单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 42726 篇文献,本页显示第 21 - 40 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
21 2026-08-23
Bile extracellular vesicles for early cholangiocarcinoma detection in primary sclerosing cholangitis
2026-Aug-21, JHEP reports : innovation in hepatology IF:9.5Q1
研究论文 本研究探讨了胆汁来源的细胞外囊泡作为液体活检来源,用于原发性硬化性胆管炎中胆管癌的早期检测,并识别出具有诊断和预测价值的蛋白质生物标志物。 首次在胆汁细胞外囊泡中鉴定出能区分原发性硬化性胆管炎伴胆管癌与单纯原发性硬化性胆管炎的蛋白质标志物,并开发了结合CA19-9的机器学习模型,以及能提前预测胆管癌发生的蛋白质组合。 研究为探索性研究,样本量有限,且预测模型仅在内部验证,需在更大规模的独立队列中进行外部验证。 评估胆汁细胞外囊泡蛋白质生物标志物在原发性硬化性胆管炎患者中早期诊断和预测胆管癌的潜力。 原发性硬化性胆管炎患者、原发性硬化性胆管炎伴胆管癌患者,以及后来发展为胆管癌的原发性硬化性胆管炎患者。 蛋白质组学 胆管癌、原发性硬化性胆管炎 质谱分析、单细胞RNA测序、ELISA 机器学习模型(逻辑回归) 胆汁样本、血清样本、蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据 共74份胆汁样本,包括52份来自原发性硬化性胆管炎患者,14份来自原发性硬化性胆管炎伴胆管癌患者,8份来自后来发展为胆管癌的患者。 NA 单细胞RNA测序 NA NA
22 2026-08-23
Environmental Endocrine Disruptors Activate CBX2 to Disrupt Cholesterol Homeostasis in PCOS
2026-Aug-21, The Journal of steroid biochemistry and molecular biology IF:2.7Q3
研究论文 该研究通过建立来曲唑诱导的PCOS大鼠模型,整合bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq及功能验证,揭示环境内分泌干扰物通过激活CBX2并通过H3K27me3表观遗传沉默破坏胆固醇稳态,从而促进PCOS发病的机制 首次发现环境内分泌干扰物(BPA和DDT)通过激活CBX2并介导H3K27me3表观遗传沉默,解偶联颗粒细胞增殖与代谢支持功能,建立了EDC-CBX2-H3K27me3表观遗传轴,并提出CBX2作为环境相关PCOS的分子标志物和治疗靶点 研究主要基于大鼠模型和体外细胞实验,缺乏体内人体验证;样本量可能有限;CBX2作为治疗靶点的临床转化潜力需进一步验证 阐明环境内分泌干扰物通过表观遗传机制连接PCOS发病的分子机制,并寻找关键调控因子和潜在治疗靶点 来曲唑诱导的PCOS样大鼠模型、人颗粒细胞(GCs) 表观遗传学、转录组学 多囊卵巢综合征 bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、ChIP-seq、功能验证(如基因敲低) 大鼠模型、细胞模型 转录组数据、表观基因组数据、图像(如脂滴) 大鼠模型(未明确数量)、人颗粒细胞样本(未明确数量) NA bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、ChIP-seq NA NA
23 2026-08-23
PGAM5-mediated VDAC1 oligomerization Facilitates Ponatinib-Induced Cardiotoxicity via Disrupting the Mitophagy-Mitochondrial unfolded protein response Synergistic Defense Crosstalk
2026-Aug-21, Chemico-biological interactions IF:4.7Q1
研究论文 本研究探讨了PGAM5介导的VDAC1寡聚化通过干扰线粒体自噬与线粒体未折叠蛋白反应的协同防御串扰,促进普纳替尼诱发的心脏毒性 首次揭示PGAM5/VDAC1轴作为上游应激感应机制,将普纳替尼暴露转化为线粒体质量控制崩溃,从而介导心脏损伤 研究主要基于小鼠模型和细胞实验,临床相关性需进一步验证 探究PGAM5/VDAC1轴是否通过协调破坏线粒体自噬和UPRmt来介导普纳替尼诱发的心脏损伤 心肌细胞特异性PGAM5敲除小鼠、乳鼠心肌细胞、HL-1细胞 病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 基因敲除小鼠模型 单细胞转录组数据、图像、基因表达数据 小鼠和细胞样本,具体数量未提供 NA 单细胞RNA测序 NA NA
24 2026-08-23
Retraction notice to "the molecular structure of SHISA5 protein and its novel role in primary biliary cholangitis: From single-cell RNA sequencing to biomarkers" [Int. J. Biol. Macromol. 296 (2025) 139775]
2026-Aug-21, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
25 2026-08-23
Combining in vitro and in silico approaches to model neural tube patterning and isthmic organizer formation
2026-Aug-21, NPJ systems biology and applications IF:3.5Q1
研究论文 整合体外实验与计算模型,利用单细胞RNA测序数据模拟神经管模式形成及峡部组织者形成 通过将计算模型嵌入3D几何结构,揭示瞬时形态发生素信号如何诱导不可逆模式,并准确捕捉中后脑边界峡部组织者的形成与维持 基于体外模拟数据,可能无法完全反映体内复杂环境,且文章未提及具体局限性 理解人类神经管早期发育中细胞身份的空间区域化机制,以及形态发生素梯度的基因调控响应 人类神经管模式形成的体外模拟及计算模型 计算生物学 NA 单细胞RNA测序 计算模型 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
26 2026-08-23
Maternal sleep deprivation reshapes offspring hippocampal development through a Trem2-centered microglial program revealed by single-nucleus and spatial transcriptomics
2026-Aug-21, Molecular psychiatry IF:9.6Q1
研究论文 该研究结合单核RNA测序和空间转录组学,揭示母体睡眠剥夺通过以Trem2为中心的小胶质细胞程序重塑后代海马发育,并导致长期认知和行为异常 首次跨生命阶段绘制母体睡眠剥夺后代海马细胞图谱,发现Trem2相关小胶质细胞状态的重编程,并通过AAV介导的Trem2恢复验证其功能 未明确提及局限性,但可能包括样本仅限于大鼠模型,以及Trem2恢复治疗效果的长期性和广泛性需进一步验证 探究母体晚期妊娠睡眠剥夺对后代海马发育的影响机制,特别是Trem2相关小胶质细胞程序的作用 大鼠母体及其后代(出生后第1、7、14和56天)的海马组织 神经科学、转录组学 神经发育障碍、神经精神疾病 单核RNA测序、空间转录组学、AAV介导的基因恢复技术、行为学测试、电生理记录 NA 基因表达数据、空间转录数据、行为数据、电生理数据 实验涉及大鼠母体和后代,在多个时间点(P1、P7、P14、P56)进行分析,具体样本量未在摘要中明确 NA 单核RNA-seq、空间转录组学 NA NA
27 2026-08-23
Epithelial interferon-stimulated gene programs modulate chemotherapy sensitivity in colorectal cancer via EPSTI1
2026-Aug-21, Oncogene IF:6.9Q1
研究论文 本研究整合结直肠癌患者来源肿瘤类器官的基因组、转录组和体外药物反应数据,结合功能实验,发现上皮干扰素刺激基因程序通过EPSTI1调节化疗敏感性 NA NA 阐明结直肠癌中上皮细胞内在机制如何影响化疗反应的异质性 结直肠癌患者来源的肿瘤类器官以及接受新辅助化疗前后的肿瘤组织 基因组学、转录组学、功能基因组学 结直肠癌 基因组测序、转录组测序、单细胞RNA测序、体外药物反应分析、功能实验 肿瘤类器官模型、细胞系模型、基因敲减模型 基因组数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据、药物反应数据、功能实验数据 结直肠癌患者来源的肿瘤类器官及肿瘤组织样本,具体数量未在摘要中说明 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 用于单细胞RNA测序分析结直肠癌新辅助化疗前后的肿瘤组织
28 2026-08-23
The landscape mapping of single-cell sequencing in the research progression and hotspots of liver cancer based on systematical analysis
2026-Aug-21, Medicine IF:1.3Q2
研究论文 通过系统分析,描绘了单细胞测序技术在肝癌研究中的进展与热点图谱 运用文献计量学方法对单细胞测序在肝癌领域的研究进行知识图谱分析,揭示了该领域的研究热点和趋势 未明确提及局限性 绘制单细胞测序在肝癌研究中的研究水平、研究热点和进展趋势图谱 2017年至2024年3月间发表的相关文章 文献计量学 肝癌 单细胞测序 NA 文献数据 379篇文章 NA NA NA NA
29 2026-08-23
Exploring and validating hub genes associated with atopic dermatitis through weighted gene co-expression network analysis and machine learning
2026-Aug-21, Medicine IF:1.3Q2
研究论文 利用加权基因共表达网络分析和机器学习方法,识别并验证特应性皮炎的关键枢纽基因及其致病机制 整合差异表达分析与加权基因共表达网络,结合机器学习算法筛选出6个新的枢纽基因,并通过单细胞RNA测序和独立队列验证其表达失调 结论基于公共数据库的生物信息学分析,缺乏湿实验验证及不同人群的临床样本支持 识别特应性皮炎的新生物标志物,并探讨其发病机制,为治疗提供潜在靶点 特应性皮炎相关的基因表达数据集和候选枢纽基因 机器学习 特应性皮炎 基因表达微阵列、单细胞RNA测序 加权基因共表达网络分析、最小绝对收缩和选择算子、支持向量机递归特征消除 基因表达数据、单细胞转录组数据 从基因表达综合数据库获取7个特应性皮炎数据集,包含多个样本(具体数量未说明) NA 基因表达微阵列、单细胞RNA测序 NA NA
30 2026-08-23
EXPRESS: Harnessing Single-Cell Gene Regulatory Networks for Precision Health
2026-Aug-21, Journal of investigative medicine : the official publication of the American Federation for Clinical Research IF:2.5Q3
综述 本文探讨了利用单细胞基因调控网络促进精准健康的研究现状,重点介绍了通过单细胞转录组数据构建基因调控网络以推进临床应用的进展。 聚焦于从单细胞转录组数据构建基因调控网络并将其转化为精准健康实践,提出将生物学网络方法用于临床应用的整合视角。 未明确列出,但提及了数据分析和实际应用中的关键挑战。 探讨单细胞RNA测序技术及基因调控网络在精准健康中的应用潜力,并分析面临的主要挑战。 单细胞转录组数据和基因调控网络 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 基因调控网络 转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
31 2026-08-21
Single-cell sequencing identifies characteristics of disease and bone marrow in concurrent multiple myeloma and myelodysplastic syndrome
2026-Aug-20, Chinese medical journal IF:7.5Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
32 2026-08-23
Single-cell multiomics reveals exosome-mediated reprogramming and clonotypic remodeling of T cells in triple-negative breast cancer
2026-Aug-20, Signal transduction and targeted therapy IF:40.8Q1
研究论文 本研究利用单细胞多组学分析探讨了来自三阴性乳腺癌细胞系和患者样本的外泌体对T细胞可塑性和克隆型重塑的免疫调节作用 首次结合单细胞RNA-seq、V(D)J测序、非编码RNA谱分析及功能分析,系统揭示三阴性乳腺癌外泌体诱导T细胞亚群偏移、克隆型扩增及特定miRNA介导的免疫抑制机制 未提供明确的局限性描述 阐明三阴性乳腺癌外泌体对人T细胞可塑性和抗原特异性的直接影响及免疫调节机制 三阴性乳腺癌外泌体处理的原代人T细胞 单细胞多组学 三阴性乳腺癌 单细胞RNA-seq、V(D)J测序、非编码RNA谱分析、单细胞及常规细胞因子分析 NA 单细胞转录组、免疫组库序列、miRNA表达、细胞因子谱 17种三阴性乳腺癌细胞系和35份患者样本 NA 单细胞RNA-seq、单细胞V(D)J测序、非编码RNA测序 NA NA
33 2026-08-23
MLL1 Regulates T-Cell Phenotype via Notch Signaling During Abdominal Aortic Aneurysm Development
2026-Aug-20, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 本研究探讨MLL1通过Notch信号通路调控T细胞表型在腹主动脉瘤发展中的作用,发现MLL1通过表观遗传调控Notch1信号促进Th17极化,从而加剧动脉瘤形成 首次揭示MLL1通过表观遗传调控Notch1信号通路驱动Th17细胞极化在腹主动脉瘤发展中的作用,为动脉瘤治疗提供了新靶点 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本数量有限,需进一步验证MLL1作为治疗靶点的临床可行性 探讨MLL1在腹主动脉瘤发展中对CD4+ T细胞分化的调控机制,以及Notch信号通路在其中的作用 腹主动脉瘤组织样本、CD4+ T细胞、小鼠模型(AngII诱导和弹性蛋白酶诱导的AAA模型) 病理学 腹主动脉瘤 单细胞RNA测序、染色质免疫沉淀、流式细胞术 NA 基因表达数据、表观遗传数据、细胞表型数据 人类AAA和非动脉瘤主动脉组织(具体数量未提及),小鼠模型(C57BL/6J小鼠) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
34 2026-08-23
A Decoy-Receptor-Armed Biomimetic Nanotherapeutic With Inherent Tropism for Conserved Pathogenic Macrophages for Treating Osteoarthritis and Intervertebral Disc Degeneration
2026-Aug-20, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本文开发了一种模拟巨噬细胞的纳米治疗系统,通过靶向保守的致病巨噬细胞,同时中和炎症信号并重编程免疫细胞,用于治疗骨关节炎和椎间盘退变 首次利用单细胞转录组学鉴定人类OA和IVDD中共有的致病性IL-1β巨噬细胞特征,并设计了一种具有同源靶向性的仿生纳米系统(GM1-dMOF@PTL),通过诱饵受体中和细胞外IL-1β并抑制NF-κB/NLRP3炎症轴,实现多管齐下的免疫调节 研究主要在动物模型中进行,缺乏人类临床试验验证;纳米系统的长期安全性、生物分布和潜在毒性尚未全面评估 开发一种针对骨关节炎和椎间盘退变的疾病修饰性纳米疗法,通过靶向共同的致病巨噬细胞驱动因素,减轻脊柱和关节的退行性病变 人类骨关节炎和椎间盘退变组织中的巨噬细胞,以及小鼠模型中的椎间盘和关节软骨 药物递送、纳米医学 骨关节炎、椎间盘退变 单细胞转录组学 NA 单细胞转录组数据 人类OA和IVDD样本(具体数量未提供),小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
35 2026-08-23
Type I interferon-activated myeloid states are associated with less fibrotic stages in idiopathic pulmonary fibrosis
2026-Aug-20, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究整合单细胞转录组学、空间转录组学和磷酸化CyTOF技术,定义了与特发性肺纤维化早期阶段相关的髓系细胞状态,发现I型干扰素激活的髓系状态与较少纤维化阶段相关。 首次将肺部消化物和支气管肺泡灌洗细胞的单细胞转录组学、亚细胞分辨率空间转录组学和外周血单细胞磷酸化CyTOF数据整合,以定义与早期纤维化相关的髓系状态。 未明确提及限制,但可推测样本量有限和仅基于基因表达分析可能限制对功能机制的深入理解。 明确特发性肺纤维化早期免疫过程中与较少纤维化阶段相关的髓系细胞状态。 特发性肺纤维化患者和非疾病对照的肺部消化物、支气管肺泡灌洗细胞和血细胞。 单细胞转录组学 特发性肺纤维化 单细胞转录组学、空间转录组学、磷酸化CyTOF NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据、磷酸化CyTOF数据 108名患者的肺部消化物和支气管肺泡灌洗细胞,以及血细胞样本 10x Genomics, Fluidigm 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞磷酸化CyTOF 10x Chromium, 10x Visium, CyTOF 10x Chromium单细胞3',10x Visium空间转录组学,CyTOF磷酸化检测
36 2026-08-23
STWave: Fine-Scale Spatial Structure Discovery in Microscopic-Resolution Spatial Transcriptomics via Patchwise Wavelet Graphs
2026-Aug-19, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 提出STWave框架,利用小波图和分块学习策略,在显微镜分辨率的空间转录组数据中识别精细空间结构,实现高效的聚类分析 采用解耦的基于补丁的学习策略,克服内存墙限制;使用离散小波变换多尺度编码基因表达特征,捕捉全局趋势和细微细节 未提及具体局限性 开发可扩展的空间域识别框架,以便在有限计算资源下分析超大规模空间转录组数据集 空间转录组数据中的组织结构和细胞亚型 计算生物学,机器学习 肿瘤微环境 空间转录组学 小波图神经网络 空间转录组数据 未提及具体样本数量,但涉及多个平台的数据集 10x Genomics, Nanostring, Vizgen 空间转录组学 Visium HD, Xenium, CosMx Visium HD, Xenium, CosMx平台
37 2026-08-23
Integrating machine learning and multi-omics analysis to identify and validate key genes associated with periodontitis
2026-Aug-19, Acta odontologica Scandinavica IF:1.4Q3
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序、孟德尔随机化及机器学习方法,识别并验证了与牙周炎相关的关键基因作为潜在诊断生物标志物 首次结合单细胞RNA测序、孟德尔随机化和多种机器学习算法组合,识别出四种新的牙周炎亚型,并验证了IGFBP4、IL1B和LAPTM5作为诊断生物标志物的潜力 样本量有限(仅13例III/IV期牙周炎患者和健康对照),并且实验验证仅限于RT-qPCR,缺乏更大规模的临床验证 通过多组学分析识别牙周炎的诊断生物标志物,以促进早期检测和干预 牙周炎患者和健康对照的牙龈组织 机器学习 牙周炎 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, RT-qPCR 随机森林, 套索回归, 岭回归, 弹性网络, 支持向量机, 梯度提升机, XGBoost, 朴素贝叶斯 基因表达数据(单细胞和批量RNA-seq), 遗传变异数据 13例III/IV期牙周炎患者和健康对照的牙龈组织 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA 使用了GEO数据集GSE164241(单细胞)、GSE10334、GSE16134、GSE23586、GSE106090(批量)
38 2026-08-23
Fzd7 Restrains Pink1-Dependent Mitophagy in Suture Stem Cells to Maintain Cranial Suture Patency
2026-Aug-19, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究结合单细胞RNA测序和Visium HD空间转录组学,揭示了Fzd7通过调控Pink1依赖性线粒体自噬维持颅缝间充质干细胞(SuSC)功能及颅缝通畅性的机制 首次将单细胞RNA-seq与2µm Visium HD空间转录组学结合,在Fgfr2小鼠模型中解析了SuSC的时空变化,并发现了Fzd7-Pink1线粒体自噬轴在颅缝通畅性维持中的新作用 研究基于小鼠模型,可能不完全代表人类颅缝早闭的复杂性,且未深入探讨Fzd7下游其他信号通路 阐明SuSC功能障碍在颅缝早闭中的作用,特别是Fzd7和Pink1介导的线粒体自噬在维持颅缝通畅中的机制 Fgfr2小鼠模型中的Prrx1阳性颅缝间充质干细胞(SuSC) 分子生物学 颅缝早闭 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 基因表达数据, 空间转录组数据 未明确说明样本数量 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium HD 2µm Visium HD空间转录组学
39 2026-08-23
Integrated multi-omics strategy for screening novel protective antigens against Brucella melitensis and analysis of their immunogenicity
2026-Aug-19, Brazilian journal of microbiology : [publication of the Brazilian Society for Microbiology] IF:2.1Q3
research paper 本研究利用多组学整合策略筛选布鲁氏菌新保护性抗原,并分析其免疫原性,为开发安全有效的亚单位疫苗提供基础 通过整合单细胞转录组测序、全基因组扫描和泛基因组分析,筛选出在强毒株中保守且仅存在于强毒株中的膜/分泌蛋白作为候选抗原,其中BMEI1943展现出强Th1型免疫原性 摘要未提供明确的局限性信息 筛选针对羊种布鲁氏菌的新型保护性抗原,并评估其免疫原性,以开发更安全的亚单位疫苗 布鲁氏菌羊种M16、544 A、M5、104 M菌株,以及C57BL/6J小鼠 微生物学、免疫学 布鲁氏菌病 单细胞转录组测序、第二代测序、泛基因组分析、原核表达系统、间接ELISA、流式细胞术 NA 单细胞转录组数据、基因组序列数据、免疫学实验数据 45,231个细胞(12种免疫细胞亚群),4株布鲁氏菌,若干小鼠 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Genomics Chromium 10x Genomics单细胞转录组测序平台
40 2026-08-23
NOX2 deficiency exacerbates lupus nephritis through activation of NLRP3 inflammasome in neutrophils
2026-Aug-19, Journal of biomedical science IF:9.0Q1
研究论文 本研究探讨NOX2缺陷如何通过中性粒细胞中NLRP3炎症小体的激活加剧狼疮性肾炎,并评估IL-1受体拮抗剂的治疗潜力 首次揭示NOX2衍生ROS作为NLRP3炎症小体负调控因子在狼疮性肾炎中的作用,并提出IL-1β阻断作为针对ROS产生受损患者的精准治疗策略 未提供明确的局限性声明 阐明NOX2衍生ROS在狼疮性肾炎发病机制中的作用,并识别潜在治疗靶点 NOX2缺陷(Ncf1-/-)小鼠和野生型对照小鼠 免疫学 狼疮性肾炎 单细胞RNA测序、流式细胞术、转录组分析 NA 基因表达数据 小鼠模型(具体数量未提及) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序
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