本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-11-05 |
CA1-Associated Epithelial-State Remodeling in Colon Cancer Cells Exposed to Polystyrene Nanoplastics: Integrated Multi-Omics and In Vitro Analyses
2026-Nov-03, Food and chemical toxicology : an international journal published for the British Industrial Biological Research Association
IF:3.9Q1
DOI:10.1016/j.fct.2026.116476
PMID:42977244
|
研究论文 | 该文通过整合bulk转录组学、可解释机器学习、WGCNA、单细胞与空间转录组学、结构分析及体外实验,研究聚苯乙烯纳米塑料暴露下结肠癌细胞的CA1相关上皮状态重塑 | 首次将可解释机器学习、WGCNA、单细胞与空间转录组学及分子对接和分子动力学模拟相结合,系统揭示PS-NPs暴露相关的CA1/CA2低表达上皮状态,并在HCT116细胞中验证PS-NPs对CA1、CA2和Occludin表达及细胞行为的影响 | 分子对接与100 ns分子动力学仅显示苯乙烯与CA1之间微弱且动态的接触;机器学习模型的跨队列比较为探索性分析,训练AUC达1.000可能存在过拟合;体外实验主要基于HCT116单一细胞系,缺乏体内验证 | 探究PS-NPs暴露与结肠癌上皮分子状态之间的关联,识别连接纳米塑料暴露与结肠癌细胞行为的关键基因及上皮状态重塑机制 | 结肠癌差异表达基因、苯乙烯相关基因、结肠癌单细胞与空间转录组数据、类器官数据、TCGA-COAD与Human Protein Atlas数据以及HCT116结肠癌细胞 | 多组学与机器学习 | 结肠癌 | bulk RNA-seq、单细胞转录组学、空间转录组学、WGCNA、可解释机器学习、分子对接、分子动力学模拟 | LASSO、GBM、SHAP | 基因表达数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据、图像、文本 | 2139个结肠癌差异表达基因与766个苯乙烯相关基因取交集得到159个候选基因;45个分类模型;HCT116细胞体外实验 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
| 22 | 2026-11-05 |
Exploration of Key Targets and Prognostic Significance of Vitamin Metabolism in Uterine Corpus Endometrial Carcinoma Progression Using Bulk and Single-Cell RNA Sequencing
2026-Nov-03, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
DOI:10.1007/s43032-026-02252-y
PMID:42977868
|
研究论文 | 该研究利用批量与单细胞RNA测序数据,识别维生素代谢相关基因在子宫体子宫内膜癌进展中的关键靶点,并构建8基因预后模型 | 首次结合WGCNA与单细胞RNA测序分析维生素代谢相关基因在UCEC中的预后价值,构建8基因LASSO-Cox预后模型,并发现DKC1通过激活IL-6/JAK2/STAT3通路促进UCEC恶性进展 | 基于公共数据库的回顾性分析,缺乏独立外部验证队列;体外细胞实验不能完全代表体内肿瘤微环境 | 探索维生素代谢相关基因在子宫体子宫内膜癌进展中的关键靶点及预后意义 | 子宫体子宫内膜癌(UCEC)患者及其转录组数据、临床数据与单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, qRT-PCR, Western blot, CCK-8, 集落形成实验, Transwell, ELISA | LASSO-Cox回归, WGCNA, inferCNV, CellChat | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 临床数据, 图像 | NA | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 23 | 2026-11-05 |
Autophagy-Active Immune Cell Cluster and Crucial Gene Expression in Nonunion Via Single-Cell Sequencing and Functional Enrichment Analysis
2026-Nov-03, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/72578
PMID:42980210
|
研究论文 | 该研究通过单细胞测序和功能富集分析,识别了骨不连中自噬活跃的免疫细胞簇及关键基因 | 首次结合单细胞测序和RNA-seq数据,鉴定骨不连中自噬活跃的巨噬细胞亚群,并揭示了关键的配体-受体通路和差异表达基因 | 研究基于公共数据库的回顾性数据,样本量有限,缺乏实验验证 | 识别与骨不连进展相关的自噬活跃免疫细胞簇和关键基因 | 股骨骨不连组织和正常组织 | 数字病理学 | 骨不连 | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | AUCell, CellChat | 单细胞转录组数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 24 | 2026-11-05 |
Integrated Single-Cell Transcriptomics Identifies Epi_C4 and Supports a Pro-Tumor Role for FAM20C in Lung Adenocarcinoma
2026-Nov-03, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/74572
PMID:42980222
|
研究论文 | 整合四个公共单细胞RNA测序数据集,识别肺腺癌中的上皮细胞异质性状态Epi_C4,并验证FAM20C的促肿瘤作用 | 通过整合大规模单细胞转录组数据识别出具有高非整倍体、低分化特征的上皮状态Epi_C4,并基于其构建12基因预后模型,同时首次揭示FAM20C在Epi_C4中富集并发挥促肿瘤功能 | 12基因预后模型在GSE29013验证队列中未能有效分层患者,且FAM20C功能验证仅在NCI-H838细胞系中进行,缺乏体内实验验证 | 刻画肺腺癌瘤内上皮异质性并评估其临床相关性 | 肺腺癌患者单细胞转录组数据及TCGA和GEO队列数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 193,280个质控后的单细胞(来自4个公共单细胞RNA测序数据集),外加TCGA LUAD队列和6个独立GEO队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 25 | 2026-11-05 |
Neoadjuvant PD-L1/TGF-β blockade can rapidly disrupt the tumor stroma in head and neck cancer patients
2026-Nov-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI198718
PMID:42969228
|
研究论文 | 本研究探讨了新辅助PD-L1/TGF-β双抑制剂bintrafusp alfa治疗头颈部鳞状细胞癌患者后对肿瘤基质的快速影响 | 首次在窗口机会研究中证明靶向TGF-β可在短时间内破坏肿瘤基质,表现为活化的LRRC15+ CAF显著减少、胶原I和XII含量降低以及CD8+ T细胞浸润增加,且这些变化在两个独立队列中得到验证 | 最终临床队列样本量小(6例+6例),无法评估治疗效果,需要进一步试验和新型生物标志物来筛选可能获益的患者 | 研究新辅助bintrafusp alfa治疗对头颈部鳞状细胞癌肿瘤基质的影响 | 头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)患者 | 数字病理 | 头颈癌 | scRNA-seq、成像、空间转录组学 | NA | 图像、文本 | 两个队列共12例HNSCC患者(每队列6例),治疗前和治疗后3周的肿瘤活检样本 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | 10x Chromium, 10x Visium | NA |
| 26 | 2026-11-05 |
Assessing the toxicological effects of di(2-ethylhexyl) phthalate on vascular diseases: Insights from network toxicology, Mendelian randomization, single-cell RNA sequencing, and experimental validation
2026-Nov-02, Tissue & cell
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.tice.2026.104114
PMID:42976599
|
研究论文 | 本研究结合网络毒理学、孟德尔随机化、单细胞RNA测序和实验验证,系统探讨了邻苯二甲酸二(2-乙基己基)酯(DEHP)对血管疾病(腹主动脉瘤、颈动脉斑块和血管重塑)的毒性作用及分子机制。 | 首次整合网络毒理学、孟德尔随机化、单细胞RNA测序和实验验证多种方法,揭示DEHP通过TLR4、PARP1和MMP9等核心基因网络诱导血管毒性的分子机制。 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内动物模型验证;DEHP暴露浓度和时间的临床相关性有待进一步确认。 | 系统探索DEHP诱导血管毒性的分子机制,并识别关键分子靶点。 | 血管疾病(腹主动脉瘤、颈动脉斑块和血管重塑)及血管平滑肌细胞(VSMC)。 | 毒理学、网络毒理学、孟德尔随机化、单细胞转录组学 | 血管疾病(腹主动脉瘤、颈动脉斑块、血管重塑) | 网络毒理学、孟德尔随机化、单细胞RNA测序、分子对接、体外实验验证 | NA | 基因表达数据、eQTL数据、单细胞RNA测序数据、图像(分子对接)、实验数据 | NA(未在摘要中明确样本量) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 27 | 2026-06-18 |
High-resolution single-cell sequencing of trans-spliced mRNA
2026-Nov, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-026-01373-7
PMID:42303775
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 28 | 2026-11-05 |
Deciphering the metabolic landscape of MYCN non-amplified neuroblastoma through integrated multiomics
2026-Nov, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.70595
PMID:42311143
|
研究论文 | 该研究通过整合单细胞RNA测序、蛋白质组学和代谢组学,系统解析了MYCN非扩增神经母细胞瘤的代谢特征 | 首次对MYCN非扩增神经母细胞瘤进行整合多组学代谢表征,结合随机森林分类器和双向正交偏最小二乘分析筛选生物标志物,揭示了氧化脂质代谢重塑在高危疾病进展中的核心作用 | 样本量较小,仅纳入22例神经母细胞瘤样本,需更大规模队列验证发现 | 解析MYCN非扩增神经母细胞瘤的代谢景观,揭示高危疾病进展机制并识别潜在治疗靶点 | 22例神经母细胞瘤样本 | 多组学、代谢组学、单细胞转录组学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学、代谢组学、多组学整合分析 | 随机森林分类器、双向正交偏最小二乘分析 | 单细胞转录组数据、蛋白质组数据、代谢组数据 | 22例神经母细胞瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序、蛋白质组学、代谢组学 | NA | NA |
| 29 | 2026-11-05 |
The transcriptional landscape in thyroid cancer: current status of circulating biomarkers and liquid biopsy approaches
2026-Nov, Expert review of anticancer therapy
IF:2.9Q2
DOI:10.1080/14737140.2026.2708770
PMID:42490163
|
综述 | 本文综述了甲状腺癌转录组图谱和液体活检方法的最新进展,涵盖组织与液体活检转录组学技术及其在分子分型、生物标志物发现和精准医疗中的应用 | 系统整合了从bulk RNA测序到单细胞和空间转录组学、细胞外囊泡RNA、循环肿瘤细胞和循环非编码RNA等多种转录组学和液体活检方法,并讨论了多组学整合和人工智能驱动分析框架在甲状腺癌精准管理中的前景 | 常规临床实施仍需标准化方法学、前瞻性多中心验证,以及与液体活检、多组学和人工智能分析框架的整合 | 总结转录组图谱和液体活检方法在甲状腺癌分子分类、生物标志物发现、肿瘤异质性、疾病监测、治疗分层和精准肿瘤学中的最新进展 | 甲状腺癌 | 精准医学 | 甲状腺癌 | bulk RNA测序, 单细胞转录组学, 空间转录组学, 细胞外囊泡RNA分析, 循环肿瘤细胞检测, 循环非编码RNA分析 | NA | 文本 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 30 | 2026-11-05 |
Endothelial miR-15a/16-1 Regulation of SYNE1 Mediates Structural and Functional Recovery after Traumatic Brain Injury
2026-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.77111
PMID:42584458
|
研究论文 | 本文揭示了内皮细胞特异性敲除miR-15a/16-1通过靶向SYNE1促进创伤性脑损伤后的血脑屏障修复及神经功能恢复 | 首次发现内皮miR-15a/16-1-SYNE1轴在TBI后促进内皮修复和神经恢复中的作用,并利用人TBI组织单细胞RNA测序验证SYNE1在内皮细胞中的下调 | 研究主要基于动物模型,人体数据仅为观察性单细胞转录组分析,尚无直接干预人体内皮miR-15a/16-1或SYNE1的临床证据 | 探究内皮细胞miR-15a/16-1在TBI后长期结构和功能恢复中的作用及其下游分子机制 | 创伤性脑损伤小鼠模型及人TBI脑组织样本 | 神经科学, 分子生物学, 单细胞转录组学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA-seq, 转录组分析, 荧光素酶报告基因实验, AAV介导基因敲低 | NA | 基因表达数据, 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 31 | 2026-11-05 |
Multi-Omics Integration Identifies a CDH3-Associated Malignant Epithelial State and Immunosuppressive Niche to Predict Prognosis in Thymic Epithelial Tumors
2026-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.77153
PMID:42603286
|
研究论文 | 该研究整合单细胞RNA测序、空间转录组学、多重免疫荧光、bulk转录组学、功能实验、异种移植验证和计算病理学,刻画胸腺上皮肿瘤的恶性上皮异质性 | 鉴定出位于恶性状态轨迹起点、富集干性和EMT特征的CDH3相关恶性上皮状态,揭示其与M2巨噬细胞富集的免疫抑制微环境共定位,提出CCN2-LRP1上皮-髓系串扰轴,构建68基因CDH3相关预后特征,并建立可从常规H&E切片预测患者结局的深度学习病理模型 | 摘要未明确说明研究局限性 | 解析胸腺上皮肿瘤中恶性上皮状态与微环境组织,并建立预后预测工具 | 胸腺上皮肿瘤(TETs)患者样本、TCGA-THYM队列、患者来源胸腺癌类器官及异种移植模型 | 数字病理学 | 胸腺上皮肿瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫荧光, bulk转录组学, 功能实验, 异种移植, 计算病理学 | CNN | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 32 | 2026-11-05 |
Danggui Sini Decoction Alleviates Sciatica by Reducing Peripheral Sensitization through Downregulation of Transient Receptor Potential Channels in Dorsal Root Ganglions
2026-Nov, Chinese journal of integrative medicine
IF:2.2Q2
DOI:10.1007/s11655-026-4045-8
PMID:42686949
|
研究论文 | 本文探讨当归四逆汤是否通过下调背根神经节中参与外周敏化的瞬时受体电位通道来缓解坐骨神经痛 | 首次结合mRNA测序和单细胞RNA测序分析,揭示当归四逆汤通过下调TRP通道及炎症因子抑制外周敏化来缓解坐骨神经痛 | 研究仅在大鼠CCI模型中进行,样本量较小,尚未在人体中验证 | 阐明当归四逆汤是否通过下调参与外周敏化的TRP通道来缓解坐骨神经痛 | SD大鼠坐骨神经慢性压迫损伤模型 | 神经药理学 | 坐骨神经痛 | mRNA测序, 单细胞RNA测序, Western blot, ELISA | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 行为学数据 | 64只SD大鼠(第一批32只,第二批32只) | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 33 | 2026-11-05 |
Inhibiting calreticulin palmitoylation enhances the efficacy of elesclomol-CuCl2 on oxaliplatin-triggered immunogenic cell death in pancreatic cancer
2026-Nov, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2026.108459
PMID:42744192
|
研究论文 | 该文开发了elesclomol-CuCl2联合奥沙利铂的优化组合疗法用于诱导胰腺癌免疫原性细胞死亡,并揭示其通过抑制CALR棕榈酰化发挥作用的分子机制 | 首次发现抑制钙网蛋白(CALR)Cys137位点棕榈酰化是L-OHP/ES-CU诱导ICD的关键驱动因素,通过阻断自噬-溶酶体途径降解促进CALR从内质网向膜转位,从而启动ICD信号并重塑肿瘤免疫微环境 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 开发胰腺导管腺癌(PDAC)免疫原性细胞死亡(ICD)的优化联合治疗方案并阐明其核心分子通路 | 人PDAC组织样本及PDAC细胞 | 肿瘤免疫学、空间转录组学、单细胞转录组学 | 胰腺癌 | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据、图像 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 34 | 2026-11-05 |
Kaempferol attenuates type 2 diabetic osteoporosis via METTL3/YTHDF2-regulated PTEN m⁶A methylation and ferritinophagy-ferroptosis inhibition
2026-Nov, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2026.108473
PMID:42759588
|
研究论文 | 该研究通过生物信息学、细胞和动物实验,探讨山奈酚通过METTL3/YTHDF2调控PTEN m⁶A甲基化及抑制铁蛋白自噬-铁死亡改善2型糖尿病骨质疏松的作用与机制 | 首次揭示山奈酚通过METTL3/YTHDF2/PTEN/PI3K/AKT轴抑制铁蛋白自噬依赖性铁死亡来缓解2型糖尿病骨质疏松 | 摘要未明确说明样本量及平台细节,机制验证主要依赖细胞和动物模型,缺乏临床样本验证 | 探究山奈酚治疗2型糖尿病骨质疏松的效果及其通过m⁶A修饰和铁蛋白自噬依赖性铁死亡的分子机制 | 2型糖尿病骨质疏松细胞模型(高糖高脂诱导的BMSCs)和链脲佐菌素加高脂饮食诱导的小鼠T2DOP模型 | 骨代谢疾病与分子药理学 | 2型糖尿病骨质疏松 | 单细胞RNA-seq、网络药理学、分子对接、多种分子生物学实验 | NA | 单细胞RNA-seq数据、细胞实验数据、动物实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 35 | 2026-09-28 |
Corrigendum to "a scRNA-seq-guided gelsolin-functionalized gelatin Methacryloyl platform integrating structural support and immunomodulation for osteoarthritis repair" [Int. J. Biol. Macromol. 381 (2026) 154162 1-16]
2026-Nov, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.154485
PMID:42800764
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 36 | 2026-11-05 |
SIRT1/PGC-1α axis and CPT1A-mediated metabolic reprogramming reshape macrophage polarization to ameliorate intervertebral disc degeneration
2026-Nov, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2026.108433
PMID:42697416
|
研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序、bulk RNA测序和同位素示踪,揭示SIRT1/PGC-1α轴和CPT1A介导的代谢重编程调控巨噬细胞极化,从而改善椎间盘退变 | 首次阐明SIRT1/PGC-1α/CPT1A轴通过代谢重编程(增强OXPHOS和FAO、降低糖酵解)促进巨噬细胞M2极化,从而缓解椎间盘退变,并验证SRT1720和C75的体内治疗效果 | 研究主要基于大鼠穿刺诱导模型,尚未在人类临床样本中验证;scRNA-seq和bulk RNA-seq仅用于探索性分析,机制验证主要依赖体外实验 | 阐明SIRT1/PGC-1α轴和CPT1A介导的代谢重编程如何调控椎间盘退变中的巨噬细胞极化 | 穿刺诱导椎间盘退变大鼠模型及巨噬细胞 | 单细胞组学、代谢组学 | 椎间盘退变、慢性下腰痛 | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、同位素示踪、免疫荧光、Western blot、流式细胞术、慢病毒过表达、基因敲低回补 | NA | 基因表达数据、图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 37 | 2026-11-05 |
Alpha-ketoglutarate ameliorates systemic sclerosis-associated fibrosis by restoring endothelial function
2026-Nov, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2026.109686
PMID:42892459
|
研究论文 | 本文通过靶向代谢组学、单细胞RNA测序和动物模型,揭示α-酮戊二酸通过恢复内皮功能和抑制TGF-β/Smad信号通路来改善系统性硬化症相关纤维化 | 首次发现α-KG在纤维化肺组织和TGF-β刺激的成纤维细胞中 paradoxically 升高;通过单细胞RNA测序意外鉴定内皮细胞而非成纤维细胞是α-KG在纤维化肺中的主要靶细胞;揭示α-KG通过恢复内皮功能、上调eNOS和紧密连接蛋白、抑制TGF-β/Smad激活及逆转代谢抑制来发挥抗纤维化作用 | 研究主要基于博来霉素诱导的小鼠模型和HUVECs体外实验,尚未在SSc患者中进行临床验证;α-KG的具体分子靶点和信号转导机制仍需进一步阐明 | 探究α-酮戊二酸对系统性硬化症相关纤维化的治疗作用及其细胞和分子机制 | 博来霉素诱导的皮肤和肺纤维化小鼠模型、TGF-β刺激的成纤维细胞、博来霉素处理的人脐静脉内皮细胞(HUVECs) | 数字病理学, 机器学习 | 系统性硬化症, 肺纤维化, 皮肤纤维化, 自身免疫性疾病 | 靶向代谢组学, 单细胞RNA测序, 批量转录组测序, 转录组反卷积分析 | NA | 基因表达数据, 代谢组数据, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 38 | 2026-11-05 |
Longitudinal proteomics integrated with multi‑omics reveal molecular drivers of responses to neoadjuvant chemotherapy in rectal cancer
2026-Nov, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2026.109699
PMID:42901338
|
研究论文 | 该研究通过对直肠癌患者治疗前后样本进行纵向4D-DIA蛋白质组学分析,并结合多组学数据和功能验证,揭示了新辅助化疗反应的分子驱动因素 | 首次对直肠癌新辅助化疗进行纵向4D-DIA蛋白质组学分析,整合bulk RNA测序、单细胞转录组学和功能验证,发现RAC2作为预测化疗反应的生物标志物,并揭示其在肿瘤-免疫细胞通讯中的作用 | 部分患者仅有治疗前样本(156例中仅31例有配对治疗前后样本),单细胞分析样本量有限,RAC2的预测性能仍需更大规模独立队列验证 | 揭示局部晚期直肠癌新辅助化疗反应的分子决定因素,寻找预测性生物标志物和治疗靶点 | 局部晚期直肠癌(LARC)患者 | 数字病理学, 多组学, 肿瘤生物学 | 直肠癌 | 4D-DIA蛋白质组学, bulk RNA-seq, 单细胞转录组学 | NA | 蛋白质组数据, 转录组数据, 图像数据 | 156例患者的治疗前后标本,其中31例有配对治疗前后样本 | NA | 4D-DIA蛋白质组学, bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 39 | 2026-11-05 |
Single-Cell Characterization of SPP1-Expressing Macrophages and Their Predicted Interactions With T Cells in the Breast Cancer Bone Metastatic Microenvironment
2026-Nov, Cancer reports (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/cnr2.70732
PMID:42968173
|
研究论文 | 该文整合单细胞RNA测序数据集,系统刻画乳腺癌正常组织、原发灶与骨转移微环境的细胞组成,并预测SPP1表达巨噬细胞与T细胞的相互作用 | 在乳腺癌骨转移微环境中鉴定出高表达SPP1的M2极化巨噬细胞亚群(Mac-SPP1),并预测其通过SPP1-整合素及CD74-MIF/COPA信号轴与CD4-S100A9和CD8-GZMK T细胞亚群相互作用 | 骨转移样本与原发/正常样本来自不同数据集,结果仅为描述性,不能单独归因于转移进展,且需实验验证及在同一研究内同时刻画原发与转移样本的队列中确认 | 系统刻画乳腺癌正常组织、原发肿瘤与骨转移微环境的单细胞特征,并解析巨噬细胞与T细胞亚群之间的预测性相互作用 | 乳腺癌患者的正常组织、原发肿瘤及骨转移样本中的单细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 141056个高质量单细胞(来自GSE266330骨转移数据集与GSE243526原发/正常乳腺数据集) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 40 | 2026-11-05 |
Single-Cell Profiling Reveals a Protective WNT5A-ATF3-FOSB Signaling Axis in Hair Follicle Stem Cells During Androgenetic Alopecia
2026-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.77109
PMID:42584938
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建脱发与非脱发区域头皮毛囊的分子解剖图谱,揭示WNT5A-ATF3-FOSB信号轴在雄激素性脱发中的作用 | 首次在单细胞水平发现雄激素性脱发中毛囊干细胞WNT5A信号沉默导致ATF3及其靶基因FOSB下调,并验证激活该轴可维持毛囊干细胞能力并抑制脱发进展 | 摘要未明确说明样本量及具体实验细节,机制验证主要在小鼠模型中进行,人体治疗转化仍需进一步研究 | 解析雄激素性脱发的分子机制并寻找潜在治疗靶点 | 人类头皮毛囊(脱发区与非脱发区)及雄激素性脱发小鼠模型 | 单细胞组学 | 雄激素性脱发 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |