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当前共找到 34820 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 21 | 2026-01-04 |
CellPredX, a computational framework for cross-data type, cross-sample, and cross-protocol cell type annotation through domain adaptation and deep metric learning
2026-Jan, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013824
PMID:41481570
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研究论文 | 本文介绍了CellPredX，一个用于跨数据类型、跨样本和跨协议细胞类型注释的计算框架 | CellPredX通过领域适应和深度度量学习整合异构嵌入，并引入带注意力机制的稀疏中心损失来增强判别性表示，同时提供基于梯度归因的解释模块以提高生物可解释性 | NA | 开发一个统一且可解释的跨模态细胞类型注释框架，以解决单细胞分析中标签转移的挑战 | scRNA-seq和scATAC-seq数据中的细胞类型 | 机器学习 | NA | scRNA-seq, scATAC-seq | 深度学习，领域适应，度量学习 | 单细胞测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, single-cell ATAC-seq | NA | NA |
| 22 | 2026-01-04 |
TDP2 drives immune evasion and metastatic progression in prostate cancer
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0339607
PMID:41481587
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研究论文 | 本研究探讨了TDP2在前列腺癌中通过调节肿瘤微环境促进免疫逃逸和转移进展的作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示TDP2高表达的上皮细胞与髓系细胞、巨噬细胞和成纤维细胞的广泛相互作用，并发现TDP2通过抑制M1巨噬细胞极化和树突状细胞成熟来驱动免疫逃逸 | 未明确说明样本的具体数量或来源，且研究主要基于相关性分析，缺乏直接的体内功能验证 | 探究TDP2在前列腺癌肿瘤微环境调节和疾病进展中的作用 | 前列腺癌患者样本中的上皮细胞、髓系细胞、巨噬细胞、成纤维细胞和CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序，通路富集分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 23 | 2026-01-04 |
A non-invasive urinary diagnostic signature for diabetic kidney disease revealed by machine learning and single-cell analysis
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0340096
PMID:41481634
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研究论文 | 本研究通过整合尿液和肾脏单细胞测序与机器学习，开发了一种用于糖尿病肾病的非侵入性诊断生物标志物 | 首次结合尿液来源细胞的单细胞分析和机器学习，识别出与肾小管损伤相关的三基因生物标志物面板，用于糖尿病肾病的非侵入性诊断 | 研究主要基于公共数据库的转录组数据，需要进一步的前瞻性临床验证以确认其诊断性能 | 开发糖尿病肾病的非侵入性诊断生物标志物 | 糖尿病肾病患者的尿液和肾脏组织 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序，机器学习 | 机器学习模型 | 单细胞转录组数据，批量转录组数据 | 2,089个尿液来源细胞，多个独立队列验证 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 24 | 2026-01-04 |
Mechanistic Insights into Threonine Tyrosine Kinase Mediated Cell Cycle Regulation in Triple-negative Breast Cancer
2026 Jan-Feb, Cancer genomics & proteomics
IF:2.6Q3
DOI:10.21873/cgp.20563
PMID:41482351
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研究论文 | 本研究探讨了苏氨酸酪氨酸激酶（TTK）在三阴性乳腺癌（TNBC）中通过调控细胞周期和Wnt/β-catenin信号通路促进肿瘤进展的机制 | 首次通过单细胞RNA测序和伪时间轨迹分析揭示了TTK在TNBC细胞周期S和G2/M期特异性富集，并阐明其通过维持β-catenin-Cyclin D1信号驱动G1/S和G2/M转换的新机制 | 研究主要基于体外细胞系实验和生物信息学分析，缺乏体内动物模型验证；临床相关性分析依赖于公共数据集，未进行独立队列验证 | 阐明TTK在三阴性乳腺癌发生发展中的分子机制，评估其作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力 | 三阴性乳腺癌细胞系、正常乳腺上皮细胞、公共RNA测序数据集（包括bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq） | 癌症生物学 | 乳腺癌 | RNA测序（包括bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq）、siRNA敲低、细胞增殖/克隆形成/迁移实验、细胞周期分析、免疫荧光、Western blot、功能富集分析、蛋白质互作分析、伪时间轨迹分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、细胞功能数据 | 未明确具体样本数量，使用了TNBC细胞系、正常乳腺上皮细胞和公共RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 25 | 2026-01-04 |
Exosomes Transfer ST6GAL1-mediated Therapeutic Resistance in Rectal Cancer Cells
2026 Jan-Feb, Cancer genomics & proteomics
IF:2.6Q3
DOI:10.21873/cgp.20558
PMID:41482354
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研究论文 | 本研究探讨了外泌体在直肠癌细胞间转移ST6GAL1蛋白，从而导致治疗抵抗的机制 | 首次揭示了外泌体介导的ST6GAL1蛋白转移是直肠癌治疗抵抗的新机制，并发现蛋白活性与mRNA表达存在显著差异 | 研究主要基于细胞系和类器官模型，缺乏体内实验验证；样本量较小（n=4） | 探究直肠癌治疗抵抗的机制，特别是外泌体在转移ST6GAL1蛋白中的作用 | 结直肠癌细胞系、ST6GAL1敲低细胞、结直肠癌类器官 | 癌症生物学 | 直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术 | NA | RNA测序数据、流式细胞术数据 | 4个重复实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 26 | 2026-01-04 |
Roll with the punches: Fibroblast growth factor 10 alleviates pyroptosis of alveolar epithelial cells in different immune niches
2026-Jan, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70569
PMID:41482636
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研究论文 | 本研究揭示了成纤维细胞生长因子10（FGF10）在急性呼吸窘迫综合征（ARDS）中的保护作用，其通过抑制肺泡上皮细胞（AECs）的焦亡来减轻急性肺损伤 | 首次在ARDS患者中发现血清FGF10水平显著降低并与不良预后相关，并阐明了FGF10通过抑制AMPK-RIPK1/caspase-8/caspase-3/GSDME信号通路来阻断不同免疫细胞引发的肺泡上皮细胞焦亡的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外共培养实验，其结论在人体中的直接适用性仍需进一步临床验证 | 探究FGF10在ARDS中的临床相关性及其减轻急性肺损伤的分子机制 | ARDS患者、LPS诱导的急性肺损伤小鼠模型、肺泡上皮细胞、巨噬细胞、中性粒细胞 | 单细胞组学 | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据、临床数据 | ARDS患者（未明确具体数量）、LPS诱导的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 27 | 2026-01-04 |
Integrated Network Pharmacology, Single-Cell Transcriptomics Unveil the Mechanistic Role of Morusin in Aortic Dissection
2026-Jan, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70971
PMID:41482800
|
研究论文 | 本研究通过整合网络药理学、单细胞转录组学和实验验证，揭示了桑黄素通过靶向关键炎症和凋亡通路缓解主动脉夹层进展的多靶点多通路机制 | 首次结合网络药理学、单细胞转录组学与体内外实验，系统阐明桑黄素在主动脉夹层中的细胞类型特异性作用机制 | 研究主要基于动物模型和体外细胞实验，尚未进行临床试验验证 | 阐明桑黄素缓解主动脉夹层进展的分子机制 | 主动脉夹层相关基因、血管平滑肌细胞、BAPN诱导的AD小鼠模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学、网络药理学、分子对接、体外细胞实验、动物模型 | NA | 转录组数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 28 | 2026-01-04 |
Identifying vascular stiffening-sensitive macrophages through integration of single-cell transcriptomics and imaging flow cytometry
2025-Dec-31, Biophysics reports
DOI:10.52601/bpr.2025.240063
PMID:41477484
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学和成像流式细胞术，识别了在血管硬化过程中对细胞外基质刚度敏感的SPP1+巨噬细胞亚群 | 首次结合单细胞转录组学与成像流式细胞术，在动脉硬化模型中系统性地识别并验证了SPP1+巨噬细胞是对细胞外基质刚度敏感的特定免疫细胞亚群 | 研究主要基于小鼠模型和体外培养系统，在人体样本中的验证尚不充分，且未深入探讨SPP1+巨噬细胞促进血管硬化的具体分子机制 | 旨在识别在心血管疾病中响应动脉硬化的特定免疫细胞成分和关键因子 | 硬化颈动脉斑块中的免疫细胞、不同刚度聚丙烯酰胺凝胶上培养的巨噬细胞、急性钙化小鼠模型中的血管组织 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，成像流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 29 | 2026-01-04 |
A competition model of multilineage priming and cell-fate decisions
2025-Dec-31, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116690
PMID:41481416
|
综述 | 本文综述了多谱系启动和细胞命运决策的竞争模型，探讨了祖细胞如何通过基因表达程序的竞争产生多样化的细胞命运 | 提出了集体多能性作为群体自我调节以平衡胚胎发育中所有下游命运产生的新兴状态，并整合了诱导性发育与自主性命运选择模式 | NA | 探讨祖细胞和干细胞如何通过多谱系启动和基因表达程序的竞争性相互作用产生多样化的细胞命运 | 祖细胞、干细胞及其在胚胎发育中的命运决策过程 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组学、克隆谱系追踪、多组学整合 | 竞争模型 | 转录组数据、谱系数据、多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 30 | 2026-01-04 |
Epidermal resident memory T cell fitness requires antigen encounter in the skin
2025-Dec-30, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.107096
PMID:41468295
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研究论文 | 本文研究了表皮驻留记忆T细胞（T）的适应性，发现其在皮肤中遭遇抗原的经历能增强其持久性和增殖能力 | 揭示了抗原在表皮中的遭遇如何通过TGFβ信号通路增强T细胞的持久性和增殖能力，并识别了TGFβRIII的关键作用 | NA | 探讨表皮驻留记忆T细胞适应性的机制，特别是抗原遭遇对其持久性和功能的影响 | 表皮驻留记忆T细胞（T） | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 31 | 2026-01-04 |
Predictive markers for the efficacy of CAR T-cell therapy: the interplay between CAR T-cell fitness and systemic immunity
2025-Dec-23, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2025017873
PMID:41061151
|
综述 | 本文综述了CAR T细胞疗法疗效的预测标志物，重点关注CAR T细胞自身特性与全身免疫状态的相互作用 | 系统性地整合了CAR T细胞内在属性（如记忆亚群、代谢适应性）与全身免疫环境（如炎症因子、免疫抑制微环境）作为预测标志物的最新进展，并强调了单细胞组学和高维分析技术在此领域的应用 | 本文为综述性文章，未报告新的原始实验数据，其结论基于对现有文献的总结，可能受已发表研究的偏倚影响 | 探讨用于预测CAR T细胞疗法疗效和安全性的生物标志物，以优化患者分层和治疗策略 | 复发或难治性淋巴系统恶性肿瘤患者及其接受CAR T细胞治疗的相关生物样本与数据 | 自然语言处理 | 淋巴系统恶性肿瘤 | 单细胞转录组学、全面蛋白质组学分析、细胞因子多功能性检测、高维免疫表型分析 | 机器学习 | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 32 | 2026-01-04 |
Quantum Generative Modeling of Single-Cell transcriptomes: Capturing Gene-Gene and Cell-Cell Interactions
2025-Dec-19, ArXiv
PMID:41281198
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研究论文 | 本文提出了一种基于量子计算的单细胞转录组模拟器qSimCells，利用量子纠缠同时建模基因-基因和细胞-细胞相互作用 | 首次引入量子计算框架，通过参数化量子电路和CNOT门编码非线性基因调控网络和具有明确因果方向的细胞间通讯拓扑，克服了经典方法仅依赖线性相关的局限 | 未明确说明模拟数据规模与真实数据的定量对比指标，且量子计算硬件依赖可能限制实际应用 | 开发能够捕获单细胞转录组数据中非线性依赖关系的高保真模拟方法 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 量子生成模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 33 | 2026-01-04 |
Temporal single-cell analysis reveals age-associated delay in immune resolution after respiratory viral infection
2025-Dec-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.15.694321
PMID:41446064
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和高维流式细胞术，比较了年轻和老年小鼠在流感病毒感染后的肺部免疫反应，揭示了老年宿主中干扰素信号通路异常导致免疫细胞持续存在和慢性免疫病理的机制 | 首次在老年宿主中系统性地结合时间序列单细胞分析，识别出干扰素α/γ信号通路在单核细胞来源巨噬细胞和间质巨噬细胞亚群中的关键作用，并证明抑制该通路可改善长期呼吸结局 | 研究基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类；且主要关注肺部免疫，未全面评估全身性免疫反应 | 阐明老年宿主在急性呼吸道病毒感染后免疫病理增强和肺修复延迟的免疫决定因素 | 年轻和老年小鼠的肺部组织 | 数字病理学 | 呼吸道病毒感染 | 单细胞RNA测序, 高维流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 年轻和老年小鼠的肺部样本（具体数量未在摘要中明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 34 | 2026-01-04 |
Host Genetic Architecture between Epstein-Barr Virus Activity and Multiple Sclerosis Reveals Shared Pathways
2025-Dec-15, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2025.12.11.25342083
PMID:41445616
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研究论文 | 本研究通过开发从全基因组测序数据量化EBV DNA的流程，进行了跨祖先的EBV DNA阳性全基因组关联研究，揭示了EBV活动与多发性硬化症风险之间的遗传和细胞联系 | 开发了从全基因组测序数据量化EBV DNA的新流程，并首次在人群规模队列中进行了跨祖先的EBV DNA阳性GWAS，同时建立了优化的单细胞RNA-seq方法用于EBV检测 | 未明确说明样本的具体临床特征或随访时间，且独立验证队列样本量较小（n=94） | 阐明EBV活动与多发性硬化症之间的宿主遗传机制和细胞通路 | EBV感染、多发性硬化症、宿主遗传变异、B细胞 | 基因组学 | 多发性硬化症 | 全基因组测序、GWAS、qPCR、单细胞RNA-seq、孟德尔随机化分析 | 多基因风险评分、孟德尔随机化 | 基因组数据、单细胞转录组数据 | 617,186名个体（GWAS），94名个体（独立验证队列），以及MS患者和健康个体的单细胞样本 | NA | 全基因组测序，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 35 | 2026-01-04 |
MisTIC: Missegmented Transcript Inference Correction for Improved Spatial Transcriptomics Analysis
2025-Dec-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.11.693759
PMID:41446065
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研究论文 | 本文介绍了一种名为MisTIC的变分贝叶斯模型，用于校正空间转录组学数据中的转录本错误分配问题，以提高分析准确性 | MisTIC模型无需重新分割细胞，即可有效校正转录本错误分配，从而提升下游分析的精度并支持新的研究视角 | NA | 开发一种校正空间转录组学数据中转录本错误分配的方法，以改善细胞类型识别、差异表达分析和细胞间通讯检测 | 空间转录组学数据中的转录本分配错误 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学技术 | 变分贝叶斯模型 | 空间转录组学数据 | NA | 10x Genomics, Vizgen, NanoString | 空间转录组学 | 10X Xenium, MERSCOPE, CosMx | NA |
| 36 | 2026-01-04 |
SEEK-VEC: Robust Latent Structure Discovery via Ensemble Topic Modeling
2025-Dec-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.12.693799
PMID:41427368
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研究论文 | 本文提出了一种名为SEEK-VEC的集成框架，用于通过主题建模发现计数数据中的潜在结构 | SEEK-VEC通过集成多个候选主题模型，利用谱集成程序自动强化信号并减轻噪声，生成数据的共识低维嵌入，从而在信号弱时优于现有方法 | NA | 开发一个鲁棒的集成框架，用于在计数数据中检测潜在结构，以克服标准主题建模方法的限制 | 计数数据，包括自报告的心理病理症状数据、食物偏好问卷和单细胞转录组学数据 | 机器学习 | NA | 主题建模 | 集成主题模型 | 计数数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 37 | 2026-01-04 |
Spatiotemporal Atlas of Heart Development Reveals Blood-Flow-Dependent Cellular, Structural, Metabolic, and Spatial Remodeling
2025-Dec-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.09.693024
PMID:41427371
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研究论文 | 本研究通过扰动鸡胚胎心脏血流，结合单细胞和空间转录组学，构建了血流依赖的心脏发育时空图谱，揭示了血流力学如何重塑心脏组织的细胞、结构和代谢特征 | 首次在胚胎心脏发育中系统整合血流力学扰动与高分辨率空间转录组学，揭示了血流依赖的跨尺度（分子、细胞、结构）重塑机制，并识别了LOX表达心肌细胞等新的血流敏感细胞状态 | 研究基于鸡胚胎模型，其结论在哺乳动物或人类中的普适性需进一步验证；空间转录组分辨率虽高但仍存在技术限制 | 探究血流力学如何调控胚胎心脏的细胞程序、组织结构和代谢适应，阐明血流依赖的发育重塑机制 | 鸡胚胎心脏组织 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 空间转录组数据，单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 38 | 2026-01-04 |
Riemannian Metric Learning for Alignment of Spatial Multiomics
2025-Dec-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.09.693237
PMID:41427348
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研究论文 | 本文提出了一种名为Manifold Gromov-Wasserstein (MGW)的度量学习框架，用于对齐空间多组学数据中的异构模态 | MGW框架利用神经场推断模态特定的黎曼度量，并通过Gromov-Wasserstein最优传输对齐这些度量，实现了无需超参数的成本计算，并具有理论不变性 | 未在摘要中明确提及 | 开发一种能够对齐空间多组学数据中不同模态的方法 | 空间多组学数据，包括转录组、表观基因组、蛋白质组和代谢组等 | 机器学习 | 结直肠癌、肾癌 | 空间转录组学、空间代谢组学 | 神经场 | 空间多模态数据 | 数千个细胞 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | NA |
| 39 | 2026-01-04 |
Protocol for reconstructing spatially aware receptor-TF-target signaling cascades using spatial transcriptomics
2025-Dec-10, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104237
PMID:41385380
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研究论文 | 本文提出了一种使用SpaGRN框架从空间转录组学数据重建空间感知的受体-转录因子-靶标信号级联的协议 | 通过整合细胞外信号和空间依赖性，克服了传统方法忽视空间约束的局限，实现了信号通路的系统映射 | NA | 开发一种从空间转录组学数据推断基因调控网络的方法，特别关注空间约束下的信号级联重建 | 复杂组织（如发育胚胎和肿瘤）中的信号通路 | 空间转录组学 | 肿瘤 | 空间转录组学 | 统计框架（SpaGRN） | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 40 | 2026-01-04 |
Normal cardiac lymphatics and their mimics
2025-Nov-24, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00549.2025
PMID:41285409
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研究论文 | 本研究利用Prox1-tdTomato淋巴报告小鼠，详细描述了小鼠心脏中淋巴管（LyVs）的正常结构和分布模式 | 首次系统性地定义了小鼠心脏不同解剖部位的淋巴管分布，并揭示了淋巴标记物在其他细胞类型中的表达，为心血管疾病研究提供了重要参考 | 研究主要基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类心脏，且样本数量未明确说明 | 明确心脏淋巴管在正常状态下的结构和分布，以促进心血管疾病中淋巴系统功能的研究 | Prox1-tdTomato淋巴报告小鼠的心脏组织 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 光片显微镜、冷冻切片、振动切片、免疫染色、单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 图像、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |