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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-03-20 |
Single-cell RNA sequencing: a tool for precision dermatology
2026-Mar-19, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljag013
PMID:41518002
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 22 | 2026-03-21 |
What is spatial transcriptomics?
2026-Mar-19, Archives of disease in childhood. Education and practice edition
DOI:10.1136/archdischild-2025-328924
PMID:40866122
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 23 | 2026-03-21 |
Single-Cell CRISPR: An Efficient Strategy for Decoding Plant Cis-Regulatory Complexity
2026-Mar-19, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70647
PMID:41854240
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综述 | 本文综述了单细胞CRISPR(scCRISPR)系统在植物顺式调控元件功能分析中的最新进展,强调其在单细胞遗传筛选中的革命性潜力 | 整合单细胞技术与全基因组遗传筛选,特别是scCRISPR系统,为解码植物顺式调控复杂性提供了高效策略,能识别关键调控元件并揭示基因表达控制机制 | 在植物研究中应用这些方法仍面临挑战,如技术优化和数据分析复杂性 | 解码植物顺式调控元件的复杂性,以理解复杂调控通路并改进宏观表型修饰能力 | 植物中的转录顺式调控元件(CREs) | 自然语言处理 | NA | 单细胞转录组学,全基因组遗传筛选,scCRISPR系统 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 24 | 2026-03-21 |
RARRES1 marks an immune-cold, chemoresistance-associated malignant epithelial subpopulation enriched in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Mar-19, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-026-04361-8
PMID:41854891
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,识别了胰腺导管腺癌中一个与化疗耐药和免疫抑制相关的恶性上皮亚群,并鉴定RARRES1作为其核心上调基因及新的泛癌预后生物标志物 | 首次在PDAC中鉴定出一个富集于进展期疾病和肝转移的恶性上皮亚群,该亚群具有免疫冷表型,并发现RARRES1作为其核心调控基因,可作为新的泛癌预后生物标志物 | 研究样本量相对较小(27个样本),且功能验证主要基于吉西他滨耐药细胞,需进一步在更大队列和体内模型中验证 | 探究胰腺导管腺癌化疗耐药和免疫逃逸的细胞机制,识别关键恶性上皮亚群及其分子驱动因素 | 胰腺导管腺癌患者样本,包括初治和化疗暴露的原发肿瘤及肝转移样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,CNV推断,基因集富集分析,细胞间通讯分析,NMF分析,药物敏感性预测 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 27个样本(包括初治和化疗暴露的原发肿瘤及肝转移) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 25 | 2026-03-21 |
Hypoxia-related and immune phenotype-related fusion model for non-invasive prognostication of hepatocellular carcinoma treated by TACE: a multicentre study
2026-Mar-19, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-337938
PMID:41856522
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研究论文 | 本研究开发并验证了一个多模态预后模型,用于非侵入性预测接受TACE治疗的肝细胞癌患者的生存结果 | 结合了深度学习、传统影像组学、临床变量以及多组学分析(包括单细胞RNA测序和TCGA数据),构建了一个具有生物学可解释性的融合模型,能够实现更精细的风险分层 | 研究为回顾性多中心设计,可能存在选择偏倚;模型的外部验证和临床应用仍需进一步前瞻性研究确认 | 开发并验证一个用于精确评估接受TACE治疗的肝细胞癌患者生存结果的多模态预后模型 | 肝细胞癌患者 | 计算机视觉 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,对比增强CT成像,深度学习,影像组学 | 早期融合模型,晚期融合模型,临床-影像学模型 | 图像,临床数据,转录组数据 | 共1448名患者,包括TACE队列(1349名)、随机试验生物标志物子集(41名)、单细胞RNA测序队列和TCGA肝细胞癌队列(50名) | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 26 | 2026-03-21 |
Fel d 1-Expressing Plant-Derived Bioparticle: A Novel Treatment for Cat Allergy
2026-Mar-19, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.70280
PMID:41856757
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研究论文 | 本文研究了一种表达猫过敏原Fel d 1的植物源性生物颗粒(Fel d 1 eBP)作为猫过敏新型疗法的过敏性和免疫原性特征 | 开发了基于植物源性生物颗粒的Fel d 1过敏原表达系统,相比传统过敏原免疫疗法具有低过敏性和免疫调节特性 | 研究样本量较小(12名猫过敏患者和12名非过敏对照),且为开放标签的0期研究,需要更大规模的临床试验验证 | 评估Fel d 1 eBP作为猫过敏新型治疗候选物的过敏性和免疫原性 | 猫过敏患者和非过敏对照个体的T细胞、B细胞、嗜碱性粒细胞及皮肤反应 | 免疫学 | 过敏性疾病 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、嗜碱性粒细胞激活试验、皮肤点刺试验 | NA | 单细胞RNA测序数据、流式细胞术数据、临床观察数据 | 12名猫过敏患者和12名非过敏对照用于体外实验,20名猫过敏个体用于体内皮肤点刺试验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 27 | 2026-03-21 |
Seamless vessel-microenvironment bioprinting reveals contact-dependent vascular communications
2026-Mar-19, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2026.02.003
PMID:41856805
|
研究论文 | 本研究开发了一种无缝血管-微环境生物打印系统,用于模拟无界面干扰的血管-基质相互作用 | 采用纳米级PEG化多面体低聚倍半硅氧烷修饰的胶原蛋白构建了同质生物墨水-支撑浴系统,实现了无材料边界的血管-微环境建模 | 未明确说明系统的长期稳定性或体内验证情况 | 研究血管-微环境相互作用在组织发育和疾病中的作用机制 | 血管、基质细胞、肿瘤细胞和癌症相关成纤维细胞 | 组织工程与生物打印 | 肿瘤血管生成 | 单细胞RNA测序、细胞-细胞通讯分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 28 | 2026-03-21 |
Histone lactylation-driven feedback loop modulates pyrimidine metabolism to promote oral carcinogenesis
2026-Mar-19, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08580-w
PMID:41857010
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研究论文 | 本研究揭示了组蛋白乳酸化,特别是H3K18la,在口腔鳞状细胞癌(OSCC)发生中的关键作用,并阐明了一个由糖酵解/H3K18la/TK1/β-catenin组成的正反馈环路 | 首次揭示了组蛋白乳酸化(特别是H3K18la)通过激活TK1转录和嘧啶代谢,驱动口腔癌发生的分子机制,并发现了一个新的正反馈环路 | 研究主要基于体外和动物模型,临床转化潜力需进一步验证;对H3K18la在其他癌症类型中的普适性未探讨 | 探究组蛋白乳酸化在口腔癌发生中的作用及其分子机制 | 口腔白斑(OLK)和口腔鳞状细胞癌(OSCC)组织及细胞 | 表观遗传学 | 口腔鳞状细胞癌 | 免疫组化、CUT&Tag、scRNA-seq、ChIP-qPCR | NA | 组织样本、细胞系、测序数据 | 未明确指定具体样本数量,但涉及OLK和OSCC组织、细胞系及动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 29 | 2026-03-21 |
Integrated machine learning and multi-omics analysis identifies ALOX5 as a potential therapeutic target for tubulointerstitial inflammation in diabetic kidney disease
2026-Mar-19, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-44445-0
PMID:41857149
|
研究论文 | 本研究通过整合机器学习与多组学分析,识别出ALOX5作为糖尿病肾病肾小管间质炎症的潜在治疗靶点 | 首次结合多数据集、WGCNA、机器学习及单细胞测序伪时序分析,系统鉴定ALOX5在DKD免疫微环境中的关键作用,并筛选出天然小分子抑制剂和厚朴酚 | 研究主要基于生物信息学分析和体外验证,缺乏体内实验验证和临床前模型的数据支持 | 识别糖尿病肾病肾小管组织中的关键炎症生物标志物并阐明其免疫调节机制 | 糖尿病肾病患者的肾小管组织及其中表达的基因与免疫细胞 | 机器学习 | 糖尿病肾病 | 转录组测序, 单细胞测序, 多重免疫组化 | LASSO, Random Forest | 基因表达数据, 单细胞数据, 图像数据 | 多个GEO转录组数据集中的样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 30 | 2026-03-21 |
Bulliform cells: anatomical, physiological, genetic, and computational perspectives on plants' drought adaptation
2026-Mar-19, Planta
IF:3.6Q1
DOI:10.1007/s00425-026-04984-2
PMID:41857245
|
综述 | 本文综述了泡状细胞在植物干旱适应中的关键作用,整合了其解剖学、生理学、遗传学和计算生物学视角 | 提出了一个整合多组学、系统生物学和AI驱动建模的新框架,以预测泡状细胞行为并优化作物抗逆性 | 对泡状细胞如何响应复合非生物胁迫以及水分保存与叶片温度调节之间的生理权衡仍存在显著知识空白 | 阐明泡状细胞在植物干旱适应中的作用,并探索其作为开发抗逆作物靶点的潜力 | 禾本科植物叶片中的泡状细胞 | 植物生物学 | NA | 高分辨率成像、单细胞转录组学、机器学习、全基因组关联研究、数量性状位点作图 | AI驱动建模 | 图像、转录组数据、遗传数据 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 31 | 2026-03-21 |
scZiva: imputation method for single-cell RNA-seq data with zero-inflated variational autoencoder
2026-Mar-19, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-026-06422-2
PMID:41857511
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 32 | 2026-03-21 |
Unraveling the mechanism of tripterygium glycosides tablets-induced liver injury and the protective role of total glucosides of peony from immune-metabolic dysregulation to multi-cellular cascade
2026-Mar-19, Chinese medicine
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s13020-026-01373-5
PMID:41857612
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和病理验证,揭示了雷公藤多苷片诱导肝损伤的免疫代谢失调机制及白芍总苷的保护作用 | 首次阐明雷公藤多苷片肝毒性的铁-脂质轴驱动多细胞级联机制,并发现白芍总苷通过逆转库普弗细胞极化等多靶点作用发挥解毒效果 | 研究基于小鼠模型,临床转化需进一步验证;机制细节如特定信号通路需深入探索 | 探究雷公藤多苷片肝损伤机制及白芍总苷的保护作用 | 小鼠肝脏组织中的库普弗细胞、中性粒细胞、内皮细胞、肝细胞和脂肪细胞 | 单细胞组学 | 药物性肝损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 对照小鼠模型(TGT vs. Con 和 TGT + TGP vs. TGT) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 33 | 2026-03-21 |
Single-cell analysis of a salmonid immune system (river brown trout Salmo trutta fario) reveals evolutionary divergence and hatchery-induced transcriptional reprogramming
2026-Mar-18, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-026-02554-2
PMID:41845393
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析,研究了河鳟(Salmo trutta fario)免疫系统的进化差异和养殖环境诱导的转录重编程 | 首次生成了河鳟免疫细胞的单细胞转录组图谱,揭示了全基因组复制衍生的同源基因对的转录分化,并发现了养殖环境对免疫细胞转录身份的塑造作用 | 研究主要基于肾脏来源的免疫细胞,可能未涵盖所有免疫组织;样本来源和数量有限,可能影响结果的普适性 | 探究脊椎动物免疫系统的进化多样性,特别是鲑鱼科物种的免疫细胞转录特征,以及养殖环境对免疫适应性的影响 | 河鳟(Salmo trutta fario)的肾脏免疫细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过83,000个肾脏来源的免疫细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 34 | 2026-03-21 |
Elucidating the mechanism of plasticizers associated with atherosclerosis through network toxicology, bulk RNA sequencing, and single-cell RNA sequencing analysis
2026-Mar-18, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2026.120024
PMID:41855688
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研究论文 | 本研究通过整合网络毒理学、bulk RNA测序和单细胞RNA测序分析,筛选并鉴定了与常见塑化剂暴露相关的动脉粥样硬化生物标志物 | 首次结合网络毒理学、机器学习、分子对接、分子动力学模拟及单细胞RNA测序,系统探究塑化剂暴露与动脉粥样硬化之间的分子机制,并识别出AR和CCR2作为关键生物标志物 | 研究主要基于公共数据库数据,缺乏实验验证;样本来源和数量可能受限;塑化剂暴露的体内效应需进一步证实 | 筛选和鉴定与常见塑化剂暴露相关的动脉粥样硬化生物标志物,为靶向治疗策略提供基础 | 动脉粥样硬化相关基因、塑化剂相关基因、免疫细胞、血管平滑肌细胞、T淋巴细胞 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 网络毒理学, bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 分子对接, 分子动力学模拟 | 机器学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 35 | 2026-03-21 |
Spatial remodeling of the tumor immune microenvironment in hepatocellular carcinoma with cirrhosis driven by Treg-CD8⁺T cell crosstalk via the SPP1-ITGA4 axis
2026-Mar-18, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102734
PMID:41855857
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研究论文 | 本研究通过空间分析比较了伴有和不伴有肝硬化的肝细胞癌的肿瘤免疫微环境,揭示了肝硬化背景下Treg细胞与CD8⁺ T细胞通过SPP1-ITGA4轴相互作用形成的免疫抑制空间生态位 | 首次系统性地比较了肝硬化与非肝硬化肝细胞癌肿瘤微环境的细胞组成、空间组织和免疫调控互作的差异,并识别出由Treg-CD8⁺T细胞通过SPP1-ITGA4信号轴介导的免疫抑制空间生态位 | 研究主要基于HBV阳性病例,结果可能不适用于其他病因的肝细胞癌;空间分析与单细胞RNA-seq数据的整合依赖于公共数据库,可能存在批次效应 | 系统表征和比较非肝硬化与肝硬化肝细胞癌肿瘤微环境的细胞组成、空间结构及免疫调控相互作用 | 肝细胞癌(HCC)肿瘤微环境,特别是伴有肝硬化(CirrHCC)与不伴有肝硬化(Non-cirrHCC)的病例 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 空间分析,单细胞RNA-seq | NA | 空间转录组数据,单细胞RNA-seq数据 | 278例HBV阳性病例,共映射了2,837,999个细胞,涵盖11种主要细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 36 | 2026-03-21 |
CAV1-DOT1L axis in TAM-derived EVs orchestrates VM and sensitises PDAC to combined VM and VEGF targeting
2026-Mar-18, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-337293
PMID:41856521
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研究论文 | 本研究揭示了肿瘤相关巨噬细胞(TAM)通过细胞外囊泡(EV)中的CAV1-DOT1L-ATG5轴调控胰腺导管腺癌(PDAC)中的血管生成拟态(VM),并发现联合靶向VM和VEGFR可有效抑制肿瘤进展 | 首次发现TAM来源的EV通过CAV1-DOT1L轴驱动VM,并揭示了VM与内皮血管生成之间的补偿性关联,提出了联合靶向VM和VEGFR的新治疗策略 | 研究主要基于临床样本和动物模型,尚未在人体临床试验中验证联合治疗策略的安全性和有效性 | 阐明VM在PDAC中的调控机制,并探索针对VM和血管生成的治疗策略 | 胰腺导管腺癌(PDAC)组织、肿瘤相关巨噬细胞(TAM)、细胞外囊泡(EV) | 数字病理学 | 胰腺癌 | 组织病理学、三维组织透明化、空间转录组学、单细胞RNA测序、EV蛋白质组学 | NA | 图像、转录组数据、蛋白质组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 37 | 2026-03-21 |
Corrigendum to "scDCL: A multi-view single-cell RNA sequencing clustering method based on dual contrastive learning" [Comput. Biol. Chem. 123 (2026), 108998]
2026-Mar-18, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 38 | 2026-03-21 |
Generation of tetraploid organs in mice
2026-Mar-18, Zoological research
IF:4.0Q1
|
研究论文 | 本研究结合CRISPR/Cas9、Cre-LoxP系统和囊胚互补技术,在小鼠体内成功生成了四倍体的肝脏、心脏和胰腺组织 | 首次通过四倍体胚胎干细胞(4-ESCs)囊胚互补技术,在小鼠模型中稳健地生成了完全由供体细胞重构的四倍体器官,并系统评估了其发育特征和细胞贡献 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在大型哺乳动物或人体中验证;四倍体个体表现出显著的体重和器官质量减少,其长期功能和生理影响尚不明确 | 探索利用四倍体胚胎干细胞通过囊胚互补技术生成功能性器官的可行性,以解决临床器官短缺问题 | 小鼠四倍体胚胎干细胞(tdTomato标记)及由其生成的肝脏、心脏和胰腺组织 | 发育生物学与再生医学 | 器官衰竭/器官短缺 | CRISPR/Cas9基因编辑、Cre-LoxP系统、囊胚互补技术、流式细胞分选、单细胞转录组测序 | 小鼠模型 | 基因型数据、流式细胞数据、单细胞转录组数据 | 未明确具体样本数量,但涉及四倍体与二倍体对照小鼠的多个器官(肝、心、胰)在E18.5阶段的比较分析 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | NA |
| 39 | 2026-03-21 |
Single-cell atlas of Exopalaemon carinicauda gills provides insights into pillar cell-mediated responses to low-salinity stress in crustaceans
2026-Mar-18, Zoological research
IF:4.0Q1
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研究论文 | 本研究通过整合超微结构表征和单细胞RNA测序,揭示了凡纳滨对虾鳃在低盐胁迫下的细胞响应机制,特别是柱状细胞在离子稳态调节中的关键作用 | 首次结合超微结构分析和单细胞转录组学,系统解析了甲壳动物鳃在低盐胁迫下的细胞异质性,并明确了柱状细胞通过分化轨迹和酸-碱调节基因上调介导适应性响应的新机制 | 研究仅聚焦于单一物种(凡纳滨对虾)的鳃组织,未涉及其他器官或物种的比较,且功能验证实验相对有限 | 探究甲壳动物鳃在低盐胁迫下的细胞适应性机制,特别是柱状细胞介导的离子调节过程 | 凡纳滨对虾(Exopalaemon carinicauda)的鳃组织细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、超微结构表征、加权基因共表达网络分析(WGCNA)、伪时间轨迹重建 | NA | 单细胞转录组数据、形态学图像数据 | 未明确指定样本数量,但基于单细胞测序分析涉及11个转录 distinct 细胞群体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 40 | 2026-03-21 |
Relevance of Clonal Hematopoiesis in Immune Cells for Degenerative Aortic Valve Stenosis
2026-Mar-17, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.125.044406
PMID:41294132
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综述 | 本文综述了克隆性造血在免疫细胞中对退行性主动脉瓣狭窄的临床相关性及其潜在机制 | 系统总结了CHIP与AVS的关联,包括其驱动突变在患者中的高频率、对死亡率的负面影响,以及通过FACS和sc-RNA-seq等实验方法揭示的炎症通路机制 | 未来研究需评估主动脉瓣狭窄较轻阶段的发病率和进展,并评估与不同类型获得性突变的潜在相互作用 | 探讨克隆性造血在退行性主动脉瓣狭窄中的临床意义及潜在治疗策略 | 退行性主动脉瓣狭窄患者,特别是接受经导管主动脉瓣置换术的严重患者,以及相关小鼠模型 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 荧光激活细胞分选(FACS),单细胞RNA测序(sc-RNA-seq) | NA | 临床数据,实验数据,测序数据 | 多数研究中约三分之一的严重AVS患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |