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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-02-05 |
Integrated multicenter single-cell atlas of bladder cancer reveals tumor heterogeneity associated with immunotherapy
2026-Feb-03, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003830
PMID:41632017
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研究论文 | 本研究通过整合多中心单细胞转录组数据,构建了膀胱癌的单细胞图谱,揭示了与免疫治疗相关的肿瘤异质性 | 构建了大规模多中心膀胱癌单细胞图谱,定义了肿瘤间和肿瘤内异质性程序,并发现TGF-β1-PTHLH轴在免疫检查点抑制剂耐药中的作用 | 研究基于回顾性数据整合,需要前瞻性临床验证;单细胞测序技术可能受批次效应影响 | 解析膀胱癌的肿瘤异质性及其对免疫治疗反应的影响 | 膀胱癌患者肿瘤样本 | 单细胞转录组学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序,拷贝数变异分析 | 无监督聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 123个样本,842,127个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 22 | 2026-02-05 |
Single-nucleus multiple-organ chromatin accessibility landscape in the adult rat
2026-Feb-03, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag013
PMID:41632074
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研究论文 | 本研究通过单核ATAC测序技术,构建了成年大鼠多个器官的染色质可及性图谱,识别了77种细胞类型,并分析了细胞类型和器官特异性转录因子、内皮和基质细胞的共享与特异性特征、跨器官巨噬细胞调控状态,以及跨物种基因调控程序的保守性与特异性 | 首次在大鼠模型中生成多器官单核染色质可及性图谱,整合基因活性评分与已知标记基因进行细胞分类,揭示了跨器官和跨物种的调控保守性与特异性 | 研究仅基于大鼠模型,未直接验证功能影响,样本数量相对有限(约110,000个细胞),且依赖于与小鼠转录组图谱的相关性比较 | 解析组织特异性调控逻辑,并推进大鼠模型中跨器官和跨物种的细胞类型注释与功能推断 | 成年大鼠(Rattus norvegicus)的九个器官 | 表观遗传学 | NA | snATAC-seq(单核ATAC测序) | NA | 染色质可及性数据 | 超过110,000个细胞,来自9个器官的25个文库 | NA | 单核ATAC-seq | NA | NA |
| 23 | 2026-02-05 |
Genetic insights into therapeutic targets for gestational diabetes mellitus: a multi-omics analysis
2026-Feb-03, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05053-x
PMID:41632246
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据,识别了妊娠期糖尿病的遗传支持药物靶点 | 结合cis-eQTL、全基因组关联数据、MR、SMR、共定位分析、cis-pQTL MR和scRNA-seq,系统识别GDM的因果基因和细胞类型特异性表达 | 未明确提及样本量或数据来源的具体限制 | 识别妊娠期糖尿病的遗传支持药物靶点,为基于机制的疗法和精准预防策略提供基础 | 妊娠期糖尿病(GDM) | 生物信息学 | 妊娠期糖尿病 | 全基因组关联研究、Mendelian randomization、单细胞RNA测序 | Mendelian randomization、SMR、共定位分析 | 遗传数据、表达数据、蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 24 | 2026-02-05 |
The Transcription Factor TCF21 is Necessary for Adoption of Cell Fates by Foxd1+ Stromal Progenitors during Kidney Development
2026-Feb-03, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00345.2025
PMID:41632505
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和ATAC测序技术,揭示了转录因子TCF21在肾脏发育过程中对Foxd1+基质祖细胞命运决定的关键调控作用 | 首次鉴定TCF21作为肾脏基质细胞身份的关键决定因子,并发现其缺失导致新型Endomucin高表达细胞群的出现及纤维化表型 | 研究主要在小鼠模型中进行,人类肾脏发育中的适用性需进一步验证;长期功能影响仅观察到2个月 | 探究肾脏发育过程中基质祖细胞命运决定的分子机制 | 小鼠胚胎肾脏中的Foxd1+基质祖细胞及其衍生细胞 | 发育生物学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 免疫染色, 组织学分析 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据, 组织图像数据 | 胚胎期14.5天和18.5天的小鼠肾脏细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 25 | 2026-02-05 |
BiCLUM: Bilateral contrastive learning for unpaired single-cell multi-omics integration
2026-Feb-03, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013932
PMID:41632825
|
研究论文 | 本文提出了一种名为BiCLUM的双边对比学习方法,用于整合未配对的单细胞多组学数据 | BiCLUM通过双边对比学习框架,同时实现细胞水平和特征水平的跨模态对齐,并利用先验基因组知识将一种模态(如scATAC-seq)转换到另一种模态(如scRNA-seq)的数据空间 | NA | 整合未配对的单细胞多组学数据,以理解不同分子模态(如RNA表达、染色质可及性和蛋白质丰度)之间的复杂相互作用 | 单细胞多组学数据,包括scRNA-seq、scATAC-seq和CITE-seq等 | 机器学习 | NA | scRNA-seq, scATAC-seq, CITE-seq | 对比学习 | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 26 | 2026-02-05 |
Decoding cytokine networks in ulcerative colitis to identify pathogenic mechanisms and therapeutic targets
2026-Feb-03, Science signaling
IF:6.7Q1
DOI:10.1126/scisignal.adt0986
PMID:41632832
|
研究论文 | 本文通过系统免疫学建模分析溃疡性结肠炎的单细胞转录组数据,构建了复杂的细胞因子信号网络,以揭示疾病发病机制和潜在治疗靶点 | 利用单细胞转录组数据构建细胞因子信号网络,识别了治疗初治患者特有的细胞因子子网络、疾病状态中交互模式改变的细胞因子,以及JAK家族介导的细胞因子-细胞因子相互作用,特别是将TL1A定位为TNF和IL-23A的上游调节因子 | 研究基于体外验证(结肠上皮类器官和固有淋巴样细胞共培养),可能未完全模拟体内复杂环境,且样本来源和数量可能限制普遍性 | 解码溃疡性结肠炎中的细胞因子网络,以识别致病机制和治疗靶点 | 溃疡性结肠炎患者的结肠活检样本,包括治疗初治和治疗暴露患者 | 系统免疫学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞转录组学 | 系统免疫学建模 | 单细胞转录组数据 | 来自溃疡性结肠炎患者的结肠活检样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 27 | 2026-02-05 |
The fetal trophoblast cell marker HLA-G activates a type I interferon response in primary NK cells through the receptor KIR2DL4
2026-Feb-03, Science signaling
IF:6.7Q1
DOI:10.1126/scisignal.adv2400
PMID:41632833
|
研究论文 | 本研究揭示了胎儿滋养层细胞表达的HLA-G通过受体KIR2DL4激活原代NK细胞中的I型干扰素反应,并探讨其在早期妊娠中的作用 | 发现HLA-G通过非经典途径选择性诱导I型干扰素刺激基因(ISGs)的转录,并揭示了KIR2DL4胞质尾端与JAK1结合的新机制 | 研究主要基于体外实验,体内验证和临床相关性需进一步探索 | 探究HLA-G在早期妊娠中如何调节NK细胞的免疫反应 | 原代NK细胞和早期妊娠母胎界面的细胞 | 免疫学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA-seq数据 | 未明确指定样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 28 | 2026-02-05 |
Single-Cell Dissection of Dimethomorph-Induced Neurotoxicity in the Gestational Brain: Metabolic Disruption and Blood-Brain Barrier Dysfunction
2026-Feb-03, Environmental science & technology
IF:10.8Q1
DOI:10.1021/acs.est.5c11595
PMID:41632862
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和代谢组学分析,揭示了杀菌剂二甲吗啉在妊娠小鼠脑组织中诱导神经毒性、代谢重编程和血脑屏障功能障碍的机制 | 首次结合单细胞RNA测序与代谢组学技术,系统解析二甲吗啉在妊娠期大脑中的细胞特异性神经毒性效应及代谢通路异常 | 研究基于小鼠模型,人类直接相关性需进一步验证;未涉及长期暴露效应或剂量反应关系的全面评估 | 探究农药二甲吗啉在妊娠期诱导神经毒性的分子机制及其对母胎健康的风险 | 妊娠小鼠脑组织中的神经细胞(包括小胶质细胞、少突胶质细胞、星形胶质细胞和内皮细胞) | 单细胞组学 | 神经毒性疾病 | 单细胞RNA测序, 代谢组学分析 | NA | 单细胞转录组数据, 代谢物数据 | 妊娠小鼠脑组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 29 | 2026-02-05 |
Happening in the Prostate Tumor Microenvironment: Ion Channels and Extrachromosomal DNA Driving Phenotypic Plasticity
2026-Feb-03, The Prostate
DOI:10.1002/pros.70139
PMID:41632930
|
综述 | 本文综述了离子通道和染色体外DNA在前列腺癌肿瘤微环境中的关键作用,探讨了它们如何驱动肿瘤可塑性、耐药性和疾病进展 | 整合了离子通道生物学和染色体外DNA动力学,并利用公开的单细胞RNA测序数据集分析了它们在肿瘤和基质细胞群中的表达谱,揭示了新的治疗靶点 | 本文是一篇综述,主要基于现有证据和公开数据集的分析,缺乏原创性的实验验证 | 探讨离子通道和染色体外DNA在前列腺癌肿瘤可塑性、耐药性和疾病进展中的作用机制 | 前列腺癌细胞及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个公开的单细胞RNA测序数据集(原发性前列腺癌和去势抵抗性前列腺癌) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 30 | 2026-02-05 |
spRefine denoises and imputes spatial transcriptomics with a reference-free framework powered by genomic language model
2026-Feb-03, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.281001.125
PMID:41633767
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研究论文 | 本文介绍了一种名为spRefine的深度学习框架,利用基因组语言模型对空间转录组数据进行去噪和插补,以解决高噪声和基因测量缺失的问题 | spRefine首次结合基因组语言模型,以无参考框架联合处理空间转录组数据的去噪和插补,提高了数据整合的鲁棒性,并支持模型预训练和新生物信号的发现 | NA | 开发一个深度学习框架来改善空间转录组数据的分析,通过去噪和插补提升数据质量,并探索其在生物信号发现和老化研究中的应用 | 空间转录组数据 | 数字病理学 | 老年疾病 | 空间转录组学 | 深度学习框架, 基因组语言模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 31 | 2026-02-05 |
Targeting RRBP1 reverses immune evasion and enhances immunotherapy efficacy via the CXCL10-CXCR3 axis in bladder cancer
2026-Feb-03, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013809
PMID:41633771
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研究论文 | 本研究探讨了炎症相关基因RRBP1在膀胱癌中调节肿瘤恶性进展和免疫逃逸的作用,并揭示了其通过CXCL10-CXCR3轴增强免疫治疗效果的机制 | 首次将RRBP1鉴定为炎症免疫相关基因,并阐明其通过调控CXCL10-CXCR3轴重塑肿瘤免疫微环境,从而逆转免疫逃逸并增强抗PD-L1治疗疗效 | NA | 探索RRBP1在调节膀胱癌恶性进展和免疫逃逸中的意义,并评估其对免疫治疗疗效的影响 | 膀胱癌 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 转录组学、蛋白质组学、CRISPR Cas9筛选、单细胞RNA测序、多重免疫荧光、流式细胞术、RNA测序 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据、免疫组化图像、流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 32 | 2026-02-05 |
An in vivo and in vitro spatiotemporal profile of human midbrain development
2026-Feb-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67779-1
PMID:41633979
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学分析,比较了人类胎儿中脑发育与体外中脑模型的时空特征,以评估诱导多能干细胞衍生模型的生物学相关性 | 首次整合单细胞和空间转录组学数据,系统比较了胎儿中脑发育与体外中脑模型的时空特征,并利用此框架验证了患者来源中脑类器官在疾病研究中的应用 | 研究主要聚焦于第一和第二孕期的胎儿中脑,未涵盖更晚期或成年阶段,且体外模型的复杂性可能仍有限 | 评估诱导多能干细胞衍生中脑模型在模拟人类中脑发育和疾病方面的相似性与适用性 | 人类胎儿中脑组织(第一和第二孕期)及体外中脑模型(包括脑类器官) | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 组织学图像 | 胎儿中脑组织样本(第一和第二孕期)及体外中脑模型样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 33 | 2026-02-05 |
HCMV infection disrupts barrier functions and promotes epithelial-mesenchymal transition in a cholangiocyte organoid model
2026-Feb-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68962-8
PMID:41634045
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研究论文 | 本研究建立了一个人iPSC来源的胆管细胞类器官模型,用于探究人巨细胞病毒感染如何破坏胆管上皮屏障功能并诱导上皮-间质转化 | 首次建立了可被人巨细胞病毒感染的人iPSC来源胆管细胞类器官模型,揭示了感染通过TGF-β信号通路诱导上皮-间质转化的新机制,并发现了感染具有生产性和潜伏性两种模式 | 研究主要基于体外类器官模型,其在体生理相关性需进一步验证;样本量相对有限 | 探究人巨细胞病毒是否能够直接感染胆管上皮并导致胆管病变的发病机制 | 人iPSC来源的胆管细胞样细胞类器官模型及胆道闭锁患者肝组织 | 数字病理学 | 胆道疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 类器官模型 | 基因表达数据 | 未明确具体数量,涉及人iPSC来源类器官及胆道闭锁患者肝组织 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 34 | 2026-02-05 |
Single-cell transcriptomics identifies fibroblast associated immune heterogeneity and prognostic signatures in bladder cancer
2026-Feb-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-38219-x
PMID:41634289
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 35 | 2026-02-05 |
Integrative analysis of transcriptome and single-cell sequencing combined with experimental validation identifies biomarkers associated with T cell and senescence in sepsis
2026-Feb-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-38559-8
PMID:41634312
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 36 | 2026-02-05 |
YAP1-driven tumor-like cancer-associated fibroblasts modulate biomechanics of pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Feb-03, Journal of gastroenterology
IF:6.9Q1
DOI:10.1007/s00535-026-02346-z
PMID:41634388
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研究论文 | 本研究揭示了YAP1驱动的肿瘤样癌症相关成纤维细胞(tCAFs)在调控胰腺导管腺癌(PDAC)生物力学特性中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定出与高YAP1活性相关的tCAFs亚群,并阐明YAP1介导mCAFs向tCAFs转化及细胞外基质重塑的机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限;YAP1抑制剂与吉西他滨联合疗法的长期疗效和安全性需进一步评估 | 探究YAP1如何通过调控CAFs亚群促进PDAC基质重塑和疾病进展 | 胰腺导管腺癌(PDAC)的癌症相关成纤维细胞(CAFs)亚群、细胞外基质(ECM)和肿瘤生物力学特性 | 单细胞组学与肿瘤微环境 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、磁共振弹性成像(MRE) | KPC小鼠模型 | 单细胞转录组数据、生物力学成像数据 | PDAC患者和小鼠模型的样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 37 | 2026-02-05 |
XBP1-driven proliferative B cell subcluster in Diffuse Large B Cell Lymphoma linked to altered nucleotide metabolism
2026-Feb-03, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-03673-2
PMID:41634749
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别并表征了弥漫性大B细胞淋巴瘤中一个与增殖相关的独特B细胞亚群 | 识别了一个由XBP1驱动的、富集核苷酸代谢和细胞周期通路的增殖性B细胞亚群,并揭示了其与CD8+ T/NK细胞通过特定配体-受体对进行通讯的机制 | 研究依赖于公共数据库GSE182434的现有数据集,可能受限于原始样本的收集和处理方法,且功能验证主要在细胞系中进行 | 旨在解决对弥漫性大B细胞淋巴瘤中B细胞异质性及其对疾病进展功能影响的认识不足问题 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤样本中的细胞,特别是恶性B细胞及其亚群 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序,拷贝数变异分析,细胞间通讯分析,功能富集分析,SCENIC分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 38 | 2026-02-05 |
Single-cell profiling reveals reprogrammed hierarchy and disrupted immune-stromal ecosystem in TP53-mutated AML
2026-Feb-03, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-026-00751-x
PMID:41634865
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了TP53突变急性髓系白血病的重编程细胞层级和紊乱的免疫-基质生态系统 | 首次提供了TP53突变AML的单细胞图谱,揭示了其向粒-单核细胞分化的偏向性、铁死亡抵抗表型以及免疫-基质生态系统的全面失调 | 样本量相对有限(30例患者),且为观察性研究,需进一步功能验证和更大队列验证 | 阐明TP53突变AML的耐药和复发机制 | 30例初诊AML患者的骨髓样本(11例TP53突变,19例TP53野生型) | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 30例初诊AML患者骨髓样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 39 | 2026-02-05 |
Effector Functions of Conventional and Unconventional Mycobacterium tuberculosis (Mtb)-Specific T Cells
2026-Feb-02, Cold Spring Harbor perspectives in medicine
IF:7.8Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a041829
PMID:41184129
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综述 | 本文综述了传统与非传统结核分枝杆菌特异性T细胞的效应功能及其在免疫防御和免疫病理中的作用 | 整合了单细胞和空间转录组学的最新发现,揭示了T细胞亚群的异质性、功能可塑性和空间区隔化,并强调了肺实质组织驻留记忆T细胞作为保护性免疫关键预测因子的新认识 | 作为一篇综述文章,主要基于现有文献进行总结,未提出新的实验数据或验证性研究 | 阐明结核分枝杆菌特异性T细胞的效应功能,并探讨其对疫苗设计策略的启示 | 结核分枝杆菌特异性T细胞,包括CD4 T细胞、CD8 T细胞和非传统T细胞 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞转录组学,空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 40 | 2026-02-05 |
Single-Cell Analysis, Spatial Transcriptomics and Molecular Docking Unveil Potential Therapeutic Targets for Carotid Atherosclerosis
2026-02-02, Balkan medical journal
IF:1.9Q2
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序、空间转录组学和分子对接分析,揭示了颈动脉粥样硬化的细胞亚群、相互作用及潜在治疗靶点 | 整合单细胞测序、空间转录组学和分子对接技术,首次系统解析颈动脉粥样硬化的细胞异质性及区域特异性表达模式 | 研究基于公共数据库的测序数据,缺乏实验验证;样本来源和数量未明确说明 | 解析颈动脉粥样硬化的细胞亚群功能与相互作用,发现潜在治疗靶点 | 颈动脉粥样硬化相关的细胞亚群,包括巨噬细胞、内皮细胞和血管平滑肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序,空间转录组学,分子对接 | NA | 单细胞测序数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |