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当前共找到 45427 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-11-07 |
Dysregulated retinal DPP10 expression with single cell-based next genomic sequencing profiling in X-linked juvenile retinoschisis
2026-Dec, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2026.111287
PMID:42874762
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序分析Rs1敲入小鼠模型视网膜，发现DPP10在光感受器中随疾病进展显著上调，并验证其作为XLRS循环生物标志物的潜力 | 首次在XLRS小鼠模型中利用单细胞RNA测序揭示视杆光感受器转录失调，发现DPP10进行性上调并与细胞应激相关，且循环DPP10在患者中显著升高 | 研究主要基于小鼠模型和Y79细胞系，人体视网膜组织验证有限，DPP10作为生物标志物的临床适用性需更大样本验证 | 阐明RS1突变诱导的细胞类型特异性转录重塑机制，并探索DPP10作为XLRS生物标志物的潜力 | CRISPR/Cas9构建的Rs1敲入小鼠模型、Y79视网膜细胞系、XLRS患者血液样本 | 数字病理学 | X连锁青少年视网膜劈裂症 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色, 定量PCR, 蛋白质印迹, siRNA敲低 | CRISPR/Cas9基因编辑小鼠模型, Y79细胞模型 | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 22 | 2026-11-07 |
pH/ROS dual-responsive SmartGel-Cas9/TRPV4 for autophagy regulation in intervertebral disc degeneration
2026-Dec, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2026.103768
PMID:42990627
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研究论文 | 本研究开发了一种pH/ROS双响应SmartGel平台，用于局部递送CRISPR-Cas9 RNP并抑制TRPV4，以调控椎间盘退变中的自噬 | 开发了基于GelMA/PBA的pH/ROS双响应SmartGel，可在疾病微环境下释放Cas9/sgRNA，实现局部CRISPR-Cas9 RNP递送与TRPV4抑制的协同治疗 | 研究主要基于大鼠模型和体外细胞实验，尚未在大型动物或临床样本中验证；对CaMKKβ-AMPK-mTOR通路的上游调控机制仍需进一步阐明 | 探究pH/ROS双响应SmartGel-Cas9/TRPV4系统通过调控自噬与钙信号通路减缓椎间盘退变的潜力与机制 | 髓核细胞与大鼠椎间盘退变模型 | 基因治疗、纳米医学、骨科研究 | 椎间盘退变 | CRISPR-Cas9基因编辑、scRNA-seq、蛋白质组学分析 | NA | 图像、文本、组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、蛋白质组学 | NA | NA |
| 23 | 2026-11-07 |
Fine mapping of early adipogenesis identifies committed progenitors with dual white and beige potential
2026-Nov-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.118086
PMID:42992136
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研究论文 | 该研究通过平行白色和米色脂肪生成分化及单细胞转录组学，精细定位早期脂肪生成过程，发现具有白色和米色双重潜能的定向祖细胞 | 揭示了白色和米色分化共享转录状态连续体，鉴定出ICAM1阳性定向祖细胞同时贡献白色和米色表型，提出早期微环境重塑启动成熟细胞可塑性的模型 | 仅使用六名健康受试者的皮下脂肪祖细胞，样本量有限，未涉及年龄、肥胖和胰岛素抵抗等生理病理状态下的验证 | 探究脂肪组织产热能力个体差异的细胞基础，精细定位早期脂肪生成过程中的定向祖细胞 | 六名健康受试者的皮下脂肪祖细胞 | 单细胞转录组学 | 肥胖 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 六名健康受试者的皮下脂肪祖细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 24 | 2026-11-07 |
Mechanosensing channels PIEZO1 and PIEZO2 regulate mitral valve serotonin-mediated homeostasis and pathophysiology
2026-Nov-06, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvag190
PMID:42687771
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研究论文 | 该研究探讨机械敏感钙通道PIEZO1和PIEZO2通过5-HT机制在正常二尖瓣稳态和二尖瓣反流病理生理中的作用 | 首次在二尖瓣反流中研究PIEZO1和PIEZO2，揭示了机械转导、5-HT生成与受体信号及胶原合成之间的新联系 | 摘要未明确说明样本量有限或体外实验的局限性，但研究主要基于体外细胞实验和少量临床样本 | 研究PIEZO1和PIEZO2是否通过5-HT机制介导正常二尖瓣稳态和二尖瓣反流的病理生理 | 人正常二尖瓣和二尖瓣反流瓣膜样本及二尖瓣间质细胞 | 心血管疾病研究 | 二尖瓣反流 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、Western blot、细胞培养、生物反应器 | NA | 单细胞转录组数据、图像、蛋白质数据 | 9例二尖瓣反流和5例正常二尖瓣样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 25 | 2026-11-07 |
Acetyltransferase MOF Regulates Macrophage Inflammation in Abdominal Aortic Aneurysms
2026-Nov-06, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.126.329212
PMID:42817883
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研究论文 | 该研究揭示了乙酰转移酶MOF通过调控巨噬细胞炎症反应在腹主动脉瘤发展中的作用 | 首次发现MOF在腹主动脉瘤巨噬细胞中表达上调，并通过增加H4K16ac修饰促进NF-κB介导的炎症基因转录，靶向抑制MOF通路可减轻腹主动脉瘤发展 | 研究主要基于小鼠模型和人类组织样本的体外分析，尚未进行临床试验验证；MOF抑制剂MG-149的长期安全性和特异性仍需进一步评估 | 探究MOF在腹主动脉瘤形成过程中对巨噬细胞炎症反应的调控机制，并评估靶向MOF通路治疗腹主动脉瘤的潜力 | 人类腹主动脉瘤组织和对照组织、小鼠腹主动脉瘤模型（Ang II诱导和猪胰腺弹性蛋白酶诱导） | 心血管疾病 | 腹主动脉瘤 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、染色质免疫沉淀 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞数据、染色质免疫沉淀数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 26 | 2026-11-07 |
Pancreatic α cells function as MHC class II-dependent antigen-presenting cells in type 1 diabetes
2026-Nov-06, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aei0410
PMID:42981408
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研究论文 | 该研究揭示胰腺α细胞在1型糖尿病进展中获得MHC-II依赖的抗原呈递能力，并通过JAK-STAT通路诱导MHC-II表达，促进抗原特异性CD4 T细胞活化 | 首次发现胰腺α细胞在T1D中作为非专业抗原呈递细胞，通过JAK-STAT依赖的MHC-II诱导机制发挥作用，拓展了对自身免疫性糖尿病中抗原呈递机制的理解 | 摘要中未明确说明研究的具体局限性 | 探究胰腺α细胞在1型糖尿病炎症胰岛中是否参与抗原呈递及其机制 | 非肥胖糖尿病（NOD）小鼠和人类1型糖尿病胰岛中的胰腺α细胞 | 单细胞组学，免疫学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序，免疫染色 | NA | 单细胞RNA测序数据，图像 | NOD小鼠和人类T1D胰岛的单细胞RNA测序数据集（具体样本量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 27 | 2026-11-07 |
Hoxa10 governs lifelong skeletal stem cell maintenance and bone repair
2026-Nov-06, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aeg2088
PMID:42981418
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研究论文 | 本文通过诱导性基因敲除、谱系追踪、单细胞转录组学和损伤模型，揭示Hoxa10作为细胞自主调控因子维持骨骼干细胞身份和骨再生能力。 | 首次将远端Hox基因Hoxa10鉴定为骨骼干细胞维持的细胞自主调控因子，揭示其通过抑制过早成骨、成脂和成软骨分化并促进III型胶原产生和胶原纤维排列来维持干细胞未分化状态，且发现该调控程序在人类原代SSPCs中保守。 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究维持骨骼干细胞和祖细胞身份及骨再生能力的转录调控程序 | 小鼠骨骼干细胞和祖细胞（SSPCs）及人类原代SSPCs | 单细胞转录组学, 骨骼生物学, 再生医学 | 骨骼疾病, 骨质疏松, 骨折愈合障碍 | 诱导性基因敲除, 谱系追踪, 单细胞转录组学, 损伤模型 | NA | 单细胞转录组数据, 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 28 | 2026-11-07 |
Vascular nexus glia regulates vascular homeostasis and undergoes dynamic remodelling in deep vein thrombosis
2026-Nov-06, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvag180
PMID:42704474
|
研究论文 | 该研究发现并表征了血管外膜中一种保守的血管连接胶质细胞（VNG）网络，揭示其在血管稳态维持中的作用及在深静脉血栓形成过程中的动态重塑 | 首次鉴定出大型血管外膜中保守的血管连接胶质细胞（VNG）群体，揭示其依赖Suz12的表观遗传发育机制，并通过时间分辨单细胞转录组和组织透明化技术首次描绘其在深静脉血栓中的双相表型转变 | 研究主要基于小鼠模型，人类血管中VNG的功能验证有限，且Suz12缺失导致血管代谢紊乱的具体分子机制尚需进一步阐明 | 探究血管壁中是否存在特化的胶质细胞群体及其在病理应激下的分子和形态重塑规律 | 人类和小鼠大型血管外膜中的胶质细胞、hGFAP-Cre;tdTomato报告小鼠、MADM小鼠、小鼠深静脉血栓模型 | 单细胞组学、血管生物学、神经血管界面 | 深静脉血栓、静脉血栓栓塞性疾病、心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、组织透明化、跨组织转录组整合分析、遗传谱系追踪、MADM系统 | 小鼠模型（hGFAP-Cre;tdTomato、MADM、深静脉血栓模型） | 单细胞转录组数据、图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 29 | 2026-11-07 |
Atherosclerotic plaque fibroblasts derive from adventitial and medial Pdgfra-lineage-positive cells and predominantly maintain fibroblast identity
2026-Nov-06, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvag183
PMID:42713730
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研究论文 | 通过54个单细胞RNA测序文库的荟萃分析及Pdgfra谱系追踪小鼠，揭示动脉粥样硬化斑块中成纤维细胞的起源、身份与命运，发现其主要来源于外膜和中膜Pdgfra阳性细胞并维持成纤维细胞身份 | 首次通过大规模单细胞转录组荟萃分析结合Pdgfra-CreERT2谱系追踪小鼠系统定义斑块成纤维细胞身份（Pdgfra、Pi16、Cygb、Serpinf1），揭示斑块成纤维细胞双起源（主要外膜Pdgfra+祖细胞、少量中膜Pdgfra+Myh11+平滑肌细胞），鉴定五种小鼠动脉成纤维细胞亚群及人特异亚群，发现内皮样成纤维细胞与斑块不稳定性相关 | 研究主要基于小鼠模型和公共单细胞数据荟萃分析，人特异性成纤维细胞亚群的功能验证有限；内皮样成纤维细胞向内皮细胞转变的分子机制尚未完全阐明；样本来源和数量可能影响亚群鉴定的稳健性 | 阐明动脉粥样硬化斑块中成纤维细胞的身份、起源及在斑块进展中的命运 | 小鼠动脉粥样硬化模型（Ldlr-/-小鼠）的主动脉、外膜和斑块组织，以及人类对照和动脉粥样硬化动脉组织 | 单细胞组学、心血管生物学 | 心血管疾病、动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序、谱系追踪、伪时间分析、跨物种整合分析 | Pdgfra-CreERT2/tdTomato谱系报告小鼠、Myh11谱系报告小鼠、Cdh5谱系报告小鼠、Ldlr-/-动脉粥样硬化小鼠模型 | 单细胞转录组数据、图像 | 54个单细胞RNA测序文库，包括小鼠和人类对照及动脉粥样硬化动脉样本、小鼠外膜和斑块样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 30 | 2026-11-07 |
RUNX3-ERG Cooperation Orchestrates Endothelial Gene Regulation and Vascular Homeostasis
2026-Nov-06, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.327641
PMID:42841196
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研究论文 | 该研究揭示了RUNX3与ERG协同调控内皮细胞基因表达及血管稳态的机制 | 首次证明RUNX3是内皮细胞中的关键转录协调因子，通过与ERG及染色质调控因子在ETS:RUNX基序上整合，双向调控血管生成与稳定性相关基因 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类样本仅通过单细胞转录组分析进行验证，缺乏直接的人体功能实验证据 | 阐明RUNX3在内皮细胞中的血管功能及其转录调控机制 | 内皮特异性RUNX3敲除小鼠、小鼠视网膜血管、人动静脉畸形样本 | 分子生物学、血管生物学 | 癌症、血管畸形、视网膜病变 | ATAC-seq、co-IP、 proximity ligation assay、EMSA、ChIP-qPCR、单细胞转录组分析 | NA | 图像、文本、测序数据 | NA | NA | 单细胞转录组测序、ATAC-seq、ChIP-qPCR | NA | NA |
| 31 | 2026-11-07 |
Mast Cell-Derived CCL2 Exacerbates Endometriosis Pain via Binding to CCR4
2026-Nov-06, Omics : a journal of integrative biology
IF:2.2Q3
DOI:10.1177/15578100261503774
PMID:42992652
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研究论文 | 本文研究了肥大细胞来源的CCL2通过结合神经元CCR4加剧子宫内膜异位症疼痛的机制 | 首次揭示肥大细胞来源的CCL2通过激活神经元CCR4促进神经敏化，从而导致子宫内膜异位症疼痛，并提出CCL2/CCR4作为新的治疗靶点 | 摘要中未明确说明研究的具体局限性 | 探究肥大细胞和CCL2在子宫内膜异位症神经敏化中的作用机制 | 子宫内膜异位症患者的异位和在位子宫内膜组织、对照的正常子宫内膜组织、子宫内膜间质细胞、肥大细胞、神经元以及EMs大鼠模型 | 数字病理学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、生物信息学分析、免疫组织化学、细胞共培养、动物模型实验 | NA | 单细胞转录组数据、组织图像、临床疼痛评分 | 公共scRNA-seq数据集（GSE179640）以及EMs患者和对照的子宫内膜组织样本（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 32 | 2026-11-07 |
DeSCENT: Deconvolutional Single-Cell RNA-seq Enhances Transcriptome-based Cancer Survival Analysis
2026-Nov-06, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag810
PMID:42993079
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研究论文 | 提出DeSCENT方法，从bulk RNA-seq数据生成基于参考的细胞表达谱，并结合两种表征进行癌症生存预测 | 将bulk RNA-seq反卷积得到的细胞表达谱与bulk表征结合用于生存预测，弥补单细胞数据缺乏生存信息的不足 | 仅在转录组数据场景下评估，外部验证性能低于内部评估，积分Brier分数结果不一致 | 利用细胞水平的表达表征增强基于转录组的癌症生存分析 | TCGA中八种癌症队列的患者样本 | 计算生物学 | 泛癌 | bulk RNA-seq反卷积、单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | TCGA八种癌症队列（具体样本量未说明） | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 33 | 2026-11-07 |
Decoding transcriptional, metabolic, and cell death signatures in osteoarthritis and endemic osteoarthritis at single-cell resolution
2026-Nov-05, Bone & joint research
IF:4.7Q1
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研究论文 | 该研究在单细胞分辨率下比较了骨关节炎（OA）和Kashin-Beck病（KBD）软骨细胞的转录、代谢和细胞死亡特征 | 首次在单细胞水平系统比较OA和KBD的软骨细胞异质性、代谢活动和细胞死亡特征，揭示了两种疾病不同的疾病特异性分子图谱 | 样本量有限（17例软骨样本），关键发现虽经免疫组化和qRT-PCR验证，但缺乏功能实验验证；未涉及其他关节组织或更大队列验证 | 探究OA和KBD在单细胞分辨率下细胞异质性、代谢和细胞死亡特征的分子差异 | 人软骨样本中的软骨细胞（来自3例健康对照、8例OA患者和6例KBD患者） | 单细胞转录组学 | 骨关节炎、Kashin-Beck病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫组化染色、实时定量PCR | Louvain聚类算法 | 单细胞转录组数据、图像、文本 | 139,943个软骨细胞，来自17例人软骨样本（3例健康对照、8例OA、6例KBD） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 34 | 2026-11-07 |
Epigenetic Activation of ANGPTL4 Drives EBV-Negative Gastric Cancer via Neutrophil Recruitment and NET Release via Stabilizing ANXA5
2026-Nov-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.78595
PMID:42985843
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研究论文 | 该文通过多组学整合分析揭示了EBV感染通过ANGPTL4启动子高甲基化沉默其表达，而EBV阴性胃癌中低甲基化介导的ANGPTL4过表达通过招募中性粒细胞和促进NET释放驱动肿瘤进展的分子机制 | 首次揭示EBV感染诱导ANGPTL4启动子高甲基化导致其在EBVaGC中转录沉默，而EBVnGC中低甲基化介导ANGPTL4过表达；阐明了cANGPTL4通过NF-κB/CXCL8轴招募肿瘤相关中性粒细胞并直接结合稳定ANXA5促进NET释放的新机制；提出ANGPTL4作为EBVnGC潜在干预靶点 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究EBVaGC与EBVnGC亚型差异的分子机制，以及ANGPTL4在免疫微环境中的亚型特异性表观遗传调控和生物学功能 | EBV阳性与EBV阴性胃癌患者样本及胃癌细胞 | 数字病理, 表观遗传学, 肿瘤免疫学 | 胃癌 | 多组学整合分析, 甲基化测序, 空间转录组学, 免疫组织化学 | NA | 多组学数据, 图像, 文本 | NA | NA | 空间转录组学, 甲基化测序 | NA | NA |
| 35 | 2026-11-07 |
Single-cell transcriptomic atlas unravels renal cell heterogeneity and intercellular communication in Adriamycin-induced nephropathy
2026-Nov-05, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-06052-8
PMID:42986397
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序构建了阿霉素诱导肾纤维化的小鼠肾脏单细胞转录组图谱，揭示了肾细胞异质性及细胞间通讯变化，并鉴定出SPP1和LAMININ相关的上皮-巨噬细胞通讯特征 | 构建了阿霉素诱导肾纤维化的单细胞转录组图谱，结合CellChat分析揭示了损伤的肾小管上皮细胞与巨噬细胞之间由SPP1和LAMININ介导的通讯网络，并利用人类肾脏数据集进行跨物种验证 | 研究主要基于转录组和蛋白水平的关联分析，SPP1和LAMININ相关信号通路的具体机制尚未通过功能实验验证，跨物种验证仅基于公共数据集的表达模式比较 | 表征阿霉素诱导肾纤维化的细胞和转录组景观，鉴定与纤维化进展相关的细胞间通讯通路 | 阿霉素诱导肾病模型小鼠肾脏组织及人类肾脏转录组数据集 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 36 | 2026-11-07 |
Serum Perfluorooctanoic Acid and Elevated Atherosclerosis Index: NHANES Associations and Exploratory Ceramide-Related Analyses
2026-Nov-05, Cardiovascular toxicology
IF:3.4Q2
DOI:10.1007/s12012-026-10219-3
PMID:42986554
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研究论文 | 该研究基于NHANES数据评估血清PFOA与动脉粥样硬化指数（AI）的关联，并结合网络毒理学、机器学习及bulk和单细胞转录组学探索神经酰胺相关分子机制 | 首次将NHANES人群流行病学分析与网络毒理学、机器学习及bulk和单细胞转录组学整合，揭示PFOA暴露与AI升高的关联，并优先鉴定APOE及神经酰胺相关分子候选和巨噬细胞-泡沫细胞MIF通讯模式 | 研究为横断面设计，无法推断因果关系；连续AI关联在调整调查周期后减弱；分子机制分析为探索性，需进一步实验验证 | 探讨血清PFOA与动脉粥样硬化相关脂质状态的关联，并探索神经酰胺相关的候选分子联系 | NHANES参与者及PFOA暴露相关转录组数据集 | 流行病学与毒理基因组学 | 心血管疾病 | 调查加权横断面分析, 网络毒理学, 机器学习, bulk转录组学, 单细胞转录组学 | 机器学习模型 | 问卷调查数据, 血清生化数据, 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 37 | 2026-11-07 |
Alveolar Type II Cell-derived MMP1high basal cells promote destructive microcysts in idiopathic pulmonary fibrosis
2026-Nov-05, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.202597
PMID:42986692
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研究论文 | 该文通过原代细胞类器官和空间转录组学，揭示肺泡II型细胞来源的MMP1高表达基底细胞在特发性肺纤维化中促进破坏性微囊形成 | 首次发现呼吸细支气管和IPF肺泡微囊之间存在显著上皮相似性；鉴定CEACAM6+呼吸气道分泌细胞（RASCs）为基底细胞前体；揭示AT2和RB来源基底细胞转分化是IPF肺泡破坏和微囊形成的新驱动因素；发现Frizzled-5 WNT激动剂抗体可逆转MMP1高表达表型 | 未明确说明样本量，需要进一步验证WNT激动剂抗体的治疗潜力 | 探究特发性肺纤维化中肺泡微囊形成的细胞起源和分子机制 | 特发性肺纤维化患者的肺泡微囊、呼吸细支气管、原代细胞类器官 | 空间转录组学、类器官研究 | 特发性肺纤维化 | 空间转录组学、原代细胞类器官培养、RNA轨迹分析、sh-RNAi基因敲低 | NA | 空间转录组数据、类器官表型数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 38 | 2026-11-07 |
Bridging scRNA-seq and scATAC-seq With Graph Domain Adaptation for Cell Type Annotation
2026-Nov-05, IEEE transactions on neural networks and learning systems
IF:10.2Q1
DOI:10.1109/TNNLS.2026.3747934
PMID:42986739
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研究论文 | 提出了一种基于图域适应的框架scGDA，用于将scRNA-seq的细胞类型注释迁移到scATAC-seq数据 | 采用任务特定的图域适应框架，独立构建k近邻图并利用双图神经网络模块捕获全局和局部结构特征，在共享嵌入空间中对齐不同组学表示，避免过度校正 | 未明确提及 | 解决scATAC-seq细胞类型注释中跨组学对齐的挑战，实现从scRNA-seq到scATAC-seq的标签迁移 | 单细胞ATAC-seq数据和单细胞RNA-seq数据 | 机器学习 | NA | 单细胞ATAC-seq，单细胞RNA-seq | 图神经网络，图域适应 | 单细胞组学数据 | 多个基准数据集 | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 39 | 2026-11-07 |
Protocol for reference-free single-cell-resolution deconvolution of spot-based spatial transcriptomics with CoexpressDeconvolve
2026-Nov-05, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2026.104947
PMID:42986757
|
研究论文 | 本文介绍了一种使用 CoexpressDeconvolve 对基于点的空间转录组数据进行无参考单细胞分辨率解卷积的实验方案 | 提出无需参考数据的 CoexpressDeconvolve 方法，可直接从基于点的空间转录组数据重建单细胞分辨率全转录组图谱，并开发了管家基因细胞密度校准、联合过离散基因筛选、基因共表达流形和自动主题数选择等流程 | 作为协议文章，主要描述操作步骤，方法性能的系统评估有限 | 提供从基于点的空间转录组数据实现单细胞分辨率解卷积的标准化操作流程 | 基于点的空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组测序、潜在狄利克雷分配、层次贝叶斯采样 | 潜在狄利克雷分配、层次贝叶斯模型 | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x兼容对象 | NA |
| 40 | 2026-11-07 |
Plant Single-Cell Metabolomics and Metabolite Imaging: Current Advances and Future Directions
2026-Nov-05, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koag337
PMID:42987215
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综述 | 综述了植物单细胞采样、单细胞代谢组学和质谱成像技术的最新进展及其未来发展方向 | 系统整合了植物单细胞代谢组学与质谱成像技术，并强调了通过光谱库、计算代谢组学和AI辅助注释揭示植物细胞与空间暗代谢组的新兴努力 | 未提及具体实验验证或数据集，主要基于现有技术总结，缺乏对各项技术性能的系统比较和标准化评估 | 总结植物单细胞采样、单细胞代谢组学和质谱成像用于空间代谢组学的当前技术，并探讨构建单细胞分辨率下可定量、空间分辨且生物学可解释的植物信号与代谢网络的长期目标 | 植物细胞、亚细胞结构及完整植物器官中的代谢物 | 空间代谢组学、单细胞代谢组学 | NA | 单细胞代谢组学（scMet）、质谱成像（MSI）、计算代谢组学、AI辅助注释 | NA | 质谱数据、代谢物光谱数据、空间成像数据 | NA | NA | 单细胞代谢组学、质谱成像、空间代谢组学 | NA | NA |