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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
21 2025-12-23
CD146+ CAFs mediate immunosuppression in gastric cancer via COL4A1: potential therapeutic targets
2025-Dec-21, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序鉴定出胃癌中一个独特的CD146+癌症相关成纤维细胞亚群,并揭示了其通过COL4A1介导免疫抑制的机制 首次在胃癌中鉴定出CD146+ CAFs这一特异性亚群,并系统阐明了其通过JAG1-NOTCH3信号轴促进COL4A1分泌,进而驱动巨噬细胞M2样极化并抑制CD8+ T细胞功能的完整分子机制 研究样本量相对有限(9对患者匹配组织),且主要基于临床前模型验证机制,尚未在更大规模临床队列中验证治疗靶点的有效性 鉴定胃癌中具有免疫抑制功能的特定CAF亚群,并阐明其介导免疫抑制的分子机制 胃癌患者肿瘤组织及癌旁正常组织中的成纤维细胞 单细胞组学 胃癌 单细胞RNA测序 生物信息学分析结合体外和体内实验验证 单细胞转录组数据 9对患者匹配的肿瘤和癌旁正常组织,共8,322个高质量成纤维细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
22 2025-12-23
Targeted antisense oligonucleotide treatment rescues developmental alterations in spinal muscular atrophy organoids
2025-Dec-21, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究利用脊髓性肌萎缩症(SMA)患者的脊髓和大脑类器官,揭示了疾病早期神经发育缺陷的广泛机制,并证明早期施用优化的反义寡核苷酸(ASO)可以挽救形态和功能缺陷 首次在SMA类器官模型中系统揭示了超越运动神经元退化的广泛神经发育缺陷,并证实早期ASO干预可精确纠正神经元分化关键节点的异常剪接 研究主要基于SMA 1型男性供者的类器官,样本多样性有限,且类器官模型无法完全模拟体内复杂环境 探究SMA的早期神经发育缺陷机制并评估早期治疗干预的效果 由多名SMA 1型男性供者细胞生成的脊髓和大脑类器官 神经科学 脊髓性肌萎缩症 单细胞转录组学、多电极阵列(MEA)分析、反义寡核苷酸(ASO)治疗 类器官模型 转录组数据、电生理数据 多名SMA 1型男性供者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
23 2025-12-23
PR inhibition stimulates G6PD expression to enhance malignancy in luminal breast cancer
2025-Dec-21, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本研究探讨了孕酮受体(PR)表达与管腔型乳腺癌恶性程度之间的潜在联系,特别是通过葡萄糖代谢途径,如磷酸戊糖途径(PPP)和葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PD)表达 揭示了PR抑制通过上调G6PD表达增强PPP活性,从而促进管腔型乳腺癌的恶性进展,并提出了以低PR表达为生物标志物、靶向G6PD的治疗策略 研究基于已发表数据集和细胞系实验,缺乏体内模型验证,且样本来源和数量未明确说明 探究PR表达与管腔型乳腺癌葡萄糖代谢及恶性程度之间的关联 管腔型乳腺癌细胞系(MCF7和T47D)及已发表的单细胞RNA测序数据集 癌症生物学 乳腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
24 2025-12-23
Exploring the expression and prognostic roles of LAD1 in lung adenocarcinoma
2025-Dec-21, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞和bulk RNA测序数据,探索了LAD1在肺腺癌中的表达及其预后作用 首次在单细胞水平上识别LAD1在肺腺癌细胞亚群中的特异性表达,并构建了包含LAD1表达和临床参数的列线图模型用于预后预测 样本量相对较小(10例单细胞数据,36例组织样本),且功能验证仅在A549细胞系中进行,缺乏体内实验验证 识别肺腺癌的新型生物标志物并理解其潜在机制 肺腺癌患者样本(包括单细胞和bulk RNA测序数据)及A549细胞系 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 免疫组化染色, siRNA敲低, 划痕愈合实验, Transwell实验 列线图模型 RNA测序数据, 图像数据 10例肺腺癌患者的单细胞RNA测序数据,36例肺腺癌患者的癌组织和癌旁组织样本 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
25 2025-12-23
Multi-omics integration and machine learning define robust molecular subtypes and prognostic signatures in hepatocellular carcinoma
2025-Dec-21, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过整合多组学数据和机器学习算法,定义了肝细胞癌的分子亚型并构建了预后签名 结合十种聚类算法和十种机器学习算法进行多组学整合分析,并利用单细胞RNA测序和空间转录组学数据揭示关键基因的细胞来源和空间表达模式 需要前瞻性临床验证来确认模型的预测性能 改进肝细胞癌的分子分型和预后预测 肝细胞癌患者 机器学习 肝细胞癌 多组学整合分析,单细胞RNA测序,空间转录组学 机器学习算法(未指定具体模型) 多组学数据,单细胞RNA测序数据,空间转录组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
26 2025-12-23
Single-Cell Targeted Transcriptomics Reveals Subset-Specific Immune Signatures Differentiating Asymptomatic and Cardiac Patients With Chronic Chagas Disease
2025-Dec-20, The Journal of infectious diseases IF:5.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞靶向转录组学揭示了慢性恰加斯病无症状和心脏型患者中免疫亚群的特异性免疫特征差异 首次应用免疫基因靶向单细胞RNA测序技术,在慢性恰加斯病的两个极化临床组中解析了免疫细胞的功能特征,揭示了与疾病进展相关的细胞特异性基因表达模式 研究样本可能有限,未涉及其他临床形式如消化型恰加斯病,且机制性验证不足 揭示慢性恰加斯病不同临床形式(无症状与心脏型)的免疫机制,以识别疾病标志物和病理机制 慢性恰加斯病患者的外周血单个核细胞,包括无症状(IND)和心脏型(CCC)临床组 单细胞组学 恰加斯病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 来自IND和CCC患者的外周血单个核细胞样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
27 2025-12-23
GCHFR-gut microbiota axis in gout: an integrative multi-omics and Mendelian randomization study with clinical and molecular validation
2025-Dec-20, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究通过整合多组学孟德尔随机化、肠道菌群分析、临床验证和计算模拟,确定了GCHFR等基因作为痛风的潜在治疗靶点 首次将多组学孟德尔随机化、肠道菌群关联分析和分子对接模拟相结合,系统性地识别并验证了痛风相关的候选基因及其与肠道菌群的互作关系 样本量相对有限(临床验证队列101人),功能验证主要在计算层面,需要进一步的体内外实验证实 识别痛风的分子机制和潜在治疗靶点 痛风患者、健康对照、候选基因(BAIAP2, CD248, GCHFR, ABHD14B)、肠道菌群 生物信息学、计算生物学 痛风 多组学孟德尔随机化(pQTL/eQTL/mQTL)、单细胞RNA测序、qRT-PCR、分子对接、分子动力学模拟 孟德尔随机化模型、分子对接模型、分子动力学模型 基因组、转录组、表观基因组、肠道菌群宏基因组、临床数据 临床验证队列:51名痛风患者和50名健康对照;公共数据库数据(如MiBioGen) NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
28 2025-12-23
Multicellular force coordination constructs microchannel networks for barrier-free metastasis across extracellular matrix
2025-Dec-19, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本文揭示了癌细胞通过多细胞力协调构建微通道网络,作为无屏障转移的“超级高速公路”,并探讨了其力学生物学机制 发现了癌细胞协作重编程细胞外基质以构建互连微通道网络的新机制,强调多细胞通信的协调动力学,而非单细胞视角 NA 研究癌细胞如何通过多细胞力协调克服细胞外基质屏障,促进转移 癌细胞及其在细胞外基质中的微通道网络构建 细胞生物学与生物力学 癌症 活细胞成像、原子力显微镜、光镊、单细胞测序、基于非晶格代理的模型 基于非晶格代理的模型 图像、力学数据、测序数据 NA NA 单细胞测序 NA NA
29 2025-12-23
PRDM1-driven SLC30A9 overexpression contributes to the malignant phenotype of cervical cancer cells via promoting mitochondrial hyperfunction
2025-Dec-19, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本研究揭示了转录因子PRDM1驱动的锌转运蛋白SLC30A9过表达通过促进线粒体功能亢进,从而促进宫颈癌恶性表型的作用机制 首次在宫颈癌中系统阐明了SLC30A9的功能及其转录调控机制,并发现PRDM1是调控其表达的关键转录因子 研究主要基于细胞和动物模型,临床样本验证相对有限;SLC30A9促进线粒体功能亢进的具体下游分子通路有待进一步阐明 探究SLC30A9在宫颈癌中的表达、功能及其调控机制 宫颈癌细胞系、原代宫颈癌细胞、临床宫颈癌组织样本、小鼠异种移植瘤模型 癌症生物学 宫颈癌 单细胞RNA测序、CRISPR/Cas9基因敲除、染色质免疫沉淀、生物信息学分析 NA 基因表达数据、蛋白质数据、功能表型数据 本地患者临床标本、多种已建立和原代宫颈癌细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
30 2025-12-23
Preclinical evaluation of TIGIT as a target to enhance efficacy and mitigate T cell exhaustion in multiple myeloma following BCMA-CAR-T therapy
2025-Dec-19, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和功能实验,评估了TIGIT作为靶点以增强BCMA-CAR-T疗法在多发性骨髓瘤中的疗效并减轻T细胞耗竭的潜力 首次在临床前模型中系统评估了TIGIT在BCMA-CAR-T疗法耐药中的作用,并证明抗TIGIT单克隆抗体可显著增强CAR-T增殖、减轻耗竭并提高体内抗肿瘤疗效 体外实验中TIGIT阻断对CAR-T功能影响有限,研究结论主要基于临床前模型,需进一步临床验证 阐明BCMA-CAR-T疗法在多发性骨髓瘤中的耐药机制,并探索TIGIT作为联合治疗靶点的潜力 复发/难治性多发性骨髓瘤患者的肿瘤浸润T细胞、CAR-T细胞、以及人源化免疫细胞重建小鼠模型 单细胞组学与免疫治疗 多发性骨髓瘤 单细胞RNA测序,流式细胞术,荧光素酶细胞毒性测定,CD107a脱颗粒,CFSE增殖,CD45RO/CD62L表型分析 人源化免疫细胞重建小鼠模型 单细胞转录组数据,流式细胞术数据,功能实验数据 复发/难治性多发性骨髓瘤患者样本(未明确具体数量) NA 单细胞RNA-seq NA NA
31 2025-12-23
Integrated transcriptomic analysis reveals metabolic remodeling and gene expression networks related to human 8-cell-stage embryo-like cells
2025-Dec-19, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序数据,比较和表征了来自不同干细胞系统的8细胞期胚胎样细胞,以评估其模拟人类早期胚胎发育的能力 首次整合多个研究的单细胞RNA测序数据集,系统性地比较了不同来源的8细胞期胚胎样细胞,并识别出成熟与中间状态细胞,揭示了其在能量代谢、RNA代谢和剪接调控等方面的重编程特征 研究依赖于已发表的单细胞RNA测序数据集,可能受到原始实验设计和批次效应的影响;且8细胞期胚胎样细胞仍为体外模型,与体内真实胚胎可能存在差异 评估不同干细胞来源的8细胞期胚胎样细胞作为人类早期胚胎发育和胚胎基因组激活研究模型的可靠性 人类8细胞期胚胎样细胞 单细胞组学 发育生物学 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 来自多个研究的单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
32 2025-12-23
TOGAR: Token-gated generative refinement for high-fidelity spatial transcriptomics and robust spatial domain clustering
2025-Dec-19, Genomics IF:3.4Q2
研究论文 本研究提出了一种名为TOGAR的令牌门控生成式精炼模型,用于空间转录组学数据的去噪、空间增强和聚类,以提升空间域划分的准确性和生物可解释性 TOGAR首次统一了去噪、空间增强和聚类任务,通过结合图卷积网络损失和零膨胀负二项分布损失处理稀疏计数数据,并采用基于UGate的扩散主干网络整合令牌门控、门控线性注意力和旋转位置嵌入进行生成式空间精炼 未明确提及具体局限性,但可能涉及模型在不同平台或组织类型上的泛化能力验证 解决空间转录组学数据中因稀疏性和噪声导致的长距离依赖建模困难,以准确划分空间域 空间转录组学数据 空间转录组学 NA 空间转录组学 图卷积网络, 扩散模型 基因表达计数数据 12个切片 NA 空间转录组学 NA NA
33 2025-12-23
Spatial organization of stromal subtypes stratifies colorectal cancer patients and predicts clinical outcomes
2025-Dec-19, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和多路成像技术,揭示了结直肠癌中肿瘤相关基质亚型的空间组织如何分层患者并预测临床结局 首次系统性地识别了结直肠癌中肿瘤相关基质亚群的空间组织模式,特别是NGFR基质细胞在三级淋巴结构中的分布,并发现其与患者无病生存率的相关性 研究可能受限于样本数量或技术分辨率,且空间组织的机制和功能验证需进一步探索 探究结直肠癌中肿瘤相关基质亚型的空间组织及其临床意义 结直肠癌患者及其肿瘤微环境中的肿瘤相关基质细胞 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序, 多路成像 NA 单细胞RNA测序数据, 图像数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
34 2025-12-23
Single cell spatial transcriptomics integration deciphers the morphological heterogeneity of atherosclerotic carotid arteries
2025-Dec-18, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞空间转录组学技术,揭示了人类颈动脉粥样硬化斑块的分子微结构及其形态异质性 结合单细胞RNA测序与单细胞空间转录组学,并优化细胞分割算法,首次系统解析了斑块中不同细胞亚型的位置与邻近关系,特别是炎症平滑肌细胞亚型的识别和巨噬细胞亚态在斑块边界区的转分化过程 研究主要聚焦于人类颈动脉斑块,可能无法完全代表其他动脉部位的粥样硬化病变,且样本量未在摘要中明确说明 旨在阐明动脉粥样硬化斑块的异质性及其不稳定化的分子机制 人类颈动脉粥样硬化斑块 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序, 单细胞空间转录组学 NA 转录组数据, 空间数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
35 2025-12-23
PINK1 dysfunction in hepatocellular carcinoma fosters immune evasion and disease progression by promoting neutrophil infiltration
2025-Dec-18, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究揭示了PINK1在肝细胞癌中通过促进中性粒细胞浸润介导免疫逃逸和疾病进展的机制 首次将PINK1功能失调与肝细胞癌免疫检查点阻断抵抗联系起来,并阐明其通过促进中性粒细胞招募抑制T细胞活性的具体机制 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床验证尚不充分,且未涉及其他潜在免疫细胞亚群的影响 阐明PINK1在肝细胞癌免疫逃逸中的作用机制,并探索克服免疫治疗抵抗的新策略 肝细胞癌患者数据、小鼠肿瘤模型、中性粒细胞和T细胞 肿瘤免疫学 肝细胞癌 单细胞RNA测序、流式细胞术、基因表达数据库分析 NA 基因表达数据、单细胞转录组数据、流式细胞数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
36 2025-12-23
Insights into KIF11 pathogenesis in Microcephaly-Lymphedema-Chorioretinopathy syndrome from a lymphatic perspective
2025-Dec-18, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本文从淋巴系统角度探讨KIF11基因在微头畸形-淋巴水肿-脉络膜视网膜病变综合征中的致病机制 首次揭示了KIF11与淋巴管生成关键驱动因子PROX1和VEGFR3之间的直接联系,为理解MLC综合征的淋巴功能障碍提供了新视角 研究样本量有限,且部分发现仅基于患者来源的细胞系和动物模型,需要进一步临床验证 探究KIF11基因变异如何导致淋巴系统发育异常和功能障碍 患者来源的淋巴母细胞、人类和小鼠发育组织、斑马鱼胚胎、人类淋巴内皮细胞 NA 微头畸形-淋巴水肿-脉络膜视网膜病变综合征 单细胞RNA测序、淋巴闪烁扫描术、免疫染色、基因敲低 NA 基因表达数据、影像数据、细胞功能数据 MLC患者来源的细胞系及个别患者临床数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
37 2025-12-23
GSDME-dependent pyroptosis drives abdominal aortic aneurysm via promoting vascular senescence
2025-Dec-17, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究探讨了GSDME依赖性非经典焦亡在腹主动脉瘤中的作用及其通过促进血管衰老的机制 首次揭示了GSDME依赖性非经典焦亡在腹主动脉瘤中作为'主开关'调控血管衰老的作用 研究主要基于小鼠模型和患者样本,临床转化潜力需进一步验证 确定GSDME依赖性非经典焦亡在腹主动脉瘤病理中的作用 腹主动脉瘤小鼠模型和患者样本 数字病理 心血管疾病 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 多重流式细胞术 NA RNA测序数据, 流式细胞数据 小鼠模型和患者样本 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
38 2025-12-23
Whole-heart 3D reconstruction of mouse CVB3 myocarditis reveals spatial and transcriptomic heterogeneity of immune foci
2025-Dec-16, Cardiovascular research IF:10.2Q1
研究论文 本研究通过新型大组织学重建工作流程CODA,对小鼠CVB3心肌炎进行了全心脏3D重建,揭示了免疫灶的空间和转录组异质性 首次利用CODA工作流程实现小鼠心肌炎全心脏3D重建,结合免疫组化染色和空间RNA测序,实现了形态学、免疫学和转录组的同步3D分析 研究主要基于小鼠模型,虽然部分结果在人类DCM心脏中得到验证,但直接应用于临床仍需进一步研究 探究小鼠CVB3心肌炎中炎症灶的空间、形态、免疫和转录组异质性 小鼠CVB3心肌炎模型 数字病理学 心血管疾病 空间RNA测序, qRT-PCR, 流式细胞术 NA 图像, 转录组数据 未明确说明具体样本数量,但涉及小鼠CVB3心肌炎模型 NA 空间转录组学 NA NA
39 2025-12-23
JOSD2 alleviates hypertensive renal disease through deubiquitinating AKT in renal tubular epithelial cells
2025-Dec-16, Cellular signalling IF:4.4Q2
研究论文 本研究揭示了去泛素化酶JOSD2通过去泛素化AKT并促进其自噬降解,从而减轻高血压肾病中的肾小管上皮细胞损伤和纤维化 首次发现JOSD2在高血压肾病中的保护作用,并阐明其通过去泛素化AKT(特别是K63连接泛素链)并促进p62介导的自噬降解来发挥作用的分子机制 研究主要基于小鼠模型,其在人体中的确切作用和临床转化潜力仍需进一步验证 探究去泛素化酶JOSD2在高血压肾病中的作用及分子机制,寻找潜在治疗靶点 野生型和Josd2敲除小鼠、肾小管上皮细胞 NA 高血压肾病 单细胞RNA测序、质谱分析、免疫共沉淀 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
40 2025-12-23
Implications of Single-Cell RNA Sequencing in Cervical Cancer: Unravelling the Molecular Landscape
2025-Dec-16, ACS omega IF:3.7Q2
综述 本文综述了单细胞RNA测序在宫颈癌研究中的应用,重点关注方法学进展、关键发现及其对诊断、预后和治疗干预的意义 利用单细胞RNA测序技术,在单细胞分辨率下解析宫颈癌肿瘤微环境,识别细胞间通讯网络和基因表达特征,从而发现新的生物标志物和治疗靶点 作为综述文章,未涉及原始实验数据,主要基于现有研究进行总结,可能未涵盖所有最新进展 总结单细胞RNA测序在宫颈癌研究中的应用,以改善诊断、预后和治疗策略 宫颈癌及其肿瘤微环境中的细胞群体 数字病理学 宫颈癌 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
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