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当前共找到 43522 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-09-21 |
ABCC9/SUR2 has a Complex Expression Pattern in Human Brain Gliovascular Unit Cells, Including Astrocytes
2026-Sep-19, Journal of molecular neuroscience : MN
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12031-026-02603-z
PMID:42762395
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研究论文 | 本文通过多种数据集和新型抗血清分析了ABCC9/SUR2在人脑胶质血管单元细胞中的细胞类型特异性表达模式及其与遗传风险变异的关联 | 首次系统分析人脑SUR2在胶质细胞中的表达，使用新型SUR2抗血清，发现SUR2富集的星形胶质细胞亚群可能具有稳态功能并与甲状腺激素信号相关，且ABCC9单核苷酸变异rs1914361与星形胶质细胞中SUR2表达增加相关 | 小鼠脑组织中未检测到星形胶质细胞的Sur2表达，物种差异可能限制研究结果的转化应用；摘要中未提及样本量的具体信息 | 分析人脑胶质血管单元中ABCC9/SUR2的细胞类型特异性表达模式，探索其与已知遗传风险变异的相关性，并评估SUR2在神经血管耦合和衰老相关海马硬化中的作用 | 人脑组织样本（包括胶质血管单元细胞）、小鼠脑组织样本、单核RNA测序数据集、空间转录组数据 | 数字病理学、机器学习 | 阿尔茨海默病、衰老相关海马硬化 | 单核RNA测序、空间转录组学、免疫标记 | NA | 图像、文本（转录组数据） | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 22 | 2026-09-21 |
Integrative multi-omics analysis identifies LIPA as a prognostic hub and ferroptosis regulator in lung adenocarcinoma
2026-Sep-19, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-026-05741-5
PMID:42762413
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研究论文 | 通过整合多组学分析与实验验证，该研究构建了肺腺癌五基因预后特征，并揭示LIPA作为铁死亡调控因子和预后枢纽的作用 | 首次整合多组学分析和实验验证，发现LIPA作为肺腺癌中铁死亡和免疫调节的关键连接点，并通过虚拟筛选鉴定出Castanospermine作为潜在LIPA激活剂 | 摘要中未明确说明研究的具体局限性 | 识别肺腺癌中基于代谢重编程的生物标志物和治疗靶点 | 肺腺癌（LUAD）患者样本、肿瘤微环境中的单核细胞和巨噬细胞、小鼠模型 | 多组学分析 | 肺癌 | 多组学分析、LASSO回归、单细胞转录组测序、空间转录组学、虚拟筛选 | LASSO回归 | 转录组数据、图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 23 | 2026-09-21 |
PD-L1 antibody-induced cardiac dysfunction is regulated by CCR5-positive macrophages
2026-Sep-19, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2026.179333
PMID:42762914
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研究论文 | 该研究通过小鼠模型系统探究了PD-L1抗体诱导的早期心脏毒性效应，揭示了CCL5/CCR5轴是PD-L1诱导心脏毒性的核心机制，并证明CCR5拮抗剂maraviroc可有效减轻心脏毒性而不影响抗肿瘤疗效 | 首次通过整合心脏功能评估与空间转录组学揭示了PD-L1抗体急性破坏心脏同步性和收缩功能；鉴定出单核细胞来源的CCR5阳性巨噬细胞在PD-L1诱导的CCL5趋化因子信号驱动下增殖；证明CCR5拮抗剂maraviroc通过HIF-1α/PKM2 Y105磷酸化调节和凋亡抑制发挥多模式心脏保护作用，且不削弱抗肿瘤免疫应答 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人体中验证；maraviroc未能增强PD-L1治疗的抗肿瘤效果；机制的临床转化仍需进一步研究 | 系统研究PD-L1抗体诱导的早期心脏毒性效应及其机制，并探索CCR5阻断作为预防免疫治疗相关心脏并发症的可转化策略 | 黑色素瘤荷瘤小鼠模型及PD-L1抗体治疗下的心肌组织 | 数字病理学, 机器学习 | 肺癌, 心血管疾病 | 空间转录组学, 流式细胞术, 免疫荧光 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 24 | 2026-09-21 |
T-Cell Exhaustion and Senescence in Cancer: Regulatory Circuits and Therapeutic State Engineering
2026-Sep-19, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218841
PMID:42762964
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综述 | 本文综述了癌症中T细胞耗竭与衰老的调控回路，并从可逆性、抗原依赖性、增殖历史、表观遗传固定和代谢崩溃五个维度对功能失调的T细胞状态进行分类，同时将精准细胞因子、空间限制性共刺激、代谢干预、表观遗传调控、免疫检查点阻断和基因组工程等治疗策略映射到其意图影响的细胞状态转变上。 | 提出将功能失调的T细胞状态沿五个互补维度（可逆性、抗原依赖性、增殖历史、表观遗传固定、代谢崩溃）进行组织分类，并将多种治疗策略映射到其意图影响的特定状态转变上，从而将治疗问题从“如何广泛激活T细胞”转变为“应生成、保留或拯救哪些T细胞状态”，为基于状态的生物标志物开发和治疗设计提供了可检验的基础。 | 摘要中未明确提及本文的局限性 | 综述癌症中T细胞耗竭与衰老的调控回路，并建立基于T细胞状态的精准治疗设计框架 | 癌症中的T细胞，包括初始、活化、效应、记忆、耗竭和衰老T细胞 | 数字病理学, 机器学习 | 肺癌 | 高参数流式细胞术, 单细胞转录组学, 多组学分析 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 25 | 2026-09-21 |
MAL2-Driven Lipid Droplets as Trojan Horses: Subverting Immune Surveillance to Promote Colorectal Cancer Liver Metastasis
2026-Sep-19, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218847
PMID:42762965
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研究论文 | 该研究通过整合单细胞RNA测序、转录组分析和质谱流式技术，揭示MAL2通过驱动脂滴生成与分泌，重塑肝脏免疫微环境，促进结直肠癌肝转移的机制 | 首次揭示MAL2通过激活非经典NF-κB信号通路直接驱动FASN转录，促进脂滴生物合成与分泌；提出肿瘤来源脂滴作为“特洛伊木马”选择性招募PLIN2+中性粒细胞并诱导NETs形成，捕获FABP1+巨噬细胞，构建免疫抑制龛的新概念 | 摘要中未明确提及研究的具体局限性 | 阐明结直肠癌肝转移中肿瘤细胞通过代谢机制破坏肝脏免疫监视并重塑肿瘤微环境的分子机制 | 结直肠癌肝转移患者的肿瘤组织及肝脏转移灶微环境中的恶性上皮细胞、中性粒细胞、巨噬细胞等免疫细胞 | 数字病理学, 机器学习 | 结直肠癌, 肝癌 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 质谱流式技术 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式技术 | NA | NA |
| 26 | 2026-09-21 |
Elevated ISG15 reinforces RIG-I/MDA5-linked macrophage-microglia crosstalk during blood-brain barrier disruption in neuromyelitis optica spectrum disorder
2026-Sep-19, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.117433
PMID:42763248
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序结合体外和体内实验，揭示ISG15通过RIG-I/MDA5信号通路增强巨噬细胞-小胶质细胞炎症串扰，从而参与视神经脊髓炎谱系疾病的血脑屏障破坏过程 | 首次揭示ISG15在NMOSD中通过RIG-I/MDA5/LGP2信号轴驱动巨噬细胞与小胶质细胞之间的炎症串扰，并证实ISG15与RIG-I存在物理结合，建立了连接外周与中枢髓系炎症反应的关键放大通路 | 单细胞RNA测序仅基于外周血单个核细胞，样本量有限，且主要依赖体外细胞系模型和被动转移小鼠模型，缺乏更多临床样本验证 | 探究ISG15是否通过RIG-I样受体信号通路参与NMOSD中髓系细胞活化及血脑屏障损伤过程 | NMOSD患者的外周血单个核细胞、单核细胞、血清和脑脊液，以及THP-1来源巨噬细胞、HMC3/BV2小胶质细胞和AQP4-IgG/人补体被动转移小鼠模型 | 数字病理学 | 视神经脊髓炎谱系疾病 | 单细胞RNA测序、Western blotting、免疫共沉淀、Transwell共培养 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质表达数据、图像 | NMOSD患者外周血单个核细胞（具体数量未在摘要中说明），以及THP-1来源巨噬细胞、HMC3/BV2小胶质细胞系和AQP4-IgG被动转移小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 27 | 2026-09-21 |
A Critical Synthesis of Machine Learning in Autism Spectrum Disorder Genomic Research: From Transcriptomics to Microbiome
2026-09-18, Medeniyet medical journal
IF:1.1Q2
DOI:10.4274/MMJ.galenos.2026.69259
PMID:42682077
|
综述 | 本文对截至2026年5月机器学习在自闭症谱系障碍（ASD）基因组研究中的应用进展进行了批判性综合，涵盖转录组学、全外显子组测序、非编码变异解读、多组学整合、单细胞转录组学、表观遗传分析和肠道微生物组分析 | 采用目的性主题文献综合方法，对ASD基因组研究中机器学习应用进行了广泛而批判性的评估；强调了可解释性与预测性能是正交属性；指出文献中多个极端AUC值更可能与过拟合或数据泄漏有关而非真实信号；纳入了神经多样性视角和监管科学发展等未来方向 | 采用叙述性综述而非系统综述或荟萃分析，可能存在选择偏倚；对文献中极端AUC值的判断（过拟合或数据泄漏）因原始报告未提供充分信息而无法确定性地归因 | 综合和批判性评估机器学习在ASD基因组研究中的应用，从转录组学到微生物组，识别关键主题、挑战和未来方向 | 自闭症谱系障碍（ASD）相关的基因组研究文献，包括基因表达、全外显子组测序、非编码变异、多组学、单细胞转录组、表观遗传和肠道微生物组数据 | 机器学习 | 自闭症谱系障碍 | 全外显子组测序, 转录组学分析, 单细胞转录组学, 表观遗传分析, 肠道微生物组分析, 多组学整合 | 深度学习, 神经网络, SHAP可解释AI框架 | 文本, 基因组数据, 转录组数据, 微生物组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 28 | 2026-09-21 |
Kaempferol attenuates type 2 diabetic osteoporosis via METTL3/YTHDF2-regulated PTEN m⁶A methylation and ferritinophagy-ferroptosis inhibition
2026-Sep-18, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2026.108473
PMID:42759588
|
研究论文 | 该研究通过生物信息学、细胞和动物实验探讨山奈酚通过METTL3/YTHDF2调控PTEN m⁶A甲基化及抑制铁蛋白自噬-铁死亡改善2型糖尿病骨质疏松的作用与机制 | 首次揭示山奈酚通过METTL3/YTHDF2/PTEN/PI3K/AKT轴抑制铁蛋白自噬依赖性铁死亡来缓解2型糖尿病骨质疏松，并发现YTHDF2选择性拮抗剂DC-Y13-27可逆转其保护作用 | 未明确说明样本量及单细胞RNA-seq数据的具体细胞数量，动物实验仅采用一种T2DOP模型，缺乏临床患者样本验证 | 探究山奈酚对2型糖尿病骨质疏松的治疗作用及其通过m⁶A修饰和铁蛋白自噬依赖性铁死亡的分子机制 | 2型糖尿病骨质疏松相关的骨髓间充质干细胞（BMSCs）及T2DOP小鼠模型 | 机器学习 | 骨质疏松 | 单细胞RNA-seq, 网络药理学, 分子对接, 多种分子生物学实验 | NA | 图像, 文本 | 使用单细胞RNA-seq数据集GSE212726，具体细胞数量未明确；细胞模型和动物模型样本量未说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 29 | 2026-09-21 |
Role of BTLA in ovarian cancer and its clinical prognostic significance based on multi-omics analysis
2026-Sep-17, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-026-02231-6
PMID:42754905
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研究论文 | 基于多组学分析探讨BTLA在卵巢癌中的表达、临床预后意义、功能特征及治疗相关性 | 首次基于多组学分析系统揭示BTLA在卵巢癌中的表达上调、预后关联、免疫相关功能及与染料木素的中等结合亲和力 | 回顾性探索性分析，预后关联需前瞻性大样本验证，分子对接和药物敏感性分析仅为初步预测，缺乏体内实验验证 | 探讨BTLA在卵巢癌中的表达模式、临床预后价值及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 卵巢癌患者组织样本及公共转录组和单细胞RNA测序数据 | 数字病理学, 机器学习 | 卵巢癌 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, 分子对接, 药物敏感性分析 | Cox回归 | 文本, 图像 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 30 | 2026-09-21 |
Immune dysregulation and stem-like CD8+ T cell enrichment in type 1 diabetes pancreatic lymph nodes
2026-Sep-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI196445
PMID:42741944
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研究论文 | 该研究通过质谱流式和单细胞RNA测序结合T细胞受体分析，揭示了1型糖尿病胰腺淋巴结中免疫失调和干细胞样CD8+ T细胞富集的现象 | 结合质谱流式、单细胞RNA测序和TCR分析，首次在1型糖尿病胰腺淋巴结中鉴定出TSCM样细胞富集，并发现IL-15信号驱动相关表型，同时揭示了胰腺与淋巴结中效应CD8+ T细胞的共享及定位差异 | 未明确说明 | 探究1型糖尿病中效应CD8+ T细胞的分子缺陷、组织表型和受体特异性 | 人胰腺淋巴结和胰腺组织 | 单细胞组学 | 1型糖尿病 | 质谱流式, 单细胞RNA测序, T细胞受体分析 | NA | 单细胞转录组, 蛋白质表达, TCR序列, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 31 | 2026-09-21 |
The role of spatial transcriptomics in exploring the tumor microenvironment in neuroblastoma
2026-Sep-15, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2026.118474
PMID:42744278
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综述 | 本文综述了空间转录组学（ST）在神经母细胞瘤肿瘤微环境（TME）研究中的应用，涵盖空间生物学历史、单细胞技术应用及ST的突破性意义 | 系统阐述了新型空间转录组学技术如何在保留组织天然结构的前提下实现单细胞水平分析，为神经母细胞瘤TME研究提供革命性工具 | 传统单细胞分析平台需将组织解离为单细胞悬液，牺牲了肿瘤的关键空间组织信息；早期空间转录组平台受分辨率限制 | 探讨空间转录组学在神经母细胞瘤肿瘤微环境研究中的作用与前景 | 神经母细胞瘤及其肿瘤微环境中的免疫细胞和基质细胞 | 空间转录组学 | 神经母细胞瘤 | 空间转录组学，单细胞分析 | NA | 基因表达数据，空间信息 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 32 | 2026-09-21 |
Benchmarking reference-based cellular deconvolution algorithms to predict cell proportions
2026-Sep-15, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 本文对十种基于参考的细胞去卷积算法进行了系统基准测试，通过六个实验和两个独立数据集评估其预测细胞比例的性能 | 首次对十种架构多样且流行的基于参考的去卷积算法进行系统基准测试，涵盖基线条件、测序深度鲁棒性和参考不匹配等多种条件，并使用两个独立数据集进行验证 | 仅评估了十种算法，未涵盖所有现有方法；仅使用了两个独立数据集，可能无法完全代表所有生物学场景；未评估算法在极低测序深度或高度异质性样本中的表现 | 系统比较和评估基于参考的细胞去卷积算法在不同条件下的性能，为研究人员选择合适方法提供实践指导 | 十种基于参考的细胞去卷积算法：MuSiC、DWLS、BayesPrism、CIBERSORTx、SCDC、BisqueRNA、DISSECT、TAPE、Scaden和scpDeconv | 机器学习 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | 文本 | 两个独立数据集 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 33 | 2026-09-21 |
NK3 subsets are linked to NK cell exhaustion and immunotherapy responsiveness in tumor
2026-Sep-11, Seminars in oncology
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.seminoncol.2026.152562
PMID:42762807
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研究论文 | 本研究利用公开的单细胞RNA测序数据集，识别肿瘤中自然杀伤（NK）细胞的耗竭亚群，并通过计算轨迹分析揭示其转录连续体 | 发现NK3亚群在肿瘤患者中表现出更多的耗竭特征，且LAG-3在NK耗竭亚群中相对特异性富集，并揭示了NK耗竭亚群与免疫检查点阻断治疗反应的相关性 | 研究主要基于公共数据集的计算分析，缺乏实验验证，且样本来源和数量可能有限 | 初步表征NK细胞耗竭亚群，探索LAG-3在NK细胞耗竭过程中的潜在调控作用，为靶向NK耗竭细胞的免疫治疗策略提供理论参考 | 肿瘤患者的NK细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 34 | 2026-09-21 |
Notch1 supports proliferation and bioenergetic activity in a pancreatic neuroendocrine neoplasm cell line
2026-Sep-09, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218800
PMID:42716421
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研究论文 | 本研究探讨了Notch1在胰腺神经内分泌肿瘤中的表达模式及其对肿瘤细胞增殖、细胞周期和生物能量代谢的影响 | 首次揭示Notch1在正常成人胰腺神经内分泌细胞中不表达但在胰腺神经内分泌肿瘤中重新表达，并通过CRISPR/Cas9敲除实验证明Notch1支持肿瘤细胞增殖和生物能量代谢 | 研究主要基于单一胰腺神经内分泌肿瘤细胞系BON，缺乏多种细胞系和临床样本的验证 | 探究Notch1信号通路在胰腺神经内分泌肿瘤中的表达及其功能作用 | 胰腺神经内分泌肿瘤组织样本和BON细胞系 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，免疫组化，CRISPR/Cas9基因敲除，转录组学，蛋白质组学 | NA | 图像，文本 | 胰腺神经内分泌肿瘤组织微阵列样本及BON细胞系 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 35 | 2026-09-21 |
Targeting epithelial IFN-I signaling restores barrier integrity in anti-TNF refractory Crohn's disease
2026-Sep-03, Journal of Crohn's & colitis
DOI:10.1093/ecco-jcc/jjag140
PMID:42762499
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研究论文 | 该研究揭示克罗恩病中TNF-IFN-I信号串扰驱动肠上皮功能障碍，并发现靶向上皮IFN-I信号可恢复抗TNF治疗无应答患者的屏障完整性 | 首次将上皮TNF-IFN-I信号串扰确定为抗TNF治疗无应答的先前未被认识的关键机制，并提出上皮IFN-I阻断作为抗TNF难治性克罗恩病的新型治疗挽救策略 | 研究主要基于体外类器官模型和有限的患者样本，缺乏大规模临床试验验证，抗IFN-I抗体治疗的体内安全性和有效性尚需进一步评估 | 探究上皮TNF-IFN-I信号串扰在克罗恩病上皮功能障碍和抗TNF治疗无应答中的作用机制 | 克罗恩病患者肠道活检组织、CD供体单细胞RNA测序数据、TNFR1缺陷小鼠及患者来源类器官 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 文本 | 克罗恩病患者肠道活检组织样本、CD供体单细胞RNA测序数据、小鼠及患者来源类器官 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 36 | 2026-09-21 |
Matrix Stiffness Induces Endothelial Network Senescence
2026-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.76304
PMID:42389866
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研究论文 | 该研究开发了一种三维人类体外模型，将机械应力与炎症或生化信号解耦，发现细胞外基质硬化可诱导内皮细胞衰老表型，并涉及Notch信号通路的激活 | 开发了一种能够将机械应力与炎症或生化信号解耦的三维人类体外模型，首次证明基质硬化单独即可诱导内皮细胞衰老，并发现FDA批准的γ-分泌酶抑制剂可减轻硬化诱导的衰老 | 研究主要基于体外模型和有限的临床组织样本验证，需要更大规模的临床研究进一步证实该机制在体内的普遍性 | 研究细胞外基质硬化引起的机械应力如何驱动内皮细胞衰老，并探索相关的治疗靶点 | 人类内皮细胞、合成乳房植入物患者的纤维化包膜组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 文本 | 合成乳房植入物患者的纤维化包膜组织样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 37 | 2026-09-21 |
Profiling maize embryonic leaf development and discovering new genes using high-resolution spatial long-read isoform sequencing
2026-Sep, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-026-02364-y
PMID:42608546
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研究论文 | 该研究结合高通量全长异构体测序与空间转录组学（spatial MAS-IsoSeq），对玉米胚胎叶片发育进行空间全长异构体分析，构建了新的基因模型数据库MaizeV5_IsoAnn并发现新基因 | 开发了spatial MAS-IsoSeq技术，将高通量全长异构体测序与空间转录组学结合；鉴定出285,639个异构体，其中72.87%为先前未表征的；构建了包含5,228个新基因和1,674个具有5'和/或3'侧翼区域延伸基因的MaizeV5_IsoAnn基因模型数据库；提出了LBD26作为玉米胚胎叶脉发育的关键转录因子 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 对玉米胚胎叶片发育进行空间全长异构体分析，构建基因模型数据库，并阐明胚胎叶片发育过程和机制 | 玉米胚胎叶片发育过程及其转录组异构体 | 空间转录组学、基因组学 | NA | 高通量全长异构体测序、空间转录组学、染色质可及性分析 | NA | 转录组测序数据、空间转录组数据、染色质可及性数据 | NA | NA | 空间转录组学、全长异构体测序 | NA | spatial MAS-IsoSeq |
| 38 | 2026-09-21 |
Long-Read Single-Cell RNA Sequencing Reveals Dynamic Isoform Changes During Corneal Epithelial Wound Healing in Cynomolgus Monkeys
2026-Sep-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.11.34
PMID:42747255
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研究论文 | 该研究利用长读长单细胞RNA测序技术，揭示了食蟹猴角膜上皮创伤愈合过程中动态的异构体变化 | 首次在食蟹猴角膜上皮创伤愈合模型中应用长读长单细胞RNA测序（HIT-scISOseq）进行异构体水平分析，发现了基因水平分析无法检测到的广泛异构体变化，包括异构体使用、多样性和转换的动态改变 | 研究仅涵盖未损伤、损伤后1天和3天三个时间点，样本量有限；验证实验主要在HCE-T细胞系和有限猴角膜组织中进行；未进行功能实验验证关键异构体的具体生物学功能 | 表征食蟹猴角膜上皮创伤愈合过程中异构体水平的转录变化，揭示异构体调控在角膜上皮修复中的作用 | 食蟹猴角膜缘组织，以及划痕损伤的HCE-T细胞 | 单细胞转录组学 | 角膜上皮创伤 | 长读长单细胞RNA测序（HIT-scISOseq）、RT-qPCR、RNA-FISH | NA | 基因表达数据（全长转录本测序数据）、图像 | 食蟹猴角膜缘组织在未损伤、损伤后1天和3天三个时间点，具体样本数未提及 | NA | 长读长单细胞RNA测序 | HIT-scISOseq | HIT-scISOseq是一种长读长单细胞方法，可检测全长转录本 |
| 39 | 2026-09-21 |
Phthalate exposure and osteoporosis: NHANES associations and integrative in silico prioritization of candidate molecular targets
2026-Sep, Chemosphere
IF:8.1Q1
|
研究论文 | 该研究利用NHANES人群数据结合多种计算生物学方法，探讨了邻苯二甲酸酯暴露与骨质疏松之间的关联，并优先筛选出潜在的候选分子靶点 | 将大规模人群流行病学关联分析与整合性计算生物学方法相结合，系统性地筛选和定位邻苯二甲酸酯暴露与骨质疏松关联的候选分子靶点及细胞背景 | 研究为观察性设计，无法建立邻苯二甲酸酯诱导骨质疏松的因果机制，且计算分析结果尚需未来实验验证 | 评估尿液邻苯二甲酸酯暴露负担与骨质疏松之间的关联，并通过整合性计算分析优先筛选候选分子靶点 | 2003-2010年NHANES的8273名参与者 | 机器学习 | 骨质疏松 | 转录组学，靶点预测，加权基因共表达网络分析，机器学习，免疫浸润分析，单细胞转录组学，细胞间通讯分析，拟时序分析，通路评分，分子对接 | 机器学习 | 文本，图像 | 8273名参与者，其中939名符合骨质疏松定义 | NA | NA | NA | NA |
| 40 | 2026-09-21 |
Programmed Clonal Expansion Associated with V(D)J Recombination Drives an ATM-Dependent Vulnerability Underlying Preferential Lymphocyte Depletion and Myeloid Bias Following DNA Damage
2026-Aug-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.08.05.743027
PMID:42760984
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研究论文 | 该研究系统表征了年轻成年小鼠在2 Gy电离辐射后48小时的急性造血反应，利用单细胞RNA测序揭示V(D)J重排相关的程序性克隆扩增导致淋巴细胞对DNA损伤的超敏性，并证明该过程依赖于ATM介导的DNA损伤应答 | 首次将DNA损伤后淋巴细胞的优先耗竭归因于V(D)J重排相关的程序性克隆扩增，并阐明这一发育阶段特异性脆弱性由ATM依赖性DNA损伤应答介导，为髓系偏向提供了机制解释 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证；仅观察了2 Gy剂量和48小时时间点，缺乏剂量梯度和时间动态分析；ATM缺陷拯救实验的分子机制细节仍有待深入解析 | 阐明DNA损伤后淋巴生成优先受抑制及髓系偏向产生的机制 | 年轻成年小鼠的骨髓和胸腺造血系统 | 单细胞组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 年轻成年小鼠接受2 Gy电离辐射后48小时的骨髓和胸腺样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |