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当前共找到 45594 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-11-10 |
STWave: Fine-Scale Spatial Structure Discovery in Microscopic-Resolution Spatial Transcriptomics via Patchwise Wavelet Graphs
2026-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.77240
PMID:42615345
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研究论文 | 提出STWave框架，通过分块小波图实现显微分辨率空间转录组学中的精细空间结构发现 | 采用解耦的基于块的学习策略实现训练和推理的高效计算，缓解硬件限制；使用离散小波变换在多尺度上编码基因表达特征，同时捕获全局趋势和细粒度细节 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 解决显微分辨率空间转录组学数据量巨大导致的内存瓶颈问题，并准确识别空间域 | 显微分辨率空间转录组学数据，包括Visium HD、Xenium和CosMx平台数据 | 空间转录组学 | 肿瘤 | 空间转录组学 | 离散小波变换图神经网络 | 基因表达图像 | NA | 10x Genomics, 10x Genomics, NanoString | 空间转录组学 | Visium HD, Xenium, CosMx | NA |
| 22 | 2026-11-10 |
Fzd7 Restrains Pink1-Dependent Mitophagy in Suture Stem Cells to Maintain Cranial Suture Patency
2026-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.77245
PMID:42615907
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研究论文 | 该研究结合单细胞RNA测序与2微米Visium HD空间转录组学，揭示Fzd7通过抑制Pink1依赖性线粒体自噬维持颅缝干细胞稳态和颅缝通畅的机制 | 首次在Fgfr2小鼠模型中将单细胞RNA测序与高分辨率Visium HD空间转录组学结合，定义Prrx1+颅缝间充质干细胞（SuSC）的阶段特异性变化，并揭示Fzd7-Pink1线粒体自噬轴在颅缝早闭中的作用 | 研究主要基于Fgfr2小鼠模型，尚未在人类颅缝早闭样本中验证；机制研究以体外和动物实验为主，临床转化仍需进一步研究 | 探究颅缝间充质干细胞功能障碍在颅缝早闭发生中的作用，明确Fzd7-Pink1线粒体自噬轴调控颅缝通畅的机制 | Fgfr2小鼠模型中的Prrx1+颅缝间充质干细胞（SuSC）及冠状缝组织 | 空间转录组学、单细胞转录组学、发育生物学 | 颅缝早闭 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、AAV介导的基因过表达、条件性基因敲除 | Fgfr2小鼠模型 | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、图像 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | 10x Chromium、10x Visium HD | 10x Visium HD空间转录组（2微米分辨率）及单细胞RNA测序 |
| 23 | 2026-11-10 |
A Decoy-Receptor-Armed Biomimetic Nanotherapeutic With Inherent Tropism for Conserved Pathogenic Macrophages for Treating Osteoarthritis and Intervertebral Disc Degeneration
2026-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.77171
PMID:42621674
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研究论文 | 该研究利用单细胞转录组学识别OA和IVDD中保守的致病性IL-1β巨噬细胞特征，并开发了一种巨噬细胞仿生纳米系统（GM1-dMOF@PTL）用于靶向重编程这些细胞，从而治疗骨关节炎和椎间盘退变 | 首次识别出OA和IVDD共享的致病性IL-1β巨噬细胞特征；设计了同时具有诱饵受体（IL-1R2）和巨噬细胞膜仿生涂层的纳米系统，实现细胞外IL-1β中和与同型靶向递送的双重功能 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体临床试验中验证；纳米系统的长期安全性和生物相容性需进一步评估 | 开发一种靶向共享致病性巨噬细胞的疾病修饰性纳米治疗策略，用于治疗骨关节炎和椎间盘退变 | 骨关节炎和椎间盘退变患者样本及小鼠模型中的炎性巨噬细胞 | 数字病理学, 单细胞转录组学, 纳米医学 | 骨关节炎, 椎间盘退变 | 单细胞转录组学, 纳米技术 | NA | 单细胞转录组数据, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 24 | 2026-11-10 |
Application and Single-Cell Regulation Mechanism of Engineered EVs Combined With 4D-Printed Hydrogel for Infected Burn Repair
2026-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.77141
PMID:42627293
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研究论文 | 该研究将FGF2修饰的细胞外囊泡（F-EVs）与4D打印水凝胶结合构建4D@F-EVs系统，用于感染性烧伤创面修复，并通过单细胞RNA测序揭示其调控机制 | 首次将FGF2修饰的脂肪间充质干细胞来源细胞外囊泡与4D打印水凝胶结合，构建4D@F-EVs系统，通过激活PI3K-Akt信号通路促进KGF阳性成纤维细胞与KGFR阳性角质形成细胞之间的串扰，重建烧伤组织微环境 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 开发一种用于感染性烧伤创面修复的新型治疗系统，并阐明其通过单细胞水平调控成纤维细胞与角质形成细胞串扰的分子机制 | 感染性烧伤创面、人脂肪间充质干细胞来源的细胞外囊泡、成纤维细胞和角质形成细胞 | 数字病理, 再生医学 | 烧伤, 感染性创面 | 单细胞RNA测序, 静电吸附修饰, 4D打印水凝胶 | NA | 单细胞转录组数据, 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 25 | 2026-11-10 |
Pan-Adrenergic Inhibition Alleviates Post-Hemorrhagic Hydrocephalus by Attenuating Neutrophil Extracellular Traps-Mediated Glymphatic Dysfunction
2026-Nov, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1002/cns.71259
PMID:42995676
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研究论文 | 本研究探讨全肾上腺素能抑制通过减弱中性粒细胞胞外诱捕网介导的类淋巴系统功能障碍来缓解出血后脑积水 | 首次揭示急性出血后肾上腺素能风暴驱动中性粒细胞胞外诱捕网形成、阻塞类淋巴系统并导致颅内液体稳态失衡从而引发脑积水的机制，并提出全肾上腺素能抑制作为非手术干预策略 | 研究主要基于大鼠模型，尚未在人体中验证；PPA鸡尾酒疗法的长期安全性和有效性需进一步评估 | 阐明出血后肾上腺素能风暴驱动NETs形成、阻塞类淋巴系统并导致脑积水的机制，探索全肾上腺素能抑制的治疗潜力 | 出血后脑积水大鼠模型、原代中性粒细胞、星形胶质细胞 | 神经科学、免疫学 | 出血后脑积水、脑卒中 | 单细胞RNA测序、MRI、荧光示踪追踪、免疫荧光染色、透射电镜、ELISA、Western blot、流式细胞术 | NA | 图像、文本、分子数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 26 | 2026-11-10 |
Multi-Omics Reveals STAT1 as a Central Regulator of Oxidative Stress-Induced Senescence in the Aging Retina
2026-Nov, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70792
PMID:42998043
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研究论文 | 该研究结合bulk RNA-seq和定量蛋白质组学分析自然衰老小鼠视网膜，并通过细胞实验和单细胞数据重分析揭示STAT1是氧化应激诱导视网膜衰老的核心调控因子 | 首次通过多组学整合将STAT1鉴定为连接氧化应激、炎症信号和细胞命运调控的汇聚枢纽，并发现其在不同视网膜细胞类型中具有区室化启动和多细胞传播的特征 | 研究主要基于小鼠模型和ARPE-19细胞系，缺乏人体视网膜组织的直接验证；单细胞数据为重新分析而非新产生，STAT1在不同细胞类型中的具体功能机制尚未完全阐明 | 定义自然衰老视网膜的年龄相关分子程序并推断上游调控因子，阐明STAT1在视网膜衰老中的作用机制 | 自然衰老（24月龄）和年轻（4月龄）小鼠视网膜组织、人ARPE-19细胞系、衰老视网膜单细胞RNA-seq数据 | 多组学、数字病理学 | 年龄相关性视网膜变性、视网膜神经退行性疾病 | bulk RNA-seq、定量蛋白质组学、单细胞RNA-seq重分析 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、图像 | 24月龄和4月龄小鼠视网膜组织（具体数量未在摘要中说明）、人ARPE-19细胞系、公共衰老视网膜单细胞RNA-seq数据 | NA | bulk RNA-seq、定量蛋白质组学、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 27 | 2026-11-10 |
Lactate-Primed NETosis Modulates Hepatic Regeneration During Acute Liver Failure via the TLR9/KLF15/AJUBA Axis
2026-Nov, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.70251
PMID:42331029
|
研究论文 | 该文揭示乳酸通过MCT1进入中性粒细胞线粒体激活NETosis，NETs DNA被肝细胞TLR9识别后抑制KLF15/AJUBA轴，增加YAP1磷酸化，阻碍肝再生 | 首次阐明乳酸驱动的NETosis通过TLR9/KLF15/AJUBA轴抑制急性肝衰竭肝再生的KCs-中性粒细胞-肝细胞串扰机制 | 摘要未提及具体样本量及临床验证队列，机制主要基于体外和动物实验 | 探究急性肝衰竭中代谢-免疫串扰调控肝再生的机制 | 急性肝衰竭中的库普弗细胞、中性粒细胞和肝细胞 | 数字病理学 | 急性肝衰竭 | RNA-seq, scRNA-seq | NA | 文本 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 28 | 2026-11-10 |
Coixenolide Enhances Antitumor Immunity of Cytotoxic CD8+ T Cells by Inhibiting S100A8/A9-CD36 Axis in Obesity-Associated Pancreatic Adenocarcinoma
2026-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202515759
PMID:42640422
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研究论文 | 本研究揭示了薏苡仁酯通过抑制肥胖相关胰腺癌中S100A8/A9-CD36轴来增强细胞毒性CD8+ T细胞抗肿瘤免疫的作用机制 | 首次发现薏苡仁酯通过抑制肿瘤细胞来源的S100A8/A9与CD8+ T细胞上CD36的相互作用，减少CD8+ T细胞脂质过氧化和铁死亡，从而恢复其细胞毒性功能，为肥胖相关胰腺癌提供了免疫代谢干预新策略 | 其他潜在机制（如调节性T细胞相关机制）仍需进一步研究 | 探究薏苡仁酯在肥胖相关胰腺腺癌中的免疫调节和抗肿瘤作用及其分子机制 | 高脂饮食喂养的小鼠胰腺腺癌模型、胰腺腺癌组织、CD8+ T细胞、肿瘤细胞、患者样本 | 肿瘤免疫学、单细胞组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、细胞间通讯分析、功能实验、基因敲除 | NA | 单细胞转录组数据、图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 29 | 2026-11-10 |
Integrated Multi-Omics Analyses Reveal Causal DNA Methylation-Breast Cancer Associations Mediated by Plasma Proteins
2026-Nov, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71424
PMID:43000987
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研究论文 | 该研究通过整合全基因组血液DNA甲基化数据、乳腺癌遗传数据和多组学分析，揭示了DNA甲基化通过血浆蛋白介导乳腺癌风险的因果关联 | 首次通过孟德尔随机化结合蛋白质组介导分析和单细胞RNA测序，系统揭示血液DNA甲基化通过特定血浆蛋白介导乳腺癌风险的因果通路，并定位介导蛋白至肿瘤微环境特定细胞群 | 仅三个高置信度位点被确认，仅两个位点获得共定位支持，介导蛋白的下游机制仍需实验验证，血液甲基化与肿瘤组织甲基化的关系未充分探讨 | 探究血液DNA甲基化在乳腺癌中的因果作用及其蛋白质组介导机制 | 乳腺癌患者及对照人群的血液DNA甲基化数据和乳腺癌遗传数据 | 多组学分析、遗传流行病学 | 乳腺癌 | DNA甲基化芯片、孟德尔随机化、贝叶斯共定位分析、PheWAS、蛋白质组-wide介导分析、单细胞RNA测序 | 孟德尔随机化模型、广义汇总数据孟德尔随机化、贝叶斯共定位模型 | DNA甲基化数据、遗传变异数据、蛋白质组数据、单细胞转录组数据 | 识别19,169个差异甲基化位点，95个CpG位点与乳腺癌相关，203个乳腺癌相关蛋白 | NA | 全基因组DNA甲基化检测、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 30 | 2026-11-10 |
A Pan-Hepatic T-Cell Atlas Identifies Disease-Specific Immune Dysfunction and Therapeutic Targets for Immunotherapy
2026-Nov, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.71146
PMID:43001071
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研究论文 | 该研究构建了覆盖多种肝脏疾病的泛肝脏T细胞单细胞图谱，揭示了疾病特异性免疫功能障碍及潜在免疫治疗靶点 | 首次建立覆盖139名供者、255个血液和肝脏样本、624,215个T细胞的泛肝脏单细胞图谱（Pheat），系统比较多种肝脏疾病间T细胞异质性，发现疾病特异性检查点优势（CHB中4-1BB、HCC中TIGIT）并实验验证，预测并验证Panobinostat可重振CHB患者耗竭T细胞，揭示eTreg在不同肝病中IL-2-STAT5信号差异及Lapatinib/Olopatadine增强肝硬化Treg抑制标志物 | 摘要未明确提及研究局限性 | 建立泛肝脏T细胞单细胞图谱，系统比较多种肝脏疾病免疫异质性和动态变化，揭示疾病特异性免疫功能障碍并寻找潜在免疫治疗靶点 | 139名供者的255个血液和肝脏样本，涵盖慢性乙型肝炎、慢性丙型肝炎、酒精相关性肝炎、代谢功能障碍相关脂肪性肝炎、肝硬化、肝细胞癌患者及健康对照 | 数字病理学, 单细胞生物学, 免疫学 | 肝癌, 慢性乙型肝炎, 慢性丙型肝炎, 酒精相关性肝炎, 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎, 肝硬化 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 139名供者，255个血液和肝脏样本，624,215个T细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 31 | 2026-11-10 |
OTUD1 Prevents Immunosuppression via Promoting Lysosomal-Associated Degradation of PD-L1
2026-Nov, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.71144
PMID:43001075
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研究论文 | 本文揭示去泛素化酶OTUD1通过AKT-mTOR-TFEB轴促进PD-L1的自噬体-溶酶体降解，从而防止免疫抑制 | 首次发现OTUD1通过去泛素化AKT并经由AKT-mTOR-TFEB轴促进PD-L1的溶酶体降解，进而增强T细胞浸润和肿瘤免疫应答 | 研究主要基于肾透明细胞癌模型，机制在其他肿瘤类型中的普适性有待验证 | 探究OTUD1调控PD-L1表达及肿瘤免疫逃逸的分子机制 | 肾透明细胞癌（KIRC）患者样本、小鼠肿瘤模型、Jurkat T细胞 | 肿瘤免疫学 | 肾透明细胞癌 | 单细胞测序、分子生物学实验 | NA | 单细胞测序数据、实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 32 | 2026-11-10 |
Costunolide-Mediated Modulation of the P2X7-NLRP3 Complex Suppresses Oligodendrocyte Precursor Cell Pyroptosis and Rescues Perinatal White Matter Injury
2026-Nov, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1002/cns.71263
PMID:43001639
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研究论文 | 本文研究Costunolide通过靶向P2X7-NLRP3复合物抑制少突胶质前体细胞焦亡，从而挽救围产期白质损伤 | 首次发现损伤诱导的P2rx7+/Nlrp3+少突胶质前体细胞亚群，并揭示P2X7促进NLRP3炎症小体组装的新机制，同时证明Costunolide作为P2X7-NLRP3复合物调节剂的神经治疗潜力 | 摘要未明确提及研究局限性 | 阐明少突胶质前体细胞中NLRP3炎症小体组装的分子机制，并评估Costunolide作为P2X7-NLRP3复合物靶向调节剂的疗效 | 围产期白质损伤模型中的少突胶质前体细胞及P2rx7基因敲除大鼠 | 数字病理学, 机器学习 | 围产期白质损伤, 神经发育障碍 | 分子动力学模拟, 表面等离子体共振, 原代细胞培养, 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas9基因编辑 | CRISPR/Cas9敲除大鼠模型 | 单细胞转录组数据, 分子互作数据, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 33 | 2026-11-10 |
Exploring the role and mechanism of methionine metabolism in chronic rhinosinusitis with nasal polyps based on bioinformatics analysis
2026-Oct-31, Brazilian journal of otorhinolaryngology
IF:1.7Q2
DOI:10.1016/j.bjorl.2026.101917
PMID:42965986
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研究论文 | 本研究整合多组学数据与可解释机器学习方法，系统探究甲硫氨酸代谢在慢性鼻窦炎伴鼻息肉中的作用及其机制，并筛选潜在生物标志物与治疗靶点 | 首次系统性地将甲硫氨酸代谢与CRSwNP发病机制相关联，结合单细胞RNA测序、WGCNA、三种机器学习算法（LASSO、SVM-RFE、XGBoost）及SHAP可解释性分析筛选核心基因，并通过分子对接发现潜在治疗药物 | 证据等级仅为3级，研究主要基于生物信息学分析与公共数据库数据，缺乏实验验证和临床样本验证 | 系统研究甲硫氨酸代谢在慢性鼻窦炎伴鼻息肉中的作用，识别潜在生物标志物和治疗靶点 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉（CRSwNP）患者及相关转录组与单细胞数据 | 生物信息学、机器学习 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 单细胞RNA测序、转录组分析、WGCNA、机器学习、分子对接 | LASSO、SVM-RFE、XGBoost、SHAP | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 34 | 2026-11-10 |
smoothclust: Spatial smoothing and boundary-density summaries for spatial transcriptomics
2026-Oct-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.10.26.761912
PMID:42990310
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研究论文 | 提出smoothclust框架，包含基于空间平滑的聚类工作流和边界密度（BD）指标，用于空间转录组数据的空间域分析和组织架构量化 | 开发了可解释的边界密度指标（原始BD和相对BD），可将空间域标签图转化为局部和样本水平的组织架构汇总度量，支持外部聚类或手动注释标签 | 摘要中未明确说明方法的具体局限性 | 为空间转录组数据提供空间域识别和样本水平组织架构量化的标准化、可解释的分析框架 | 空间转录组数据集（来自多个空间转录组平台）及模拟数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间坐标和基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 35 | 2026-11-10 |
Association of fatty acid binding protein 4 with altered immune composition and ferroptosis related signatures in metastatic medullary thyroid cancer
2026-Oct-30, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2026-1934
PMID:42997718
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研究论文 | 本研究探讨了脂肪酸结合蛋白4（FABP4）在转移性甲状腺髓样癌中的表达模式及其与免疫和代谢景观的关系 | 揭示了FABP4在转移性甲状腺髓样癌中高表达，并与免疫细胞组成改变和铁死亡相关通路富集相关，提出FABP4作为转移的潜在生物标志物 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 研究FABP4在转移性甲状腺髓样癌中的表达模式及其与免疫和代谢景观的关系 | 甲状腺髓样癌组织样本（包括原发灶和淋巴结转移灶） | 数字病理学, 机器学习 | 甲状腺髓样癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 加权基因共表达网络分析, 差异表达基因分析, 功能富集分析, 基因集富集分析, inferCNV, CopyKAT | NA | 单细胞RNA测序数据, 基因表达谱数据, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 36 | 2026-11-10 |
Spatial transcriptomics reveals PDIA6 as a tumor-intrinsic driver of mesenchymal plasticity and vascular microenvironment remodeling in glioblastoma
2026-Oct-30, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2026-2106
PMID:42997716
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序、空间转录组学和批量转录组数据，揭示PDIA6是胶质母细胞瘤中驱动间质可塑性和血管微环境重塑的肿瘤内在关键调控因子 | 首次通过单细胞虚拟敲除建模和多队列整合筛选，将PDIA6鉴定为胶质母细胞瘤血管微环境的核心肿瘤内在调控因子，并揭示其在间质可塑性、应激适应和免疫逃逸中的作用 | 研究主要基于转录组数据的生物信息学分析和虚拟敲除建模，缺乏直接的体内外功能实验验证PDIA6的促血管重塑机制 | 鉴定胶质母细胞瘤中调控恶性细胞-内皮细胞交互和保护性血管龛的肿瘤内在关键驱动因子 | 胶质母细胞瘤患者样本及单细胞RNA测序、批量转录组和空间转录组数据 | 数字病理学、空间转录组学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA-seq、空间转录组学、批量RNA-seq | MOVICS多组学整合分型、单细胞虚拟敲除建模、空间解卷积 | 基因表达数据、空间转录组数据、图像 | 4个独立单细胞RNA-seq队列、7个批量队列共n=890例患者、50个Visium空间转录组切片 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq、空间转录组学、批量RNA-seq | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学切片、单细胞RNA测序数据集整合分析 |
| 37 | 2026-11-10 |
A novel tumor cell origin-based risk score (TCOMRS) to predict liver metastasis and guide treatment in colon adenocarcinoma
2026-Oct-30, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2026-1049
PMID:42997878
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研究论文 | 该文基于肿瘤细胞起源构建风险评分（TCOMRS），用于预测结肠腺癌肝转移并指导治疗策略 | 首次基于肿瘤细胞起源构建TCOMRS评分，整合单细胞RNA测序数据与一类逻辑回归算法，刻画原发肿瘤细胞与肝转移相关恶性表型的相似性，并识别FABP1为肝转移关键驱动因子 | 摘要未明确说明TCOMRS在临床实践中的前瞻性验证情况，FABP1的促转移机制仍需进一步体内外实验验证 | 开发并验证基于肿瘤细胞起源的转移风险评分，刻画结肠腺癌肝转移相关转录特征并识别肝转移进展的关键分子调控因子 | 结肠腺癌患者原发肿瘤及肝转移灶的单细胞及批量转录组数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | 一类逻辑回归（OCLR） | 文本 | 4,512个来源于肝转移灶的恶性细胞，以及TCGA-COAD、GSE39582、GSE38832、GSE161158多个独立队列 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 38 | 2026-11-10 |
Machine-learning-assisted multi-omics profiling identifies CALB1 as a subtype-associated regulator of PI3K/AKT signaling and malignant progression in non-small cell lung cancer
2026-Oct-30, Translational lung cancer research
IF:4.0Q1
DOI:10.21037/tlcr-2026-0576
PMID:42999431
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研究论文 | 该研究通过机器学习辅助的多组学框架识别NSCLC代谢-表观遗传重塑亚型及预后调控因子，并验证CALB1通过PI3K/AKT信号促进恶性进展 | 整合机器学习辅助的Cox建模与多组学数据识别NSCLC亚型相关调控因子CALB1，并结合单细胞RNA测序、蛋白质组和磷酸化蛋白质组、功能实验及体内异种移植模型系统验证CALB1通过PI3K/AKT信号调控恶性表型及PI3Kα抑制剂敏感性 | 摘要未明确说明，需阅读全文进一步评估 | 通过机器学习辅助的多组学框架识别NSCLC亚型相关调控因子，并表征CALB1在恶性进展中的功能和信号相关性 | 非小细胞肺癌（NSCLC）转录组队列、公共队列、院内NSCLC标本、A549和PC9细胞、A549皮下异种移植小鼠模型 | 数字病理, 机器学习 | 肺癌 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 磷酸化蛋白质组学, qRT-PCR, western blotting, 免疫组织化学 | 机器学习辅助的Cox模型 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组数据, 磷酸化蛋白质组数据, 图像, 文本 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学, 磷酸化蛋白质组学 | NA | NA |
| 39 | 2026-11-10 |
Single-cell and spatial transcriptome analyses unveil that MYH11 links stemness to immunotherapy resistance in non-small cell lung cancer
2026-Oct-30, Translational lung cancer research
IF:4.0Q1
DOI:10.21037/tlcr-2026-0927
PMID:42999620
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研究论文 | 结合单细胞RNA测序和空间转录组测序，揭示MYH11高表达干性亚群与非小细胞肺癌免疫治疗耐药相关 | 首次联合scRNA-seq与ST-seq鉴定出与免疫治疗耐药相关的MYH11高表达干性亚群及MYH11+成纤维细胞亚群，并通过多组学和实验验证揭示其通过NOTCH信号通路和CXCL12/TUBA1A调控干性和免疫耐药 | 未明确说明样本量有限、缺乏前瞻性临床验证、机制研究主要依赖体外实验 | 识别非小细胞肺癌中肿瘤干性亚群及其相关信号通路，阐明免疫治疗耐药的机制 | 非小细胞肺癌患者肿瘤样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序, 批量RNA测序, 多重免疫荧光, 免疫组织化学, qRT-PCR, western blot | 机器学习, CytoTRACE, Monocle3, CellChat, fastCNV, 共识聚类 | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 40 | 2026-11-10 |
HOMED enables hierarchical and multimodal optimization of DNA methylation deconvolution across tissues
2026-Oct-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.08.730896
PMID:42990126
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研究论文 | 本文提出了HOMED框架，整合细胞类型层级、scRNA-seq引导的去卷积以及配对bulk RNA-seq/DNAm数据优化CpG特征，用于bulk DNA甲基化数据的细胞类型去卷积 | 整合细胞类型层级关系、单细胞RNA测序引导的去卷积和配对bulk RNA-seq/DNAm数据进行CpG特征优化，克服现有基于参考的DNAm去卷积方法忽视相关细胞类型间层级关系及参考谱变异性有限导致泛化性差的问题 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 开发一种准确且实用的方法从bulk DNA甲基化数据中推断细胞类型比例，以解决表观基因组关联研究中细胞异质性混杂问题 | 多种模拟和真实异质性组织数据集，以及吸烟暴露胎盘DNA甲基化队列 | 表观遗传学 | NA | DNA甲基化测序, 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | DNA甲基化数据, 基因表达数据 | 多个模拟和真实异质性组织数据集，以及一个吸烟暴露胎盘DNA甲基化队列 | NA | bulk DNA甲基化, 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |