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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
21 2026-02-20
Single-cell characterization of trophoblast-epithelial interactions at the human maternal-fetal interface during early implantation†
2026-Feb-18, Biology of reproduction IF:3.1Q2
研究论文 本研究利用输卵管异位妊娠(TEP)的单细胞RNA测序数据构建胚胎植入模型,以探究人类早期妊娠中母胎界面的植入机制 首次利用TEP的scRNA-seq数据构建胚胎植入模型,并通过与正常宫内妊娠(IUP)数据比较验证其作为研究植入机制参考工具的实用性 研究基于TEP模型,可能无法完全模拟正常宫内植入的生理环境,且样本来源有限 探究人类早期胚胎植入过程中母胎界面的分子机制 输卵管异位妊娠和正常宫内妊娠的母胎界面细胞 单细胞组学 妊娠相关疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq),免疫荧光染色 CellPhoneDB,CellChat 单细胞转录组数据,图像数据 基于公共数据库GSE214607中的正常宫内妊娠数据及TEP患者植入位点数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
22 2026-02-20
Recent advances in reproductive biology: European innovations in embryo development and research†
2026-Feb-18, Biology of reproduction IF:3.1Q2
综述 本文综述了欧洲在生殖生物学和胚胎学领域的开创性贡献,重点介绍了辅助生殖技术、高通量单细胞RNA测序以及合成胚胎模型的创新进展 整合了高通量单细胞RNA测序技术揭示早期胚胎发育的分子通路,并开发了合成胚胎模型作为自然胚胎研究的替代方案,展示了多能细胞的自我组织能力 在实现模型的可重复性和更稳健的植入模型方面仍存在挑战 推动生殖生物学和胚胎学的发展,改善人类和动物的生育结果 人类和动物的胚胎发育过程 生殖生物学 不孕症 高通量单细胞RNA测序 合成胚胎模型 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
23 2026-02-20
Computational integration of in vivo single cell and in vitro bulk transcriptomics across 236 human and mouse datasets differentiates physiological versus non-physiological hepatic cell lines for hepatotoxicity screening
2026-Feb-18, Toxicological sciences : an official journal of the Society of Toxicology IF:3.4Q2
研究论文 本研究通过整合人类和小鼠的体内单细胞与体外批量转录组数据,评估了肝细胞系在毒性筛选中的生理相关性 提出了一种新的计算学方法,利用现有大数据指导选择功能相关性更强的细胞系,可应用于其他组织的体外建模和广泛的生物医学应用 研究主要基于转录组数据,可能未涵盖所有生理层面的差异,且数据集数量有限(236个) 区分生理性与非生理性肝细胞系,以优化肝毒性筛选的体外模型选择 人类和小鼠的肝细胞系、肝细胞、肝星状细胞、胆管细胞以及体内肝脏组织 计算生物学 肝毒性 单细胞RNA测序(scRNAseq)、批量转录组学 NA 转录组数据 236个人类和小鼠数据集,包括214个细胞系数据集和7个体内单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
24 2026-02-20
Characterization of p16-positive stromal cells in age-related cardiac disorders
2026-Feb-18, Journal of biochemistry IF:2.1Q4
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析衰老小鼠心脏中的p16阳性基质细胞,揭示了p16+成纤维细胞在年龄相关心脏纤维化中的关键作用 首次在单细胞水平上表征p16阳性基质细胞,并发现TGF-β信号和BMP4在p16+成纤维细胞中显著富集,选择性消除这些细胞可改善心脏纤维化 研究基于小鼠模型,人类样本验证尚不充分 探究p16阳性基质细胞在年龄相关心脏疾病中的作用机制 衰老小鼠心脏中的p16阳性基质细胞,特别是成纤维细胞 单细胞组学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 使用p16-Tom和p16-Col1a2-LRTD转基因小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
25 2026-02-20
SNUPN variants cause spinocerebellar atrophy by disrupting global splicing in cerebellar Purkinje cells
2026-Feb-18, Brain : a journal of neurology IF:10.6Q1
研究论文 本研究通过识别SNUPN基因的致病性变异,揭示了其在脊髓小脑萎缩中的作用机制,并利用小鼠模型和单细胞RNA测序技术证实了snurportin-1通过U1 snRNP介导的RNA剪接在浦肯野细胞发育中的关键作用 首次将SNUPN基因突变与脊髓小脑萎缩联系起来,并利用敲入小鼠模型和单细胞RNA测序技术,系统性地阐明了snurportin-1功能障碍通过破坏RNA剪接导致浦肯野细胞异常和小脑萎缩的分子机制 研究样本量较小(仅两个家族),且未全面评估SNUPN突变在其他中枢神经系统区域的影响,可能限制了结论的普适性 探究SNUPN基因突变在脊髓小脑萎缩中的致病机制及其对中枢神经系统的影响 携带SNUPN基因致病性变异的两个家族患者、模拟患者变异的敲入小鼠模型、以及小鼠小脑中的浦肯野细胞 神经科学 脊髓小脑萎缩 单细胞RNA测序、RNA测序、体外核转运分析、小鼠模型构建 敲入小鼠模型 RNA序列数据、单细胞RNA测序数据 两个家族的患者及模拟变异的敲入小鼠 NA 单细胞RNA测序 NA NA
26 2026-02-20
3D "emboli" culture models epithelial breast cancer cell oxidative mitochondrial metabolism with relevance for lung metastasis
2026-Feb-18, Cancer research communications IF:2.0Q3
研究论文 本研究比较了乳腺球培养模型和“栓子”培养模型在模拟乳腺癌细胞生物学特性方面的差异,特别关注了“栓子”模型在模拟上皮性乳腺癌细胞氧化线粒体代谢及肺转移中的应用 开发并验证了一种新型的“栓子”培养模型,该模型能特异性富集上皮特征并模拟乳腺癌细胞的氧化磷酸化代谢,与肺转移相关基因表达增强相关 研究仅使用了三种乳腺癌细胞系(SUM149、IBC-3和MDA-MB-468),可能无法完全代表所有乳腺癌亚型的特性 比较不同3D培养模型在模拟乳腺癌生物学特性方面的适用性,并评估“栓子”模型在研究肺转移相关信号通路和药物敏感性方面的价值 乳腺癌细胞系(SUM149、IBC-3和MDA-MB-468) 数字病理学 乳腺癌 蛋白质组学、单细胞转录组学、代谢通量分析、电子显微镜超微结构定量分析 3D细胞培养模型(乳腺球培养模型和“栓子”培养模型) 图像、文本(基因表达数据) 三种乳腺癌细胞系 NA 单细胞转录组学 NA NA
27 2026-02-20
Intercellular communication landscape and its working mechanism in systemic sclerosis-associated interstitial lung disease
2026-Feb-18, Rheumatology (Oxford, England)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和ATAC测序分析,揭示了系统性硬化症相关间质性肺病中细胞间通讯的景观及其工作机制 首次系统性评估了SSc-ILD中的促纤维化因子,并通过整合scRNA-seq和scATAC-seq数据,发现了SPP1/CCL18阳性巨噬细胞与COL1A2间充质细胞在细胞间通讯中的关键作用 样本量相对有限,动物模型数量较少,且主要基于相关性分析,需要进一步的功能性实验验证 探究系统性硬化症相关间质性肺病的发病机制,特别是细胞间通讯网络的作用 人类肺组织样本(正常和SSc-ILD患者)、SSc患者血清样本、博来霉素诱导的肺纤维化动物模型 数字病理学 系统性硬化症相关间质性肺病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单细胞ATAC测序(scATAC-seq)、ELISA、免疫荧光、免疫组化 NA 单细胞转录组数据、表观基因组数据、血清蛋白数据、组织图像数据 34例人类肺组织(17例正常,17例SSc-ILD)、55例SSc患者血清(32例伴ILD,23例不伴ILD)、5只动物模型 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
28 2026-02-20
Exploration and Validation of the Diagnostic Potential of the Circadian Rhythm-Related Genes CCL23 and VNN1 in Adolescents with Depressive Disorder
2026-Feb-18, Molecular neurobiology IF:4.6Q1
研究论文 本研究探索并验证了昼夜节律相关基因CCL23和VNN1作为青少年抑郁障碍诊断生物标志物的潜力 首次从转录组学角度识别CCL23和VNN1作为抑郁障碍的昼夜节律相关生物标志物,并通过多数据集验证其诊断性能 样本量较小(15例患者和15例对照),且研究仅基于血液样本,未直接评估脑组织表达 探索昼夜节律相关基因作为抑郁障碍诊断生物标志物的潜力 青少年抑郁障碍患者和年龄匹配的健康对照 自然语言处理 抑郁障碍 RNA测序、RT-qPCR、单细胞RNA测序 NA 转录组数据 15例青少年抑郁障碍患者和15例年龄匹配对照 NA 单细胞RNA-seq NA NA
29 2026-02-20
A pathomics-based pyroptosis signature predicts survival in clear cell renal cell carcinoma
2026-Feb-18, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究开发了一种基于病理组学特征和细胞焦亡信号的新型预后模型,用于预测透明细胞肾细胞癌患者的生存情况 首次在ccRCC中整合病理组学特征与细胞焦亡相关信号构建预后模型,并揭示了关键基因在肿瘤微环境中的表达模式 模型主要基于TCGA数据库的回顾性数据,需要前瞻性临床研究进一步验证其临床应用价值 开发更准确的预后工具以改善透明细胞肾细胞癌的临床管理 透明细胞肾细胞癌患者 数字病理学 肾细胞癌 病理组学分析、单细胞测序 StepCox[forward]+Lasso算法 全切片数字病理图像、基因表达数据 TCGA数据库中的ccRCC患者样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
30 2026-02-20
Causality between Cholecystectomy, Blood Lipids, and Major Adverse Cardiac and Cerebrovascular Events: A Multimodal Approach Highlighting Lipid Regulation
2026-Feb-18, Bulletin of experimental biology and medicine IF:0.9Q4
研究论文 本研究采用多模态方法评估了胆囊切除术对血脂水平和主要不良心脑血管事件风险的因果影响 首次结合孟德尔随机化、富集分析、多变量MR和表达数量性状位点MR,并整合单细胞测序数据,系统揭示了胆囊切除术通过调节ApoB/ApoA1比率影响心血管风险的机制 研究依赖于公共数据库的遗传数据,可能存在人群特异性和数据异质性限制 评估胆囊切除术与血脂水平及主要不良心脑血管事件之间的因果关系 胆囊切除术后患者的血脂代谢和心脑血管事件风险 生物信息学 心血管疾病 孟德尔随机化、富集分析、表达数量性状位点分析、单细胞测序 MR分析模型 遗传数据、基因表达数据 基于公共数据库的遗传数据(具体样本量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
31 2026-02-20
A hybrid neighborhood enhanced contrastive learning and self-knowledge distillation method for scRNA-seq data clustering analysis
2026-Feb-18, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文提出了一种名为scKD的新方法,结合混合邻域增强对比学习和自知识蒸馏策略,用于提升单细胞RNA测序数据的聚类分析性能 整合了混合邻域增强对比学习模型与自知识蒸馏策略,以提高聚类准确性并准确识别主要细胞类型和罕见细胞亚型 未在摘要中明确提及 解决单细胞RNA测序数据高维度、复杂性和噪声带来的挑战,实现精确的细胞类型分类 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 对比学习, 知识蒸馏 基因表达数据 多个真实世界数据集(具体数量未在摘要中提供) NA 单细胞RNA-seq NA NA
32 2026-02-20
Spatiotemporal Role of GLI2 in Driving SHH-Medulloblastoma Tumorigenesis
2026-Feb-18, Neuro-oncology IF:16.4Q1
研究论文 本研究通过构建GLI2扩增的小鼠模型,揭示了GLI2在驱动SHH型髓母细胞瘤发生中的时空作用及MAPK通路的关键角色 首次构建了GLI2扩增的髓母细胞瘤小鼠模型,明确了GLI2作为SHH-MB主要致癌驱动因子的作用,并发现胚胎期Math1+祖细胞对GLI2诱导的肿瘤发生具有特异性易感性 研究主要基于小鼠模型,虽然与人类肿瘤相似,但可能存在物种差异;未涉及临床治疗干预的验证 探究GLI2在SHH型髓母细胞瘤发生发展中的驱动机制及发育起源 GLI2扩增的SHH型髓母细胞瘤小鼠模型及人类肿瘤样本 数字病理学 髓母细胞瘤 单细胞RNA测序, 免疫组织化学分析 小鼠遗传模型 单细胞转录组数据, 组织图像数据 未明确样本数量,但涉及多个发育时间点(E13.5-E15.5胚胎期及出生后)的小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
33 2026-02-20
Robust and efficient annotation of cell states through gene signature scoring
2026-Feb-18, Genome research IF:6.2Q1
研究论文 本文提出了一种名为调整邻域评分(ANS)的确定性算法,用于改进单细胞RNA测序数据中的基因签名评分,以提高细胞状态注释的准确性和稳定性 ANS算法通过增强的对照基因选择,显著提高了评分稳定性和跨签名可比性,在细胞状态注释准确性上可与监督方法相媲美 未明确说明ANS算法在特定疾病类型或更大规模数据集上的泛化能力限制 改进单细胞RNA测序数据中基于基因签名评分的细胞状态注释方法 单细胞RNA测序数据中的细胞状态和类型 单细胞分析 癌症 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 确定性算法(ANS) 单细胞RNA测序数据 九个健康和癌症单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
34 2026-02-20
TWIST1 drives endothelial-to-mesenchymal-transition to stabilize atherosclerotic plaques
2026-Feb-18, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究探讨了转录因子TWIST1在动脉粥样硬化斑块中通过驱动内皮-间质转化来促进斑块稳定的作用 挑战了传统观点,即内皮-间质转化仅导致斑块不稳定,提出TWIST1驱动的内皮-间质转化可促进斑块稳定性 研究主要基于小鼠模型和体外细胞培养,人类体内验证有限 探究TWIST1在动脉粥样硬化斑块进展中的作用及其机制 高胆固醇血症小鼠的内皮细胞和人类主动脉内皮细胞 心血管疾病研究 心血管疾病 单细胞RNA测序,组织学分析,细胞培养 NA RNA测序数据,组织图像,细胞实验数据 高胆固醇血症小鼠模型和人类主动脉内皮细胞培养 NA 单细胞RNA-seq NA NA
35 2026-02-20
Immune regulation and cellular crosstalk drive non-fibrotic lung remodeling in pre-metamorphic frogs exposed to paraquat
2026-Feb-18, BMC biology IF:4.4Q1
研究论文 本研究通过组织学分析、行为学实验和单细胞RNA测序,探讨了Microhyla fissipes蝌蚪在环境相关浓度百草枯暴露下的急性肺反应,揭示了非纤维化肺重塑机制 首次在蝌蚪模型中揭示百草枯诱导的非纤维化肺重塑,涉及免疫调节和细胞互作,并发现发育信号通路如Wnt/β-catenin的重新激活 结论仅适用于蝌蚪阶段和短期暴露,需要进一步研究评估长期或变态后结果 研究环境化学应激下脊椎动物肺的急性损伤反应、恢复力和发育可塑性 Microhyla fissipes蝌蚪的肺组织 单细胞组学 肺损伤 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量,涉及Microhyla fissipes蝌蚪 NA 单细胞RNA-seq NA NA
36 2026-02-20
A comprehensive evaluation of long-read de novo transcriptome assembly
2026-Feb-18, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 本文对长读长从头转录组组装工具进行了全面评估,并比较了其与短读长组装工具的性能 首次系统性地评估了RATTLE、RNA-Bloom2和isONform等长读长从头转录组组装工具,并分析了组装选择对差异表达检测的下游影响 与参考基因组引导的方法相比,长读长从头组装在准确性和冗余度方面仍存在局限性 评估和比较长读长从头转录组组装工具的性能,为无高质量参考基因组时的差异表达分析提供策略指导 长读长从头转录组组装工具(RATTLE、RNA-Bloom2、isONform)和短读长组装工具(Trinity) 生物信息学 NA 长读长测序、短读长测序、转录组组装、差异表达分析 NA 测序数据(模拟数据、spike-in sequin转录本、真实样本数据) 人类和豌豆(Pisum sativum)样本,测序深度覆盖600万至6000万读长 Oxford Nanopore Technologies, Pacific Biosciences 长读长测序、单细胞测序 Oxford Nanopore Technologies, PacBio ONT cDNA测序、ONT直接RNA测序、PacBio 10×单细胞测序
37 2026-02-20
High-Resolution Spatial Multi-Omics Enables Prognostic Scoring in Intrahepatic Cholangiocarcinoma
2026-Feb-18, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy IF:12.1Q1
研究论文 本研究通过整合空间多组学技术,开发了一种新型空间多模态评分系统,用于肝内胆管癌的预后评估和风险分层 首次结合图像质谱流式细胞术、扩展凝胶空间蛋白质组学、单细胞RNA测序、批量蛋白质组学及多重免疫荧光技术,实现高分辨率空间多组学分析,并开发出基于微观尺度(1mm)的空间多模态预后评分系统 研究样本量相对有限(训练队列155例,验证队列214例),且未在更广泛的多中心队列中进行外部验证 开发肝内胆管癌的预后工具,以优化风险分层和治疗决策 肝内胆管癌(iCCA)患者的肿瘤微环境 数字病理学 肝内胆管癌 图像质谱流式细胞术(IMC)、扩展凝胶空间蛋白质组学、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、批量蛋白质组学、多重免疫荧光(mIF) 空间多模态评分系统 图像、蛋白质组数据、转录组数据 训练队列155例患者,独立验证队列214例患者 NA 单细胞RNA测序、空间蛋白质组学、批量蛋白质组学 NA NA
38 2026-02-20
Deciphering immune features and cellular heterogeneity in PRRSV infection via single-cell RNA sequencing
2026-Feb-17, Journal of virology IF:4.0Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,解析了PRRSV感染期间肺部免疫特征和细胞异质性 首次在单细胞水平上全面描绘了PRRSV感染下肺部免疫细胞的转录组图谱,并识别出SPP1巨噬细胞亚群作为病毒主要靶细胞 研究仅基于转录组数据,未结合蛋白质组或功能验证实验 阐明PRRSV感染如何扰乱肺部免疫细胞群体及诱导免疫功能障碍的机制 PRRSV感染仔猪的肺部细胞 数字病理学 猪繁殖与呼吸综合征 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 46,922个单细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
39 2026-02-20
Elucidation of population-based bacterial adaptation to antimicrobial treatment by single-cell sequencing analysis of the gut microbiome of a hospital patient
2026-Feb-17, mSystems IF:5.0Q1
研究论文 本研究利用单细胞测序技术,分析了一名接受抗生素治疗的急性脑出血患者的肠道微生物组,揭示了抗生素耐药基因的广泛存在、进化路径及水平基因转移事件 首次在患者个体层面,通过单细胞测序技术系统性地描绘了抗生素治疗期间肠道微生物组中抗生素耐药基因的多样性、进化动态及跨物种水平基因转移网络,并发现了具有不同耐药基因进化模式的肺炎克雷伯菌菌株 研究仅基于单一样本(一名患者),样本量小,限制了结果的普适性;研究为观察性分析,未能建立因果关系 阐明在抗生素治疗压力下,基于人群的细菌适应性进化机制,特别是抗生素耐药基因的获得与传播 一名患有急性脑出血并接受抗生素治疗的成年男性患者的肠道微生物组 微生物组学 脑出血 单细胞测序 NA 单细胞基因组数据 1名患者的肠道微生物组样本 NA 单细胞测序 NA NA
40 2026-02-20
A pan-cancer single-cell transcriptomic atlas of human bone metastases
2026-Feb-17, Cell reports. Medicine
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序构建了人类骨转移瘤的泛癌图谱,揭示了骨转移的分子机制和免疫治疗新靶点 首次创建了涵盖13种不同来源的62例骨转移瘤的单细胞转录组图谱,并结合大规模原发和转移性泛癌数据集进行整合分析,识别出与癌细胞增殖相关的特定细胞类型和免疫检查点基因 研究样本量相对有限(62例骨转移瘤),且主要基于转录组数据,缺乏蛋白质组或表观遗传学的验证 探究人类骨转移瘤的分子机制和免疫微环境特征,为免疫治疗优化提供新策略 人类骨转移瘤组织、配对的原发肿瘤和正常骨髓样本,以及骨转移小鼠模型 数字病理学 骨转移瘤 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 无监督聚类分析 单细胞转录组数据 62例骨转移瘤样本,涵盖13种不同癌症来源 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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