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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
21 2026-09-07
Early SOX9 Activation Primes Hippo-YAP/TAZ Rewiring During Glioblastoma Stemness Acquisition
2026-09, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 本研究整合单细胞RNA测序、伪时间重建、空间转录组学及体内外功能实验,探讨SOX9在胶质母细胞瘤干性获得过程中的作用,并提出Hippo-YAP/TAZ重连的早期启动-后期解耦模型 首次揭示SOX9表达在胶质母细胞瘤恶性转化早期达到峰值且与Hippo-YAP/TAZ通路呈相位依赖性耦合,并发现血管周围微环境中SOX9与恶性细胞的最强关联,支持时空特异性的早期启动-后期解耦模型 摘要中未明确提及研究局限性 阐明SOX9在胶质母细胞瘤干性获得过程中的时间与空间调控作用及其与Hippo-YAP/TAZ通路的关系 胶质母细胞瘤细胞及星形胶质细胞恶性转化过程中的SOX9表达与功能 数字病理学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据、图像 NA NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
22 2026-09-07
Single-Cell Immune Profiling Suggests Non-Classical Monocyte Is Associated Immunodepression in Tuberculosis Treatment Non-Responders
2026-09, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序分析8名结核病患者的外周血单核细胞,比较2个月痰培养转阴状态,发现非经典单核细胞与治疗无应答者的免疫抑制相关 首次在结核病治疗无应答者中通过单细胞转录组关联非经典单核细胞、CD4+ Tregs及成熟NK亚群的免疫网络,提出LGALS9等候选生物标志物 观察性研究,样本量小(8例),免疫网络为计算推断,需前瞻性蛋白质与功能验证 探索结核病治疗早期无应答(2个月痰培养未转阴)相关的免疫细胞变化及潜在机制 8名结核病患者的外周血单核细胞,按治疗2个月痰培养转阴状态分层 单细胞转录组学 结核病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 8名结核病患者的外周血单核细胞样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
23 2026-09-07
Benchmarking cell type annotation in spatial transcriptomics: resolving cellular hierarchies, biological fidelity, and dynamic cell states
2026-Aug-28, Research square
研究论文 对20种空间转录组细胞类型注释方法在四种技术及六种生物与技术场景下进行系统基准测试,评估其准确性、结构保留及生物学保真度 首次提供包含专家人工标注的多种空间转录组数据集的系统基准,涵盖参考依赖和参考自由方法,并引入结构感知指标评估全局细胞关系及下游富集分析一致性 基准数据集主要基于人工标注,可能受主观影响;方法性能因上下文而异,未完全覆盖所有可能的空间转录组平台及场景 系统评估空间转录组细胞类型注释方法的性能,为不同情境提供方法选择指南,并识别下一代方法的开发重点 20种前沿细胞类型注释方法及来自四种空间转录组技术的基准数据集,涵盖多种组织、实验条件、细胞数量和基因面板规模 生物信息学、机器学习、计算生物学 不适用 空间转录组学、单细胞RNA测序 多种,包括神经网络模型如scANVI, Seurat, TACCO(具体类型未提及) 空间基因表达数据、图像数据 未明确说明具体样本数量,涉及多种组织、实验条件和细胞数量 不适用 空间转录组学 未明确具体平台,但涵盖四种技术 未提供具体平台配置信息
24 2026-09-07
Microenvironment-derived APP promotes osteosarcoma malignant phenotypes and induces macrophage M2 polarization via CD74
2026-Aug-28, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
研究论文 本研究探讨了微环境来源的APP通过CD74信号轴促进骨肉瘤恶性表型并诱导巨噬细胞M2极化的机制 首次揭示了APP-CD74信号轴在骨肉瘤中的促肿瘤作用及其对免疫微环境重塑的影响,并从单细胞水平解析了细胞来源 研究主要基于体外实验和异种移植模型,缺乏临床样本验证,且APP-CD74下游信号通路的具体分子机制未完全阐明 探明APP-CD74信号轴在骨肉瘤进展及免疫重塑中的作用,并评估其作为治疗靶点的潜力 骨肉瘤细胞、巨噬细胞、内皮细胞以及骨肉瘤异种移植小鼠模型 数字病理学 骨肉瘤 bulk RNA-seq、单细胞RNA测序、CellChat、ELISA、Western blot、免疫组化 异种移植模型、细胞共培养模型 转录组数据、单细胞表达数据、图像数据(免疫组化) 具体样本数量未在标题和摘要中提供 NA bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq NA NA
25 2026-09-07
Spatially-resolved pharmaco-ecology of immunotherapy resistance in lung adenocarcinoma: Single-cell and spatial transcriptomics for mechanism-matched combination therapies
2026-Aug-27, Translational oncology IF:4.5Q1
综述 本文综述了肺腺癌免疫治疗耐药的空间药理学生态学,利用单细胞和空间转录组学探讨机制匹配的联合治疗策略 将肺腺癌免疫治疗耐药性与空间生态学概念相结合,提出从描述性免疫表型分型转向生态学诊断和精准免疫调节 存在采样偏差、平台异质性、区分关联与因果的挑战,以及需要FFPE兼容测试和前瞻性验证 探讨肺腺癌免疫治疗耐药机制,并利用单细胞和空间转录组学指导机制匹配的联合治疗 肺腺癌(LUAD)及非小细胞肺癌(NSCLC)中的恶性细胞、免疫细胞(如树突状细胞、T细胞、B细胞)、肿瘤微环境成分(如癌症相关成纤维细胞、细胞外基质、血管) 数字病理学 肺癌 空间转录组学、单细胞测序、FFPE兼容检测 NA 单细胞和空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
26 2026-09-07
TMEM176B orchestrates intratumoral hierarchy and immunosuppression in hepatocellular carcinoma: Insights from single-cell transcriptomics
2026-Aug-26, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序分析了肝细胞癌的肿瘤内异质性,并揭示了TMEM176B在肿瘤分化层级和免疫抑制中的关键作用。 首次利用单细胞转录组学描绘肝细胞癌的恶性层级结构,并识别TMEM176B作为连接肿瘤去分化与免疫重塑的关键分子。 体外实验验证功能,缺乏体内模型和临床多变量分析,需要进一步评估TMEM176B作为预后生物标志物的潜力。 探究肝细胞癌的细胞异质性和免疫微环境,揭示TMEM176B在肿瘤分级和免疫抑制中的作用及其预后价值。 五名肝细胞癌患者的肿瘤和相邻非肿瘤组织,以及LM3和Huh-7细胞系。 单细胞转录组学 肝细胞癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 5名患者的配对肿瘤和相邻非肿瘤组织 NA 单细胞RNA测序 NA NA
27 2026-09-07
Protocol to identify genes required for cardiomyocyte development using Perturb-Seq
2026-Aug-25, STAR protocols IF:1.3Q4
研究论文 本文介绍了一种使用Perturb-Seq技术识别心肌细胞发育所需基因的实验协议。 提出结合CRISPR筛选与单细胞RNA测序的协议,解决成本与异质性问题。 大规模实验成本高,分化异质性复杂。 识别心肌细胞发育所需基因。 心肌细胞发育过程中的基因。 机器学习和数字病理学 心血管疾病 Perturb-Seq,CRISPR,单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium 单细胞3'转录组
28 2026-09-07
Single-cell and bulk transcriptomic profiling of M2-like tumor-associated macrophages reveals a prognostic signature and an inflammation-metabolism crosstalk program in multiple myeloma
2026-Aug-24, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 通过单细胞和 bulk 转录组分析,识别多发性骨髓瘤特异性的 M2 样肿瘤相关巨噬细胞亚群,并构建预后签名和炎症-代谢交互程序 识别出骨髓瘤特有的 M2-TAM 亚群,并基于多机器学习算法构建共识预后模型,揭示了缺氧与炎症-代谢的交互作用 摘要未提及明确限制,可能受样本量和数据集来源限制 解析多发性骨髓瘤中 M2 样 TAM 的异质性,开发预后签名以改善风险分层 多发性骨髓瘤患者和正常骨髓中的巨噬细胞 机器学习和转录组学 多发性骨髓瘤 单细胞 RNA 测序与 bulk 转录组分析 机器学习算法(包括多种,如 Cox 相关模型等,具体未指定) 基因表达数据(单细胞和批量) 涉及多个数据集(GSE124310, GSE278230, GSE6477, GSE9782, GSE57317),具体样本数量未在摘要中明确 NA 单细胞 RNA 测序、批量转录组测序 NA NA
29 2026-09-07
COL1A1-Enhanced CD44/SLC7A11 Interaction and Cystine Uptake Result in CD34+ Foam-Like Macrophage Accumulation in Transplant Arteriosclerosis
2026-Aug-04, Circulation IF:35.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学等技术,发现移植动脉硬化中CD34+泡沫样巨噬细胞的积累由COL1A1增强的CD44/SLC7A11相互作用及胱氨酸摄取驱动,并提供了潜在治疗靶点 首次鉴定出移植动脉硬化中一种新的促炎性泡沫样巨噬细胞表型,并揭示COL1A1通过增强CD44-SLC7A11复合物膜表达促进胱氨酸摄取,进而激活mTORC1-HIF-1α信号通路驱动脂质合成的新机制 研究主要基于人类标本和小鼠模型,可能无法完全反映人类疾病的全部复杂性;且未对COL1A1-CD44-SLC7A11轴在临床干预中的长期效果进行验证 阐明移植动脉硬化中炎症性巨噬细胞亚群的起源和调控机制,以开发靶向治疗策略改善移植预后 人类慢性移植物血管病变标本和小鼠血管同种异体移植模型中的巨噬细胞亚群,特别是CD34+泡沫样巨噬细胞 数字病理学 移植动脉硬化 单细胞RNA测序、空间转录组学、流式细胞术、免疫荧光染色、邻近连接分析、免疫共沉淀、超高效液相色谱-高分辨率质谱 NA 转录组数据、图像数据、质谱数据 人类慢性移植物血管病变标本和小鼠血管同种异体移植模型(具体数量未提供) NA NA NA NA
30 2026-09-07
EVA1A responds to endoplasmic reticulum stress to regulate renal fibrosis by promoting TGF-β signaling pathway
2026-08, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本文揭示了EVA1A响应内质网应激通过促进TGF-β信号通路调节肾纤维化的机制 首次阐明EVA1A在肾纤维化中的作用,并揭示其通过CHOP响应ER应激,与BIP相互作用稳定并促进TGFBR2分泌至质膜,从而激活TGF-β信号通路的新机制 研究主要基于小鼠模型和细胞实验,临床样本数量有限,且未深入探讨EVA1A在其他CKD类型或人类患者中的具体调控网络 阐明EVA1A在TGF-β信号调节和肾纤维化中的角色及其调控机制 慢性肾病患者、UUO和UIRI小鼠模型、肾上皮细胞以及Eva1a条件敲除小鼠 分子生物学 慢性肾脏病 单细胞RNA测序、免疫组织化学、Western blot、共免疫沉淀、双分子荧光互补 条件敲除小鼠模型 基因表达数据及蛋白相互作用数据 人类肾纤维化组织和多种小鼠模型样本(具体数量未明确) NA 单细胞RNA测序 NA NA
31 2026-09-07
Decoding Brain Development and Function Through GABAergic Inhibitory Neurons
2026-08, The European journal of neuroscience
综述 本文综述了大脑皮层中间神经元在发育和功能中的关键作用,探讨了其分子和功能复杂性及其与神经发育疾病的关联 强调通过分子生物学、成像和单细胞转录组学揭示中间神经元发育的异质性,并探讨人类特有脑功能的潜在联系 未具体说明研究的局限性 旨在解析人类中间神经元的起源、功能多样性及其对神经发育疾病的理解 大脑皮层抑制性中间神经元 神经科学 神经发育障碍 单细胞转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞转录组学 NA NA
32 2026-09-07
Single-Cell Profiling Identifies Skin-Resident Memory CD4+ T Cells as a Potential Correlate of Immunity During Staphylococcus aureus Skin Infection
2026-08, European journal of immunology IF:4.5Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术,在小鼠皮肤感染模型中鉴定出皮肤驻留记忆CD4+ T细胞,并发现其在再次感染时提供保护性免疫 首次结合纵向单细胞RNA测序与流式细胞术,在金黄色葡萄球菌皮肤感染模型中全面表征皮肤驻留记忆CD4+ T细胞的转录程序、表型及功能,并证明其在保护性免疫中的关键作用,为疫苗策略提供新靶点 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类;未深入探讨CD4 Trm细胞的具体效应机制 阐明金黄色葡萄球菌皮肤感染后皮肤内免疫记忆的细胞介质,评估CD4+ T细胞的组织驻留及其在保护性免疫中的作用 小鼠皮肤感染模型中的CD4+ T细胞,特别是皮肤驻留记忆T细胞(Trm) 单细胞测序, 免疫学 皮肤和软组织感染(金黄色葡萄球菌感染) 单细胞RNA测序, 流式细胞术 NA 单细胞转录组数据, 流式细胞术数据 小鼠皮肤感染模型样本(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
33 2026-09-07
A Bacterial Microbiome Is Dispensable for the Induction of CD8 T Cell Exhaustion
2026-08, European journal of immunology IF:4.5Q2
研究论文 本研究探讨了微生物组在慢性病毒感染中CD8 T细胞耗竭诱导中的作用,发现微生物组并非必需。 首次证明微生物组缺失不影响T细胞耗竭的发生及病毒控制,挑战了微生物组在免疫调节中的普遍必要性观点。 研究局限于特定的小鼠模型(LCMV感染),可能不足以推广到其他慢性感染或人类疾病。 评估微生物组对慢性病毒感染诱导CD8 T细胞耗竭和病毒控制的影响。 无菌小鼠和特定病原体自由小鼠中的病毒特异性CD8 T细胞。 微生物组学、免疫学 慢性病毒感染 单细胞测序 NA 单细胞基因表达数据 未明确,涉及无菌和特定病原体自由小鼠。 NA 单细胞RNA测序 NA NA
34 2026-09-07
Metabolic Dysregulation of FC3 Fibrochondrocytes via MDH2 Promotes Intervertebral Disc Degeneration
2026-07, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 通过整合单细胞RNA测序和转录组测序数据,揭示FC3纤维软骨细胞亚群中MDH2介导的代谢失调促进椎间盘退变的机制 首次识别出FC3纤维软骨细胞亚群及其三种功能状态,并确定MDH2为核心枢纽基因连接TCA循环激活与FC3代谢表型,同时筛选出潜在治疗药物 基于公共数据集的分析,缺乏实验验证,且未提供体内或体外功能实验证据 阐明椎间盘退变进展中关键细胞亚群和代谢机制,并筛选潜在治疗靶点 椎间盘退变组织中的细胞亚群,特别是FC3纤维软骨细胞 生物信息学 椎间盘退变 单细胞RNA测序、转录组测序 加权基因共表达网络分析、伪时间轨迹推断 基因表达数据 公共数据集GSE230809和GSE186542,具体样本数未提及 NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
35 2026-09-07
Inflammaging: Experimental Insights and Translational Advances
2026-07, European journal of immunology IF:4.5Q2
综述 本综述讨论炎症衰老(Inflammaging)的机制基础、最新进展及其在临床转化中的应用,包括细胞衰老、SASP、线粒体功能障碍等,并评估了多种干预策略的可行性和有效性 利用单细胞和空间转录组学揭示炎症衰老的组织特异性和背景依赖性模式,强调系统性复杂性,并整合多种治疗策略(如衰老细胞清除药物、衰老调节药物、代谢调节剂等)及其联合应用 挑战包括生物标志物开发、长期安全性评估以及衰老人群异质性问题 阐述炎症衰老的机制基础及其转化医学进展,以支持精准老年科学范式,延长健康寿命并减少慢性病负担 衰老相关疾病过程中的炎症衰老及其机制,包括细胞衰老、SASP、线粒体功能障碍、免疫衰老等 机器学习 老年疾病 NA NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
36 2026-09-07
EFHD2 drives lactate-mediated DNA damage repair and immunosuppression via HMGB1 and HIF-1α to confer radioresistance in colorectal cancer
2026-Jun-23, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 该研究揭示了EFHD2通过乳酸介导的DNA损伤修复和免疫抑制促进结直肠癌放疗抵抗的机制,并提出靶向EFHD2轴可恢复抗肿瘤免疫并改善治疗效果 首次阐明EFHD2的K9乳酸化修饰在DNA修复中的关键作用,并整合多组学数据与空间转录组学揭示其重塑肿瘤免疫微环境的机制 研究主要基于细胞模型和小鼠实验,患者样本数量有限,且未深入探讨EFHD2在其他癌症类型中的普适性 探索结直肠癌放疗抵抗的分子机制,特别是EFHD2在乳酸代谢、DNA修复和免疫抑制中的作用 放疗抵抗的结直肠癌细胞模型、免疫缺陷和免疫健全小鼠、患者来源的直肠癌样本 癌症生物学、免疫学、转录组学 结直肠癌 RNA测序、蛋白质组学、乳酸化蛋白质组学、空间转录组学、单细胞RNA测序、免疫共沉淀、分子对接、多重免疫荧光、流式细胞术 细胞模型和小鼠模型 转录组数据、蛋白质组数据、单细胞和空间转录组数据、免疫组化数据 不适用(未提供具体数量) NA RNA测序、蛋白质组学、乳酸化蛋白质组学、空间转录组学、单细胞RNA测序 NA NA
37 2026-09-07
Multi-omics integration and clinical validation identify CKAP2 as a diagnostic biomarker for bladder cancer
2026-Jun-23, World journal of surgical oncology IF:2.5Q1
研究论文 通过多组学整合与临床验证,确定CKAP2作为膀胱癌的诊断生物标志物 采用多组学整合结合孟德尔随机化因果推断和独立临床队列验证,全面评估CKAP2的诊断价值及其在肿瘤微环境中的作用 摘要未提及局限性 利用多组学方法整合临床验证,识别并严格验证CKAP2作为膀胱癌的重要诊断生物标志物 膀胱癌组织样本,包括127个组织样本(50对匹配的肿瘤和邻近正常组织、21个独立肿瘤组织和6个独立邻近正常组织) 机器学习 膀胱癌 多组学整合分析,差异表达分析,机器学习,孟德尔随机化,单细胞RNA测序 机器学习模型,逻辑回归模型 基因表达数据,单细胞RNA测序数据,临床组织样本数据 127个组织样本,包括50对匹配的肿瘤和邻近正常组织、21个独立肿瘤组织和6个独立邻近正常组织;单细胞RNA测序数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
38 2026-09-07
PD-L1-targeted OMV priming licenses myeloid co-stimulation and chemokine circuits to potentiate CAR-T therapy in advanced-stage solid tumors
2026-Jun-23, Journal of nanobiotechnology IF:10.6Q1
研究论文 本研究开发了靶向PD-L1的细菌外膜囊泡(OMV)作为预刺激平台,通过重塑骨髓细胞区室和增强肿瘤内共刺激,提高晚期实体瘤中CAR-T细胞的疗效 首次将PD-L1靶向的OMV用于CAR-T治疗的预刺激,通过促进树突状细胞成熟和巨噬细胞促炎极化,增强CAR-T细胞的募集和功能,并支持剂量降低的CAR-T治疗 摘要未提及研究的局限性 开发一种系统性预刺激策略,以克服实体瘤中CAR-T细胞治疗的免疫抑制微环境限制 细菌外膜囊泡、CAR-T细胞、树突状细胞、巨噬细胞、肿瘤微环境 机器学习 实体瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'
39 2026-09-07
Deciphering mitotic catastrophe-associated transcriptomic patterns in renal cell carcinoma: prognostic significance and immunotherapy-related associations
2026-Jun-22, Biology direct IF:5.7Q1
研究论文 本研究结合多组学、临床和影像数据,构建基于有丝分裂灾难相关基因的肾细胞癌预后模型,并鉴定CCNF作为肿瘤进展和免疫微环境的关键调节因子 首次将有丝分裂灾难相关基因与肾细胞癌预后及免疫治疗反应关联,并利用单细胞RNA测序和体内外实验验证CCNF的功能 免疫治疗队列中CCNF相关结果的验证仍需进一步研究 探讨有丝分裂灾难相关基因在肾细胞癌中的预后意义及与免疫治疗的关联 肾细胞癌患者及细胞系、小鼠异种移植模型 数字病理学 肾细胞癌 多组学分析、单细胞RNA测序、体外实验、小鼠异种移植 CoxBoost、随机生存森林 转录组、临床数据、影像数据、单细胞RNA测序数据 TCGA及多个外部队列的肾细胞癌患者样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
40 2026-09-07
Single-cell RNA sequencing in ovarian cancer: decoding the tumor microenvironment for personalized therapy
2026-Jun-22, Journal of ovarian research IF:3.8Q1
综述 本文综述了单细胞RNA测序在卵巢癌研究中的应用,重点解析肿瘤微环境以促进个性化治疗。 强调了scRNA-seq与空间转录组学、多组学平台及人工智能的整合,以增强细胞复杂性解析和患者分层 面临特定细胞类型代表性不足、技术变异性和高成本等挑战 探讨单细胞技术在卵巢癌中解码肿瘤微环境生物学,并推动临床转化和个性化治疗策略 卵巢癌肿瘤微环境中的免疫、基质、内皮和细胞外基质成分 数字病理学 卵巢癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
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