单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 32827 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-11-20 |
T cell immune dysfunction and progression to severe COVID-19 in asthma revealed by single-cell RNA sequencing
2025-Nov-18, Tuberculosis and respiratory diseases
IF:2.5Q2
DOI:10.4046/trd.2025.0099
PMID:41253375
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究哮喘患者中T细胞免疫功能障碍与进展为重症COVID-19的关联 | 首次使用单细胞RNA测序揭示哮喘患者中T细胞比例减少和细胞毒性CD8+ T细胞扩增与重症COVID-19发展的关联 | 样本量较小（仅12名患者），特别是哮喘/重症COVID-19组仅有1名患者 | 评估哮喘患者免疫功能障碍与进展为重症COVID-19之间的关联 | 哮喘和非哮喘COVID-19患者的外周免疫细胞 | 单细胞组学 | COVID-19, 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 12名患者（4名哮喘，8名非哮喘），共155,565个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 22 | 2025-11-20 |
Oncolytic virus-induced IL-1β+ monocyte-IL-6+ CAF axis suppresses dendritic cell-mediated antitumor immunity in pancreatic cancer
2025-Nov-18, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013175
PMID:41253490
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研究论文 | 本研究揭示了胰腺癌中溶瘤病毒诱导的单核细胞-CAF-DC免疫抑制轴机制 | 首次发现溶瘤病毒通过IL-1β+单核细胞-IL-6+CAF轴抑制树突状细胞抗肿瘤免疫的新机制 | 研究主要基于小鼠和患者来源的肿瘤模型，临床转化仍需进一步验证 | 探究胰腺癌中基质成分如何调节溶瘤病毒疗效的免疫机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)的肿瘤微环境 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | 小鼠模型和患者来源肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 23 | 2025-11-20 |
Transcription factor 4 regulates the interhemispheric midline remodeling through neuron-astroglia communications during corpus callosum formation
2025-Nov-18, Translational psychiatry
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41398-025-03696-7
PMID:41253748
|
研究论文 | 本研究揭示了转录因子TCF4通过神经元-星形胶质细胞通讯调控大脑半球间中线重塑和胼胝体形成的关键机制 | 首次发现TCF4介导的神经元-星形胶质细胞通讯对胼胝体形成至关重要，并鉴定Sema7a为关键介质 | NA | 探究TCF4在胼胝体形成过程中的分子机制 | 小鼠大脑半球间中线组织和细胞 | 神经科学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序，体外移植实验 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 24 | 2025-11-20 |
UHRF1 restricts HCoV-229E infection through epigenetic silencing of the viral receptor APN
2025-Nov-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-64977-9
PMID:41253770
|
研究论文 | 本研究通过全基因组CRISPR筛选发现UHRF1通过表观遗传沉默病毒受体APN来限制HCoV-229E感染 | 首次揭示UHRF1作为年龄相关的宿主防御因子通过启动子超甲基化下调冠状病毒受体APN表达 | 研究主要聚焦于HCoV-229E病毒，未验证对其他冠状病毒的普适性 | 理解病毒-宿主相互作用并鉴定影响病毒致病性和疾病进展的宿主因子 | HCoV-229E冠状病毒及其宿主细胞 | 病毒学 | 冠状病毒感染 | 全基因组CRISPR敲除筛选, CRISPR激活筛选, 转录组分析, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 年轻和老年个体的原代肺泡巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 25 | 2025-11-20 |
Multidimensional tumor-blood profiling uncovers systemic lymphocyte-monocyte imbalance in pituitary neuroendocrine tumors
2025-Nov-18, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02489-0
PMID:41253784
|
研究论文 | 通过多维肿瘤-血液分析揭示垂体神经内分泌肿瘤中系统性淋巴细胞-单核细胞失衡 | 首次系统揭示垂体神经内分泌肿瘤导致外周免疫系统失衡，发现肿瘤切除可逆转这种免疫失调 | 研究主要基于转录组数据，需要进一步功能验证 | 探究垂体神经内分泌肿瘤对外周免疫网络的调控作用 | 垂体神经内分泌肿瘤患者和健康对照的肿瘤组织及外周血单个核细胞 | 生物信息学 | 垂体神经内分泌肿瘤 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | 随机森林分类器 | 转录组数据, 血液常规数据 | 883个肿瘤样本, 283个PBMC样本(108患者+175对照), 69个单细胞样本, 600个验证样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 26 | 2025-11-20 |
Single-cell integration analysis reveals molecular signatures of the tumor microenvironment in early-onset colorectal cancer
2025-Nov-18, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01129-8
PMID:41254101
|
研究论文 | 通过单细胞整合分析揭示早发性结直肠癌肿瘤微环境的分子特征 | 首次在单细胞水平系统比较早发性与标准发病结直肠癌的分子和免疫特征差异 | 样本量相对有限，需要更大规模研究验证 | 探究早发性结直肠癌的分子和免疫特征差异 | 168名22-91岁结直肠癌患者 | 单细胞组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 168例结直肠癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 27 | 2025-11-20 |
Metabolomic and transcriptomic profiling of HNSCC identifies AMIGO2 as a therapeutic target modulating tumor microenvironment
2025-Nov-18, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01132-z
PMID:41254143
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示头颈鳞状细胞癌代谢异质性，鉴定AMIGO2作为调控肿瘤微环境的治疗靶点 | 首次整合空间代谢组学/转录组学、单细胞转录组学和批量多组学数据构建配体-受体特征谱，发现AMIGO2通过调控嘌呤代谢影响肿瘤微环境 | NA | 探索头颈鳞状细胞癌代谢重编程与肿瘤微环境的相互作用机制 | 头颈鳞状细胞癌患者组织样本及癌前病变患者临床队列 | 多组学整合分析 | 头颈鳞状细胞癌 | 空间代谢组学, 空间转录组学, 单细胞转录组学, 批量多组学 | 配体-受体特征谱 | 代谢组数据, 转录组数据 | 头颈鳞状细胞癌和癌前病变患者临床队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 代谢组学 | NA | NA |
| 28 | 2025-11-20 |
Progression-free survival for unresectable non-metastatic locally advanced pancreatic cancer after surgical microwave ablation plus durvalumab and tremelimumab: phase-2 non-randomized prospective clinical trial
2025-Nov-18, Communications medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1038/s43856-025-01186-x
PMID:41254229
|
研究论文 | 评估微波消融联合度伐利尤单抗和替西木单抗免疫治疗对不可切除局部晚期胰腺癌患者无进展生存期的影响 | 首次将局部微波消融与双免疫检查点抑制剂联合应用于胰腺癌治疗，并利用单细胞转录组和T细胞受体分析肿瘤微环境 | 样本量较小（12例患者），T细胞受体指标与无进展生存期无显著统计学相关性，需要更大队列验证 | 评估联合治疗方案对不可切除局部晚期胰腺癌患者的疗效和免疫机制 | 12例非转移性不可切除局部晚期胰腺导管腺癌患者 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组测序，T细胞受体分析 | NA | 单细胞RNA测序数据，临床数据 | 12例患者（其中6例进行了单细胞分析，3例有治疗前后配对样本） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 29 | 2025-11-20 |
Constructing a novel MPT-driven necrosis-associated gene set for predicting prognosis and immune status in skin cutaneous melanoma
2025-Nov-18, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-025-06370-z
PMID:41254408
|
研究论文 | 构建了一个基于线粒体通透性转换驱动坏死的新型基因特征，用于预测皮肤黑色素瘤的预后和免疫状态 | 首次将线粒体通透性转换驱动的坏死相关基因特征应用于皮肤黑色素瘤预后预测和免疫状态评估 | 研究基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 开发皮肤黑色素瘤的预后预测模型并评估其与免疫状态的关系 | 皮肤黑色素瘤患者 | 生物信息学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 差异表达分析, Cox回归分析, LASSO回归分析 | 基因特征模型, 诺莫图预测模型 | 基因表达数据, 临床数据 | TCGA-SKCM和GTEx数据集，以及GEO队列(GSE19234, GSE65904) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 30 | 2025-11-20 |
scMFF: a machine learning framework with multiple feature fusion strategies for cell type identification
2025-Nov-18, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06309-8
PMID:41254497
|
研究论文 | 提出一种用于单细胞RNA测序数据细胞类型识别的多特征融合机器学习框架 | 整合四种不同特征表示并探索六种融合策略，克服单一特征类型的局限性 | 未在摘要中明确说明研究局限性 | 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型分类的准确性和稳定性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 机器学习 | COVID-19及其他疾病 | 单细胞RNA测序 | 多特征融合框架结合多种分类器 | 单细胞RNA测序数据 | 42个疾病相关数据集和1个外部COVID-19数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 31 | 2025-11-20 |
ELF3-regulated PES1 targets VEGFR2 to mediate angiogenesis and retinal inner barrier injury in diabetic retinopathy
2025-Nov-18, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07334-0
PMID:41254671
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq分析，揭示了ELF3/PES1/VEGFR2信号通路在糖尿病视网膜病变中调控血管生成和血视网膜屏障功能的关键作用 | 首次发现PES1通过结合VEGFR2增强子调控其mRNA表达，并证实ELF3在糖尿病条件下调控PES1上调的新机制 | 研究主要聚焦于分子机制，临床转化应用仍需进一步验证 | 探讨PES1在糖尿病视网膜病变血管生成和血视网膜屏障功能中的作用及调控机制 | 糖尿病视网膜病变中的内皮细胞和视网膜血管 | 生物医学研究 | 糖尿病视网膜病变 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, Western blot, 划痕实验, 管形成实验, transwell, EdU增殖实验, 免疫荧光, Evans Blue实验, PAS染色, H&E染色, ChIP-seq | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 细胞功能数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 32 | 2025-11-20 |
HLA-A drives diabetic retinopathy pathogenesis: multi-omics integration reveals resveratrol's therapeutic potential via immunomodulation
2025-Nov-18, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07117-7
PMID:41254735
|
研究论文 | 本研究通过多组学整合分析确定了HLA-A在糖尿病视网膜病变中的致病作用，并发现白藜芦醇通过免疫调节具有治疗潜力 | 首次通过双向孟德尔随机化和单细胞RNA-seq整合分析确立HLA-A在糖尿病视网膜病变中的因果作用，并发现白藜芦醇的治疗潜力 | 样本量相对有限(n=81)，主要基于中国人群队列，需要更多种族群体的验证 | 识别糖尿病视网膜病变的新型生物标志物和治疗靶点 | 糖尿病视网膜病变患者外周血样本和THP-1细胞系 | 生物信息学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA-seq, 双向孟德尔随机化, eQTL/pQTL分析, 分子对接, 细胞实验 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据, 临床数据 | 81例中国人群外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 33 | 2025-11-20 |
Disruption of E-cadherin in the airway led to dysplastic stressed cells and asthma-like phenotypes
2025-Nov-17, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.06.030
PMID:40683251
|
研究论文 | 本研究通过破坏小鼠气道上皮细胞中的E-钙黏蛋白，揭示了其缺失导致细胞应激、增殖增加和哮喘样表型的机制 | 首次证明E-钙黏蛋白缺失可通过上皮细胞内在机制和上皮-免疫细胞互导引发气道重塑，无需过敏原暴露 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究E-钙黏蛋白在气道上皮细胞命运决定和哮喘样表型形成中的作用机制 | 小鼠气道上皮祖细胞（club细胞）和终末分化纤毛细胞 | 单细胞生物学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 34 | 2025-11-20 |
Single-cell and spatial multiomics identifies heterogeneous xylem development driven by mechanical stress in Populus
2025-Nov-17, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.06.038
PMID:40701155
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间多组学技术揭示了机械应力驱动的杨树木材异质性发育机制 | 首次在木本植物中应用单细胞和空间多组学技术，解决了关于正常木材和张力木材纤维细胞起源和发育的百年科学问题 | 研究主要聚焦于杨树物种，结果在其他木本植物中的普适性需要进一步验证 | 探究机械应力下木材形成的细胞异质性发育机制 | 杨树的正常木材、张力木材和对侧木材组织 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 代谢组学, 磷酸化蛋白质组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间基因表达数据, 代谢物数据, 蛋白质磷酸化数据 | 正常木材、张力木材和对侧木材组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 35 | 2025-11-20 |
Single-cell transcriptomics identifies chondrocyte differentiation dynamics in vivo and in vitro
2025-Nov-17, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.06.031
PMID:40712580
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组技术分析体内外软骨细胞分化动态，为改善体外软骨生成提供框架 | 首次结合胚胎长骨单细胞RNA测序与公共数据构建软骨内骨化图谱，并通过轨迹比对揭示体外分化偏离机制 | 研究主要基于人类胚胎干细胞模型，与原发性组织存在差异；FOXO1抑制策略需进一步功能验证 | 优化体外软骨细胞分化方法以更好地模拟体内发育过程 | 人类胚胎长骨组织、人类胚胎干细胞衍生的软骨细胞 | 单细胞生物学 | 肌肉骨骼疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 单核RNA测序(snRNA-seq) | 轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 胚胎长骨样本及公共数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 36 | 2025-11-20 |
stTransfer enables transfer of single-cell annotations to spatial transcriptomics with single-cell resolution
2025-Nov-17, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2025.101205
PMID:41101315
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研究论文 | 开发了一种名为stTransfer的方法，通过整合单细胞RNA测序数据和空间转录组数据，实现单细胞水平上的细胞类型注释 | 使用图自编码器和迁移学习技术，最小化scRNA-seq与ST数据集之间的信息传递损失 | NA | 解决空间转录组技术在单细胞水平细胞类型注释中的检测灵敏度和基因覆盖度限制 | 斑胸草雀视顶盖神经元群体 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 图自编码器, 迁移学习 | 基因表达数据, 空间位置数据 | 公开可用的空间转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | Stereo-seq | 高精度Stereo-seq |
| 37 | 2025-11-20 |
Development of a single-cell derived MDSCs signature score for prognostic risk stratification and therapeutic decision guidance in breast cancer
2025-Nov-17, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102605
PMID:41252877
|
研究论文 | 本研究开发了基于单细胞RNA测序的髓源性抑制细胞特征评分系统，用于乳腺癌预后风险分层和治疗决策指导 | 首次系统性地在乳腺癌中表征新的MDSCs基因特征，并建立了具有多方面临床转化能力的MDSCs相关标志物评分框架 | NA | 开发MDSCs特征评分用于乳腺癌预后风险分层和治疗决策指导 | 乳腺癌患者和髓源性抑制细胞 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 多组学数据分析, 机器学习 | 机器学习风险评分模型 | 单细胞RNA测序数据, 批量多组学数据 | 12,767个MDSCs细胞，整合多个独立患者队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 38 | 2025-11-20 |
PD-1+/CXCR6+CD8+T lymphocytes promote MASLD malignant progression through inflammatory and immune dysregulation
2025-Nov-17, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115847
PMID:41253047
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研究论文 | 本研究揭示PD-1+/CXCR6+CD8+T淋巴细胞通过炎症和免疫失调促进MASLD恶性进展的机制 | 首次发现PD-1+/CXCR6+CD8+T细胞亚群在MASLD向HCC恶性转化过程中的关键作用 | 动物模型与临床样本数量有限，机制研究仍需深入 | 探究CD8 T细胞在MASLD向HCC恶性进展中的动态变化及作用机制 | MASLD模型小鼠和MASLD/HCC临床患者样本 | 免疫学 | 肝细胞癌 | 流式细胞术、单细胞测序 | NA | 流式细胞数据、单细胞测序数据、临床生化指标 | MASLD模型小鼠和临床患者样本（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 39 | 2025-11-20 |
Unravelling cell heterogeneity and gene regulation mechanisms in multiple myeloma through single-cell RNA-seq
2025-Nov-16, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2025.11.006
PMID:41253222
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术解析多发性骨髓瘤的细胞异质性和基因调控机制 | 整合四个公共scRNA-Seq数据集，首次在多发性骨髓瘤中系统识别24个细胞亚群并预测651个调控子 | 仅使用公共数据集，缺乏实验验证 | 研究多发性骨髓瘤的细胞异质性和基因调控机制 | 多发性骨髓瘤细胞 | 生物信息学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 四个数据集共包含597、172、477和51,840个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 40 | 2025-11-20 |
Spatial multi-omics guides ASCT2-targeted delivery of glycolysis inhibitor for cervical cancer suppression and chemoresistance reversal
2025-Nov-16, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.11.035
PMID:41253274
|
研究论文 | 本研究通过空间多组学分析识别宫颈癌糖酵解重编程特征，并开发靶向ASCT2的谷氨酰胺功能化脂质体系统用于递送糖酵解抑制剂洛尼达明 | 首次通过空间多组学技术验证宫颈癌糖酵解脆弱性，并利用ASCT2过表达特征设计肿瘤特异性纳米递送系统 | 未明确说明样本规模及临床转化潜力 | 建立宫颈癌糖酵解重编程的空间验证并开发靶向纳米平台以逆转化疗耐药 | 宫颈癌临床标本、小鼠模型及多种宫颈癌细胞系 | 空间多组学 | 宫颈癌 | 空间代谢组学, 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 空间多组学数据, 单细胞RNA测序数据, 临床标本数据 | TCGA队列、配对患者标本、匹配小鼠样本及多种宫颈癌细胞系 | NA | 空间代谢组学, 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |