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当前共找到 38805 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-04-28 |
SC-MO-GRN-DB: A comprehensive repository for single-cell multiomic gene regulatory networks
2026-Apr-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115323
PMID:41907425
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研究论文 | 开发了一个包含实验验证基因调控网络和单细胞多组学数据集的综合数据库SC-MO-GRN-DB | 首次整合了单细胞多组学数据与实验验证的基因调控网络，涵盖六种分子模式，为GRN推断方法提供标准化基准 | 未具体说明局限性 | 构建用于开发和验证单细胞多组学基因调控网络推断方法的公共资源库 | 人类和小鼠组织的单细胞多组学数据集及实验验证的基因调控网络 | 机器学习 | NA | scRNA-seq、scATAC-seq、scChIP-seq、scDNA-Met、scHi-C、scCRISPR-seq | NA | 序列数据、表观遗传数据、基因扰动筛选数据 | 超过200万个细胞，来自人类和小鼠组织的六种分子模式数据 | NA | 单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq、单细胞ChIP-seq、单细胞DNA甲基化、单细胞Hi-C、单细胞CRISPR-seq | NA | NA |
| 22 | 2026-04-28 |
KRT15 identified by scRNA-Seq and machine learning as stemness regulator and prognostic biomarker in ESCC
2026-Apr-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115020
PMID:41907411
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和机器学习鉴定KRT15作为食管鳞状细胞癌干性调控因子和预后生物标志物 | 首次结合单细胞测序和机器学习算法筛选出干细胞样亚群特异性标志物KRT15，并通过功能实验验证其在食管鳞状细胞癌中的干性和侵袭性调控作用 | 未提及具体局限性，但可能包括需要更多临床样本验证、机制研究不深入或缺乏体内实验验证 | 识别食管鳞状细胞癌中与干性相关的关键分子并评估其预后价值 | 食管鳞状细胞癌细胞中的肿瘤干细胞样亚群 | 机器学习, 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法（具体模型未指定） | 单细胞测序数据 | 未明确说明样本数量 | 未指定 | 单细胞RNA测序 | 未指定 | 未指定 |
| 23 | 2026-04-28 |
Single-cell transcriptomic analyses reveal angiogenic vascular responses to chronic cerebral hypoperfusion
2026-Apr-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115331
PMID:41907427
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示慢性脑低灌注引起的血管新生反应 | 首次在慢性脑低灌注模型中鉴定出尖端内皮细胞亚型，并阐明Apln/Aplnr信号通路在血管新生中的作用 | 仅在小鼠模型中进行验证，缺乏人类样本的数据支持 | 阐明慢性脑低灌注后血管损伤与修复的细胞和分子机制 | 接受不对称颈总动脉狭窄诱导的慢性脑低灌注的小鼠脑组织 | 单细胞转录组学 | 血管性认知障碍与痴呆 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠脑组织样本（具体数量未提及） | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 24 | 2026-04-28 |
Universal Nanovial Screening Enables Functional Discovery of Metabolite-Reactive T-Cell Receptors for Cancer Therapy
2026-Apr-16, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c22721
PMID:41990155
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研究论文 | 开发基于纳米小瓶的功能筛选平台，用于从人类血液中非常规T细胞高通量发现代谢物反应性T细胞受体 | 首次实现基于纳米技术的“功能优先”筛选策略，结合纳米小瓶、MR1或CD1d分子标记、细胞因子捕获抗体和分泌编码单细胞测序，高通量发现非常规T细胞的TCR及其功能关联 | NA | 开发高通量功能筛选平台，发现非常规T细胞的TCR用于癌症治疗 | 人类血液中非常规T细胞（包括黏膜相关恒定T细胞MAIT和恒定自然杀伤T细胞iNKT） | 单细胞测序 | 癌症 | 单细胞测序，纳米小瓶筛选 | NA | 单细胞测序数据 | 人类血液样本中分离的稀有MAIT和iNKT细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 功能筛选 | 纳米小瓶 | 基于纳米小瓶的MR1/CD1d分子和细胞因子捕获抗体标记平台，结合分泌编码单细胞测序 |
| 25 | 2026-04-28 |
A Counterfactual Framework for Directional Cell-Cell Interaction Analysis in Spatial Transcriptomics
2026-Apr-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.05.716510
PMID:42005861
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研究论文 | 提出一种基于反事实推理的定向细胞间相互作用分析方法，用于空间转录组学 | 首次引入反事实干预框架，不依赖配体-受体对，直接测试细胞间影响的定向性和发送细胞特异性 | 未明确提及，但可能依赖于空间转录组数据的质量和样本数量 | 开发一种统计上严格且可扩展的方法，用于空间转录组学中定向细胞间通信分析 | 胆管癌组织微阵列（38个核心）中的肿瘤、免疫和基质细胞 | 数字病理学 | 胆管癌 | 空间转录组学 | 图模型（邻域条件图模型） | 空间基因表达数据 | 38个胆管癌组织微阵列核心 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | Xenium空间转录组平台 |
| 26 | 2026-04-28 |
Reconstructing biologically coherent cellular profiles from imaging-based spatial transcriptomics
2026-Apr-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.08.710395
PMID:41959255
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研究论文 | 提出了TRACER方法，通过基因一致性和空间共定位优化成像空间转录组学中的细胞表示，无需外部注释或参考图谱 | 利用数据直接观察到的基因-基因一致性和转录本空间共定位来精炼细胞表示，无需外部标注或参考图谱 | 未明确提及局限性 | 解决成像空间转录组学中细胞分割导致的混合细胞图谱和未检测细胞核缺失问题 | 成像空间转录组学数据中的细胞图谱 | 数字病理学 | NA | 成像空间转录组学 | NA | 图像、空间转录组数据 | 跨多种平台、组织和分割方法的样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 27 | 2026-04-28 |
Heterogeneity and clinical relevance of group 2 innate lymphoid cells subsets in nasal polyps
2026-Apr-07, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2026.03.021
PMID:41956382
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研究论文 | 该研究探讨了鼻息肉中2型固有淋巴样细胞亚群的异质性及其临床相关性 | 首次在鼻息肉中鉴定出四个具有不同激活状态的ILC2亚群，并揭示其与临床严重程度的关联 | 未提供明确的局限性信息 | 探究鼻息肉中ILC2亚群的异质性及其与临床严重程度的关系 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者的鼻息肉组织和外周血样本 | 机器学习和数字病理学 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞数据 | 6份鼻息肉组织和4份外周血样本用于单细胞测序 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 28 | 2026-04-28 |
Integrative transcriptomics defines CD36 as a key regulator of immunometabolic signaling in acute myeloid leukemia
2026-Apr, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-025-01728-6
PMID:41489721
|
研究论文 | 整合转录组学定义了CD36作为急性髓系白血病免疫代谢信号的关键调节因子 | 通过整合批量转录组学、单细胞RNA测序和空间转录组学，首次揭示CD36在急性髓系白血病免疫代谢网络中的中心调控作用，并利用结直肠癌空间转录组学验证了巨噬细胞共定位 | 需要进一步的体外和体内综合验证 | 研究CD36作为免疫代谢介质在急性髓系白血病发病机制中的调控作用 | 急性髓系白血病细胞系及临床样本 | 机器学习 | 急性髓系白血病 | RNA测序，单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 转录组数据，单细胞转录组数据，空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 10x Chromium，10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序，10x Visium空间转录组学（结直肠癌样本） |
| 29 | 2026-04-28 |
A comprehensive benchmarking study on computational tools for cross-omics label transfer from single-cell RNA to ATAC data
2026-04-01, G3 (Bethesda, Md.)
DOI:10.1093/g3journal/jkag026
PMID:41655240
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研究论文 | 对27种从单细胞RNA到ATAC数据的跨组学标签转移计算方法进行全面的基准测试研究 | 首次系统评估跨单细胞RNA和ATAC数据的标签转移工具，发现Bridge和GLUE在不同条件下的最佳表现，并探讨数据不平衡、数据二值化等对模型性能的影响 | 研究依赖于现有公开数据集，可能未涵盖所有组织类型和物种；基准测试中未评估工具的可解释性 | 评估并比较不同计算工具在单细胞RNA到ATAC数据标签转移中的性能，为方法开发提供建议 | 人类和小鼠多种组织中的单细胞RNA和ATAC数据 | 机器学习 | NA | scRNA-seq, scATAC-seq | Bridge, GLUE, bindSC等 | 单细胞基因表达和染色质开放性数据 | 多种人类和小鼠组织样本，具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 30 | 2026-04-28 |
Developing a Single-Cell Spatial Transcriptomics Workflow for In Vivo Evaluation of Implanted Biomaterials
2026-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202513242
PMID:41691505
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研究论文 | 为Xenium平台开发单细胞空间转录组学工作流程，用于评估植入生物材料的小鼠体内反应，揭示巨噬细胞和成纤维细胞在支架中的空间异质性 | 首次将高分辨率空间转录组学Xenium平台用于生物材料体内评估，通过空间分析检测到传统组织学无法识别的细胞动态转变 | NA | 开发适用于Xenium平台的生物信息学工作流程，分析植入材料引发的体内细胞反应，为生物材料的合理设计提供依据 | 皮下植入电纺聚己内酯（PCL）支架的小鼠模型 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 小鼠皮下植入支架样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | Xenium空间转录组学平台 |
| 31 | 2026-04-28 |
Multi-omics analyses of the Alviniconcha holobiont reveal multi-faceted adaptations to deep-sea hydrothermal vents
2026-04, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-025-3148-0
PMID:41692943
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研究论文 | 通过多组学分析揭示了深海热液喷口Alviniconcha蜗牛全生物体多方面适应机制 | 首次提供了两种Alviniconcha蜗牛的染色体水平基因组，并整合空间转录组学揭示了鳃丝功能分区 | 未提及 | 研究深海热液喷口中Alviniconcha全生物体的分子和生理适应机制 | Alviniconcha adamantis和Alviniconcha marisindica两种蜗牛及其共生菌 | 基因组学、空间转录组学 | NA | 染色体级别基因组组装、空间转录组学 | NA | 基因组序列、空间转录组数据 | 两种Alviniconcha蜗牛物种 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 32 | 2026-04-28 |
Single-Cell Profiling Reveals Distinct Immune Communication Networks in Centenarians and Elderly Controls
2026-Apr, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70486
PMID:41979395
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研究论文 | 通过单细胞转录组学分析，揭示了百岁老人及其后代与老年对照者之间不同的免疫细胞通讯网络，鉴定出与健康衰老相关的免疫重塑模式 | 首次在单细胞水平上系统比较百岁老人、其后代和老年对照者的免疫细胞间通讯网络，发现健康衰老个体中由IL-15和IL-18等正调控因子介导的配体-受体相互作用增强，与效应免疫细胞毒性和免疫监视能力提高一致 | 仅分析外周血单个核细胞的免疫通讯，未涉及其他组织或器官；跨种族或跨队列的验证有限 | 探究免疫细胞间通讯在健康衰老和极端长寿中的变化及其机制 | 百岁老人、其子女以及老年对照者的外周血单个核细胞 | 机器学习 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 表达数据 | 包含百岁老人、其子女和老年对照者共多个样本的PBMC单细胞转录组数据 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒 |
| 33 | 2026-04-28 |
LAML-Pro: Joint Maximum Likelihood Inference of Cell Genotypes and Cell Lineage Trees
2026-Mar-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.27.714879
PMID:41959070
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研究论文 | 提出一种名为LAML-Pro的算法，能够联合推断细胞基因型和细胞谱系树，以克服现有两步法因基因型错误导致谱系树不准确的问题 | 提出基于概率混合型缺失观测（PMMO）模型的联合推断方法，利用状态转移的稀疏性在数千个细胞中快速构建谱系树，并纠正基因型错误 | 仅适用于基于成像的谱系追踪数据，对新一代测序数据适用性未明确说明 | 开发一种能够从动态谱系追踪数据中同时推断细胞基因型和谱系树的算法，以提高谱系重建的准确性 | 模拟数据以及两种基于成像的谱系追踪系统产生的实验数据 | 机器学习 | NA | 基因组编辑诱导突变、单细胞成像 | PMMO（概率混合型缺失观测模型）、最大似然估计 | 成像数据（荧光成像）、模拟基因型数据 | 模拟数据中数千个细胞；实验数据中两种成像谱系追踪系统的样本 | NA | 单细胞成像 | NA | NA |
| 34 | 2026-04-28 |
Intercellular communication is a heritable dimension of human tissue architecture
2026-Mar-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.29.715138
PMID:41959167
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研究论文 | 本研究提出EdgeMap方法，整合空间转录组学与GWAS摘要统计，将性状遗传力分解为细胞内在和细胞间组成部分，并解析细胞间信号为特定配体-受体通道 | 首次将遗传效应定位到细胞间分子界面，建立细胞间通讯作为遗传架构的可遗传维度 | 未明确说明限制 | 探究细胞间通讯在组织架构中的遗传性及其对疾病风险的贡献 | 17种人类性状和5种人体组织 | 机器学习 | 双相情感障碍、心血管疾病、肝脏疾病 | 空间转录组学、GWAS摘要统计 | EdgeMap | 空间转录组数据 | 多种组织切片及独立GWAS队列 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium HD | 细胞分割的Visium HD |
| 35 | 2026-04-28 |
The Human Male Mammary Gland has Similar Epithelial Populations to Female but Distinct Composition and Transcriptional Properties
2026-Mar-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.27.714915
PMID:41959192
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研究论文 | 论文通过单细胞RNA测序描绘了正常成人男性乳腺的细胞图谱，发现其与女性乳腺具有相同的上皮细胞类型，但组成和转录特性不同 | 首次以单细胞分辨率描述正常男性乳腺的细胞和转录特征，揭示了男性乳腺中管腔成熟细胞比例增加、基底细胞和管腔祖细胞减少的特异性组成，以及区别于女性的基因表达、RNA加工、炎症信号和雌激素受体通路活性差异 | 未提及具体局限性 | 填补正常男性乳腺单细胞层面表征的空白，为男性乳腺癌的细胞基础提供参考 | 正常成人乳腺组织样本（来自3名男性和14名女性捐赠者） | 数字病理学, 机器学习 | 男性乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 17名捐赠者（3名男性、14名女性），共174471个细胞（含18117个男性来源细胞） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'转录组测序 |
| 36 | 2026-04-28 |
High-dimensional multiomics reveals perturbations to IL-6/IL-6R axis and RUNX3 in CD4+ T cells during third trimester pregnancy
2026-Mar-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.26.711478
PMID:41959409
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研究论文 | 通过高维多组学分析揭示妊娠晚期CD4+ T细胞中IL-6/IL-6R轴和RUNX3的扰动 | 首次结合流式细胞术筛选>350个表面蛋白和单细胞RNA测序（含>130种CITE-seq条形码抗体）系统分析妊娠期CD4+ T细胞的表面蛋白组和转录组变化 | 研究对象仅限于足月妊娠（>37周）样本，未包含早产或整个妊娠周期的纵向数据 | 理解妊娠期CD4+ T细胞表面蛋白质组和转录组的分子变化及其免疫调节机制 | 正常妊娠女性血液和蜕膜中的CD4+ T细胞，以及非妊娠女性血液中的CD4+ T细胞 | 免疫学 | 妊娠相关疾病 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序, CITE-seq | NA | 蛋白质表达数据, 基因表达数据 | 足月妊娠（>37周）女性的血液和蜕膜样本，以及非妊娠女性的血液样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 结合CITE-seq抗体标记 |
| 37 | 2026-04-28 |
CosMxScope: Scalable Reconstruction and Digital Pathology Integration of Imaging-Based Spatial Transcriptomics Data
2026-Mar-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.25.713520
PMID:41959506
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研究论文 | CosMxScope是一个轻量级开源Python框架，用于重建成像型空间转录组学数据并与数字病理学工具整合 | 将CosMx空间分子成像仪数据与广泛使用的数字病理学环境（如QuPath）桥接，提供FOV图像拼接、细胞分割多边形和转录坐标转换为GeoJSON对象的功能，促进空间转录组学与病理学分析工作流的结合 | 该框架专为CosMx SMI平台设计，可能不适用于其他空间转录组学平台 | 开发一个实用的工具，实现空间转录组学数据与数字病理学可视化环境的交互式探索和整合 | 人类和小鼠组织的CosMx空间分子成像数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像和转录坐标 | 多个正在进行的研究项目涉及人类和小鼠组织 | NA | 空间转录组学 | CosMx Spatial Molecular Imager | CosMx空间分子成像仪，用于单细胞空间多组学分析，可测量每个细胞数千个RNA或蛋白质靶标 |
| 38 | 2026-04-28 |
Bulliform cells: anatomical, physiological, genetic, and computational perspectives on plants' drought adaptation
2026-Mar-19, Planta
IF:3.6Q1
DOI:10.1007/s00425-026-04984-2
PMID:41857245
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review | 本综述从解剖学、生理学、遗传学和计算学角度综合探讨了泡状细胞在植物干旱适应中的作用 | 提出了多组学、系统生物学和AI驱动建模的综合框架，用于预测泡状细胞行为以优化作物抗逆性 | 对泡状细胞在复合非生物胁迫下的响应机制以及水分保持与叶片热调节之间的生理权衡的理解仍存在显著知识空白 | 整合泡状细胞的结构、功能和调控知识，推动抗胁迫作物品种的开发 | 泡状细胞（禾本科叶片上的特化表皮运动细胞） | machine learning | NA | 单细胞转录组学、全基因组关联分析、QTL定位 | NA | 图像、转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | 高分辨率成像、单细胞转录组学技术 |
| 39 | 2026-04-28 |
Dynamic and cell-type specific transcriptional reprogramming underlies the floral transition in the maize shoot apical meristem
2026-Mar-18, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04033-x
PMID:41851888
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研究论文 | 通过整合时间序列RNA-seq、单细胞转录组学、染色质可及性和转录因子结合谱，构建了玉米茎尖分生组织开花转变的时空分子框架 | 首次在单细胞分辨率下揭示了玉米开花转变过程中细胞类型特异性转录重编程的协调作用，并鉴定出ZmMADS69-ZmRap2.7-ZMM4调控模块及UNBRANCHED2/UNBRANCHED3的新角色 | 未明确提及 | 解析玉米茎尖分生组织开花转变过程中全局和细胞类型特异性转录重编程的分子机制 | 玉米茎尖分生组织中的细胞 | 机器学习和数字病理学 | 不适用 | RNA-seq, 单细胞转录组学, ATAC-seq, 转录因子结合谱分析 | 不适用 | RNA序列数据, 染色质可及性数据, 转录因子结合数据 | 未明确提及 | 不适用 | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | 不适用 | 不适用 |
| 40 | 2026-03-20 |
Single-cell RNA sequencing uncovers neutrophil clusters associated with autoimmune neuroinflammation
2026-Mar-18, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-026-03772-9
PMID:41851894
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |