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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
21 2026-10-05
Integrating single-cell transcriptomics to reveal the ferroptosis regulators in the tumor microenvironment that contribute to bladder urothelial carcinoma progression and immunotherapy
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 该研究利用单细胞转录组数据,通过非负矩阵分解聚类识别膀胱尿路上皮癌肿瘤微环境中与铁死亡相关的细胞亚型,并探究其对肿瘤进展和免疫治疗的影响 首次利用非负矩阵分解降维聚类在膀胱癌肿瘤微环境中鉴定出新的铁死亡相关细胞亚型,发现ACSL4+CAFs亚型与不良预后和免疫治疗抵抗相关,并揭示PTN-SDC1轴在CAF与癌细胞通讯中的作用 研究主要基于生物信息学分析和体外实验验证,缺乏体内动物实验和大规模临床队列验证 揭示铁死亡在膀胱尿路上皮癌肿瘤微环境中的调控机制,探索铁死亡相关细胞亚型对膀胱癌进展、预后及免疫治疗的影响 膀胱尿路上皮癌肿瘤微环境中的癌细胞、癌相关成纤维细胞、巨噬细胞和T细胞 数字病理学 膀胱癌 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 非负矩阵分解 图像, 文本 NA NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
22 2026-10-05
Single-Cell RNA Sequencing Unifies Developmental Programs of Esophageal and Gastric Intestinal Metaplasia
2023-06-02, Cancer discovery IF:29.7Q1
研究论文 该研究构建了涵盖整个胃肠道的单细胞RNA测序图谱,比较了食管和胃的肠化生(BE-IM和GIM)的发育轨迹和分子特征 首次通过单细胞RNA测序统一了食管和胃肠化生的发育程序,发现两者共享分子特征,单个细胞同时具有胃和肠上皮的转录特性,且具有促肿瘤的活化成纤维细胞微环境 摘要中未明确提及研究局限性 验证食管肠化生(BE-IM)和胃肠化生(GIM)在应对不同炎症刺激时遵循平行发育轨迹的假设 整个胃肠道的生理正常和病理状态组织,包括食管胃化生(E-GM)、巴雷特食管肠化生(BE-IM)、萎缩性胃炎和胃肠化生(GIM) 单细胞组学 食管腺癌, 胃腺癌, 巴雷特食管, 萎缩性胃炎, 肠化生 单细胞RNA测序, 蛋白质表达研究 NA 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
23 2026-10-05
Blockade of interleukin 10 potentiates antitumour immune function in human colorectal cancer liver metastases
2023-02, Gut IF:23.0Q1
研究论文 该研究利用人结直肠癌肝转移切片培养体系,评估IL-10阻断对內源性T细胞和CAR-T细胞抗肿瘤功能的影响 首次在人结直肠癌肝转移器官型切片培养中证实IL-10阻断可增强内源性T细胞和CEA特异性CAR-T细胞的抗肿瘤功能,并揭示其依赖于抗原呈递细胞和MHC分子 样本量有限(38例患者肿瘤),且为体外切片培养体系,缺乏体内实验验证和临床转化数据 评估IL-10阻断对微卫星稳定型结直肠癌肝转移中内源性T细胞和CAR-T细胞抗肿瘤功能的影响 人结直肠癌肝转移肿瘤组织切片(38例患者)及小鼠CAR-T细胞 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序、免疫组化、多重免疫组化、原位杂交、反相蛋白阵列、延时荧光显微镜 NA 图像、文本 38例患者的结直肠癌肝转移肿瘤切片 NA 单细胞RNA测序 NA NA
24 2026-10-05
Single-cell sequencing unveils distinct immune microenvironments with CCR6-CCL20 crosstalk in human chronic pancreatitis
2022-09, Gut IF:23.0Q1
研究论文 该研究通过对人类慢性胰腺炎患者胰腺免疫细胞进行单细胞测序,揭示了不同病因慢性胰腺炎中独特的免疫微环境及CCR6-CCL20信号轴的相互作用 首次在单细胞水平上对人类慢性胰腺炎的胰腺免疫细胞进行转录组和表位测序以及T细胞受体测序,发现了遗传性慢性胰腺炎中CCR6+ CD4+ T细胞的显著富集以及CCR6-CCL20信号轴在胰腺特异性免疫串扰中的关键作用 样本量相对有限,仅纳入器官捐献者及接受全胰腺切除术的遗传性和特发性慢性胰腺炎患者,验证队列规模较小,可能影响结果的普遍性 利用不同病因慢性胰腺炎患者及非慢性胰腺炎器官捐献者的胰腺组织,表征胰腺免疫反应,以识别与人类慢性胰腺炎相关的关键信号分子 人类慢性胰腺炎患者的胰腺免疫细胞,包括遗传性和特发性慢性胰腺炎患者以及非慢性胰腺炎器官捐献者 单细胞组学 慢性胰腺炎 CITE-seq, TCR测序, 流式细胞术, 功能实验 NA 单细胞转录组数据, 表位数据, TCR序列数据 器官捐献者、遗传性及特发性慢性胰腺炎患者的胰腺免疫细胞样本,另有一个独立慢性胰腺炎患者队列用于验证 NA single-cell RNA-seq, single-cell multi-omics, single-cell TCR-seq NA NA
25 2026-10-05
Immune disease risk variants regulate gene expression dynamics during CD4+ T cell activation
2022-06, Nature genetics IF:31.7Q1
研究论文 该研究利用单细胞转录组学技术,在119名健康个体的655,349个CD4+ T细胞中绘制了基因表达的数量性状位点(eQTL),揭示了免疫疾病风险变异如何动态调控T细胞激活过程中的基因表达。 首次在单细胞水平上、跨多个激活时间点(未刺激及三个激活时间点)系统绘制CD4+ T细胞的动态eQTL图谱,发现了大量在激活过程中动态调控的基因,并将免疫疾病风险变异与细胞状态特异性的基因表达调控联系起来。 研究仅纳入健康个体,未涵盖疾病患者样本;仅关注CD4+ T细胞,未涉及其他免疫细胞类型;体外激活模型可能无法完全反映体内T细胞激活的复杂性。 探究免疫疾病风险变异如何在CD4+ T细胞激活过程中调控基因表达动态,从而揭示遗传易感性的机制。 119名健康个体的CD4+ T细胞,共655,349个细胞,涵盖未刺激状态和三个激活时间点。 机器学习, 数字病理学 免疫疾病 单细胞转录组学, eQTL分析 NA 文本, 图像 119名健康个体的655,349个CD4+ T细胞 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'转录组
26 2026-10-05
Molecular Computational Anatomy: Unifying the Particle to Tissue Continuum via Measure Representations of the Brain
2022, BME frontiers IF:5.0Q1
研究论文 本文提出了一种统一的脑映射理论,通过几何测度表示将空间转录组学与细胞尺度组织学等微观粒子尺度与计算解剖学中的组织尺度相结合 首次引入几何varifold测度表示微观尺度的确定性结构与功能,并利用类Boltzmann方法实现从分子粒子描述到组织尺度经验概率的一致性过渡,提出了分子计算解剖学的统一框架 摘要中未明确提及研究的局限性 统一空间转录组学和细胞尺度组织学的分子表示与计算解剖学中的组织尺度,实现跨尺度的脑映射 大脑的分子和细胞尺度数据以及组织尺度影像数据 计算解剖学 NA 空间转录组学、组织学 NA 图像、文本(分子数据) NA NA 空间转录组学 NA NA
27 2026-10-05
Single-cell transcriptional analyses of spasmolytic polypeptide-expressing metaplasia arising from acute drug injury and chronic inflammation in the stomach
2020-06, Gut IF:23.0Q1
研究论文 该研究通过单细胞RNA测序比较了健康胃、急性药物损伤胃和慢性炎症胃黏膜中表达解痉多肽的化生(SPEM)细胞的转录组变化。 首次在单细胞水平上定义了急性和慢性损伤诱导的SPEM的转录变化,发现SPEM和颈部细胞增生在SPEM相关转录物表达上几乎相同,且不同病因诱导的SPEM程序高度保守,但慢性炎症环境下的SPEM细胞具有独特的免疫调节能力。 摘要中未明确提及研究局限性。 在单细胞水平上定义胃黏膜急性和慢性损伤诱导的SPEM相关的转录变化。 健康胃、药物诱导和炎症诱导SPEM病变的胃体上皮细胞。 单细胞转录组学 胃癌、肠化生 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 来自健康、急性损伤和慢性炎症胃组织的上皮细胞样本(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
28 2026-10-04
Chaenomeles speciosa-derived extracellular vesicles accelerate fracture healing via orchestrating immuno-angiogenic coupling
2026-Dec, Bone reports IF:2.1Q3
研究论文 该研究探究了宣木瓜来源的细胞外囊泡通过调控免疫-血管生成偶联加速骨折愈合的作用和机制 首次揭示宣木瓜来源的细胞外囊泡通过重塑骨免疫微环境、促进M2巨噬细胞极化和血管生成,经免疫-血管生成偶联机制加速骨折愈合,为难愈性骨折提供多靶点治疗新策略 研究主要基于大鼠股骨骨折模型和体外细胞实验,尚需进一步开展临床转化研究以验证其安全性和有效性 探究宣木瓜来源的细胞外囊泡能否通过重塑免疫微环境促进骨折愈合 人骨不连组织、RAW 264.7巨噬细胞、人脐静脉内皮细胞、大鼠股骨骨折模型 数字病理 骨折不愈合 单细胞RNA测序、网络药理学、分子对接、超速离心、透射电子显微镜、微计算机断层扫描 NA 图像、文本 人骨不连组织样本(具体数量未提及)、RAW 264.7巨噬细胞、人脐静脉内皮细胞、大鼠股骨骨折模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
29 2026-10-04
Spatiotemporal development of sparse excitatory neuronal types within the deep mouse cortex
2026-Oct-16, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究利用单细胞空间转录组技术,在四个发育时间点及两种性别的小鼠大脑中构建了超过150万个脑细胞的数据集,重点揭示了深层皮层中稀疏兴奋性神经元类型(subplate和claustrum)的时空发育差异 首次在单细胞空间水平上系统比较了发育中的subplate和claustrum,发现两者尽管在成年期具有相似的分子特性,但在起源、转录组演化和时空成熟上存在显著差异 研究主要基于小鼠模型,结果是否适用于其他物种(包括人类)尚需验证;仅覆盖四个发育时间点,可能遗漏更精细的发育动态 绘制发育中小鼠大脑细胞类型的时空组织图谱,理解皮层模式形成和功能 发育中小鼠大脑的深层皮层神经元,特别是subplate和claustrum细胞类型 空间转录组学 NA 单细胞空间转录组学 NA 图像、文本 超过150万个脑细胞,覆盖胚胎期和出生后多个时间点及两种性别 NA 单细胞空间转录组学 NA NA
30 2026-10-04
Characterization of hematopoietic stem cell-derived microglia-like cells in nonhuman primates
2026-Oct-13, Blood advances IF:7.4Q1
研究论文 该研究利用自体非人灵长类造血干细胞移植模型,探究了基因修饰造血干细胞来源的微胶质样细胞在脑内的植入及其转录组特征 首次在非人灵长类动物模型中系统表征了造血干细胞移植后微胶质样细胞的植入情况、形态学特征和单细胞转录组,揭示了其边界相关巨噬细胞样表型 样本量较小(仅5只非人灵长类),未涉及人类临床试验,且对微胶质样细胞的功能性验证有限 探究造血干细胞移植后微胶质样细胞在中枢神经系统中的植入效率、分布规律及转录组身份 5只接受基因修饰自体造血干细胞移植的非人灵长类动物 单细胞转录组学 神经性溶酶体贮积症 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 5只非人灵长类动物的脑组织样本 NA single-cell RNA-seq NA NA
31 2026-10-04
Lineage and renewal dynamics of sebaceous glands govern skin barrier integrity in mice
2026-Oct-06, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 该研究通过批量分离小鼠皮脂腺、构建谱系追踪小鼠模型并结合单细胞RNA测序,揭示了皮脂腺的异质性、谱系起源及动态更新机制,并发现Pparγ是调控皮脂细胞稳态的关键因子 首次系统揭示小鼠皮脂腺干细胞后代可回归毛囊隆突并再分化,发现+细胞通过不同分化轨迹形成典型和非典型皮脂腺,并证明皮脂细胞分化程序高度依赖Pparγ且可通过局部药理调控 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限,且对皮脂腺干细胞微环境调控的分子机制尚未完全阐明 阐明皮脂腺的细胞生物学特征、谱系来源及更新动态,探索调控皮脂腺稳态和皮肤屏障完整性的可行途径 小鼠皮脂腺组织及皮脂腺干细胞,并涉及人类皮脂细胞的药理验证 单细胞生物学、皮肤生物学 皮肤病 单细胞RNA测序、谱系追踪、批量分离 小鼠模型 基因表达数据、谱系追踪数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
32 2026-10-04
High-Risk Rhabdomyosarcomas Feature a Convergent Cell State
2026-Oct-02, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 该研究通过单细胞转录组等技术,发现高风险横纹肌肉瘤的癌细胞汇聚于一种共同的细胞状态,该状态与FOXO1融合状态无关 发现了高风险横纹肌肉瘤中一种超越传统分子和组织学边界的汇聚性细胞状态,该状态仅部分与FOXO1融合的转录效应重叠,并意外表现出神经特征 摘要中未明确提及研究的局限性 探究高风险横纹肌肉瘤的细胞状态异质性及其与FOXO1融合状态的关系 横纹肌肉瘤(RMS)患者的肿瘤细胞 数字病理学 横纹肌肉瘤 单细胞转录组学、核转录组学、染色质可及性测序、空间转录组学、扰动研究 NA 转录组数据、表观遗传数据、空间数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 NA NA
33 2026-10-04
Targeting Cystine Addiction Suppresses Breast Cancer Lung Metastasis
2026-Oct-02, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本文利用MYC驱动的乳腺癌体内和离体模型,探索乳腺肿瘤细胞转移至肺部时发生改变的关键代谢通路,发现转移细胞依赖外源性胱氨酸/半胱氨酸合成谷胱甘肽,靶向该代谢依赖可抑制肺转移并增强放疗敏感性 揭示了MYC驱动乳腺癌肺转移细胞对胱氨酸/半胱氨酸的代谢依赖性,发现转移细胞因转硫途径下调而依赖外源性胱氨酸摄取来合成谷胱甘肽,并证明胱氨酸酶联合局部放疗可有效减轻肺转移负担 摘要中未明确说明研究的具体局限性 探索乳腺肿瘤细胞转移至肺部时发生改变的关键代谢通路及其相关脆弱性,以开发更有效的抗转移治疗策略 MYC驱动的乳腺癌体内和离体模型中的乳腺肿瘤细胞及其肺转移灶 代谢组学、肿瘤生物学 乳腺癌 稳定同位素分辨代谢组学、质谱成像、单细胞RNA测序 NA 代谢组数据、质谱成像数据、单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq、稳定同位素分辨代谢组学、质谱成像 NA NA
34 2026-10-04
Methyl eugenol increases neural microcirculation to promote nerve repair by regulating endothelial cell and Schwann cell communication via Ptn/Sdc4
2026-Oct-02, Natural products and bioprospecting IF:4.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序和mRNA测序揭示甲基丁香酚通过调控内皮细胞与施万细胞间Ptn/Sdc4通讯增强神经微循环,从而促进神经修复 首次揭示甲基丁香酚通过Ptn/Sdc4信号轴调控内皮细胞与施万细胞通讯,进而增强神经微循环并促进神经修复 研究仅在大鼠CCI模型中验证,未涉及其他神经损伤模型或人类样本,机制验证主要依赖细胞实验 探究甲基丁香酚是否通过增强神经微循环促进神经修复 SD大鼠及大鼠主动脉内皮细胞和大鼠施万细胞RSC96 机器学习 神经损伤 单细胞测序,mRNA测序 NA 图像,文本 64只SD大鼠(32只用于CCI时间梯度实验,32只用于药物干预实验) NA single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
35 2026-10-04
METTL14-mediated m6A modification of CXCL9 mRNA regulates macrophage CS polarization to suppress OSCC growth and stemness
2026-Oct-02, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1
研究论文 本文揭示了METTL14通过介导CXCL9 mRNA的m6A修饰调控巨噬细胞CS极化,从而抑制口腔鳞状细胞癌生长和干性的机制 首次发现METTL14通过m6A修饰CXCL9 mRNA并由阅读蛋白IGF2BP3识别和稳定,驱动TAM向CXCL9⁺表型极化,进而抑制OSCC生长和干性,揭示了CS比值调控的新表观遗传机制 研究主要基于公共数据库scRNA-seq数据和有限数量的bulk转录组队列(330例),体内实验仅使用小鼠模型,缺乏临床干预验证 阐明METTL14调控TAM CS极化的分子机制及其对OSCC生长和干性的影响 口腔鳞状细胞癌(OSCC)肿瘤微环境中的肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)及OSCC细胞 数字病理学 口腔鳞状细胞癌 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq, m6A甲基化修饰分析 NA 文本, 基因表达数据 scRNA-seq数据(OSCC和正常样本)及3个独立bulk转录组队列共330例患者组织样本,另包含体外细胞实验和小鼠体内实验 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
36 2026-10-04
Bisphenol A Exposure Perturbs the Immune Microenvironment in Alzheimer's Disease: Insights from Network Toxicology and Single-Cell Transcriptomics
2026-Oct-02, Journal of molecular neuroscience : MN IF:2.8Q2
研究论文 该研究整合网络毒理学、批量转录组学、机器学习、免疫去卷积、单核转录组学、ceRNA分析、分子对接及100纳秒分子动力学模拟,探究双酚A暴露与阿尔茨海默病之间的潜在分子联系 整合了网络毒理学、批量转录组学、机器学习、免疫去卷积、单核转录组学、ceRNA分析、分子对接和分子动力学模拟等多种方法,系统性地揭示BPA暴露与AD之间的潜在分子关联,并识别出GSK3B、BCL2、EGFR、APP和PPARD五个候选基因特征 模型在验证队列中表现显著下降,提示泛化能力有限且可能存在过拟合;LM22参考矩阵不能直接代表脑内驻留免疫细胞群,免疫分析结果需谨慎解读;研究主要基于计算预测,属于假设生成性研究,需要实验研究来确立因果关系和机制 探究双酚A暴露与阿尔茨海默病之间的潜在分子联系及其对免疫微环境的影响 双酚A暴露相关的阿尔茨海默病分子靶点和免疫微环境 机器学习 阿尔茨海默病 网络毒理学, 批量转录组学, 机器学习, 免疫去卷积, 单核转录组学, ceRNA分析, 分子对接, 分子动力学模拟 机器学习 基因表达数据, 图像 NA NA 单核转录组学, 批量转录组学 NA NA
37 2026-10-04
Once yearly cell-based therapy for sustained and dose-tunable delivery of monoclonal antibodies
2026-Oct-02, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本研究开发了一种免疫调节性封装细胞类'生物制剂工厂'平台,可在体内持续原位生产单克隆抗体,通过一次给药实现长达一年的持续且剂量可调的抗体递送 首次开发出免疫调节性封装细胞平台,克服了单克隆抗体不稳定性、免疫原性和纤维化异物反应等既往方法的局限;通过筛选化学修饰藻酸盐生物材料,实现了HIV中和抗体3BNC117血清滴度稳定维持1年;可从同种异体细胞底盘生产13种不同单克隆抗体;整合至可回收宏装置实现按需终止治疗和剂量比例调整 摘要未明确提及研究局限性,但可能需要进一步的大规模临床试验验证其长期安全性和有效性 开发一种可临床转化的细胞递送平台,以单次给药替代频繁注射,实现治疗性单克隆抗体的持续、剂量可调递送 免疫功能正常小鼠、非人灵长类动物;使用的单克隆抗体包括3BNC117、ipilimumab、pembrolizumab、adalimumab和PGT121等13种 数字病理学, 机器学习 肺癌, 心血管疾病, 自身免疫性疾病 单细胞RNA测序 NA 文本, 图像 免疫功能正常小鼠和非人灵长类动物(具体数量未在摘要中说明) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于分析局部免疫微环境
38 2026-10-04
Multi-omics-driven personalized management of advanced HCC
2026-Oct-02, Cell reports. Medicine
研究论文 该研究通过多组学分析揭示了晚期肝细胞癌(HCC)联合治疗响应机制,并构建了预测模型以实现个性化管理 结合空间蛋白质组学、空间转录组学、单细胞RNA测序和批量转录组学进行多组学综合分析,揭示了cGAS-STING激活在免疫抑制性上皮细胞中对治疗响应的影响,并基于此提出三联疗法(cGAS激活+免疫检查点阻断+抗纤维化)及个性化预测模型 摘要中未明确提及样本量及验证队列的规模,预测模型的临床适用性仍需进一步验证 利用多组学方法解析晚期肝细胞癌对TACE联合免疫检查点阻断的治疗响应机制,并开发个性化治疗策略 接受经动脉化疗栓塞(TACE)联合免疫检查点阻断(ICB)治疗的前瞻性临床试验中的肝细胞癌患者的肿瘤样本 数字病理学 肝癌 空间蛋白质组学、空间转录组学、单细胞RNA测序、批量转录组学 组稀疏学习算法 图像、文本 NA NA single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics, spatial proteomics, bulk RNA-seq NA NA
39 2026-10-04
Systematic transcriptomic evaluation of blastoid models of early human development
2026-Oct-02, Cell systems IF:9.0Q1
研究论文 该研究通过整合并整理多时间点人类囊胚的单细胞转录组数据,建立了一个参考图谱,用于系统评估不同胚状体模型在细胞身份和谱系分化方面与人类囊胚的保真度 建立了人类囊胚细胞身份和谱系分化的参考图谱,并首次系统性地评估了不同来源和协议生成的胚状体模型的细胞谱系覆盖度、真实性和分化进程 摘要中未明确提及研究的局限性 评估胚状体模型模拟人类囊胚的保真度,为优化高保真胚状体生成协议提供基准 人类囊胚及干细胞来源的胚状体模型 单细胞转录组学、发育生物学 NA 单细胞转录组测序 NA 单细胞转录组数据 多个培养时间点的离体人类囊胚及多种胚状体模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
40 2026-10-04
Integrated transcriptomic and deep learning analyses define acRG signature for prognosis and therapeutic options in osteosarcoma
2026-Oct-02, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
研究论文 该研究整合单细胞RNA测序与深度学习分析,构建了骨肉瘤ac4C相关基因预后特征acRGBS,并验证了S100A13作为治疗靶点的潜力 首次整合单细胞RNA测序与机器学习框架构建骨肉瘤ac4C相关六基因预后特征acRGBS,并揭示S100A13通过调控线粒体钙稳态驱动肿瘤进展的新机制 摘要中未明确提及研究局限性 构建骨肉瘤ac4C相关基因预后特征并探索潜在治疗靶点 骨肉瘤患者样本及骨肉瘤细胞系 机器学习 骨肉瘤 单细胞RNA测序 深度学习 基因表达数据 多个独立队列(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
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