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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-03-24 |
Extracellular vesicle miR-93-5p cargo regulates glomerular endothelial cell damage in Alport syndrome
2026-Mar-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.197643
PMID:41869725
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研究论文 | 本研究探讨了miR-93-5p在Alport综合征中减轻肾小球损伤的作用,以及人羊水干细胞来源的细胞外囊泡(hAFSC-EVs)通过其miR-93-5p货物介导疾病修饰活性的机制 | 首次揭示了miR-93-5p在肾小球内皮细胞中的下调与Alport综合征进展相关,并证明hAFSC-EVs通过传递miR-93-5p调节VEGFR1和VEGFR2信号通路,从而恢复肾小球内皮细胞功能 | 研究主要基于体外和动物模型,人类患者数据验证有限,且未详细探讨miR-93-5p在其他肾细胞类型中的作用 | 探究miR-93-5p在Alport综合征肾小球损伤中的保护作用及hAFSC-EVs的治疗机制 | 肾小球内皮细胞、人羊水干细胞来源的细胞外囊泡(hAFSC-EVs)、Alport综合征动物模型及患者活检组织 | 分子生物学与病理学 | Alport综合征 | 空间转录组学、空间分子成像、转录组学、蛋白质组学 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、空间成像数据 | 动物模型及患者活检组织,具体样本数量未明确说明 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 22 | 2026-03-24 |
Macrophages expressing macrophage receptor with collagen structure attenuate liver fibrosis through a tissue restoration phenotype
2026-Mar-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.193172
PMID:41869728
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现并验证了表达胶原结构巨噬细胞受体(MARCO)的巨噬细胞亚群在肝纤维化中具有组织修复表型,并能通过与肝星状细胞相互作用减轻纤维化 | 首次在肝纤维化模型中通过单细胞RNA-seq鉴定出MARCO高表达巨噬细胞亚群,并证明其具有独特的组织修复表型,能通过调节肝星状细胞功能减轻纤维化 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类肝纤维化样本中得到验证;MARCO+巨噬细胞的具体作用机制仍需进一步阐明 | 探究巨噬细胞在肝纤维化中的作用,特别是MARCO+巨噬细胞亚群的功能 | 小鼠肝纤维化模型中的巨噬细胞和肝星状细胞 | 单细胞组学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠肝纤维化模型样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 23 | 2026-03-24 |
Evaluating the Utilities of Foundation Models in Single-Cell Data Analysis
2026-Mar-23, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202514490
PMID:41869863
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研究论文 | 本文通过综合实验评估了基础模型在单细胞测序数据分析中的性能,并提出了scEval评估框架 | 首次对十种单细胞基础模型在八个下游任务中进行系统性评估,揭示了基础模型与任务特定方法的性能差异,并提出了训练优化指南 | 研究发现单细胞基础模型并非在所有任务中都优于任务特定方法,这挑战了开发单细胞基础模型的必要性 | 评估基础模型在单细胞数据分析中的效用和性能 | 单细胞测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 基础模型(包括scGPT、Geneformer、CellFM等) | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 24 | 2026-03-24 |
scResponse: A Rank-Based Method for Identifying Cell States That Contribute to Immunotherapy Response by Single-Cell Data
2026-Mar-23, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202524397
PMID:41869876
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研究论文 | 本研究开发了一种名为scResponse的基于排序的方法,通过单细胞数据识别影响免疫治疗反应的细胞状态 | scResponse算法首次量化单细胞对免疫治疗的反应,能捕捉多种细胞亚型和状态(如血管细胞正常化、巨噬细胞极化、CD8 T细胞终末耗竭及成纤维细胞亚型)对疗效的细微影响,并跨癌症整合分析识别关键代谢通路 | 方法作为概念验证,主要依赖计算分析,实验验证仅限于肿瘤-CD8 T细胞共培养和小鼠模型,尚未在广泛临床样本中验证 | 开发一种评估免疫治疗疗效的单细胞分辨率方法,以促进新免疫治疗增敏策略的机制理解和靶点发现 | 单细胞数据中的细胞状态,包括血管细胞、巨噬细胞、CD8 T细胞和成纤维细胞亚型 | 单细胞分析 | 癌症 | 单细胞测序 | 基于排序的算法 | 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 25 | 2026-03-24 |
Integrative machine learning analysis suggests novel molecular targets for liver cancer diagnosis and therapy
2026-Mar-22, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04889-2
PMID:41866435
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研究论文 | 本研究通过整合机器学习与基因组数据分析,识别了肝细胞癌的关键分子靶点并开发了一个8基因诊断模型 | 结合WGCNA、单细胞测序和多种机器学习算法,发现了一个新的8基因诊断签名,在训练队列中AUC达到1.000,并在外部数据集中得到验证 | 研究依赖于公共微阵列数据集,可能受样本异质性和平台差异影响,且需要进一步实验验证 | 通过识别关键分子靶点和通路,提高肝细胞癌的及时有效诊断和治疗 | 肝细胞癌患者与对照组的基因表达数据 | 机器学习 | 肝癌 | 微阵列分析,单细胞测序,WGCNA,ssGSEA | 多种机器学习算法 | 基因表达数据 | 来自NCBI GEO的微阵列数据集,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 26 | 2026-03-24 |
Mathematical dissection of tumor phenotypic heterogeneity in a spatial data-informed nonlocal reaction-diffusion model
2026-Mar-22, Journal of mathematical biology
IF:2.2Q2
DOI:10.1007/s00285-026-02380-8
PMID:41866589
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研究论文 | 本研究提出了一个结合空间基因表达数据的非局部反应-扩散模型,用于严格分析血管化肿瘤内的表型异质性和进化 | 首次将非局部反应-扩散模型与真实空间转录组学数据相结合,以量化肿瘤细胞空间密度、表型状态和血管分布,并识别表型异质性的关键决定因素 | 模型在具有高空间和表型维度的情况下进行严格数学分析仍然具有挑战性,且先前研究很少通过整合模型与真实空间数据来探索表型异质性的关键决定因素 | 剖析血管化肿瘤内的表型异质性和进化 | 肿瘤细胞 | 机器学习 | 肿瘤 | 空间转录组学 | 非局部反应-扩散模型 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 27 | 2026-03-24 |
Integrated single-cell and bulk transcriptomics reveals STAB1 as a novel therapeutic target for ovarian cancer
2026-Mar-21, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102738
PMID:41865597
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组学,结合机器学习算法,揭示了STAB1作为卵巢癌新型治疗靶点的重要性 | 首次通过整合单细胞和批量转录组学,结合机器学习算法,将STAB1识别为连接免疫抑制基质和恶性上皮的关键“双检查点”分子 | 研究主要基于计算分析和体外实验,缺乏体内模型验证 | 解析卵巢癌的免疫抑制肿瘤微环境和异质性,以识别新的治疗靶点 | 卵巢癌(OC)的肿瘤微环境、STAB1基因、卵巢癌细胞系(A2780和SK-OV-3) | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞转录组学、批量转录组学、机器学习算法(LASSO和SVM-RFE) | 集成机器学习算法 | 转录组数据 | 多队列批量转录组数据及单细胞分析样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 28 | 2026-03-24 |
Gene regulatory network determinants of rapid recall in human memory CD4+ T cells
2026-Mar-20, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117103
PMID:41865369
|
研究论文 | 本研究利用单核多组学测序技术,揭示了人类记忆CD4+ T细胞快速回忆反应的基因调控网络机制 | 首次通过单核多组学测序结合基因调控网络分析,识别出记忆相关转录因子(MAF、PRDM1、RUNX2、SMAD3和KLF6)在调控快速回忆反应中的关键作用,并通过实验验证了KLF6的结合活性 | 研究主要基于体外测序数据,体内功能验证和疾病关联机制仍需进一步探索 | 探究人类记忆CD4+ T细胞快速回忆反应的基因调控网络决定因素 | 人类CD4+ T细胞(包括幼稚细胞和记忆细胞) | 单细胞组学 | 免疫介导疾病 | 单核多组学测序(基因表达和染色质可及性)、染色质免疫沉淀测序、单细胞RNA测序 | 基因调控网络分析 | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单核多组学测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 29 | 2026-03-24 |
IL-4 treatment induces apoptosis of blood monocytes and proliferation of recruited injury-associated macrophages to resolve liver injury
2026-Mar-20, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117136
PMID:41865375
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研究论文 | 本研究探讨了IL-4在急性肝损伤模型中的作用机制,发现其通过诱导血液单核细胞凋亡和促进损伤相关巨噬细胞增殖来促进肝损伤修复 | 揭示了IL-4治疗通过改变损伤相关髓系细胞的组成、数量和功能来促进肝损伤修复的新途径 | 研究主要基于小鼠模型,人类应用需进一步验证;未详细探讨IL-4在其他器官损伤中的普适性 | 阐明IL-4在肝损伤修复中的治疗机制 | 小鼠急性肝损伤模型中的髓系细胞(单核细胞和巨噬细胞) | NA | 肝损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 30 | 2026-03-24 |
Methods of muscle atrophy analysis at the single-nucleus level
2026-Mar-20, Mechanisms of ageing and development
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.mad.2026.112178
PMID:41865775
|
研究论文 | 本文介绍了一种针对骨骼肌的组织解离和细胞核分离的详细协议,并概述了适用于单细胞核RNA测序数据的生物信息学分析流程 | 优化了骨骼肌的单细胞核RNA测序样本制备方法,并提供了针对肌肉萎缩状态的转录组比较分析流程 | NA | 研究肌肉萎缩的分子机制,特别是在衰老和神经肌肉病理条件下的肌肉功能衰退 | 骨骼肌组织,特别是肌肉纤维的细胞核 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞核RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 31 | 2026-03-24 |
Single-cell RNA sequencing reveals the characteristics of porcine viral diseases, development, and immune repertoires: Current status and challenges
2026-Mar-20, Infection, genetics and evolution : journal of molecular epidemiology and evolutionary genetics in infectious diseases
DOI:10.1016/j.meegid.2026.105929
PMID:41865947
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综述 | 本文系统综述了单细胞RNA测序技术在猪研究中的应用进展,涵盖疾病机制解析、发育生物学探索和免疫特性分析三个方面 | 首次系统性地将scRNA-seq技术在猪研究中的三大应用方向(疾病、发育、免疫)进行整合综述,并分析了该技术面临的独特挑战与未来前景 | 本文为综述性文章,未涉及原始实验数据;文中指出的技术挑战(如猪参考基因组注释不完整、样本处理困难、数据分析复杂)仍需后续研究解决 | 总结scRNA-seq技术在猪病毒性疾病、发育过程和免疫组库研究中的应用现状,分析技术挑战并展望未来应用前景 | 猪(作为农业经济动物和人类疾病模型) | 数字病理学 | 病毒性疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 32 | 2026-03-24 |
PRAMEL12 orchestrates spermiogenesis to ensure male fertility in mice
2026-Mar-20, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2026.111392
PMID:41866036
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研究论文 | 本研究通过基因敲除小鼠模型,揭示了PRAMEL12在精子发生中的关键作用,其缺失导致精子染色质凝聚缺陷和雄性不育 | 首次明确了PRAMEL12作为精子发生必需调控因子的功能,并揭示了其通过调控组蛋白-鱼精蛋白转换过程影响精子染色质凝聚的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,其在人类中的功能验证尚需进一步研究 | 探究PRAMEL12在精子发生过程中的具体功能及其导致雄性不育的分子机制 | Pramel12基因敲除小鼠及其精子发生过程 | 生殖生物学 | 雄性不育症 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学分析、组织化学分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质组数据、组织学图像 | 未明确具体数量的小鼠样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 33 | 2026-03-24 |
Single-cell sequencing reveals metabolic reprogramming and immune regulation underlie the maintenance of teleost granulomas
2026-Mar-20, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2026.111287
PMID:41866100
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研究论文 | 本研究通过整合多组织转录组学、单细胞RNA测序、超微结构成像和荧光原位杂交技术,揭示了硬骨鱼肉芽肿维持的代谢重编程和免疫调控机制 | 首次在脊椎动物中解析了肉芽肿的代谢和功能景观,发现了上皮样巨噬细胞(E-Macs)的代谢适应和表型转换,并证明这些特征在斑马鱼中是进化保守的 | 研究主要基于硬骨鱼感染模型,在哺乳动物中的普适性仍需验证;单细胞测序数据主要来自感染后期,动态变化过程有待进一步研究 | 探究脊椎动物肉芽肿维持的生物能量学和调控机制 | 大口黑鲈(Micropterus salmoides)-诺卡氏菌(Nocardia seriolae)感染模型,以及斑马鱼 | 单细胞生物学 | 慢性肉芽肿性疾病 | 多组织转录组学, 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 超微结构成像, 荧光原位杂交(FISH) | NA | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 图像数据 | 涉及多个组织(头肾、脾脏、肝脏、肾脏)的样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 34 | 2026-03-24 |
Targeting BATF: A new strategy for cancer immunotherapy
2026-Mar-20, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2026.189579
PMID:41866089
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综述 | 本文综述了BATF作为癌症免疫治疗新靶点的研究进展,重点关注其在CD8 T细胞发育和耗竭中的作用 | 强调了BATF作为新型免疫治疗靶点的潜力,并探讨了其与PD-1表达之间的正反馈机制 | NA | 为抗肿瘤免疫治疗提供新的见解和方法 | BATF转录因子及其在T细胞中的作用 | NA | 癌症 | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 35 | 2026-03-24 |
A single-nucleus and spatial transcriptomic atlas of poplar leaves reveals the regulation of leaf polarity and cuticle deposition
2026-Mar-20, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2026.03.015
PMID:41866110
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研究论文 | 本研究利用单核和空间转录组学技术,绘制了杨树叶片的细胞图谱,揭示了叶片极性和角质层沉积的调控机制 | 首次整合单核与空间转录组学解析杨树叶片的细胞类型及其背腹极性,并鉴定MYC2作为调控角质层生物合成的关键转录因子 | 研究主要基于杨树模型,结果在其他植物物种中的普适性有待验证,且功能验证实验相对有限 | 探究叶片背腹极性的分子网络及其与代谢适应的整合机制 | 杨树叶片细胞 | 植物生物学 | NA | 单核转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 未明确指定样本数量,但涉及杨树叶片的多种细胞类型 | NA | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 36 | 2026-03-24 |
CTPS1 modulates mitophagy to propel diffuse large B-cell lymphoma via reshaping CEPT1-mediated phospholipid metabolism
2026-Mar-19, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2026.104132
PMID:41865720
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研究论文 | 本文探讨了CTPS1通过调节CEPT1介导的磷脂代谢和线粒体自噬,促进弥漫性大B细胞淋巴瘤进展的机制 | 首次揭示了CTPS1在DLBCL中通过上调CEPT1表达,重塑磷脂代谢并驱动BNIP3介导的线粒体自噬,从而促进肿瘤进展的新机制 | 未明确CTPS1抑制剂R80在临床治疗中的具体疗效和潜在副作用 | 研究CTPS1在弥漫性大B细胞淋巴瘤中的作用及其潜在治疗价值 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤患者和DLBCL细胞 | 肿瘤生物学 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 37 | 2026-03-24 |
Single-Cell and Mendelian Randomization Analyses Identify Key Genes Common to COVID-19 and Multiple Sclerosis
2026-Mar-17, Viral immunology
IF:1.5Q4
DOI:10.1177/08828245261426986
PMID:41841545
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、全基因组关联研究和表达数量性状位点数据,识别了COVID-19和多发性硬化症共有的关键基因,并阐明了其在B细胞功能中的作用机制 | 首次结合单细胞测序与孟德尔随机化分析,系统性地识别了COVID-19和多发性硬化症共有的关键致病基因,并揭示了其在B细胞发育轨迹中的动态表达模式 | 研究中识别的关键基因名称在摘要中未明确列出,且样本来源和具体数量未详细说明 | 阐明B细胞在COVID-19和多发性硬化症发病机制中的共同分子机制,为开发更有效的治疗策略提供依据 | COVID-19患者和多发性硬化症患者的B细胞 | 生物信息学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序, 全基因组关联研究, 表达数量性状位点分析, 基因集富集分析, 伪时间分析 | 孟德尔随机化分析 | 单细胞RNA测序数据, 基因组关联数据, 表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 38 | 2026-03-24 |
Senescence-associated metabolic alterations aggravate calcific aortic valve disease
2026-Mar-17, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehag191
PMID:41841768
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研究论文 | 本研究揭示了衰老相关的NAD+代谢紊乱通过内皮细胞和巨噬细胞的不同机制,共同驱动钙化性主动脉瓣疾病的炎症和钙化过程 | 首次结合人类主动脉瓣的bulk RNA-seq和单细胞转录组学,系统绘制了NAD+通路图谱,并阐明了内皮细胞NAD+缺乏与巨噬细胞代谢多样性在疾病中的协同作用 | 动物模型和细胞实验的结果需要在更大规模的人类队列中进一步验证,且延迟治疗的疗效有限 | 探究细胞类型特异性的NAD+补救代谢紊乱是否驱动瓣膜炎症和钙化 | 人类主动脉瓣组织、Nampt基因敲除小鼠、瓣膜内皮细胞和巨噬细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞转录组学, 蛋白质组学, 孟德尔随机化 | 基因敲除小鼠模型 | 转录组数据, 蛋白质组数据, 遗传数据 | 涉及人类瓣膜组织、基因工程小鼠模型及UK Biobank队列数据 | NA | 单细胞转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 39 | 2026-03-24 |
ADAMTS7 promotes smooth muscle foam cell expansion in atherosclerosis
2026-Mar-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI187451
PMID:41609669
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研究论文 | 本研究揭示了ADAMTS7通过AP-1/PU.1/CD36调控轴驱动平滑肌细胞泡沫细胞形成,从而促进动脉粥样硬化的机制 | 首次在单细胞水平解析了ADAMTS7在人类颈动脉粥样硬化中的细胞特异性表达,并建立了平滑肌细胞和内皮细胞特异性基因修饰小鼠模型,揭示了ADAMTS7通过调控CD36表达促进平滑肌细胞摄取氧化低密度脂蛋白的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限;未涉及其他血管细胞类型(如巨噬细胞)中ADAMTS7的功能 | 阐明ADAMTS7促进动脉粥样硬化的细胞特异性机制 | 人类颈动脉粥样硬化样本、平滑肌细胞特异性Adamts7条件敲除和转基因小鼠、内皮细胞特异性Adamts7条件敲除和转基因小鼠 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, RNA-seq | 条件敲除小鼠模型, 转基因小鼠模型 | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据, 基因表达数据 | 人类颈动脉粥样硬化单细胞RNA-seq数据集(具体样本数未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 40 | 2026-03-24 |
Reactive astrocyte subpopulations with high Gfap and C4b expression in different Alzheimer's disease mouse models: Single-cell nuclear transcriptome analysis
2026-Mar-14, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-25-00789
PMID:41837502
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研究论文 | 本研究通过单细胞核转录组测序分析,在阿尔茨海默病小鼠模型中识别出具有高Gfap和C4b表达的反应性星形胶质细胞亚群,并揭示了其在疾病早期发病机制中的潜在作用 | 首次在阿尔茨海默病小鼠模型中,利用单细胞核转录组测序技术,识别出具有高Gfap和C4b表达的反应性星形胶质细胞亚群,并发现其与RNA剪接通路相关,为疾病异质性提供了新的细胞和分子基础 | 研究样本量较小(仅涉及4只阿尔茨海默病模型小鼠和1只对照小鼠),且仅基于小鼠模型,可能无法完全反映人类阿尔茨海默病的复杂性 | 探究阿尔茨海默病早期阶段的细胞异质性和细胞类型特异性分子扰动,以识别新的靶向治疗策略 | 阿尔茨海默病小鼠模型(载脂蛋白E4敲入和淀粉样前体蛋白/早老素1小鼠)的海马组织 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞核转录组测序 | NA | 转录组数据 | 4只阿尔茨海默病模型小鼠(3只8月龄淀粉样前体蛋白/早老素1小鼠和1只6月龄载脂蛋白E4敲入小鼠)和1只6月龄载脂蛋白E3敲入对照小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |