本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-08-26 |
Interleukin-1β Drives Disease Progression in Arrhythmogenic Cardiomyopathy
2024-Dec-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.11.628020
PMID:39763850
|
研究论文 | 本研究通过单核RNA测序和空间转录组学分析致心律失常性心肌病(ACM)患者心肌样本,发现了由纤维化和炎症细胞及衰竭心肌细胞构成的特征性空间微环境,并证实IL-1β在疾病进展中起关键驱动作用,使用抗IL-1β中和抗体治疗可减轻疾病表现 | 首次在ACM中应用单核RNA测序和空间转录组学整合分析,鉴定出炎症-纤维化空间微环境及其细胞组成,并揭示IL-1β作为潜在治疗靶点 | 未提及明显局限性 | 阐明ACM中疾病进展的分子机制,并评估IL-1β靶向治疗的潜在益处 | ACM患者心肌组织样本及携带纯合桥粒芯蛋白-2突变的小鼠心脏组织 | 数字病理学 | 致心律失常性心肌病 | 单核RNA测序、空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、空间转录数据 | 患者样本数未明确,小鼠模型为纯合桥粒芯蛋白-2突变小鼠 | NA | 单核RNA测序、空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 22 | 2026-08-26 |
Regulation of disease-associated microglia in the optic nerve by lipoxin B4 and ocular hypertension
2024-11-20, Molecular neurodegeneration
IF:14.9Q1
DOI:10.1186/s13024-024-00775-z
PMID:39568070
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术,发现脂氧素B4能调控视神经中的疾病相关小胶质细胞,并在眼高压诱导的神经病变中发挥神经保护作用 | 首次发现脂氧素B4可调控视神经中的小胶质细胞,并抑制疾病相关小胶质细胞标志物CD74的表达,为神经保护机制提供了新见解 | 研究主要基于小鼠模型,且未深入探讨LXB4调控小胶质细胞的具体分子机制 | 探究脂氧素B4在视网膜和视神经中是否调控其他细胞类型(特别是小胶质细胞),并阐明其在眼高压诱导神经病变中的神经保护机制 | 小鼠视网膜和视神经中的小胶质细胞、星形胶质细胞和视网膜神经节细胞 | 神经科学 | 青光眼 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、qPCR、免疫组化、MorphOMICs和伪时间轨迹分析 | NA | 基因表达数据、图像数据 | 未提供具体样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 23 | 2026-08-26 |
Regulation of Diseases-Associated Microglia in the Optic Nerve by Lipoxin B4 and Ocular Hypertension
2024-Oct-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.18.585452
PMID:38562864
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序等技术,探究了脂氧素B4在视神经和视网膜中对小胶质细胞的调控作用及其在眼高压诱导神经退行性变中的神经保护机制 | 首次发现LXB4通过调控视神经远端小胶质细胞向稳态表型转化并抑制疾病相关表型(如CD74表达)发挥神经保护作用,并揭示了眼高压诱导的独特CD74阳性小胶质细胞群体 | 未明确提及研究局限性 | 探究LXB4在眼高压诱导神经病变中对视网膜和视神经中小胶质细胞的调控作用及其神经保护机制 | 小鼠视网膜和视神经中的小胶质细胞,以及视网膜神经节细胞和星形胶质细胞 | 神经科学 | 青光眼 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、qPCR、免疫组化、形态学分析(MorphOMICs)、伪时间轨迹分析 | NA | 基因表达数据、图像数据 | 小鼠模型(具体样本量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'转录组测序 |
| 24 | 2026-08-26 |
Expression, DNA methylation pattern and transcription factor EPB41L3 in gastric cancer: a study of 262 cases
2024-10-01, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-024-01849-7
PMID:39354571
|
研究论文 | 本研究探讨了胃癌中EPB41L3基因的表达、DNA甲基化模式及转录因子调控机制,发现非CpG甲基化与肿瘤进展相关,并鉴定CDC5L为关键转录因子 | 首次揭示EPB41L3启动子非CpG甲基化与胃癌恶性进展的关联,并鉴定CDC5L为调控EPB41L3表达的新型转录因子 | 未提供具体局限性信息 | 阐明EPB41L3在胃癌中的表达和甲基化模式,鉴定调控转录因子及受影响的下游通路 | 胃癌患者组织样本及细胞系 | 数字病理学 | 胃癌 | 免疫组化、亚硫酸盐测序、RNA-seq、单细胞RNA-seq、ChIP-qPCR、荧光素酶报告基因 | NA | 组织样本、细胞系数据 | 262例胃癌患者组织(其中70例用于测序) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 25 | 2026-08-26 |
Non-thermal atmospheric pressure plasma induces selective cancer cell apoptosis by modulating redox homeostasis
2024-09-26, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-024-01810-8
PMID:39327567
|
研究论文 | 本研究探讨了非热大气压等离子体通过调节氧化还原稳态选择性诱导癌细胞凋亡的机制,并评估其在癌症治疗中的应用潜力 | 揭示了NTAPP通过下调NRF2诱导的活性氧清除系统和抑制自噬来实现癌细胞选择性死亡的新机制,为癌症治疗提供新策略 | 研究仅限于体外实验,未进行体内模型验证;机制研究可能不足以完全解释体内复杂环境下的效应 | 探索NTAPP诱导癌细胞选择性死亡的机制,并评估其作为癌症疗法的应用价值 | HT1080纤维肉瘤细胞和人类正常成纤维细胞 | 数字病理学 | 纤维肉瘤 | 单细胞RNA测序、蛋白质印迹、免疫荧光染色、荧光染色、透射电子显微镜 | NA | 基因表达数据、图像 | NA(未提供具体样本数量) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 26 | 2026-08-26 |
Loss of p53 and SMAD4 induces adenosquamous subtype pancreatic cancer in the absence of an oncogenic KRAS mutation
2024-09-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101711
PMID:39232498
|
研究论文 | 本研究建立了携带野生型KRAS且缺失Trp53/Smad4或Trp53/Tgfbr2的基因工程小鼠模型,发现这些缺失可诱导自发性胰腺肿瘤形成,并具有腺鳞癌亚型特征及独特的肿瘤免疫微环境。 | 首次证明在没有致癌KRAS突变的情况下,Trp53/Smad4或Trp53/Tgfbr2的缺失足以诱导胰腺癌形成,且揭示了KRAS野生型胰腺腺鳞癌的独特组织学特征和免疫微环境。 | 未提供明确的局限性信息。 | 探究在无致癌KRAS突变背景下,Trp53/Smad4或Trp53/Tgfbr2缺失对胰腺癌发生的影响及其肿瘤特征。 | 基因工程小鼠模型(Trp53;Smad4;Pdx1-Cre和Trp53;Tgfbr2;Pdx1-Cre)及其胰腺肿瘤组织。 | 癌症研究、单细胞转录组学 | 胰腺癌(胰腺腺鳞癌) | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 基因工程小鼠模型 | 单细胞转录组数据、组织学图像 | 两种小鼠模型(PPSSC和PPTTC)的肿瘤样本,具体数量未提及。 | 未提及 | 单细胞RNA测序 | 未提及 | 未提及 |
| 27 | 2026-08-26 |
Isogenic patient-derived organoids reveal early neurodevelopmental defects in spinal muscular atrophy initiation
2024-08-20, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101659
PMID:39067446
|
研究论文 | 本研究利用同基因患者来源的诱导多能干细胞和脊髓类器官模型,揭示脊髓性肌萎缩症早期神经发育缺陷及其对后期运动神经元变性的影响 | 首次报道同基因患者来源的iPSC模型和脊髓类器官系统,揭示SMA早期神经发育异常,并发现SMN2向SMN1转换不能完全逆转这些发育缺陷 | 研究未完全覆盖SMA病理的全部机制,且SMN增加干预可能无法完全修正所有患者的病理 | 探究神经发育缺陷是否构成脊髓性肌萎缩症发病的早期机制 | 脊髓性肌萎缩症的脊髓类器官及早期小鼠胚胎 | 数字病理学 | 脊髓性肌萎缩症 | 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 28 | 2026-08-26 |
Modulation of Neuronal Excitability and Plasticity by BHLHE41 Conveys Lithium Non-Responsiveness
2024-Jul-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.25.605130
PMID:39372797
|
研究论文 | 本研究通过基因集富集分析发现核心时钟基因与锂反应性相关,并利用双敲除小鼠模型证明BHLHE40/41缺失导致锂无反应性,揭示了锂作用的高度细胞特异性机制 | 首次将核心时钟基因BHLHE41/40与锂无反应性联系起来,并通过单细胞RNA测序揭示锂在上层兴奋性神经元中的特异性调控网络 | 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类,且未深入探讨BHLHE41在人类患者中的具体作用机制 | 探讨双相障碍患者锂无反应性的分子机制,特别是时钟基因在其中的作用 | 双敲除BHLHE40/41的小鼠及其前额叶皮层和海马神经元 | 神经科学 | 双相障碍 | 基因集富集分析、行为学测试、细胞电生理记录、单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、电生理数据、行为数据 | 双敲除小鼠及对照小鼠,具体数量未在摘要中提供 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 29 | 2026-08-26 |
Exploring the role of CD8+ T cells in clear renal cell carcinoma metastasis
2024-07, FEBS open bio
IF:2.8Q3
DOI:10.1002/2211-5463.13819
PMID:38872260
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析透明细胞肾细胞癌中CD8+ T细胞的亚群分类,并探究其在肿瘤转移中的作用 | 首次基于单细胞转录组将CD8+ T细胞细分为四个亚群,揭示了与不良预后相关的关键基因及潜在介导转移的特定亚群 | 研究主要依赖于生物信息学分析和有限样本的免疫荧光验证,缺乏功能实验和临床关联的深入验证 | 阐明CD8+ T细胞在透明细胞肾细胞癌转移中的角色和异质性,以探索免疫逃逸机制 | 透明细胞肾细胞癌组织中的CD8+ T细胞 | 单细胞转录组学 | 透明细胞肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 亚群聚类分析及基因集富集分析 | 单细胞转录组数据 | 未明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 30 | 2026-08-26 |
Olfactory neuroblastoma mimics molecular heterogeneity and lineage trajectories of small-cell lung cancer
2024-06-10, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.05.003
PMID:38788720
|
研究论文 | 本研究通过基因工程小鼠模型揭示了嗅觉神经母细胞瘤的分子异质性和谱系轨迹,并发现其与小细胞肺癌在细胞命运和微环境方面具有相似性 | 首次建立Rb1/Trp53/Myc突变的转移性高级别嗅觉神经母细胞瘤小鼠模型,并证明球状基底细胞是其起源细胞,同时揭示了肿瘤内细胞命运异质性和可塑性,以及与小细胞肺癌的保守相似性 | 未明确提及研究的局限性 | 探究嗅觉神经母细胞瘤的细胞起源、分子异质性及其与小细胞肺癌的相似性,为分类和治疗提供新见解 | 嗅觉神经母细胞瘤(人源和小鼠模型)及小细胞肺癌(作为对比) | 分子生物学 | 嗅觉神经母细胞瘤、小细胞肺癌 | 基因工程小鼠模型、单细胞转录组学、条形码谱系追踪 | 基因工程小鼠模型 | 单细胞转录组数据、条形码谱系追踪数据 | 涉及小鼠模型和多个人类嗅觉神经母细胞瘤样本,具体数量未提供 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 31 | 2026-08-26 |
Integrative molecular and spatial analysis reveals evolutionary dynamics and tumor-immune interplay of in situ and invasive acral melanoma
2024-06-10, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.04.012
PMID:38759655
|
研究论文 | 该研究通过整合基因组学、单细胞转录组学、空间转录组学及蛋白质组学方法,对147例肢端黑色素瘤进行了分子和空间特征分析,揭示了原位到浸润性进展过程中的演化动态及肿瘤-免疫相互作用。 | 首次揭示了肢端黑色素瘤从原位到浸润性进展中的早期单克隆播种模式和两种不同的区域扩张模式(克隆扩张和亚克隆多样化),并发现了与侵袭性相关的APOE/CD163巨噬细胞亚群及其通过IGF1-IGF1R相互作用促进肿瘤上皮-间质转化的机制。 | 样本量有限,且主要基于中国人群,可能影响结果的普适性;此外,体外和离体实验未能完全模拟体内微环境的复杂性。 | 解析肢端黑色素瘤从原位到浸润性进展的演化动态及其与肿瘤免疫微环境的相互作用,为早期检测和治疗提供生物标志物。 | 147例肢端黑色素瘤样本,包括原发和浸润性肿瘤,以及相关免疫细胞。 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 基因组测序、RNA-seq、单细胞RNA测序、空间转录组 | NA | 基因组数据、转录组数据、空间转录组数据、蛋白质组数据 | 147例肢端黑色素瘤样本 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA-seq, 空间转录组 | 10x Chromium, 10x Visium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'端测序, 10x Visium空间转录组, Illumina NovaSeq高通量测序 |
| 32 | 2026-08-26 |
KLF4 in smooth muscle cell-derived progenitor cells is essential for angiotensin II-induced cardiac inflammation and fibrosis
2024-Jun-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.04.597485
PMID:38895472
|
研究论文 | 本研究通过谱系追踪、单细胞RNA测序和空间转录组技术,揭示了平滑肌细胞来源的AdvSca1-SM祖细胞在血管紧张素II诱导的心脏纤维化中向肌成纤维细胞分化的轨迹,并证明转录因子KLF4对该促纤维化反应至关重要 | 首次发现AdvSca1-SM细胞在血管紧张素II诱导的心脏纤维化中具有促纤维化分化轨迹,并揭示KLF4不仅维持细胞干性,还协调其对促纤维化刺激的反应,为心脏纤维化提供潜在治疗靶点 | 未提及具体局限性 | 阐明KLF4调控平滑肌细胞来源的AdvSca1-SM细胞表型的分子机制,及其在血管紧张素II诱导的心脏炎症和纤维化中的作用 | 主动脉、颈动脉和股动脉外膜中的AdvSca1-SM细胞,以及人类心脏肥大组织 | 生物信息学 | 心脏纤维化 | 谱系追踪、单细胞RNA测序、空间转录组 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | 小鼠模型和人类心脏组织样本,具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组 | NA | NA |
| 33 | 2026-08-26 |
Neutrophil and macrophage crosstalk might be a potential target for liver regeneration
2024-06, FEBS open bio
IF:2.8Q3
DOI:10.1002/2211-5463.13803
PMID:38710666
|
研究论文 | 本研究通过重新分析小鼠部分肝切除模型的单细胞RNA测序数据,追踪肝细胞和非实质细胞的转录变化,揭示了中性粒细胞与巨噬细胞之间的相互作用可能是促进肝再生的潜在治疗靶点 | 创新性地利用单细胞RNA测序数据重新分析,结合CellChat和加权基因共表达网络分析,首次揭示了肝再生过程中中性粒细胞与巨噬细胞之间的复杂串扰,并指出门静脉周围区域的肝细胞在其他区域中更为活跃 | 研究主要基于小鼠模型,可能无法完全代表人类肝脏再生的复杂性;此外,对中性粒细胞耗竭的实验结果未详细讨论其潜在的分子机制 | 旨在探究中性粒细胞在肝脏再生过程中的作用,并识别可能促进肝再生的潜在治疗靶点 | 小鼠部分肝切除模型中的肝细胞和非实质细胞(包括中性粒细胞和巨噬细胞) | 单细胞测序 | 肝再生 | 单细胞RNA测序 | 未明确指定,但可能涉及神经网络或聚类算法(基于CellChat和WGCNA) | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 34 | 2026-08-26 |
Increased Thyroid DPP4 Expression Is Associated With Inflammatory Process in Patients With Hashimoto Thyroiditis
2024-05-17, The Journal of clinical endocrinology and metabolism
DOI:10.1210/clinem/dgad723
PMID:38127960
|
研究论文 | 本研究旨在探讨桥本甲状腺炎患者外周血和甲状腺组织中DPP4的表达及其在病理生理过程中的作用 | 首次研究了桥本甲状腺炎患者甲状腺组织中DPP4的表达和活性,并通过单细胞RNA测序和体外细胞实验揭示其与炎症过程的关系 | 样本量较小,且为病例对照研究,可能无法充分代表一般人群 | 探讨桥本甲状腺炎患者外周血和甲状腺组织中DPP4的表达及其在病理生理过程中的作用 | 40名未用药的桥本甲状腺炎患者和81名对照个体 | 数字病理学 | 桥本甲状腺炎 | 单细胞RNA测序、体外细胞实验 | NA | 基因表达数据、细胞实验数据 | 40名患者和81名对照个体,以及6个旁肿瘤组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 35 | 2026-08-26 |
Tracking in situ checkpoint inhibitor-bound target T cells in patients with checkpoint-induced colitis
2024-05-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.04.010
PMID:38744246
|
研究论文 | 利用多模态单细胞和亚细胞空间转录组学追踪检查点抑制剂结合的T细胞,揭示结肠炎发病机制 | 首次使用多模态单细胞和亚细胞空间转录组学追踪体内检查点抑制剂结合的T细胞,并识别其独特的微结构域和因果信号通路 | 未提及具体局限性 | 阐明检查点抑制剂诱导结肠炎中T细胞的起源和致病机制,为预防策略提供资源 | 接受检查点抑制剂治疗并发生结肠炎的癌症患者肠道组织中的T细胞 | 数字病理学 | 结肠炎 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 图像、文本 | 未提及具体样本量 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 多模态单细胞和亚细胞空间转录组学 |
| 36 | 2026-08-26 |
Identification of hypoxic macrophages in glioblastoma with therapeutic potential for vasculature normalization
2024-05-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.03.013
PMID:38640932
|
研究论文 | 利用单细胞转录组学绘制了51例胶质瘤患者中单核细胞来源肿瘤相关巨噬细胞的时空转录谱,识别出一种缺氧巨噬细胞亚群,并通过肾上腺髓质素信号导致血管高通透性,提出了靶向该亚群以正常化肿瘤血管的治疗策略 | 首次在弥漫性胶质瘤中描绘了缺氧巨噬细胞的空间定位和转录特征,并揭示其通过旁分泌肾上腺髓质素破坏血管内皮连接的新机制,为血管正常化治疗提供了新靶点 | 研究主要基于异种移植模型,需进一步在临床样本中验证治疗策略的有效性和安全性 | 阐明胶质瘤中单核细胞来源肿瘤相关巨噬细胞的异质性及缺氧微环境对其重编程的影响,并探索靶向缺氧巨噬细胞以改善药物递送和预后的治疗潜力 | 来自51例IDH野生型胶质母细胞瘤或IDH突变型胶质瘤患者的单核细胞来源肿瘤相关巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | 胶质母细胞瘤、弥漫性胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 51例患者样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'转录组测序 |
| 37 | 2026-08-26 |
Tumor cell-intrinsic epigenetic dysregulation shapes cancer-associated fibroblasts heterogeneity to metabolically support pancreatic cancer
2024-05-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.03.005
PMID:38579725
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了胰腺导管腺癌中肿瘤细胞内在的表观遗传失调(SETD2缺失)如何通过BMP2信号重塑癌症相关成纤维细胞的异质性,并促进肿瘤代谢支持 | 首次将肿瘤细胞内在的表观遗传失调与癌症相关成纤维细胞异质性联系起来,发现脂质负载的CAF亚群及其通过ABCA8a转运体为肿瘤提供脂质以支持氧化磷酸化的代谢相互作用 | 摘要中未提及明显的局限性 | 探究肿瘤细胞内在的表观遗传失调对胰腺癌中癌症相关成纤维细胞异质性的影响及其代谢支持机制 | 胰腺导管腺癌中的肿瘤细胞和癌症相关成纤维细胞(包括脂质负载的CAF亚群) | 单细胞转录组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 38 | 2026-08-26 |
Transcriptional and functional remodeling of lung-resident T cells and macrophages by Simian varicella virus infection
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1408212
PMID:38887303
|
研究论文 | 利用单细胞测序和恒河猴模型,研究猿猴水痘病毒(SVV)感染对肺部常驻T细胞和巨噬细胞的转录组和功能重塑 | 首次结合单细胞测序和恒河猴实验模型,揭示SVV感染对肺部常驻T细胞和巨噬细胞的转录组重塑,特别是感染细胞与旁观者细胞的差异表达 | 摘要中未提及 | 明确VZV在感觉神经节潜伏和传播的机制,通过SVV感染模型研究肺部急性免疫反应 | 恒河猴肺部常驻T细胞和巨噬细胞(感染和旁观者) | 单细胞测序、免疫学 | 水痘及带状疱疹 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未提及具体数量,但为恒河猴模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 39 | 2026-08-26 |
Integration of single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq to construct liver hepatocellular carcinoma stem cell signatures to explore their impact on patient prognosis and treatment
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0298004
PMID:38635528
|
研究论文 | 整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,构建肝细胞肝癌干细胞特征,并探讨其对患者预后和治疗的影响 | 构建了基于癌症干细胞相关基因的新型预后风险模型,并评估了其对免疫治疗和化疗药物敏感性的预测能力 | 未提及 | 构建肝细胞肝癌干细胞特征,以预测患者预后并指导治疗策略 | 肝细胞肝癌患者的肿瘤干细胞相关基因 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 未明确说明具体数量,基于公开数据集 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 40 | 2026-08-26 |
A targeted CRISPR-Cas9 mediated F0 screen identifies genes involved in establishment of the enteric nervous system
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0303914
PMID:38809858
|
研究论文 | 利用斑马鱼开发了一种基于CRISPR-Cas9的F0靶向筛选,结合单细胞RNA测序、CRISPR反向遗传学和高内涵成像,鉴定出影响肠道神经系统建立的相关基因,并发现阿片受体参与其神经化学编码 | 首次在斑马鱼中建立高效、快速的体内F0 CRISPR筛选流程,整合单细胞RNA测序、CRISPR反向遗传学和高含量成像技术,用于系统性鉴定肠道神经系统发育相关的新基因 | 摘要中未明确指出局限性,可能包括F0嵌合体效果、候选基因功能验证不足或仅针对斑马鱼模型的适用性限制 | 鉴定参与肠道神经系统建立的关键基因,并探索其功能,以增进对神经系统构建的理解 | 斑马鱼体内肠道神经嵴细胞及其发育过程中的肠道神经系统 | 分子生物学 | 先天性巨结肠病 | CRISPR-Cas9 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |