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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
21 2026-08-19
The miRNA-virus Axis in RNA Virus Infections: Mechanisms, Therapeutic Targeting, and Systems Biology Approaches
2026-Aug-17, Microbial pathogenesis IF:3.3Q2
综述 本文全面综述了RNA病毒感染中的miRNA-病毒轴,涵盖其机制、治疗靶向策略及系统生物学方法 提出了超越传统抗病毒-促病毒二分法的miRNA功能分类,并整合了miRNA功能分类与靶向抗病毒干预的治疗决策框架 讨论了递送效率、组织特异性和脱靶效应等关键挑战,但未提供具体实验验证 重新解读miRNA-病毒轴为动态调控网络,并为开发下一代抗病毒疗法提供转化框架 RNA病毒及宿主miRNA相互作用 系统生物学 病毒感染相关疾病 NA NA NA NA NA NA NA NA
22 2026-08-19
Characterizing intra- and intertumor heterogeneity in ovarian high-grade serous carcinoma subtypes using single-cell and spatial transcriptomics
2026-Aug-17, Genome research IF:6.2Q1
研究论文 本研究利用单细胞和空间转录组学技术,表征了卵巢高级别浆液性癌亚型内部及肿瘤间的异质性 首次将分子亚型与空间转录组学结合,量化了HGSC在2D空间内的肿瘤内和肿瘤间异质性,并发现了亚型特异性空间抗共定位现象及Midkine信号差异,提出多切片分析的必要性 未明确说明局限性,但暗示每患者单一切片可能不足以全面表征空间转录组 探索HGSC中基于转录组的分子亚型与空间表达结构域之间的关联及其在患者间的变异性 卵巢高级别浆液性癌(HGSC)的组织样本 空间转录组学 卵巢癌 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 基因表达数据、空间数据 未提供具体数目 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
23 2026-08-19
Identifying phenotype-genotype-function coupling in 3D organoid imaging using Shape, Appearance and Motion Phenotype Observation Tool (SPOT)
2026-Aug-17, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 开发了标准化形状-外观-运动(SAM)表型组和观察工具(SPOT),用于从3D类器官成像中识别表型-基因型-功能耦合 提出了一种无需先验知识的、基于2D投影视频全面描述3D形态动态表型的工具,并结合单细胞RNA测序揭示WNT信号通路改变与肠道类器官形态异常的关系 未在文中明确提及限制,但可能包括对2D投影视频的依赖和特定类器官模型的适用性 利用活细胞成像识别表型-基因型-功能耦合关系,推动生物医学发现 小鼠和人类类器官,包括模拟类器官数据库和超过160万实例 计算机视觉 NA 活细胞成像,单细胞RNA测序 NA 图像(2D投影视频),转录组数据 超过160万个小鼠和人类类器官实例 NA 单细胞RNA测序 NA NA
24 2026-08-19
Canonical and non-canonical miRNA degradation shapes state transitions and stemness in breast cancer
2026-Aug-17, The EMBO journal
研究论文 本研究结合CRISPRi介导的ZSWIM8敲低、miRNA测序和AGO2-eCLIP技术,绘制了乳腺癌亚型中的靶向miRNA降解(TDMD)图谱,并揭示了其调控细胞状态转变和干性的机制 首次在人类癌症中系统定义TDMD景观,并发现非经典TDMD机制(不依赖ZSWIM8和蛋白酶体),扩展了miRNA降解的机制谱 摘要中未提及明显的局限性 探究靶向miRNA降解在乳腺癌中的作用及其对细胞状态转变和干性的影响 乳腺癌细胞系及亚型,特别是三阴性乳腺癌中的恶性细胞亚群 基因组学 乳腺癌 CRISPRi、miRNA-seq、AGO2-eCLIP、单细胞转录组学 NA 测序数据(miRNA-seq、eCLIP、单细胞转录组) 未明确,涉及乳腺癌亚型及细胞系 NA miRNA-seq、单细胞转录组学 NA NA
25 2026-08-19
CKLF1 Serves as a Pivotal Mediator of Blood-Brain Barrier Disruption and Neuroinflammation via PI3K/AKT/mTOR Signaling in Ischemic Stroke
2026-Aug-17, Molecular neurobiology IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序、调控网络分析和机器学习筛选,确定CKLF1为缺血性卒中的关键内皮调节因子,并验证其在血脑屏障破坏和神经炎症中的作用机制。 首次通过整合单细胞测序、调控网络分析和机器学习方法,鉴定CKLF1为缺血性卒中相关内皮调节因子,并阐明其通过PI3K/AKT/mTOR信号通路调控血脑屏障破坏和神经炎症的机制。 尚未明确CKLF1在缺血性卒中中的上游调控机制,以及其与其他信号通路的相互作用。 探究CKLF1在缺血性卒中中血脑屏障破坏和神经炎症中的作用及机制。 缺血性卒中相关内皮细胞、小胶质细胞和外周中性粒细胞。 机器学习和单细胞转录组学 缺血性卒中 单细胞RNA测序、调控网络分析、机器学习筛选 机器学习模型(具体未提及) 单细胞转录组数据 未提及具体样本数量,使用tMCAO/R小鼠模型。 NA 单细胞RNA测序 NA NA
26 2026-08-19
Tumor-driven arginine depletion induces T-cell metabolism reprogramming to suppress atherosclerosis in colorectal cancer
2026-Aug-17, Acta pharmacologica Sinica IF:6.9Q1
研究论文 本研究探讨了结直肠癌对动脉粥样硬化的影响,发现肿瘤驱动的精氨酸耗竭通过重编程T细胞代谢来抑制动脉粥样硬化。 首次揭示肿瘤通过系统性精氨酸耗竭诱导斑块内T细胞向氧化磷酸化主导状态转变,从而改变动脉粥样硬化斑块的炎症微环境,并证明精氨酸补充可逆转此效应。 研究主要基于小鼠模型和临床数据,精氨酸代谢干预的长期效果及在人类中的适用性仍需进一步验证。 阐明结直肠癌对动脉粥样硬化发展的影响及其潜在机制,探索针对斑块的免疫代谢干预策略。 合并动脉粥样硬化和结直肠癌的患者,以及携带皮下MC38肿瘤的ApoE和Ldlr小鼠、自发性肠道腺瘤的APCApoE小鼠。 多组学整合分析 结直肠癌、动脉粥样硬化 单细胞RNA测序、空间转录组学、代谢组学、批量RNA测序 NA 基因表达数据、代谢物数据、空间转录数据 临床患者数据及三种小鼠模型(具体数量未提及) 10x Genomics, Illumina, 其他 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 10x Chromium, 10x Visium, Illumina NovaSeq 单细胞RNA测序和空间转录组学平台专用于分析斑块组织,代谢组学和批量RNA测序用于全局分析
27 2026-08-19
Profiling maize embryonic leaf development and discovering new genes using high-resolution spatial long-read isoform sequencing
2026-Aug-17, Nature plants IF:15.8Q1
研究论文 本研究通过结合高通量全长异构体测序和空间转录组学(称为spatial MAS-IsoSeq)分析玉米胚胎发育,识别出大量未表征的异构体,构建新基因模型数据库,并探索胚胎叶片发育的调控网络。 创新性地将空间转录组学与全长异构体测序结合,提高了短读段外显子映射和空间转录表达检测精度,发现了大量新异构体和基因,并构建了改进的基因模型数据库。 未提供具体限制信息。 旨在通过空间分辨率的长读段异构体测序解析玉米胚胎叶片发育中的转录组异构体,发现新基因并构建基因模型数据库,以揭示胚胎发生机制。 玉米胚胎叶片发育过程中的转录组异构体和基因。 数字病理学 NA 全长异构体测序和空间转录组学 NA 序列数据、空间转录组数据 玉米胚胎组织样本(具体数量未提供) NA 空间转录组学、长读段测序 NA NA
28 2026-08-19
Blocking AGEs reduces airway epithelial viral susceptibility in diabetes-exacerbated COPD
2026-Aug-17, EMBO molecular medicine IF:9.0Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序研究糖尿病加重COPD中气道上皮对病毒的易感性,发现AGEs-RAGE/MD2轴的作用 首次揭示高血糖-AGEs-RAGE/MD2轴在糖尿病加重COPD中增加病毒易感性的机制,并提出AGEs作为治疗靶点 未在人类临床试验中验证,且动物模型可能无法完全模拟人类COPD和糖尿病并发症 阐明糖尿病加重COPD的机制,特别是对病毒感染的易感性 COPD患者(伴或不伴糖尿病)的气道上皮细胞、COPD糖尿病小鼠模型 数字病理学 慢性阻塞性肺疾病(COPD) 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据(单细胞RNA测序数据) COPD患者(伴或不伴糖尿病)和COPD糖尿病小鼠 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 使用10x Chromium进行单细胞RNA测序,分析气道上皮细胞
29 2026-08-19
The LncRNA-Tumor Immune Microenvironment Nexus: Integrative Insights for Cancer Immunotherapy
2026-Aug-17, Genomics, proteomics & bioinformatics
综述 该文章综合探讨了长链非编码RNA与肿瘤免疫微环境之间的相互作用,并强调了其在癌症免疫治疗中的潜在应用价值。 通过整合多组学分析、单细胞转录组学和计算建模,系统揭示了lncRNA在调控肿瘤免疫微环境中的复杂网络,并提出了将其作为生物标志物和治疗靶点的新策略。 由于是综述文章,未提供新的实验数据,且lncRNA靶向治疗的临床转化仍面临递送和特异性等挑战。 总结lncRNA在肿瘤免疫微环境中作用机制的最新发现,并探讨其作为免疫治疗靶点的转化前景。 长链非编码RNA(lncRNA)及其在肿瘤免疫微环境中的调控网络。 自然语言处理 癌症 高通量测序、单细胞转录组学 NA 文本 NA NA NA NA NA
30 2026-08-19
SPCC: Inferring Spatial Cell-Cell Interaction by Integrating Single-cell and Spatial Transcriptomics
2026-Aug-17, Genomics, proteomics & bioinformatics
研究论文 开发了一种名为SPCC的深度学习计算框架,通过整合单细胞和空间转录组数据,推断细胞间的空间相互作用。 利用对抗性联合变分自编码器和随机森林模型,实现未配对单细胞和空间数据的对齐与映射,提高对测序噪声的鲁棒性,并成功识别出新的细胞间相互作用,如PECAM1-SOX4。 摘要中未提及局限性。 旨在通过整合单细胞和空间转录组数据,准确推断个体细胞分辨率的空间结构,并识别空间细胞间相互作用。 小鼠躯体感觉皮层、乳腺癌和黑色素瘤脑转移数据。 机器学习 乳腺癌、黑色素瘤 空间转录组测序、单细胞RNA测序 对抗性联合变分自编码器、随机森林 基因表达数据 三个数据集,具体样本数量未提及 NA 空间转录组学 NA NA
31 2026-08-19
ICOS-ImmunoPET Monitors T Cell Activation After Combination Immune Checkpoint Blockade in a Mouse Model of Melanoma Brain Metastasis
2026-Aug-15, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究利用ICOS免疫PET成像技术监测黑色素瘤脑转移小鼠模型联合免疫检查点阻断治疗后的T细胞活化情况 首次将ICOS作为生物标志物用于免疫PET成像,实现对免疫检查点抑制剂治疗反应的早期、非侵入性、功能性评估,并通过对人脑转移样本的单细胞RNA测序数据重分析验证其临床相关性 研究主要基于小鼠模型,人样本数据仅为转录组重分析,缺乏前瞻性临床试验验证;且文章未提及成像技术的具体分辨率和敏感性限制 开发并验证ICOS免疫PET成像技术,用于监测黑色素瘤脑转移中免疫检查点抑制剂治疗后的T细胞活化,以改善早期反应评估和患者分层 黑色素瘤脑转移小鼠模型及6例人类黑色素瘤脑转移标本 分子影像学 黑色素瘤脑转移 免疫PET成像、单细胞RNA测序 小鼠肿瘤模型 免疫PET影像数据、单细胞RNA测序数据 6例人类黑色素瘤脑转移标本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
32 2026-08-19
Reduced Occludin expression in aortic endothelial cells mediates endothelial barrier dysfunction in aortic dissection
2026-Aug-14, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
研究论文 本研究探讨了紧密连接蛋白Occludin在主动脉夹层发病机制中的作用,发现其下调导致内皮屏障功能障碍,是AD的起始因素 首次通过单细胞RNA测序和条件性基因敲除小鼠模型,证实内皮细胞中Occludin下调直接引发主动脉夹层,并提出靶向Occludin的治疗策略 研究主要基于动物模型和体外实验,缺乏临床样本验证;且BAPN诱导的AD模型与人类AD的病理过程存在差异 阐明Occludin在主动脉夹层早期内皮屏障功能障碍中的因果作用,并评估其作为治疗靶点的潜力 人类升主动脉组织、小鼠主动脉组织、人主动脉内皮细胞 心血管疾病 主动脉夹层 单细胞RNA测序、免疫印迹、免疫组化、荧光素酶报告基因、腺相关病毒介导的基因过表达 条件性基因敲除小鼠、AAV介导的过表达小鼠 基因表达数据、组织病理图像、影像数据、体外通透性数据 人类样本数量不详;小鼠模型包括内皮特异性Ocln敲除和过表达组;体外使用HAECs 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
33 2026-08-19
A novel adrenomedullin receptor signaling-based prognostic model predicts immunosuppressive microenvironment and informs therapeutic stratification in hepatocellular carcinoma: A retrospective bioinformatics study
2026-Aug-14, Medicine IF:1.3Q2
研究论文 本研究基于肾上腺髓质素受体信号相关基因构建并验证了一个多基因预后模型,用于预测肝细胞癌患者的预后和免疫微环境特征 利用116种机器学习算法组合构建预后模型,并首次将肾上腺髓质素受体信号通路与肝细胞癌的免疫抑制微环境及药物敏感性分析相结合,为个体化治疗提供新框架 药物敏感性分析结果属于假设生成性质,需要实验验证;TP53突变频率在风险组间无显著差异;单细胞分析仅揭示了ARGs在肿瘤内皮细胞中的表达,其他细胞类型未详细阐述 开发和验证基于肾上腺髓质素受体信号相关基因的预后模型,并探索其与肝细胞癌临床特征、免疫微环境、药物敏感性及体细胞突变的关系 肝细胞癌患者 机器学习 肝细胞癌 转录组测序, 单细胞RNA测序 随机生存森林 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 临床数据 TCGA和GEO数据库中的肝细胞癌患者样本,包含GSE14520队列等 NA RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
34 2026-08-19
Identifying head and neck squamous cell carcinoma: HPV-associated signature by integrating bulk and single-cell sequencing data
2026-Aug-14, Medicine IF:1.3Q2
研究论文 利用批量和单细胞测序数据,通过Scissor算法构建了预测头颈鳞状细胞癌HPV状态的模型,该模型具有较高的准确性。 首次结合批量和单细胞测序数据,使用Scissor算法构建了预测HPV状态的评分系统,比现有生物标志物具有更高的预测准确性。 未明确说明局限性,但可能包括依赖特定数据集、外部验证不足等。 开发一种准确预测头颈鳞状细胞癌患者HPV状态的方法。 头颈鳞状细胞癌(HNSC)患者及其肿瘤样本。 数字病理学 头颈鳞状细胞癌 批量测序、单细胞测序 Scissor算法、基因集变异分析(GSVA) 基因表达数据 发现集和验证集的大小未明确,但涉及1070个HPV阳性细胞 NA 批量RNA测序、单细胞RNA测序 NA NA
35 2026-08-19
Epigenetic modulation of stromal cell states underpins pathological tissue niches in Crohn's disease
2026-Aug-12, Nature immunology IF:27.7Q1
研究论文 使用单细胞空间转录组学、RNA测序和ATAC测序技术,绘制克罗恩病肠道中18种基质细胞状态及其微环境图谱,揭示炎症成纤维细胞状态的表观遗传调控机制 首次在克罗恩病全层肠道组织中结合单细胞空间转录组、RNA-seq和ATAC-seq,鉴定18种基质细胞状态,并发现炎症成纤维细胞状态可通过组蛋白去乙酰化酶抑制剂逆转 未明确说明样本来源及患者数量,且未进行体内功能验证 探究克罗恩病中基质细胞状态的起源、表型稳定性及其表观遗传调控机制 克罗恩病患者全层肠道组织中的基质细胞 单细胞组学 克罗恩病 单细胞空间转录组学、RNA-seq、ATAC-seq NA 单细胞基因表达数据、染色质开放数据、空间转录数据 约2,500,000个细胞 NA 单细胞空间转录组学、单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 NA NA
36 2026-08-19
Multi-omics-guided identification of blood-entering bioactive components and candidate responsive targets of Shugan Jianpi Tiaochang Pill against colorectal adenoma
2026-Aug-12, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1
研究论文 本研究通过多组学方法鉴定舒肝健脾调肠方治疗结直肠腺瘤的入血活性成分及候选响应靶点 首次整合血清药物化学、蛋白质组学、网络药理学、单细胞和空间转录组学及虚拟敲除等多组学策略,系统鉴定TCP的入血成分和候选靶点,并通过分子对接、分子动力学模拟、表面等离子体共振和细胞实验进行验证 仍需进一步的机制验证,以确认EPHA7和LDHB在TCP治疗中的具体功能作用 鉴定TCP治疗结直肠腺瘤的入血活性成分和候选响应靶点,阐明其分子机制 结直肠腺瘤小鼠模型和HCT-116细胞系 数字病理学 结直肠腺瘤 血清药物化学、蛋白质组学、网络药理学、单细胞转录组学、空间转录组学、分子对接、分子动力学模拟、表面等离子体共振 虚拟敲除分析 蛋白质组学数据、转录组学数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据、分子对接数据、SPR数据 AOM/DSS诱导的CRA小鼠模型和HCT-116细胞系,具体样本量未提供 NA 单细胞转录组学, 空间转录组学 NA NA
37 2026-08-19
[Role and mechanism of methyltransferase-like 3 in promoting macrophage NLRP3 inflammatory responses in medication-related osteonecrosis of the jaw]
2026-Aug-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序构建唑来膦酸诱导的颌骨坏死样病变小鼠免疫图谱,探讨METTL3在巨噬细胞NLRP3炎症反应中的作用和机制 首次在单细胞水平揭示METTL3作为关键表观遗传调控因子促进巨噬细胞NLRP3炎症反应,参与药物相关性颌骨坏死发病,并通过虚拟敲降分析预测关键基因 摘要中未提及研究局限性 探究METTL3在药物相关性颌骨坏死中调控巨噬细胞炎症反应的作用和机制 唑来膦酸诱导的颌骨坏死样病变小鼠及巨噬细胞 单细胞生物学 药物相关性颌骨坏死 单细胞RNA测序、免疫组化、蛋白质印迹 NA 单细胞转录组数据、组织图像、蛋白质表达数据 未明确样本量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
38 2026-08-19
CD177+ neutrophils drive extracellular matrix remodelling and HGF-alpha release in ALPPS-induced liver regeneration
2026-Aug-06, Gut IF:23.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学,揭示了ALPPS诱导肝再生过程中CD177+中性粒细胞通过促进内皮迁移、细胞外基质降解和HGF-α释放来驱动肝再生的免疫机制 首次在ALPPS患者和动物模型中阐明CD177+中性粒细胞通过CD177-PECAM1相互作用促进内皮迁移,并通过MMP9降解ECM释放HGF-α来驱动肝再生的新机制,为肝衰竭治疗提供了潜在新策略 未提及具体局限性 阐明ALPPS诱导肝再生过程中的免疫变化及其潜在机制 ALPPS患者的残余肝组织及小鼠ALPPS模型中的中性粒细胞 数字病理学 肝肿瘤, 肝衰竭 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 流式细胞术, 组织学分析 NA 基因表达数据, 图像 世界最大ALPPS临床队列及小鼠ALPPS模型 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
39 2026-08-19
Targeting cancer stem cells enhances multikinase inhibitor therapy in metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease-related hepatocellular carcinoma
2026-Aug-06, Gut IF:23.0Q1
研究论文 本研究首次在代谢功能障碍相关脂肪性肝病相关肝细胞癌中表征CD133+癌症干细胞,并揭示其通过CD133-MYH9/β-catenin轴促进肿瘤发生及耐药,靶向CD133可增强多激酶抑制剂疗效 首次系统表征MASLD-HCC中CD133+癌症干细胞特性,并揭示其通过CD133-MYH9/β-catenin轴驱动肿瘤发生的机制,提出联合靶向CD133与多激酶抑制剂的新型治疗策略 研究主要基于临床样本和动物模型,CD133+细胞在人类MASLD-HCC中的具体作用机制仍需进一步验证,且纳米颗粒递送系统的临床转化尚需更多研究 阐明MASLD-HCC中癌症干细胞的特征及功能,并探索靶向CD133增强多激酶抑制剂治疗效果的可行性 MASLD-HCC患者肿瘤及癌旁组织、基因工程小鼠模型、CD133过表达小鼠模型、单细胞RNA测序数据 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序、质谱分析、基因谱系追踪、siRNA纳米颗粒递送 NA 基因表达谱数据、单细胞转录组数据、蛋白质互作数据 29对肿瘤及癌旁组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
40 2026-08-19
Age-Associated B Cells Contribute to Inflammation Via Antibody-Independent Mechanisms in Takayasu Arteritis
2026-Aug-04, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
研究论文 本研究探讨了年龄相关B细胞在Takayasu动脉炎中通过抗体非依赖机制促进炎症的作用 首次揭示TAK中ABC分化与抗体分泌细胞生成解偶联,且ABC通过促炎功能而非抗体介导炎症 未明确提及主要局限,但样本量较小(如组织学n=5,临床随访n=4) 研究TAK中B细胞激活途径及其对发病机制的贡献 Takayasu动脉炎患者及系统性红斑狼疮患者的B细胞 免疫学 Takayasu动脉炎 组织学分析、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、流式细胞术、体外实验 NA 基因表达数据、流式细胞术数据、组织学图像 组织学n=5,流式细胞术n=125,bulk RNA-seq n=12,体外实验n=5,功能实验n=6,体外药物实验n=15,临床随访n=4 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
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