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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
21 2026-05-19
CXCL16 promotes macrophage-driven inflammation and vascular smooth muscle cell phenotypic switching during carotid plaque destabilization
2026-May-17, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究整合多组GEO数据集和单细胞RNA测序,发现CXCL16通过促进NF-κB依赖的巨噬细胞活化和迁移,以及增强SPP1/骨桥蛋白介导的巨噬细胞-血管平滑肌细胞(VSMC)对话,驱动颈动脉斑块失稳 首次整合多组GEO数据集和单细胞RNA测序,提出CXCL16作为颈动脉斑块失稳的诊断生物标志物和潜在治疗靶点,并阐明其通过NF-κB和SPP1/骨桥蛋白通路促进巨噬细胞-血管平滑肌细胞互作的分子机制 研究中CXCL16在颈动脉斑块中的致病机制主要基于体外和动物模型,人体中的具体调控网络仍需进一步验证 探究CXCL16在颈动脉斑块失稳中的作用机制及其作为诊断生物标志物和潜在治疗靶点的价值 颈动脉斑块样本(包括稳定和不稳定斑块)、巨噬细胞、血管平滑肌细胞 生物信息学 颈动脉粥样硬化、缺血性脑卒中 转录组学、单细胞RNA测序、免疫组织化学、细胞共培养、NF-κB抑制实验 随机森林、LASSO回归 转录组数据、单细胞RNA测序数据、人类组织标本数据 多组GEO数据集中的颈动脉斑块样本(具体数量未明确) NA 单细胞RNA测序 NA NA
22 2026-05-19
Recombinant humanized type III collagen attenuates recurrent spontaneous abortion by regulating stromal cell decidualization and reinforcing protective immune microenvironment at the maternal-fetal interface
2026-May-17, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示重组人源化III型胶原蛋白通过调节基质细胞蜕膜化和增强母胎界面保护性免疫微环境来减轻复发性自然流产 首次在单细胞分辨率下阐明rhCOLIII治疗复发性自然流产的机制,发现其通过激活氧化应激反应通路调控基质细胞功能,并通过APOE-TREM2和BSG-PPIA信号增强抗炎巨噬细胞活性及CD16+ NK细胞丰度 研究主要基于小鼠模型,其结论在人类中的直接适用性尚需进一步验证;单细胞分析仅限于妊娠第8天,未能全面覆盖时间动态变化 探究rhCOLIII在复发性自然流产中的治疗潜力及其分子机制 人子宫内膜/蜕膜组织样本、小鼠RSA模型(CBA/J ♀ × DBA/2 ♂)的子宫组织 数字病理学 复发性自然流产 免疫组织化学、免疫印迹、单细胞RNA测序、多重免疫组织化学、流式细胞术 NA 单细胞RNA测序数据、免疫组化图像 包含健康供体/正常妊娠者和RSA患者的人类样本,以及24只小鼠(RSA组和rhCOLIII治疗组各12只,具体样本数未明确逐项列出) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
23 2026-05-19
CCL5 at the tumor-bone interface: A lymphocyte-derived gatekeeper against mandibular invasion in oral squamous cell carcinoma
2026-May-17, Oral oncology IF:4.0Q2
研究论文 探究CCL5在口腔鳞状细胞癌下颌骨侵犯中的作用及其预后价值 首次揭示肿瘤免疫微环境中CCL5和FoxP3表达缺失与骨侵犯的关联,并证实CCL5可作为独立预后标志物 未提及 分析CCL5与口腔鳞状细胞癌骨侵犯的预后相关性及其免疫机制 口腔鳞状细胞癌患者肿瘤组织及免疫微环境 数字病理学 口腔癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 免疫组化 NA 基因表达数据, 病理图像 TCGA队列327例、回顾性队列206例 Illumina bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 Illumina NovaSeq TCGA HNSCC队列RNA-seq数据;单细胞RNA测序数据来源
24 2026-05-19
Clinical outcomes and spatial transcriptomic profiles of CD19/20 CAR-T therapy in relapsed or refractory B-cell non-Hodgkin's lymphoma
2026-May-17, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 评估双特异性CD19/20 CAR-T细胞疗法在复发/难治B细胞非霍奇金淋巴瘤中的临床疗效,并结合空间转录组学分析揭示应答相关的肿瘤内在和微环境特征 首次在双靶点(CD19/20)CAR-T治疗R/R B-NHL的I/II期临床研究中整合空间单细胞转录组学,识别出两种主导性肿瘤结构(B细胞主导型和成纤维细胞/单核巨噬细胞富集型)及其与治疗应答的关联 空间转录组学分析仅来自5例患者预处理活检样本,样本量小;且未对长期随访中的肿瘤微环境动态变化进行分析 评估双特异性CD19/20 CAR-T细胞疗法的安全性和有效性,并探索肿瘤内在和微环境因素对临床应答的影响 复发/难治B细胞非霍奇金淋巴瘤(R/R B-NHL)患者 数字病理学 B细胞非霍奇金淋巴瘤 空间单细胞转录组学 NA 基因表达数据 32例患者接受治疗,其中31例可评估疗效;5例患者空间转录组分析 NA 空间转录组学 NA 空间单细胞转录组学分析预处理肿瘤活检样本
25 2026-05-19
Alleviation of diabetic cardiomyopathy via preventing VCAM1-positive cells from senescence by engineered nanovesicles
2026-May-17, Journal of nanobiotechnology IF:10.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序发现VCAM1阳性细胞作为糖尿病心肌病的前衰老内皮细胞群体,并设计工程化纳米囊泡靶向递送STING抑制剂以缓解疾病 首次鉴定VCAM1作为前衰老细胞的标志物,并利用膜脂工程改造纳米囊泡实现精准靶向递送 仅在糖尿病小鼠模型中验证,缺乏临床试验数据 探讨靶向前衰老细胞治疗糖尿病心肌病的可行性 糖尿病小鼠心脏中的VCAM1阳性前衰老内皮细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 糖尿病小鼠心脏样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
26 2026-05-19
Nuclear factor IX promotes endometriosis progression through transcriptional activation of tetraspanin-2
2026-May-16, Journal of molecular medicine (Berlin, Germany)
研究论文 本研究通过整合公共单细胞RNA测序数据和自身RNA测序数据,发现并验证了核因子IX通过转录激活四跨膜蛋白2促进子宫内膜异位症进展的机制 首次揭示核因子IX在子宫内膜异位症间质细胞中高表达,并通过转录调控四跨膜蛋白2促进细胞增殖和侵袭,为子宫内膜异位症治疗提供新靶点 本研究未提及潜在局限性 探究核因子IX在子宫内膜异位症进展中的分子机制及其作为治疗靶点的潜力 子宫内膜异位症间质细胞、正常子宫内膜间质细胞、子宫内膜异位症小鼠模型 机器学习 妇科疾病 单细胞RNA测序,RNA测序,荧光素酶报告基因实验,染色质免疫沉淀实验 NA 基因表达数据 整合公共数据库与自身样本,具体数量未说明;小鼠模型实验 NA 单细胞RNA测序,RNA测序 NA NA
27 2026-05-19
Single-cell multi-omics analysis reveals two molecular subtypes of human male breast cancer with distinct neuroendocrine and immune characteristics
2026-May-16, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 通过单细胞多组学分析揭示人类男性乳腺癌的两种分子亚型,具有不同的神经内分泌和免疫特征 首次在单细胞分辨率下全面解析男性乳腺癌,识别出两种具有不同神经内分泌和免疫状态的主要分子亚型,并发现CD45+/KRT18+细胞及关键转录因子DLX2调控神经内分泌特征 未提及 阐明男性乳腺癌的潜在机制,为分子亚型提供基础和新见解,并开发创新治疗选择 人类男性乳腺癌患者的多组学数据集 机器学习 乳腺癌 单细胞RNA测序,批量RNA测序,成像质谱流式细胞术 NA 单细胞RNA测序数据,批量RNA测序数据,成像数据 多组学大规模数据集 NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA NA
28 2026-05-19
Role of HMGB1 in tumors and its targeted therapy
2026-May-16, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
综述 总结了HMGB1在肿瘤中的角色、靶向治疗及其作为生物标志物的应用价值 提出了利用单细胞RNA测序、空间转录组学、实时活细胞成像等前沿技术全面研究HMGB1时空动态及其分子调控机制 肿瘤异质性、HMGB1双面功能及靶向技术局限性仍构成挑战 阐明HMGB1在肿瘤进展中的角色及靶向治疗潜力 肿瘤细胞、肿瘤相关巨噬细胞、肿瘤相关中性粒细胞、肿瘤相关成纤维细胞、T细胞 机器学习和数字病理学 肿瘤 单细胞RNA测序、空间转录组学、实时活细胞成像 NA NA NA NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
29 2026-05-19
Spatial Multi-Omics Defines Cancer-associated fibroblasts Subtype Gradients Driving Metabolic Support and Immune Remodeling in Pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-May-16, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 整合空间转录组学和空间代谢组学,定义胰腺导管腺癌中癌症相关成纤维细胞亚型梯度,驱动代谢支持和免疫重塑 首次整合空间多组学与最优传输模型,揭示了CAF亚型在代谢支持与免疫重塑中的差异功能 未提及技术验证的样本量差异或潜在混杂因素 阐明CAF的代谢和空间异质性及其临床相关性 胰腺导管腺癌组织中的癌症相关成纤维细胞 数字病理学, 机器学习 胰腺癌 空间转录组学, 空间代谢组学, 多重免疫荧光 CNN, 最优传输模型 图像, 文本 PDAC组织样本(未具体说明数量)及独立空间代谢组学队列 NA 空间转录组学, 空间代谢组学 NA NA
30 2026-05-19
Single-cell analysis reveals IL1B+ macrophages promote lung metastasis in adenoid cystic carcinoma
2026-May-16, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 单细胞分析揭示IL1B+巨噬细胞促进腺样囊性癌肺转移 通过整合单细胞RNA测序、批量转录组学和多重免疫组化,首次鉴定出由IL1B肿瘤相关巨噬细胞、CD24腔样肿瘤细胞、ACKR1内皮细胞和HSPA1ACD8 T细胞组成的转移微环境,并系统揭示了IL1B TAMs在肿瘤细胞内渗和定植两个关键步骤中的多重作用机制 未明确说明研究局限性 阐明腺样囊性癌肺转移的潜在机制 腺样囊性癌肿瘤组织及肺转移病灶中的肿瘤细胞、免疫细胞和内皮细胞 机器学习 癌症 单细胞RNA测序, 批量转录组学, 多重免疫组化 NA 基因表达数据, 图像数据 小鼠模型及腺样囊性癌患者样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
31 2026-05-19
SENP1 facilitates the adaptation of colonic non-lymphoid tissue Treg cells and restrains intestinal inflammation
2026-May-16, Mucosal immunology IF:7.9Q1
研究论文 该研究揭示了SENP1对结肠非淋巴组织调节性T细胞的适应性调节及抑制肠道炎症的重要作用 首次发现SENP1在结肠Treg细胞稳态维持中的特异性调节作用,并阐明其通过影响CD25表达和IL-2信号通路影响Treg功能 主要基于小鼠模型研究,部分机制可能需要在人体中进一步验证 探究SENP1在结肠调节性T细胞功能及肠道免疫稳态中的调节作用 小鼠结肠调节性T细胞及肠道炎症模型 NA 肠道炎症性疾病 单细胞RNA测序,基因敲除 NA 单细胞转录组数据 小鼠模型,具体样本数量未在摘要中提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
32 2026-05-19
Single-Cell RNA Sequencing Unveils CD8+ T Cell Heterogeneity in the Diffuse Large B-cell Lymphoma Microenvironment: A Systematic Review
2026-May-16, Critical reviews in oncology/hematology
综述 系统性综述单细胞RNA测序揭示弥漫大B细胞淋巴瘤微环境中CD8+ T细胞的异质性 构建了CD8+ T细胞动态耗竭轨迹图谱,揭示了多个功能不同的亚群层次连续性,并识别了与预后及治疗反应相关的生物标志物 未进行荟萃分析,未来需要多中心研究验证靶点并标准化单细胞RNA测序分析框架 系统综合单细胞RNA测序证据,绘制CD8+ T细胞异质性图谱并探讨其对弥漫大B细胞淋巴瘤的临床意义 弥漫大B细胞淋巴瘤肿瘤微环境中的CD8+ T细胞 数字病理学 弥漫大B细胞淋巴瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 18项符合条件的单细胞RNA测序研究 NA 单细胞RNA测序 NA NA
33 2026-05-19
Islet inflammatory macrophages drive MSC loss and multiple interactions involved in β-cell adaptation during diabetes
2026-May-16, Metabolism: clinical and experimental
研究论文 利用单细胞RNA测序揭示2型糖尿病进展中胰岛炎症巨噬细胞导致间充质干细胞丢失及β细胞适应过程中的多重相互作用 首次在糖尿病小鼠模型中揭示巨噬细胞与间充质干细胞之间的旁分泌串扰共同调控β细胞适应,并阐明了TNF-α介导的Wntless下调在其中的关键作用 研究基于小鼠模型,结论在人类中的适用性尚需验证 探究2型糖尿病进展中非β胰岛细胞(尤其是巨噬细胞和间充质干细胞)在β细胞功能适应中的作用 糖尿病小鼠胰岛中的巨噬细胞、间充质干细胞和β细胞 单细胞转录组学 2型糖尿病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 糖尿病小鼠胰岛样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
34 2026-05-19
Predicting gene-specific regulation with transcriptomic and epigenetic single-cell data
2026-May-15, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 提出MetaFR方法,利用单细胞ATAC-seq和RNA-seq数据学习基因特异性调控模型 提出MetaFR方法,通过高效回归树在单细胞或元细胞水平建立基因表达预测模型,运行时间和预测性能优于现有方法SCARlink 单细胞数据固有的稀疏性使分析具有挑战性 研究基因特异性调控机制,利用转录组和表观遗传组单细胞数据预测基因表达 基因表达预测模型及调控区域 机器学习 NA 单细胞ATAC-seq、单细胞RNA-seq 回归树 表观遗传数据、转录组数据 NA NA 单细胞ATAC-seq、单细胞RNA-seq NA NA
35 2026-05-19
A CSF disease-associated macrophage signature defines progressive multiple sclerosis
2026-May-13, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1
研究论文 本研究结合流式细胞术和单细胞转录组学,揭示了进行性多发性硬化症患者脑脊液中CD14+单核细胞增多,这些细胞呈现边界相关巨噬细胞样特征并与疾病进展相关 首次在脑脊液中定义与进行性多发性硬化症相关的疾病相关巨噬细胞特征,并发现这些细胞与神经退行性病变中发现的疾病相关小胶质细胞/巨噬细胞共享部分特性 研究为回顾性与前瞻性结合设计,样本量相对有限,且未探讨脑脊液细胞变化的因果关系 探究进行性多发性硬化症患者脑脊液中的细胞变化及其作为生物标志物的潜力 多发性硬化症患者(包括复发-缓解型和进行性型)及非炎症性对照的脑脊液细胞 数字病理学 多发性硬化症 流式细胞术、单细胞转录组学、ELISA NA 单细胞转录组数据、流式细胞数据、ELISA数据 回顾性流式细胞术:299例(169例RRMS,56例PMS,74例对照);前瞻性单细胞转录组学:35人(11例对照,12例RRMS,12例PMS);额外阿尔茨海默病对照数据来自公开数据集 NA 单细胞RNA-seq、流式细胞术 NA NA
36 2026-05-19
A Spatial Atlas of Muscle-Invasive Bladder Cancer Reveals Lineage-Specific Vulnerabilities and Immune Architecture
2026-May-13, Cancer discovery IF:29.7Q1
研究论文 通过整合空间转录组学、批量RNA和全外显子测序数据,构建了肌层浸润性膀胱癌的空间图谱,揭示了肿瘤内部的管腔-基底轴、谱系特异性脆弱性和免疫结构 首次通过空间转录组学揭示MIBC肿瘤内连续有序的管腔-基底轴及其与染色体不稳定性、转录可塑性和治疗敏感性的关联 未提及,可能包括样本量限制和空间转录组技术的分辨率局限性 构建肌层浸润性膀胱癌的空间图谱,以理解其谱系状态、免疫结构和治疗脆弱性 22个肌层浸润性膀胱癌肿瘤样本 计算病理学 膀胱癌 空间转录组学、批量RNA测序、全外显子测序 NA 空间基因表达数据、RNA测序数据、全外显子测序数据 22个肿瘤样本(空间转录组学),超过3000个肿瘤样本(泛队列分析) NA 空间转录组学 NA NA
37 2026-05-19
Maternal immune activation perturbs the brain epitranscriptome
2026-May-12, Brain, behavior, and immunity
研究论文 本研究揭示了母体免疫激活如何扰动大脑表观转录组,并鉴定出脱甲基酶FTO可作为改善MIA后代行为表型的治疗靶点 首次通过空间转录组学和直接RNA测序技术,系统地描述了发育中小鼠大脑中表观转录组调控因子的细胞类型和脑区特异性分布,并阐明了MIA如何改变大脑表观转录组图谱 未明确提及研究限制 阐明母体免疫激活导致的RNA代谢紊乱的精确机制,并寻找潜在治疗靶点 母体免疫激活小鼠模型及其后代 机器学习, 数字病理学 神经发育障碍 空间转录组学, 直接RNA测序 NA 空间转录组数据, 直接RNA测序数据 使用MIA小鼠模型及其后代,具体样本量未说明 NA 空间转录组学, 直接RNA测序 NA NA
38 2026-05-19
A Perturb-seq screen guided by species divergence uncovers pathways for collateral artery formation
2026-May-10, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过物种分化引导的 Perturb-seq 筛选,揭示侧支动脉形成的通路 结合豚鼠和小鼠的单细胞 RNA 测序数据,开发 Perturb-seq 平台以发现调控动脉内皮细胞特化的基因,并识别出抑制侧支动脉形成的通路 研究主要基于小鼠模型和体外实验,结果在人类中的适用性尚需验证 探索侧支动脉形成的发育机制,鉴定能够促进其生长的治疗靶点 豚鼠和小鼠的组织内皮细胞,特别是与侧支动脉发育相关的基因表达模式 机器学习, 数字病理学 心血管疾病 单细胞 RNA 测序, Perturb-seq NA 基因表达数据 来自豚鼠和小鼠组织的内皮细胞样本 10x Genomics 单细胞 RNA 测序 10x Chromium 10x Chromium 单细胞 3' 测序平台
39 2026-05-19
BART-spatial unravels biologically significant transcriptional regulators from spatial omics data
2026-May-08, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出BART-spatial方法,从空间组学数据中推断有生物学意义的转录调控因子 首次整合空间变异性和伪时间信息与公开的转录调控因子结合图谱,从空间组学数据中推断功能性转录调控因子,而传统方法主要针对非空间单细胞数据且忽略空间异质性 对转录调控因子低表达的处理仍有限制,且依赖公开的结合图谱可能覆盖不全 开发一种计算方法用于从空间组学数据中识别活性转录调控因子 空间转录组和空间表观基因组数据中的转录调控因子 机器学习 NA 空间转录组学、空间表观基因组学 BART(结合分析预测调控) 空间组学数据 多个空间数据集,来自不同平台 10x Genomics, Atera 空间转录组学, 空间表观基因组学 10x Visium, Visium HD, Atera, spatial RNA-ATAC-seq 10x Visium, Visium HD, Atera平台和空间RNA-ATAC-seq技术
40 2026-05-19
LongAllele: a joint inference framework for allele-specific analysis on long-read bulk and single-cell RNA sequencing
2026-May-08, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出一种基于期望最大化算法的联合推断框架LongAllele,用于长读段批量与单细胞RNA测序的等位基因特异性分析 首次将杂合变异检测、单倍型推断与读段-单倍型分配整合为统一统计框架,并引入可相位感知的检验方法处理非相位读段,避免假阳性错误 未提及具体局限性,可能包括计算复杂度高或对长读段数据质量依赖较强 开发能全面表征基因、异构体和局部事件水平等位基因调控效应的统计框架 GTEx多组织批量、外周血单核细胞(单细胞)和人海马体(单细胞核)长读段RNA-seq数据集 自然语言处理 NA 长读段RNA测序 期望最大化算法 RNA测序数据(长读段) GTEx多组织样本(批量)、外周血单核细胞(单细胞)、人海马体(单细胞核) NA NA NA NA
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