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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
21 2026-05-30
Single-Cell Landscape Change in Cervical Epithelial Cells and Microenvironment During the Transformation from CINIII to Cervical Squamous Cell Carcinoma
2026-May-21, Cancers IF:4.5Q1
research paper 利用单细胞测序技术揭示了宫颈上皮细胞及微环境从CINIII向宫颈鳞状细胞癌转变过程中的细胞和分子变化 首次通过单细胞测序全面解析CINIII向CSCC转变过程中宫颈上皮细胞及微环境的动态变化,并鉴定了Sox2及其信号通路作为恶性转化中特定宫颈干细胞的标志物 未明确提及局限性 研究CINIII向宫颈鳞状细胞癌转变过程中的细胞和分子机制,为非侵入性治疗提供分子基础 宫颈上皮细胞及其微环境中的多种细胞类型,包括血管内皮细胞、成纤维细胞、巨噬细胞、T细胞、B细胞等 单细胞组学, 数字病理学 宫颈癌 单细胞测序 NA 单细胞转录组数据 未明确提及样本量 NA single-cell RNA-seq NA NA
22 2026-05-30
Integrative Analysis of Major Depressive Disorder and Ovarian Cancer: From Genetic Association to Single-Cell Mechanisms
2026-May-21, Biomedicines IF:3.9Q1
研究论文 利用单细胞转录组学和遗传学方法探究重度抑郁症与卵巢癌之间的关联机制 首次通过整合单细胞RNA-seq、eQTL和GWAS数据,以CD8效应记忆T细胞为共同焦点,识别出CLSTN3作为连接抑郁症与卵巢癌的候选分子 MR分析中CLSTN3与卵巢癌风险的关联未经过多重比较校正;功能验证仅局限于体外实验,缺乏体内研究支持 揭示重度抑郁症增加卵巢癌风险的潜在生物学机制 重度抑郁症和卵巢癌患者的免疫细胞亚群(特别是CD8效应记忆T细胞)及卵巢癌细胞系HOC7 机器学习 抑郁症、卵巢癌 单细胞RNA-seq、流式细胞术、eQTL分析、孟德尔随机化、siRNA敲低 NA 单细胞转录组数据、基因组关联研究摘要统计数据 未明确总样本量,涉及抑郁症和卵巢癌患者外周血单细胞数据及HOC7细胞系 NA 单细胞RNA-seq NA NA
23 2026-05-30
Pyroptosis-Related Gene Signatures and Immune Modulation in Ovarian Cancer: Insights from Multi-Omics and Machine Learning
2026-May-21, Genes IF:2.8Q2
研究论文 通过多组学和机器学习分析卵巢癌中焦亡相关基因特征及其免疫调节作用,确定CEP55为潜在生物标志物 首次系统整合焦亡相关基因与多组学数据及机器学习算法,鉴定CEP55作为卵巢癌核心生物标志物,并揭示其在细胞周期调控与免疫调节之间的桥梁作用 研究主要依赖公开数据库GSE54388,样本来源有限,且缺乏体外实验验证CEP55的功能机制 系统分析卵巢癌中焦亡相关基因的表达谱,发现稳健的生物标志物以改善早期诊断和预后评估 卵巢癌患者样本及正常对照样本的基因表达数据,包括微阵列数据和单细胞RNA-seq数据 机器学习 卵巢癌 微阵列、单细胞RNA-seq 支持向量机、XGBoost、广义线性模型 基因表达数据、免疫细胞浸润数据 GSE54388数据集的卵巢癌及正常样本,多个独立bulk和scRNA-seq数据集用于验证 NA NA NA NA
24 2026-05-30
Neuregulin-1β Mitigates Doxorubicin-Induced Cardiotoxicity via Serping1 in Cardiac Fibroblasts
2026-May-21, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究评估了Neuregulin-1β在阿霉素诱导的心脏毒性中的保护作用,特别是通过Serping1调节心脏成纤维细胞 首次发现Serping1在蒽环类心脏毒性中的新作用,并揭示了NRG1通过调节成纤维细胞-心肌细胞相互作用发挥保护作用的机制 NA 阐明NRG1在DOX治疗期间(特别是在癌症存在时)的心脏保护机制 荷瘤雌性BALB/c小鼠、人3D心脏微组织、原代心脏成纤维细胞富集培养物 机器学习 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 图像、文本 4T1肿瘤携带雌性BALB/c小鼠,分组为盐水组、DOX组、DOX+NRG1组 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序
25 2026-05-30
Deciphering Cell-Type-Specific Transcriptional Regulation in Tomato Leaves Through Ensemble Machine Learning and Single-Cell Transcriptomics
2026-May-21, Plants (Basel, Switzerland)
研究论文 通过集成机器学习和单细胞转录组学解析番茄叶片细胞类型特异性转录调控 首次将高维加权基因共表达网络分析与集成机器学习结合,用于非模式作物番茄的单细胞转录组分析,并通过计算机模拟预测转录因子敲除对细胞命运的影响 研究基于计算机模拟分析,缺乏实验验证;仅聚焦番茄叶片,未涉及其他组织或胁迫条件 解析番茄叶片中细胞类型特异性的转录调控机制 番茄叶片单细胞转录组数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 集成机器学习模型(如XGBoost) 单细胞转录组数据 涉及19个细胞亚群,分属5种主要细胞类型,样本总数未明确 NA 单细胞RNA测序 NA NA
26 2026-05-30
A Vascular-Extracellular Matrix Molecular Program Identifies High-Risk Diffuse Glioma Across Independent Multi-Omics
2026-May-20, Cancers IF:4.5Q1
研究论文 利用MOFA+从弥漫性胶质瘤多组学数据中识别出血管-细胞外基质重塑程序作为独立预后因子 首次通过多组学因子分析(MOFA+)整合转录组、甲基化和基因组数据,识别出血管-ECM轴作为弥漫性胶质瘤的独立预后因子,并通过外部验证和单细胞数据投影验证其稳健性 血管-ECM程序在TCGA的IDH分层亚组中未达到FDR校正显著性,且在CGGA队列中方向一致但效应大小存在队列依赖性;研究为相关性分析,缺乏因果验证 识别弥漫性胶质瘤中独立于IDH突变状态和肿瘤纯度的稳健预后分子程序 弥漫性胶质瘤患者(TCGA 667例,CGGA批次1 325例,批次2 693例,共1685例) 机器学习 弥漫性胶质瘤 MOFA+, RNA-seq, 甲基化测序, 基因组测序, 单细胞RNA-seq MOFA+ 转录组数据, 甲基化数据, 基因组数据, 单细胞转录组数据 1685例弥漫性胶质瘤患者(含TCGA 667例,CGGA批次1 325例,批次2 693例) Illumina bulk RNA-seq, 甲基化测序, 全外显子组测序, 单细胞RNA-seq Illumina HiSeq, Illumina NovaSeq TCGA和CGGA队列使用Illumina平台进行RNA-seq和甲基化阵列分析;单细胞数据来自GSE131928(GBM样本)
27 2026-05-30
[Multi-omics integration deciphers immune-metabolic heterogeneity in colorectal cancer: a prognostic model and therapeutic strategies targeting ANGPTL4/FABP4/RBP7]
2026-May-20, Nan fang yi ke da xue xue bao = Journal of Southern Medical University
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
28 2026-05-30
Organoids to Model Tumor Microenvironment in Progression of Pathogenesis and Treatment Resistance in Glioblastoma Multiforme
2026-May-18, Brain sciences IF:2.7Q3
综述 本文综述了类器官技术在多形性胶质母细胞瘤(GBM)肿瘤微环境建模及治疗耐药机制研究中的最新进展 系统比较了多种GBM类器官策略(患者来源类器官、脑类器官共培养系统及免疫/血管整合平台),并强调空间转录组学、芯片上类器官及人工智能集成等新兴技术的应用 未讨论类器官模型的长期稳定性、标准化问题及临床转化中的大规模验证挑战 总结GBM类器官技术在模拟肿瘤微环境驱动机制和治疗耐药中的最新进展 多形性胶质母细胞瘤及其肿瘤微环境中的细胞组分(肿瘤相关巨噬细胞、反应性星形胶质细胞、内皮细胞、周细胞、GBM干细胞)和非细胞组分(细胞外基质重塑、缺氧、代谢梯度及细胞因子网络) 数字病理学 胶质母细胞瘤 空间转录组学、类器官培养、芯片上类器官、活体成像、谱系追踪、基因组编辑 类器官模型 空间转录组数据、成像数据 不适用 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组学平台
29 2026-05-30
The USP19-DnaJC7 Axis Stabilizes p53 in Cisplatin-Treated Epithelial Ovarian Cancer
2026-May-18, Cells IF:5.1Q2
研究论文 本研究发现了在顺铂治疗的上皮性卵巢癌中,去泛素化酶USP19通过稳定DnaJC7来增强p53稳定性,从而可能抑制癌症复发的机制 首次揭示了USP19-DnaJC7轴在调控p53稳定性中的作用,为增强顺铂疗效提供了新的联合治疗策略 NA(摘要未提及具体局限性) 阐明上皮性卵巢癌复发的分子机制,寻找新的治疗靶点 上皮性卵巢癌患者转录组数据和单细胞RNA测序数据,以及相关细胞实验模型 分子生物学 上皮性卵巢癌 RNA测序, 单细胞RNA测序, 蛋白质-蛋白质相互作用分析 NA 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 NA(摘要未明确说明样本数量) NA 单细胞RNA-seq NA NA
30 2026-05-30
Preliminary Analysis of the Proportion and Characteristics of Dual BCR B Cells in SLE Model Mice and Patients via scRNA-Seq Combined with scBCR-Seq Technology
2026-May-17, Cells IF:5.1Q2
研究论文 利用单细胞RNA测序结合单细胞BCR测序技术初步分析SLE模型小鼠和患者中双BCR B细胞的比例与特征 首次在高通量单B细胞水平揭示双BCR B细胞在SLE模型小鼠和患者中的比例、亚群来源分布、CDR3库组成和效应分子表达呈现独特特征 未说明 探究系统性红斑狼疮中双BCR B细胞的比例、BCR配对类型、克隆演化模式和转录组特征 SLE模型小鼠(MRL/Lpr和SLE.Yaa)及SLE患者外周血 数字病理学 系统性红斑狼疮 单细胞RNA测序, 单细胞BCR库测序 NA 基因表达数据, BCR序列数据 SLE模型小鼠和SLE患者(具体数量未说明) 10x Genomics 单细胞RNA测序, 单细胞BCR测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'试剂盒结合单细胞BCR测序
31 2026-05-30
Toward Precision Health in Autoimmunity and Immune-Related Adverse Events: The Autoantibody Reactome, Spatial Omics, and Multimodal Data Integration
2026-May-16, Biomedicines IF:3.9Q1
观点文章 本文探讨了自身抗体反应组、空间组学和多模态数据整合在自身免疫性疾病及免疫相关不良事件精准医疗中的应用前景 提出自身抗体反应组作为连接系统性免疫历史、组织病理和临床轨迹的统一框架,并强调空间组学作为解码反应组定义免疫状态的机制工具,而非独立解决方案 未提供具体实验数据验证,仅基于现有文献进行理论推演;临床转化需要从探索性资源转向经分析验证且临床可解释的生物标志物组合 为自身免疫性疾病和免疫相关不良事件开发临床可用的风险分层、早期检测、内型分型和治疗指导工具 类风湿关节炎患者(作为原型疾病)和免疫检查点抑制剂相关性炎症关节炎患者(作为治疗诱导免疫失调模型) 机器学习 类风湿关节炎, 免疫相关不良事件 空间转录组学, 空间蛋白质组学 多模态人工智能模型 文本, 图像 NA NA 空间转录组学, 空间蛋白质组学 NA NA
32 2026-05-30
Integrative Multi-Omics Analysis Identifies IL18R1 as a Circulating Prognostic Biomarker for Risk Stratification in Extensive-Stage Small Cell Lung Cancer
2026-May-15, Cancers IF:4.5Q1
研究论文 通过整合多组学分析识别IL18R1作为广泛期小细胞肺癌循环预后生物标志物 首次通过整合pQTL/eQTL孟德尔随机化、差异表达和加权基因共表达网络分析,结合多种机器学习方法和单细胞转录组学,系统性识别并验证了IL18R1作为广泛期小细胞肺癌的循环预后生物标志物,并构建了包含血浆IL18R1和临床变量的预后模型 IL18R1在局限期小细胞肺癌中的预测效能不一致,需要进一步验证 识别小细胞肺癌的循环预后生物标志物以改善风险分层 广泛期小细胞肺癌患者 机器学习, 数字病理学 肺癌 孟德尔随机化, 单细胞转录组学, 多组学分析 LASSO-Cox, Elastic Net 基因表达数据, 蛋白质组学数据, 单细胞转录组数据 训练集GSE149507,验证集GSE60052;单细胞数据集GSE150766和GSE279570;前瞻性临床队列300例 NA 单细胞RNA测序 NA NA
33 2026-05-30
DNA Hypomethylation of MIR21 Drives Hsa-miR-21-5p Expression in High-Grade Meningiomas and Reshapes Transcriptomic Signatures of Oncogenic Pathways and Intercellular Communication
2026-May-15, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究探讨了MIR21基因DNA低甲基化如何驱动高级别脑膜瘤中hsa-miR-21-5p的表达,并重塑致癌通路和细胞间通讯的转录组特征 首次揭示了MIR21基因的DNA低甲基化在高级别脑膜瘤中驱动hsa-miR-21-5p过表达,并通过影响多个靶基因和肿瘤微环境中边界相关巨噬细胞的通讯来促进肿瘤生长 未明确提及该研究的局限性 阐明MIR21基因DNA低甲基化在高级别脑膜瘤中调控hsa-miR-21-5p表达及其对致癌通路和细胞间通讯的影响 不同WHO分级的脑膜瘤组织样本及KT21-MG1脑膜瘤细胞系 数字病理学 脑膜瘤 NA NA 转录组数据、单细胞RNA测序数据 良性、非典型和间变性脑膜瘤样本 NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
34 2026-05-30
Integrated Transcriptomic and Spatial Analyses Associate M2-like Myeloid Signatures with Neuroimmune Remodeling in Alzheimer's Disease
2026-May-15, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 通过整合转录组和空间分析方法,发现M2样髓系特征与阿尔茨海默病的神经免疫重塑相关 首次综合使用批量转录组、单细胞RNA测序和空间转录组数据,跨Braak分期和疾病状态系统表征AD相关的髓系免疫变化,并利用免疫特征分类器识别区分AD与对照的髓系相关变量 研究仅揭示相关性而非因果关系,M2样髓系特征作为候选神经免疫成分仍需在人类相关系统中进行实验验证 阐明阿尔茨海默病中巨噬细胞和髓系状态随疾病严重程度的变化及其在神经免疫重塑中的作用 阿尔茨海默病患者的脑组织样本及相关转录组数据 机器学习和生物信息学 阿尔茨海默病 批量转录组分析、单细胞RNA测序、空间转录组学、CellChat分析 NA 基因表达数据(转录组数据) 涉及多个数据集,具体样本量未在摘要中说明 NA 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
35 2026-05-30
Prognostic Genes Linked to Asparagine Metabolism in Hepatocellular Carcinoma: Identification, Validation, and Regulatory Mechanisms Based on Transcriptome and Single-Cell RNA Sequencing
2026-May-15, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 基于转录组和单细胞RNA测序,鉴定并验证与肝细胞癌中天冬酰胺代谢相关的预后基因及其调控机制 首次从与天冬酰胺代谢特征相关的共表达模块中鉴定预后标志物,而非仅关注经典代谢基因,并构建了包含BOP1、SAC3D1和PDE2A的三基因预后风险评分模型 研究主要基于公开数据库,缺乏系统的实验和临床验证 明确天冬酰胺代谢在肝细胞癌进展中的调控机制,并建立预后模型 肝细胞癌患者样本的转录组和单细胞RNA测序数据 自然语言处理 肝细胞癌 RNA测序、单细胞RNA测序 LASSO算法 基因表达数据、单细胞转录组数据 TCGA数据库和GEO数据集(GSE14620) NA 单细胞RNA测序 NA NA
36 2026-05-30
Integrated Network Pharmacology and Single-Cell Transcriptomics Reveal Transketolase as a Potential Target for the DanShen-DaHuang Herb Pair in Acute Kidney Injury
2026-May-15, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 整合网络药理学和单细胞转录组学揭示丹参-大黄药对在急性肾损伤中靶向转酮醇酶的潜在机制 首次结合网络药理学、加权基因共表达网络分析和多算法机器学习优先排序,预测转酮醇酶作为丹参-大黄药对治疗急性肾损伤的潜在核心靶点,并通过单细胞RNA测序解析其在巨噬细胞M2极化中的调控作用 主要基于计算分析和公共数据库,缺乏体内外实验对预测靶点的直接验证,且样本来源有限,单细胞数据来自单一数据集 探究丹参-大黄药对在急性肾损伤中的分子作用靶点及机制 急性肾损伤(AKI)和丹参-大黄药对 计算生物学、机器学习和单细胞转录组学 急性肾损伤 网络药理学、加权基因共表达网络分析(WGCNA)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、分子对接 LASSO、Boruta、随机森林、GBM、XGBoost、决策树 基因表达数据(网络药理学、WGCNA)、单细胞RNA测序数据(GSE197266) 单细胞RNA测序分析包含77,593个高质量细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
37 2026-05-30
NFE2L2-Associated Ferroptosis Resistance Reshapes the Tumor Immune Microenvironment and Guides Therapeutic Strategies in Prostate Cancer
2026-May-15, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究通过多组学方法解析前列腺腺癌中NFE2L2相关的铁死亡抵抗如何重塑肿瘤免疫微环境并指导治疗策略 整合批量RNA-seq、单细胞RNA-seq和空间转录组学多组学数据,首次揭示NFE2L2相关铁死亡抵抗与免疫排斥的关联,并识别出RSL3、阿托伐醌和索拉非尼作为潜在治疗药物 研究基于计算分析,铁死亡调节剂的免疫调节作用及药物疗效仍需体内外实验验证 探索前列腺腺癌中铁死亡抵抗对肿瘤免疫微环境的影响及治疗策略 前列腺腺癌患者样本(包括498个肿瘤的批量RNA-seq、68,322个细胞的单细胞RNA-seq和19,483个点的空间转录组数据) 计算机视觉, 自然语言处理 前列腺癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 分子对接 NA 图像, 文本, 视频 498个肿瘤样本(批量RNA-seq),68,322个细胞(单细胞RNA-seq),19,483个点(空间转录组) Illumina, 10x Genomics 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 Illumina NovaSeq, 10x Chromium, 10x Visium Illumina NovaSeq用于批量RNA-seq测序,10x Chromium Single Cell 3'用于单细胞RNA-seq,10x Visium用于空间转录组学
38 2026-05-30
A Multi-Omics Framework Reveals Tumor Heterogeneity and Predicts Therapeutic Targets in Renal Cell Carcinoma
2026-May-15, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 开发了一个整合单细胞RNA测序、批量RNA测序和临床数据的计算框架,用于识别与癌症进展相关的细胞亚群,并在肾细胞癌中揭示肿瘤异质性和预测治疗靶点 首次开发了CPcellsubpopulation计算框架,整合多组学数据识别癌症进展相关细胞亚群,并在9种癌症中验证了一致性模式 未提及具体局限性,可能包括计算框架的验证范围有限以及缺少外部独立验证队列 揭示肿瘤细胞异质性和多细胞相互作用,识别癌症进展相关细胞亚群并预测治疗靶点 肾细胞癌患者肿瘤组织样本 计算生物学 肾细胞癌 单细胞RNA测序、批量RNA测序、空间转录组学 NA 基因表达数据、空间转录组数据 9种癌症数据集,具体样本量未提及 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量RNA测序 NA NA
39 2026-05-30
CNS1-dependent regulatory T cells shape recovery from acute lung injury
2026-May-14, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
研究论文 研究CNS1依赖的调节性T细胞在急性肺损伤恢复中的作用 通过单细胞RNA测序揭示CNS1缺陷导致Treg细胞无法完全激活支持抑制和修复功能的转录程序,首次阐明外周诱导Treg在ALI严重程度中的关键作用 未明确说明 探究外周诱导的调节性T细胞在急性肺损伤恢复过程中的功能机制 CNS1基因敲除小鼠的肺组织Treg细胞 机器学习 急性肺损伤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠模型(CNS1缺陷与野生型对照) NA 单细胞RNA测序 NA NA
40 2026-05-30
Breast Cancer Milieu Maneuvers Cancer-Associated Macrophages to Synergize Neoplastic Repertoires
2026-May-14, Cancers IF:4.5Q1
综述 探讨乳腺癌微环境如何调控肿瘤相关巨噬细胞(TAM)以促进肿瘤发展,并重点分析M2型巨噬细胞的分子机制、异质性及临床转化挑战 系统整合了单细胞测序、空间转录组学和计算生物学的最新进展,揭示TAM异质性,并批判性评估了从基础研究到临床应用的转化障碍 临床转化受限于治疗特异性低、补偿性信号通路激活以及小鼠与人类巨噬细胞生物学差异 阐明乳腺癌中支持M2型巨噬细胞极化的分子信号,并探讨克服治疗局限性的策略 乳腺癌肿瘤相关巨噬细胞(TAMs),尤其是M2亚型及其相关信号通路(如CSF1/CSF1R、STAT3、IL-6等) NA 乳腺癌 单细胞测序、空间转录组学 NA NA NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
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