例不伴ILD),5只动物模型 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
446 2026-03-30
Germ layer specification and organotropism in lymphoma invasion
2026-Mar-04, Science bulletin IF:18.8Q1
研究论文 本研究探讨了弥漫性大B细胞淋巴瘤中胚层依赖性结外侵袭的临床和分子特征及其与胚胎发育的关系 首次识别了淋巴瘤侵袭的胚层依赖性模式,并揭示了其与患者生存和器官趋向性迁移的关联 研究主要基于特定队列,可能未涵盖所有淋巴瘤亚型,且机制细节需进一步验证 探究淋巴瘤侵袭模式与胚层发育的关系,以理解肿瘤进展与胚胎发育的相互作用 弥漫性大B细胞淋巴瘤患者及其肿瘤样本 数字病理学 淋巴瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 未明确指定样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
447 2026-03-30
From Immunobiology to Clinical Application: Tumor-Infiltrating Lymphocytes in Melanoma
2026-Mar-03, Journal of personalized medicine IF:3.0Q1
综述 本文是一篇关于黑色素瘤中肿瘤浸润淋巴细胞(TILs)从免疫生物学到临床应用(特别是基于TIL的过继细胞疗法)的叙述性综述 系统性地整合了当前关于TIL生物学、预后/预测价值以及TIL-ACT在晚期黑色素瘤中应用的最新知识,并指出了未来的研究方向 作为一篇叙述性综述,其结论基于现有文献的综合,而非原始数据分析;研究检索截止至2026年1月,可能未包含此后最新的突破 综述黑色素瘤中肿瘤浸润淋巴细胞(TILs)的生物学作用、临床意义以及基于TIL的过继细胞疗法(TIL-ACT)的应用现状与前景 黑色素瘤患者、肿瘤浸润淋巴细胞(TILs)以及基于TIL的过继细胞疗法 数字病理学 黑色素瘤 空间转录组学、显微镜检查 NA 文本(文献数据)、可能的图像数据(显微镜下特征) NA(综述文章,未涉及具体样本量) NA 空间转录组学 NA NA
448 2026-03-30
The role of ionotropic glutamate receptors in Alzheimer's disease: A scientometric analysis
2026-Mar-03, Journal of Alzheimer's disease : JAD
研究论文 本文对阿尔茨海默病中离子型谷氨酸受体的研究进行了全面的文献计量分析 首次对iGluR在AD研究领域进行了系统的文献计量分析,揭示了研究趋势从NMDAR功能障碍到临床应用的演变,并识别了新兴研究力量如中国学者的快速增长 分析基于截至2025年8月的文献,可能未涵盖最新研究进展;依赖数据库收录的文献,可能存在遗漏 通过文献计量分析,梳理iGluR在阿尔茨海默病研究中的发展脉络、研究热点和未来方向 PubMed、Web of Science和Scopus数据库中1986年至2025年关于iGluR与阿尔茨海默病的4810篇文献 自然语言处理 阿尔茨海默病 文献计量分析 NA 文本 4810篇论文 NA NA NA NA
449 2026-03-30
Improving atlas-scale single-cell annotation models with hierarchical cross-entropy loss
2026-03, Nature computational science IF:12.0Q1
研究论文 本文提出了一种分层交叉熵损失函数,用于改进单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释模型 引入分层交叉熵损失函数,将生物层次结构明确纳入模型训练目标,提升了模型的泛化性能 未提及具体的数据集规模或模型训练细节,可能缺乏对不同生物样本的广泛验证 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型注释的准确性和泛化能力 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释模型 机器学习 NA 单细胞RNA测序 线性模型、Transformer 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
450 2026-03-30
Partially shared multi-modal embedding learns holistic representation of cell state
2026-03, Nature computational science IF:12.0Q1
研究论文 本文提出了一种名为APOLLO的计算框架,用于自动学习多模态数据之间的部分信息共享,以更全面地表示细胞状态 APOLLO框架通过使用具有部分重叠潜在空间的自动编码器,能够自动学习多模态数据之间的部分信息共享,从而保留并区分共享和模态特定信息,提供更可解释和全面的细胞状态视图 NA 开发一个计算框架,以整合单细胞多模态数据并学习部分信息共享,从而更全面地表示细胞状态 单细胞多模态数据,包括scRNA-seq、scATAC-seq、蛋白质丰度和多重成像数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、蛋白质丰度测量、多重成像 自动编码器 多模态数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 多重成像 NA NA
451 2026-03-30
singIST: An integrative method for comparative single-cell transcriptomics between disease models and humans
2026-Mar, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 本文提出了一种名为singIST的计算方法,用于在疾病模型与人类条件之间进行单细胞转录组学的比较分析 singIST在单细胞分辨率下提供了可解释的定量度量,以评估疾病模型与人类参考在通路、细胞类型和基因水平的相似性,并整合了基因同源性、细胞类型存在、重要性以及基因表达变化,控制单细胞数据的内在复杂性 NA 开发一种计算方法来评估疾病模型与人类疾病在单细胞转录组水平的相似性,以辅助药物发现和早期开发 疾病模型(如小鼠模型)和人类条件(如特应性皮炎和化脓性汗腺炎) 自然语言处理 特应性皮炎,化脓性汗腺炎 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
452 2026-03-30
Meningeal Lymphatics Drives Macrophage Clearance via CCL2-CCR2 Axis After Cerebral Ischemia
2026-Feb-28, Current issues in molecular biology IF:2.8Q3
研究论文 本研究揭示了脑缺血后脑膜淋巴管通过CCL2-CCR2轴介导巨噬细胞清除的新机制 首次发现脑膜淋巴管通过CCL2-CCR2化学趋化轴主动招募巨噬细胞进行缺血后血管周围清除,并提出VEGF-C增强淋巴功能联合CCL2-CCR2轴调控的协同治疗新策略 研究基于小鼠大脑中动脉闭塞模型,临床转化需进一步验证;单细胞测序样本量有限,未涵盖所有免疫细胞类型 阐明脑卒中后脑膜淋巴管介导免疫细胞清除的具体分子机制 脑缺血小鼠模型的脑膜巨噬细胞和淋巴管内皮细胞 单细胞组学 脑血管疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠大脑中动脉闭塞模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
453 2026-03-30
Utilizing bulk and single-cell RNA sequencing to identify potential biomarkers linked to angiogenesis and integrated stress response in chondrosarcoma
2026-Feb-21, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,识别了与软骨肉瘤血管生成和整合应激反应相关的潜在生物标志物HSPA8、LMNA和SERPINH1,并探索了其分子机制 首次结合批量RNA测序和单细胞RNA测序分析软骨肉瘤,系统识别了与血管生成和整合应激反应相关的三个关键基因,并构建了包括转录因子、miRNA和lncRNA在内的分子调控网络 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要进一步的体内外实验验证这些生物标志物的功能和临床意义 识别与软骨肉瘤血管生成和整合应激反应相关的潜在生物标志物,并阐明其分子机制 软骨肉瘤患者样本 生物信息学 软骨肉瘤 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 分子对接分析 加权基因共表达网络分析, 伪时间分析, 细胞通讯分析 基因表达数据 来自GEO数据库的多个数据集(包括GSE184118、GSE30835、GSE22855),具体样本数量未明确说明 NA 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 NA NA
454 2026-03-30
Integrative analysis of polyamine-associated genes reveals a prognostic and immunological signature in esophageal squamous cell carcinoma
2026-Feb-19, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本文通过整合单细胞和批量转录组分析,探讨了多胺代谢在食管鳞状细胞癌中的预后和免疫学意义 首次在ESCA中结合单细胞RNA-seq和批量转录组数据,构建了一个基于八种多胺相关基因的预后模型,并揭示了其与免疫微环境的关联 研究样本量有限(仅基于四个患者的单细胞数据),且需要更多独立队列验证模型的普适性 探索多胺代谢在食管鳞状细胞癌中的预后价值和免疫调控作用 食管鳞状细胞癌患者及其肿瘤组织 计算生物学 食管鳞状细胞癌 单细胞RNA-seq,批量转录组分析 Cox和LASSO回归模型 转录组数据 四个患者的单细胞RNA-seq数据(GSE188900),以及训练(GSE53624)和验证(GSE53622)队列的批量转录组数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
455 2026-03-30
Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L orchestrates alternative splicing critical for primordial follicle formation
2026-Feb-19, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本研究揭示了hnRNPL介导的可变剪接在原始卵泡形成中的关键作用及其与原发性卵巢功能不全的关联 首次鉴定hnRNPL作为调控原始卵泡形成的关键剪接因子,并阐明其与PTBP1和SRSF10相互作用的分子机制 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 阐明从原始生殖细胞到原始卵泡形成过程中可变剪接的动态调控机制 小鼠生殖细胞发育过程 发育生物学 原发性卵巢功能不全 scRNA-seq, bulk RNA-seq, RIP-seq, IP-MS, 免疫荧光 条件性基因敲除小鼠模型 单细胞转录组数据、批量RNA-seq数据、蛋白质互作数据 小鼠胚胎期E16.5-E18.5及出生后P1时间点的卵巢组织 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
456 2026-03-30
Cardiac Macrophages Across Space and Time: Roles in Homeostasis, Disease, and Remodeling
2026-Feb-19, The Canadian journal of cardiology
综述 本文综述了心脏巨噬细胞在稳态、疾病和重塑中的空间和时间特异性作用,强调了其异质性和靶向治疗潜力 整合单细胞和空间转录组学数据,揭示了心脏巨噬细胞在空间和时间上的动态分布及其在疾病中的精确调控作用 综述性质文章,未涉及具体实验验证,且基于现有研究,可能存在数据局限性 探讨心脏巨噬细胞在稳态维持、损伤响应和修复中的角色,以开发精准免疫调节疗法 心脏巨噬细胞,包括组织驻留巨噬细胞和招募的单核细胞来源巨噬细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
457 2026-03-30
A pathomics-based pyroptosis signature predicts survival in clear cell renal cell carcinoma
2026-Feb-18, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究开发了一种基于病理组学和细胞焦亡信号的新型预后模型,用于预测透明细胞肾细胞癌患者的生存 首次在ccRCC中整合病理组学特征与细胞焦亡相关信号来构建预后模型 模型主要基于TCGA数据,需要外部验证以确认其普适性 开发更准确的预后工具以改善透明细胞肾细胞癌的临床管理 透明细胞肾细胞癌患者及其全切片图像与基因表达数据 数字病理 肾细胞癌 病理组学分析、单细胞测序 StepCox[forward]+Lasso算法 图像、基因表达数据 基于TCGA数据集的样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
458 2026-03-30
Dipeptidylpeptidase 4 inhibition attenuates gestational pathologies via immune homeostasis restoration in the pulmonary-uterine axis
2026-Feb-17, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究揭示了呼吸道病毒感染通过肺-子宫免疫轴影响妊娠的机制,并发现DPP4抑制剂西格列汀可通过恢复免疫稳态来减轻妊娠并发症 首次揭示了肺-子宫免疫轴的存在及其在妊娠并发症中的作用机制,并发现DPP4抑制剂可作为针对病毒感染诱导的妊娠病理的双器官治疗策略 研究机制主要基于动物模型,尚未在人体中得到验证;具体信号通路细节有待进一步阐明 探究呼吸道病毒感染如何影响妊娠结局,并寻找潜在的治疗策略 妊娠期小鼠模型及相关的免疫细胞 免疫学 妊娠并发症 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
459 2026-02-15
Single-cell RNA sequencing combined with single-cell genome-wide association study identifies SF3B4 as a hub gene in hepatocellular carcinoma progression
2026-Feb-14, Discover oncology IF:2.8Q2
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
460 2026-03-30
Tissue-Specific High-Quality Protoplast Isolation for Single-Cell Analyses in Arabidopsis
2026-02-06, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 本文介绍了一种从拟南芥多种组织中分离高质量原生质体的稳健且可重复的协议,适用于单细胞分析 该协议针对不同组织类型(如叶片、茎、花和根)的独特生理特性,优化了酶消化条件和纯化步骤,确保了高产量和广泛细胞类型的代表性 NA 优化植物单细胞RNA测序(scRNAseq)应用中的原生质体分离方法,以研究细胞类型特异性基因表达和发育动态 拟南芥(Arabidopsis thaliana)的多种组织,包括地上部分(叶片、茎、花)和根组织 植物生物学 NA 单细胞RNA测序(scRNAseq)、流式细胞术(FACS)、瞬时基因表达分析 NA 单细胞悬浮液 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
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