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当前共找到 32606 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-11-15 |
Antiviral Monocytes Increase Prior to Detectable HIV-1 Rebound Viremia
2025-Nov-14, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiaf367
PMID:40628395
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研究论文 | 本研究通过分析HIV-1治疗中断前后血浆蛋白质组学和单细胞转录组学数据，发现病毒反弹前CD16++单核细胞增加并表达抗病毒基因 | 首次在可检测的病毒反弹前观察到独特的转录特征，特别是CD16++单核细胞的增加和抗病毒基因表达上调 | 研究样本量有限，仅关注外周血单核细胞，未涉及其他组织中的HIV-1潜伏库 | 表征HIV-1治疗中断后病毒反弹引发的免疫反应特征 | 人类免疫缺陷病毒1型（HIV-1）感染者的外周血单核细胞 | 单细胞组学 | HIV-1感染 | 单细胞转录组学，血浆蛋白质组学 | NA | 单细胞RNA测序数据，蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 22 | 2025-11-15 |
Spatially organized cellular communities shape functional tissue architecture in the pancreas
2025-Nov-14, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adx5791
PMID:41223257
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研究论文 | 本研究结合单细胞和空间转录组学技术，揭示了胰腺中细胞群体如何通过空间组织形成功能性组织结构 | 首次将单细胞和空间转录组学结合，系统描绘了胰腺从胚胎发育到成年稳态的空间细胞图谱，并发现了上皮-间充质单元作为基本组织微环境 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 解析胰腺组织结构和细胞空间组织的发育机制 | 小鼠和人类胰腺组织 | 空间转录组学 | 胰腺疾病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 转录组数据,空间定位数据 | 小鼠胚胎发育到成年多个时间点的胰腺组织 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 23 | 2025-11-15 |
Evolution and Co-occurrence of PI3K Pathway Gene Mutations in Endometrial Carcinoma Molecular Subtypes at the Single-Cell Level
2025-Nov-14, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-1237
PMID:40833784
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研究论文 | 通过单细胞测序研究子宫内膜癌分子亚型中PI3K通路基因突变的进化模式和共存情况 | 首次在单细胞水平揭示不同分子亚型子宫内膜癌中PI3K通路基因突变的进化模式差异 | 样本量较小，属于探索性研究，需要进一步验证 | 探究PI3K通路基因突变在子宫内膜癌不同分子亚型中的进化模式 | 子宫内膜样子宫内膜癌组织样本 | 单细胞基因组学 | 子宫内膜癌 | 单核DNA测序 | NA | 基因组DNA序列数据 | 11个肿瘤样本（NSMP=5，MMRd=3，POLE=3），共50,009个细胞 | NA | 单细胞DNA测序 | NA | 针对64个癌症相关基因热点变异及PTEN、PIK3R1、PIK3CA编码序列的测序 |
| 24 | 2025-11-15 |
Multiomics and Single-Cell Insights Reveal a Lysophosphatidic Acid-Mediated Resistant Mechanism to Third-generation EGFR-TKI in Non-Small Cell Lung Cancer
2025-Nov-14, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-0993
PMID:40853904
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研究论文 | 本研究通过多组学和单细胞分析揭示了非小细胞肺癌对第三代EGFR-TKI产生耐药性的溶血磷脂酸介导机制 | 首次整合血浆代谢组学、耐药细胞系多组学分析和单细胞RNA测序，系统揭示了LPA介导的第三代EGFR-TKI耐药新机制 | 样本量相对有限，需要进一步验证研究结果 | 探究第三代EGFR-TKI在非小细胞肺癌中的代谢耐药机制 | 非小细胞肺癌患者和耐药细胞系 | 癌症生物学 | 肺癌 | 代谢组学分析, 单细胞RNA测序, 功能实验 | 代谢物预测模型 | 代谢组数据, 单细胞RNA测序数据, 临床数据 | 216份纵向样本来自186名NSCLC患者，215名NSCLC患者单细胞RNA测序分析 | NA | 单细胞RNA测序, 代谢组学 | NA | NA |
| 25 | 2025-11-15 |
Metastasis-Initiating Osteosarcoma Subpopulations Establish Paracrine Interactions with Lung and Tumor Cells to Create a Metastatic Niche
2025-Nov-14, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-3360
PMID:40882022
|
研究论文 | 本研究揭示了骨肉瘤中具有转移启动能力的亚群通过建立与肺细胞和肿瘤细胞的旁分泌相互作用形成转移微环境的机制 | 首次发现低增殖性骨肉瘤亚群能够响应肺上皮细胞来源的IL1α持续产生IL6和CXCL8等转移促进因子 | 研究主要依赖体外模型和动物模型，需要进一步验证在人类患者中的适用性 | 探索骨肉瘤肺转移的细胞和分子机制，为开发靶向转移的治疗策略提供理论基础 | 骨肉瘤细胞、肺上皮细胞、转移微环境 | 癌症生物学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, 体外器官型转移模型, 人源异种移植模型, 鼠免疫活性骨肉瘤模型 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 26 | 2025-11-15 |
Dynamic changes in chromatin accessibility during cell fate specification at the neural plate border
2025-Nov-14, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204943
PMID:41235466
|
研究论文 | 本研究使用单细胞ATAC测序技术探索神经板边界细胞在分化为神经细胞、神经嵴细胞和基板细胞过程中染色质可及性的动态变化 | 开发了整合scATAC-seq和scRNA-seq数据的分析流程scACE，首次揭示了神经板边界细胞通过不同染色质调控策略控制细胞命运选择的机制，并预测并验证了Foxk2作为基板细胞分化的新调控因子 | NA | 研究发育过程中染色质可及性动态变化与细胞命运决定的关系 | 神经板边界细胞及其分化的神经细胞、神经嵴细胞和基板细胞 | 表观遗传学 | NA | 单细胞ATAC测序(scATAC-seq), 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 基因调控网络 | 表观基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 27 | 2025-11-15 |
Composition and functional state of T and NK cells in the extramedullary myeloma tumor microenvironment
2025-Nov-14, Blood cancer discovery
IF:11.5Q1
DOI:10.1158/2643-3230.BCD-25-0170
PMID:41236394
|
研究论文 | 本研究通过单细胞技术揭示了髓外多发性骨髓瘤肿瘤微环境中T细胞和NK细胞的组成与功能状态 | 首次系统描述EMM肿瘤微环境中T细胞和NK细胞的组成特征和功能状态，并与骨髓微环境进行比较 | 样本量有限，仅在一半的EMM肿瘤中观察到特定现象 | 探究髓外多发性骨髓瘤肿瘤微环境中免疫细胞的组成和功能状态 | 髓外多发性骨髓瘤患者的肿瘤微环境免疫细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据,流式细胞数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 28 | 2025-11-15 |
The aberrant migration and differentiation of neural crest cells are associated with the production of HVP in bearded chicken
2025-Nov-14, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01726-7
PMID:41236583
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了胡须鸡内脏腹膜黑变病的细胞起源和分子机制 | 首次发现HVP黑色素细胞与雪旺细胞具有共同神经嵴细胞起源，并鉴定出SEMA3C-PLXND1和TNC-SDC1轴在黑色素细胞异常迁移和黏附中的关键作用 | 研究样本仅来自胡须鸡，结果在其他鸡种中的普适性需要进一步验证 | 探究内脏腹膜黑变病的细胞起源和分子机制 | 胡须鸡的黑色、褪色和正常腹膜组织 | 单细胞转录组学 | 内脏腹膜黑变病 | 单细胞RNA测序 | UMAP, CellChat | 单细胞转录组数据 | 40日和120日龄胡须鸡的腹膜组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 29 | 2025-11-15 |
Deciphering neutrophil dynamics in the focal lesion tumor microenvironment to overcome immunosuppression in multiple myeloma
2025-Nov-13, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025028963
PMID:40758944
|
研究论文 | 通过分析多发性骨髓瘤病灶微环境中的中性粒细胞动态，揭示其免疫抑制机制并探索治疗新策略 | 首次在多发性骨髓瘤中鉴定出三个独特的CXCR2+成熟中性粒细胞亚群，并证实TREM1+CD10+亚群与患者预后不良相关 | 临床前模型研究，需进一步临床验证 | 解析多发性骨髓瘤肿瘤微环境中中性粒细胞的免疫抑制功能 | 多发性骨髓瘤患者的病灶和骨髓样本中的髓系细胞 | 单细胞生物学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序，免疫荧光成像，功能分析 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 多发性骨髓瘤患者配对病灶和骨髓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 30 | 2025-11-15 |
Single-cell RNA sequencing in osteosarcoma: applications in diagnosis, prognosis, and treatment
2025-Nov-13, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-025-03121-5
PMID:41231422
|
综述 | 本文通过文献综述探讨单细胞RNA测序技术在骨肉瘤诊断、预后和治疗中的应用 | 首次系统综述单细胞RNA测序在骨肉瘤研究中的全面应用，识别了新的细胞亚群和潜在治疗靶点 | 存在单细胞协议的技术偏差和非英语文献的排除，可能影响结果的普适性 | 评估单细胞RNA测序对骨肉瘤发生发展的贡献 | 骨肉瘤肿瘤微环境中的细胞亚群和分子机制 | 单细胞组学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 107项研究 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 31 | 2025-11-15 |
ScRDAVis: An R shiny application for single-cell transcriptome data analysis and visualization
2025-Nov-13, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013721
PMID:41231930
|
研究论文 | 开发了一个名为ScRDAVis的交互式R Shiny应用程序，用于单细胞转录组数据的分析和可视化 | 首个提供hdWGCNA用于共表达网络和转录因子调控网络分析的GUI平台 | NA | 为无编程经验的生物学家提供易于使用的单细胞数据分析工具 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 32 | 2025-11-15 |
Comparative genomics, integrated with single-cell sequencing and genetic analyses, reveal roles of transcription factor AP2-M2 in asexual replication of Babesia parasite
2025-Nov-13, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013699
PMID:41231960
|
研究论文 | 本研究通过比较基因组学、单细胞测序和遗传分析揭示了转录因子AP2-M2在巴贝斯虫无性繁殖阶段的关键调控作用 | 首次构建了新疆巴贝斯虫染色体级别参考基因组，结合单细胞RNA测序揭示了寄生虫无性繁殖阶段的转录异质性和关键调控因子BxAP2-M2的持续表达特征 | 研究主要聚焦于单一巴贝斯虫物种，调控机制的具体分子通路尚未完全阐明 | 探索巴贝斯虫无性繁殖阶段的调控机制 | 新疆巴贝斯虫及其无性繁殖阶段 | 寄生虫学 | 巴贝斯虫病 | 比较基因组学, 单细胞RNA测序, 系统发育分析, 伪时间分析 | NA | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 33 | 2025-11-15 |
Library size-stabilized metacells construction enhances co-expression network analysis in single-cell data
2025-Nov-13, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013697
PMID:41231963
|
研究论文 | 提出一种通过稳定文库大小构建元细胞的计算框架，以提升单细胞数据中共表达网络分析的准确性 | 首次在元细胞构建过程中显式稳定文库大小，有效降低组合偏差对共表达网络分析的干扰 | 未明确说明方法在不同单细胞技术平台和样本类型中的普适性验证 | 解决单细胞RNA测序数据中的组合偏差问题，提高共表达网络分析的可靠性 | 单细胞RNA测序数据和阿尔茨海默病脑组织样本 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | LSMetacell框架 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 34 | 2025-11-15 |
Unified integration of spatial transcriptomics across platforms with LLOKI
2025-Nov-13, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280803.125
PMID:41233159
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研究论文 | 本文提出了一种名为LLOKI的新型框架，用于整合不同平台的空间转录组数据，无需共享基因面板 | 开发了首个无需共享基因面板即可整合成像空间转录组数据的框架，通过最优传输引导的特征传播和批次对齐实现跨平台整合 | NA | 解决空间转录组数据跨平台整合的挑战 | 小鼠脑组织样本和卵巢癌数据集 | 空间转录组学 | 卵巢癌 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | scGPT，图神经网络 | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 五个不同技术的小鼠脑样本和五个卵巢癌数据集 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 35 | 2025-11-15 |
Genetic and embryonic transcriptome analyses reveal the molecular and developmental basis of Mayer-Rokitansky-Küster-Hauser syndrome
2025-Nov-13, Journal of medical genetics
IF:3.5Q2
DOI:10.1136/jmg-2025-110805
PMID:41233206
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研究论文 | 本研究通过基因负荷分析和单细胞转录组测序揭示了Mayer-Rokitansky-Küster-Hauser综合征的遗传基础和发育机制 | 整合遗传负荷分析与胚胎单细胞转录组数据，首次系统识别MRKHS的新候选基因并揭示潜在的双基因遗传模式 | MRKHS的遗传病因仍未完全阐明，需要进一步功能验证 | 阐明MRKHS的分子遗传机制和胚胎发育基础 | 727名MRKHS先证者和2504名女性对照个体，人类和小鼠胚胎后肾组织 | 遗传学 | 生殖系统发育异常 | 外显子组测序,基因组测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据,转录组数据 | 727例患者和2504例对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 36 | 2025-11-15 |
Macrophage retrotransposon expression is associated with lupus
2025-Nov-13, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00369-9
PMID:41233567
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研究论文 | 本研究揭示了活性氧缺陷通过促进小鼠转录本D家族逆转录转座子表达驱动狼疮早期发病的机制 | 首次发现MTD逆转录转座子在组织驻留巨噬细胞中的异常表达与狼疮发病相关，并证明其可作为治疗靶点 | 研究主要基于ROS缺陷的lpr小鼠模型，人类临床验证尚需进一步研究 | 阐明NCF1基因变异导致狼疮的免疫失调机制 | 活性氧缺陷的狼疮易感lpr小鼠的组织驻留巨噬细胞 | 免疫学 | 狼疮 | bulk RNA测序, 流式细胞术, 空间分辨单细胞转录组成像 | NA | RNA测序数据, 流式细胞数据, 空间转录组数据 | 狼疮易感lpr小鼠的脾脏、肾脏和颅骨硬脑膜组织 | NA | 单细胞转录组, 空间转录组 | NA | NA |
| 37 | 2025-11-15 |
Exploring the mediating role of potential therapeutic genes in the pathogenesis of hypopituitarism through the metabolites from a genomic perspective
2025-Nov-13, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-025-10169-1
PMID:41233666
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研究论文 | 通过整合基因组数据与代谢物信息，探索潜在治疗基因在垂体功能减退症发病机制中的中介作用 | 首次采用孟德尔随机化方法系统分析基因-代谢物-垂体功能减退症的因果路径，发现UBAC1基因通过1-Methyl-4-imidazoleacetate代谢物介导疾病风险的机制 | 研究主要基于公共数据库的汇总数据，缺乏实验验证；中介效应仅解释4.35%的总效应，可能存在其他未发现的机制 | 识别垂体功能减退症的潜在药物靶点并阐明其发病机制 | 垂体功能减退症相关基因和血清/脑脊液代谢物 | 基因组学 | 垂体功能减退症 | 表达数量性状位点分析、全基因组关联研究、孟德尔随机化、贝叶斯共定位 | 两样本孟德尔随机化、两步孟德尔随机化 | 基因组数据、代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 38 | 2025-11-15 |
A single-cell multi-omics framework identifies immune cell drivers of migraine and repurposable therapeutics
2025-Nov-13, The journal of headache and pain
IF:7.3Q1
DOI:10.1186/s10194-025-02179-w
PMID:41233745
|
研究论文 | 本研究建立了一个单细胞多组学分析框架，识别偏头痛的免疫细胞驱动因素和可重新利用的治疗药物 | 开发了结合单细胞孟德尔随机化和共定位分析的多组学框架，首次在单细胞分辨率系统探索偏头痛的免疫介导调控机制 | 研究依赖于已有的基因组关联研究和单细胞数据，需要进一步实验验证 | 探索偏头痛的免疫遗传学基础并识别潜在治疗靶点 | 14种免疫细胞类型和偏头痛相关基因 | 生物信息学 | 偏头痛 | 单细胞表达数量性状位点分析, 单细胞孟德尔随机化, 共定位分析, 单细胞RNA测序, 全表型组关联研究 | 统计遗传学模型 | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | 9,117个独特的单细胞eQTLs | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 39 | 2025-11-15 |
Glutamine metabolism reprogramming promotes bladder cancer progression via PYCR1: a multi-omics and functional validation study
2025-Nov-13, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07386-2
PMID:41233804
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析和功能验证揭示了谷氨酰胺代谢重编程通过PYCR1促进膀胱癌进展的机制 | 首次构建基于谷氨酰胺代谢的预后评分模型GMscore，并发现PYCR1通过P5CS介导的脯氨酸合成和PI3K/AKT/mTOR信号通路调控膀胱癌代谢重编程 | 研究样本量有限，需要更多独立队列验证GMscore的预测效能 | 探索谷氨酰胺代谢在膀胱癌中的临床意义及其对免疫治疗反应的预测价值 | 膀胱癌细胞系、患者样本、异种移植模型 | 多组学分析 | 膀胱癌 | 靶向代谢组学、单细胞RNA测序、批量转录组分析、随机森林分析、PCA分析 | 预后评分模型GMscore | 代谢组数据、单细胞RNA测序数据、批量转录组数据 | 多个队列的膀胱癌患者样本和细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 靶向代谢组学 | NA | NA |
| 40 | 2025-11-15 |
Integrating bulk and single-cell RNA sequencing analysis to reveal characterization of mechanical stimulus-related genes and prognostic signatures in breast cancer
2025-Nov-13, Breast cancer research : BCR
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s13058-025-02130-6
PMID:41233852
|
研究论文 | 通过整合bulk和单细胞RNA测序分析，揭示机械刺激相关基因在乳腺癌中的特征并建立预后预测模型 | 首次建立基于机械刺激相关基因的乳腺癌预后评分模型，并在单细胞水平验证机械刺激对肿瘤免疫微环境的影响 | 研究主要基于TCGA数据库，需要更多独立队列验证模型的普适性 | 预测乳腺癌患者预后并理解机械刺激在乳腺肿瘤微环境中的作用 | 乳腺癌患者和肿瘤样本 | 生物信息学 | 乳腺癌 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, LASSO-Cox回归, SCISSOR算法, 体外和体内实验 | 预后评分模型, 列线图 | RNA测序数据, 临床数据 | TCGA数据库乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |