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当前共找到 45107 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-11-01 |
Identification and functional characterization of ASCC2 as a diagnostic biomarker and immune regulatory hub in Kawasaki disease
2026-Nov, Clinical rheumatology
IF:2.9Q2
DOI:10.1007/s10067-026-08453-9
PMID:42816712
|
研究论文 | 该研究通过批量转录组数据识别川崎病的诊断生物标志物，并用单细胞RNA测序和体外实验对ASCC2进行功能验证 | 识别了由EPB42、RUNDC3A和ASCC2组成的川崎病下调分子特征，并在独立队列中验证；首次结合单细胞分析和计算机扰动分析揭示ASCC2与NK细胞毒性和细胞周期调控的关联 | 该标志物在鉴别川崎病与临床相关发热性感染时仅表现出中等判别能力，更适合作为辅助分子标志物而非独立诊断工具；机制研究仅为初步的体外实验 | 识别川崎病下调的候选诊断生物标志物，并探究优先候选基因ASCC2在川崎病中的潜在功能相关性 | 川崎病患者、健康对照、发热性对照（人腺病毒感染和A组链球菌感染）、TNF-α刺激的人脐静脉内皮细胞（HUVECs） | 机器学习, 数字病理学, 转录组学 | 川崎病, 心血管疾病, 儿童疾病 | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 差异表达分析, WGCNA, 机器学习, CellChat, scTenifold扰动分析, siRNA敲低 | 机器学习算法（三基因诊断模型）, scTenifold | 转录组数据, 单细胞基因表达数据, 图像（CCK-8实验数据） | GSE73461发现队列、GSE68004独立外部验证队列和GSE168732单细胞RNA测序数据集（具体样本数未在摘要中给出） | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 22 | 2026-11-01 |
Endothelial ADRB3 protects the heart from myocardial infarction by suppressing endothelial-to-mesenchymal transition
2026-Oct-31, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvag261
PMID:42963081
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研究论文 | 该文揭示内皮细胞ADRB3通过抑制TGFβR2-SMAD2依赖的内皮间质转化（EndoMT）保护心肌免受缺血性损伤 | 首次阐明内皮细胞ADRB3在心肌梗死后心脏修复中的作用，并鉴定TGFβR2为ADRB3的内源性结合伙伴，揭示ADRB3通过阻断SMAD2募集至TGFβR1从而抑制EndoMT的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚缺乏临床样本验证；ADRB3作为治疗靶点的安全性和有效性仍需进一步研究 | 探究内皮细胞ADRB3在心肌梗死后心脏修复中的作用及其分子机制 | 内皮细胞特异性ADRB3敲除小鼠、AAV9介导内皮ADRB3过表达小鼠及心肌梗死模型 | 心血管生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、邻近连接实验、免疫共沉淀、质谱分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质互作数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 23 | 2026-11-01 |
Divergent T cell programs in plaque rupture and erosion revealed by single-cell multiomics in the OPTICO-ACS study
2026-Oct-31, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvag258
PMID:42963869
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研究论文 | 该研究通过单细胞多组学结合流式细胞术、血浆蛋白质组学和T细胞受体测序，比较了斑块侵蚀与斑块破裂所致急性冠脉综合征患者冠状动脉内及外周血T细胞表型、激活程序和克隆结构 | 首次在OPTICO-ACS研究框架下，结合OCT斑块形态分类、CITE-seq单细胞转录组与表面蛋白联合分析及配对TCR测序，系统揭示斑块侵蚀与破裂具有根本不同的T细胞免疫特征：侵蚀以记忆偏向、克隆扩增的调节性和细胞毒性T细胞亚群为特征，破裂以促炎表型、多样化TCR库和增强的炎症信号为特征 | 侵蚀相关亚组样本量有限；仅对部分患者进行了CITE-seq和TCR测序；研究为观察性设计，免疫治疗策略的临床转化仍需进一步验证 | 表征斑块侵蚀与斑块破裂所致急性冠脉综合征中冠状动脉内及外周T细胞的表型、激活程序和克隆结构差异 | 133例经光学相干断层扫描（OCT）分类为斑块侵蚀或斑块破裂的急性冠脉综合征连续患者 | 单细胞多组学、心血管免疫学 | 心血管疾病、急性冠脉综合征 | 流式细胞术、血浆蛋白质组学、CITE-seq、单细胞转录组测序、T细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据、表面蛋白数据、TCR序列数据、流式细胞术数据、蛋白质组数据 | 133例急性冠脉综合征患者，包括冠状动脉病变近端血液和外周血样本，部分亚组进行CITE-seq和TCR测序 | NA | 单细胞多组学、单细胞RNA-seq、T细胞受体测序 | NA | NA |
| 24 | 2026-11-01 |
Cancer-associated fibroblasts: origins, functional heterogeneity and therapeutic potential
2026-Oct-30, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-026-02743-z
PMID:42957652
|
综述 | 系统阐述癌症相关成纤维细胞（CAF）的起源、功能异质性及治疗潜力 | 强调CAF功能双重性（促瘤与抑瘤），提出从 indiscriminate 清除转向重编程CAF状态的治疗新范式，并整合单细胞与空间转录组学解析CAF异质性 | 未涉及具体实验数据验证，主要基于文献综述；对CAF亚群精确标志物及临床转化挑战讨论有限 | 解析CAF的细胞起源、激活通路、功能异质性及其在肿瘤微环境中的作用，探讨靶向CAF的治疗策略 | 癌症相关成纤维细胞（CAFs）及其亚群（myCAFs、iCAFs等）、肿瘤微环境 | 肿瘤生物学 | 泛癌种 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 25 | 2026-11-01 |
Transcriptional and functional profiling reveals a dynamic continuum of beta-cell activation states
2026-Oct-30, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.118233
PMID:42961903
|
研究论文 | 该研究结合磷酸化S6激活标记与单细胞转录组分析，揭示β细胞对葡萄糖的响应呈动态连续激活状态，并具有空间组织和功能异质性 | 以磷酸化S6为激活标记证明β细胞随葡萄糖浓度升高被顺序招募，并发现招募具有空间组织（高阈值细胞主要位于胰岛核心）；提出低阈值、中间、高阈值三种功能亚群构成连续谱而非离散亚群，且该分工在高脂饮食代谢需求下可重塑 | 摘要未提及具体样本量、测序平台及验证实验细节，功能亚群的分子标志物和调控机制可能仍需进一步验证 | 探究β细胞是否对葡萄糖做出均一响应，并解析其激活状态的功能异质性、空间组织及代谢应激下的可塑性 | 胰岛β细胞（包括不同葡萄糖激活阈值的β细胞亚群） | 单细胞转录组学、糖尿病研究 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序、磷酸化S6免疫标记 | NA | 单细胞转录组数据、图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 26 | 2026-11-01 |
Decoder-FFPE-seq enables sensitive, genome-wide spatial transcriptomics of archival tissues at single-cell resolution
2026-Oct-30, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ady5085
PMID:42962014
|
研究论文 | 本文提出了一种名为Decoder-FFPE-seq的树状DNA坐标条形码设计空间转录组技术，用于对归档FFPE组织进行高灵敏度、全基因组覆盖、单细胞分辨率的空间转录组分析 | 将RNA到DNA探针转换与印迹辅助条形码技术相结合，采用树状DNA坐标条形码设计，相比现有平台灵敏度提高超过2.6倍，并支持扩展探针库以捕获长非编码RNA和病毒RNA | 摘要中未明确提及该研究的局限性 | 解决FFPE组织空间转录组学中高灵敏度、全基因组覆盖、单细胞分辨率和研究者可及性难以兼顾的挑战 | FFPE小鼠脑组织和归档人类样本，包括口腔鳞状细胞癌（OSCC）免疫治疗队列样本 | 空间转录组学 | 口腔鳞状细胞癌 | 空间RNA测序（Decoder-FFPE-seq），RNA-to-DNA探针转换，印迹辅助条形码 | NA | 图像、文本 | NA | NA | 空间转录组学 | Decoder-FFPE-seq | 树状DNA坐标条形码设计结合RNA-to-DNA探针转换与印迹辅助条形码的FFPE组织适配空间RNA测序平台 |
| 27 | 2026-11-01 |
Human hair-bearing skin organoids reveal cell type-specific susceptibility and innate immune responses to herpes simplex virus 1
2026-Oct-30, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aef5563
PMID:42962008
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研究论文 | 该研究利用人类含毛囊皮肤类器官结合单细胞空间转录组学和成像技术，绘制了HSV-1在皮肤结构中的传播图谱和宿主反应 | 首次使用人类含毛囊皮肤类器官结合单细胞空间转录组学技术研究HSV-1感染，揭示了细胞类型特异性的易感性和先天免疫反应的空间组织特征 | 类器官模型可能无法完全模拟体内复杂的免疫细胞相互作用和系统性免疫反应 | 建立生理相关的模型来研究HSV-1在皮肤中的空间传播和宿主-病毒相互作用 | 人类含毛囊皮肤类器官 | 空间转录组学 | HSV-1感染 | 单细胞空间转录组学，成像 | NA | 图像，文本 | NA | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 28 | 2026-11-01 |
WGCNA and single-cell analysis identify FLG, DSG3 and DSG1 as melanoma-associated hub genes and their modulation by Dinaciclib
2026-Oct-30, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2026.112013
PMID:42962559
|
研究论文 | 该研究整合转录组数据，通过WGCNA和单细胞分析鉴定FLG、DSG3和DSG1为黑色素瘤相关枢纽基因，并验证Dinaciclib对其表达的调节作用 | 首次将WGCNA与单细胞RNA测序相结合鉴定黑色素瘤相关的桥粒基因模块，发现FLG、DSG1和DSG3作为枢纽基因，并揭示Dinaciclib可下调这些基因的表达 | 研究主要基于生物信息学分析和体外细胞实验，缺乏体内动物模型验证和临床样本的大规模验证 | 鉴定与黑色素瘤进展相关的分子改变，寻找预后生物标志物和治疗靶点 | 黑色素瘤转录组数据集、TCGA-SKCM队列、A375和SK-MEL-28黑色素瘤细胞系 | 数字病理学、机器学习 | 黑色素瘤 | 转录组测序、单细胞RNA测序、WGCNA、GSEA、LASSO-Cox回归、分子对接 | LASSO-Cox、WGCNA | 基因表达数据、图像（单细胞数据） | NA | NA | bulk RNA-seq、single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 29 | 2026-11-01 |
An interpretable deep learning framework for revealing fine-grained spatial domains
2026-Oct-30, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101646
PMID:42962665
|
研究论文 | 提出RIF，一种稳健且可解释的深度学习框架，用于细粒度空间域识别，并支持空间可变基因检测 | 利用图神经网络结合伪标签半监督学习保持组织结构完整性；引入双预处理集成策略提升模型稳健性和泛化能力；通过网络可解释性实现空间可变基因检测 | 摘要中未明确提及 | 实现准确、细粒度且可解释的空间域划分及空间可变基因检测 | 空间转录组数据，包括小鼠脑组织、乳腺癌及浸润性导管癌数据集 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组测序 | 图神经网络（GNN） | 基因表达数据、空间位置数据 | 侵袭性导管癌数据集包含超过720,000个细胞 | NA | 空间转录组学 | NA | 涉及多个测序平台 |
| 30 | 2026-11-01 |
LILRB3 as an ulcerative colitis-associated molecular biomarker: integrated transcriptomic, single-cell, and experimental validation
2026-Oct-30, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2026.150471
PMID:42962737
|
研究论文 | 该研究整合转录组学、单细胞分析和实验验证，识别溃疡性结肠炎相关分子生物标志物LILRB3并探究其在免疫失调中的作用 | 通过整合127种机器学习算法组合筛选UC生物标志物，结合单细胞RNA测序、细胞通讯分析和scTenifoldKnk虚拟敲除揭示LILRB3在M1巨噬细胞中的促炎作用，并通过体内外实验验证 | LILRB3的具体分子机制仍需进一步研究，研究主要基于生物信息学分析和初步实验验证，缺乏深入的功能机制探索 | 识别溃疡性结肠炎相关分子生物标志物并探索其在免疫失调中的作用 | 溃疡性结肠炎患者结肠组织、DSS诱导结肠炎小鼠模型、THP-1来源巨噬细胞 | 数字病理学、机器学习 | 溃疡性结肠炎 | bulk转录组测序、单细胞RNA测序、RT-qPCR、Western blot、免疫组化、siRNA敲低 | 逻辑回归、WGCNA、多种机器学习算法组合、scTenifoldKnk | 基因表达数据、图像、文本 | 多个公共转录组数据集及独立验证队列、额外结肠组织队列、DSS诱导小鼠模型和临床样本 | NA | bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 31 | 2026-11-01 |
C3a/C3aR1 axis promotes invasion of cutaneous squamous cell carcinoma and is associated with metastasis and poor prognosis
2026-Oct-30, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2026.10.019
PMID:42962879
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研究论文 | 本文研究了补体C3a/C3aR1轴在皮肤鳞状细胞癌侵袭和转移中的作用，并探讨其作为治疗靶点的潜力 | 首次揭示C3a/C3aR1轴在皮肤鳞状细胞癌侵袭和转移中的作用，并发现C3aR1表达与转移风险和不良预后相关 | 未提及 | 探究补体C3a/C3aR1轴在皮肤鳞状细胞癌进展中的作用 | 皮肤鳞状细胞癌细胞、成纤维细胞、巨噬细胞以及正常皮肤、光化性角化病、原位鳞癌、侵袭性鳞癌和转移灶组织 | 肿瘤生物学 | 皮肤鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, RNA测序, 免疫荧光, 免疫组化, 多重免疫荧光, 3D球体共培养 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 32 | 2026-11-01 |
CMTM6 regulates hematopoietic stem cell homeostasis through modulating IFNRs-STAT1-KLF4 signaling axis
2026-Oct-30, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.10.047
PMID:42962913
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研究论文 | 本文研究了CMTM6通过稳定IFN受体并调控IFNR-STAT1-KLF4信号轴来维持造血干细胞稳态的机制 | 首次揭示了CMTM6在正常造血中的生理功能，即通过稳定IFNAR1和IFNGR1蛋白表达，调控IFNR-STAT1-KLF4信号轴维持造血干细胞稳态 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类造血干细胞中验证；CMTM6调控IFN受体稳定性的具体分子机制（如泛素化修饰等）未完全阐明 | 探究CMTM6是否调控造血干细胞维持并阐明其 underlying 分子通路 | 条件性Cmtm6敲除小鼠（Vav-Cre）的骨髓造血干细胞 | 血液学、干细胞生物学、分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序、流式细胞术、竞争性移植、免疫共沉淀、功能实验 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据、流式细胞数据、实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 33 | 2026-11-01 |
Estrogen-driven PDK4-MYH9 phosphorylation promotes mitochondrial fission and osteogenic commitment of mesenchymal stem cells
2026-Oct-30, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.10.051
PMID:42962912
|
研究论文 | 该研究揭示了雌激素通过ERα-PDK4-MYH9信号轴促进线粒体分裂，从而促进间充质干细胞成骨分化，并逆转去卵巢小鼠骨丢失 | 首次发现PDK4是ERα的直接转录靶点，并阐明PDK4催化MYH9丝氨酸1943位点磷酸化，进而促进DRP1招募至线粒体及线粒体分裂的新机制，提出PDK4过表达可在无外源雌激素情况下逆转骨丢失 | 研究主要基于小鼠模型和原代细胞，尚未在人类PMOP患者样本中验证；PDK4作为治疗靶点的安全性和有效性仍需进一步临床前研究 | 阐明雌激素调控间充质干细胞成骨分化的新机制，并识别关键下游分子事件 | 去卵巢小鼠、原代小鼠骨髓来源间充质干细胞、条件性基因敲除小鼠 | 单细胞转录组学、分子生物学、骨代谢 | 绝经后骨质疏松症 | 单细胞RNA测序、CUT&Tag-seq、RNA-seq、CUT&Tag-qPCR、免疫共沉淀、质谱分析、定点突变、线粒体形态学分析、体外成骨分化实验 | NA | 单细胞转录组数据、转录组数据、表观遗传数据、图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq、CUT&Tag-seq | NA | NA |
| 34 | 2026-11-01 |
YAP/AP-1 Activation in Sebocytes Promotes CCL5-Dependent Perifollicular Macrophage Recruitment in Rosacea
2026-Oct-30, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2026.109721
PMID:42963011
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研究论文 | 该研究揭示玫瑰痤疮中皮脂细胞通过脂质代谢重编程驱动YAP/AP-1激活，上调CCL5，从而招募毛囊周围巨噬细胞，形成以毛囊皮脂腺单位为中心的炎症微环境 | 首次提出以毛囊皮脂腺单位为中心的炎症微环境概念，揭示皮脂细胞中脂质驱动的YAP/AP-1信号激活上调CCL5，进而通过CCL5-CCR5轴招募毛囊周围巨噬细胞的新机制，并证实脂质代谢重编程（胆固醇酯积累）是YAP核转位上游驱动因素 | 摘要未明确说明研究局限性 | 探究玫瑰痤疮中皮脂细胞是否参与巨噬细胞招募及其空间基础和局部信号机制 | 人玫瑰痤疮皮损组织、皮脂细胞、巨噬细胞、毛囊皮脂腺单位 | 数字病理, 空间转录组学, 单细胞转录组学 | 玫瑰痤疮 | 多重免疫荧光, 单细胞RNA测序, 空间转录组分析, 转录组分析, 非靶向脂质组学, siRNA沉默, 免疫中和 | NA | 图像, 文本（测序数据）, 脂质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 35 | 2026-11-01 |
Repurposing the orphan drug nitisinone synergizes with sorafenib to sensitize immunotherapy-refractory MSS-CRC via metabolic stress-driven STING activation
2026-Oct-30, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2026.109724
PMID:42963013
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研究论文 | 研究发现HPD是MSS-CRC中索拉非尼敏感性的调节因子，FDA批准的孤儿药尼替西农抑制HPD并与索拉非尼协同，通过代谢应激驱动STING激活，使免疫治疗难治的MSS-CRC增敏 | 首次将孤儿药尼替西农老药新用，与索拉非尼联合通过双重代谢阻断制造合成致死陷阱，引发线粒体崩溃和mtDNA释放，激活cGAS-STING通路，将免疫'冷'肿瘤转化为免疫'热'肿瘤，并与抗PD-1三联疗法展现优越疗效 | 研究主要基于体外类器官、共培养和动物模型，尚缺乏临床试验数据验证；TCGA队列分析为回顾性关联研究，代谢标志物的前瞻性验证仍需开展 | 探索使MSS-CRC对免疫检查点阻断增敏的代谢策略，阐明HPD抑制与索拉非尼协同的机制及转化潜力 | 微卫星稳定结直肠癌（MSS-CRC）患者来源类器官、人PBMC-肿瘤共培养、免疫健全原位小鼠模型、TCGA MSS-CRC队列及单细胞RNA-seq数据 | 肿瘤免疫学、代谢组学、精准医学 | 结直肠癌 | 患者来源类器官培养、PBMC-肿瘤共培养、原位小鼠模型、单细胞RNA-seq、TCGA队列分析、代谢组学分析 | NA | 类器官实验数据、动物模型数据、单细胞转录组数据、临床队列数据 | TCGA MSS-CRC队列（具体数量未在摘要中说明）、患者来源类器官、人PBMC-肿瘤共培养及免疫健全原位模型（具体数量未说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 36 | 2026-11-01 |
Oral nicotine pouch extracts disrupt osteogenic differentiation in human embryonic stem cells
2026-Oct-30, Toxicology and applied pharmacology
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.taap.2026.118096
PMID:42963005
|
研究论文 | 该研究评估了口含尼古丁袋（ONP）提取物对人胚胎干细胞成骨分化的发育毒性 | 首次使用人胚胎干细胞模型评估多种ZYN口味和尼古丁浓度的口含尼古丁袋提取物对早期成骨分化的影响，并结合单细胞RNA测序、拟时序轨迹分析和转录组学起点（tPOD）分析揭示机制 | 体外细胞模型无法完全反映体内复杂生理环境，未评估长期暴露效应和不同细胞类型的敏感性差异 | 探究口含尼古丁袋提取物对人胚胎干细胞成骨分化的潜在发育毒性及其机制 | H9人胚胎干细胞（hESCs）及其成骨分化模型 | 毒理学，发育生物学，干细胞生物学 | NA | RT-qPCR，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 37 | 2026-11-01 |
Spatial transcriptomics in immune-mediated necrotising myopathy uncovers a specific necrotic signature related to immune-driven fibrosis
2026-Oct-30, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2026.08.018
PMID:42963274
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研究论文 | 该研究利用空间转录组学结合单核转录组数据，揭示免疫介导坏死性肌病中与免疫驱动纤维化相关的特异性坏死特征 | 首次在免疫介导坏死性肌病中应用空间转录组学，发现了富集于坏死区域的SFRP4+免疫驱动成纤维细胞亚型，其携带补体相关“类肿瘤”炎症成纤维细胞特征及以金属硫蛋白表达为特征的特定干扰素反应 | 摘要中未明确说明样本量有限及空间转录组分辨率等技术限制 | 探究免疫介导坏死性肌病的发病机制 | 肌炎患者的肌肉活检组织 | 空间转录组学 | 免疫介导坏死性肌病 | 空间转录组学，单核RNA测序 | NA | 空间转录组数据，单核转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学，单核RNA-seq | NA | NA |
| 38 | 2026-11-01 |
Single-Cell Omics Profiling Reveals Enhanced Heterogeneity of Cord Blood Basophils at Birth
2026-Oct-30, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.70551
PMID:42963344
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研究论文 | 该研究通过单细胞转录组测序结合流式细胞术，对配对母血和脐带血中的嗜碱性粒细胞进行综合谱分析，揭示其转录和功能异质性差异 | 首次对配对母血与脐带血嗜碱性粒细胞进行单细胞组学比较分析，发现脐带血嗜碱性粒细胞异质性更高、具有更早的拟时序状态和更naïve的状态，并利用单卵双胎样本验证了转录组差异的生物学意义 | 样本量较小（仅4对母胎样本，包括1对单卵双胎），缺乏蛋白质水平上更广泛的验证，且未深入探究异质性产生的具体调控机制 | 利用单细胞组学方法全面分析母血和脐带血嗜碱性粒细胞的转录特征和异质性，探究围产期环境中嗜碱性粒细胞的组成和功能差异 | 母血和脐带血中的嗜碱性粒细胞（来自4对配对母胎样本，包括1对单卵双胎） | 单细胞组学 | 过敏性疾病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞术数据 | 4对母胎配对样本（共8份血液样本，含1对单卵双胎） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 39 | 2026-11-01 |
Spatial single-cell mapping of transcriptional differences across genetic backgrounds in mouse brains
2026-Oct-30, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-026-03289-2
PMID:42963409
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研究论文 | 该论文介绍了一种名为ATLAS的可扩展组织映射方法，通过从scRNA-seq数据学习转录特征，用寡核苷酸探针原位编码并解码，以推断细胞类型和转录组，并应用于比较不同遗传背景的小鼠大脑。 | 开发了ATLAS方法，能够实现图谱规模的空间单细胞转录组定位，使用数万条寡核苷酸探针进行原位编码和解码，可同时推断细胞类型和插补转录组，并进行了多技术定量比较和大规模小鼠大脑比较分析。 | 摘要中未明确提及研究局限性。 | 开发一种可扩展的空间单细胞转录组映射方法，用于比较不同遗传背景（包括性别和自闭症模型）下小鼠大脑的细胞类型分布和区域组成差异。 | 小鼠大脑冠状切片，包括五种雄性C57BL/6J小鼠、五种雌性C57BL/6J小鼠和五种雄性BTBR Ttf/J小鼠（特发性自闭症模型）。 | 空间转录组学 | 自闭症 | 单细胞RNA测序，空间转录组学，MERFISH | NA | 图像，文本 | 超过400个冠状切片，共计4000万个细胞 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 40 | 2026-11-01 |
SCGB3A2 marks a low-angiogenesis tumor cell state associated with extracellular PGK2 and angiostatin in lung adenocarcinoma
2026-Oct-30, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-026-00844-7
PMID:42963551
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA-seq和空间转录组学，揭示了SCGB3A2标记的肺腺癌低血管生成肿瘤细胞状态，并发现其与细胞外PGK2和血管抑制素相关 | 首次将SCGB3A2定义为肺腺癌中低血管生成肿瘤细胞状态的标志物，并发现其与细胞外PGK2/血管抑制素信号相关 | 未明确提及研究局限性 | 探究肺腺癌中肿瘤细胞内在的抑制血管生成机制 | 肺腺癌肿瘤细胞及公共单细胞RNA-seq队列、批量队列和细胞系 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | 图像，文本 | 两个公共肺腺癌单细胞RNA-seq队列，独立批量队列（TCGA-LUAD，GSE72094），以及A549和NCI-H1975细胞系 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | 10x Chromium，10x Visium | NA |