单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 39013 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-05-03 |
PEBP1 inhibition as a therapeutic target for neurological recovery in ischemic stroke
2026-Apr-30, Neurotherapeutics : the journal of the American Society for Experimental NeuroTherapeutics
IF:5.6Q1
DOI:10.1016/j.neurot.2026.e00912
PMID:42066623
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析，确定PEBP1为缺血性卒中后神经恢复的治疗靶点，并通过实验验证其抑制效果 | 首次结合单细胞转录组学与大规模遗传学数据（孟德尔随机化）系统识别PEBP1为卒中后神经损伤的关键介质，并利用药理学抑制（FerroLOXIN-1）和基因敲低（AAV-BI30介导的shRNA）双重策略验证其治疗潜力 | 潜在脱靶效应需进一步验证；研究仅基于欧洲生物信息学研究所和英国生物银行的数据集，缺乏其他人群（如亚洲人群）的验证；体内模型仅采用大脑中动脉闭塞模型，可能无法完全模拟人类卒中异质性 | 探索缺血性卒中后神经功能恢复的新基因靶点，评估PEBP1抑制的治疗潜力 | 缺血性卒中患者（欧洲人群）、小鼠大脑中动脉闭塞模型、内皮细胞 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序、孟德尔随机化、共定位分析、定量PCR、免疫荧光 | NA | 基因表达数据、遗传变异数据 | 初始数据集：34,593例病例和624,214例对照；验证数据集：86,668例病例和1,503,898例对照；英国生物银行：26,052例病例和487,214例对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 22 | 2026-05-03 |
A conserved re-epithelialization program underlies malignancy in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Apr-30, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2026.03.021
PMID:42066759
|
研究论文 | 利用高分辨率空间转录组学识别胰腺导管腺癌中保守的再上皮化程序MP10，并揭示其在PanIN向PDAC进展中的作用机制 | 首次发现保守的再上皮化程序MP10标记侵袭性胰腺癌细胞，并揭示其与伤口边缘角质细胞再上皮化的相似性，以及FOSL1转录因子在侵袭中的驱动作用 | 未明确提及研究限制，可能包括样本数量有限或机制验证不足 | 探究胰腺导管腺癌从PanIN进展为侵袭性癌症的分子机制 | 人类胰腺导管腺癌组织和小鼠PanIN向PDAC进展模型 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 高分辨率空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 23 | 2026-04-30 |
Characterizing Infiltrating Macrophages in Intracranial Aneurysm with IA Animal Models and Spatial Transcriptomics
2026-Apr-29, Translational stroke research
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s12975-026-01437-6
PMID:42053685
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24 | 2026-05-03 |
GPR124 regulates hyaloid blood vessel regression and is associated with endothelial-mesenchymal transition
2026-Apr-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-50835-1
PMID:42056280
|
研究论文 | 本研究揭示了GPR124在调节玻璃体血管退化中的作用，并发现其与内皮-间质转化相关 | 首次识别GPR124作为玻璃体血管退化的关键调节因子，并发现其通过WNT/β-catenin信号和内皮-间质转化促进血管重塑 | 未明确GPR124下游的具体分子机制，且仅在小鼠模型中验证，缺乏人类数据 | 阐明GPR124在玻璃体血管退化过程中的功能和机制 | 小鼠玻璃体血管内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、免疫染色 | 基因敲除小鼠模型（Gpr124条件性敲除） | 基因表达数据、图像 | 使用他莫昔芬诱导的内皮特异性Gpr124敲除小鼠模型，具体样本量未在摘要中提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序用于分析玻璃体血管内皮细胞 |
| 25 | 2026-05-03 |
scDecorr: feature decorrelation based representation learning enables self-supervised alignment of multiple single-cell experiments
2026-Apr-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-50586-z
PMID:42056283
|
研究论文 | 提出scDecorr框架，利用特征去相关自监督学习实现单细胞RNA测序数据的稳健表示学习和跨批次整合 | 首次将特征去相关自监督学习用于单细胞数据整合，通过最大化扭曲嵌入相似性并去相关化组件来捕获生物信号、消除技术噪声，结合无监督域适应实现跨批次域不变表示 | 未提及具体局限性 | 开发高效的单细胞RNA测序数据表示学习和整合方法，以克服数据稀疏性、高变异性和技术批次效应 | 单细胞RNA测序数据中的细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 自监督学习模型 | 基因表达数据 | 多个单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 26 | 2026-05-03 |
LMCD1 aggravates cardiac fibrosis after myocardial infarction via activating STAT5A
2026-Apr-29, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
DOI:10.1016/j.bbamcr.2026.120153
PMID:42066818
|
研究论文 | 本研究揭示LMCD1通过激活STAT5A加剧心肌梗死后心脏纤维化 | 首次发现LMCD1在心肌梗死后心脏纤维化中的驱动作用，并阐明其通过直接结合并激活STAT5A促进心脏成纤维细胞活化的新机制 | 仅在小鼠模型和体外细胞实验中验证，缺乏临床样本数据支持，且未探讨LMCD1的翻译后修饰调控机制 | 探究LMCD1在心肌梗死后心脏纤维化中的功能及其分子机制 | 小鼠心肌梗死模型及TGF-β1诱导的原代心脏成纤维细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、免疫共沉淀 | NA | 基因表达数据 | 公开的单细胞RNA测序数据集及小鼠组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 公开的单细胞RNA测序数据集 |
| 27 | 2026-05-03 |
LC3B promotes bladder cancer cell proliferation via the Sp1-cyclin D1/p27 axis with pan-cancer clinical associations
2026-Apr-29, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2026.112560
PMID:42066829
|
研究论文 | 揭示LC3B通过Sp1-cyclin D1/p27轴促进膀胱癌细胞增殖及其泛癌临床关联 | 首次阐明LC3B在膀胱癌中非自噬依赖的促增殖功能，通过Sp1介导的cyclin D1转录激活和p27抑制驱动G1/S期转变 | 未具体说明研究局限，但可推断缺乏临床样本验证及治疗应用探索 | 探究LC3B在膀胱癌中的表达模式、生物学功能及其分子机制，并评估其在多种人类癌症中的临床相关性 | 膀胱癌细胞系T24T和J82、单细胞RNA测序数据、泛癌数据集 | 分子生物学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 基因敲除, 体外和体内增殖实验, 泛癌分析, 基因集富集分析 | NA | 单细胞转录组数据, 基因表达数据 | T24T和J82膀胱癌细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 28 | 2026-05-03 |
A NETs-centric multi-omics framework prioritizes PGLYRP1 and MMP9 as subtype-associated thromboinflammatory biomarker candidates and putative therapeutic hypotheses in ischemic stroke
2026-Apr-29, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2026.107422
PMID:42066918
|
研究论文 | 本研究通过多组学策略鉴定缺血性卒中中与NETs相关的亚型特异性血栓炎症生物标志物候选基因和潜在治疗假说 | 首次整合多队列外周血转录组学、机器学习特征选择、孟德尔随机化和单细胞RNA测序等多组学方法，从NETs角度系统解析缺血性卒中亚型特异性血栓炎症模式，并识别出PGLYRP1和MMP9作为候选生物标志物和治疗靶点 | 仍需进一步验证候选生物标志物在更大独立队列中的临床效能，以及候选化合物Naringin的体内治疗潜力 | 鉴定缺血性卒中中NETs相关亚型特异性血栓炎症生物标志物和潜在治疗靶点 | 缺血性卒中患者的外周血样本和单细胞转录组数据 | 机器学习 | 脑血管疾病 | 转录组测序、单细胞RNA测序、分子动力学模拟 | 机器学习特征选择模型 | 转录组数据、单细胞转录组数据 | 多队列缺血性卒中患者，具体样本量未在摘要中明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 29 | 2026-05-03 |
Unraveling the Role of Non-coding RNAs in Parkinson's Disease: Molecular Mechanisms and Therapeutic Insights
2026-Apr-29, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2026.106963
PMID:42067182
|
综述 | 探讨非编码RNA在帕金森病中的作用，包括分子机制和治疗潜力 | 系统总结了miRNA、lncRNA和circRNA在帕金森病发病机制中的多层次调控网络，并强调了单细胞测序和多组学数据在揭示细胞特异性非编码RNA失调中的作用 | 未讨论非编码RNA作为治疗靶点的临床转化挑战和安全性问题 | 阐明非编码RNA在帕金森病中的分子机制并探索其治疗潜力 | 帕金森病相关的非编码RNA，包括miRNA、lncRNA和circRNA | 自然语言处理 | 帕金森病 | NA | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 多组学 | NA | NA |
| 30 | 2026-05-03 |
Alveolar Type 2 Cell Dysfunction Is Associated with Bile Acid Alterations in Experimental Hepatopulmonary Syndrome
2026-Apr-28, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1093/ajrcmb/aanag067
PMID:42048159
|
研究论文 | 本研究通过实验性肝肺综合征模型，发现肺泡2型细胞功能障碍与胆汁酸变化相关 | 首次揭示肝肺综合征中胆汁酸水平升高与AT2细胞功能改变的直接关联，并发现FXR激动剂可恢复AT2细胞功能 | 仅使用小鼠模型，且未完全阐明胆汁酸调控AT2细胞的具体分子机制 | 探究肝肺综合征中肺泡功能障碍的机制，特别是AT2细胞与胆汁酸的关系 | 胆总管结扎小鼠模型中的肺泡2型细胞和胆汁酸 | 数字病理学 | 肝肺综合征 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 质谱胆汁酸分析 | NA | RNA测序数据, 质谱数据 | 胆总管结扎小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 31 | 2026-05-03 |
Immune dysregulation and cellular dysfunction mediate di-n-pentyl phthalate-induced hepatotoxicity: Insights from single-cell RNA sequencing
2026-Apr-28, Food and chemical toxicology : an international journal published for the British Industrial Biological Research Association
IF:3.9Q1
DOI:10.1016/j.fct.2026.116114
PMID:42061636
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序探究邻苯二甲酸二正戊酯（DNPP）诱导肝脏毒性的免疫失调与细胞功能障碍机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术系统揭示DNPP暴露导致肝脏毒性中T-NK细胞、髓系细胞和内皮细胞亚群的显著变化及基因表达下调 | NA | 阐明DNPP诱导肝脏毒性的潜在机制，特别是免疫稳态破坏和细胞功能损伤的作用 | DNPP暴露的小鼠肝脏组织 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | DNPP暴露小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 32 | 2026-05-03 |
GLUL drives metabolic reprogramming and confers docetaxel resistance in prostate cancer
2026-Apr-25, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2026.118008
PMID:42044811
|
研究论文 | 揭示谷氨酸-氨连接酶GLUL驱动前列腺癌代谢重编程并导致多西他赛耐药 | 首次鉴定GLUL作为多西他赛耐药的关键代谢调控因子，并阐明其通过谷氨酰胺代谢重编程协调PI3K-AKT-mTOR信号、糖酵解和氧化磷酸化，形成代谢-信号网络支持化疗耐药 | 研究未具体阐明GLUL在体内其他微环境细胞类型中的作用，且临床样本量有限 | 揭示前列腺癌多西他赛耐药的代谢决定因子 | 临床标本、耐药细胞系、异种移植瘤模型 | 机器学习 | 前列腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 代谢组学 | NA | 转录组数据, 代谢组数据, 单细胞转录组数据 | 多个独立队列的临床标本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 33 | 2026-05-03 |
Single-cell profiling uncovers kaempferol-mediated immunoregulation in the protection against experimental autoimmune hepatitis
2026-Apr-25, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158240
PMID:42066574
|
研究论文 | 利用单细胞分析揭示山奈酚通过免疫调节保护实验性自身免疫性肝炎的机制 | 首次通过单细胞RNA测序和质谱流式技术揭示山奈酚在自身免疫性肝炎中的免疫调节机制，特别是对CD8+记忆T细胞亚群的调控作用 | 未说明具体局限性 | 探究山奈酚缓解自身免疫性肝炎的治疗效果及免疫调节机制 | 山奈酚在ConA诱导的实验性自身免疫性肝炎小鼠模型中的作用 | 单细胞分析 | 自身免疫性肝炎 | 单细胞RNA测序, 质谱流式, 抗体微阵列, 多重免疫荧光 | NA | 文本 | 小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式 | NA | NA |
| 34 | 2026-05-03 |
Correction: Kobayashi et al. Pathogenesis of Graves' Disease Determined Using Single-Cell Sequencing with Thyroid Autoantigen Peptide Stimulation in B Cells. Cells 2025, 14, 1102
2026-Apr-23, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15090751
PMID:42059808
|
更正 | 对Kobayashi等人2025年发表于Cells期刊的关于Graves病发病机制研究的作者名单进行更正，补充遗漏的两位作者Takahiro Tsujikawa和Shigeru Hirano | NA | NA | 更正已发表论文中的作者信息错误 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 35 | 2026-05-03 |
Diabetes-induced TREM2-endothelial cell signaling impairs ischemic vascular repair
2026-Apr-22, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adu3761
PMID:42018669
|
研究论文 | 揭示糖尿病通过TREM2-内皮细胞信号传导损害缺血性血管修复的机制 | 首次通过单细胞RNA测序和空间转录组学绘制人类糖尿病血管图谱，鉴定TREM2-内皮细胞相互作用为糖尿病血管病变的关键驱动因素，并在多种模型中验证其作为潜在治疗靶点的价值 | 未提及具体限制 | 探索糖尿病中内皮细胞和巨噬细胞的异质性如何转化为细胞间相互作用并影响血管功能 | 来自非糖尿病供体和2型糖尿病供体的人类肠系膜动脉，以及链脲佐菌素和高脂高蔗糖饮食诱导的糖尿病后肢缺血小鼠模型 | 数字病理学 | 心血管疾病、糖尿病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 非糖尿病和2型糖尿病供体的人类肠系膜动脉样本；链脲佐菌素和高脂高蔗糖饮食诱导的糖尿病小鼠 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 36 | 2026-05-03 |
An integrated single-cell transcriptomics and explainable AI approach for cancer stemness biomarker discovery in non-small cell lung cancer
2026-Apr-22, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 针对非小细胞肺癌中罕见癌细胞干性状态的识别难题，开发了整合单细胞转录组学与可解释人工智能的检测流程，并发现六个关键生物标志物 | 将单细胞RNA测序与可解释人工智能（SHAP特征归因）结合，克服了传统方法在识别罕见癌细胞干性状态时的局限，并鉴定出DLL1、ITGA6等六个关键候选生物标志物 | 研究仅基于2名患者样本，统计功效有限，但通过效应量验证支持了结果的可靠性 | 开发一种可重复的整合单细胞转录组学与可解释人工智能方法，用于非小细胞肺癌癌细胞干性生物标志物发现 | 非小细胞肺癌中的癌细胞干细胞样上皮细胞 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 逻辑回归，LightGBM，XGBoost，CatBoost | 单细胞转录组数据 | 2名非小细胞肺癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 利用scVI进行批次校正，CellTypist进行细胞注释 |
| 37 | 2026-05-03 |
CAR-M2 immunotherapy resolves renal fibrosis via revascularization and apoptosis of profibrotic Cxcr2+ endothelial cells
2026-Apr-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2026.102698
PMID:41887221
|
研究论文 | 本研究通过可注射水凝胶递送靶向FAP并分泌IL-4的CAR-M2巨噬细胞，通过诱导促纤维化Cxcr2+内皮细胞凋亡和血管再生，有效缓解肾纤维化 | 首次利用CAR-M2免疫疗法靶向纤维化微环境，通过单细胞测序鉴定出与纤维化相关的Cxcr2+内皮细胞亚群并特异性清除，揭示了MMP2激活Rxra触发线粒体自噬的分子机制 | 仅在小鼠模型中验证，缺乏临床数据；CAR-M2的长期安全性和免疫原性未评估；HAMA-CS水凝胶的降解动力学和体内分布需进一步优化 | 开发针对肾纤维化的新型免疫治疗策略，靶向纤维化微环境中的血管稀疏和成纤维细胞活化 | 慢性肾病小鼠模型及肾脏组织中的基质细胞、内皮细胞、巨噬细胞 | 数字病理学 | 肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠肾脏组织样本（具体数量未提供） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 38 | 2026-05-03 |
Multi-omics reveal vitamin D regulation of immune-gut microbiome interactions and tolerogenic pathways in inflammatory bowel disease
2026-Apr-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2026.102703
PMID:41895287
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示维生素D在炎症性肠病中对免疫-肠道微生物组相互作用和耐受性通路的调节作用 | 首次在多组学层面（包括IgA/IgG结合微生物组测序、单细胞RNA测序和免疫组库测序）研究维生素D对IBD患者宿主-微生物免疫互作的影响，发现维生素D通过增强B细胞激活因子信号、改变B细胞受体和T细胞受体克隆型、增加α4β7+调节性B细胞和T细胞来促进免疫耐受 | 该信息在标题和摘要中未明确说明 | 探讨维生素D如何改变IBD患者宿主免疫-肠道微生物组的相互作用 | 炎症性肠病（IBD）患者 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 多组学分析（IgA-seq、IgG-seq、16S rRNA测序、单细胞RNA测序、免疫组库测序） | NA | 序列数据 | 该信息在标题和摘要中未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序, 16S rRNA测序, 免疫组库测序 | NA | NA |
| 39 | 2026-05-03 |
Non-neuronal sites of latency for alphaherpesviruses
2026-04-21, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01723-25
PMID:41910332
|
综述 | 探讨alphaherpesvirus在非神经元细胞中潜伏存在的证据和机制 | 提出alphaherpesvirus在非神经元细胞如扁桃体和淋巴组织中的潜伏存在，突破传统只关注神经元的观念 | 区分真正的潜伏感染与人类alphaherpesvirus中的流产性或持续性感染仍具挑战性 | 理解非神经元储存在疱疹病毒发病机制中的作用 | alphaherpesvirus亚家族成员，包括HSV-1和BoHV-1 | 机器学习 | 心血管疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 40 | 2026-05-03 |
Single-cell spatial transcriptomics reveals tumor microenvironment heterogeneity in primary and lymph node-metastatic small cell lung cancer
2026-Apr-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2026.102713
PMID:41916294
|
研究论文 | 利用单细胞空间转录组学揭示小细胞肺癌原发灶和淋巴结转移灶中肿瘤微环境的异质性 | 首次利用CosMx Spatial Molecular Imager对105例原发和淋巴结转移标本进行单细胞空间转录组分析，构建了超过60万个细胞的高分辨率空间图谱，并发现三种富集于淋巴结转移的恶性亚克隆及其与免疫排斥特征的空间相关性 | 未明确提及局限性，但可能包括样本量有限、缺乏功能验证实验或未探讨其他转移部位 | 阐明小细胞肺癌淋巴结转移中肿瘤微环境的空间细胞生态系统及机制 | 75例小细胞肺癌患者的105个原发肿瘤和淋巴结转移标本 | 数字病理学, 机器学习 | 小细胞肺癌 | 空间转录组学, CosMx Spatial Molecular Imager | NA | 空间转录组数据 | 105个标本，来自75例小细胞肺癌患者，超过60万个细胞 | NanoString Technologies | 空间转录组学 | CosMx Spatial Molecular Imager | CosMx Spatial Molecular Imager单细胞空间转录组学平台 |