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当前共找到 39678 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-05-27 |
Macrophage EHD1 Promotes Inflammation and Stabilizes Sortilin to Accelerate Atherosclerosis
2026-May-21, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.327751
PMID:42165151
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研究论文 | 本研究揭示了巨噬细胞中内吞调控因子EHD1通过促进TNFR2-NF-κB信号通路和稳定Sortilin蛋白加速动脉粥样硬化发展的机制 | 首次发现EHD1通过调节内吞循环和Sortilin稳定性参与动脉粥样硬化进程，为膜运输失调相关治疗策略提供新方向 | 未说明具体研究限制，但可能涉及动物模型与人类临床转化的差异 | 探索内吞调控因子EHD1在巨噬细胞免疫反应中的作用及其对动脉粥样硬化进程的影响 | 小鼠和人类动脉粥样硬化斑块中的巨噬细胞 | NA | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序、免疫荧光染色、骨髓移植、炎症信号通路和胞吞作用分析 | NA | 基因表达数据、组织切片图像 | 涉及Ehd1基因敲除小鼠和野生型小鼠的骨髓移植实验，以及人类斑块样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3'测序平台 |
| 22 | 2026-05-27 |
Concurrent genetic and non-genetic resistance mechanisms to KRAS inhibition in colorectal cancer
2026-May-21, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2026.04.009
PMID:42167227
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研究论文 | 对结直肠癌中KRAS抑制剂的并发遗传和非遗传耐药机制进行了探索，结合靶向外显子组测序和空间转录组学分析患者匹配的活检样本 | 首次揭示KRAS抑制剂耐药中遗传事件与转录适应状态共存，并识别TBK1作为炎症适应阶段的潜在靶点 | 未明确说明样本量大小及长期随访数据，空间分析分辨率可能有限 | 阐明结直肠癌中KRAS抑制剂耐药的分子机制 | 结直肠癌患者匹配的活检样本、人类和小鼠类器官模型 | 机器学习和数字病理学 | 结直肠癌 | 靶向外显子组测序、空间转录组学 | NA | 测序数据和空间转录组数据 | 多个患者匹配活检样本（具体数量未提及）及人类和小鼠类器官模型 | Illumina | 空间转录组学 | Illumina NovaSeq | 靶向外显子组测序和空间转录组学实验 |
| 23 | 2026-05-27 |
DGAT: a dual-graph attention network for inferring spatial protein landscapes from transcriptomics
2026-May-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-73114-z
PMID:42168176
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研究论文 | 提出一种双图注意力网络DGAT，从空间转录组数据推断空间蛋白景观 | 首次利用双图注意力网络整合转录组、蛋白质组和空间信息，从转录组数据中准确推断空间蛋白表达 | 依赖空间转录组和蛋白质组配对数据集进行训练，可能受限于数据可用性 | 开发一种深度学习框架，从空间转录组数据中推断空间蛋白表达，实现蛋白水平的组织解析 | 空间转录组和蛋白质组数据集，包括公开和内部数据集 | 深度学习，空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 双图注意力网络 | 空间基因表达数据，空间蛋白表达数据 | 多个公开和内部数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 24 | 2026-05-27 |
Expanding canonical cortical cell type markers in the era of single-cell transcriptomics
2026-May-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-51501-2
PMID:42168596
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研究论文 | 利用近50万个单核和单细胞转录组数据，系统评估皮层细胞类型标志物的表达保真度和背景表达，并扩展了经典标志物集合 | 首次大规模跨研究量化不同脑区中经典细胞类型标志物的表达保真度和背景表达，提出统计框架整合伪批量分析以识别高保真度、低背景且跨区域表达一致的标志物 | 依赖已有研究的单细胞数据，可能受数据整合偏差影响；未涉及功能验证实验 | 阐明皮层细胞类型经典标志物的表达特征，并提供优化后的标志物资源 | 人类大脑皮层六大主要细胞类型（如神经元、星形胶质细胞等） | 转录组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）, 单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 19个研究，近50万个高质量单核和单细胞表达谱 | 多项（根据19个研究不等，可能包括10x Genomics等） | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | 多项（如10x Chromium等） | 来自19个研究的不同平台配置，具体未说明 |
| 25 | 2026-05-27 |
Enhancing cell type annotation for cancer transcriptomics using retrieval-augmented generation
2026-May-20, Cancer genetics
IF:1.4Q4
DOI:10.1016/j.cancergen.2026.05.002
PMID:42184649
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研究论文 | 本研究开发了一种基于检索增强生成的框架，用于提高癌症转录组学中细胞类型注释的准确性和可重复性 | 提出混合词汇-语义信息检索与本体感知评估的集成方法，结合查询扩展、释义和轻量级重排序来优化语义相关性，并通过细胞本体论确保生物学有效性 | 未提及框架在除人类组织外的其他物种或大规模数据集上的性能，也未讨论计算资源需求 | 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型注释的稳定性和可重复性 | 来自不同人类组织的九个公开单细胞RNA测序数据集 | 自然语言处理 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 检索增强生成模型 | 文本（单细胞基因表达数据及细胞注释结果） | 9个人类组织单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 26 | 2026-05-27 |
ETS1 Orchestrates a Hybrid EMT Program Driving Metastasis and Immune Evasion
2026-May-19, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-3134
PMID:42153907
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析，揭示了ETS1转录因子在驱动上呼吸消化道鳞状细胞癌远端转移和免疫逃逸中的双重作用，并提出HSP90抑制作为潜在治疗策略 | 首次发现ETS1同时调控上皮-间充质转化和免疫微环境，作为双重驱动因子促进肿瘤转移与免疫逃逸，并筛选出HSP90抑制剂作为靶向治疗手段 | 研究主要基于单细胞转录组数据，缺乏多组学验证；体内外模型可能无法完全模拟肿瘤微环境的复杂性 | 探究肿瘤内转录异质性程序在肿瘤转移和免疫逃逸中的作用机制 | 上呼吸消化道鳞状细胞癌肿瘤细胞及患者肿瘤样本 | 数字病理学 | 鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个患者队列的上呼吸消化道鳞状细胞癌肿瘤样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 27 | 2026-05-27 |
Decoding cellular communication networks and signaling pathways in bone, skeletal muscle, and bone-muscle crosstalk through spatial transcriptomics in a young male mouse
2026-May-19, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-026-00520-w
PMID:42156722
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研究论文 | 通过空间转录组学技术解析年轻雄性小鼠骨骼、骨骼肌及骨-肌串扰中的细胞通讯网络和信号通路 | 首次利用空间转录组学（10x Genomics Visium）生成骨骼与肌肉间细胞通讯的全转录组图谱，结合SMART和CellChat计算工具解卷积细胞类型并识别配体-受体相互作用，为骨-肌分子串扰提供新见解 | 未在论文标题和摘要中明确说明 | 解析骨骼与骨骼肌中细胞通讯网络和信号通路的空间组织，以及骨-肌交互作用的分子机制 | 年轻雄性小鼠股骨及邻近骨骼肌组织 | 数字病理学 | 肌少症 | 空间转录组学 | NA | 基因表达图像 | 小鼠样本（具体数量未在摘要中提供） | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Genomics Visium空间转录组学平台 |
| 28 | 2026-05-27 |
Analysis of B cell dynamic changes and pivotal drivers based on single-cell transcriptome of peripheral blood in sepsis
2026-May-16, Blood cells, molecules & diseases
DOI:10.1016/j.bcmd.2026.103009
PMID:42184475
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research paper | 基于外周血单细胞转录组分析脓毒症中B细胞的动态变化及关键驱动因子 | 整合四个GEO数据集进行单细胞B细胞轨迹分析，首次系统鉴定脓毒症中B细胞分化动态及关键命运调控因子，并筛选出六种具有诊断价值的枢纽基因 | 未提及具体限制，可能包括样本量有限、缺乏功能验证或跨种族验证 | 揭示脓毒症中B细胞的动态变化及关键驱动因子，并筛选诊断生物标志物 | 脓毒症患者和健康对照者的外周血B细胞 | 机器学习 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | XGBoost, LASSO | 单细胞转录组数据 | 四个GEO数据集，具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 29 | 2026-05-27 |
The rule of three: structural diversity, differential expression and distinct regulatory output of three MALT paralogues in salmonid fish
2026-May-14, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2026.111397
PMID:42134735
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research paper | 本文研究了虹鳟鱼中三种MALT旁系同源基因的结构多样性、差异表达及其对免疫信号通路的调控作用 | 首次揭示了三种MALT旁系同源基因在鱼类中的组织特异性表达模式、结构差异（Malt3缺少死亡结构域）以及它们对NF-κB信号通路的启动子特异性激活和免疫调控的协同效应 | 研究仅使用CHSE-214细胞作为异源系统进行过表达实验，尚需在生理相关系统中进行进一步验证 | 探索虹鳟鱼中三种MALT旁系同源基因的功能差异及其对先天免疫信号调控的贡献 | 虹鳟鱼三种MALT旁系同源基因（Malt1、Malt2、Malt3） | 免疫学 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 荧光素酶报告基因检测, 过表达实验 | NA | 转录组数据 | 虹鳟鱼组织样本及CHSE-214细胞系 | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | 利用公开的bulk和单细胞RNA-seq数据集进行分析 |
| 30 | 2026-05-27 |
Scalable genotyping in fixed transcriptomes resolves clonal heterogeneity via single-cell sequencing
2026-May-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.11.717967
PMID:41993258
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研究论文 | 介绍了一种名为GIFT的新方法，可在单细胞水平同时检测数百个靶向遗传变异和全转录组图谱 | 核心创新在于利用相邻单链DNA探针间的缺口填充反应对原生转录本序列进行条形码标记，实现高度特异的靶向突变检测，并适用于FFPE组织 | NA | 开发一种可扩展的单细胞基因分型方法，以耦合转录状态与体细胞突变 | 来自35名骨髓增殖性肿瘤患者的超过70万个细胞 | 单细胞基因组学 | 骨髓增殖性肿瘤 | 单细胞RNA-seq, 靶向基因分型 | NA | 单细胞转录组数据 | 35名骨髓增殖性肿瘤患者的超过70万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 31 | 2026-05-27 |
Flow Matching for Count Data
2026-May-08, ArXiv
PMID:42147731
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研究论文 | 提出了一种基于流匹配的计数数据生成框架 count-FM，利用连续时间生灭过程实现高维计数数据在批次或时间点之间的分布映射 | 首次将流匹配框架扩展到计数数据场景，采用连续时间生灭过程与局部单位跳变模拟计数空间中的过渡，实现免模拟训练的条件转移率学习，无需将计数转化为连续空间或分类状态 | 未提及对极大规模计数数据或异常值处理的鲁棒性，可能受限于计算资源需求 | 开发适用于高维计数数据的生成模型，实现无条件生成、分布转移和条件生成任务 | 单细胞RNA测序数据（scRNA-seq）和神经尖峰序列数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 流匹配模型（flow-matching） | 计数数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 32 | 2026-05-27 |
Charting spatial ligand-target activity using Renoir
2026-05-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72388-7
PMID:42086556
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研究论文 | 提出Renoir方法，用于在空间转录组数据中绘制配体-靶基因活性图谱，揭示组织微环境中的细胞间通讯 | 首次实现空间拓扑上配体-靶基因活性映射，能解析特定空间生态位中的配体-下游靶标关系，并识别具有不同配体-靶标相互作用的细胞生态位 | 未提及具体局限性 | 开发一种方法以在空间转录组数据中推断配体对下游靶基因的影响，并识别特定空间生态位中的细胞间相互作用 | 发育到疾病状态的各种空间转录组数据集，包括胎儿肝脏和肝细胞癌组织 | 计算机视觉, 机器学习 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 图像, 文本 | 多个空间转录组数据集，涵盖不同分辨率和发育阶段至疾病状态 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 33 | 2026-05-27 |
Beyond the Cell Atlas: Functional Communities as the Essential Pathologic Units Driving Kidney Disease
2026-May-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000001023
PMID:41563353
|
综述 | 提出“功能社群”作为肾脏疾病核心病理单位的概念框架，并探讨其在空间与多组学技术下的应用前景 | 首次将空间约束的多细胞互作“功能社群”定义为肾脏疾病的根本病理单位，超越传统单细胞图谱，整合人工智能与多组学构建虚拟模型以模拟细胞动态互作 | 尚未提供大规模实证验证，关键技术挑战如空间分辨率、多模态数据整合和虚拟模型的可预测性需进一步解决 | 推动对肾脏疾病病理机制的理解，从离散细胞状态转向多细胞功能社群，以指导新型诊断与治疗策略 | 肾脏疾病的病理微环境，包括三种典型病理社群：适应不良修复微环境、促纤维化微环境和组织破坏性免疫微环境 | 自然语言处理 | 肾脏疾病 | 空间转录组学、多组学技术、人工智能 | NA | NA | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium FFPE |
| 34 | 2026-05-27 |
α -Klotho Promotes Cell Death and Suppresses Inflammation through TNF-Cellular Inhibitor of Apoptosis Protein 1 Signaling in Autosomal Dominant Polycystic Kidney Disease
2026-May-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000940
PMID:41563399
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研究论文 | 该研究发现α-Klotho蛋白在常染色体显性多囊肾病中通过TNF-细胞凋亡抑制蛋白1信号通路促进细胞死亡并抑制炎症 | 首次阐明了α-Klotho在ADPKD中的未知作用和机制，揭示其通过结合并 destabilizing 细胞凋亡抑制蛋白1发挥促凋亡和抗炎功能 | 结果基于Pkd1突变小鼠模型，需要进一步在人类患者样本中验证 | 研究α-Klotho在常染色体显性多囊肾病中的角色和作用机制 | Pkd1突变小鼠以及转α-Klotho基因的Pkd1-HOMO-KLTg小鼠 | 机器学习和数字病理学 | 常染色体显性多囊肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | Pkd1突变小鼠和Pkd1-HOMO-KLTg转基因小鼠的肾脏样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 35 | 2026-05-27 |
Single-cell and spatial transcriptomics identify immune-stromal interactions in cardiac allograft vasculopathy
2026-May, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-026-00813-7
PMID:42151633
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学整合分析，鉴定心脏同种异体移植血管病变（CAV）中免疫-基质细胞相互作用 | 首次在人体冠状动脉中结合单细胞RNA测序和空间转录组学，全面刻画CAV新内膜微环境，并发现IFN信号作为潜在治疗靶点 | 未提及具体局限性 | 阐明心脏同种异体移植血管病变（CAV）的关键细胞和分子机制 | 人体冠状动脉组织和CAV小鼠模型 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 包括CAV、动脉粥样硬化性冠状动脉疾病和非疾病对照的人体冠状动脉组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 单细胞RNA测序和空间转录组学平台，用于分析人体冠状动脉组织 |
| 36 | 2026-05-27 |
Random Projection Methods Outperform Principal Component Analysis for Dimensionality Reduction in Single Cell RNA-Seq
2026 May-Jun, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1177/15578666261436821
PMID:42041160
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研究论文 | 系统比较随机投影方法与主成分分析在单细胞RNA测序降维中的性能 | 提出了一种自适应匹配稀疏随机投影算法，根据输入数据稀疏模式动态调整投影矩阵密度，并在多个公开scRNA-seq数据集上全面比较RP与PCA在聚类质量和局部保持方面的表现 | 未详细说明自适应方法在不同数据规模和噪声水平下的稳健性，且评估仅限于公开数据集 | 评估随机投影方法相对于主成分分析在单细胞RNA测序降维中的计算效率和下游分析效果 | 多个公开的单细胞RNA测序数据集，包含有标签和无标签场景 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 稀疏随机投影、高斯随机投影、自适应匹配稀疏随机投影、层次聚类、球形K均值 | 基因表达数据 | 多个公开scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 37 | 2026-05-27 |
Single-Cell Characterization of Terminal States and State-Specific Transcriptional Regulatory Networks in Hepatocellular Carcinoma
2026-May, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71214
PMID:42186138
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序数据，建立整合细胞命运动态与转录调控网络的框架，揭示肝细胞癌的终末细胞状态及其特异性转录调控网络 | 首次通过整合CellRank命运推断和SCENIC调控网络重建，识别出肝细胞癌的三种终末细胞状态（免疫激活、代谢、增殖型），并阐明其沿分化连续体形成及核心调控因子 | 未提及具体限制 | 探究肝细胞癌肿瘤细胞在命运轨迹中的状态转变及其转录调控机制 | 肝细胞癌肿瘤细胞 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | CellRank, SCENIC | 基因表达数据 | NA（基于公开单细胞RNA测序数据及TCGA-LIHC批量转录组数据） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 38 | 2026-05-27 |
Single-cell transcriptomics reveals lateral transfers of multiple functional genes from prokaryotes to free-living ciliated protists in detrital food webs
2026-May, Marine life science & technology
IF:5.8Q1
DOI:10.1007/s42995-026-00382-5
PMID:42186547
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了自由生活的原生生物在碎屑食物网中通过水平基因转移从原核生物获取多个功能性基因的机制 | 首次在自由生活的厌氧纤毛虫APM类群中基于单细胞转录组进行全基因组水平基因转移筛选，发现63个候选原核水平转移基因，其中多个形成降解复杂有机物的互联通路，并首次记录CPR细菌到真核生物的水平转移事件 | 研究基于有限的数据集（9种APM纤毛虫的36个组学数据集），且候选基因的功能预测主要依赖生物信息学分析，缺乏实验验证 | 探索侧向基因转移在自由生活的原生生物厌氧环境适应中的进化意义和生态角色 | 9种土壤/沉积物中的APM纤毛虫（包括Armophorea、Muranotrichea和Parablepharismea类群） | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 文本 | 36个组学数据集，涵盖9种APM纤毛虫 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 39 | 2026-05-27 |
Exploring the CeRNA landscape in plants: advances, methods, and challenges
2026-Apr-20, TAG. Theoretical and applied genetics. Theoretische und angewandte Genetik
DOI:10.1007/s00122-025-05135-z
PMID:42008014
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综述 | 本文综述了植物中竞争性内源RNA机制的研究进展，探讨了其与动物ceRNA的差异、在应激响应中的作用以及结合前沿技术的研究方法 | 总结了植物ceRNA与动物ceRNA在序列特征、相互作用模式和功能上的关键差异，并提出了结合单细胞测序和空间转录组学等前沿技术与多组学工具的综合研究方法 | 现有生物信息学工具预测准确性有限，且植物复杂组织中的功能验证存在困难 | 揭示植物ceRNA网络的调控机制，填补转录后调控的知识空白，并为作物改良提供新策略 | 植物中的竞争性内源RNA及其调控网络 | 自然语言处理 | NA | 单细胞测序、空间转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 40 | 2026-05-27 |
RAN-S100A10-EGFR axis facilitates papillary thyroid cancer metastasis by PI3K/AKT signaling
2026-Apr-16, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08649-6
PMID:41991927
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研究论文 | 发现了RAN-S100A10-EGFR轴通过PI3K/AKT信号促进甲状腺乳头状癌转移的机制 | 首次揭示S100A10在甲状腺乳头状癌中通过与RAN和EGFR相互作用形成调控轴，激活PI3K/AKT信号并促进上皮-间充质转化（EMT）进而增强转移能力 | 未提及具体的局限性 | 探究S100A10在甲状腺乳头状癌转移中的功能及其具体分子机制 | 甲状腺乳头状癌组织和细胞系 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 蛋白质印迹, 质谱分析, 免疫共沉淀, 免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |