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当前共找到 39284 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-05-09 |
Single-cell profiling uncovers a hypoxia-vascular-immune axis underlying poor immunotherapy response in acral versus cutaneous melanoma
2026-May-07, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08201-2
PMID:42098765
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示肢端黑色素瘤和皮肤黑色素瘤在肿瘤微环境上的差异，特别是围绕缺氧-血管-免疫轴解释肢端黑色素瘤免疫治疗反应差的机制 | 首次系统性地解析了肢端黑色素瘤中血管间质成分（特别是周细胞）对免疫治疗抵抗的贡献，并发现了新的免疫抑制轴（NECTIN2-TIGIT）关联缺氧环境 | 主要依赖转录组数据分析，缺乏大规模功能验证实验和临床前瞻性验证 | 研究肢端黑色素瘤与皮肤黑色素瘤在肿瘤微环境（尤其血管-间质成分）上的差异，解释肢端黑色素瘤免疫治疗反应差的机制 | 肢端黑色素瘤、皮肤黑色素瘤和正常皮肤组织的单细胞转录组数据 | 机器学习 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量RNA测序、qPCR、Western blot | NA | 单细胞转录组、空间转录组、批量RNA测序 | 31例肢端黑色素瘤、13例皮肤黑色素瘤和35例正常皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 22 | 2026-05-09 |
A pyroptosis-related molecular signature stratifies prognosis and highlights GSDMB-mediated malignancy in intrahepatic cholangiocarcinoma
2026-May-07, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-026-00824-1
PMID:42098854
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研究论文 | 基于细胞焦亡相关基因构建肝内胆管癌预后分子分型，揭示GSDMB通过TGF-β信号轴促进肿瘤恶性进展的机制 | 首次整合多组学数据（转录组、单细胞转录组、蛋白质组、磷酸化蛋白质组、空间转录组和基因组突变）系统阐明细胞焦亡在肝内胆管癌中的临床和生物学意义，并发现TGF-β-GSDMB-CDH3信号轴驱动肿瘤侵袭性 | 研究主要基于队列数据分析和体外实验，未进行体内动物模型验证，且GSDMB下游的具体分子机制仍需进一步探索 | 阐明细胞焦亡在肝内胆管癌中的预后分层价值和分子调控机制 | 肝内胆管癌患者的肿瘤组织及细胞样本 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学, 磷酸化蛋白质组学, 空间转录组学, 基因组突变分析 | 回归分析模型（LASSO-Cox） | 转录组数据、蛋白质组数据、空间转录组数据、基因组数据 | 165236个单细胞来自肝内胆管癌组织 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 23 | 2026-05-09 |
Single-cell and machine learning-integrated bulk RNA-seq analysis reveals TKT as an oxidative stress-associated diagnostic biomarker in acute myocardial infarction
2026-May-07, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-026-00978-z
PMID:42098867
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研究论文 | 通过单细胞和机器学习的批量RNA测序整合分析，揭示TKT作为急性心肌梗死中氧化应激相关的诊断生物标志物 | 首次在单细胞水平上系统分析急性心肌梗死中氧化应激相关基因的动态表达谱，并利用六种机器学习算法共识筛选出TKT作为稳健的诊断标志物 | 未在独立大规模队列或不同人群中进行外部验证；TKT的功能机制尚未在体内动物模型中验证 | 识别急性心肌梗死中氧化应激相关的诊断生物标志物 | 急性心肌梗死患者的心肌组织和外周免疫细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、西方 blot、伪时间轨迹推断、细胞间通信网络构建 | LASSO、随机森林、Boruta、贝叶斯模型、LVQ、Treebag | 单细胞转录组数据、批量RNA测序数据 | 多个队列的批量RNA测序数据集和单细胞RNA测序样本 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 24 | 2026-05-09 |
Integrating single-cell multi-omics and machine learning to reveal triaptosis heterogeneity in clear cell renal cell carcinoma
2026-May-07, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-026-00982-3
PMID:42098870
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研究论文 | 整合单细胞多组学和机器学习揭示透明细胞肾细胞癌中triaptosis的异质性 | 首次在单细胞水平系统描绘透明细胞肾细胞癌中triaptosis的异质性格局，并基于高triaptosis上皮亚群构建稳健的四基因预后标志，实现对预后分层、免疫治疗指导和化疗反应预测的强效模型 | NA | 阐明triaptosis在透明细胞肾细胞癌中的异质性及其临床意义 | 透明细胞肾细胞癌组织的单细胞转录组、空间转录组和批量转录组数据 | 机器学习 | 肾癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组测序、批量RNA测序 | 机器学习模型、预后标志 | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒, 10x Visium空间转录组学 |
| 25 | 2026-05-09 |
A bone-derived hormone permits rapid visual escape via GPR37 receptor in a subpopulation of VTA GABAergic neurons
2026-May-06, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2025.12.048
PMID:41679312
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研究论文 | 揭示了骨源性激素骨钙素通过GPR37受体增强VTA GABA能神经元亚群兴奋性，从而促进快速视觉逃逸的分子机制 | 首次发现骨源性激素骨钙素通过GPR37-cAMP-THIK-1通路调控中脑腹侧被盖区GABA能神经元亚群的兴奋性，建立骨-脑代谢轴与快速逃逸行为之间的新联系 | 未明确解释骨钙素信号如何特异性调控共释放神经元亚群，且实验仅在小鼠模型中进行 | 阐明骨源性激素骨钙素调节快速视觉逃逸行为的神经机制 | 小鼠中脑腹侧被盖区GABA能神经元亚群 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学、电生理学 | NA | 转录组数据、电生理数据 | 小鼠模型（具体数量未详） | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 26 | 2026-05-09 |
Hepatocyte-targeted Bap1 reduction in the liver primes an inflammatory transcriptional response
2026-May-06, G3 (Bethesda, Md.)
DOI:10.1093/g3journal/jkag047
PMID:41712409
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研究论文 | 利用AAV8介导的CRISPR/CAS9基因组编辑技术，构建小鼠肝细胞特异性Bap1敲除模型，结合空间转录组学和免疫组化分析Bap1缺失对肝脏免疫应答的影响 | 首次在体内系统中通过肝细胞特异性Bap1敲除模型，结合单细胞分辨率空间转录组学与免疫组化定量分析，揭示了Bap1缺失如何改变肝脏损伤后的免疫细胞募集和炎症环境 | 仅在小鼠模型中验证，未在人类样本中确认；未探讨Bap1缺失在不同损伤类型下的具体机制 | 研究Bap1在肝脏正常功能中的调节作用，及其缺失后对肝脏免疫应答和损伤反应的影响 | 小鼠肝细胞特异性Bap1敲除模型 | 数字病理学 | 肝癌 | AAV8介导的CRISPR/CAS9基因组编辑, 空间转录组学, 免疫组化, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据, 图像 | 小鼠肝细胞特异性Bap1敲除模型（具体样本量未提及） | 10x Genomics, NA | 空间转录组学, 批量RNA测序 | 10x Visium, NA | 单细胞分辨率空间转录组学 |
| 27 | 2026-05-09 |
Periodontitis induces skeletal muscle atrophy by increasing circulating levels of activin A
2026-05-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72766-1
PMID:42091891
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研究论文 | 本研究揭示牙周炎通过增加循环中activin A的水平导致骨骼肌萎缩 | 首次发现牙周炎通过gingiva中activin A的高表达进入循环系统，从而诱导骨骼肌萎缩，并提出了通过局部注射siInhba来预防这种萎缩的新策略 | 未提及明显的局限性 | 探究牙周炎对骨骼肌的影响及其中介机制 | 雄性小鼠及人类牙周炎患者 | 机器学习 | 牙周炎 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型及人类牙周炎组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 28 | 2026-05-09 |
Single-cell and spatial transcriptomic profiling of POU5F1 in Lung Adenocarcinoma: Dynamics, spatial niche, and prognosis via multi-algorithm ML
2026-May-06, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102800
PMID:42097097
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研究论文 | 整合单细胞和空间转录组学以及多算法机器学习，系统研究POU5F1在肺腺癌中的动态变化、空间微环境及预后价值 | 首次综合运用因果推断、单细胞和空间转录组学、RNA速度分析及多算法机器学习，全面解析POU5F1在肺腺癌中的功能机制，并构建基于POU5F1相关差异表达基因的高性能预后模型 | 文中未明确说明局限性 | 阐明POU5F1在肺腺癌中的系统性功能和机制，并评估其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 肺腺癌细胞及组织样本 | 机器学习, 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, RNA速度分析, 孟德尔随机化, 机器学习 | 机器学习预后模型 | 基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间基因表达 |
| 29 | 2026-05-09 |
Targeting senescence mitigates the deleterious effects of midlife obesity on neurovascular function by partially restoring blood-brain barrier integrity and neurovascular coupling
2026-May-05, Journal of cerebral blood flow and metabolism : official journal of the International Society of Cerebral Blood Flow and Metabolism
IF:4.9Q1
DOI:10.1177/0271678X261444196
PMID:42083907
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研究论文 | 研究发现中年肥胖通过诱导神经血管单元内的细胞衰老导致脑血管功能障碍，清除衰老细胞可部分恢复血脑屏障完整性和神经血管耦合 | 首次揭示细胞衰老是连接中年肥胖与脑血管和认知功能障碍的关键机制，并通过清除衰老细胞（针对p16阳性细胞）提供了概念验证性治疗策略 | 未明确说明，但推测可能存在研究仅基于动物模型、长期效果未评估、以及人群普适性需进一步验证等潜在局限 | 探究中年肥胖导致脑血管功能障碍和认知衰退的细胞机制，以及靶向衰老疗法是否可减轻相关损害 | 高脂饮食诱导肥胖的小鼠模型，重点关注神经血管单元中的内皮细胞和神经元 | 机器学习, 数字病理学 | 血管性认知障碍, 痴呆 | 单细胞RNA测序, 多模态体内纵向成像 | NA | 图像, 文本 | 涉及高脂饮食诱导肥胖小鼠及对照小鼠的样本，具体数量未在摘要中提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 30 | 2026-05-09 |
Charting spatial ligand-target activity using Renoir
2026-05-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72388-7
PMID:42086556
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研究论文 | 介绍了Renoir方法，用于在空间拓扑结构中绘制配体-靶标活性，识别具有特定配体-靶标相互作用的空间通讯微环境 | Renoir首次能够跨越空间拓扑结构绘制配体-靶标活性，识别空间通讯微环境中的配体-靶标相互作用，并在不同分辨率和背景下（从发育到疾病）进行空间路径级活性映射 | 未提及具体局限性 | 开发一种新方法，用于从空间转录组数据中推断并绘制配体对下游靶标基因的影响，以解析不同空间微环境中配体-靶标的关系 | 多种空间数据集，涵盖从发育到疾病的不同分辨率（从点状到单细胞），包括胎儿肝脏和肝细胞癌样本 | 计算机视觉 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 多种空间数据集，具体数量未提及 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 31 | 2026-05-09 |
Profiling cell dynamic changes of goat peripheral blood mononuclear cells after Pasteurella multocida infection with single-cell transcriptomics and histopathology
2026-May-05, Veterinary research
IF:3.7Q1
DOI:10.1186/s13567-025-01661-2
PMID:42087228
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研究论文 | 利用单细胞转录组学和组织病理学，分析山羊感染多杀性巴氏杆菌后外周血单个核细胞的动态变化 | 首次利用单细胞RNA测序技术全面解析山羊感染多杀性巴氏杆菌后外周血单个核细胞的动态免疫反应，鉴定关键基因和免疫通路 | 未提及具体局限性 | 研究山羊感染多杀性巴氏杆菌后外周血单个核细胞的免疫反应机制 | 山羊外周血单个核细胞及感染后多组织样本 | 数字病理学 | 细菌感染 | 单细胞RNA测序、重组酶聚合酶扩增-侧流层析试纸条、组织病理学 | NA | 基因表达数据 | 42,615个细胞，来自山羊感染前后的外周血单个核细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 重组酶聚合酶扩增-侧流层析试纸条 | NA | NA |
| 32 | 2026-05-09 |
Analytical approaches for the isolation and characterisation of circulating tumour cells in clinical practice
2026-May-05, Clinica chimica acta; international journal of clinical chemistry
DOI:10.1016/j.cca.2026.121055
PMID:42097193
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综述 | 本文综述了循环肿瘤细胞（CTC）的分离与表征分析方法及其在临床实践中的应用 | 综合评估CTC分离平台的性能指标，如捕获效率、富集度、纯度、通量、回收率和细胞活力，并探讨微流控、单细胞测序和人工智能驱动分析等新技术如何增强CTC检测的敏感性和特异性 | CTC极低频率和表型异质性使分离和分析具有挑战性；基于细胞系验证可能高估在真实患者样本中的性能 | 评估CTC分离与表征技术在精准肿瘤学中的应用，并讨论其作为预后和预测生物标志物的潜力 | 循环肿瘤细胞（CTC） | 机器学习 | 肿瘤 | NA | CNN | 图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 33 | 2026-05-09 |
ROS, identified as a driver for fibroblast activation, can be counteracted by glucocorticoid in LINC00605-dependent GMD machinery
2026-May-05, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，以增生性瘢痕为模型，揭示了活性氧（ROS）驱动成纤维细胞活化为肌成纤维细胞，并通过LINC00605依赖的糖皮质激素受体介导的mRNA降解机制抑制ROS生成，从而为治疗增生性瘢痕提供新策略 | 首次证明ROS是成纤维细胞活化的驱动因子，并发现糖皮质激素通过非经典糖皮质激素受体途径的LINC00605依赖的mRNA降解机制下调NOXA1表达，从而抑制ROS生成，逆转成纤维细胞表型转变 | 研究中未提及具体局限性，但可能包括模型系统在体内验证的不足或翻译到临床的潜在挑战 | 阐明ROS在成纤维细胞活化中的作用机制及糖皮质激素的调控途径 | 增生性瘢痕来源的成纤维细胞 | 机器学习和数字病理学 | 增生性瘢痕 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 34 | 2026-05-09 |
Dynamic Responses of Cancer-Associated Fibroblasts to Therapy in Primary Liver Cancer
2026-May-05, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218566
PMID:42097494
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综述 | 总结癌症相关成纤维细胞在原发性肝癌中的动态响应及其对治疗的影响 | 系统梳理了肝癌中CAF亚型在化疗和免疫治疗下的动态变化及其对治疗反应和预后的影响，并讨论了靶向特定CAF亚型的挑战 | 缺乏统一的标记物来识别CAF亚型，且治疗依赖的可塑性尚未完全阐明 | 全面概述CAF亚型在原发性肝癌中的异质性、功能多样性及其治疗响应的动态变化 | 原发性肝癌中的癌症相关成纤维细胞 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、空间多组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间多组学 | NA | NA |
| 35 | 2026-05-09 |
A practical guide to spatial transcriptomics: lessons from over 1000 samples
2026-May, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.08.020
PMID:40975650
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综述 | 基于1000多个样本的空间转录组学实践指南，涵盖实验设计、样本处理、测序和计算分析 | 总结了跨平台大规模空间转录组学实验的实操经验，特别强调临床样本的注意事项 | 主要基于作者团队经验，可能未涵盖所有平台或新兴技术 | 提供空间转录组学实验的实用指南，支持可重复的标准化工作流程 | 空间转录组学实验的实践流程和最佳实践 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 超过1000个空间样本 | NA | 空间转录组学 | NA | 涉及多个空间转录组学平台 |
| 36 | 2026-05-09 |
In vitro models of cancer-associated fibroblast heterogeneity uncover subtype-specific effects of CRISPR perturbations
2026-May, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.70153
PMID:41146557
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研究论文 | 开发了一种共培养模型，利用原代癌症相关成纤维细胞和永生化肿瘤细胞系，可靠地再现肿瘤中观察到的CAF表型，并通过单细胞转录组学表征CAF亚型异质性及CRISPR扰动的影响 | 首次通过共培养模型系统性地验证了CAF模型的可转化性，并利用永生化CAF细胞系进行单细胞CRISPR扰动，揭示了亚型特异性效应 | 未明确说明局限性，但隐含了对胰腺肿瘤CAF异质性知识的缺乏以及模型可转化性评估不足 | 研究癌症相关成纤维细胞的亚型异质性及其在CRISPR扰动下的亚型特异性效应 | 从胰腺癌患者分离的原代CAFs、永生化CAF细胞系、肿瘤细胞系 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 胰腺癌患者来源的CAFs及永生化CAF细胞系 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 37 | 2026-05-09 |
TransGRN: A Transfer Learning-Based Framework for Inferring Gene Regulatory Networks Across Cell Lines
2026-May, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3628564
PMID:41191474
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研究论文 | 提出一种基于迁移学习的框架TransGRN，用于跨细胞系推断基因调控网络 | 采用跨细胞系预训练策略，结合多个源细胞系的单细胞RNA测序数据和大语言模型生物知识，以及集成基因表达谱与语义信息的调控交互提取模块，实现跨细胞系泛化 | 依赖源细胞系的预训练数据质量，且在目标细胞系数据极稀缺时性能可能受限 | 解决在目标细胞系先验调控信息匮乏的小样本场景下，基因调控网络推断的有效性问题 | 细胞系及单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 迁移学习模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 38 | 2026-05-09 |
Belimumab modulates type I interferon signalling in the treatment of systemic lupus erythematosus
2026-05, Clinical and experimental rheumatology
IF:3.4Q2
DOI:10.55563/clinexprheumatol/03t59o
PMID:41328601
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研究论文 | 贝利木单抗通过调节I型干扰素信号传导治疗系统性红斑狼疮的机制研究 | 首次通过单细胞RNA测序揭示贝利木单抗在SLE患者中调节免疫细胞亚群及I型干扰素信号通路的新机制 | 样本量较小，仅6例患者，且未探究长期疗效及潜在副作用 | 研究贝利木单抗对系统性红斑狼疮患者免疫图谱的影响 | 6例活动期SLE患者的外周血单核细胞 | 单细胞转录组学 | 系统性红斑狼疮 | RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 6例活动期SLE患者 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 单细胞RNA测序（10x Chromium平台） |
| 39 | 2026-05-09 |
The transcriptome of CD14+CD163-HLA-DRlow monocytes predicts mortality in idiopathic pulmonary fibrosis
2026-May, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.00804-2025
PMID:41360505
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序发现CD14+CD163-HLA-DRlow单核细胞的转录组可预测特发性肺纤维化患者的死亡率 | 首次揭示CD14+CD163-HLA-DRlow单核细胞特异性转录组特征与IPF死亡率之间的关联，并通过多队列验证、药物预测和基因子集筛选提高了临床转化的潜力 | 未明确说明样本中种族或其他混杂因素对结果的影响，且药物候选需进一步实验验证 | 探索免疫细胞特异性转录组谱与特发性肺纤维化患者预后的关联，并识别预测死亡率的生物标志物 | 特发性肺纤维化患者及健康对照的外周血单核细胞、支气管肺泡灌洗液和肺组织样本 | 机器学习 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 总样本量1054人，其中IPF患者555人，其他499人 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 40 | 2026-05-09 |
Exploring fibroblast activation protein as an early biomarker in chronic lung allograft dysfunction
2026-May, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.01738-2025
PMID:41412718
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研究论文 | 探索成纤维细胞活化蛋白作为慢性肺同种异体移植功能障碍早期生物标志物的潜力 | 首次系统评估FAP在CLAD中的表达模式及其作为早期诊断标记物的可行性，结合小鼠模型和临床队列进行验证 | FAP的鉴别能力中等（AUC 0.78），需要在多中心队列中进行前瞻性验证 | 验证FAP表达是否在CLAD中升高以及能否作为早期诊断标志物 | 小鼠肺移植模型和人类CLAD患者肺组织及支气管活检标本 | 数字病理学 | 慢性肺同种异体移植功能障碍 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学 | NA | 基因表达数据，组织图像 | 2个小鼠模型（各不同品系组合）+ 5例对照和5例CLAD患者的人肺组织 + 240例肺移植受者活检（62例CLAD，178例无CLAD） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |