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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-01-05 |
Designing 5' UTR sequences improves the capacity of mRNA therapeutics in preclinical models of aging and obesity
2026-Jan-02, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.12.060
PMID:41485049
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研究论文 | 本研究通过设计5' UTR序列,在衰老和肥胖小鼠模型中提高了mRNA疗法的治疗潜力 | 发现核糖体蛋白mRNA的5' UTR(如RPS9)能增强合成mRNA在氧化应激条件下的蛋白输出,并改善衰老和肥胖模型中的免疫反应 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化需进一步验证;机制探索集中在LARP1/LARP4和TOP基序,可能忽略其他调控因素 | 优化mRNA疗法在衰老和肥胖个体中的应用效果 | 合成mRNA的5' UTR序列及其在细胞和小鼠模型中的功能 | 生物信息学与基因治疗 | 衰老与肥胖 | RNA-seq, scRNA-seq, Ribo-seq, CLIP-seq | NA | 转录组与翻译组数据 | 人类和小鼠细胞,以及衰老和高脂饮食小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 22 | 2026-01-05 |
XIAP-ULK1-mediated mitophagy modulates carnitine metabolism to mitigate diabetic kidney disease
2026-Jan, Autophagy
IF:14.6Q1
DOI:10.1080/15548627.2025.2581214
PMID:41139215
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研究论文 | 本研究探讨了XIAP-ULK1介导的线粒体自噬在调节肉碱代谢中的作用及其在缓解糖尿病肾病中的治疗潜力 | 揭示了XIAP通过K48连接的多聚泛素化导致ULK1降解,从而损害线粒体自噬并破坏肉碱代谢的新机制 | NA | 阐明线粒体自噬如何连接肉碱代谢通路至糖尿病肾病,并探索其治疗策略 | 糖尿病肾病患者的肾活检样本、糖尿病小鼠模型、高糖处理的肾小管上皮细胞 | NA | 糖尿病肾病 | 分子对接、RNA测序、单细胞RNA测序、液相色谱-质谱联用、免疫组织化学、免疫荧光、透射电子显微镜 | NA | 分子数据、细胞数据、动物模型数据、临床样本数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 23 | 2026-01-05 |
Single-cell multi-omic landscape reveals anatomical-specific immune features in adult and pediatric sepsis
2026-Jan, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-025-02345-x
PMID:41339491
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学分析揭示了成人和儿童脓毒症中解剖部位特异性的免疫特征 | 整合单细胞转录组、T细胞受体和B细胞受体测序、CITE-seq、bulk RNA测序和血浆蛋白质组学,首次系统描绘了脓毒症中解剖部位和年龄特异性的免疫程序 | 研究主要基于外周血样本,可能未完全反映局部感染部位的免疫状态;样本量虽较大,但外部验证队列规模有限 | 探究不同感染解剖部位如何塑造脓毒症的免疫反应,并识别潜在的精准免疫治疗靶点 | 成人和儿童脓毒症患者及对照个体的外周血单核细胞和血浆 | 单细胞多组学 | 脓毒症 | 单细胞转录组测序, 单细胞T细胞受体测序, 单细胞B细胞受体测序, CITE-seq, bulk RNA测序, 血浆蛋白质组学 | NA | 单细胞RNA-seq数据, 蛋白质组数据, 转录组数据 | 281名成人和儿童个体(脓毒症患者及对照),外加164名独立个体用于验证 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学, bulk RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 24 | 2026-01-05 |
CellPredX, a computational framework for cross-data type, cross-sample, and cross-protocol cell type annotation through domain adaptation and deep metric learning
2026-Jan, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013824
PMID:41481570
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研究论文 | 本文提出了一个名为CellPredX的计算框架,用于通过领域适应和深度度量学习实现跨数据类型、跨样本和跨协议的单细胞类型注释 | 提出了一个结构统一但参数自适应调整的半监督跨模态框架,集成了领域适应和深度度量学习,并引入了带有注意力机制的稀疏中心损失以增强判别性表示,同时包含一个基于梯度归因的解释器模块以提高模型的可解释性 | 未在摘要中明确说明 | 解决单细胞分析中跨异构数据集和模态的细胞类型注释难题 | scRNA-seq和scATAC-seq数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 | 领域适应,深度度量学习 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 25 | 2026-01-05 |
TDP2 drives immune evasion and metastatic progression in prostate cancer
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0339607
PMID:41481587
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和通路富集分析,探讨了TDP2在前列腺癌中通过调节肿瘤微环境促进免疫逃逸和转移进展的作用 | 首次揭示了TDP2作为肿瘤微环境中的关键调节因子,通过抑制M1巨噬细胞极化和树突状细胞成熟,以及富集EMT相关通路,驱动前列腺癌的免疫逃逸和转移 | NA | 探究TDP2在前列腺癌肿瘤微环境调节和疾病进展中的作用 | 前列腺癌细胞及肿瘤微环境中的免疫细胞和基质细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,通路富集分析 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 26 | 2026-01-05 |
A non-invasive urinary diagnostic signature for diabetic kidney disease revealed by machine learning and single-cell analysis
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0340096
PMID:41481634
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研究论文 | 本研究通过整合尿液和肾脏单细胞测序数据与机器学习,开发了一种用于糖尿病肾病(DKD)的非侵入性尿液诊断生物标志物组合 | 建立了一个计算流程来区分尿沉渣中肾脏来源的细胞,并利用机器学习筛选出与肾小管损伤相关的三基因生物标志物组合(PDK4、RHCG、FBP1),实现了对DKD的高精度非侵入性诊断 | 研究主要基于公共数据库的转录组数据,需要在更大规模的独立队列中进行前瞻性临床验证 | 开发用于糖尿病肾病(DKD)的非侵入性诊断生物标志物 | 糖尿病肾病(DKD)患者及多种慢性肾脏病患者的尿液和肾脏组织样本 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序,机器学习 | 机器学习模型 | 单细胞转录组数据,批量转录组数据 | 2,089个尿液来源细胞,多个独立队列验证 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 27 | 2026-01-05 |
Mechanistic Insights into Threonine Tyrosine Kinase Mediated Cell Cycle Regulation in Triple-negative Breast Cancer
2026 Jan-Feb, Cancer genomics & proteomics
IF:2.6Q3
DOI:10.21873/cgp.20563
PMID:41482351
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研究论文 | 本研究探讨了苏氨酸酪氨酸激酶(TTK)在三阴性乳腺癌(TNBC)中通过调控细胞周期和Wnt/β-catenin信号通路促进肿瘤进展的机制 | 通过整合bulk和单细胞RNA测序数据,结合功能实验,揭示了TTK在TNBC细胞周期G1/S和G2/M转换中的动态调控作用及其与β-catenin-Cyclin D1信号通路的关联 | 研究主要基于体外细胞实验和生物信息学分析,缺乏体内动物模型验证,且临床样本的回顾性分析可能受限于数据集的异质性 | 阐明TTK在三阴性乳腺癌中的致癌机制,并评估其作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力 | 三阴性乳腺癌细胞系、正常乳腺上皮细胞以及公共数据库中的bulk和单细胞RNA测序数据 | 癌症生物学 | 三阴性乳腺癌 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, siRNA敲低, 细胞增殖实验, 集落形成实验, 迁移实验, 细胞周期分析, 免疫荧光, Western blotting, 功能富集分析, 蛋白质-蛋白质相互作用分析, 伪时间轨迹分析 | NA | RNA测序数据, 细胞实验数据, 蛋白质表达数据 | 未明确具体样本数量,但使用了TNBC细胞系、正常乳腺上皮细胞以及公共数据库中的乳腺癌数据集 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 28 | 2026-01-05 |
Exosomes Transfer ST6GAL1-mediated Therapeutic Resistance in Rectal Cancer Cells
2026 Jan-Feb, Cancer genomics & proteomics
IF:2.6Q3
DOI:10.21873/cgp.20558
PMID:41482354
|
研究论文 | 本研究探讨了外泌体如何通过转移ST6GAL1蛋白在直肠癌细胞间传播治疗抵抗性 | 首次揭示了外泌体介导的ST6GAL1蛋白转移是直肠癌治疗抵抗的新机制 | 研究主要基于体外细胞系和类器官模型,缺乏体内验证 | 探究直肠癌治疗抵抗的分子机制 | 直肠癌细胞系和类器官 | 癌症生物学 | 直肠癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术 | NA | RNA测序数据、流式细胞数据 | 4个重复实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 29 | 2026-01-05 |
Pan-cancer analysis of RNA expression signatures associated with cancer tissue architecture
2026-Jan, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03233-9
PMID:41107552
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研究论文 | 本研究通过非负矩阵分解分析癌症基因组图谱项目中28种癌症类型的RNA表达数据,识别出七种与癌症组织结构相关的签名,揭示了组织结构在癌症中的普遍性和特异性特征 | 首次在泛癌层面系统分析癌症组织结构相关的RNA表达签名,并利用空间转录组学和实验模型验证,发现网络形成胶原与肾细胞癌患者生存的强相关性 | 研究基于现有公共数据集,可能受样本选择和测序技术限制,且实验验证主要集中在肾细胞癌,其他癌症类型的机制探索有限 | 探究癌症组织结构在泛癌水平上的RNA表达特征及其与癌症病理特征的关系 | 28种癌症类型的RNA表达数据,包括癌症基因组图谱项目和泛癌全基因组分析数据 | 生物信息学 | 泛癌分析 | RNA-seq,空间转录组学 | 非负矩阵分解 | 基因表达数据 | 来自28种癌症类型的多个样本,具体数量未在摘要中明确 | NA | bulk RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 30 | 2026-01-05 |
Plasma apolipoprotein E protein attenuates pulmonary fibrosis through LRP1 and PLAU dual receptor-mediated TGF-β/Smad inhibition
2025-Dec-29, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.12.045
PMID:41475664
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研究论文 | 本研究揭示了血浆载脂蛋白E(apoE)通过双重受体LRP1和PLAU抑制TGF-β/Smad信号通路,从而减轻肺纤维化的新机制,并提出了LXR激动剂RGX-104作为潜在治疗策略 | 首次发现血浆apoE是肺纤维化的因果性保护因子,并阐明其通过LRP1和PLAU双重受体协同作用抑制TGF-β/Smad信号通路的新机制;利用CRISPR工程APOE缺陷犬模型和单细胞转录组学等技术进行跨物种验证和机制解析 | 研究主要基于动物模型和体外实验,其临床转化效果和长期安全性仍需进一步的人体临床试验验证 | 识别肺纤维化的新治疗靶点并阐明血浆apoE减轻该疾病的机制 | 特发性肺纤维化(IPF) | NA | 肺纤维化 | 整合荟萃分析、双样本孟德尔随机化、CRISPR基因编辑、单细胞转录组学、SPIDER技术、表面等离子体共振(SPR) | NA | 血浆队列数据、基因数据、转录组数据、蛋白质相互作用数据 | 七个血浆队列(具体样本数未明确)、APOE缺陷犬、Apoe‒/‒小鼠、人精准切割肺切片 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 31 | 2026-01-05 |
Myeloid immune checkpoint blockade overcomes antibiotic resistance in bone infection by enhancing efferocytosis and suppressing MSC PANoptosis
2025-Dec-29, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2025.101348
PMID:41483713
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了抗生素耐药性骨感染中巨噬细胞与间充质干细胞之间失调的免疫-基质相互作用机制 | 首次发现抗生素耐药性骨感染中SIRPα-Thbs1-CD47轴介导的巨噬细胞检查点机制,并证明靶向该轴可恢复胞葬作用、减轻炎症并促进骨再生 | 研究主要基于动物模型和体外实验,尚未在临床患者中进行验证 | 阐明抗生素耐药性骨感染中骨免疫平衡失调的细胞与分子机制 | 感染骨组织中的巨噬细胞、间充质干细胞和中性粒细胞 | 单细胞组学 | 骨感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 101,336个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 32 | 2026-01-05 |
Expression patterns and clinical implications of chaperonin subunit 3 mRNA and protein in laryngeal squamous cell carcinoma
2025-Dec-24, World journal of clinical oncology
IF:2.6Q3
DOI:10.5306/wjco.v16.i12.112161
PMID:41480162
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研究论文 | 本研究探讨了伴侣蛋白亚基3(CCT3)在喉鳞状细胞癌(LSCC)中的表达模式、临床意义及其对癌细胞生长的影响 | 首次通过整合多数据库mRNA表达数据、单细胞RNA-seq验证、免疫组化分析及CRISPR基因敲除功能实验,系统揭示了CCT3在LSCC中的致癌作用及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 临床样本量相对有限(88例免疫组化样本),且临床参数亚组分析未发现显著差异,需更大规模队列验证 | 探究CCT3在喉鳞状细胞癌中的表达特征、临床相关性及其对癌细胞生长的调控机制 | 喉鳞状细胞癌(LSCC)组织样本(269例mRNA数据、88例蛋白数据)及LSCC细胞系 | 数字病理学 | 喉癌 | 单细胞RNA-seq, 免疫组化, CRISPR基因敲除, 基因集富集分析, 蛋白质相互作用网络构建 | NA | mRNA表达数据, 单细胞RNA-seq数据, 免疫组化图像数据 | 269例LSCC组织(mRNA数据), 88例临床样本(30例LSCC vs 58例非LSCC,蛋白数据) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 33 | 2026-01-05 |
Predictive markers for the efficacy of CAR T-cell therapy: the interplay between CAR T-cell fitness and systemic immunity
2025-Dec-23, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2025017873
PMID:41061151
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综述 | 本文探讨了CAR T细胞疗法疗效的预测标志物,重点关注CAR T细胞适应性与系统性免疫之间的相互作用 | 整合了单细胞转录组学、蛋白质组学分析和细胞因子多功能性检测等新兴技术,结合机器学习方法,用于识别预测性生物标志物并优化治疗策略 | NA | 识别和优化CAR T细胞疗法的预测性生物标志物,以改善患者分层和治疗效果 | CAR T细胞疗法在复发或难治性淋巴恶性肿瘤患者中的应用 | 机器学习 | 淋巴恶性肿瘤 | 单细胞转录组学、蛋白质组学分析、细胞因子多功能性检测 | 机器学习 | 转录组、蛋白质组、细胞因子数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 34 | 2026-01-05 |
The Sixth Annual Symposium of the Midwest Aging Consortium
2025-Dec-22, The journals of gerontology. Series A, Biological sciences and medical sciences
DOI:10.1093/gerona/glaf280
PMID:41429578
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会议记录 | 本文记录了中西部衰老联盟第六届年度研讨会的活动内容,重点展示了衰老研究领域的跨学科合作、新机制发现及前沿技术应用 | 强调了区域合作平台在整合衰老研究资源、促进早期研究人员参与及加速临床转化方面的创新作用 | NA | 促进衰老科学研究的跨学科合作与临床转化 | 衰老机制、临床干预策略及研究方法学 | NA | 老年疾病 | 单细胞转录组学、空间转录组学、代谢组学、类器官培养 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 35 | 2026-01-05 |
Guardians within: Cross-talk between the gut microbiome and host immune system
2025-Dec-22, World journal of gastrointestinal pathophysiology
DOI:10.4291/wjgp.v16.i4.111245
PMID:41479870
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综述 | 本文综述了肠道微生物群与宿主免疫系统之间的复杂互作,探讨了微生物如何影响免疫细胞分化、调节炎症反应并维持免疫稳态 | 整合了宏基因组学、代谢组学和单细胞测序等最新技术进展,深入揭示了微生物-免疫轴的作用机制,为基于微生物组的治疗策略开辟了新途径 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据,且微生物-免疫互作的因果机制仍需进一步实验验证 | 探讨肠道微生物群与宿主免疫系统之间的互作关系及其在健康和疾病中的作用 | 肠道微生物群、宿主免疫细胞(如巨噬细胞、树突状细胞、自然杀伤细胞、先天淋巴细胞、T细胞、B细胞)及其代谢产物(如短链脂肪酸) | NA | 自身免疫性疾病、炎症性疾病、癌症 | 宏基因组学、代谢组学、单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 36 | 2026-01-05 |
Recovering gene regulatory networks in single-cell multi-omics data with PRISM-GRN
2025-Dec-11, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280757.125
PMID:41067887
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研究论文 | 本文提出PRISM-GRN,一种贝叶斯模型,用于从单细胞多组学数据中恢复基因调控网络 | PRISM-GRN创新性地将已知GRN、scRNA-seq和scATAC-seq数据整合到概率框架中,采用基于生物可解释机制的架构,能处理非配对组学数据和有限先验信息 | NA | 从单细胞多组学数据中重建细胞类型特异性基因调控网络 | 基因调控网络 | 机器学习 | NA | scRNA-seq, scATAC-seq | 贝叶斯模型 | 单细胞多组学数据 | 四个基准数据集 | NA | single-cell RNA-seq, single-cell ATAC-seq | NA | NA |
| 37 | 2026-01-05 |
Cell-type- and chromosome-specific chromatin landscapes and DNA replication programs of Drosophila testis tumor stem cell-like cells
2025-Dec-10, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280809.125
PMID:41371963
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研究论文 | 本研究开发了细胞类型特异性基因组技术,分析了果蝇睾丸肿瘤干细胞样细胞的转录组、组蛋白修饰模式和复制时序 | 开发了细胞类型特异性染色质分析测定法,首次在体内绘制了GSC样和CySC样细胞的H3K4me3、H3K27me3和H3K9me3富集区域,并整合了转录组、染色质和复制时序数据,揭示了GSC样细胞与体细胞谱系不同的复制程序 | NA | 研究成年干细胞在体内的转录、染色质和复制时序特征,以理解基因组调控差异 | 果蝇睾丸中的生殖干细胞样细胞和体细胞囊肿干细胞样细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序,细胞类型特异性染色质分析测定 | NA | 转录组数据,组蛋白修饰数据,复制时序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 38 | 2026-01-05 |
Protocol for reconstructing spatially aware receptor-TF-target signaling cascades using spatial transcriptomics
2025-Dec-10, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104237
PMID:41385380
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研究论文 | 本文介绍了一种使用SpaGRN框架从空间转录组学数据重建空间感知的受体-转录因子-靶点信号级联的协议 | 通过整合细胞外信号和空间依赖性,克服了传统方法忽视空间约束的局限,实现了信号通路的系统映射 | NA | 开发一种从空间转录组学数据推断基因调控网络的协议 | 复杂组织如发育胚胎和肿瘤中的信号通路 | 空间转录组学 | 肿瘤 | 空间转录组学 | 统计框架(SpaGRN) | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 39 | 2026-01-05 |
Ketogenic diet impairs NK cell cytotoxic function in colorectal cancer liver metastasis by inducing ferroptosis via suppression of the p62-Keap1-Nrf2 pathway
2025-Dec-10, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2025.103969
PMID:41385828
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研究论文 | 本研究揭示了生酮饮食通过诱导铁死亡损害NK细胞功能,从而促进结直肠癌肝转移的机制 | 首次阐明了生酮饮食通过p62-Keap1-Nrf2通路诱导NK细胞铁死亡,进而促进癌症转移的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人体临床验证尚不充分 | 探究生酮饮食对结直肠癌肝转移的影响及其免疫调控机制 | 结直肠癌肝转移小鼠模型、患者肿瘤微环境NK细胞 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、非靶向代谢组学、免疫荧光染色 | 小鼠肿瘤模型 | 单细胞转录组数据、代谢组数据、流式细胞数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 40 | 2026-01-05 |
Pig and human adult hematopoietic stem and progenitor cells are overall transcriptionally similar
2025-Dec-01, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2025.105334
PMID:41338433
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了猪骨髓造血干细胞和祖细胞在转录组水平上与人类高度相似,并提供了其分选鉴定策略 | 首次在单细胞分辨率下系统比较猪与人类造血干细胞和祖细胞的转录组相似性,并鉴定出进化保守的造血调控因子 | 研究主要基于转录组数据,功能验证实验相对有限,且样本来源单一(仅骨髓) | 探究猪造血干细胞和祖细胞的转录组特征及其与人类的相似性,为异种移植和造血嵌合体研究提供基础 | 猪骨髓造血干细胞和祖细胞(HSPCs) | 单细胞组学 | 造血系统疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量(猪骨髓细胞) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |