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当前共找到 43580 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-09-24 |
Exploring the immune environment of glioblastoma in humanized mouse models
2026-Jul-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noag073
PMID:41913047
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研究论文 | 该研究建立了一种新型人源化小鼠胶质母细胞瘤模型，将患者来源异种移植瘤（PDX）移植到人源化免疫缺陷小鼠中，以研究肿瘤与人类免疫细胞的相互作用 | 首次将辐射耐受的PDX移植到表达关键人类细胞因子的人源化小鼠中，成功重建了多样化的人类免疫细胞浸润，且免疫细胞基因表达谱与人类复发性GBM相似，并揭示了肿瘤中高比例的神经祖细胞样细胞 | 样本量较小，仅使用了2种免疫缺陷小鼠模型，且未进行功能性免疫治疗验证实验 | 建立能够模拟人类肿瘤与免疫细胞相互作用的人源化GBM小鼠模型，用于研究肿瘤免疫微环境和评估新型免疫疗法 | 人源化小鼠模型中的胶质母细胞瘤PDX肿瘤及其浸润的人类免疫细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、光谱流式细胞术、免疫组织化学 | NA | 图像、文本 | 2种免疫缺陷小鼠模型，移植辐射耐受的PDX肿瘤 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 22 | 2026-09-24 |
NT-I7, a Long-Acting Interleukin 7, Increases Lymphocyte Counts and Induces CD8+ T-cell Clonotype Expansion in Patients with Newly Diagnosed High-Grade Gliomas
2026-Jul-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-2953
PMID:41880597
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研究论文 | 一项I期临床试验评估长效白介素7（NT-I7）在新诊断高级别胶质瘤患者中的安全性、最大耐受剂量及对淋巴细胞的影响 | 首次在高级别胶质瘤患者中开展NT-I7的I期临床试验，发现其可显著增加淋巴细胞计数，并通过单细胞RNA测序揭示CD8+ T细胞选择性克隆扩增，且在MGMT启动子未甲基化的胶质母细胞瘤患者中观察到有前景的临床反应 | 样本量较小，为I期剂量探索性试验，缺乏对照组，疗效仍需更大规模随机试验验证 | 确定NT-I7在新诊断高级别胶质瘤患者中的最大耐受剂量、安全性及其对免疫细胞（尤其是淋巴细胞）的影响 | 新诊断高级别胶质瘤患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | I期临床试验患者（具体数量未在摘要中说明），其中部分患者接受单细胞RNA测序免疫分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 23 | 2026-09-24 |
Taming autoimmunity: Alpha-1 antitrypsin overexpressing mesenchymal stromal cells promote regulatory T cell crosstalk to reverse diabetes
2026-Jul-01, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2026.03.032
PMID:41918165
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研究论文 | 该文章研究了过表达α-1抗胰蛋白酶（AAT）的间充质干细胞（MSC）如何通过促进调节性T细胞（Treg）与其他免疫细胞的相互作用来逆转糖尿病。 | 首次利用单细胞RNA测序、流式细胞术和功能分析，系统揭示了AAT-MSCs通过增强Treg扩增、诱导CD8 T细胞耗竭并提升胰岛细胞存活，从而调节免疫微环境、逆转新发糖尿病的细胞间通讯机制。 | 研究主要基于非肥胖糖尿病小鼠模型和体外实验，缺乏长期安全性和人体临床试验数据。 | 探索AAT-MSCs在1型糖尿病及其他自身免疫或炎症疾病中的免疫调节机制和临床应用潜力。 | 非肥胖糖尿病小鼠的胰腺淋巴结和胰岛，以及小鼠和人类的CD4、CD8 T细胞和胰岛细胞。 | 单细胞组学、免疫学、细胞治疗 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、功能分析、CellChat分析 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 24 | 2026-09-24 |
Spatial and Single-Cell Mapping Reveals Valvular Interstitial Cell and Macrophage Sex Differences in Calcific Aortic Valve Disease
2026-Jul, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.126.324694
PMID:42206364
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研究论文 | 该研究通过组织学、扫描电镜、单细胞测序和空间转录组学分析人类主动脉瓣组织，揭示了钙化性主动脉瓣疾病中瓣膜间质细胞和巨噬细胞的性别差异 | 首次结合单细胞和空间转录组学揭示钙化性主动脉瓣疾病中瓣膜间质细胞和巨噬细胞在钙化位点附近的性别依赖性空间组织和基因表达差异，发现男性偏向性AP-1转录因子复合物表达和女性偏向性ECM重塑基因表达 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究驱动主动脉瓣组织性别依赖性纤维钙化的细胞机制，理解钙化性主动脉瓣疾病中性别差异的细胞表型 | 人类男性和女性主动脉瓣组织，包括健康患者和钙化性主动脉瓣疾病患者的瓣膜组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序, 空间转录组学, RNA原位杂交, 组织学技术, 扫描电子显微镜 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 25 | 2026-09-24 |
Acute wood smoke exposure is associated with cell-specific hippocampal transcriptomic responses in an accelerated ovarian failure mouse model
2026-Jul, Neurotoxicology
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.neuro.2026.103476
PMID:42214760
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研究论文 | 该研究利用加速卵巢衰竭小鼠模型，通过空间转录组学技术探究急性木烟暴露对海马体的细胞特异性转录组响应 | 首次将加速卵巢衰竭模型与急性木烟暴露相结合，利用空间转录组学揭示围绝经期样激素状态下海马体对空气污染的细胞特异性转录响应，阐明了卵巢激素下降与空气污染暴露的交互作用机制 | 研究仅使用小鼠模型，样本量较小（每组n=4），仅评估急性暴露（2天），未涉及长期暴露效应，且未进行蛋白质水平或功能验证 | 测试围绝经期样激素状态是否放大海马体对急性木烟暴露的响应，并定义细胞类型特异性的转录组框架 | 雌性C57BL/6小鼠，采用VCD诱导的中度加速卵巢衰竭模型 | 空间转录组学 | 神经系统疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 每组4个切片，共2组（过滤空气组和木烟暴露组） | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台，结合自动化细胞类型注释 |
| 26 | 2026-09-24 |
IL-22 promotes genesis of small intestinal secretory cells that protect against cholera in mice
2026-Jul, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-026-02375-7
PMID:42236988
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研究论文 | 通过对 infant mouse 小肠上皮和免疫细胞进行单细胞RNA测序，并结合IL-22Fc处理，研究IL-22在霍乱弧菌感染中促进肠道分泌细胞分化及黏膜防御的机制 | 首次揭示IL-22通过促进肠上皮细胞产生Reg3β及增加分泌系和杯状细胞丰度，分泌黏液至肠隐窝，从而抑制霍乱弧菌与上皮结合，保护小鼠免于腹泻和死亡 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类中验证；IL-22Fc的长期安全性及对肠道菌群的影响未充分探讨 | 探究小肠固有免疫防御机制及IL-22在抗霍乱弧菌感染中的作用 | infant mouse 小肠上皮细胞和免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 霍乱 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 27 | 2026-09-24 |
The embryonic origins of site-specific arthritis
2026-Jul, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-026-02542-2
PMID:42260300
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研究论文 | 结合单细胞RNA测序、成像和X射线断层扫描技术，研究胎儿发育期间手指关节的细胞组成、空间组织和结构，揭示PI16成纤维细胞在特定部位关节炎易感性中的作用 | 首次结合单细胞RNA测序、成像和X射线断层扫描技术系统研究胎儿手指关节发育过程中的细胞组成和空间组织，发现PIP关节富含PI16通用成纤维细胞，并揭示其在血管周围区域和发育中的肌腱-韧带界面定位，提出间充质细胞化学计量学差异是驱动组织炎症易感性的普遍原则 | NA | 探究部位特异性炎症的细胞基础，阐明为何近端指间关节更易受炎症性关节炎影响而远端指间关节不受影响 | 人类胎儿手指关节（近端指间关节和远端指间关节） | 单细胞组学 | 关节炎 | 单细胞RNA测序、成像、X射线断层扫描 | NA | 单细胞转录组数据、图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 28 | 2026-09-24 |
PRECISE: A Prognostic Thyrocyte-Derived Gene Signature for Papillary Thyroid Carcinoma
2026-Jul-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-4488
PMID:42008746
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研究论文 | 该研究利用单细胞和单核RNA测序数据开发了甲状腺细胞来源的基因特征PRECISE，并在多个队列中验证其对甲状腺乳头状癌的预后价值 | 首次利用单细胞和单核RNA测序数据开发甲状腺细胞来源的基因特征PRECISE，包含41个在肿瘤细胞中下调的上皮基因，并在多个独立队列中验证其独立预后价值 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 开发有效的生物标志物并改进甲状腺乳头状癌的风险分层方法 | 甲状腺乳头状癌患者 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 批量RNA测序 | 多变量Cox比例风险模型 | 基因表达数据 | 发现队列109例（MDACC），验证队列65例（VUMC）和370例（TCGA），其中11例肿瘤和4例正常样本进行单核RNA测序 | NA | 单核RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 29 | 2026-09-24 |
OT-55 reshapes tolerogenic BH3-mimetic-induced apoptosis toward immunogenic cell death in acute myeloid leukemia, potentiating PD-1/Tim-3 blockade
2026-Jul-01, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-09000-9
PMID:42386711
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研究论文 | 本研究探讨了羟基香豆素OT-55联合Bcl-xL抑制剂A-1331852将BH3模拟物诱导的耐受性凋亡转化为免疫原性细胞死亡，并增强PD-1/Tim-3阻断疗法在急性髓系白血病中的疗效 | 首次提出OT-55作为免疫原性佐剂可将BH3模拟物驱动的耐受性凋亡转化为免疫原性细胞死亡，并构建了九基因AML ICD评分系统，证明了联合PD-1/Tim-3阻断可实现局部和远端肿瘤控制且毒性较低 | 研究主要基于小鼠模型和回顾性患者队列数据分析，缺乏前瞻性临床试验验证，OT-55在人体中的安全性和有效性尚需进一步评估 | 探索免疫原性佐剂OT-55能否将BH3模拟物触发的耐受性凋亡转化为免疫原性启动，从而增强检查点免疫治疗并克服AML中的免疫逃逸 | 急性髓系白血病（AML），包括三个AML患者队列（TARGET-AML、BEAT-AML、GSE37642）及小鼠C1498粒单核细胞白血病细胞模型 | 数字病理学, 机器学习 | 白血病 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 转录组分析, CIBERSORTx免疫浸润分析 | Cox回归, CIBERSORTx | 转录组数据, 图像, 文本 | 三个AML患者队列（TARGET-AML、BEAT-AML、GSE37642）的转录组数据，AML和健康供体的骨髓scRNA-seq数据，以及小鼠C1498细胞模型 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 30 | 2026-09-24 |
Single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics in the discovery of kidney disease potential biomarkers: a narrative review
2026-Jul-01, BMC nephrology
IF:2.2Q2
DOI:10.1186/s12882-026-05159-7
PMID:42387422
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）及其与空间转录组学（ST）整合技术在肾脏疾病潜在生物标志物发现中的最新应用与进展 | 系统总结了scRNA-seq与空间转录组学整合技术在肾脏疾病生物标志物发现中的应用，并提出了未来研究与临床应用的新视角和方向 | 作为叙述性综述，未进行系统性文献检索和定量分析，可能存在文献选择偏倚 | 总结单细胞RNA测序及空间转录组学在肾脏疾病潜在生物标志物发现中的最新应用与进展 | 肾脏疾病及其相关生物标志物 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 31 | 2026-09-24 |
Network-based integrative transcriptomic analysis reveals immune-regulatory and oncogenic signatures of EOMES and SPRYD3 in head and neck squamous cell carcinoma
2026-Jul-01, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-026-16379-3
PMID:42387439
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研究论文 | 结合头颈鳞癌批量转录组数据与口腔鳞癌单细胞RNA测序数据，通过网络分析识别出EOMES和SPRYD3分别代表免疫调控和致癌增殖两种不同的转录程序 | 整合批量转录组与单细胞RNA测序数据揭示EOMES和SPRYD3在HNSCC中分别代表免疫调控和致癌增殖两种不同的转录程序，并利用CopyKAT鉴定非整倍体上皮细胞中SPRYD3的特异性富集 | 实验验证样本量有限，EOMES在OSCC组织中仅呈低表达趋势，尚未在更大队列中验证其预后价值 | 探讨头颈鳞癌中上皮增殖与免疫活性之间的关系，识别与肿瘤进展相关的基因程序及预后标志物 | 头颈鳞癌（HNSCC）患者及口腔鳞癌（OSCC）样本 | 数字病理学 | 头颈鳞癌 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序，共表达网络分析，CopyKAT | NA | 转录组数据，图像 | GSE83519、TCGA-HNSC批量转录组队列及GSE172577单细胞RNA测序队列（具体样本数未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 32 | 2026-09-24 |
From heterogeneity to mechanism: a systems-level analysis pinpoints the S100A8/A9 axis in colorectal cancer
2026-Jul-01, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-026-04399-9
PMID:42387561
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研究论文 | 该研究通过整合bulk转录组学、单细胞RNA-seq图谱和机器学习优先级分析的多组学策略，解析S100蛋白家族在结直肠癌中的功能异质性，并识别出髓源性S100A8/A9轴作为促肿瘤炎症微环境的关键放大因子 | 通过多组学整合策略解决了S100家族在结直肠癌中广泛失调但预后价值有限的悖论，揭示了S100A8和S100A9的表达并非肿瘤内在性的，而是高度集中于肿瘤浸润髓系细胞，并实验验证了其作为炎症驱动因子的功能 | qRT-PCR验证队列仅30例患者，样本量较小；功能验证仅限于体外实验，缺乏体内动物模型验证；未深入探讨S100A8/A9轴的具体信号传导机制 | 解析S100蛋白家族在结直肠癌中的功能角色，克服其异质性带来的治疗靶点识别障碍，寻找潜在的预后标志物和治疗靶点 | 结直肠癌患者的肿瘤组织及癌旁正常组织、肿瘤浸润髓系细胞、结直肠癌细胞系 | 机器学习 | 结直肠癌 | bulk转录组学、单细胞RNA-seq、qRT-PCR | 机器学习 | 文本、图像 | 30例患者队列（qRT-PCR验证），TCGA bulk转录组数据，Pan-GI细胞图谱大规模单细胞RNA-seq数据 | NA | bulk RNA-seq、single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 33 | 2026-09-24 |
Single-cell transcriptomics reveals MAFB-driven macrophage reprogramming and immune divergence in recurrent glioblastoma
2026-Jun-29, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-026-16321-7
PMID:42374253
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研究论文 | 该研究通过整合大规模单细胞转录组数据集，揭示了复发性胶质母细胞瘤中由MAFB驱动的CXCL3⁺肿瘤相关巨噬细胞重编程及免疫微环境差异 | 首次鉴定出复发性胶质母细胞瘤中独特的CXCL3⁺肿瘤相关巨噬细胞亚群，并确定MAFB为该巨噬细胞状态的核心转录调控因子，同时通过体内实验验证了MAFB敲除可抑制颅内肿瘤生长并延长生存期 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究复发性胶质母细胞瘤中肿瘤相关巨噬细胞的激活状态和转录程序，揭示肿瘤复发的免疫微环境机制 | 胶质母细胞瘤患者样本及患者来源的GBM细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组测序, 免疫组织化学, 多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 图像 | 大规模单细胞转录组数据集（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 34 | 2026-09-24 |
Compound models and Pearson residuals for single-cell RNA-seq data without UMIs
2026-Jun-27, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04161-4
PMID:42365288
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研究论文 | 该文章提出了一种复合模型和Pearson残差方法，用于标准化无UMI的scRNA-seq数据，通过将扩增步骤建模为复合分布来捕捉过度离散和零膨胀模式 | 首次将Pearson残差方法扩展到非UMI数据，通过复合分布建模扩增步骤，并发现多种测序协议的扩增分布可用破碎幂律描述 | 文章未明确提及限制 | 扩展Pearson残差方法到无UMI的scRNA-seq数据，以进行有效的基因选择和嵌入 | Smart-seq2数据集和其他非UMI scRNA-seq数据 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 复合模型（负二项分布和扩增分布） | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 35 | 2026-09-24 |
Decoding the association between platinum resistance and HPV status in cervical cancer using organoid models
2026-Jun-26, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-026-02665-w
PMID:42363253
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研究论文 | 该研究通过建立宫颈癌类器官模型，结合药物敏感性测试和单细胞RNA测序，揭示了非HPV16高危型HPV感染与铂类耐药之间的关联及其分子机制 | 首次利用宫颈癌类器官模型系统性地揭示了非HPV16高危型HPV感染与铂类耐药之间的关联，并通过单细胞RNA测序鉴定了铂类耐药类器官中DNA修复增强、PI3K/AKT通路激活和凋亡信号抑制等分子特征，提出PI3K/AKT抑制剂BYL719可作为铂类耐药宫颈癌的潜在治疗辅助药物 | 未在摘要中明确说明研究局限性 | 探究HPV感染状态与宫颈癌铂类耐药之间的关联，并利用类器官模型研究其潜在分子机制 | 宫颈癌患者的肿瘤组织及由此建立的宫颈癌类器官 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序、药物敏感性测试、类器官培养 | NA | 基因表达数据、图像 | 37个宫颈癌类器官（CCOs），其中27个用于表征和药物敏感性测试 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 36 | 2026-09-24 |
Transcriptional heterogeneity predicts and enables clonal selection in ageing haematopoiesis
2026-Jun-25, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-10046174/v1
PMID:42396490
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研究论文 | 该研究结合可遗传谱系追踪与单细胞RNA测序，在异时和同时移植模型中追踪造血干细胞克隆的转录状态与长期功能输出，揭示衰老相关的克隆选择机制 | 提出克隆层面的转录异质性（而非平均转录状态）是预测衰老相关克隆选择的关键因素，并开发了计算框架scCloneVar来量化克隆分辨率的转录异质性并识别差异变异基因（DVG） | 研究主要基于小鼠造血干细胞移植模型，人类HSC数据仅用于保守性分析，尚未在人类体内验证转录异质性对克隆选择的预测能力 | 探究姐妹细胞间的转录变异性（而非转录状态本身）是否是预测衰老相关克隆选择的属性，以造血干细胞为测试案例 | 小鼠造血干细胞（HSC）克隆及人类HSC | 单细胞组学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序, 可遗传谱系追踪 | scCloneVar计算框架 | 单细胞转录组数据, 谱系追踪数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 37 | 2026-09-24 |
Circuit organization and transcriptomic heterogeneity of sympathetic circuits innervating cranial structures
2026-Jun-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117446
PMID:42241285
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研究论文 | 该研究结合神经元示踪、单细胞和空间转录组学，解析了支配颅部结构的交感神经环路的电路组织和转录组异质性 | 结合神经元示踪与单细胞及空间转录组学，首次揭示了颈上神经节（SCG）神经元的电路组织规则：每个SCG神经元仅支配单一效应器官，投射类型（P型）形成两个主要区室但彼此混杂，成熟转录组类型（T型）出生后出现且呈头尾偏倚，T型与P型并非严格一一对应，表明交感颅部效应器受多种转录组SCG类型的组合调控 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 阐明支配颅部组织的交感神经环路的电路组织和细胞异质性 | 颈上神经节（SCG）神经元及其支配的颅部效应器官 | 空间转录组学, 单细胞转录组学 | NA | 神经元示踪, 单细胞转录组测序, 空间转录组学 | NA | 图像, 文本, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 38 | 2026-09-24 |
Spatial transcriptomics reveals coordinated ventricular patterning and maturation in the developing human heart
2026-Jun-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-74476-0
PMID:42336864
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研究论文 | 该研究构建了发育中人类心脏的时空转录组图谱，揭示了心室图式形成和成熟的协调机制。 | 首次对发育中的人类心脏进行时空转录组分析，覆盖8-15个受孕后周数的30个切片，将每个空间点视为多细胞单元，解析了解剖学上连贯的区域和特化亚群，并通过轨迹推断揭示了从心内膜到心外膜的连续转录梯度。 | 未明确提及 | 揭示人类心脏如何建立空间组织结构以及区域程序如何整合以协调发育。 | 发育中的人类心脏组织 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 30个切片，覆盖8-15个受孕后周数 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 39 | 2026-09-24 |
Sequential and coordinated control of human plasma cell differentiation by IRF4 and BLIMP1 utilizing a discriminating ISRE/EICE motif lexicon
2026-Jun-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.15.732353
PMID:42367882
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研究论文 | 该研究利用CRISPR/Cas9扰动和单细胞RNA测序，揭示了IRF4和BLIMP1通过识别不同的ISRE/EICE基序词汇协同调控人类浆细胞分化的机制 | 发现了ISRE/EICE基序中非保守核苷酸可区分IRF4和BLIMP1的结合，揭示了基序词汇依赖的IRF4-BLIMP1相互作用模式，即IRF4先独立发挥作用然后与BLIMP1协同 | 研究主要基于体外分步分化系统，可能无法完全反映体内浆细胞分化的复杂微环境调控 | 解析IRF4和BLIMP1在人类浆细胞分化过程中如何分配和协调其基因组活动 | 人类初始B细胞及浆细胞前体细胞 | 机器学习 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑, 单细胞RNA测序, 多组学分析, CUT&RUN, DNA结合实验 | NA | 文本, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 40 | 2026-09-24 |
Correcting spatial transcriptomics data affected by a prevalent transcript leakage problem across platforms, species, and tissues
2026-Jun-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.13.732076
PMID:42367830
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研究论文 | 该文章揭示了空间转录组学数据中普遍存在的转录本泄漏问题，并提出了一种基于贝叶斯模型的无参考校正方法DeLeakage来清理数据 | 首次发现并系统证明了空间转录组学数据中跨平台、物种和组织的普遍转录本泄漏问题，并提出了一种无参考的贝叶斯模型DeLeakage进行有效校正 | 摘要中未明确提及 | 解决空间转录组学数据中的转录本泄漏问题，提高数据质量和下游分析的准确性 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 贝叶斯模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 基于成像的空间转录组学, 基于测序的空间转录组学 | NA | NA |