单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 41493 篇文献,本页显示第 21 - 40 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
21 2026-07-15
Spatial and single-cell profiling identify NDRG1⁺ macrophages as key hallmark of angiogenic remodeling and platinum resistance in HGSOC
2026-Jul-13, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 通过空间转录组学和单细胞测序鉴定出NDRG1⁺巨噬细胞是高级别浆液性卵巢癌血管生成重塑和铂类耐药的关键标志 首次整合空间转录组学、单细胞测序和多重免疫荧光技术,精确定义了一种名为Macro4的肿瘤促进性巨噬细胞表型,并发现NDRG1是其主调控因子,与缺氧适应、血管生成和铂类耐药密切相关 文章未明确指出局限性 阐明高级别浆液性卵巢癌中驱动疾病进展和治疗耐药的巨噬细胞程序 高级别浆液性卵巢癌患者的肿瘤样本 数字病理学 卵巢癌 空间转录组学, 单细胞测序, 多重免疫荧光 随机生存森林 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 图像数据 多个队列的样本 NA 空间转录组学, 单细胞RNA测序 NA NA
22 2026-07-15
Multi-omics analysis of arginine metabolism in ovarian cancer: A prognostic signature and GTF2F2-driven stromal remodeling
2026-Jul-13, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 通过多组学分析卵巢癌中精氨酸代谢,构建预后特征并发现GTF2F2驱动基质重塑 首次结合单细胞和批量RNA测序分析,利用十种机器学习算法构建精氨酸代谢相关预后特征(AMRS),并识别GTF2F2作为关键转录调控因子 未提及明确的局限性,但可能包括样本队列的异质性和缺乏前瞻性验证 建立精氨酸代谢相关预后特征以指导卵巢癌预后和治疗,并识别可干预的调控因子 卵巢癌患者的单细胞和批量RNA测序数据,以及A2780和HEY细胞系 自然语言处理, 计算生物学 卵巢癌 RNA测序, 单细胞RNA测序, siRNA抑制, qPCR, 免疫印迹, CCK-8, 集落形成, 迁移, 流式细胞术, 双荧光素酶报告基因分析 随机生存森林(RSF), SHAP, GAN 基因表达数据, 单细胞转录组数据 未明确提及样本数量,但包括单细胞测序和批量RNA测序数据,以及A2780和HEY细胞系实验 Illumina, 10x Genomics 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 Illumina NovaSeq, 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序, Illumina NovaSeq批量RNA测序
23 2026-07-15
Serum metabolomics profiling in head and neck squamous cell carcinoma: a multicentre diagnostic study
2026-Jul-13, EBioMedicine IF:9.7Q1
研究论文 本研究通过血清代谢组学分析,开发并验证了一个用于检测头颈部鳞状细胞癌的8-代谢物诊断模型,并进行了分子分型探索 首次在大规模多中心队列中通过血清代谢组学建立高灵敏度和特异性的HNSCC诊断模型,并整合空间转录组等数据揭示分子异质性 模型在区分HNSCC与口腔潜在恶性疾病时表现出中等鉴别能力(AUC=0.710),且研究为回顾性质,需前瞻性验证 开发血清代谢组学生物标志物用于头颈部鳞状细胞癌的早期诊断和分子分型 头颈部鳞状细胞癌患者、健康对照、口腔潜在恶性疾病患者 机器学习 头颈部鳞状细胞癌 LC-MS/MS, 空间转录组学 机器学习特征选择模型 代谢组学数据、转录组学数据、空间转录组学数据 938名参与者(457名HNSCC患者,451名对照,30名OPMD患者) NA 空间转录组学 NA NA
24 2026-07-15
Nasal immunity in respiratory viral infection, transmission, and protection
2026-Jul-13, Immunity IF:25.5Q1
review 综述了鼻黏膜在呼吸道病毒感染、传播和保护中的免疫作用 利用单细胞RNA测序和气液界面模型等高分辨率技术,阐述了鼻黏膜上皮和免疫细胞在病毒感染中的协调作用以及组织记忆形成机制 未提及具体研究限制 总结鼻黏膜在稳态下的细胞组成、病毒感染后的免疫反应,并探讨鼻内疫苗接种策略以预防疾病和病毒传播 小鼠和人类的鼻黏膜细胞 machine learning respiratory viral infection RNA-seq NA 单细胞RNA测序数据 NA 10x Genomics single-cell RNA-seq 10x Chromium 单细胞RNA测序
25 2026-07-15
Tumor innervation drives cancer cell plasticity and immune evasion through the SLPI-GZMB axis
2026-Jul-13, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序,揭示肿瘤神经支配通过SLPI-GZMB轴驱动癌细胞可塑性和免疫逃逸的机制 首次发现神经来源的P物质通过TACR1受体诱导肿瘤细胞分泌SLPI,并明确SLPI通过抑制颗粒酶B介导的细胞凋亡和焦亡促进免疫逃逸,同时提出SP-TACR1-SLPI轴作为联合免疫治疗的靶点 主要基于小鼠模型和临床数据集分析,尚需在人类肿瘤中进一步验证;SLPI在神经支配肿瘤中的具体调控网络及下游信号通路的全貌尚未完全阐明 探究神经信号如何调控癌细胞可塑性和免疫抵抗的分子机制 小鼠神经内与非神经内肿瘤配对模型、人肿瘤样本(具有神经浸润)以及临床免疫治疗数据集 机器学习 肿瘤 单细胞RNA测序、蛋白质组学、生物化学分析 NA 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 小鼠模型(具体数量未提及)及人类肿瘤临床样本 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
26 2026-07-15
Restoring the CD226 in CD8+T cells overcomes TIGIT-refractory immunity in HER2+ breast cancer
2026-Jul-13, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本研究揭示通过恢复CD8+T细胞中的CD226来克服HER2阳性乳腺癌中TIGIT介导的免疫耐受机制 首次发现TIGIT信号通路是HER2+乳腺癌免疫治疗耐受的关键轴,并证明恢复CD226共刺激受体可逆转这一耐受 未提及临床转化中的潜在副作用或长期治疗效果的评估 探究HER2+乳腺癌对免疫检查点阻断治疗耐受的机制并开发新的联合治疗策略 HER2阳性乳腺癌患者和动物模型中的CD8+T细胞、肿瘤细胞及肿瘤微环境 免疫肿瘤学 乳腺癌 单细胞转录组学、体外共培养实验、体内扰动实验、多重组织分析 动物模型(抗HER2非敏感小鼠模型)、患者队列(新辅助治疗非pCR队列) 单细胞转录组数据、临床队列数据、组织切片数据 采用抗HER2非敏感小鼠模型和包含新辅助治疗非pCR患者队列 NA 单细胞RNA测序 NA NA
27 2026-07-15
Transcriptomic analysis of tissue-resident memory T cells of the fallopian tube reveals a precursor immune surveillance network for ovarian cancer prevention
2026-Jul-13, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序和配对T细胞受体测序分析输卵管组织驻留记忆样T细胞,揭示其在卵巢癌预防中的前体免疫监视网络 首次发现输卵管来源与肿瘤浸润的驻留记忆样T细胞之间存在显著克隆和功能重叠,并鉴定出与表观遗传可塑性和代谢适应相关的新型SIK3高表达亚群 未提及 研究输卵管组织驻留记忆样T细胞在卵巢癌免疫监视和预防中的作用 来自患者配对非癌性输卵管、转移性肿瘤和外周血的组织驻留记忆样T细胞 数字病理学 卵巢癌 单细胞RNA测序、配对T细胞受体测序、类器官共培养 NA 单细胞转录组数据、T细胞受体序列数据 患者配对样本(非癌性输卵管、转移性肿瘤和外周血) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序和配对T细胞受体测序
28 2026-07-15
Dynamic single-cell transcriptomic analysis of peripheral blood mononuclear cells identifies novel biomarkers for autoimmune encephalitis
2026-Jul-13, Molecular psychiatry IF:9.6Q1
研究论文 对自身免疫性脑炎患者外周血单核细胞进行动态单细胞转录组分析,鉴定出NKT细胞及其亚群NKT-6减少可作为新型生物标志物 首次通过动态单细胞转录组分析揭示自然杀伤T细胞及其亚群NKT-6减少是自身免疫性脑炎的特异性标志物,并在多种神经精神疾病独立队列中验证其疾病特异性 未提及具体局限性 鉴定自身免疫性脑炎的新型生物标志物 自身免疫性脑炎患者外周血单核细胞 机器学习 自身免疫性脑炎 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 自身免疫性脑炎急性期患者及六个月序贯治疗随访样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
29 2026-07-15
Ex utero 3D culture system illuminates post-implantation development and functions of the mouse yolk sac
2026-Jul-13, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 提出一种新型3D仿生培养平台,在体外精确重现小鼠卵黄囊的植入后发育过程,并揭示其代谢、凝血、血管发育和屏障形成等新功能 开发了一种操作简单、高可重复性的3D仿生培养平台,首次在体外成功模拟了卵黄囊的中胚层、血管和内胚层分化,并通过单细胞RNA测序确认其与体内模型的保真度,揭示了卵黄囊在糖代谢、脂代谢、蛋白质代谢、凝血、物质运输和屏障形成中的新功能 未明确提及局限性 阐明卵黄囊在植入后发育中的分子和细胞机制,优化全胚胎培养系统 小鼠卵黄囊及其发育过程 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 3D仿生培养平台 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
30 2026-07-15
High-resolution reconstruction of cell-type-specific transcriptional regulatory processes from bulk sequencing samples
2026-Jul-13, Nature biotechnology IF:33.1Q1
研究论文 引入深度学习方法DeepDETAILS,从批量测序样本中高分辨率重建细胞类型特异性转录调控过程 提出一种准监督的交叉模态解卷积框架DeepDETAILS,利用scATAC-seq参考库对批量数据集进行碱基对分辨率基因组信号映射,适用于多种组学数据 未明确说明 开发一种从批量测序样本中解析细胞类型特异性转录调控信号的方法 人类组织和细胞类型,包括39种组织和86种细胞类型 机器学习 原发性硬化性胆管炎 scRNA-seq, scATAC-seq, PRO-cap, PRO-seq, ChIP-seq 深度学习 基因组信号数据 39种人类组织、86种细胞类型 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
31 2026-07-15
The perineurium integrates leptin with its sympathetic outflow to protect against obesity
2026-Jul-13, Nature metabolism IF:18.9Q1
研究论文 使用小鼠交感神经节的单细胞RNA测序,发现神经束膜细胞整合瘦素与交感流出以抵抗肥胖,揭示了瘦素作用中外周调控的新机制 首次发现神经束膜细胞同时表达瘦素受体和β-肾上腺素能受体,并揭示其在调节能量消耗和体重中的关键作用 研究主要基于小鼠模型,临床观察仅为相关性分析,且未排除其他细胞类型在过程中的贡献 探究瘦素外周传入与交感神经传出平衡的调控机制 小鼠交感神经节的神经束膜细胞、脂肪组织中的交感神经元束 单细胞转录组学 肥胖 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠交感神经节样本 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
32 2026-07-15
Single-cell and spatial transcriptomic analysis reveal distinct tumor microenvironment signatures in primary and recurrent hypopharyngeal squamous cell carcinoma
2026-Jul-13, Cellular & molecular biology letters IF:9.2Q1
研究论文 通过单细胞和空间转录组学分析揭示原发性和复发性下咽鳞状细胞癌中不同的肿瘤微环境特征 首次系统描绘复发性下咽鳞状细胞癌的肿瘤微环境特征,发现恶性上皮细胞通过IGF2BP2介导的m6A修饰稳定SMAD3 mRNA进而激活TGF-β信号,以及FN1介导的基质激活和CTLA4上调驱动的免疫逃逸机制 样本量较小(原发6例、复发3例),需要更大队列验证;功能验证实验有限,未深入探讨IGF2BP2抑制剂或CTLA4阻断的疗效 阐明下咽鳞状细胞癌复发相关的肿瘤微环境特征和分子机制 原发性和复发性下咽鳞状细胞癌的肿瘤组织样本 数字病理学 下咽鳞状细胞癌 scRNA-seq, 空间转录组学 NA 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据 6例原发性下咽鳞状细胞癌和3例复发性下咽鳞状细胞癌样本 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3'测序平台, 10x Visium空间转录组学平台
33 2026-07-15
Machine learning-based prognostic model and single-cell transcriptomic integration for identifying brain metastasis-associated malignant subpopulations and potential therapeutic targets in lung adenocarcinoma
2026-Jul-13, Cancer cell international IF:5.3Q1
研究论文 通过机器学习构建肺腺癌脑转移预后模型,并结合单细胞转录组学分析识别恶性亚群及潜在治疗靶点 首次整合机器学习算法与单细胞转录组分析,构建12基因脑转移相关预后签名,并发现SEC61G和CFL1作为新的治疗候选生物标志物 研究主要基于公开数据集,可能需要更多独立外部队列验证;单细胞分析样本量有限,可能影响细胞亚群全面性 识别肺腺癌脑转移的生物标志物和治疗靶点,并构建预后模型 肺腺癌脑转移样本的单细胞转录组数据以及多个肺腺癌患者队列 单细胞转录组学 肺腺癌、脑转移 单细胞RNA-seq、inferCNV、hdWGCNA、机器学习、qRT-PCR、免疫组化 机器学习预后模型(101种算法组合) 单细胞转录组数据 肺腺癌脑转移样本及多个肺腺癌生存队列 NA 单细胞RNA-seq NA NA
34 2026-07-15
An integrative epigenomic and single-cell framework identifies a prognostic DNA methylation risk score and ZNF638 silencing in urothelial carcinoma
2026-Jul-13, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 该研究通过整合表观基因组和单细胞分析框架,鉴定了尿路上皮癌中的预后DNA甲基化风险评分和ZNF638沉默 首次构建了基于441个预后甲基化单倍型块的DNA甲基化风险评分,并在多个独立队列中验证其预后价值;揭示了ZNF638通过调控抗病毒先天免疫基因表达发挥肿瘤抑制作用的新机制 需在前瞻性队列和功能研究中进一步验证ZNF638的治疗相关性,研究为回顾性注册且样本量有限 阐明表观遗传失调如何塑造尿路上皮癌的肿瘤身份、免疫微环境和临床风险 尿路上皮癌患者的肿瘤组织和细胞系 数字病理学 尿路上皮癌 EM-seq, WGBS, scRNA-seq, RNA-seq, CUT&Tag NA DNA甲基化数据、单细胞RNA测序数据、转录组数据 72例EM-seq样本、9例WGBS样本、9例scRNA-seq样本、574例验证队列 Illumina 单细胞RNA测序、全基因组亚硫酸氢盐测序、EM-seq Illumina NovaSeq NA
35 2026-07-15
Spatial organization of the TNBC tumor microenvironment: multicellular niches, T-cell bottlenecks, and therapeutic opportunities
2026-Jul-13, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
综述 综述了三阴性乳腺癌肿瘤微环境的空间组织,包括多细胞微环境、T细胞瓶颈和治疗机会 整合单细胞测序、空间转录组学和多重成像技术,系统阐述了微环境中多细胞互作的空间异质性及免疫抑制微环境的形成机制 主要基于现有文献总结,可能缺乏原创新数据;对跨队列可重复性微环境结构的验证尚有限 揭示TNBC肿瘤微环境的空间组织模式及其对免疫治疗反应的影响,提出基于空间特征的精准分层和联合治疗策略 三阴性乳腺癌(TNBC)的肿瘤微环境,包括免疫细胞、成纤维细胞、血管、神经等组分及其空间互作 机器学习, 数字病理学 乳腺癌 单细胞测序, 空间转录组学, 多重成像 NA 图像, 文本 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3’测序, 10x Visium FFPE空间转录组学
36 2026-07-15
Mechanical stress promotes excessive NETs and exacerbates acute lung injury via Piezo1-mediated mitochondrial dysfunction
2026-Jul-11, Redox biology IF:10.7Q1
研究论文 本研究揭示了机械应力通过Piezo1介导的线粒体功能障碍促进NETs过度形成并加剧急性肺损伤的机制 首次阐明Piezo1机械感受器在ALI中感知病理物理应变并通过Ca2+超载驱动线粒体功能障碍和NETs过度形成的新机制 研究主要基于动物模型和体外实验,人体内的具体机制有待进一步验证 探究肺生物力学微环境如何通过Piezo1调控中性粒细胞过度活化及其在急性肺损伤中的作用 LPS诱导的急性肺损伤小鼠模型中的多形核中性粒细胞 机器学习 急性肺损伤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 LPS诱导的小鼠模型及体外压缩细胞系统 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
37 2026-07-15
Integrative transcriptomics and scpagwas analysis predicts immune-related markers of preeclampsia
2026-Jul-11, Journal of reproductive immunology IF:2.9Q2
研究论文 整合转录组学和scPagwas分析预测子痫前期免疫相关标志物 首次整合单细胞RNA测序与批量转录组数据,利用scPagwas算法评估遗传关联,并结合LASSO和随机森林算法筛选出子痫前期巨噬细胞中三个关键枢纽基因(ARL4C、SLC16A10、DAB2) 样本量较小(单细胞数据4例,批量数据157例),且主要基于公共数据库的分析,缺乏实验验证 识别子痫前期胎盘组织中的免疫调控因子 子痫前期患者和正常妊娠的胎盘组织 机器学习 子痫前期 单细胞RNA测序、批量转录组测序、scPagwas分析 LASSO、随机森林、Monocle 基因表达数据 单细胞RNA测序4例,批量转录组数据157例 NA 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq NA NA
38 2026-07-15
Spatial transcriptome profiling links SERPINA3 to nerve-associated immunosuppression in pancreatic cancer
2026-Jul-10, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 利用空间转录组学等技术揭示SERPINA3在胰腺癌神经相关免疫抑制中的作用 首次通过空间转录组学等方法阐明感觉神经元诱导的SERPINA3促进胰腺癌免疫逃逸的机制 尚处于临床前研究阶段,需进一步验证临床转化潜力 探究胰腺导管腺癌中神经-免疫相互作用的机制 胰腺导管腺癌肿瘤细胞、感觉神经元、CD8 T细胞等 机器学习 胰腺癌 空间转录组学、多重免疫荧光、单细胞RNA测序 NA 空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 涉及多种细胞培养和动物模型,样本量未明确说明 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组学平台
39 2026-07-15
High salt supplementation of a MASH-inducing diet causes lean MASH phenotype with increased hepatic urea cycle activity and EIF5A hypusination
2026-Jul-09, Molecular metabolism IF:7.0Q1
研究论文 高盐补充诱导的瘦型MASH小鼠模型揭示了肝脏尿素循环活性增强和EIF5A羟脯氨酸化增加与肥胖型MASH不同的机制 创建了一种饮食诱导的瘦型MASH小鼠模型,并发现了与肥胖型MASH在肝脏尿素循环、线粒体蛋白合成和免疫细胞激活方面的差异 目前缺乏合适的动物模型,且环境触发因素和分子机制尚不明确 探究瘦型MASH的环境触发因素和分子机制,建立合适的动物模型 小鼠(Western diet加液体果糖诱导的肥胖型MASH和高盐补充的瘦型MASH模型) 机器学习 代谢性肝病 单细胞测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
40 2026-07-15
Ferroptosis-resistant myeloid niche shapes tumor natural evolution in glioblastoma
2026-Jul-09, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 通过整合多组学数据,揭示了抗铁死亡髓系微环境在胶质母细胞瘤肿瘤自然演化中的塑造作用 首次发现NUPR1髓系抑制性细胞在坏死周围微环境中富集,并通过抗铁死亡程序驱动间充质样肿瘤细胞进展 未提及明显限制 探究胶质母细胞瘤中髓系细胞与肿瘤细胞在空间和功能上的相互作用及其在肿瘤演化中的角色 多灶性胶质母细胞瘤患者的肿瘤组织样本 数字病理学 胶质母细胞瘤 scRNA-seq, scATAC-seq, 空间转录组学, 多重免疫荧光, 超微结构分析 NA 单细胞转录组数据, 单细胞染色质可及性数据, 空间转录组数据, 免疫荧光图像 多灶性胶质母细胞瘤患者样本 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium, Illumina NovaSeq 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学FFPE, Illumina NovaSeq测序平台
回到顶部