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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
21 2026-03-03
Integrated Bulk and Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals Mitochondrial Transporter Gene Programs in Human Spermatogonial Stem Cells
2026-Mar-02, Stem cell reviews and reports IF:4.5Q2
研究论文 本研究通过整合批量微阵列分析和单细胞RNA测序数据,揭示了人类精原干细胞中线粒体转运蛋白基因程序的独特表达模式 首次在人类精原干细胞中系统性地描述了线粒体转位酶复合物和转运蛋白基因的转录架构,并识别了关键的调控网络和miRNA-mRNA相互作用 研究样本量较小(每组3个生物学重复),且主要依赖于转录组数据,功能验证不足 探究人类精原干细胞中线粒体转运蛋白基因的转录调控网络及其在干细胞维持中的作用 人类精原干细胞富集群体和成纤维细胞 单细胞组学 NA 批量微阵列分析, 单细胞RNA测序 limma, WGCNA, STRING/cytoHubba 转录组数据 每组3个生物学重复的人类精原干细胞富集群体 NA 单细胞RNA-seq NA NA
22 2026-03-03
Single cell and multi-omics analysis reveal senescence-related molecular subtypes and a prognostic signature in clear cell renal cell carcinoma
2026-Mar-02, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据,揭示了透明细胞肾细胞癌中细胞衰老相关的分子亚型,并构建了一个基于衰老相关基因的预后风险评分模型 首次在ccRCC中系统表征细胞衰老特征,定义了两种基于衰老相关基因表达的新型分子亚型,并识别出ALDH18A1作为关键预后基因和潜在治疗靶点 研究主要基于转录组数据,需要进一步的实验验证来确认衰老相关特征的生物学功能 阐明细胞衰老在透明细胞肾细胞癌中的特征、临床意义及预后价值 透明细胞肾细胞癌患者组织样本 数字病理学 肾癌 单细胞RNA测序, 批量转录组测序 随机生存森林 转录组数据 TCGA-KIRC队列537例, E-MTAB-1980队列101例, CPTAC-ccRCC队列105例, 以及单细胞RNA测序数据集GSE222703和GSE210042 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
23 2026-03-03
Spatially resolved airway niches: mapping epithelial-immune microenvironments in asthma
2026-Mar, Expert review of respiratory medicine IF:2.9Q2
综述 本文综述了空间组学技术在哮喘研究中的应用,揭示了气道壁中上皮-免疫微环境的分子特征及其在疾病异质性和治疗反应中的作用 整合了多种空间组学技术(如Visium-HD、Xenium、CosMx SMI等)的数据,首次系统性地绘制了哮喘气道中IL-13富集的杯状细胞中心、肥大细胞-平滑肌环路等特定微环境,并强调了这些空间信息在传统解离分析中被忽略 临床广泛应用仍需降低检测成本、减少RNA扩散、统一FFPE工作流程,并需要在全球队列中进行多组学整合以提高可重复性和临床可操作性 通过空间组学技术解析哮喘气道中上皮-免疫微环境的分子构成与空间分布,以推动精准医疗发展 人类气道活检样本、离体肺切片以及小鼠哮喘模型 空间转录组学 哮喘 空间转录组学、多重成像蛋白质组学、空间代谢组学 NA 空间组学数据(转录组、蛋白质组、代谢组) NA 10x Genomics, NanoString, Bruker, Fluidigm, Ionpath 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 空间代谢组学 Visium-HD, Xenium, CosMx SMI, MERFISH, Imaging Mass Cytometry, MIBI, MALDI-MSI Visium-HD(空间转录组学), Xenium(原位基因表达), CosMx SMI(单分子成像), MERFISH(多重误差鲁棒荧光原位杂交), Imaging Mass Cytometry(成像质谱流式), MIBI(多重离子束成像), 高分辨率MALDI-MSI(基质辅助激光解吸电离质谱成像)
24 2026-03-03
Single-Cell and Multiomic Analysis Reveals Neutrophil Heterogeneity and Prognostic Value in Cervical Lesions
2026-Mar, Cancer science IF:4.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了宫颈病变中中性粒细胞的异质性,并建立了基于中性粒细胞浸润的风险模型用于预后预测 首次在宫颈癌中系统鉴定出五个中性粒细胞亚群(N0-N4),并发现N4亚群在疾病进展中显著增加,通过空间转录组学和组织微阵列分析证实其与肿瘤区域富集及促癌功能相关 样本量较小(仅20例宫颈活检样本),且研究主要基于观察性分析,缺乏体内功能验证实验 探究中性粒细胞在宫颈癌肿瘤微环境中的异质性及其在疾病进展和预后中的作用 宫颈活检样本(涵盖不同疾病阶段) 数字病理学 宫颈癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq),空间转录组学,组织微阵列分析,多组学分析 风险模型 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据,组织微阵列数据 20例宫颈活检样本 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
25 2026-03-03
Single cell RNA-seq characterization of non-fibrotic stromal wound repopulation in the rabbit
2026-Mar, Experimental eye research IF:3.0Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,在兔模型中探究了非纤维化角膜基质伤口愈合过程中的转录变化 首次通过单细胞RNA测序揭示了角膜基质细胞在非纤维化伤口愈合中的异质性及从静止态到成纤维细胞的连续转录轨迹 研究仅基于兔模型,结果可能不完全适用于人类;且仅关注了特定时间点(第7天和第28天)的转录变化 探究非纤维化角膜伤口愈合的分子机制,以预防角膜手术或损伤后的瘢痕形成 兔角膜基质细胞(包括静止态角膜细胞和伤口愈合过程中的成纤维细胞) 单细胞转录组学 角膜疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 兔角膜组织样本(包括对照组和损伤后第7天、第28天的时间点) NA 单细胞RNA-seq NA NA
26 2026-03-03
Targeting SPP1-CD44-Hedgehog Axis Elicits Therapeutic Effects in Hepatocellular Carcinoma by Suppressing Intratumoral Fibrosis
2026-Mar, Cancer science IF:4.5Q1
研究论文 本文通过转录组学、免疫组化和单细胞RNA测序分析,揭示了SPP1通过SPP1-CD44-GLI1轴促进肝细胞癌(HCC)内纤维化和肿瘤进展的机制 首次将SPP1-CD44-Hedgehog轴确定为HCC内纤维化的关键调控通路,并验证了其作为治疗靶点的潜力 研究主要基于体外和动物模型,临床转化效果需进一步验证 探究HCC内纤维化的分子机制并寻找潜在治疗靶点 肝细胞癌(HCC)组织和细胞 数字病理学 肝癌 转录组学分析、免疫组化、单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据、图像数据、单细胞RNA测序数据 372个HCC样本的转录组数据、103个HCC组织的免疫组化分析、228,564个活细胞的单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序 NA NA
27 2026-03-03
Synovial fibroblast responses to different types of injury resulting in cartilage repair or osteoarthritis
2026-Mar, Osteoarthritis and cartilage IF:7.2Q1
研究论文 本研究通过整合分析小鼠关节损伤模型的单细胞RNA测序数据,比较了滑膜成纤维细胞对不同类型和持续时间关节损伤的响应 揭示了滑膜成纤维细胞在关节表面损伤和创伤后骨关节炎模型中的异质性响应,包括谱系特异性转录因子的共表达特征 基于已发表的scRNA-seq数据,可能受原始实验设计和样本量的限制 比较不同关节损伤模型中滑膜成纤维细胞的响应机制,以指导关节修复和骨关节炎的未来研究 小鼠滑膜成纤维细胞 数字病理学 骨关节炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 多个小鼠关节损伤模型的数据集(JSI、DMM、ACLR模型,包含不同时间点) NA 单细胞RNA-seq NA NA
28 2026-03-03
The Role of CCR1 as a decisive factor for immune response activation versus suppression phenotypes in gastric cancer
2026-Mar, Neoplasia (New York, N.Y.)
研究论文 本研究探讨了趋化因子受体1(CCR1)在胃癌免疫微环境中的作用,发现其通过激活巨噬细胞中的NF-κB和MAPK通路,上调CXCL9和CXCL10,从而促进T细胞募集并抑制肿瘤生长 首次在胃癌中系统阐明了CCR1通过巨噬细胞调控T细胞浸润的分子机制,并利用单细胞和空间转录组学技术揭示了CCR1在巨噬细胞中的特异性表达模式 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床样本的验证仍需扩大;CCR1作为治疗靶点的具体药物开发路径尚未明确 探究CCR1在胃癌免疫微环境中促进或抑制肿瘤进展的双重作用 胃癌患者组织样本、CCR1基因敲除小鼠模型、巨噬细胞 肿瘤免疫学 胃癌 转录组分析、单细胞转录组学、空间转录组学、Western blotting、qRT-PCR、免疫荧光 NA 转录组数据、临床数据、图像数据 未明确样本数量,但包含患者分层数据、小鼠模型及体外实验 NA 单细胞转录组学, 空间转录组学 NA NA
29 2026-03-03
Experimental study of tumor-associated macrophage-derived SPP1 inhibit CD8+ T cells to promote Colorectal cancer progression
2026-Mar, Neoplasia (New York, N.Y.)
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了肿瘤相关巨噬细胞(TAM)来源的分泌磷蛋白1(SPP1)通过抑制CD8⁺ T细胞向Tc1细胞分化,从而促进结直肠癌进展的机制 首次在结直肠癌中鉴定出一个高表达SPP1的独特TAM亚群,并阐明了TAM来源的SPP1通过CD44介导的信号通路抑制CD8⁺ T细胞功能的具体分子机制 研究主要基于小鼠模型和体外实验,其在人类结直肠癌患者中的临床相关性及转化潜力仍需进一步验证 探究肿瘤相关巨噬细胞在结直肠癌免疫微环境中的调控作用及其分子机制 结直肠癌(CRC)肿瘤微环境中的肿瘤相关巨噬细胞(TAM)和CD8⁺ T细胞 肿瘤免疫学 结直肠癌 单细胞RNA测序,空间转录组学分析,体外共培养实验 小鼠结直肠癌模型(MC38细胞) 单细胞转录组数据,空间转录组数据 未明确提及具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
30 2026-03-03
Integrating single-cell and spatial transcriptomics to dissect mast-cell heterogeneity and arginine-metabolism-associated markers in BRCA
2026-Mar, Neoplasia (New York, N.Y.)
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序数据,揭示了乳腺癌中肥大细胞的异质性,并识别了与精氨酸代谢相关的标志物,特别是OAT基因在促进乳腺癌侵袭性中的作用 首次将精氨酸代谢与肥大细胞异质性及功能特化联系起来,并整合多组学数据识别了与预后相关的HAS和LAS亚群,以及关键基因OAT的功能验证 研究主要基于公共数据集和体外实验,缺乏体内模型验证,且样本来源可能受批次效应影响 解析乳腺癌中肥大细胞的异质性及其与精氨酸代谢相关的功能标志物 乳腺癌组织中的肥大细胞 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq Seurat, Monocle2, CellChat, hdWGCNA, LASSO-Cox, MiloR 基因表达数据 272,592个细胞(来自GSE161529数据集),以及TCGA和GSE42568的批量RNA-seq数据 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq NA NA
31 2026-03-03
The Poly(rC) binding protein 2 is required for spermatogenesis by regulating alternative splicing and mRNA stability
2026-Mar, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
研究论文 本研究揭示了RNA结合蛋白PCBP2通过调控关键转录本的mRNA稳定性和选择性剪接,在精子发生过程中发挥不可或缺的作用 首次在体内阐明了PCBP2在精子发生中的功能,并发现其通过招募hnRNPU和DDX5形成复合物来协调减数分裂和精子形成相关基因的mRNA命运 研究主要基于小鼠模型,其在人类中的确切功能机制和临床转化潜力仍需进一步验证 探究PCBP2在精子发生过程中的功能及其在非梗阻性无精子症中的作用机制 小鼠生殖细胞、人类睾丸组织(来自非梗阻性无精子症患者) 生殖生物学 男性不育症(非梗阻性无精子症) bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq (scRNA-seq), IP-MS, RIP-Seq NA RNA序列数据、蛋白质质谱数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
32 2026-03-03
Tamoxifen promotes metastasis of breast cancer via reshaping lipid-driven fibrotic microenvironments in the lung
2026-Mar, Neoplasia (New York, N.Y.)
研究论文 本研究揭示了长期使用他莫昔芬可能通过重塑肺部脂质驱动的纤维化微环境,促进雌激素受体阳性乳腺癌的肺转移 首次揭示长期他莫昔芬治疗通过改变肺部脂质代谢和纤维化微环境来促进乳腺癌肺转移的新机制,并提出了靶向脂质代谢作为潜在治疗策略 研究主要基于小鼠模型(PyMT和4T1同种移植模型),人类临床相关性有待进一步验证 探究长期他莫昔芬治疗对乳腺癌肺转移微环境形成的影响及其机制 雌激素受体阳性乳腺癌及其肺转移微环境 肿瘤生物学 乳腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、免疫荧光、流式细胞术 NA 基因表达数据、蛋白质表达数据、细胞表型数据 PyMT和4T1小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
33 2026-03-03
Revealing the function and mechanism of piRNA-related genes in bladder cancer through single-cell sequencing and methylation analyses and construction of prognostic features based on consensus clustering
2026-Mar, Current urology IF:0.9Q4
研究论文 本研究通过单细胞测序和甲基化分析揭示了piRNA相关基因在膀胱癌中的功能和机制,并基于共识聚类构建了预后特征 首次结合单细胞测序、甲基化分析和共识聚类技术,系统性地探索piRNA相关基因在膀胱癌中的功能、机制及预后价值,并构建了一个包含MAPK13、INHBA和LAMB2的三基因预后模型 研究主要基于公共数据库和体外实验,缺乏大规模的前瞻性临床队列验证,且对piRNA相关基因的具体调控网络和体内功能机制仍需进一步深入探索 探索PIWI-interacting RNA相关基因在膀胱癌发生发展中的功能、潜在机制及其预后价值 膀胱癌细胞和组织,以及相关的PIWI-interacting RNA相关基因 生物信息学与计算生物学 膀胱癌 单细胞测序,甲基化测序,差异甲基化位点测序,定量聚合酶链反应,共识聚类,机器学习 共识聚类,逻辑回归 基因表达数据,甲基化数据,单细胞测序数据 基于The Cancer Genome Atlas-Urothelial Bladder Carcinoma数据集,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq,甲基化测序 NA NA
34 2026-03-03
SMARCA4 deficiency in glioblastoma: Mitochondrial transfer from MSCs and the clinical dilemma in targeting the tumor microenvironment
2026-Mar, Neoplasia (New York, N.Y.)
研究论文 本研究探讨了SMARCA4在胶质母细胞瘤微环境中的作用,特别是其通过线粒体转移调节间充质基质细胞功能 首次揭示SMARCA4通过调控间充质基质细胞的线粒体转移影响胶质母细胞瘤进展,提出靶向该过程的新治疗策略 研究主要基于免疫缺陷异种移植模型,可能无法完全模拟人体内复杂的肿瘤微环境 探究SMARCA4表达与胶质母细胞瘤进展的相关性及其在肿瘤微环境中的功能 胶质母细胞瘤细胞、间充质基质细胞、免疫缺陷小鼠模型 数字病理学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序 免疫缺陷异种移植模型 RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
35 2026-03-03
Single-cell transcriptome analysis reveals a cellular immune response in common carp (Cyprinus carpio) infected with Aeromonas hydrophila
2026-Mar, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,全面探究了鲤鱼在感染嗜水气单胞菌后,其关键免疫器官头肾中的细胞免疫应答机制,特别关注了巨噬细胞在细胞水平的异质性、分化及分子调控网络 首次在鲤鱼中应用单细胞RNA测序技术,系统揭示了感染嗜水气单胞菌后头肾中巨噬细胞的异质性、分化轨迹和分子调控网络,为理解鱼类细胞免疫应答提供了新的视角 NA 探究鲤鱼在感染嗜水气单胞菌后的细胞免疫应答机制 鲤鱼(Cyprinus carpio)的头肾组织 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
36 2026-03-03
Molecular Mechanisms of Rotator Cuff Degeneration Identified by Spatial Transcriptomics and Multiplex Immunofluorescence
2026-Mar, Journal of orthopaedic research : official publication of the Orthopaedic Research Society IF:2.1Q2
研究论文 本研究利用空间转录组学和多重免疫荧光技术,探究了老年肩袖撕裂患者与年龄匹配对照组的肩袖组织中基因表达和空间异质性,旨在揭示关键分子通路 首次结合空间转录组学和多重免疫荧光技术,系统分析了肩袖撕裂组织的空间基因表达梯度及细胞相互作用,识别了区域特异性修复相关基因 样本量较小(每组10例),且仅针对老年患者,可能限制了结果的普适性 揭示肩袖撕裂的分子机制,识别潜在治疗靶点 老年肩袖撕裂患者和年龄匹配对照组的肩袖组织样本 数字病理学 肩袖撕裂 空间转录组学,多重免疫荧光 NA 空间转录组数据,免疫荧光图像 20例肩袖组织样本(10例患者,10例对照) NA 空间转录组学 NA NA
37 2026-03-03
Resveratrol as a Novel YAP Inhibitor Targeting Glioblastoma Progression and Sensitizing to Chemotherapy
2026-Mar, Cancer science IF:4.5Q1
研究论文 本研究探讨了天然化合物白藜芦醇作为新型YAP抑制剂,在靶向胶质母细胞瘤进展和增强化疗敏感性中的作用 首次发现天然化合物白藜芦醇能够抑制YAP表达,并证实其通过抑制上皮-间质转化来抑制胶质母细胞瘤的恶性表型,同时增强对替莫唑胺和卡莫司汀的化疗敏感性 研究主要基于体外细胞实验,缺乏体内实验验证,临床转化需要进一步研究 探究YAP在胶质母细胞瘤中的作用,并评估白藜芦醇作为YAP抑制剂在治疗中的潜力 胶质母细胞瘤细胞系(U-251 MG, U-87 MG)和患者来源的胶质母细胞瘤细胞 肿瘤生物学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序,shRNA基因沉默,功能测定(增殖、球体形成、迁移、侵袭、药物敏感性) NA 基因表达数据,细胞功能数据 未明确样本数量,使用了已发表的胶质母细胞瘤数据集、两种细胞系和患者来源细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
38 2026-03-03
Integrating feature selection with unsupervised deep embedding for clustering single-cell RNA-seq data
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 提出一个名为FSSC的统一框架,用于在单细胞RNA测序数据分析中联合进行特征选择和聚类 将特征选择与无监督深度嵌入集成,通过联合优化同时学习低维表示并选择紧凑的聚类判别基因,克服了传统方法将特征选择作为独立预处理步骤的局限性 未明确提及具体的数据集规模限制或计算资源要求 提高单细胞RNA测序数据聚类的准确性并识别有生物学意义的标记基因 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 零膨胀负二项式自编码器 基因表达数据 模拟和真实单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
39 2026-03-03
Evolutionary convergence and divergence of hippocampal cytoarchitecture between rodents and primates revealed by single-cell spatial transcriptomics
2026-Mar, National science review IF:16.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞空间转录组学分析,揭示了啮齿动物与灵长类海马体细胞结构的进化趋同与差异 首次利用单细胞空间转录组学技术,跨物种比较了猕猴、狨猴和小鼠海马体的转录组图谱,发现了灵长类特异性和层状特异性的谷氨酸能细胞类型,以及GABA能细胞的进化富集 研究主要基于转录组数据,功能验证相对有限;样本物种数量较少,可能未涵盖所有相关进化分支 探究海马体细胞类型和空间分布的跨物种进化模式,为理解海马体功能演化提供分子和细胞基础 猕猴、狨猴和小鼠的海马体组织 数字病理学 NA 单细胞空间转录组学分析, 单核RNA测序 NA 空间转录组数据, RNA-seq数据 多个物种(猕猴、狨猴、小鼠)的海马体样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞空间转录组学, 单核RNA-seq NA NA
40 2026-03-03
Single-cell advances in the investigation of the pathogenesis and treatment of brain metastasis
2026-Mar, Neuro-oncology advances IF:3.7Q2
综述 本文综述了近年来应用单细胞RNA测序技术研究脑转移瘤的进展,重点关注肿瘤异质性、肿瘤微环境以及治疗反应 系统总结了单细胞RNA-seq技术在脑转移瘤研究中的应用,整合了多个研究对肿瘤细胞转录特征、免疫细胞变化及微环境组成的发现 作为综述文章,未提出新的实验数据或模型,主要依赖现有研究的整合与分析 总结单细胞技术如何增进对脑转移瘤发病机制的理解,并探讨其对未来治疗策略的启示 脑转移瘤及其微环境中的肿瘤细胞、免疫细胞、血管细胞和基质细胞 数字病理学 脑转移瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
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