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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-02-26 |
Single-cell transcriptomics unveils the immunologic landscape of anti-PD-1-associated indirect drug-induced liver injury
2026-Feb-25, Journal of gastroenterology
IF:6.9Q1
DOI:10.1007/s00535-026-02370-z
PMID:41739156
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了抗PD-1治疗诱导的间接药物性肝损伤的免疫学机制 | 首次在荷瘤条件下提供了抗PD-1诱导肝损伤小鼠模型中肝脏微环境的单细胞图谱,揭示了代谢重编程和促纤维化表型,并发现NETosis激活与肝损伤进展密切相关 | 研究基于小鼠模型,人类样本验证有限,且机制探索可能未涵盖所有病理因素 | 探究免疫检查点抑制剂(特别是抗PD-1)引起的肝损伤(ILICI)的病理机制 | C57BL/6J小鼠的Lewis肺癌模型及患者肝组织样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型组和对照组,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 22 | 2026-02-26 |
Single-cell transcriptomics reveals heterocellular γ-globin gene expression in Aγδβ-thalassemia
2026-Feb-24, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2025016755
PMID:41733931
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 23 | 2026-02-26 |
Myeloid landscape profiling identifies DLBCL-specific suppressive macrophages colocalized with blood endothelial cells
2026-Feb-24, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2024015689
PMID:41733976
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研究论文 | 本研究通过单细胞技术揭示了弥漫性大B细胞淋巴瘤中肿瘤相关巨噬细胞与血管内皮细胞共活化的特异性模式及其对免疫抑制微环境的影响 | 首次在单细胞水平系统描绘B细胞淋巴瘤中单核吞噬细胞的异质性,并发现DLBCL特异性ANXA1-FPR1/2/S100A9信号轴介导的免疫抑制空间互作 | 研究样本量有限,空间互作机制需进一步功能验证 | 解析B细胞淋巴瘤肿瘤微环境中单核吞噬细胞与血管内皮细胞的相互作用机制 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤和滤泡性淋巴瘤患者的淋巴结组织 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序,质谱流式细胞术,空间成像 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质组数据,空间成像数据 | B细胞淋巴瘤淋巴结与反应性次级淋巴器官样本 | NA | 单细胞RNA-seq,质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 24 | 2026-02-26 |
Single-cell Spatial Transcriptomics Reveals Hepatocyte Reprogramming in Fontan Associated Liver Disease
2026-Feb-24, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.198823
PMID:41734025
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研究论文 | 本研究利用单细胞空间转录组学技术,揭示了Fontan相关肝病中肝细胞的重编程现象,特别是在晚期纤维化阶段 | 首次在FALD中应用单细胞空间转录组学,识别出具有细胞应激和冗余区域基因表达的独特肝细胞亚群,并发现WNT2信号异常驱动肝细胞区域破坏 | 样本量较小(早期和晚期纤维化各1例用于ST分析),且为横断面研究,难以确定因果关系 | 探究Fontan相关肝病的病理生理学机制,特别是肝细胞重编程和纤维化进展 | FALD患者的肝移植组织样本,包括早期和晚期纤维化阶段 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞空间转录组学,免疫荧光染色,原位杂交 | 无监督聚类分析,CellChat分析 | 空间转录组数据,图像数据 | ST分析:2例FALD患者(早期和晚期纤维化各1例);免疫荧光验证:18例FALD组织 | NA | 单细胞空间转录组学 | CosMxTM Spatial Molecular Imaging | 使用6000个基因的原位杂交进行CosMxTM空间分子成像 |
| 25 | 2026-02-26 |
Inflammasome adaptor ASC promotes sustained neuroinflammation and mild cognitive impairment in a closed-head injury model
2026-Feb-24, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI199818
PMID:41734021
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研究论文 | 本研究探讨了炎症小体适配蛋白ASC在轻度闭合性头部损伤模型中如何促进持续性神经炎症和轻度认知障碍 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了ASC在闭合性头部损伤后主要在小胶质细胞簇中选择性表达,并证实其在持续性神经炎症和认知障碍中的关键作用 | 研究基于小鼠模型,结果可能无法完全转化到人类;仅关注了ASC蛋白,其他炎症小体成分的作用未深入探讨 | 探究炎症小体相关基因在闭合性头部损伤模型中的细胞表达和功能意义 | 小鼠闭合性头部损伤模型,特别是皮质组织中的小胶质细胞和星形胶质细胞 | 神经科学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 26 | 2026-02-26 |
In Silico Reconstruction of Primary and Metastatic Tumor Architecture using Geographic Information System-Augmented Spatial Transcriptomics
2026-Feb-24, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-3161
PMID:41734374
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研究论文 | 本研究提出了一种名为GIS-ROTA的计算框架,利用地理信息系统增强的空间转录组学数据,对原发性和转移性肿瘤的架构进行计算机重建 | 开发了一种生物信息学分析框架,首次在识别空间域之前考虑生物学功能,结合通路或细胞类型富集分析与空间自相关测量,直接提供可解释性并减少传统聚类方法的主观性 | NA | 揭示肿瘤微环境中细胞群之间的相互作用、肿瘤异质性及治疗反应的空间功能模式 | 原发性和转移性雌激素受体阳性乳腺癌肿瘤样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 地理信息系统增强的计算重建框架 | 空间转录组学数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | Visium空间转录组学平台 |
| 27 | 2026-02-26 |
Specific depletion of TIGIThigh CD226- clonally expanded intratumoral Tregs defines safe and effective TIGIT targeting
2026-Feb-24, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013636
PMID:41735000
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研究论文 | 本研究通过多组学分析,鉴定出TIGIThigh CD226-克隆扩增的瘤内调节性T细胞是限制TIGIT阻断疗法疗效的主要障碍,并开发了一种能特异性清除该Treg亚群的抗TIGIT抗体,显著提升了抗肿瘤效果 | 首次鉴定出TIGIThigh CD226-克隆扩增的瘤内Tregs是TIGIT阻断疗法的主要障碍,并设计了一种具有增强ADCC活性的抗TIGIT抗体(αTIGIT-IgG1-ADCC)来特异性清除该Treg亚群,从而释放抗肿瘤免疫反应 | 研究主要基于小鼠模型和部分临床样本分析,其结论在更广泛的人类癌症类型和患者群体中的普适性仍需进一步验证 | 旨在克服当前基于TIGIT阻断的癌症免疫疗法临床疗效不足的局限性,开发更有效的治疗策略 | 小鼠肿瘤模型(MC38)、人源化TIGIT敲入小鼠、患者来源的肿瘤浸润淋巴细胞、非小细胞肺癌患者样本 | 免疫学、肿瘤学 | 非小细胞肺癌、癌症 | 单细胞RNA测序、单细胞TCR测序、癌症基因组图谱批量RNA测序、流式细胞术、生物层干涉技术、体外ADCC测定 | NA | 单细胞转录组数据、TCR序列数据、批量RNA-seq数据、流式细胞术数据 | 涉及小鼠模型和患者临床样本,具体数量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞TCR-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 28 | 2026-02-26 |
Male obesity causes adipose mitochondrial dysfunction in F1 mouse progeny via a let-7-DICER axis
2026-Feb-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69686-5
PMID:41735303
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研究论文 | 本研究揭示了父代肥胖通过精子中的let-7 microRNAs影响子代脂肪组织线粒体功能的分子机制 | 首次阐明精子中let-7d/e microRNAs通过靶向DICER1介导父代肥胖代谢表型跨代遗传的机制,并证明该机制在人类中具有保守性 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限;未详细探讨其他潜在的表观遗传调控因子 | 探究父代肥胖对子代代谢健康影响的分子机制 | 小鼠(父代肥胖模型及其F1子代)、人类精液样本 | 表观遗传学 | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序、microRNA微注射、基因表达分析 | 动物模型(小鼠) | 基因表达数据、测序数据 | 小鼠模型及人类精液样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 29 | 2026-02-26 |
A spatial transcriptomics comparison of the adult versus metamorphosed axolotl brain
2026-Feb-24, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-026-06917-w
PMID:41735337
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研究论文 | 本研究使用空间转录组学比较了成年与变态墨西哥钝口螈大脑的细胞类型和分子特征变化 | 首次系统性地比较成年与变态墨西哥钝口螈大脑多个区域的细胞动态和分子机制,揭示了变态过程对大脑细胞类型和分子谱的影响 | 研究仅聚焦于五个代表性大脑区域,可能未覆盖全脑所有变化;样本数量未在摘要中明确说明 | 研究墨西哥钝口螈大脑在成年与变态状态下的细胞动态和分子机制,以理解再生能力与变态过程的关系 | 墨西哥钝口螈(Ambystoma mexicanum)的成年与变态个体大脑 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 30 | 2026-02-26 |
The ubiquitin-proteasome system is an important driver of EBV-associated nasopharyngeal carcinoma progression: a meta-analysis of transcriptomic data
2026-Feb-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-34808-4
PMID:41735356
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荟萃分析 | 本研究通过荟萃分析转录组数据,揭示了泛素-蛋白酶体系统(UPS)在EBV相关鼻咽癌进展中的驱动作用及其与免疫逃逸和不良预后的关联 | 首次在单细胞分辨率下系统性地将EBV-宿主基因相互作用与鼻咽癌转录组数据相结合,并识别出UPS作为关键驱动因素和潜在生物标志物 | NPC数据集样本量较小,UPS高表达细胞的预后关联性仅达到边缘显著水平,需要更大样本的验证和功能研究 | 利用公开数据集识别EBV-宿主基因相互作用,并在单细胞分辨率下重新定位其表达,以探索鼻咽癌的进展机制 | EBV相关的鼻咽癌(NPC) | 生物信息学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),转录组数据分析 | NA | 转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 来自多个公开数据集的样本(具体数量未明确说明,但提及NPC数据集较小) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 31 | 2026-02-26 |
Metabolic quiescence of naive-like memory T cells precedes and maintains antigen-specific T cell memory
2026-Feb-24, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-026-02421-w
PMID:41735532
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研究论文 | 本研究通过流式细胞术和单细胞RNA测序,对黄热病疫苗接种后人类抗原特异性CD8 T细胞进行纵向代谢和表型分析,揭示了代谢静止与长期免疫记忆形成的关键联系 | 首次在体内高分辨率地捕捉了人类抗原特异性CD8 T细胞的纵向代谢动态,并明确了代谢静止的naive样记忆T细胞在长期免疫记忆维持中的核心作用 | 研究主要基于黄热病疫苗模型,结果在其他疫苗或感染模型中的普适性有待验证,且样本时间跨度虽长但样本量可能有限 | 探究人类抗原特异性CD8 T细胞在疫苗接种后的代谢动态及其与长期免疫记忆形成的关系 | 人类抗原特异性CD8 T细胞,特别是黄热病疫苗接种后的CD8 T细胞亚群 | 免疫学 | 传染病 | 流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据,流式细胞术数据 | 黄热病疫苗接种后的人类CD8 T细胞样本,追踪至接种后26年 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 32 | 2026-02-26 |
Unraveling CD4+ T cell heterogeneity and cell death-associated genes in high-grade serous ovarian cancer: a comprehensive analysis of single-cell RNA and spatial transcriptome sequencing
2026-Feb-24, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-026-04266-z
PMID:41735641
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学,深入解析了高级别浆液性卵巢癌中CD4+ T细胞的异质性及其与细胞死亡相关基因的关联 | 首次结合单细胞RNA测序与空间转录组学,系统揭示了HGSOC中CD4+ T细胞的异质性,并构建了基于hdWGCNA的预后模型,同时通过共培养实验验证了MAL基因的功能作用 | 研究样本可能有限,且体外共培养实验可能无法完全模拟体内复杂的肿瘤微环境 | 阐明CD4+ T细胞在高级别浆液性卵巢癌进展中的作用,并识别关键的细胞死亡相关基因 | 高级别浆液性卵巢癌患者样本中的CD4+ T细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, qPCR, Western blotting | inferCNV, 伪时间轨迹分析, SCENIC转录调控网络, hdWGCNA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 独立的高级别浆液性卵巢癌队列 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 33 | 2026-02-26 |
Single-nucleus transcriptomics of an engineered pig model reveals microglia-T cell interactions driving Huntington's disease neurodegeneration
2026-Feb-24, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-026-01621-x
PMID:41735662
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研究论文 | 本研究利用基因工程猪模型,通过单核和空间转录组学技术揭示了亨廷顿病中微胶质细胞与T细胞相互作用驱动神经退行性病变的机制 | 首次在生理相关的大型动物模型中揭示亨廷顿病中微胶质细胞通过分泌趋化因子配体八招募细胞毒性CD8阳性T细胞加速神经元丢失的免疫机制 | 研究主要基于猪模型,其与人类疾病的完全一致性仍需进一步验证,且治疗策略的临床转化潜力有待评估 | 探究免疫细胞浸润在中枢神经系统中的作用及其在亨廷顿病神经退行性病变中的驱动机制 | 携带人类亨廷顿突变(扩展CAG重复序列)的基因工程猪模型的纹状体组织 | 数字病理学 | 亨廷顿病 | 单核转录组学, 空间转录组学, 免疫组织化学, T细胞受体测序 | NA | 转录组数据, 空间表达数据, 免疫染色图像, 序列数据 | NA | NA | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 34 | 2026-02-26 |
CD14 plays a critical role in pain and inflammation across multiple models of post-traumatic osteoarthritis
2026-Feb-24, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70100
PMID:41735778
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研究论文 | 本研究通过基因敲除和抗体阻断方法,在多个人和小鼠骨关节炎模型中验证了CD14在疼痛和炎症中的关键作用 | 首次在多模型、多性别队列中系统验证CD14阻断对骨关节炎疼痛和炎症的改善作用,并结合单细胞转录组学和空间蛋白质组学揭示其作用机制 | 研究主要基于动物模型,人类样本验证相对有限;长期安全性和临床转化效果需进一步验证 | 探究CD14在创伤后骨关节炎疼痛和炎症中的作用机制及治疗潜力 | 人类骨关节炎滑液样本、多种严重程度的小鼠创伤后骨关节炎模型(包括手术和非手术模型) | 数字病理学 | 骨关节炎 | 流式细胞术、单细胞转录组学、空间蛋白质组学、高维转录组和蛋白质组分析 | NA | 分子表达数据、行为学数据、组织病理学数据 | 人类滑液样本及多种小鼠模型(包括不同性别、肥胖因素队列) | NA | 单细胞RNA-seq, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 35 | 2026-02-26 |
Evaluation of statistical differential analysis methods for identification of senescent cells using single-cell transcriptomics
2026-Feb-23, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2025.101264
PMID:41576958
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研究论文 | 本研究系统评估了Seurat包中10种差异基因表达分析方法在单细胞转录组数据中识别衰老细胞的性能 | 首次系统比较了Seurat包中多种DGE方法在单细胞转录组数据中识别衰老细胞的性能,并推荐了最佳方法 | 研究主要基于模拟和真实scRNA-seq数据集,可能未涵盖所有生物场景或技术平台 | 评估单细胞转录组学中差异基因表达分析方法的性能,以识别衰老细胞 | 单细胞RNA测序数据中的衰老细胞 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 36 | 2026-02-26 |
DMC-BrainMap is an open-source, end-to-end tool for multi-feature brain mapping in different species
2026-Feb-23, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101302
PMID:41666930
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研究论文 | 介绍一款名为DMC-BrainMap的开源、端到端工具,用于处理和分析不同物种的脑部解剖数据 | 开发了一款用户友好的开源napari插件,无需编程即可完成从图像预处理到数据分析可视化的全流程脑图谱绘制,支持多种特征映射和跨物种应用 | NA | 为神经科学研究提供一个标准化、易用的脑部解剖数据处理和分析工具 | 小鼠、大鼠和斑马鱼等模式生物的脑部组织学数据 | 数字病理学 | NA | 组织学成像、空间转录组学 | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 37 | 2026-02-26 |
Predictive modeling of molecular activity underlying physical cell-cell interactions
2026-Feb-23, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101301
PMID:41672069
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Gloss的预测建模框架,用于系统地将基因和通路活性与LIPSTIC测量的细胞间相互作用强度联系起来 | Gloss框架在多个数据集和基准测试中优于基于相关性和标准回归方法,同时保持可解释性 | NA | 分析LIPSTIC+scRNA-seq数据,并优先考虑驱动细胞通信的基因和通路 | 小鼠肿瘤中的髓样细胞-T细胞相互作用以及病毒感染期间不同T细胞亚群之间的相互作用 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | group lasso | scRNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 38 | 2026-02-26 |
Distinct mutations in the autoimmune regulator gene differentially affect transcriptional and functional properties of medullary thymic epithelial cells
2026-Feb-23, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddag004
PMID:41686483
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研究论文 | 本研究探讨了自身免疫调节因子基因不同突变对胸腺髓质上皮细胞转录组和功能特性的差异影响 | 通过结合小鼠模型和单细胞RNA测序,揭示了AIRE基因杂合和错义突变对mTEC转录异质性、组织限制性抗原表达及细胞行为的特异性影响 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;突变类型覆盖范围可能不全 | 阐明AIRE基因不同突变如何差异影响胸腺髓质上皮细胞的生物学功能,以深入理解自身免疫多内分泌综合征1型的发病机制 | 胸腺髓质上皮细胞 | 单细胞组学 | 自身免疫多内分泌综合征1型 | 单细胞RNA测序, CRISPR-Cas9基因编辑, 慢病毒表达 | 小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确具体样本数量,但涉及CRISPR-Cas9生成的杂合突变mTECs及野生型mTECs | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 39 | 2026-02-26 |
An integrative spatial multi-omic workflow for unified analysis of tumor tissue
2026-Feb-23, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101306
PMID:41687601
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研究论文 | 本研究提出了一种空间多组学整合工作流,用于统一分析肿瘤组织,结合空间转录组学和空间代谢组学技术 | 开发了SMINT工作流,整合现有和自定义计算工具,实现细胞分割和空间坐标配准,并识别了IDH突变胶质瘤浸润边缘的独特细胞邻域 | 仅使用细胞核分割时仅包含40%的转录本,且未考虑多核细胞的分割场景 | 开发空间多组学整合工作流以分析肿瘤组织 | 弥漫性IDH突变胶质瘤 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | 空间多组学数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | NA |
| 40 | 2026-02-26 |
Single-cell capture of on-ART SIV transcription reveals TGF-β-mediated metabolic control of viral latency
2026-Feb-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.198810
PMID:41729081
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、代谢分析和流式细胞术,探究了TGF-β抑制剂galunisertib如何通过代谢调控影响SIV潜伏感染的机制 | 开发了新型敏感的SIV转录捕获分析(SCAP),用于检测ART治疗期间罕见的病毒转录细胞,并揭示了TGF-β通过代谢抑制调控病毒潜伏的新机制 | 研究样本仅限于SIV感染的猕猴模型,未在人类HIV感染者中进行验证 | 探究TGF-β在SIV潜伏感染中的代谢调控机制 | SIV感染且接受抗逆转录病毒治疗(ART)的猕猴的淋巴结样本 | 单细胞组学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序, 代谢组学, 高维光谱流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 代谢数据, 流式细胞数据 | SIV感染ART治疗的猕猴样本,包含127个检测到SIV表达的细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |