单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 39033 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-05-04 |
ScRNA-Seq: A way to reveal the potential mechanisms of metastasis in small cell lung cancer
2026-May, Bulletin du cancer
IF:1.1Q4
DOI:10.1016/j.bulcan.2025.12.014
PMID:41760455
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在揭示小细胞肺癌转移潜在机制中的应用 | 强调单细胞测序技术能够以单细胞分辨率揭示肿瘤异质性、肿瘤微环境和细胞间通讯网络，克服传统高通量测序无法捕捉细胞间异质性的局限性 | 未明确说明局限性 | 探讨单细胞测序技术在小细胞肺癌转移机制研究中的潜力和挑战 | 小细胞肺癌的转移机制及其细胞异质性和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 22 | 2026-05-04 |
Cell-specific gene expression plasticity in response to hypoxia promotes high-altitude adaptive evolution
2026-May, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-025-3108-3
PMID:41793589
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研究论文 | 该研究利用绵羊从平原到高原的转运实验，结合单细胞RNA测序和单核RNA测序技术，揭示了细胞在低氧环境下通过基因表达可塑性促进高海拔适应的进化机制 | 首次构建重要器官在低氧适应过程中的细胞转录组图谱，发现免疫细胞中逆转可塑性对遗传适应的促进作用，并揭示了AP-1→HIF∣-BHLHE41网络在三种器官中的共同调控机制 | 未提及 | 探究基因表达可塑性与遗传适应在低氧环境下的分子和细胞机制 | 绵羊的脑、心脏和肺组织 | 自然语言处理 | 心血管疾病 | scRNA-seq, snRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 27只绵羊的236,805个细胞和906,315个细胞核 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 23 | 2026-05-04 |
Preimplantation genetic testing for meiotic aneuploidy in trophectoderm biopsies - is it time to change our approach?
2026-May, Reproductive biomedicine online
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.rbmo.2026.105504
PMID:41865500
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评论文章 | 讨论在滋养层活检中区分减数分裂与有丝分裂非整倍体的必要性，提出核型定位技术可改善胚胎植入前遗传学检测的准确性 | 首次提出结合核型定位和亲本强度分析来区分减数分裂与非整倍体，避免误弃仅含临床意义未知的有丝分裂非整倍体的潜在可用胚胎 | NA | 改进胚胎植入前遗传学检测策略，减少非整倍体误判导致的胚胎丢弃 | 囊胚期滋养层活检样本 | 生物信息学 | 染色体非整倍体相关疾病 | 单核苷酸多态性亲本单倍型分析（核型定位）、单细胞测序 | NA | 遗传数据（单核苷酸多态性、单细胞序列） | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24 | 2026-05-04 |
Unannotated noncoding transcripts as a source of intratumor heterogeneity in malignant cell states
2026-May, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-025-3273-6
PMID:41870780
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研究论文 | 本研究通过分析12种常见癌症类型的3'端单细胞RNA测序数据，发现了与恶性细胞状态密切相关的未注释非编码转录本，并验证其在肿瘤内异质性中的作用 | 首次发现未注释的非编码转录本通过表观遗传激活驱动肿瘤内转录组异质性，并验证了两个非编码转录本促进肺癌细胞增殖和迁移的功能 | 未明确说明样本量及跨癌种的系统验证不足，功能验证仅限于肺癌细胞系 | 探索未注释非编码转录本在肿瘤内异质性中的分子机制及其功能意义 | 12种常见癌症类型的恶性细胞 | 机器学习和生物信息学 | 泛癌（肺癌、前列腺癌等12种） | 单细胞RNA测序（3'标签），多区域批量RNA测序，表观遗传学分析 | NA | 单细胞转录组数据，批量RNA测序数据，多组学数据 | 覆盖12种癌症类型的肿瘤样本（具体数量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 测序试剂盒 |
| 25 | 2026-05-04 |
scSurvival: Single-Cell Survival Analysis of Clinical Cancer Cohort Data at Cellular Resolution
2026-May-01, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-25-0965
PMID:42013315
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研究论文 | 提出scSurvival框架，在单细胞分辨率下对临床癌症队列数据进行生存分析 | 首个直接从单细胞数据建模生存结局的注意力多实例Cox回归框架，整合变分自编码器处理高维、稀疏和批次效应 | 未明确说明 | 开发直接从单细胞转录组数据预测患者生存并识别关键细胞亚群的方法 | 黑色素瘤和肝癌患者的单细胞RNA测序队列数据 | 机器学习 | 黑色素瘤, 肝癌 | 单细胞RNA测序 | 注意力多实例Cox回归, 变分自编码器 | 单细胞转录组数据, 临床生存数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 26 | 2026-05-04 |
Macrophage-related Genomic Signatures Predict HCC Prognosis and Therapy Response
2026 May-Jun, Cancer genomics & proteomics
IF:2.6Q3
DOI:10.21873/cgp.20587
PMID:42055628
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研究论文 | 整合单细胞和bulk RNA-seq数据识别巨噬细胞相关基因特征，构建HCC预后和免疫治疗反应预测模型 | 首次利用巨噬细胞相关基因特征进行肝癌分子亚型划分，并基于主成分分析构建预后模型；整合单细胞与bulk转录组数据揭示免疫微环境差异 | 研究仅依赖公开数据库（GSE151530, HCCDB18, TCGA-HCC），缺乏独立外部验证队列；未进行实验验证巨噬细胞相关基因的功能机制 | 识别巨噬细胞相关基因组特征，划分肝细胞癌分子亚型，构建预后模型预测生存和疗法反应 | 肝细胞癌患者样本的转录组数据（单细胞和bulk RNA-seq）及对应临床信息 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | 主成分分析 | 基因表达数据 | 整合GSE151530（scRNA-seq）、HCCDB18（bulk RNA-seq）和TCGA-HCC（bulk RNA-seq）数据集 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 27 | 2026-05-04 |
Single-Cell Analysis Identified a Recurrent Malignant-Associated Transcriptional State in Colorectal Cancer
2026-May, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.70335
PMID:41770629
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研究论文 | 对四名日本结直肠癌患者的肿瘤和邻近正常组织进行单细胞RNA测序，鉴定出一个与恶性相关的重复性转录状态，并发现RASSF6表达在该状态中显著降低 | 首次在单细胞层面描述了日本结直肠癌患者中一个反复出现的癌症相关转录状态，并揭示了肿瘤组织中RASSF6表达一致降低的特征，该特征在群体平均分析中可能被低估 | 样本数量有限（仅四名日本患者），且未在更大队列中验证该转录状态的普适性 | 通过单细胞转录组分析揭示结直肠癌的分子异质性，并鉴定与恶性肿瘤相关的细胞状态 | 四名日本结直肠癌患者的肿瘤组织和邻近正常组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 4名患者的肿瘤和邻近正常组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 28 | 2026-05-04 |
Tetrameric STAT5 regulates the formation of immune niche cells to protect stem cell regenerative repair against mucosal inflammation
2026-May-01, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-026-01716-0
PMID:42062572
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研究论文 | 四聚体STAT5通过调节免疫微环境细胞保护肠道干细胞再生修复免受黏膜炎症影响 | 发现四聚体STAT5抑制隐窝T细胞微环境形成，打破其可促进TCRγδ细胞扩增并增强肠道干细胞再生，为炎症性肠病治疗提供新靶点 | 未提及 | 探究四聚体STAT5在肠道炎症中调控干细胞再生修复的机制 | 肠道干细胞、隐窝T细胞、STAT5四聚体 | 机器学习 | 炎症性肠病（溃疡性结肠炎） | 染色质免疫沉淀、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | IBD患者标本、STAT5高活性及四聚体缺陷小鼠、类器官 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 29 | 2026-05-04 |
Immune cell annotation in the single-cell studies: technologies, challenges, and integrative solutions
2026-May-01, Immunologic research
IF:3.3Q3
DOI:10.1007/s12026-026-09780-4
PMID:42062653
|
综述 | 综述单细胞研究中免疫细胞注释的技术挑战与整合解决方案 | 详细阐述mRNA与蛋白质表达差异的生物学因素和技术假象，并系统评估转录组、蛋白质组及多模态技术的优缺点 | 未提供实证数据验证所提方法的有效性，且未涉及大规模临床样本的应用验证 | 探讨免疫细胞注释在单细胞研究中的挑战并整合多模态解决方案 | 免疫细胞（如外周血单核细胞）及其转录组与蛋白质组数据 | 自然语言处理，数字病理 | 非特定疾病 | 单细胞RNA测序，CITE-seq | NA | 转录组数据，蛋白质组数据 | NA | 10x Genomics, BD Biosciences, Illumina | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | 10x Chromium, BD Rhapsody, Illumina NovaSeq | CITE-seq整合转录组与表位测序 |
| 30 | 2026-05-04 |
A Decline in Follicle Cell Function Is a Major Driver of Drosophila Ovarian Aging
2026-May, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70529
PMID:42062799
|
研究论文 | 发现卵泡细胞功能下降是果蝇卵巢老化的主要驱动因素 | 通过单细胞RNA测序揭示卵泡系细胞在卵巢老化中基因表达变化最多，并通过遗传操作Atg8a基因改善卵巢体细胞功能和生殖能力 | 研究仅以果蝇为模型，结果可能不能直接推广到人类等高等生物 | 探究果蝇卵巢老化的细胞和分子机制，并寻找延缓生殖老化的策略 | 果蝇卵巢（卵泡细胞和生殖细胞） | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 31 | 2026-05-04 |
Conventional type-1 DC density is associated with checkpoint inhibitor response across multiple types of cancer
2026-May-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI200987
PMID:42065248
|
研究论文 | 分析多种癌症类型中传统1型树突状细胞密度与检查点抑制剂治疗反应之间的关联 | 首次在多癌种中系统验证cDC1密度与免疫检查点抑制剂疗效的强关联，并结合空间转录组学揭示cDC1-CD8+ T细胞组织微环境与治疗预后的关系 | 主要基于回顾性临床试验数据，cDC1作为生物标志物的前瞻性验证尚未完成 | 探究cDC1树突状细胞密度对免疫检查点抑制剂治疗反应的预测价值 | 黑色素瘤、尿路上皮癌、非小细胞肺癌患者的肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 肺癌, 黑色素瘤, 尿路上皮癌 | RNA测序, 多重免疫荧光, 空间转录组学, GeoMX-DSP | NA | RNA序列, 图像 | 7项关键临床试验的RNA序列数据，黑色素瘤、尿路上皮癌和非小细胞肺癌的多重免疫荧光样本 | NA | 空间转录组学 | Xenium, GeoMX-DSP | Xenium空间转录组学平台用于黑色素瘤样本分析，NSCLC样本使用GeoMX-DSP分析 |
| 32 | 2026-05-04 |
Evidence of off-target probe binding affecting 10x Genomics Xenium gene panels compromise accuracy of spatial transcriptomic profiling
2026-May-01, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.107070
PMID:42065925
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研究论文 | 探究10x Genomics Xenium探针的脱靶结合对空间转录组分析准确性的影响 | 开发了Off-target Probe Tracker（OPT）软件工具来识别探针脱靶结合，并通过多方数据验证了其对基因表达模式的扭曲效应 | 未说明 | 评估探针脱靶结合对空间转录组数据准确性的影响并提升生物学可解释性 | 10x Genomics Xenium技术及其探针面板 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 图像、文本 | 单个人类乳腺癌样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | Xenium人类乳腺癌基因面板、Visium CytAssist、3'单细胞RNA-seq |
| 33 | 2026-05-04 |
Integrative multi-omics analysis identifies coronin 1C as a potential mediator linking circadian rhythm disruption to neuroimmune dysregulation in ischemic stroke
2026-May-01, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116732
PMID:42068898
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研究论文 | 通过整合多组学分析，发现CORO1C是连接昼夜节律紊乱与缺血性卒中神经免疫失调的关键介质 | 首次将昼夜节律紊乱与缺血性卒中后的神经免疫失调联系起来，并鉴定CORO1C作为核心调控因子，利用单细胞转录组学和虚拟基因敲除分析揭示其机制 | 未提及具体局限性，但可能包括体内外模型与人类生理的差异、样本量限制以及因果关系验证的深度 | 探究昼夜节律紊乱是否通过免疫失衡促进缺血性卒中进展及其分子机制 | 人类缺血性卒中脑组织转录组数据、外周血单核细胞单细胞RNA测序数据、小鼠昼夜节律时相依赖性卒中模型 | 机器学习, 数字病理学 | 缺血性卒中 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 基因敲除 | 机器学习模型 | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | 人类脑组织和血液样本，小鼠模型（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 34 | 2026-05-04 |
A human endometrium-on-chip platform for functional assessment of luminal epithelial receptivity
2026-Apr-30, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117349
PMID:42068548
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研究论文 | 开发了一种人类子宫内膜芯片模型，用于评估腔上皮细胞对胚胎植入的功能性接收能力 | 首次构建了能够定量测量胚泡附着到患者来源腔上皮的人类器官芯片模型，并挑战了基于转录组标记的接收性定义 | 未提及具体局限性，但可能包括模型简化了体内微环境的复杂性 | 研究人类子宫内膜上皮细胞在胚胎植入过程中获得接收性的分子机制 | 人类子宫内膜腔上皮细胞和胚泡 | 数字病理学 | 生殖医学相关疾病 | 单细胞RNA测序 | 器官芯片模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量，但涉及患者来源的子宫内膜上皮 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 35 | 2026-05-04 |
Identification of key driver genes in idiopathic pulmonary arterial hypertension by single-cell RNA sequencing and experimental validation
2026-Apr-30, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153869
PMID:42068750
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和实验验证，鉴定特发性肺动脉高压的关键驱动基因 | 首次整合单细胞RNA测序分析与体内外实验验证，系统筛选出四个关键枢纽基因（COL1A1、MYL9、COL1A2和TPM2），并证实其沉默可抑制HMGB1诱导的肺动脉平滑肌细胞增殖和迁移 | 未提及研究局限 | 揭示特发性肺动脉高压的分子机制并鉴定潜在治疗靶点 | 肺动脉平滑肌细胞 | 生物信息学 | 特发性肺动脉高压 | 单细胞RNA测序、qPCR、Western blotting、siRNA敲低 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 36 | 2026-05-04 |
The Applications of Single-Cell and Spatial Transcriptomics in Neuroscience and Brain Disorders
2026-Apr-30, Neuroscience and biobehavioral reviews
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.neubiorev.2026.106721
PMID:42069165
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综述 | 综述单细胞和空间转录组学在神经科学和脑疾病中的应用 | 系统总结了主要空间转录组学平台及其优缺点，并特别强调了在神经科学中的应用，如脑细胞类型鉴定、结构-功能关系和发育过程，以及精神疾病和神经退行性疾病中的空间基因表达模式 | 作为综述，未提供新的实验数据或发现，且侧重于现有技术总结，可能未涵盖最新未发表的研究 | 总结空间转录组学技术平台，并探讨其在神经科学和脑疾病研究中的应用和未来方向 | 空间转录组学技术及其在神经科学和脑疾病（如阿尔茨海默病、抑郁症）中的应用 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病, 抑郁症 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 空间数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 37 | 2026-05-04 |
The BTN3A3-TOMM22 axis preserves mitochondrial homeostasis to facilitate HCC stemness and drug resistance
2026-Apr-30, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218557
PMID:42069175
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研究论文 | 本研究揭示了BTN3A3-TOMM22轴通过维持线粒体稳态促进肝癌干性和耐药性的新机制 | 首次阐明BTN3A3在肝细胞癌中通过非免疫性方式调控线粒体重编程，防止TOMM22泛素化降解以维持线粒体稳态，从而驱动干性和耐药性 | 尚未明确BTN3A3在线粒体转位及与TOMM22相互作用的精细分子机制 | 探究BTN3A3在肝细胞癌干性和耐药性中的作用及其线粒体相关分子机制 | 肝细胞癌细胞、原位异种移植小鼠模型、患者来源类器官 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞转录组测序、批量转录组测序、质谱分析、免疫共沉淀 | NA | 转录组数据 | 批量与单细胞转录组数据来源样本数未明确，体内模型和类器官实验样本量未详述 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 38 | 2026-05-04 |
LILRB2+ monocytes reshape the immune activation landscape in immunotherapy with non-small cell lung cancer: Evidence from real-world cohorts and single-cell analyses
2026-Apr-30, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.152331
PMID:42069195
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研究论文 | 利用真实世界队列和单细胞分析研究LILRB2+单核细胞在非小细胞肺癌免疫治疗中对免疫激活景观的重塑作用 | 首次在单细胞水平解析LILRB2+单核细胞亚群在PD-1/PD-L1免疫治疗中重塑免疫抑制表型并增强疗效的作用机制 | 未充分探索LILRB2单核细胞在更广泛免疫治疗场景下的作用 | 探究LILRB2单核细胞对非小细胞肺癌免疫治疗疗效的预测价值及其免疫机制 | 非小细胞肺癌患者及其单核细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 来自OAK、POPLAR和ORIENT-11临床试验的多个队列 | Illumina | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | Illumina NovaSeq | NA |
| 39 | 2026-05-04 |
GRK5 in dorsolateral septal somatostatin neurons mediates chronic stress-induced depression via the AKT-mTORC1 pathway
2026-Apr-28, Neuropharmacology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.neuropharm.2026.110997
PMID:42061809
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现，慢性束缚压力导致小鼠背外侧隔核中生长抑素阳性神经元的GRK5下调，并通过AKT-mTORC1通路介导抑郁样行为 | 首次发现背外侧隔核SST神经元中GRK5的特异性下调是慢性应激诱发抑郁的关键机制，并验证GRK5作为新型抗抑郁靶点的潜力 | 研究仅在动物模型上进行，未在人类样本中验证；未阐明GRK5下调的上游调控机制 | 探究背外侧隔核SST神经元中GRK5在慢性应激诱发抑郁中的作用及其分子机制 | 小鼠的背外侧隔核SST阳性GABA能神经元 | 机器学习 | 抑郁症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠（具体数量未在摘要中说明） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 40 | 2026-05-04 |
Multi-organ single-cell analysis of preferential expression of CAKUT genes
2026-Apr-27, BMC nephrology
IF:2.2Q2
DOI:10.1186/s12882-026-05003-y
PMID:42045859
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研究论文 | 通过多器官单细胞分析揭示CAKUT相关基因的优先表达模式 | 首次利用单细胞RNA测序数据系统分析CAKUT相关基因在人类胎儿和成人肾、输尿管及膀胱中的细胞类型特异性表达，并发现共享的基质-间充质基因表达特征 | 基于公共数据集，缺乏独立验证实验；样本仅涉及人胎儿和成人组织，未涵盖所有发育阶段 | 探究先天性肾脏和尿路畸形（CAKUT）相关基因是否在发育过程中共享细胞表达程序 | 人胎儿和成人肾、输尿管及膀胱组织中的单细胞 | 单细胞生物学 | 先天性肾脏和尿路畸形（CAKUT） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 公开数据集中的多个胎儿和成人样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |