单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 44722 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-10-26 |
scTHREAD: a cell-resolved long-read transcriptome database with linked isoform, poly(A), junction, and allelic evidence
2026-Oct-23, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag1038
PMID:42922366
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研究论文 | 本文介绍了一个名为scTHREAD的开放获取数据库，用于整合、探索和检索单细胞长读长转录组证据，涵盖isoform、poly(A)、剪接连接和等位基因信息 | 首次构建了一个细胞分辨率的长期读长转录组数据库，整合了来自34个人类和小鼠数据集的453次运行，覆盖923,389个细胞，并链接了isoform、poly(A)位点、剪接连接和等位基因证据，提供完整的溯源信息和预计算的差异使用分析 | 未明确提及 | 整合分散的单细胞长读长数据集，提供一个可比较和重用的资源，以研究细胞类型特异性的isoform使用、替代多聚腺苷酸化和等位基因表达 | 人类和小鼠的单细胞长读长转录组数据 | 机器学习, 基因组学 | NA | 单细胞长读长转录组测序 | NA | 文本, 序列 | 923,389个细胞，来自34个数据集，453次运行 | Oxford Nanopore, PacBio | 单细胞长读长转录组测序 | NA | NA |
| 22 | 2026-10-26 |
Identification of a Novel EBF1-Expressing Disease-Associated Arterial Subpopulation in Pulmonary Arterial Hypertension
2026-Oct-23, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.328069
PMID:42922444
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研究论文 | 该研究构建了大鼠肺动脉高压模型的单细胞多组学数据集，鉴定出一个表达EBF1的新型疾病相关动脉内皮亚群，并验证了其作为治疗靶点的潜力 | 首次在肺动脉高压进展的4个时间点构建单细胞多组学数据集，鉴定出表达EBF1的新型疾病相关动脉内皮亚群，并通过计算机模拟和体内敲低实验验证EBF1是肺动脉高压的关键转录调控因子和治疗靶点 | 研究主要基于Sugen5416/缺氧大鼠模型，人类样本验证依赖于已发表的单细胞RNA测序数据再分析，体内敲低实验使用大鼠模型，尚未在人类临床试验中验证 | 通过鉴定肺动脉高压进展过程中独特的疾病相关细胞群体及其关键分子调控因子，理解肺动脉高压的分子病因，寻找新的治疗靶点 | Sugen5416/缺氧大鼠模型的肺动脉内皮细胞、人类肺动脉高压患者的已发表单细胞RNA测序数据 | 单细胞多组学、表观遗传学、心血管疾病 | 肺动脉高压 | 单细胞多组学（scRNA-seq + scATAC-seq）、免疫荧光、计算机模拟、腺相关病毒介导的体内敲低 | NA | 单细胞转录组数据、单细胞表观遗传数据、图像 | 大鼠模型4个不同时间点的肺动脉内皮细胞，以及已发表的人类肺动脉高压患者单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 23 | 2026-10-26 |
Epithelial-to-mesenchymal transition confers mechanical resistance to hemodynamic stress during hematogenous dissemination
2026-Oct-23, Journal of cell science
IF:3.3Q3
DOI:10.1242/jcs.265092
PMID:42924583
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研究论文 | 研究流体剪切力作为机械瓶颈选择性富集预先存在的间充质肿瘤细胞，而非诱导EMT，从而赋予血行转移中的机械抗性 | 提出FSS并非广泛诱导EMT，而是通过机械破坏上皮样表型选择性富集预存在的间充质细胞；直接操纵EMT状态证实因果关系；临床单细胞RNA-seq数据验证VIM/KRT比值与CTC丰度相关 | 摘要未明确说明；可能包括体外细胞系模型的局限性、单细胞分析样本量有限、未涉及体内动物实验验证 | 探究流体剪切力下循环肿瘤细胞存活的生物学特征及EMT状态对机械抗性的影响机制 | 同一细胞系分离的上皮和间充质子群、患者来源的CTC单细胞RNA-seq数据 | 肿瘤生物学、机械生物学 | 癌症转移（泛癌种） | 单细胞RNA-seq、体外流体剪切力实验、TGFβ诱导EMT、E-cadherin过表达 | NA | 单细胞转录组数据、实验数据 | 三个患者来源的CTC数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 24 | 2026-10-26 |
Macrophage-Derived Glycoprotein Nonmetastatic Melanoma Protein B Attenuates Cardiac Dysfunction by Promoting Vascular Endothelial Growth Factor-Independent Angiogenesis
2026-Oct-23, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.126.050564
PMID:42924840
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研究论文 | 本文研究了巨噬细胞来源的GPNMB在压力超负荷诱导的心脏重构中的作用，发现其通过CD44/mTOR轴促进不依赖VEGF的血管新生，从而改善心脏功能 | 首次揭示巨噬细胞分泌的GPNMB在压力超负荷心脏重构中的保护作用，并阐明其通过CD44/mTOR通路独立于VEGF促进血管新生的新机制 | 机制研究主要基于体外实验，体内直接证据有限；AAV9过表达为治疗性干预，尚未转化为临床；未完全明确GPNMB下游其他潜在通路 | 探究巨噬细胞来源的GPNMB在压力超负荷诱导的心脏重构和血管新生中的作用及机制 | 髓系特异性Gpnmb敲除小鼠、对照小鼠、人内皮细胞 | 心血管疾病、单细胞转录组学 | 心力衰竭 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 25 | 2026-10-26 |
Cellular diversity of the developing chick trigeminal ganglion at single-cell resolution
2026-Oct-23, Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists
IF:2.0Q3
DOI:10.1002/dvdy.70201
PMID:42924893
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研究论文 | 该研究对HH17期鸡三叉神经节进行单细胞RNA测序，构建了约87,000个细胞的高分辨率图谱，解析了神经嵴和颅基板来源细胞群的转录异质性与发育轨迹 | 首次在单细胞分辨率下构建发育中鸡三叉神经节图谱，利用RNA速率分析揭示神经嵴与颅基板来源群体向神经元分化汇聚的不同发育轨迹，并鉴定出谱系富集的lncRNA（如MIR137HG） | 仅覆盖HH17单一发育时间点，缺乏多时间点的动态发育信息，且未进行功能验证实验 | 解析发育中三叉神经节内异质性细胞群体的分子特征及其发育轨迹 | HH17期鸡胚胎三叉神经节 | 单细胞组学、发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | RNA速率分析 | 单细胞转录组数据、图像 | 约87,000个细胞（HH17期鸡三叉神经节） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 26 | 2026-10-26 |
Shared Genetic Architecture Between Mental Disorders and Heart Failure Subtypes: A Comprehensive Multitrait Genome-Wide Analysis
2026-Oct-23, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.126.052657
PMID:42925051
|
研究论文 | 该研究通过多性状全基因组关联分析揭示了精神障碍与心力衰竭亚型之间共享的遗传结构 | 首次综合运用多性状GWAS、跨表型关联分析、精细定位、贝叶斯共定位、单细胞RNA测序、遗传信息空间映射（gsMap）和Geneformer计算机扰动分析，系统鉴定精神障碍与心力衰竭之间的多效性基因和共享遗传位点 | 研究结果主要为探索性分析，缺乏功能验证实验，尚不能进行机制或治疗层面的解读 | 探究精神障碍与心力衰竭之间的共享遗传结构，鉴定与两者均相关的多效性候选基因 | UK Biobank队列中的精神障碍患者（如创伤后应激障碍、抑郁症、双相情感障碍）及心力衰竭患者 | 机器学习, 基因组学 | 心血管疾病, 精神疾病 | GWAS, LDSC, 多性状全基因组关联分析, 跨表型关联分析, 统计精细定位, 贝叶斯共定位, 单细胞RNA测序, gsMap空间映射 | Geneformer | 基因型数据, 图像, 文本 | UK Biobank前瞻性队列（具体样本量未在摘要中给出）；扩张型心肌病心脏细胞图谱 | NA | 单细胞RNA-seq, GWAS, 空间转录组学 | NA | NA |
| 27 | 2026-10-26 |
Single-Cell Measurement Revolution: A New Paradigm in Tuberculosis Diagnosis
2026-Oct-21, ACS measurement science au
IF:4.6Q1
DOI:10.1021/acsmeasuresciau.6c00245
PMID:42921420
|
观点文章 | 本文评述了三种互补的单细胞测量平台（scRNA-seq、单细胞表面增强拉曼光谱、单细胞荧光探针）在结核病诊断中检测单个活菌的潜力与挑战 | 系统性地将宿主免疫异质性分析（scRNA-seq）、病原体分子异质性分析（单细胞SERS）和病原体特异性荧光激活（单细胞荧光探针）三种单细胞测量范式整合到结核病诊断框架中，并提出以标本驱动的探针设计为未来方向 | 现有技术在多种临床标本（痰液、拭子、体液、组织、呼出气溶胶）中灵敏度不足，成本高且与常规临床工作流程不兼容；直接对结核分枝杆菌进行scRNA-seq的临床应用仍然有限；难以区分缓慢复制具有活力的杆菌与代谢活跃但不可复制的菌群 | 探讨单细胞测量技术能否可靠地在临床样本中检测单个活的结核分枝杆菌，并评估各平台的转化障碍与未来方向 | 结核分枝杆菌及结核病患者临床样本（痰液、拭子、体液、组织、呼出气气溶胶） | 单细胞分析、传染病诊断 | 结核病 | 单细胞RNA测序、单细胞表面增强拉曼光谱、单细胞荧光探针 | NA | 转录组数据、光谱数据、荧光成像数据、文本 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 28 | 2026-10-26 |
Hypoxia-induced SATB homeobox 2 increases hypoxia-inducible factor-1-dependent tumorigenesis and drives bevacizumab resistance in lung adenocarcinoma
2026-Oct-19, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.103069
PMID:42896440
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研究论文 | 该文揭示缺氧诱导的SATB2作为表观遗传调控因子，与HIF-1α和p300形成轴，促进肺腺癌的恶性进展和贝伐珠单抗耐药 | 首次识别SATB2为缺氧诱导的表观遗传调控因子，阐明HIF-1α直接结合SATB2启动子促进其表达，SATB2与HIF-1α及p300物理互作增强H3K27乙酰化和RNA聚合酶II延伸，形成正反馈回路放大缺氧转录程序，并揭示SATB2-p300-HIF-1α轴驱动贝伐珠单抗耐药 | 摘要未明确提及研究局限性 | 探究协调缺氧信号与肿瘤微环境重塑的表观遗传机制，并寻找肺腺癌抗血管生成治疗耐药的潜在治疗靶点 | 肺腺癌细胞模型、小鼠肿瘤模型及肺腺癌患者样本 | 数字病理, 空间转录组学, 肿瘤表观遗传学 | 肺癌 | 空间转录组学，基于参考的细胞类型去卷积分析 | NA | 空间转录组数据，图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 29 | 2026-10-26 |
Emerging role of AI in single-cell sequencing toward biomarker discovery, therapeutic target identification and precision medicine in lung cancer
2026-Oct-19, Critical reviews in oncology/hematology
DOI:10.1016/j.critrevonc.2026.105653
PMID:42896640
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综述 | 本文综述了单细胞测序和人工智能在肺癌生物标志物发现、治疗靶点识别和精准医学中的新兴应用 | 整合单细胞测序与人工智能分析，以克服传统批量测序在解析肿瘤异质性方面的局限，并识别传统统计方法难以检测的细微细胞状态、动态细胞相互作用和复杂分子通路 | 作为综述，未提供原始实验数据；未详细讨论这些技术临床转化面临的具体挑战和未来方向 | 探讨单细胞测序和人工智能在肺癌精准医学中的应用潜力，包括生物标志物发现、治疗靶点识别和个性化治疗选择 | 肺癌 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | 机器学习 | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 30 | 2026-10-26 |
Single-cell transcriptomic and immune microenvironment analyses reveal a TIMP1-associated OLFM4⁺ tumor epithelial program linked to colorectal cancer progression and immune evasion
2026-Oct-16, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.103066
PMID:42887063
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研究论文 | 通过单细胞转录组和免疫微环境分析，揭示了一个与TIMP1相关的OLFM4⁺肿瘤上皮细胞程序，该程序与结直肠癌进展和免疫逃逸相关 | 识别了C3 OLFM4⁺肿瘤上皮亚型，构建了OLFM4⁺肿瘤细胞风险评分（OTRS）模型，并揭示了TIMP1在结直肠癌恶性行为中的作用 | TIMP1功能仅在体外实验中评估，缺乏体内验证和临床队列的广泛验证 | 探究结直肠癌正常-腺瘤-癌序列中与进展相关的上皮细胞状态及其与免疫微环境的相互作用 | 结直肠癌患者的正常结直肠黏膜、腺瘤和肿瘤组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | Cox回归, LASSO回归, inferCNV, Monocle, Slingshot, CytoTRACE, CellChat, SCENIC | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 31 | 2026-10-26 |
Network pharmacology and single-cell sequencing analysis of gastrodin in anticancer effects against colorectal cancer by regulating key target genes and the tumor immune microenvironment
2026-Oct-15, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.103076
PMID:42879954
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研究论文 | 通过网络药理学、单细胞测序分析和体外实验，探究天麻素抗结直肠癌的作用机制及其对肿瘤免疫微环境的调控 | 首次整合网络药理学、多种机器学习算法（LASSO、SVM、随机森林及SHAP分析）、单细胞RNA测序、免疫浸润分析、分子对接与体外实验，系统揭示天麻素通过靶向核心基因（尤其是NFE2L3）并调控肿瘤免疫微环境抑制结直肠癌进展的机制 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验验证，缺乏体内动物实验和临床样本验证 | 阐明天麻素抗结直肠癌的潜在靶点、分子机制及其对肿瘤免疫微环境的调控作用 | 结直肠癌（CRC）相关基因、天麻素潜在靶点、结直肠癌细胞系及组织 | 数字病理学、机器学习 | 结直肠癌 | 网络药理学、转录组分析、单细胞RNA测序、分子对接 | LASSO回归、支持向量机（SVM）、随机森林、SHAP分析 | 文本、基因表达数据、图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 32 | 2026-10-26 |
Perturb-Seqr: Signature Search Engine Integrating Connectivity Mapping Resources
2026-Oct-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.10.06.757137
PMID:42926540
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研究论文 | 开发了一个整合多个 Connectivity Mapping 资源的综合搜索引擎 Perturb-Seqr，用于药物和靶点发现 | 首次整合了九个小分子转录组 Connectivity Maps 和七个单基因扰动表达 Connectivity Maps，构建了包含 450,271 个基因集、覆盖 9,856 种药物和 17,643 个基因扰动的统一搜索引擎 | 摘要中未明确提及 | 整合和评估新兴的 Connectivity Mapping 数据集，构建综合搜索引擎以识别疾病特征的潜在逆转剂和模拟剂，用于药物和靶点发现 | 九个小分子转录组 Connectivity Maps 和七个单基因扰动表达 Connectivity Maps | 机器学习 | NA | bulk RNA-seq, cDNA microarray, DRUG-seq, scRNA-seq, Perturb-seq, PISA proteomics | NA | 文本 | 450,271 个基因集，9,856 种独特药物扰动，17,643 个独特基因扰动，917 个细胞系和细胞类型 | NA | bulk RNA-seq, cDNA microarray, DRUG-seq, single-cell RNA-seq, Perturb-seq, PISA proteomics | NA | NA |
| 33 | 2026-10-26 |
Cellular and molecular census of the pleiotropic disease locus Negr1 in zebrafish
2026-Oct-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.10.08.757516
PMID:42926676
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研究论文 | 本文通过构建斑马鱼Negr1敲入报告基因，结合单细胞转录组学、全脑配准和单神经元投射映射，系统解析Negr1基因在细胞和分子层面的表达模式 | 首次在斑马鱼中构建Negr1敲入报告基因，并整合单细胞转录组学与全脑三维配准及单神经元投射映射，揭示Negr1在多类细胞中的分级表达及三个保守投射枢纽 | 研究基于斑马鱼模型，与人类大脑的物种差异可能影响结论的外推性；未直接验证不同细胞群体与具体疾病表型的因果关系 | 探究多效性疾病位点Negr1的细胞起源，确定该基因在脑内的表达细胞类型和空间分布 | 斑马鱼（Negr1敲入报告基因品系）的脑和视网膜组织 | 单细胞组学、神经科学、数字病理学 | 精神疾病（抑郁症、精神分裂症、自闭症谱系障碍、厌食症）、代谢疾病（体重指数相关） | 单细胞转录组测序、全脑配准、单神经元投射映射、敲入报告基因 | NA | 图像、文本（单细胞转录组数据） | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 34 | 2026-10-26 |
A Unified Comparison of 10X Genomics and Parse Biosciences scRNA-seq Technologies
2026-Oct-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.10.09.758116
PMID:42926792
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研究论文 | 系统比较10X Genomics Chromium与Parse Biosciences Evercode WT两种scRNA-seq平台的系统性偏差，聚焦基因计数和组成差异 | 通过按引物策略分离Parse读数，将引物化学偏差与平台层面效应区分开来，发现平台层面差异更大；发现Parse中核RNA相对富集；用不依赖液滴模型的污染度量方法反驳了Parse污染显著更低的说法 | 研究聚焦于基因计数和组成差异而非细胞类型分辨率；仅纳入7对匹配样本，样本量有限 | 系统表征和比较基于液滴与基于split-pool条形码的两种高通量scRNA-seq范式的系统性偏差 | 来自5项研究、涵盖多种组织和物种的7对匹配的10X Genomics Chromium与Parse Biosciences Evercode WT scRNA-seq样本 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达计数数据 | 7对匹配样本（来自5项研究） | 10x Genomics, Parse Biosciences | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium, Parse Evercode WT | 10X Genomics Chromium液滴法scRNA-seq与Parse Biosciences Evercode WT split-pool条形码scRNA-seq |
| 35 | 2026-10-26 |
A chimeric infection program and epigenetic conflict underpin endogenous giant virus latency
2026-Oct-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.10.09.758095
PMID:42926574
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研究论文 | 研究绿藻莱茵衣藻中内源巨型病毒punuivirus的潜伏机制，揭示嵌合感染程序与表观遗传冲突 | 首次揭示内源巨型病毒通过嵌合基因组结构（潜伏基因富集剪接体内含子和6mA标记，毒力基因受保守病毒启动子控制）和病毒编码的TET酶维持5mC低水平来实现潜伏与再激活的机制 | 研究仅基于莱茵衣藻- punuivirus单一系统，机制普适性需在其他GEVE系统中验证；单细胞水平病毒产生亚群的调控细节尚未完全阐明 | 探究内源巨型病毒如何适应宿主并在宿主防御机制下保持再激活能力 | 绿藻莱茵衣藻（Chlamydomonas reinhardtii）及其内源潜伏巨型病毒punuivirus | 微生物学、表观遗传学、病毒学 | NA | 单细胞RNA-seq、表观遗传分析（5mC和6mA甲基化检测） | NA | 转录组数据、表观遗传数据 | 单细胞RNA-seq分析莱茵衣藻细胞群体（近70%细胞表达病毒转录本）；比较完整GEVE株与自然缺失变异株 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 36 | 2026-10-26 |
An R-loop-related gene signature predicts prognosis and shapes the immune microenvironment in esophageal squamous cell carcinoma
2026-Oct-09, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-026-16564-4
PMID:42926202
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研究论文 | 该研究整合转录组和单细胞RNA测序数据，构建R-loop相关基因评分系统，预测食管鳞状细胞癌预后并刻画免疫微环境 | 首次系统刻画食管鳞状细胞癌中的R-loop景观，构建RLRG评分系统，并揭示SquamousEpithelium细胞在R-loop相关进展中的关键作用 | 研究结果仍需功能验证 | 构建R-loop相关基因评分系统以预测食管鳞状细胞癌预后并分析肿瘤免疫微环境和干性 | 食管鳞状细胞癌患者 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 转录组测序、单细胞RNA测序、RT-qPCR、Western Blot、免疫组织化学、免疫荧光 | 生物信息学算法 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、图像 | NA | NA | bulk RNA-seq、single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 37 | 2026-10-26 |
Random mtDNA mutagenesis maps genotype-phenotype associations across metabolic contexts and lineages
2026-Oct-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.10.08.757705
PMID:42926536
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研究论文 | 开发了mtDIVE随机线粒体DNA诱变平台，结合单细胞转录组学和mtDNA基因分型，在代谢状态和发育谱系中映射基因型-表型关联 | 首次实现池式线粒体正向遗传学筛选，可同时产生从单碱基替换到每分子超过100个突变的广泛基因型谱，并将mtDNA基因型与单细胞转录组表型直接关联 | 仅实现C→T突变类型，可能无法覆盖全部mtDNA突变谱；研究主要在人上皮细胞和斑马鱼胚胎中进行，向其他物种和组织的推广需进一步验证 | 解决mtDNA突变效应难以系统解析的问题，将mtDNA基因型与细胞表型联系起来，区分突变身份与突变负荷的后果 | 人上皮细胞和斑马鱼胚胎 | 线粒体遗传学 | 线粒体遗传病, 肿瘤 | 随机C→T诱变, 单细胞转录组学, mtDNA基因分型 | NA | 单细胞转录组数据, 基因型数据, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 38 | 2026-10-26 |
Restoration of deficient IL-15 signaling enhances innate lymphoid cell immunity in brain metastasis
2026-Oct-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.10.02.756334
PMID:42926552
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和功能耗竭模型，揭示了乳腺癌脑转移中1型固有淋巴细胞因IL-15信号缺陷而功能失调，并证明局部补充IL-15可恢复其抗肿瘤免疫 | 首次揭示脑转移微环境中IL-15可用性严重受限导致1型固有淋巴细胞组织特异性功能障碍，并提出局部IL-15信号激活作为颅内恶性肿瘤的先天免疫治疗策略 | 研究主要基于乳腺癌脑转移模型，未涵盖其他肿瘤类型的脑转移；IL-15Rα蛋白浓度差异的机制尚未完全阐明；iPSC-NK细胞的长期安全性和有效性需进一步验证 | 探究1型固有淋巴细胞在乳腺癌脑转移中的功能状态及其功能障碍的机制，并开发恢复其抗肿瘤免疫的治疗策略 | 乳腺癌脑转移小鼠模型中的1型固有淋巴细胞（NK细胞和ILC1）及肿瘤微环境 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌脑转移 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 39 | 2026-10-26 |
HIV remodels germinal centers through T follicular helper cell loss
2026-Oct-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.10.08.757815
PMID:42926580
|
研究论文 | 利用HIV感染者的罕见临床样本及淋巴类器官模型，揭示HIV通过丢失滤泡辅助性T细胞（Tfh）重塑生发中心结构与细胞组成 | 首次记录HIV感染者生发中心微环境的重新塑形，发现GC Tfh细胞减少及滤泡CD8 T细胞增加，并证明该变化独立于CD4计数；同时建立可形成生发中心样结构的淋巴类器官急性感染模型以重现上述发现 | 摘要未明确说明样本量及队列规模，类器官模型仅为急性感染模型，可能无法完全反映慢性感染的长期免疫重塑过程 | 理解HIV对生发中心及Tfh细胞的影响，阐明HIV储存库的免疫微环境，为治愈策略及免疫缺陷机制提供依据 | HIV感染者（PLWH）的淋巴组织临床样本及淋巴类器官感染模型 | 免疫学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、组织学图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 40 | 2026-10-26 |
Scalable localization of clustering instability for spatial transcriptomics
2026-Oct-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.10.08.738042
PMID:42926708
|
研究论文 | 本文提出了InSTability框架，用于在空间转录组学中定位聚类不稳定性，并系统评估了种子依赖性变异及其下游影响 | 提出了一种可解释的每个斑点聚类不稳定性评分，以及时间复杂度与斑点数量呈线性的算法，能够为大型高分辨率数据集生成空间分辨的聚类不稳定性图谱 | 摘要中未明确提及研究的具体局限性 | 系统评估空间转录组学中聚类方法的种子依赖性变异程度及其对下游分析的影响，并提供定位聚类不稳定性的工具 | 空间转录组学数据及七种聚类方法（BayesSpace、GraphST、Leiden、Louvain、SEDR、STAGATE和SpiceMix） | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 18个基准样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |