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当前共找到 42187 篇文献,本页显示第 21 - 40 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
21 2026-08-09
scXpand: Pan-cancer detection of T cell clonal expansion from single-cell RNA sequencing without paired single-cell TCR sequencing
2026-Aug-07, Cell genomics IF:11.1Q1
研究论文 开发了scXpand,一种机器学习框架,用于直接从单细胞RNA测序数据中检测T细胞克隆扩增,无需配对TCR测序 首次实现无需配对TCR测序即可从scRNA-seq数据中泛癌检测T细胞克隆扩增,并构建了包含260万T细胞的大型配对数据库 未提及具体局限性,可能包括依赖训练数据质量、泛化性需进一步验证 开发一种直接基于scRNA-seq数据的泛癌T细胞克隆扩增检测方法,以解决配对测序限制 人类T细胞,来自2.6百万个细胞的配对scRNA/TCR-seq数据 机器学习 癌症 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和配对TCR测序 机器学习模型(未指定具体类型,如CNN等) 单细胞基因表达数据 260万个人类T细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
22 2026-08-09
Nuclear localized p70S6K maintain cancer stem-like properties by modulating RPA3 activity in osteosarcoma
2026-Aug-07, Cellular signalling IF:4.4Q2
研究论文 本研究揭示了核定位的p70S6K通过与RPA3相互作用并调节其单链DNA结合活性,维持骨肉瘤癌症干细胞特性,并提出了核p70S6K-RPA3通路作为潜在的治疗靶点 首次发现核定位的p70S6K在骨肉瘤中通过物理结合RPA3并调节其活性来驱动癌症干细胞特性,填补了核p70S6K在癌症发展中作用的研究空白 摘要中未提及研究的局限性 探究核定位的p70S6K在骨肉瘤癌症干细胞维持中的作用及其机制,并评估其作为治疗靶点的潜力 骨肉瘤细胞及癌症干细胞亚群 机器学习 骨肉瘤 单细胞转录组学 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
23 2026-08-09
Growth differentiation factor 15 impairs periodontal ligament stem cell proteostasis via integrated stress response to drive diabetic periodontitis
2026-Aug-07, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和孟德尔随机化,揭示生长分化因子15通过整合应激反应损害牙周韧带干细胞蛋白稳态,从而驱动糖尿病牙周炎进展 首次阐明GDF15在糖尿病牙周炎中通过PERK-eIF2α信号通路介导ISR的机制,并利用遗传缺失、抗体中和及ISR抑制等方法验证其治疗潜力 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,可能不完全反映人类糖尿病牙周炎的复杂性,且未涉及长期治疗效果评估 阐明GDF15在糖尿病牙周炎中的作用及其通过ISR影响牙周再生的机制,为改善T2DM患者牙周再生结局提供新靶点 牙周组织、牙周韧带干细胞、糖尿病小鼠模型 基因组学、分子生物学 糖尿病牙周炎 单细胞RNA测序、孟德尔随机化、基因敲除、抗体中和、药理学抑制 NA 单细胞转录组数据、临床遗传数据、实验数据 未在标题和摘要中明确说明样本量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
24 2026-08-09
Cerebral large vessel occlusion stroke multiomics biosample cohort (CLOMB): a multicentre cohort protocol
2026-Aug-07, Stroke and vascular neurology IF:4.4Q1
研究方案 本研究介绍了一个多中心、多组学的双向队列研究方案,旨在收集急性缺血性卒中伴大血管闭塞患者的血栓、颅内血液及外周血样本,进行代谢组学、蛋白质组学和转录组学分析,以探索卒中及无效再通的相关生物标志物 创新性地采集了通过微导管或抽吸导管首次通过闭塞部位时的颅内血液,并结合血栓和外周血进行多组学分析,以研究局部闭塞微环境 文中未提及具体局限性 建立标准化的闭塞微环境生物样本采集和多组学分析方案,探索候选生物学通路,为改善卒中结局、促进诊断和分类提供基础 500例接受血管内治疗的急性缺血性卒中伴大血管闭塞患者 多组学 缺血性卒中 代谢组学、蛋白质组学、转录组学、单细胞RNA测序 NA 生物样本、临床数据、影像数据 500例患者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
25 2026-08-09
Integrated Identification of NAD⁺ Metabolism-Associated Candidate Genes
2026-Aug-07, Molecular neurobiology IF:4.6Q1
研究论文 通过整合批量与单细胞转录组分析,识别与偏头痛及NAD⁺代谢相关转录特征的外周免疫相关候选基因 首次将NAD⁺代谢相关转录特征与偏头痛的外周免疫失调联系起来,利用多算法交叉验证和单细胞测序探索候选基因表达谱 未提及具体局限性 识别偏头痛中与NAD⁺代谢相关的转录特征的外周免疫候选基因 偏头痛患者外周血样本及偏头痛小鼠模型 转录组学 偏头痛 批量RNA测序、单细胞RNA测序、qPCR LASSO回归、SVM-RFE、XGBoost 转录组数据 未明确样本数量 NA 批量RNA-seq、单细胞RNA-seq NA NA
26 2026-08-09
Single-cell transcriptomic analysis of ferroptosis-associated cell populations in the progression of diabetic retinopathy
2026-Aug-07, International ophthalmology IF:1.4Q3
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析糖尿病视网膜病变进展中铁死亡相关细胞群的特征和功能 首次在单细胞水平表征铁死亡相关的视网膜细胞亚群及其在糖尿病视网膜病变进展中的作用 基于大鼠模型的转录组数据,尚需验证在人类中的适用性;铁死亡相关基因集可能不完全覆盖所有相关机制 表征铁死亡相关细胞亚群及其在糖尿病视网膜病变进展中的作用 糖尿病大鼠模型的视网膜细胞 单细胞转录组学 糖尿病视网膜病变 单细胞RNA测序、RT-qPCR 聚类分析(Seurat)、蛋白互作网络、细胞通讯分析 基因表达数据 糖尿病大鼠模型的视网膜样本(具体数量未在标题和摘要中提供) NA 单细胞RNA测序 NA NA
27 2026-08-09
Hematopoietic Growth Factors Induce More Extensive Transcriptomic Remodeling in Cerebral Monocytes/Macrophages than in Microglia During the Chronic Phase of Traumatic Brain Injury
2026-Aug-06, Molecular neurobiology IF:4.6Q1
研究论文 本研究探讨了SCF+G-CSF联合治疗在慢性创伤性脑损伤小鼠模型中对脑内免疫细胞转录组的影响,发现单核细胞/巨噬细胞的转录组重塑比小胶质细胞更广泛 首次在慢性创伤性脑损伤阶段研究了SCF+G-CSF对脑内免疫细胞异质性的影响,通过单细胞RNA测序揭示外周免疫细胞(单核细胞/巨噬细胞)的转录组反应比常驻小胶质细胞更显著,并识别了潜在的关键通路(如IL-17信号通路) 未提及明确的局限性;基于小鼠模型,结果可能不直接适用于人类,且仅分析了治疗后单一时间点 阐明SCF+G-CSF联合治疗在慢性创伤性脑损伤中调节脑免疫细胞状态的机制 慢性创伤性脑损伤小鼠模型的脑内CD11b⁺免疫细胞,包括小胶质细胞和单核细胞/巨噬细胞 机器学习 创伤性脑损伤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据(单细胞RNA测序数据) 小鼠模型(具体数量未在标题和摘要中提供) NA 单细胞RNA测序 NA NA
28 2026-08-09
Dual Lineage Tracing Identifies Cellular Mechanisms Underlying Radiation-Associated Changes in Atherosclerotic Lesion Composition
2026-Aug-06, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 通过双重谱系追踪技术,研究了辐射诱导的动脉粥样硬化病变组成改变中的细胞机制,揭示了平滑肌细胞和内皮细胞的不同反应 首次在同一病变中同时追踪平滑肌细胞和内皮细胞的命运,避免了传统单谱系追踪中因动态变化标记基因导致的假阳性和假阴性问题 未在摘要中明确提及局限性 阐明辐射暴露下平滑肌细胞和内皮细胞的表型可塑性如何影响动脉粥样硬化斑块的组成和稳定性 双重谱系追踪Apoe缺陷小鼠的平滑肌细胞和内皮细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 图像和基因表达数据 使用双重谱系追踪Apoe缺陷小鼠进行实验,具体数量未在摘要中提及 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 单细胞RNA测序平台,具体配置未在摘要中详细说明
29 2026-08-09
GM-CSF Promotes Neutrophil PD-L1 Expression Through the VEGFR-2/STAT6/CSF2 Signaling Axis in Oral Squamous Cell Carcinoma
2026-Aug-06, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究揭示了口腔鳞状细胞癌中VEGFR-2/STAT6/CSF2信号轴通过促进中性粒细胞PD-L1表达介导免疫抑制的机制,为联合VEGFR-2抑制和抗PD-1治疗提供理论基础 首次发现VEGFR-2/STAT6/CSF2轴调控中性粒细胞PD-L1表达,揭示肿瘤细胞与中性粒细胞间新的免疫抑制串扰机制 研究主要在临床样本和动物模型中验证,尚需进一步临床试验证实疗效 阐明VEGFR-2高表达OSCC肿瘤通过GM-CSF诱导中性粒细胞PD-L1表达介导免疫抑制的分子机制,并评估VEGFR-2/GM-CSF轴作为治疗靶点的潜力 口腔鳞状细胞癌肿瘤组织、细胞系、中性粒细胞及小鼠模型 数字病理学 口腔鳞状细胞癌 多重免疫组化、单细胞RNA测序、流式细胞术 NA 图像、基因表达数据 临床OSCC肿瘤样本及动物模型样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
30 2026-08-09
Nephronectin promotes ameloblast differentiation through its RGD motif
2026-Aug-06, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 本研究揭示了肾连蛋白通过其RGD基序调控成釉细胞分化的分子机制,并识别出其功能受体整合素αVβ6。 首次阐明Npnt的RGD基序在成釉细胞分化中的具体作用,并发现EGF信号负调控该分化过程,提出了Npnt在牙齿发育中功能转换的新机制。 研究主要基于体外细胞系和小鼠组织,未进行体内功能验证;未深入探讨RGD基序与EGF样重复序列在体内的协同或拮抗作用。 探究Npnt在牙齿发育中通过RGD基序调控成釉细胞分化的作用及其功能受体。 小鼠牙上皮细胞系M3H1、小鼠门牙组织及牙上皮干细胞。 分子生物学 牙齿发育异常 基因过表达、siRNA敲低、竞争性抑制实验、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、细胞影像数据 小鼠牙上皮细胞系M3H1及小鼠门牙组织样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于小鼠门牙组织样本分析
31 2026-08-09
Single-cell transcriptomics reveals CD8 + T-cell heterogeneity linked to immunotherapy response in gastric cancer
2026-Aug-06, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 利用整合单细胞转录组学解析胃癌中与免疫治疗反应相关的CD8+ T细胞异质性 首次在免疫检查点抑制剂治疗的胃癌患者中,通过单细胞转录组学解析CD8+ T细胞状态,揭示治疗反应不仅取决于细胞状态丰度,还涉及共享状态内的功能重编程,并整合转录因子活性与配体-受体互作模型,阐明免疫状态分化的机制 未明确提及具体限制,但可能包括样本量有限、单细胞测序的稀疏性、以及推断方法(如轨迹和配体-受体模型)的验证不足 解析胃癌中CD8+ T细胞的异质性及其与免疫检查点抑制剂治疗反应的关系,揭示免疫状态分化的调控机制 胃癌患者肿瘤中的CD8+ T细胞 单细胞转录组学 胃癌 单细胞RNA测序、整合单细胞转录组学 轨迹分析、转录因子活性推断、配体-受体相互作用模型 单细胞转录组数据 未明确说明,涉及接受免疫检查点抑制剂治疗的胃癌患者肿瘤样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
32 2026-08-09
CXCL10 contributes to female-specific pathological progression in tauopathy model mice
2026-Aug-05, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1
研究论文 本研究揭示了CXCL10在tau蛋白病小鼠模型中促进雌性特异性病理进展的关键作用。 首次确定了CXCL10作为tau蛋白病中性别依赖性病理的关键炎症介质,并通过空间转录组学定义了星形胶质细胞CXCL10富集的炎症微环境。 CXCL10性别依赖性效应的分子机制尚不清楚。 探讨CXCL10在tau蛋白病进展中的作用及其性别依赖性机制。 P301S突变tau转基因小鼠模型 神经科学 tau蛋白病 空间转录组学、基因敲除 转基因小鼠模型 空间转录组数据、组织学数据 9个月和11-12个月龄的雄性和雌性小鼠 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组学
33 2026-08-09
Clifti-GPT: privacy-preserving federated fine-tuning and transferable inference of foundation models on clinical single-cell data
2026-Aug-05, BioData mining IF:4.0Q1
研究论文 提出Clifti-GPT,一种基于安全多方计算的隐私保护联邦学习框架,用于临床单细胞数据的基座模型微调和可迁移推理 创新性地结合安全多方计算与联邦学习,实现在不共享患者数据、临床级统计信息或模型的情况下进行零样本预测,并基于scGPT基座模型达到与集中式方法相当的性能 批处理效应影响模型性能,需进行校正以获得相似结果,且评估基于特定数据集,可能限制泛化性 开发隐私保护方法,使单细胞基座模型能够在分布式临床队列中有效微调和推理,满足GDPR合规要求 临床单细胞RNA测序数据,来自六个数据集的细胞类型分类和参考映射任务 机器学习 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 基础模型(基于scGPT) 单细胞基因表达数据 六个数据集,另包含一个大规模联邦设置(30个客户端) NA 单细胞RNA测序 NA NA
34 2026-08-09
Targeting the IL-17C-M2 macrophage axis ameliorates fibrosis in endometriosis through MAPK/ERK signaling
2026-Aug-05, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过空间转录组学和细胞相互作用分析,探讨了IL-17C-M2巨噬细胞轴在子宫内膜异位症纤维化中的作用,并验证了靶向该轴的MOR106抗体的治疗效果 首次揭示IL-17C/IL-17RE轴通过促进M2型巨噬细胞极化并激活MAPK/ERK信号通路,驱动子宫内膜异位症纤维化,并验证了MOR106抗体作为潜在治疗策略 该研究主要基于小鼠模型和体外实验,缺乏临床患者长期随访数据,且未深入探讨IL-17C在其他免疫细胞中的潜在作用 阐明IL-17C在子宫内膜异位症纤维化中的分子机制,并评估靶向IL-17C/IL-17RE轴的潜在治疗价值 人类子宫内膜异位症病灶和正常子宫内膜组织、小鼠子宫内膜异位症模型、巨噬细胞和子宫内膜基质细胞 数字病理学 子宫内膜异位症 空间转录组学、细胞相互作用分析、免疫组织化学、流式细胞术 NA 图像、基因表达数据 人类子宫内膜异位症和正常子宫内膜样本,数量未在摘要中说明,另有小鼠模型 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组学平台用于人类组织样本分析
35 2026-08-09
In silico analysis of transcriptomic datasets reveals nonlinear gene expression trajectories in aging microglia and Alzheimer's disease
2026-Aug-04, Experimental gerontology IF:3.3Q2
研究论文 通过计算机模拟分析转录组数据集,揭示衰老小胶质细胞和阿尔茨海默病中非线性基因表达轨迹 发现生理性小胶质细胞衰老中基因表达呈现动态非线性轨迹,且线粒体功能、溶酶体降解和免疫反应相关基因呈镜像模式,此模式在病理衰老后期被破坏 研究依赖公开数据集,未进行实验验证,且样本来源为小鼠和人类,可能存在物种差异 理解小胶质细胞在生理性和病理性衰老中的状态转变分子机制,识别阿尔茨海默病的早期干预靶点 小鼠(野生型和APP/PS1转基因)和人类的小胶质细胞转录组数据 转录组学 阿尔茨海默病 RNA-seq, scRNA-seq NA 基因表达数据 多个年龄段的野生型小鼠、APP/PS1转基因小鼠和人类样本 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
36 2026-08-09
Identifying potential core genes for chronic obstructive pulmonary disease associated with cocaine exposure via integrated bioinformatics and network toxicology
2026-Aug-04, Computational biology and chemistry IF:2.6Q2
研究论文 通过整合生物信息学和网络毒理学方法,识别与可卡因暴露相关的慢性阻塞性肺疾病的潜在核心基因CTSD,并探讨其分子机制 首次结合多组学数据、机器学习算法、单细胞RNA测序、虚拟敲除分析、分子对接和分子动力学模拟,系统揭示可卡因暴露与COPD之间的分子联系 研究基于公共数据库和计算预测,缺乏实验验证;可卡因暴露剂量和持续时间未具体考虑 识别可卡因暴露与COPD关联的潜在核心基因及其调控机制 可卡因暴露相关靶点和COPD相关差异表达基因 生物信息学 慢性阻塞性肺疾病 转录组测序、单细胞RNA测序 机器学习算法 基因表达数据、单细胞数据 34个重叠差异表达基因 NA 转录组测序、单细胞RNA测序 NA NA
37 2026-08-09
SRLST: a unified multimodal representation learning framework for spatial transcriptomics analysis
2026-Aug-03, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 提出了一种名为SRLST的无监督多模态表示学习框架,用于空间转录组数据分析,整合转录组、空间和形态学信息以精确识别组织结构。 创新性地采用双图变分自编码策略,联合建模空间邻近性和形态关系,并将这些信息与基因表达嵌入融合到统一潜在空间中,从而在多个数据集上提高空间域识别性能。 未在摘要中提及明确的局限性。 开发一种能够整合多种数据模态的无监督框架,以提高空间转录组中空间域的准确识别能力。 空间转录组数据,包括皮层组织、小而不连续的组织区室和复杂瘤内异质性样本。 机器学习 NA 空间转录组学 双图变分自编码器(Dual-graph variational autoencoder) 空间转录组数据(包括转录组信息、空间坐标和组织学图像) 多个不同的实验数据集(具体数目未在摘要中说明) NA 空间转录组学(spatial transcriptomics) NA NA
38 2026-08-09
Tumoral AMER1 driven dopamine synthesis triggers cancer cell pyroptosis and licenses CD8+ T cell immunity in colorectal cancer
2026-Aug-03, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本研究揭示了结直肠癌中肿瘤AMER1通过驱动多巴胺合成触发癌细胞焦亡并许可CD8+ T细胞免疫的机制。 首次将AMER1定义为免疫代谢的关键调控因子,并建立神经递质代谢旁路作为结直肠癌治疗新策略。 摘要未提及研究局限性。 阐明AMER1在结直肠癌中通过调控肿瘤免疫代谢微环境发挥肿瘤抑制作用的具体机制。 结直肠癌患者样本及小鼠同种移植瘤模型,包括不同的宿主免疫背景。 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序,多组学分析,生化追踪。 NA 单细胞RNA测序数据,多组学数据,临床数据。 未明确样本量,涉及CRC患者及小鼠模型。 NA 单细胞RNA测序。 NA NA
39 2026-08-09
Cardiac Macrophages Across Space and Time: Roles in Homeostasis, Disease, and Remodeling
2026-Aug, The Canadian journal of cardiology
综述 本文综述了心脏巨噬细胞在稳态、疾病和重塑过程中的时空异质性及其功能,探讨了基于区域和情境特异性靶向巨噬细胞的治疗潜力。 利用单细胞和空间转录组学的最新进展,系统阐述了心脏巨噬细胞的空间组织及其与心肌细胞、成纤维细胞等的互作,提出了区域和情境特异性靶向巨噬细胞的精准免疫调节策略。 限于综述性质,未提供原始实验数据;对具体分子机制的讨论可能不够深入;未涉及临床试验验证。 总结心脏巨噬细胞在稳态、损伤和修复中的时空分布及功能,评估靶向巨噬细胞治疗心脏损伤和重塑的可行性。 心脏巨噬细胞亚群,包括组织驻留巨噬细胞和募集性CCR2+巨噬细胞,以及与其互作的心肌细胞、成纤维细胞、内皮细胞和周细胞。 数字病理学 心血管疾病 单细胞转录组学,空间转录组学 NA 转录组数据,空间数据 NA NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
40 2026-08-09
Single-cell insights into plant growth, adaptation, and evolution
2026-Aug, Journal of integrative plant biology IF:9.3Q1
综述 综述了单细胞多组学技术在植物生长、适应和进化研究中的应用,涵盖转录组学、表观基因组学和空间组学,并讨论了挑战与未来方向 整合单细胞多组学方法(转录组、表观基因组和空间组学)来解析作物发育、胁迫响应和进化的调控网络,并提出了结合机器学习和空间转录组学的未来方向 讨论了原生质体分离的技术困难、多模态数据的计算整合以及跨物种的可扩展性等当前挑战 利用单细胞技术揭示植物细胞异质性,推动功能基因组学、精准育种和作物改良 植物,包括作物,重点关注细胞类型特异性程序和发育轨迹 基因组学 NA 单细胞多组学(转录组学、表观基因组学、空间组学) NA 单细胞转录组、表观基因组、空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、空间转录组学 NA NA
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