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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-01-10 |
Deciphering the Heterogeneity of Pulmonary Macrophages in Response to Fine Particles
2026-Jan-08, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202507293
PMID:41504080
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研究论文 | 本研究开发了一种双标记金纳米颗粒模型,结合流式细胞分选和单细胞RNA测序,揭示了肺部巨噬细胞亚群对吸入细颗粒物的异质性响应 | 开发了新型双标记金纳米颗粒模型来捕获颗粒物响应细胞亚群,首次系统描绘了肺泡巨噬细胞、募集巨噬细胞和间质巨噬细胞中14个功能各异亚群对颗粒物的响应图谱 | 研究主要基于金纳米颗粒模型,可能与真实环境细颗粒物的生物效应存在差异;单细胞测序样本量有限 | 解析肺部巨噬细胞对吸入细颗粒物的异质性响应机制 | 肺部巨噬细胞亚群(肺泡巨噬细胞、募集巨噬细胞、间质巨噬细胞) | 单细胞组学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序,荧光激活细胞分选 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 22 | 2026-01-10 |
CD20+FCRL4+ B Cells Activate CD8+ T Cells via MHC-I Restriction in Nasopharyngeal Carcinoma Anti-Tumor Immunity
2026-Jan-08, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202514982
PMID:41504259
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序等技术,揭示了鼻咽癌中CD20+FCRL4+ B细胞亚群通过MHC-I途径激活CD8+ T细胞的抗肿瘤机制 | 首次在鼻咽癌中鉴定出CD20+FCRL4+ B细胞亚群,并阐明其通过MHC-I限制性方式激活CD8+ T细胞的具体分子机制,特别是IFNγ通过上调WDFY4增强抗原呈递的关键作用 | 研究主要基于体外和动物模型,人体内验证仍需进一步临床研究;B细胞亚群的具体发育来源和调控网络尚未完全阐明 | 探究鼻咽癌免疫微环境中B细胞的功能及其与其他免疫细胞的相互作用,为免疫治疗提供新见解 | 鼻咽癌组织样本、CD20+FCRL4+ B细胞亚群、CD8+ T细胞 | 免疫肿瘤学 | 鼻咽癌 | 单细胞测序、免疫组织化学、流式细胞术、体外共培养系统、体内实验 | NA | 单细胞测序数据、组织图像、流式数据 | 未明确说明具体样本数量,但包括鼻咽癌组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 23 | 2026-01-10 |
Early Radial Extracorporeal Shockwave Stimulation on Proximal Tibial Circular Osteotomy Site Enhanced Heterotopic Skin Wound Healing via Small Extracellular Vesicles
2026-Jan-08, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202517257
PMID:41504389
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研究论文 | 本研究探讨了在胫骨环形截骨部位应用径向体外冲击波疗法如何通过小细胞外囊泡增强大鼠足背伤口愈合 | 首次将径向体外冲击波疗法应用于胫骨截骨部位以促进伤口愈合,并揭示了小细胞外囊泡通过ATP/P2X7R/p38MAPK通路释放及Thbs1蛋白增强的机制 | 研究仅基于大鼠模型,尚未在人类慢性伤口如糖尿病足溃疡中进行验证 | 探索新型伤口愈合治疗方法,特别是针对慢性伤口如糖尿病足溃疡 | 大鼠足背伤口模型 | 再生医学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞测序、蛋白质组学分析 | 动物模型(大鼠) | 测序数据、蛋白质表达数据 | 未明确说明具体样本数量,但涉及大鼠模型 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 24 | 2026-01-10 |
ROS Activated NETosis of Bone Marrow CD55+ Intermediate Mature Neutrophils Through HIF1α-PADI4 Pathway to Initiate Bone Aging
2026-Jan-08, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202500046
PMID:41504495
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研究论文 | 本研究揭示了骨髓中CD55+中间成熟中性粒细胞通过HIF1α-PADI4通路激活NETosis,从而引发骨老化的机制 | 首次发现CD55+中间成熟中性粒细胞亚群在骨老化中的关键作用,并揭示了ROS与HIF1α-PADI4通路协同调控NETosis的新机制 | 研究主要基于小鼠模型(SAMP6),尚未在人类样本中验证 | 探究骨髓中性粒细胞NETosis在骨老化中的调控机制及其与细胞衰老的相互作用 | 3个月大的雄性SAMP6小鼠骨髓样本,包括中性粒细胞亚群和骨髓间充质干细胞(BMSCs) | 单细胞组学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),细胞移植实验 | NA | 单细胞转录组数据 | 3个月大的雄性SAMP6小鼠骨髓样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 25 | 2026-01-10 |
Mass Spectrometry Imaging Combined With Single-Cell Transcriptional Profiling Reveals the Multidimensional Spatial Distributions and Biosynthetic Pathways of Medicinal Components in Andrographis paniculata
2026-Jan-08, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70534
PMID:41504619
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研究论文 | 本研究首次在穿心莲中建立了质谱成像与单细胞RNA测序整合的系统,揭示了药用成分的多维空间分布和生物合成途径 | 首次在穿心莲中整合质谱成像与单细胞转录组技术,揭示了药用成分在细胞类型特异性中的精细分布和光调控的生物合成机制 | 研究主要聚焦于穿心莲的叶片和茎组织,可能未涵盖所有药用成分在其他组织中的分布情况 | 探究药用植物穿心莲中活性成分的精细空间分布和生物合成途径 | 穿心莲(Andrographis paniculata)的叶片和茎组织 | 植物代谢组学 | NA | 质谱成像(MSI)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、LC-QQQ-MS/MS | NA | 质谱成像数据、单细胞转录组数据 | 穿心莲的叶片和茎组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 26 | 2026-01-10 |
Population analysis and immunologic landscape of melanoma in people living with HIV
2026-Jan-08, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-3148
PMID:41504629
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研究论文 | 本研究通过分析HIV感染者与未感染者的黑色素瘤临床数据,并结合空间免疫转录组学和多重免疫荧光技术,揭示了HIV感染者黑色素瘤独特的临床特征和免疫抑制性肿瘤微环境 | 首次在HIV感染者黑色素瘤中系统整合大规模临床队列分析与空间免疫转录组学,揭示了免疫检查点表达增加、抗原呈递减少以及CD8⁺ T细胞耗竭和髓源性抑制细胞扩增的独特免疫景观 | 样本量相对较小(空间转录组学n=11,多重免疫荧光n=29),且为回顾性研究,可能存在选择偏倚 | 剖析HIV感染者黑色素瘤的临床和免疫学特征,以解释其比HIV阴性患者更差的预后 | HIV感染者与未感染者的黑色素瘤患者 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间免疫转录组学,多重免疫荧光 | NA | 电子健康记录,肿瘤组织样本 | 临床队列:1,087名HIV感染者与394,437名未感染者;空间转录组学:11个肿瘤样本;多重免疫荧光:15名HIV感染者与14名未感染者的样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 27 | 2026-01-10 |
Cellular microenvironment of erythropoietin-producing cells in hypoxic and injured mouse kidneys
2026-Jan-08, Experimental physiology
IF:2.6Q2
DOI:10.1113/EP093422
PMID:41504852
|
研究论文 | 本研究结合空间转录组学、mRNA荧光原位杂交和连续免疫荧光技术,揭示了缺氧和损伤小鼠肾脏中促红细胞生成素产生细胞的微环境特征 | 首次利用空间转录组学等技术系统表征了活性REP细胞的直接邻域,揭示了其在缺氧和损伤条件下微环境的动态变化 | 研究仅限于小鼠模型,未在人类样本中验证;技术方法可能受限于空间分辨率 | 探究调控促红细胞生成素产生的机制 | 小鼠肾脏中的Norn细胞和肾促红细胞生成素产生细胞 | 空间转录组学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学, mRNA荧光原位杂交, 连续免疫荧光 | NA | 空间转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 28 | 2026-01-10 |
Cumulative environmental exposures adversely impact social behaviour and are associated with dysregulation of genes and proteins involved in epigenetic, ribosomal, and immune regulation in male mice
2026-Jan-08, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-025-02152-y
PMID:41504877
|
研究论文 | 本研究开发了一种新型“三重打击”小鼠模型,探究累积环境暴露对子代行为和大脑及外周免疫系统炎症相关分子特征的影响 | 开发了结合孕前社会压力、产前高脂饮食和产后免疫挑战的“三重打击”小鼠模型,并首次在雄性后代中观察到神经发育障碍相关行为风险升高及社交缺陷,同时通过单细胞RNA测序和蛋白质组学揭示了大脑与外周免疫细胞共有的炎症和核糖体通路改变 | 研究结果仅为初步假设,其机制意义需要独立验证来确认 | 探究累积环境暴露如何影响子代行为及大脑与外周免疫系统的炎症相关分子特征 | C57Bl/6JAusB小鼠(N=70)及其子代,特别是雄性三重打击子代 | 神经科学,免疫学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序,蛋白质组学 | NA | 基因表达数据,蛋白质丰度数据,行为数据 | 70只C57Bl/6JAusB小鼠 | NA | 单细胞RNA测序,蛋白质组学 | NA | NA |
| 29 | 2026-01-10 |
IL-21 enhances the cytotoxicity of intratumoral CD8+ T cells improving radiation efficacy
2026-Jan-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.190531
PMID:41505202
|
研究论文 | 本研究探讨了白细胞介素-21(IL-21)与放疗联合应用在增强肿瘤微环境中CD8+ T细胞细胞毒性、改善放疗疗效方面的作用 | 首次系统性地揭示了IL-21与放疗之间的协同作用,通过单细胞转录组测序阐明了其增强CD8+ T细胞效应功能和防止耗竭的分子机制,并在人源化小鼠模型和患者样本中进行了验证 | 研究主要基于临床前模型(小鼠模型和人源化小鼠),尚未在大型临床试验中得到验证;食管癌患者样本分析为回顾性,样本量有限 | 探索IL-21作为放疗佐剂,通过调节肿瘤微环境增强抗肿瘤免疫反应,从而提高放疗疗效 | 小鼠肿瘤模型、人源化小鼠模型(A549肿瘤)、食管癌患者术后样本 | 肿瘤免疫学 | 癌症(食管癌、肺癌模型) | 单细胞转录组测序、组织微阵列分析、数据库挖掘 | NA | 转录组数据、组织样本数据、临床数据 | 小鼠模型、人源化小鼠模型及食管癌患者术后样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 30 | 2026-01-10 |
Mapping somatosensory afferent circuitry to bone identifies neurotrophic signals required for fracture healing
2026-Jan-08, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adr9608
PMID:41505527
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学绘制了骨组织的体感传入神经环路,并识别出骨折愈合所需的神经营养信号 | 首次系统性地描绘了骨组织神经支配的神经解剖学环路,并发现FGF9是骨折修复的关键调节因子 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性尚需进一步验证 | 阐明介导骨骼伤害感受和再生的神经解剖学环路,并识别促进骨折愈合的关键神经营养信号 | 小鼠骨组织及其支配的背根神经节神经元 | 单细胞转录组学 | 骨折 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠背根神经节神经元(骨折前后) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 31 | 2026-01-10 |
IDH-mutant gliomas arise from glial progenitor cells harboring the initial driver mutation
2026-Jan-08, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adt0559
PMID:41505555
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研究论文 | 本研究通过深度测序和空间转录组学分析,确定了IDH突变胶质瘤起源于携带初始驱动突变的胶质祖细胞 | 首次结合细胞类型特异性突变分析、克隆进化方向、患者大脑空间转录组学和癌症小鼠模型,明确了IDH突变胶质瘤的起源细胞 | 样本量相对有限(70名患者),且仅针对IDH突变胶质瘤,可能不适用于其他类型脑肿瘤 | 探究IDH突变胶质瘤的起源细胞,以理解肿瘤进化并开发新治疗方法 | IDH突变胶质瘤患者(70名)的肿瘤组织、瘤周皮质、脑室下区和血液样本 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 深度测序, 空间转录组学 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 70名患者的142个组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 32 | 2026-01-10 |
CD73 blockade enhances antitumor efficacy of oHSV in solid tumors by increasing macrophage-mediated antigen presentation
2026-Jan-08, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013640
PMID:41506791
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研究论文 | 本研究探讨了CD73阻断如何通过增强巨噬细胞介导的抗原呈递来提高溶瘤疱疹病毒在实体瘤中的抗肿瘤疗效 | 揭示了免疫抑制性胞外腺苷信号是溶瘤病毒疗法的主要障碍,并证明CD73阻断可防止肿瘤免疫逃逸,支持了溶瘤病毒与CD73阻断联合策略的临床开发 | 研究主要基于小鼠模型和患者样本的转录组分析,尚未在大型临床试验中验证联合疗法的安全性和长期疗效 | 研究免疫抑制性胞外腺苷信号在调节溶瘤疱疹病毒抗肿瘤免疫疗效中的作用 | 实体瘤模型(包括颅内肿瘤模型)、CD73基因敲除小鼠、患者肿瘤样本 | 肿瘤免疫学 | 实体瘤 | 单细胞RNA测序、流式细胞术免疫表型分析、免疫荧光成像、转录组分析 | CD73基因敲除小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据、转录组数据、流式细胞术数据、免疫荧光图像 | 患者肿瘤样本(治疗前与治疗后)、CD73敲除小鼠与野生型小鼠的肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 33 | 2026-01-10 |
Representation learning of single-cell RNA-seq data
2026-Jan-08, RNA (New York, N.Y.)
DOI:10.1261/rna.080889.125
PMID:41506911
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序数据的表示学习方法,包括因子模型、自编码器、对比学习和基于Transformer的基础模型 | 提出了一个连贯的分类法,阐明了这些方法的概念基础、共同假设和关键区别,并讨论了现有基准和未来挑战 | NA | 综述单细胞RNA测序数据的表示学习方法,提供分类框架并讨论未来挑战 | 单细胞RNA测序数据及其表示学习方法 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 因子模型, 自编码器, 对比学习, Transformer | 基因表达数据 | 超过1亿个测序细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 34 | 2026-01-10 |
Disruption of bile acid homeostasis potentiates Paneth cell ablation by activating the intestinal Farnesoid X receptor in necrotizing enterocolitis
2026-Jan-08, NPJ biofilms and microbiomes
IF:7.8Q1
DOI:10.1038/s41522-025-00904-6
PMID:41507219
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研究论文 | 本研究揭示了胆汁酸稳态破坏通过激活肠道法尼醇X受体导致潘氏细胞丢失,从而在坏死性小肠结肠炎发病机制中的作用 | 首次阐明胆汁酸积累通过FXR抑制Wnt/PCP信号通路,调控肠道干细胞向潘氏细胞分化,并发现通过下调FGFR4可改善肠道菌群和丁酸盐浓度,从而恢复潘氏细胞数量 | 研究主要基于动物模型和单细胞测序数据,临床转化和人体验证尚需进一步探索 | 探究胆汁酸稳态在坏死性小肠结肠炎发病机制中的作用 | 坏死性小肠结肠炎中的潘氏细胞、肠道干细胞及胆汁酸代谢通路 | 单细胞组学 | 坏死性小肠结肠炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 35 | 2026-01-10 |
The differentiation and function of heterogeneous thymic dendritic cell subsets require signals provided by distinct thymocyte cell types
2026-Jan-08, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-025-02371-9
PMID:41507389
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和功能实验,鉴定了胸腺中七种常规树突状细胞亚群,并揭示了不同胸腺细胞亚型(CD4SP和CD8SP)在支持这些亚群稳态、激活和功能中的特异性作用 | 首次系统鉴定胸腺中七种cDC亚群,并阐明CD4SP和CD8SP胸腺细胞通过不同信号通路(如CD40信号和干扰素信号)特异性调控cDC1与cDC2/pDC的稳态与激活 | 研究主要基于小鼠模型,人类胸腺DC亚群的功能异质性及调控机制仍需进一步验证 | 探究胸腺树突状细胞亚群的异质性、稳态维持机制及其在中央耐受建立中的功能 | 小鼠胸腺中的常规树突状细胞亚群(cDC1、cDC2、pDC)及不同发育阶段的胸腺细胞(CD4SP、CD8SP) | 免疫学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 36 | 2026-01-10 |
VISTA uncovers missing gene expression and spatial-induced information for spatial transcriptomic data analysis
2026-Jan-08, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09479-6
PMID:41507434
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研究论文 | 本文提出VISTA模型,通过整合scRNA-seq和SST数据,预测空间转录组数据中未测量的基因表达,以增强空间转录组数据的分析能力 | VISTA模型结合变分推断和几何深度学习,并引入不确定性量化,首次实现了在空间转录组数据中准确预测未测量基因表达,支持多种下游分析 | 模型依赖于scRNA-seq和SST数据的整合质量,可能受数据噪声和批次效应影响,且未明确说明在更复杂组织或疾病模型中的泛化能力 | 开发一种模型以弥补空间转录组数据基因覆盖不足的问题,提升空间转录组数据的分子覆盖度和空间分辨率 | 空间转录组数据(SST)和单细胞RNA-seq数据(scRNA-seq) | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq(scRNA-seq),空间转录组学(SST) | 变分推断,几何深度学习 | 基因表达数据,空间数据 | 四个数据集(具体样本数未提供) | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 37 | 2026-01-10 |
scXDR: drug response prediction across single-cell datasets via heterogeneous network transfer learning
2026-Jan-08, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09418-5
PMID:41507436
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研究论文 | 本研究提出了一种名为scXDR的异质网络迁移学习模型,用于跨单细胞数据集的药物反应预测 | 通过异质网络整合药物、基因和细胞的特征与关联,执行消息传递、特征与结构对齐、结构重建和药物-细胞评分预测,避免了传统方法依赖批量RNA测序数据与单细胞数据整合的假设限制 | 未明确说明模型在处理高度异质性或噪声数据时的鲁棒性,以及在实际临床应用中的验证范围 | 提高单细胞水平药物反应预测的准确性,为药物开发和精准治疗提供指导 | 药物、基因、细胞(包括单细胞数据集) | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 异质网络迁移学习模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 38 | 2026-01-10 |
Revealing high-resolution spatial metagenes from spatial transcriptomics
2026-Jan-08, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-025-01848-x
PMID:41507531
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 39 | 2026-01-10 |
A subcellular spatial atlas illuminates the microenvironmental remodeling of perineural invasion in distal cholangiocarcinoma
2026-Jan-08, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-025-01773-4
PMID:41508044
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研究论文 | 本研究利用亚细胞分辨率空间转录组学技术,揭示了远端胆管癌中神经周围侵袭的微环境重塑机制 | 首次在亚细胞分辨率上构建了远端胆管癌神经周围侵袭的空间图谱,揭示了多种细胞类型的协调重塑,并识别了LAMB3-DAG1轴作为癌细胞与雪旺细胞相互作用的潜在介质 | 研究基于手术切除的肿瘤组织样本,样本量可能有限,且为观察性研究,需要进一步的功能验证 | 阐明远端胆管癌中神经周围侵袭的空间结构和分子驱动因素 | 远端胆管癌患者的肿瘤组织,根据病理学神经周围侵袭状态分层 | 空间转录组学 | 胆管癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 来自远端胆管癌患者的切除肿瘤组织样本(具体数量未明确说明) | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | Xenium亚细胞分辨率空间转录组学平台 |
| 40 | 2026-01-10 |
Mapping the secondary response to traumatic brain injury using spatial transcriptomics shows acute 4-aminopyridine treatment mitigates axonal and molecular pathology
2026-Jan-08, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-025-02219-1
PMID:41508250
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术,探究了急性4-氨基吡啶治疗对创伤性脑损伤后轴突和分子病理的影响 | 结合临床导向的神经病理学和全基因组空间转录组学,全面分析创伤性脑损伤的继发性损伤过程,并评估4-氨基吡啶作为急性治疗药物的潜力 | 研究仅在小鼠模型中进行,未涉及人类临床试验,且高剂量4-氨基吡啶可能诱发癫痫行为 | 评估4-氨基吡啶作为急性创伤性脑损伤治疗药物,以减轻轴突损伤和促进活动依赖性修复 | 成年雄性和雌性小鼠的创伤性脑损伤模型,重点关注胼胝体轴突 | 空间转录组学 | 创伤性脑损伤 | 空间转录组学,免疫标记 | NA | 空间转录组数据,免疫标记图像 | 成年雄性和雌性小鼠 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |