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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
21 2026-06-26
PERK Is Dispensable for Smooth Muscle Cell Phenotype Switching in Atherosclerosis
2026-Jul, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 探究PERK蛋白在平滑肌细胞表型转换及动脉粥样硬化中的作用,发现其并非必需 通过基因敲除、单细胞转录组和空间转录组学技术,首次系统证明PERK UPR通路在平滑肌细胞表型转换和动脉粥样硬化斑块稳定性中不具有关键作用 研究主要基于小鼠模型,人类数据为关联性分析而非因果验证,且未评估其他UPR通路分支的可能代偿作用 阐明PERK通路在平滑肌细胞表型转换和动脉粥样硬化斑块稳定性中的功能 平滑肌细胞、动脉粥样硬化斑块 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序、批量RNA测序、Xenium空间转录组学 NA 基因表达数据 小鼠模型(Ldlr-/-成年小鼠)和人类颈动脉斑块样本 10x Genomics 单细胞RNA测序、空间转录组学 10x Chromium、Xenium 10x Chromium单细胞3'试剂盒、Xenium原位空间转录组学
22 2026-06-26
Spatial and Single-Cell Mapping Reveals Valvular Interstitial Cell and Macrophage Sex Differences in Calcific Aortic Valve Disease
2026-Jul, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 通过单细胞和空间转录组学揭示钙化性主动脉瓣疾病中瓣膜间质细胞和巨噬细胞的性别差异 首次利用单细胞和空间转录组学技术系统解析人类主动脉瓣组织中瓣膜间质细胞和巨噬细胞在钙化位点附近的性别依赖性基因表达差异 未明确提及样本量及验证实验的局限性 探究钙化性主动脉瓣疾病中瓣膜组织纤维钙化的性别依赖性细胞机制 人类主动脉瓣组织 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序, 空间转录组学, RNA原位杂交, 组织学分析, 扫描电子显微镜 NA 基因表达数据, 图像 健康者和钙化性主动脉瓣疾病患者的主动脉瓣组织样本 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
23 2026-06-26
Piecing together the alveolar-capillary unit: arterial-venous capillary polarization
2026-Jul-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
综述 综述肺泡-毛细血管单元中动脉-静脉极化的研究进展 强调肺毛细血管内皮细胞中CAP1群体的异质性和修复亚群,揭示动脉-静脉极化及基因表达梯度 未提及具体局限性 总结肺毛细血管内皮细胞异质性,特别是动脉-静脉极化和修复性祖细胞 肺毛细血管内皮细胞 数字病理学 慢性肺病 单细胞转录组学、谱系追踪、表观基因组分析 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
24 2026-06-26
Identification of PSMA4 as a Therapeutic Target for Atherosclerosis: A Comprehensive Multiomics Mendelian Randomization Analysis
2026-Jul, Annals of human genetics IF:1.0Q4
研究论文 通过多组学孟德尔随机化整合分析,识别PSMA4作为动脉粥样硬化的潜在治疗靶点 首次利用多组学孟德尔随机化框架,整合GWAS、eQTL、mQTL和sQTL数据,系统鉴定并验证PSMA4作为动脉粥样硬化的遗传因果治疗靶点,并通过单细胞RNA测序揭示其在斑块免疫细胞中的高表达 研究基于欧洲人群数据,种族多样性有限;MR和共定位分析虽支持因果关系,但无法完全排除残余混杂;药物预测仍需体外和体内实验验证 鉴定新的、受遗传支持的动脉粥样硬化治疗靶点 动脉粥样硬化患者与对照人群的血液、组织样本及动脉粥样硬化斑块 自然语言处理 心血管疾病 GWAS, eQTL, mQTL, sQTL, scRNA-seq NA 基因表达、甲基化、剪接变异、单细胞转录组 三个独立队列的cis-eQTL数据及外部AS数据集,具体样本量未详述 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA NA
25 2026-06-26
Ythdf2 loss in microglia aggravates ischemic retinopathy by increasing microglia activation and microvascular anomalies
2026-Jul, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 揭示小胶质细胞中Ythdf2缺失通过增加小胶质细胞活化和微血管异常加剧缺血性视网膜病变的机制 首次探索m6A阅读蛋白Ythdf2在视网膜小胶质细胞中的作用及其在视网膜血管病变中的调控机制 未明确提及限制性 研究Ythdf2在小胶质细胞中的作用及其在视网膜血管病变中的参与,并揭示其调控机制 小胶质细胞Ythdf2及视网膜微血管 机器学习 缺血性视网膜病变 单细胞RNA测序, RNA测序 NA 基因表达数据 氧诱导视网膜病变(OIR)小鼠模型 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序系统
26 2026-06-26
Mouse, Pig, and Human Atherosclerotic Lesions Have Common and Distinct Mesenchymal Cell Populations
2026-Jul, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 通过单细胞RNA测序整合分析小鼠、猪和人类的动脉粥样硬化病变,发现共有和特有的间充质细胞群体 首次跨物种整合分析小鼠、猪和人类动脉粥样硬化斑块中的间充质细胞异质性,揭示了保守的间充质细胞连续体及多种物种特异性亚群(如DLX5和RERGL标记的平滑肌细胞亚群仅存在于人类颈动脉和冠状动脉斑块) 未明确提及但隐含限制包括:不同物种间细胞状态的功能验证不足;仅分析了特定血管床和病变阶段,可能无法完全覆盖疾病全貌 比较小鼠和猪实验性动脉粥样硬化病变中复杂的间充质细胞群体与人类临床斑块的异同 来自人类颈动脉和冠状动脉、猪主动脉和冠状动脉、以及小鼠头臂动脉的动脉粥样硬化病变样本 数字病理学、单细胞组学 动脉粥样硬化 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 整合了人类、猪和小鼠多个动脉样本的单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
27 2026-06-26
Epigenetic Regulation of the Epstein-Barr Virus Latent-Lytic Switch
2026-Jul, Journal of medical virology IF:6.8Q1
综述 综述爱泼斯坦-巴尔病毒潜伏-裂解转换的表观遗传调控机制 整合全基因组CRISPR筛选、单细胞转录组学和整合多组学分析的最新进展,揭示表观遗传抑制、转录控制、代谢适应和免疫微环境信号如何协同调控潜伏-裂解转换的分子逻辑 未提及具体限制 总结EBV潜伏-裂解转换的表观遗传调控新发现及其对治疗方法的启示 爱泼斯坦-巴尔病毒(EBV)的潜伏-裂解转换过程 机器学习 EBV相关恶性肿瘤 全基因组CRISPR筛选、单细胞转录组学、整合多组学分析 NA 单细胞转录组数据、多组学数据 NA NA 单细胞RNA测序、多组学 NA NA
28 2026-06-26
Epigenetic-Genetic Crosstalk at the Cancer-Diabetes Interface: Convergent Molecular Pathways, Multi-Omics Biomarkers, and Dual Therapeutic Targets
2026-Jun-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
综述 该综述系统探讨了癌症与糖尿病之间的表观遗传-遗传互作,揭示了常见的分子通路、多组学生物标志物及双重治疗靶点 从表观遗传与遗传互作的新视角,整合多组学技术(如单细胞测序和人工智能),深入分析癌症与糖尿病的共同分子机制,并提出双重治疗靶点的概念 未提及具体局限性,但综述性质意味着可能缺乏原始实验数据验证 揭示癌症与糖尿病共有的分子通路和生物标志物,为两者共同治疗策略提供理论基础 癌症与糖尿病的分子通路、表观遗传修饰(DNA甲基化、组蛋白修饰、非编码RNA失调)及相关风险因素(肥胖、慢性炎症、氧化应激) 机器学习, 数字病理学 癌症, 糖尿病 多组学技术, 单细胞测序 na 多组学数据 na na 单细胞RNA测序 na na
29 2026-06-26
Integrating Machine Learning and Single-Cell Analysis to Reveal the Diagnostic and Therapeutic Value of Regulated Cell Death Mechanisms in Hepatocellular Carcinoma
2026-Jun-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 结合机器学习和单细胞分析,揭示调控细胞死亡机制在肝细胞癌中的诊断和治疗价值 构建了一个基于调控细胞死亡相关基因的预后模型RCDI,并通过单细胞RNA测序验证其与肿瘤微环境异质性和免疫检查点分子的关联 NA 开发有效的预后模型,以准确预测肝细胞癌患者预后并指导靶向治疗决策 肝细胞癌患者的多队列转录组数据和单细胞RNA测序数据 机器学习 肝细胞癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序 机器学习算法 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 多队列数据(TCGA, GSE14520, ICGC)和单细胞数据(GSE149614) NA 单细胞RNA-seq NA NA
30 2026-06-26
Spatial transcriptomics uncovers the hybrid molecular identity, ciliated phenotype, and immune signature of adenomyosis lesions
2026-Jun-26, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 通过空间转录组学分析,揭示了腺肌症病变的混合分子身份、纤毛表型和免疫特征 首次利用空间转录组学对全层人子宫壁活检进行腺肌症病变的分子特征分析,发现其转录谱介于子宫内膜和肌层之间,且更接近基底子宫内膜,并鉴定出潜在逆转病变转录谱的药物 样本量较小(n=10),可能限制结果的普适性;研究仅基于转录组数据,缺乏蛋白水平的验证 阐明腺肌症病变的分子特征和发病机制,为开发靶向治疗提供基础 腺肌症患者的全层子宫壁活检组织 数字病理学 妇科疾病 空间转录组学 NA 空间转录组数据 10例腺肌症患者全层子宫壁活检样本 NA 空间转录组学 NA NA
31 2026-06-26
Targeting NOX4 with Quercetagetin-PLGA nanomaterials: a novel therapeutic strategy for Alzheimer's disease
2026-Jun-25, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
研究论文 针对阿尔茨海默病中NOX4驱动的氧化损伤和槲皮万寿菊素生物利用度低的问题,开发了靶向α7烟碱型乙酰胆碱受体的槲皮万寿菊素PLGA纳米载体 首次将槲皮万寿菊素PLGA纳米载体与α7-nAChR靶向结合,用于抑制NOX4并实现神经保护,通过单细胞RNA测序和伪时间分析揭示NOX4在少突胶质细胞和内皮细胞中的表达模式 缺乏体内验证、非靶向对照、药物暴露标准化及关键制剂参数(如包封效率),脑靶向和转化潜力受限于体外发现 开发靶向NOX4的槲皮万寿菊素纳米递送系统,治疗阿尔茨海默病 NOX4基因、槲皮万寿菊素、α7-nAChR受体、PLGA纳米载体 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序、LASSO回归、双乳液法纳米制备、蛋白质印迹、流式细胞术 NA 基因表达数据、图像、流式细胞数据 GSE97760数据集;Aβ诱导的HT-22神经元损伤模型中的体外实验 NA 单细胞RNA测序 NA NA
32 2026-06-26
Macrophage-Mediated Mechanisms of Vascular Remodeling in Arteriovenous Malformations
2026-Jun-25, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
综述 本文综述了巨噬细胞在动静脉畸形中通过介导血管重塑的机制,并探讨了其潜在的研究方向 利用单细胞RNA测序技术揭示了动静脉畸形组织中巨噬细胞的异质性及其对内皮细胞信号通路的直接调控作用,为理解巨噬细胞在动静脉畸形病理生理学中的作用提供了新的视角 目前对巨噬细胞如何具体参与动静脉畸形起始和进展的机制理解仍不充分,现有证据主要基于临床样本和动物模型,尚缺乏完整的机制解析 阐明巨噬细胞在动静脉畸形血管重塑中的介导机制,并指出未来研究方向 动静脉畸形病理组织中的巨噬细胞及其与内皮细胞的相互作用 机器学习 动静脉畸形 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 临床动静脉畸形样本(具体数量未在摘要中提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
33 2026-06-26
A cell atlas of the developing human outflow tract of the heart and its adult aortic valve derivatives
2026-Jun-25, eLife IF:6.4Q1
研究论文 对心脏流出道(OFT)发育过程及其成年主动脉瓣衍生物进行单细胞和空间转录组分析 首次在胚胎和胎儿两个时间点以及成年主动脉瓣中提供OFT的全面转录组数据,并利用空间转录组学确定细胞群分布,发现胚胎特征在成人细胞中持续存在,可用于追溯大时间尺度细胞间的关系 文中未明确提及研究的局限性 定义人类心脏流出道发育及其成年衍生物的细胞和分子特征,以理解先天性心脏缺陷并推动再生医学发展 人类心脏流出道(胚胎期和胎儿期)及其成年主动脉瓣衍生物 数字病理学 先天性心脏缺陷 单细胞RNA测序、空间转录组学 单细胞调控网络推断模型(如SCENIC) 单细胞转录组数据、空间转录组数据 人类胚胎期、胎儿期心脏流出道组织样本及成年主动脉瓣样本,具体数量未提及 10x Genomics 单细胞RNA测序、空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium用于单细胞RNA测序,10x Visium用于空间转录组学分析
34 2026-06-26
SegJointGene: joint cell segmentation and spatial gene prioritization by information entropy guided convolutional neural networks
2026-Jun-25, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 提出了SegJointGene,一种通过信息熵引导卷积神经网络联合进行细胞分割和空间基因优先级排序的深度学习框架 首次将信息熵引导的卷积神经网络与计算信息丢弃评分相结合,实现细胞类型特异性分割的重要基因识别,并迭代优化基因优先级和细胞边界 复杂组织中基于核染色的分割不够准确,基因优先级排序仍面临计算挑战 开发一种能整合分子信息以改善细胞分割和空间基因优先级排序的方法 小鼠海马体、全脑不同区域的空间转录组数据以及人类扁桃体的空间蛋白质组数据 深度学习, 计算机视觉 NA 空间转录组学, 空间蛋白质组学 卷积神经网络 图像, 基因表达数据 包含模拟数据集和多个真实空间数据集,具体样本数量不详 NA 空间转录组学, 空间蛋白质组学 NA NA
35 2026-06-26
Plant Phosphatidylinositol Signalling Network in Cotton Resistance to Verticillium Wilt
2026-Jun-25, Plant, cell & environment
综述 本文综述了磷脂酰肌醇信号网络在棉花抗黄萎病中的作用机制 系统揭示了棉花中保守的磷脂酰肌醇信号通路如何形成调控网络赋予抗病性,并强调了棉花特有的调控节点如GhPIP5K9a和GhPLDδ酶的作用 未提及具体局限性,但可能因主要基于模式植物拟南芥的比较研究,棉花中特定调控节点的功能验证尚不充分 阐明磷脂酰肌醇信号通路在棉花抗黄萎病中的调控网络 棉花以及模式植物拟南芥 机器学习 棉花黄萎病 磷酸化蛋白质组学、单细胞测序 NA NA NA NA NA NA NA
36 2026-06-26
Pan-cancer analysis identifies APOC1 as a TAM-derived modulator of adaptive immune resistance and predictor of therapeutic response
2026-Jun-25, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 通过多组学分析,全面揭示APOC1在33种癌症类型中的表达模式、临床意义及免疫调节作用 首次在泛癌层面将APOC1定义为肿瘤相关巨噬细胞来源的适应性免疫抵抗调节因子,并阐明了其与基因组不稳定性及免疫检查点阻断治疗反应的关联 尚未明确APOC1在适应性免疫抵抗中的具体分子机制,且缺乏功能性实验验证 系统解析APOC1在泛癌中的表达模式、预后价值及免疫调节机制,评估其作为治疗反应预测标志物的潜力 33种癌症类型的肿瘤样本及肿瘤相关巨噬细胞 机器学习 泛癌 多组学分析, 空间转录组学, 单细胞RNA测序 NA 转录组数据, 蛋白质组数据, 基因组数据, 表观基因组数据, 药物基因组数据, 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 包含TCGA、GTEx、CPTAC及多个独立外部队列的多种癌症样本 NA 空间转录组学, 单细胞RNA测序 NA NA
37 2026-06-26
Tumor lymph node metastasis chip reveals that the NECTIN3-TIGIT axis promotes melanoma metastasis by enhancing treg cell function and inducing CD8+ T cell exhaustion
2026-Jun-25, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
研究论文 利用肿瘤淋巴结转移芯片模型揭示NECTIN3-TIGIT轴通过增强Treg细胞功能和诱导CD8+ T细胞耗竭促进黑色素瘤转移 构建了一种整合血管、淋巴管和双肿瘤模块的肿瘤淋巴结转移芯片模型,首次在体外模拟黑色素瘤淋巴结转移微环境,并阐明NECTIN3-TIGIT轴通过SHIP-1/TRAF6和AKT/mTORC1信号通路分别调控CD8+ T细胞耗竭和Treg细胞激活的双重机制 未提及具体的局限性,但可能包括芯片模型的体内验证不足、样本量较小或临床转化潜力需进一步评估 探究NECTIN3-TIGIT轴在黑色素瘤淋巴结转移中的作用及分子机制 人原发性黑色素瘤和淋巴结转移组织、CD8+ T细胞、调节性T细胞 数字病理学 黑色素瘤 单细胞RNA测序 芯片模型(肿瘤淋巴结转移芯片) 单细胞转录组数据 人原发性黑色素瘤和淋巴结转移组织样本,具体数量未提及 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
38 2026-06-26
Integrative single-cell and bulk transcriptomics reveal cuproptosis subtypes, prognostic models, and COL5A1 as a key gene in glioblastoma
2026-Jun-24, Cellular signalling IF:4.4Q2
研究论文 整合单细胞和批量转录组数据揭示胶质母细胞瘤中铜死亡亚型、预后模型及关键基因COL5A1 首次系统整合单细胞和批量转录组分析,构建基于铜死亡相关基因的预后模型,并识别COL5A1作为连接细胞外基质重塑、恶性进展和铜死亡易感性的关键调控因子 主要基于公开数据库和体外实验验证,缺乏体内模型和临床试验数据的进一步验证 系统研究铜死亡相关基因在胶质母细胞瘤中的分子和临床意义,构建预后模型并识别关键基因 胶质母细胞瘤患者样本及肿瘤细胞 机器学习 胶质母细胞瘤 RNA测序,单细胞RNA测序 SuperPC模型 转录组数据 两个独立CGGA队列样本(具体数量未在摘要中明确) NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA NA
39 2026-06-26
Single-cell RNA sequencing: a powerful tool to study heterogeneity in papillary and anaplastic thyroid carcinoma
2026-Jun-24, European thyroid journal IF:3.5Q2
综述 综述单细胞RNA测序技术在研究甲状腺乳头状癌和未分化癌异质性中的应用 阐述了单细胞RNA测序如何深入揭示甲状腺癌肿瘤内和肿瘤间的细胞异质性,包括癌细胞表型异质性及肿瘤微环境中基质和免疫细胞的变化 未明确提及局限性 探讨单细胞RNA测序技术在研究甲状腺癌异质性方面的见解 甲状腺乳头状癌和未分化癌 单细胞转录组学 甲状腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA single-cell RNA-seq NA NA
40 2026-06-26
Exploring mechanisms of scar-free skin wound healing in adult zebrafish in comparison to mouse
2026-Jun-24, PLoS genetics IF:4.0Q1
研究论文 探究成年斑马鱼与小鼠皮肤无瘢痕愈合机制,通过单细胞RNA测序和HCR空间转录组学揭示巨噬细胞和成纤维细胞的动态变化 首次在斑马鱼皮肤伤口愈合中应用HCR空间转录组学,发现斑马鱼成纤维细胞缺乏胶原表达但能表达抗纤维化基因,且plod2基因的过表达或敲除不影响肉芽组织形成和消退 斑马鱼中plod2的转基因过表达和基因敲除未干扰肉芽组织形成和消退,暗示存在额外通路确保暂时性纤维化消退,但具体机制未完全阐明 比较成年斑马鱼与小鼠皮肤伤口愈合的分子机制,探索无瘢痕愈合的关键因素 成年斑马鱼和小鼠的皮肤伤口愈合模型 数字病理学 皮肤纤维化 单细胞RNA测序, HCR空间转录组学 NA 基因表达数据, 图像 斑马鱼和小鼠皮肤伤口样本,具体数量未提及 10x Genomics 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学
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