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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-12-21 |
Aberrant STING signalling promotes endothelial dysfunction and neurovascular injury in diabetic retinopathy
2025-Dec-19, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-025-06628-8
PMID:41419617
|
研究论文 | 本文探讨了STING信号通路在糖尿病视网膜病变中促进内皮功能障碍和神经血管损伤的作用 | 揭示了内皮细胞特异性激活cGAS/STING/IFN通路是糖尿病视网膜炎症和神经血管功能障碍的关键驱动因素 | 研究主要基于小鼠模型和公共单细胞RNA-seq数据,人类样本验证有限 | 阐明STING信号通路在糖尿病视网膜病变早期干预中的细胞特异性功能和治疗靶点价值 | 人类增殖性糖尿病视网膜病变纤维膜样本、正常死后视网膜、糖尿病和非糖尿病小鼠的视网膜内皮细胞 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA-seq、流式细胞术、腺相关病毒介导的基因操作、siRNA干扰、药理学抑制 | NA | 单细胞RNA-seq数据、流式细胞术数据、免疫荧光图像 | 包括人类增殖性糖尿病视网膜病变和特发性黄斑裂孔样本、正常死后视网膜、以及高脂饮食联合链脲佐菌素诱导的2型糖尿病小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 22 | 2025-12-21 |
Preclinical evaluation of TIGIT as a target to enhance efficacy and mitigate T cell exhaustion in multiple myeloma following BCMA-CAR-T therapy
2025-Dec-19, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-08203-w
PMID:41419632
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和功能实验,评估了TIGIT作为靶点以增强BCMA-CAR-T疗法在多发性骨髓瘤中的疗效并减轻T细胞耗竭的临床前潜力 | 首次在BCMA-CAR-T治疗的多发性骨髓瘤患者中,通过单细胞RNA测序结合功能验证,系统阐明了TIGIT在介导治疗抵抗和T细胞耗竭中的关键作用,并证明抗TIGIT单抗在体内能显著增强CAR-T功能 | 研究为临床前研究,主要基于小鼠模型和体外实验,尚未在人体临床试验中验证TIGIT阻断策略的安全性和有效性 | 阐明BCMA-CAR-T疗法在多发性骨髓瘤中产生抵抗的机制,并探索通过靶向TIGIT来增强疗效和克服复发的策略 | 复发/难治性多发性骨髓瘤患者的肿瘤浸润T细胞、BCMA-CAR-T细胞、以及人源化免疫细胞重建的小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、荧光素酶细胞毒性测定、CD107a脱颗粒测定、CFSE增殖测定、CD45RO/CD62L表型分析 | 人源化免疫细胞重建小鼠模型 | 单细胞转录组数据、流式细胞术数据、功能实验数据 | 复发/难治性多发性骨髓瘤患者的肿瘤浸润T细胞(具体样本数未在摘要中明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 23 | 2025-12-21 |
Single-cell and spatial transcriptomic profiling reveals distinct tumor microenvironment dynamics in cervical adenocarcinoma and squamous cell carcinoma
2025-Dec-19, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09310-2
PMID:41420004
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了宫颈腺癌和鳞状细胞癌之间不同的肿瘤微环境动态特征 | 首次整合单细胞和空间转录组学技术系统比较宫颈癌两种主要亚型的肿瘤微环境异质性,并识别出亚型特异性的免疫和基质特征 | 未在摘要中明确说明研究的局限性 | 解析宫颈腺癌和鳞状细胞癌的细胞和空间异质性,以理解其不同临床行为的分子基础 | 宫颈癌组织样本,重点关注腺癌和鳞状细胞癌两种亚型 | 数字病理 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据,空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 24 | 2025-12-21 |
Single-cell to pre-clinical evaluation of Trem2, Folr2, and Slc7a7 as macrophage-associated biomarkers for atherosclerosis
2025-Dec-18, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf210
PMID:41206594
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和TRAP-seq技术,在小鼠动脉粥样硬化模型中评估了Trem2、Folr2和Slc7a7作为巨噬细胞相关生物标志物的潜力 | 首次结合scRNA-seq和TRAP-seq技术,在小鼠模型中系统表征巨噬细胞在动脉粥样硬化中的组织特异性基因程序,并识别出跨物种共享的生物标志物,为循环生物标志物和PET示踪剂开发提供了新思路 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;PET示踪剂的临床应用潜力需进一步评估 | 阐明巨噬细胞在动脉粥样硬化中的驱动机制,识别可用于诊断和治疗的生物标志物 | 动脉粥样硬化小鼠模型中的巨噬细胞,涉及主动脉、脂肪组织和肝脏 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 翻译核糖体亲和纯化测序, 正电子发射断层扫描成像 | NA | 基因表达数据, 影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 25 | 2025-12-21 |
[Single-cell RNA sequencing of B cells reveals molecular typing in Sjögren syndrome]
2025-Dec-18, Beijing da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Peking University. Health sciences
PMID:41399063
|
研究论文 | 本研究通过B细胞单细胞RNA测序数据对干燥综合征患者进行无监督聚类,建立了分子分型框架,揭示了三种分子亚型及其核心调控机制和潜在治疗靶点 | 首次基于B细胞单细胞RNA测序数据对干燥综合征患者进行分子分型,定义了三种具有独特基因特征、自身抗体谱和B细胞亚群分布的亚型,并构建了亚型特异性蛋白互作网络以阐明核心调控机制 | 研究样本量相对较小(24名患者和4名健康对照),且数据来源于公共数据库,缺乏独立队列验证 | 建立干燥综合征的分子分型框架,以阐明疾病异质性并为靶向治疗开发提供见解 | 干燥综合征患者和健康对照的B细胞 | 数字病理学 | 干燥综合征 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类 | 单细胞RNA测序数据 | 24名干燥综合征患者和4名健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 26 | 2025-12-21 |
Single cell spatial transcriptomics integration deciphers the morphological heterogeneity of atherosclerotic carotid arteries
2025-Dec-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67679-4
PMID:41413386
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞空间转录组学技术,揭示了人类颈动脉粥样硬化斑块的分子微结构及其形态异质性 | 结合bulk RNA测序、单细胞RNA测序和单细胞空间转录组学,并优化细胞分割算法,首次系统解析了斑块形态异质性及其与细胞类型组成的关联 | 研究主要基于人类颈动脉样本,可能无法完全代表其他动脉部位的粥样硬化过程;样本数量未在摘要中明确说明,可能限制统计普适性 | 旨在阐明动脉粥样硬化斑块的异质性机制及其不稳定性触发因素 | 人类颈动脉粥样硬化斑块 | 数字病理学 | 心血管疾病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 单细胞空间转录组学 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 27 | 2025-12-21 |
Increased TNF-α in SJS/TEN induced by PD-1 inhibitors supports the combination therapy of etanercept and systemic corticosteroids
2025-Dec-18, Molecular immunology
IF:3.2Q3
DOI:10.1016/j.molimm.2025.12.006
PMID:41418419
|
研究论文 | 本研究探讨了PD-1抑制剂诱导的SJS/TEN中TNF-α表达上调,并评估了依那西普联合全身性皮质类固醇治疗的有效性和安全性 | 首次在PD-1抑制剂诱导的SJS/TEN中通过单细胞RNA测序和免疫荧光染色证实了TNF-α表达显著增加,并探索了依那西普联合皮质类固醇的联合疗法 | 样本量较小(仅5名患者),且单细胞RNA测序仅在一名患者中进行,可能限制结果的普遍性 | 研究PD-1抑制剂诱导的SJS/TEN中TNF-α的表达,并评估依那西普联合全身性皮质类固醇治疗的效果和安全性 | PD-1抑制剂诱导的SJS/TEN患者(n=5) | 数字病理学 | 皮肤疾病(SJS/TEN) | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),免疫荧光染色 | NA | RNA测序数据,图像数据 | 5名患者,其中一名患者进行了单细胞RNA测序(包括水疱、红斑和正常部位皮肤) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 28 | 2025-12-21 |
RETN stratification identifies a highly immunosuppressive subset of HLA-DRlow monocytes in early stage of polytrauma
2025-Dec-18, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.116027
PMID:41418639
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术,在多发性创伤患者中发现并鉴定了一个具有高度免疫抑制功能的单核细胞亚群——RETNhighHLA-DRlow单核细胞 | 首次在多发性创伤患者中,利用RETN表达水平对异质性的HLA-DRlow单核细胞进行分层,识别出一个功能严重受损、免疫抑制性更强的特定亚群,并证明其在预测脓毒症方面优于传统的HLA-DRlow单核细胞 | 研究主要聚焦于早期创伤阶段,该亚群在创伤后更晚期的动态变化及其在长期免疫抑制中的作用尚不明确,临床验证队列的样本量可能有限 | 阐明创伤后HLA-DRlow单核细胞的异质性,并明确其特定亚群在免疫抑制中的具体作用 | 多发性创伤患者的单核细胞 | 单细胞组学 | 多发性创伤及脓毒症 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术分析 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞术数据 | 临床队列及已发表数据集中的多发性创伤患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 29 | 2025-12-21 |
Macrophage efferocytosis mediated by the TP63-RAC2 pathway promotes immunosuppressive remodeling in esophageal cancer
2025-Dec-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102529
PMID:41418775
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和体外/体内实验,探讨了巨噬细胞胞葬作用在食管鳞状细胞癌中的作用及其调控机制 | 首次揭示了TP63和RAC2作为关键调控因子介导巨噬细胞胞葬作用,从而促进食管癌免疫抑制性微环境重塑的新机制 | 样本量相对较小(9名患者的27个样本),需要在更大队列中验证;主要聚焦于食管鳞状细胞癌,其他食管癌亚型未涉及 | 探究巨噬细胞胞葬作用在食管癌免疫微环境重塑中的作用及其分子机制 | 食管鳞状细胞癌患者肿瘤组织样本及其中分离的细胞 | 单细胞组学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 9名患者的27个样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 30 | 2025-12-21 |
Mitochondrial pyruvate metabolism in club cells drives airway inflammation
2025-Dec-18, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102742
PMID:41418787
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研究论文 | 本研究探讨了气道club细胞中丙酮酸代谢如何控制上皮分化和过敏性气道炎症 | 揭示了线粒体丙酮酸代谢通过代谢-免疫串扰调控哮喘发病机制的新机制,并识别了Mpc2作为治疗靶点 | 研究主要基于OVA诱导的哮喘模型,人类样本验证有限,且未全面探讨其他代谢途径的影响 | 研究丙酮酸代谢在气道club细胞中对上皮分化和过敏性炎症的调控作用 | 哮喘患者的气道club细胞和杯状细胞,以及OVA诱导的哮喘模型小鼠 | 单细胞转录组学 | 哮喘 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 哮喘患者和OVA诱导的哮喘模型小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 31 | 2025-12-21 |
PINK1 dysfunction in hepatocellular carcinoma fosters immune evasion and disease progression by promoting neutrophil infiltration
2025-Dec-18, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013079
PMID:41419228
|
研究论文 | 本研究揭示了PINK1在肝细胞癌中通过促进中性粒细胞浸润介导免疫逃逸和疾病进展的机制 | 首次将PINK1功能障碍与肝细胞癌的免疫检查点阻断抵抗联系起来,并阐明其通过促进中性粒细胞招募和抑制T细胞活性的具体机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床样本验证有限,且未探讨PINK1下游信号通路的详细分子机制 | 阐明PINK1功能障碍如何使肝细胞癌适应免疫检查点阻断诱导的免疫攻击,并识别潜在的治疗靶点 | 肝细胞癌患者数据、小鼠原位肝细胞癌模型、中性粒细胞和T细胞 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、基因表达综合数据库分析 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据、流式细胞数据 | 未明确具体样本数量,涉及在线患者数据集分析和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 32 | 2025-12-18 |
Integrate bulk RNA and single-cell sequencing to identify prognostic genes associated with dietary restriction and circadian rhythm in colorectal cancer and conduct experimental verification
2025-Dec-17, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01993-5
PMID:41405668
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 33 | 2025-12-21 |
Comprehensive analysis based on spatial domains identifies CD44 as a potential target of puerarin
2025-Dec-17, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-025-06389-2
PMID:41405724
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和分子对接技术,探讨了葛根素在黑色素瘤中的空间靶向机制,并识别CD44作为潜在作用靶点 | 首次结合空间域分析和多组学方法,揭示葛根素在黑色素瘤中的空间特异性作用,并通过分子模拟优先确定CD44为候选受体 | 研究结果仅为假设生成性,需要进一步实验验证CD44是否确实介导葛根素的空间效应 | 阐明葛根素在黑色素瘤中的治疗特异性及其空间靶向机制 | 黑色素瘤细胞及其微环境 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 分子对接, 蛋白质-配体模拟 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 分子结构数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 34 | 2025-12-21 |
GSDME-dependent pyroptosis drives abdominal aortic aneurysm via promoting vascular senescence
2025-Dec-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-66103-1
PMID:41407670
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研究论文 | 本研究揭示了GSDME依赖性非经典细胞焦亡通过促进血管衰老驱动腹主动脉瘤(AAA)的机制 | 首次发现GSDME依赖性非经典细胞焦亡在AAA中的作用,并证明VSMCs中的GSDME是AAA进展的“主开关” | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限;GSDME在特定细胞类型中的作用机制仍需进一步探索 | 探究GSDME依赖性非经典细胞焦亡在腹主动脉瘤发生发展中的作用机制 | 小鼠AAA模型、AAA患者血管组织、血管平滑肌细胞(VSMCs)、巨噬细胞、单核细胞、中性粒细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、bulk RNA-seq、多重流式细胞术 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | 小鼠模型及AAA患者血管组织(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 35 | 2025-12-21 |
Comprehensive molecular characterization of high-stemness gastric cancer cells using single-cell transcriptomics, spatial mapping, and machine learning
2025-Dec-17, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01177-0
PMID:41408440
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学、空间转录组学和机器学习,全面表征了高干性胃癌细胞的分子特征和功能 | 首次系统性地整合单细胞RNA测序、空间转录组学和机器学习算法,识别并验证了高干性胃癌细胞的特定基因特征及其在化疗耐药中的潜在作用 | 研究主要基于计算分析和体外细胞系验证,缺乏体内模型或大规模临床队列的进一步验证 | 全面表征高干性胃癌细胞的分子特征,并探索其在肿瘤侵袭性和治疗抵抗中的作用 | 胃癌细胞,特别是高干性亚群 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,bulk RNA测序,机器学习 | 支持向量机,SHAP分析 | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,bulk RNA测序数据 | 未明确指定样本数量,但使用了SGC7901和HGC-27胃癌细胞系进行实验验证 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 36 | 2025-12-21 |
Molecular subtyping and prognostic evaluation in idiopathic pulmonary fibrosis: a focus on mechanical-related genes
2025-Dec-17, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07365-7
PMID:41408564
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研究论文 | 本研究聚焦于机械相关基因,对特发性肺纤维化进行分子亚型分型及预后评估 | 首次将机械力相关评分应用于IPF样本,识别出与机械力相关的核心基因,并基于此定义了两种具有不同病理特征和炎症反应的分子亚型,同时通过CMap分析发现了针对C2亚型的潜在治疗药物 | 未明确说明样本的具体来源和数量,且研究结论主要基于生物信息学分析,需要进一步的实验验证 | 探究机械敏感基因在特发性肺纤维化发病机制中的作用,并进行分子亚型分型和预后评估 | 特发性肺纤维化患者样本及对照样本 | 生物信息学 | 特发性肺纤维化 | 加权基因共表达网络分析,单变量Cox回归分析,机器学习算法,逐步多变量Cox回归分析,单细胞RNA测序,Connectivity Map分析,伪时间轨迹分析 | 机器学习算法,Cox回归模型,列线图 | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 37 | 2025-12-21 |
Exosomal heterogeneity and functional zonation in cancer drug resistance
2025-Dec-17, Drug discovery today
IF:6.5Q1
DOI:10.1016/j.drudis.2025.104587
PMID:41418930
|
综述 | 本文综述了肿瘤微环境中外泌体的异质性及其在功能分区中对癌症耐药性的作用 | 强调了肿瘤内功能分区(如基质、缺氧、血管周围、静止和免疫冷区)驱动外泌体亚型释放的异质性,并探讨了新兴技术(如单细胞测序、空间生物学平台)在解析这些时空通信网络中的应用 | NA | 探索外泌体异质性在肿瘤微环境中的功能分区及其对癌症耐药性的影响 | 肿瘤微环境中的外泌体及其在功能分区中的分子货物和功能输出 | 空间生物学 | 癌症 | 单细胞测序、微芯片3D肿瘤培养、先进光谱方法、空间生物学平台 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 38 | 2025-12-21 |
Single Cell and Spatial Transcriptomics Implicate Vascular Cell Orchestration of Inflammatory Changes After Ultraviolet Light Exposure in Skin
2025-Dec-17, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.11.024
PMID:41419052
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学技术,揭示了紫外线照射后皮肤中血管细胞协调炎症变化的机制 | 结合单细胞RNA测序和空间转录组学,系统解析了UVB照射后皮肤各层细胞的基因表达变化,并进行了跨物种比较验证 | 研究仅基于小鼠模型和12小时时间点,人类数据为比较分析,缺乏长期动态观察 | 阐明急性紫外线辐射对皮肤的复杂影响,特别是炎症反应和自身免疫过程的启动机制 | 小鼠皮肤组织(表皮、真皮深层和脂肪组织)及人类比较数据 | 数字病理学 | 皮肤狼疮 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 未明确样本数量,但基于4,849个差异表达基因分析 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 39 | 2025-12-21 |
A cell-specific computational framework reveals a pan-cancer hypoxia signature predicting overall survival and ICI response
2025-Dec-17, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.111068
PMID:41419193
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研究论文 | 本研究开发了一个细胞特异性计算框架,揭示了预测总体生存率和免疫检查点抑制剂(ICI)应答的泛癌缺氧特征 | 首次在单细胞水平上探索泛癌缺氧特征,并开发了计算框架生成缺氧相关转录组特征(HYP.SIG),用于评估ICI疗效和临床结果 | 研究基于计算框架和回顾性数据,需要进一步实验验证 | 从缺氧角度研究肿瘤免疫逃逸机制,开发生存预后、ICI应答预测和临床治疗靶点 | 19种癌症类型的362名患者和893464个细胞 | 计算生物学 | 泛癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法(6种算法) | 单细胞转录组数据 | 362名患者,893464个细胞,18901个样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 40 | 2025-12-21 |
A conserved differentiation programme facilitates inhibitory neuron production in the developing mouse and human cerebellum
2025-Dec-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204811
PMID:41287940
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠和人类小脑发育中抑制性神经元分化的保守分子机制 | 首次在小鼠和人类小脑中鉴定出FOXO1作为ASCL1下游的关键调控因子,驱动NEP向抑制性神经元分化,并发现WNT信号通路在此过程中的保守作用 | 研究主要基于体外原代细胞培养模型,体内验证和临床相关性仍需进一步探索 | 解析哺乳动物小脑发育过程中抑制性神经元分化的分子机制 | 新生小鼠小脑和人类原代NEP细胞 | 发育生物学 | 脊髓小脑共济失调 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |