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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
21 2026-05-20
The Sig27 multigene stratifies breast cancer fatality risk via reflecting tumor-associated immune suppressive features
2026-May-18, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 评估源自前列腺癌的27基因特征集Sig27在乳腺癌中的生物标志物潜力,并揭示其与肿瘤相关免疫抑制特征的关系 首次将Sig27从前列腺癌扩展至乳腺癌及21种癌症类型,证明其通过反映肿瘤免疫抑制微环境来分层致死风险,并建立与PD1/PD-L1抑制剂治疗反应的关联 研究主要基于已有数据集的分析,缺乏独立的前瞻性队列验证,且Sig27在免疫细胞中的功能机制尚未完全阐明 评估Sig27基因特征集在乳腺癌中的预后价值及其对免疫治疗反应的预测能力 乳腺癌肿瘤细胞、肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)、调节性T细胞(Tregs)、耗竭CD8⁺ T细胞(CD8Tex) 自然语言处理 乳腺癌 RNA-seq NA 基因表达数据 13,103例原发性乳腺癌、60例转移灶、780例正常乳腺组织、6,734例批量RNA-seq样本、2,716例乳腺癌 NA 批量RNA-seq NA NA
22 2026-05-20
Identification of metabolism-associated molecular classification and prognostic genes for medulloblastoma based on bioinformatics analysis
2026-May-18, Clinics (Sao Paulo, Brazil)
研究论文 通过生物信息学分析识别髓母细胞瘤的代谢相关分子分类和预后基因 首次基于代谢特征对髓母细胞瘤进行分子分类,补充了现有亚型在代谢视角的表征,并建立了17基因代谢相关预后签名 17基因签名需要额外的多中心验证以确认其临床实用性 探索代谢相关基因在髓母细胞瘤病理生理机制中的作用,并建立基于代谢特征的分子分类和预后模型 髓母细胞瘤样本 机器学习 髓母细胞瘤 RNA-seq, 单细胞RNA-seq 非负矩阵分解聚类 基因表达数据 599个MB样本(训练集400,测试集199),74个验证样本,8个单细胞RNA-seq样本,37个RNA-seq样本 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
23 2026-05-20
From complexity to clarity: aging bone marrow niche in bone and blood regeneration and malignancy
2026-May-18, Bone research IF:14.3Q1
review 综述了骨髓微环境在衰老过程中对骨和血液再生及恶性肿瘤的影响 通过整合高分辨率成像、单细胞和空间转录组学以及体内谱系示踪等新技术,揭示了骨髓微环境内血管和间充质细胞的异质性和可塑性,并提出了衰老骨髓是恶性肿瘤的驱动者还是旁观者这一关键问题 骨髓微环境中间充质和骨系细胞的身份和层级关系、内皮细胞亚群的特化、全身调控的整合以及衰老在恶性肿瘤中的作用仍有待阐明 重新审视骨髓微环境的现有模型,重点关注成骨细胞与特化血管之间的相互作用及其在衰老过程中的失调 骨髓微环境的成骨细胞、血管、造血干细胞、间充质细胞等细胞成分 NA NA 单细胞转录组学、空间转录组学、高分辨率成像、体内谱系示踪 NA NA NA NA 单细胞转录组学, 空间转录组学 NA NA
24 2026-05-20
PMN-MDSCs-derived exosomal S100A9 drives breast cancer progression by enhancing cancer stemness and CXCL5-mediated metastatic potential
2026-May-18, Cell death discovery IF:6.1Q1
研究论文 本文揭示多形核髓源性抑制细胞通过外泌体S100A9激活STAT3-CXCL5-ERK正反馈调节轴,增强乳腺癌干性和转移潜能,促进三阴性乳腺癌进展 首次阐明PMN-MDSCs通过外泌体S100A9激活STAT3-CXCL5-ERK正反馈环路,协同增强乳腺癌细胞干性和转移能力,为靶向肿瘤微环境抑制三阴性乳腺癌进展提供新机制 主要基于小鼠模型和体外实验,临床样本验证规模有限,缺乏体内直接靶向PMN-MDSCs的治疗验证 阐明PMN-MDSCs调控乳腺癌干细胞干性重编程及增强转移潜能的分子机制 小鼠乳腺癌实体瘤组织中的PMN-MDSCs及4T1乳腺癌细胞系 数字病理学 乳腺癌 NGS CNN 图像 小鼠乳腺癌实体瘤组织样本及临床三阴性乳腺癌患者样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
25 2026-05-20
Decoding spatial transcriptomics across multicellular and subcellular resolutions
2026-May-18, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 提出STARS方法,利用Vision Transformer和对比学习,从多细胞和亚细胞分辨率空间转录组数据中重建单细胞水平基因表达 首次实现跨多细胞和亚细胞分辨率空间转录组平台的单细胞水平基因表达重建,结合组织学图像和转录组数据 未明确指出局限性 开发能准确从多细胞和亚细胞分辨率空间转录组数据中分解或聚合信号至单细胞水平的方法 小鼠肺组织、结直肠癌组织中的细胞类型,包括免疫细胞和成纤维细胞等 计算机视觉, 机器学习, 数字病理学 结直肠癌, 流感感染, 细菌继发感染 空间转录组学 Vision Transformer, 对比学习 图像, 转录组数据 小鼠肺组织(3个平台:Visium、Visium HD、Stereo-seq)及额外公共数据集 10x Genomics, BGI 空间转录组学 10x Visium, 10x Visium HD, BGI Stereo-seq 10x Visium多细胞分辨率平台, 10x Visium HD亚细胞分辨率平台, BGI Stereo-seq亚细胞分辨率平台
26 2026-05-20
Durvalumab plus HAIC-FOLFOX followed by maintenance durvalumab for hepatocellular carcinoma with major portal invasion: phase 2 DurHope study
2026-May-18, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 一项单臂二期临床研究评估度伐利尤单抗联合FOLFOX方案肝动脉灌注化疗治疗伴门静脉主干癌栓的肝细胞癌患者的疗效和安全性 首次在Vp4门静脉癌栓患者中评估度伐利尤单抗联合HAIC-FOLFOX的疗效,并通过单细胞RNA测序揭示响应者与非响应者的免疫和耐药差异 单臂设计、样本量较小(30例),探索性生物标志物分析需要更大规模验证 评估度伐利尤单抗联合HAIC-FOLFOX作为伴门静脉主干癌栓肝细胞癌患者一线治疗的效果 伴Vp3/4门静脉癌栓的肝细胞癌患者 机器学习 肝癌 单细胞RNA测序, 免疫组化, 体内模型 NA 转录组数据, 图像数据 30例患者 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞核RNA测序及外周血单细胞RNA测序
27 2026-05-20
Single-cell transcriptomic profiling of patient-derived pancreatic ductal adenocarcinoma primary cell cultures
2026-May-18, Scientific data IF:5.8Q1
研究论文 通过单细胞转录组测序技术对41例胰腺导管腺癌患者来源的原代细胞培养物进行异质性解析,构建可公开访问的转录组数据集 首次采用基于Split Pool连接的转录组测序技术对大量患者来源的胰腺癌细胞系进行高通量单细胞转录组分析,突破传统液滴微流控技术的通量限制 仅基于体外培养细胞系,可能无法完全反映体内肿瘤微环境的影响 解析胰腺导管腺癌的细胞异质性和转录调控程序,为开发单细胞分析计算工具和识别治疗靶点提供数据资源 41例胰腺导管腺癌患者来源的原代细胞培养物 数字病理学 胰腺导管腺癌 单细胞RNA测序(SPLiT-seq) NA 单细胞转录组数据 41例患者来源的细胞培养物 Parse Biosciences 单细胞RNA-seq Evercode技术 基于Split Pool连接的转录组测序技术
28 2026-05-20
Identification of diagnostic and therapeutic roles of programmed cell death-related proteins in dilated cardiomyopathy: a multi-omics and experimental validation study
2026-May-18, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 通过多组学整合分析与实验验证,识别与程序性细胞死亡相关的扩张型心肌病的诊断和治疗分子特征 首次结合批量与单细胞RNA测序数据,利用六种机器学习算法构建基于程序性细胞死亡相关核心基因的预测模型,并鉴定两种具有不同免疫代谢特征的分子亚型 多数转录组数据集代表晚期疾病状态,发现可能反映心脏重塑的共同分子特征而非早期疾病特异性机制 揭示程序性细胞死亡在扩张型心肌病中的诊断和治疗潜力 扩张型心肌病患者和动物模型的心肌组织样本 机器学习 扩张型心肌病 批量RNA测序、单细胞RNA测序、差异基因表达分析、加权基因共表达网络分析、机器学习、分子对接 预测模型 转录组数据 五个独立队列 NA 批量RNA测序,单细胞RNA测序 NA NA
29 2026-05-20
From histology to spatial transcriptomics: establishing a lightweight single-patch baseline
2026-May-18, BMC bioinformatics IF:2.9Q1
研究论文 建立从H&E染色组织学图像预测空间基因表达的轻量级单斑块基线方法,并验证其跨组织泛化能力 首次系统建立了单孤立组织斑块的基因表达预测基线,通过高效架构EfficientNet-B0实现性能与效率的优越权衡,揭示预测准确性主要受H&E组织学中空间自相关强度驱动,而非转录本丰度或化学性质 仅在肝组织和乳腺癌数据集上验证,可能需在更多组织类型和条件下评估泛化性 为空间转录组学模型建立可重复的单斑块预测基线,量化空间上下文、多分辨率集成和模型复杂度对预测的贡献 H&E染色组织学图像和空间转录组数据(包括正常肝组织和乳腺癌组织) 数字病理学 肝癌, 乳腺癌 空间转录组学, H&E染色组织学 EfficientNet-B0, ResNet, DenseNet 图像(H&E染色组织切片), 基因表达数据 肝组织Visium数据集和独立乳腺癌空间转录组数据集 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组平台
30 2026-05-20
ASCL2-mediated macrophage-myofibroblast transition generates immunosuppressive CAF_7 in NSCLC bone metastases
2026-May-18, Journal of experimental & clinical cancer research : CR IF:11.4Q1
研究论文 该研究通过整合单细胞RNA测序、伪时间分析、调节子分析以及体内外实验,揭示ASCL2驱动的巨噬细胞-肌成纤维细胞转化(MMT)生成免疫抑制性CAF_7,促进非小细胞肺癌骨转移的免疫逃逸 首次在非小细胞肺癌骨转移中鉴定出由ASCL2驱动的巨噬细胞-肌成纤维细胞转化(MMT)生成免疫抑制性CAF_7亚群,并阐明其通过直接反式激活Il6ra促进免疫逃逸的机制,同时发现靶向ASCL2可与PD-1阻断疗法协同增强抗肿瘤效果 主要基于小鼠模型和体外实验,骨转移样本数量可能有限;CAF_7在人类患者中的临床相关性及治疗靶点的转化潜力需进一步验证 探究非小细胞肺癌骨转移中肿瘤相关巨噬细胞是否通过MMT生成免疫抑制性CAF亚群及其驱动机制,并评估靶向干预与免疫治疗的协同效应 非小细胞肺癌骨转移样本、小鼠骨转移模型、骨髓来源巨噬细胞、T细胞 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序、伪时间分析、调节子分析、免疫荧光、流式细胞术、体外诱导分化、T细胞共培养、基因敲低/恢复、巨噬细胞耗竭/重建、体内示踪 NA 单细胞转录组数据、图像数据 人原发性肺肿瘤和骨转移样本、小鼠骨转移模型(具体样本量未在摘要中明确) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
31 2026-05-20
Single-cell Sequencing Unveils A Profibrotic Macrophage and Infiltrating Monocyte Niche in the Bronchoalveolar Lavage of Patients with Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2026-May-18, American journal of respiratory and critical care medicine IF:19.3Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序技术,揭示了慢性阻塞性肺疾病患者支气管肺泡灌洗液中促纤维化巨噬细胞和浸润单核细胞微环境 首次在单细胞分辨率下全面解析COPD患者肺泡空间免疫细胞组成差异及其与气流受限严重程度的关系 样本量较小(17名参与者),且未进行功能验证实验 在单细胞水平上表征COPD患者与健康对照者肺泡空间免疫细胞组成差异及其与气流受限严重程度的关系 COPD患者和健康对照者的支气管肺泡灌洗液免疫细胞 单细胞转录组学 慢性阻塞性肺疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 17名参与者(10名COPD患者,7名健康对照),共97,254个细胞 未明确说明 单细胞RNA测序 NA NA
32 2026-05-20
Machine Learning-Based Study on Xin-Pi Simultaneous Treatment Formula via Drug Nanodelivery Systems Regulating Macrophage Polarization and TEAD2/PKM2 Synergistic Repair Strategy in Myocarditis
2026-May-17, SLAS technology IF:2.5Q3
研究论文 利用机器学习与药物纳米递送系统研究心脾同治复方通过调控巨噬细胞极化和TEAD2/PKM2协同修复策略治疗心肌炎的分子机制 首次系统阐明心脾同治复方以纳米载体递送时,通过调控巨噬细胞M1/M2极化平衡和TEAD2/PKM2代谢重编程网络修复心肌炎损伤的分子机制,并结合机器学习筛选核心靶点 研究结果需要在人类队列和临床试验中进一步验证才能进行临床转化 通过机器学习方法系统解析心脾同治复方以纳米载体形式调节心肌炎的分子机制,重点关注巨噬细胞极化和TEAD2/PKM2信号通路 心肌炎小鼠模型 机器学习 心血管疾病 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 代谢组学, 蛋白质组学, 机器学习 随机森林, 支持向量机, XGBoost 基因表达数据, 蛋白质数据, 代谢物数据, 空间表达数据 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
33 2026-05-20
Single-cell analysis reveals IL1B+ macrophages promote lung metastasis in adenoid cystic carcinoma
2026-May-16, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序和批量转录组分析,结合多重免疫组化,揭示了IL1B+肿瘤相关巨噬细胞在腺样囊性癌肺转移中的作用机制 首次鉴定了IL1B TAMs在肺转移中的双重作用:在原发性病灶中促进血管生成和细胞外基质重塑以协助肿瘤细胞入血,在转移灶中通过IL-1R1/ACKR1/SELP轴吸引肿瘤细胞定植,并诱导CD8 T细胞耗竭 小鼠模型与人类患者之间的差异可能影响结论的普适性,机制验证主要基于相关性分析,缺乏直接的因果证据 探索腺样囊性癌肺转移的分子机制,特别是IL1B+肿瘤相关巨噬细胞的作用 腺样囊性癌患者的原发灶和肺转移灶样本,以及携带转移性ACC细胞的小鼠模型 单细胞生物学 腺样囊性癌 单细胞RNA测序,批量转录组分析,多重免疫组化,血浆细胞因子检测 NA 单细胞转录组数据,批量转录组数据,组织切片图像,血浆样本数据 ACC患者原发灶和肺转移灶组织样本(具体数量未在摘要中说明),以及小鼠模型样本 NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA NA
34 2026-05-20
The temporal architecture of the seminiferous epithelial cycle revealed by spatial transcriptomics
2026-May-15, Cell IF:45.5Q1
研究论文 利用seqFISH+空间转录组学技术,对小鼠睾丸细胞进行分析,揭示了生精上皮周期的时空架构,并发现支持细胞的内在周期性程序是维持基线节律的关键,而生殖细胞信号则微调周期以协调精子发生 首次利用空间转录组学技术在单细胞分辨率下绘制生精上皮周期的时空转录图谱,并发现支持细胞本身具有不依赖生殖细胞的内在周期性转录程序 研究主要基于小鼠模型,其发现需在人类或其他物种中验证;且仅对部分基因进行检测,可能遗漏一些重要调控因子 探究哺乳动物精子发生过程中生精上皮周期的时空转录调控机制,特别是支持细胞与生殖细胞之间的相互作用 成年小鼠睾丸组织(正常及生殖细胞耗竭模型:白消安处理、W/W突变小鼠) 空间转录组学、发育生物学 NA seqFISH+空间转录组学 NA 基因表达(转录组)数据、空间位置数据 867,062个小鼠睾丸细胞,2,653个基因 NA 空间转录组学 seqFISH+ 用于高多重空间单细胞基因表达分析的seqFISH+技术
35 2026-05-20
Spatial transcriptomic profiling of developing mouse hearts reveals a spatially patterned signaling environment
2026-May-15, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 利用空间转录组学技术绘制小鼠心脏发育过程中的空间图谱,揭示区域特异性信号环境 首次结合两种空间转录组学平台(10x Visium和Curio Slide-seq)系统分析小鼠胚胎期和新生期心脏的空间信号模式,并整合谱系追踪技术鉴定心外膜细胞衍生细胞及其与微环境细胞的信号互作 未明确提及局限性 解析心脏发育过程中细胞与周围微环境之间的动态信号相互作用 小鼠胚胎期和新生期心脏组织 计算机视觉, 机器学习 心血管疾病 空间转录组学, 谱系追踪, 细胞消融 NA 空间基因表达数据 小鼠心脏组织样本(具体数量未在摘要中说明) 10x Genomics, Curio Bioscience 空间转录组学 10x Visium, Curio Slide-seq 10x Visium用于胚胎期和新生期心脏空间图谱构建,Curio Slide-seq用于心脏传导细胞鉴定
36 2026-05-20
Combination scRNA-seq with GWAS identifies genetic risk factors in IgA nephropathy: An observational study
2026-May-15, Medicine IF:1.3Q2
研究论文 结合单细胞RNA测序与GWAS数据,识别IgA肾病中与巨噬细胞相关的遗传风险因子 首次通过整合单细胞RNA测序与孟德尔随机化分析,系统性地筛选IgA肾病中巨噬细胞亚群相关的潜在风险基因 研究结果基于计算预测,缺乏实验验证,且孟德尔随机化分析为探索性方法,不能提供因果关系的确定性证据 揭示IgA肾病中免疫细胞特异性机制,特别是巨噬细胞异质性在疾病进展中的作用 IgA肾病和慢性肾病患者的肾脏样本中的巨噬细胞亚群 计算生物学 IgA肾病 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析, 批量RNA测序, 分子对接 NA 基因表达数据, GWAS摘要统计 IgA肾病和慢性肾病肾脏样本(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
37 2026-05-20
A tissue-scale strategy for sensing threats in barrier organs
2026-May-14, Cell systems IF:9.0Q1
研究论文 揭示屏障器官通过空间分级表达模式识别受体来感知威胁并调节免疫应答的组织层面策略 首次发现肺部不同细胞类型对流感感染检测概率具有细胞类型特异性,上皮细胞最低而基质细胞最高,并揭示这种差异源于核酸感应PRRs的空间梯度表达 未提及 探究屏障器官如何评估威胁并调整免疫反应以平衡宿主保护与附带损伤 小鼠肺部不同细胞类型(包括上皮细胞和基质细胞) 计算生物学 流感感染 单分子成像、空间转录组学 NA 影像数据、转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
38 2026-05-20
Single-cell analysis identifies a type I interferon-associated neutrophil signature in bacterial meningitis
2026-May-14, Journal of neuroimmunology IF:2.9Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序分析,识别出细菌性脑膜炎中与I型干扰素相关的中性粒细胞特征 首次利用单细胞RNA测序技术构建细菌性脑膜炎小鼠模型中脑膜免疫细胞的转录组图谱,并聚焦于中性粒细胞在稳态和疾病状态下的转录变化,发现I型干扰素刺激基因上调与代谢基因程序下调的特征 仅基于公开数据库的单一数据集分析,且为小鼠模型,缺乏临床样本验证;预测的细胞通讯能力需进一步功能实验确认 阐明细菌性脑膜炎中中性粒细胞的转录组特征及其在脑膜免疫网络中的作用 细菌性脑膜炎小鼠模型的脑膜免疫细胞(重点关注中性粒细胞) 机器学习 细菌性脑膜炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠模型(具体数量未在摘要中明确) NA 单细胞RNA测序 NA 基于公开数据库GSE221681的单细胞RNA测序数据
39 2026-05-20
Longitudinal multiomic and spatial transcriptomic profiling of lupus nephritis progression in a murine model
2026-May-14, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
研究论文 对狼疮肾炎小鼠模型进行纵向多组学和空间转录组学分析,揭示疾病进展的分子机制和空间免疫微环境 首次结合时间序列转录组和空间转录组技术,在LN小鼠模型中绘制了疾病从早期到晚期的阶段特异性分子图谱,并识别了与B细胞和髓系细胞富集相关的空间免疫生态位 研究基于小鼠模型,需在人类LN样本中进一步验证发现的跨物种保守性及其临床相关性 阐明狼疮肾炎进展的分子机制,为早期干预提供潜在靶点 狼疮倾向的New Zealand Black/White F1小鼠肾脏样本 数字病理学 狼疮肾炎 RNA-seq, 空间转录组学 NA 转录组数据, 空间转录组数据 10周、20周和30周龄的狼疮倾向小鼠肾脏样品,每时间点至少3个生物学重复 NA 空间转录组学, 批量RNA-seq NA NA
40 2026-05-20
Eosinophils drive intestinal remodelling and innate defence in reproduction
2026-May-13, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究揭示了嗜酸性粒细胞在生殖过程中驱动肠道重塑并增强先天防御的新机制 首次发现嗜酸性粒细胞在无感染或炎症条件下,在妊娠期至哺乳期积累于小肠,以干细胞内在方式促进杯状细胞分化和黏液产生,从而增强对肠道细菌感染的先天防御 研究主要基于小鼠模型,人类生殖过程中肠道免疫适应的具体机制仍需进一步验证 探究哺乳动物生殖过程中,母体肠道屏障组织的免疫适应机制 母体小肠组织中的嗜酸性粒细胞、肠道干细胞及杯状细胞 机器学习 NA 单细胞转录组学, 空间转录组学, 类器官培养 NA 基因表达数据, 组织图像 小鼠模型,具体样本量未在摘要中说明 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium Single Cell 3' 和 10x Visium 用于小肠组织分析
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