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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
21 2026-05-01
Semi-parametric empirical bayes method for multiplet detection in snATAC-seq with probabilistic multi-omic integration
2026-Apr-29, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 提出一种半参数经验贝叶斯方法SEBULA,用于snATAC-seq数据中的多细胞体检测,并集成多组学证据 直接利用片段级信息建模单细胞背景,避免合成双细胞体依赖,实现错误发现率控制;扩展为多模态证据整合框架 未明确说明局限性 提高snATAC-seq数据中多细胞体检测的敏感性和特异性 snATAC-seq数据中的多细胞体 机器学习 NA snATAC-seq 半参数经验贝叶斯模型 单细胞染色质可及性数据 七个多模态数据集 NA 单细胞ATAC-seq、多组学联合分析 NA NA
22 2026-05-01
Spatial-aware detection of copy number alterations from spatial transcriptomics using SpaCNA
2026-Apr-29, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 提出SpaCNA框架,整合空间转录组学多模态信息,实现肿瘤拷贝数变异的高精度检测 首次将隐马尔可夫随机场模型与空间连续性及形态学特征结合,实现空间转录组数据中CNAs的稳健检测,并扩展到3D空间连续切片的重建 未提及计算资源需求或对低质量数据的适应性等局限性 开发空间转录组数据中拷贝数变异检测的计算方法 模拟数据及多种真实癌症数据集(乳腺癌、结直肠癌、头颈鳞癌) 计算生物学 乳腺癌, 结直肠癌, 头颈鳞状细胞癌 空间转录组学 隐马尔可夫随机场 空间转录组数据 模拟数据及多种癌症数据集 NA 空间转录组学 NA NA
23 2026-05-01
RUNX2 drives adenoma-to-carcinoma transition in colon cancer
2026-Apr-29, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序等技术揭示RUNX2驱动结肠腺瘤向腺癌转变的关键机制 首次发现RUNX2通过CD8耗竭T细胞-TNF-α-TNFRSF1A通路驱动结肠腺瘤向腺癌转变,并验证了其特异性抑制剂CADD522的抑制作用 未明确说明实验样本量及临床转化验证的局限性 阐明结肠腺瘤向腺癌转变的分子机制 结肠腺瘤和腺癌组织中的CD8耗竭T细胞和上皮细胞 机器学 结肠癌 单细胞RNA测序 九基因风险评分模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
24 2026-05-01
Clec3b⁺ fibroblasts are the primary effectors of portal fibrosis following activation via a KLF4/periostin axis
2026-Apr-29, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序和遗传谱系追踪,鉴定Clec3b⁺成纤维细胞为门脉纤维化的主要效应细胞,并揭示KLF4/Periostin轴调控其活化 首次明确Clec3b⁺成纤维细胞是胆道损伤后门脉纤维化的主要效应细胞,并发现KLF4/Periostin信号轴是调控其活化的关键机制 研究主要基于小鼠模型,可能不完全代表人类疾病,且未涉及其他慢性肝病中的门脉纤维化机制 探究胆道疾病中门脉纤维化的细胞和分子机制,特别是寻找关键效应细胞和调控通路 小鼠模型中的门脉成纤维细胞,特别是Clec3b⁺成纤维细胞亚群 数字病理学 胆道疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠模型样本,具体数量文中未提及 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于小鼠门脉成纤维细胞分析
25 2026-05-01
CXCL5 is associated with neutrophil-driven intestinal inflammation and IL-17-associated epithelial signaling in inflammatory bowel disease
2026-Apr-29, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 探究CXCL5在炎症性肠病中的功能,重点关注其与IL-17信号通路的相互作用及中性粒细胞驱动的肠道炎症机制 首次揭示CXCL5在肠上皮细胞中的特异性表达及其与IL-17协同调控中性粒细胞趋化的阶段依赖性作用,提出CXCL5/IL-17轴作为IBD潜在治疗靶点 慢性结肠炎模型中CXCL5缺失未显著改变疾病严重程度,需要进一步机制研究阐明其阶段特异性作用的分子基础 阐明CXCL5在炎症性肠病发病机制中的作用及其与IL-17信号通路的交互关系 IBD患者结肠组织样本、公开单细胞RNA测序数据、急性及慢性小鼠结肠炎模型、人肠上皮细胞 数字病理学 炎症性肠病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 IBD患者结肠组织样本及公开单细胞测序数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
26 2026-05-01
GPR124 regulates hyaloid blood vessel regression and is associated with endothelial-mesenchymal transition
2026-Apr-29, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究鉴定GPR124作为透明血管退化的关键调节因子,并发现其与内皮-间质转化相关 首次发现GPR124在透明血管退化中的特异性作用,并揭示其通过WNT/β-catenin信号和内皮-间质转化促进血管重塑 具体下游机制和GPR124在透明血管退化中的完整信号通路尚未完全阐明 探究GPR124在哺乳动物眼睛发育中调节透明血管退化的作用机制 透明血管内皮细胞和视网膜血管 机器学习 眼部发育疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 内皮特异性、他莫昔芬诱导的Gpr124敲除小鼠模型 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 单细胞RNA测序用于透明血管内皮细胞的转录组分析
27 2026-05-01
scDecorr: feature decorrelation based representation learning enables self-supervised alignment of multiple single-cell experiments
2026-Apr-29, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 提出scDecorr框架,利用特征解耦自监督学习实现单细胞RNA测序数据的稳健表示学习与整合 首次将特征解耦自监督学习应用于单细胞RNA测序数据整合,无需细胞类型注释即可高效降维并消除技术噪音 未明确讨论方法在极端稀疏数据或超大规模数据集上的计算效率与可扩展性 开发能够整合多样本单细胞RNA测序数据并保留生物变异性的自监督学习框架 单细胞RNA测序数据中的细胞嵌入表示与批次效应消除 机器学习 NA 单细胞RNA测序 自监督学习框架 单细胞基因表达数据 多种单细胞数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
28 2026-05-01
Spatial transcriptomic mapping of canine osteosarcoma reveals immune microenvironment features linked to survival
2026-Apr-29, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 利用空间转录组技术绘制犬骨肉瘤的免疫微环境图谱,揭示与生存相关的特征 首次使用10x Genomics Visium平台对犬骨肉瘤进行空间转录组分析,结合单细胞数据解卷积,识别与生存相关的免疫细胞空间共定位模式 样本量较小(11只犬的14个肿瘤样本),未提及技术重复或批次效应校正 探究犬骨肉瘤肿瘤内异质性和肿瘤微环境的空间特征,识别与生存相关的免疫微环境特征 11只犬的14个骨肉瘤肿瘤样本(包括原发、转移和复发肿瘤),按生存结果分层 数字病理学 骨肉瘤 空间转录组学 NA 空间基因表达数据 11只犬的14个肿瘤样本,共18,834个组织斑点 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Genomics Visium平台用于新鲜冷冻犬骨肉瘤组织切片的空间基因表达分析
29 2026-05-01
Spatial atlas of diabetic kidney disease reveals a B cell-rich subgroup
2026-Apr-29, Nature IF:50.5Q1
研究论文 利用Xenium和CosMx单细胞空间转录组学技术,结合单核RNA测序,构建糖尿病肾病空间图谱,揭示富含B细胞的亚型 首次通过跨平台空间转录组学构建可计算的肾脏组织架构,将组织微环境与预后、非侵入性检测及患者分层联系起来;发现了以B细胞为主的第三淋巴结构样免疫微环境,定义了独特的糖尿病肾病亚型 NA 探究糖尿病肾病的组织微环境异质性,识别可预测疾病进展的亚型及生物标志物 糖尿病肾病患者的肾脏组织样本 数字病理学 糖尿病肾病 单细胞空间转录组学(Xenium、CosMx)、单核RNA测序 NA 空间转录组数据、单核RNA测序数据 NA 10x Genomics, NanoString 单细胞空间转录组学, 单核RNA测序 Xenium, CosMx Xenium和CosMx单细胞空间转录组平台
30 2026-05-01
Single-cell transcriptomics reveals ADRB1 as a key immune checkpoint regulating T cell exhaustion in lung cancer and its prognostic value in lung cancer
2026-Apr-29, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 通过单细胞转录组学揭示ADRB1作为肺癌中调节T细胞耗竭的关键免疫检查点及其预后价值 首次描述ADRB1作为参与肺癌T细胞耗竭的新型免疫检查点,并证明ADRB1+ T细胞为潜在生物标志物和治疗靶点 功能研究和临床试验仍需进行以验证该新概念在治疗策略中的可行性 研究ADRB1在肺癌T细胞耗竭中的作用及其预后价值 肺腺癌和肺鳞癌患者的肿瘤及癌旁组织 自然语言处理 肺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据,TCGA批量RNA-seq数据 未明确样本数量,涉及LUAD和LUSC患者的肿瘤及癌旁组织 NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
31 2026-05-01
Integrated Genomic and Single-Cell Analysis Identifies Notch1 as a Metastasis Suppressor in Nasopharyngeal Carcinoma Targeted by the AKT/Smad3 Axis
2026-Apr-29, Biological procedures online IF:3.7Q1
研究论文 本研究系统探讨Notch1作为鼻咽癌转移抑制因子的功能及其通过AKT/Smad3轴调控上皮间质转化和转移的分子机制 首次通过整合基因组与单细胞分析揭示Notch1经AKT/Smad3轴抑制鼻咽癌转移的新型分子机制,并基于Notch1相关基因建立三种分子亚型(C1、C2、C3)用于预后分层 未明确提及具体局限性,但部分分析基于公共数据库(TCGA/GEO)及小样本临床验证,需进一步扩大样本验证 阐明Notch1在鼻咽癌侵袭转移中的抑癌功能及其分子机制 鼻咽癌临床组织样本、细胞系及裸鼠模型 机器学习和数字病理 鼻咽癌 免疫组化、单细胞RNA测序、TCGA/GEO数据整合分析、Western blot、co-IP、体内外功能实验 共识聚类、分子分型(C1/C2/C3) 基因表达数据、单细胞转录组数据、临床组织微阵列数据 鼻咽癌组织微阵列(样本数未明确)、单细胞RNA测序临床样本(数量未明确)、多个细胞系及裸鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
32 2026-05-01
Therapeutic effects of mesenchymal stem cell-derived extracellular vesicles from different tissue sources on diminished ovarian reserve and the related mechanisms
2026-Apr-29, Journal of nanobiotechnology IF:10.6Q1
研究论文 该论文比较了脂肪组织和脐带来源的间充质干细胞外泌体对环磷酰胺诱导的卵巢储备功能减退小鼠模型的治疗作用及机制 首次系统比较不同组织来源的间充质干细胞外泌体在卵巢储备功能减退治疗中的效果差异,并揭示脐带来源外泌体具有更广泛调控作用 研究对象为小鼠模型,缺乏临床样本验证;外泌体长期疗效和安全性需进一步评估 探讨不同组织来源的间充质干细胞外泌体对卵巢储备功能减退的治疗效果及机制 环磷酰胺诱导的卵巢储备功能减退小鼠模型 数字病理学 生殖疾病 蛋白质组学分析、单细胞RNA测序 NA 测序数据 环磷酰胺诱导的卵巢储备功能减退小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
33 2026-05-01
Integrated bioinformatics analysis of the shared molecular mechanisms between Parkinson's disease and COVID-19
2026-Apr-28, mSphere IF:3.7Q2
研究论文 通过整合生物信息学分析和单细胞RNA测序,探讨帕金森病与COVID-19之间的共享分子机制 首次利用单细胞RNA测序揭示CHI3L1在星形胶质细胞中的表达增加是连接COVID-19与帕金森病的关键分子机制,并发现星形胶质细胞通过多种信号分子与神经细胞活跃通讯 研究基于公开数据库,样本量有限,且缺乏进一步的实验验证 揭示帕金森病与COVID-19共享的分子机制,为治疗靶点提供新见解 帕金森病和COVID-19患者的基因表达数据及脑组织单细胞RNA测序数据 生物信息学 帕金森病,新冠肺炎 批量RNA测序,单细胞RNA测序 差异表达分析,蛋白质-蛋白质相互作用网络,细胞通讯分析 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 公开数据库中COVID-19和帕金森病患者的样本 不适用 批量RNA测序,单细胞RNA测序 不适用 不适用
34 2026-05-01
Enhancer-directed gene delivery for digit regeneration based on conserved epidermal factors
2026-Apr-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 基于保守表皮因子的增强子导向基因递送平台促进小鼠指尖再生 利用多物种(斑马鱼、蝾螈、小鼠)再生能力对比,鉴定SP转录因子家族为保守表皮再生因子,并通过增强子导向的AAV载体实现时空特异性FGF8表达,部分挽救小鼠指尖再生缺陷 未提及在人体的验证有效性及长期安全性评估 开发基于保守再生因子的基因疗法促进哺乳动物肢体再生 小鼠指尖再生模型、斑马鱼尾鳍再生、蝾螈肢体再生 机器学习和数字病理 肢体缺失 单细胞RNA测序、AAV基因递送、条件性敲除 NA 单细胞转录组数据 小鼠(数量未明确)、斑马鱼(数量未明确)、蝾螈(数量未明确) 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 用于斑马鱼尾鳍再生组织的单细胞转录组测序
35 2026-05-01
The intestinal microbiota impacts nutritional immunity and resistance to Acinetobacter baumannii pneumonia
2026-Apr-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究揭示肠道微生物群通过影响营养免疫调控宿主对鲍曼不动杆菌肺炎的抵抗力 首次阐明抗生素导致肠道菌群紊乱通过削弱吞噬细胞介导的营养免疫功能(脂质运载蛋白-2和钙卫蛋白通路)增加鲍曼不动杆菌肺炎易感性的因果机制 未明确说明,但研究主要基于小鼠模型,需在临床人群中进一步验证 探究抗生素治疗如何通过肠道菌群失调影响鲍曼不动杆菌肺炎的易感性及潜在机制 住院患者队列与小鼠模型 微生物组学 肺炎 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 住院患者队列(具体数量未提供)及小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
36 2026-05-01
Targeting GPR34 in damage-associated macrophages enhances anti-tumor immunity and the efficacy of Surufatinib in pancreatic cancer
2026-Apr-28, Signal transduction and targeted therapy IF:40.8Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序识别出高表达GPR34的损伤相关巨噬细胞亚群,并证明靶向GPR34可增强胰腺癌抗肿瘤免疫和索凡替尼疗效 首次在胰腺癌中发现GPR34+损伤相关巨噬细胞亚群,揭示其通过释放LysoPS促进CXCL16分泌和胞葬作用导致CD8 T细胞耗竭的机制 研究主要基于小鼠模型和体外共培养,尚需进一步的临床试验验证 探究靶向GPR34在胰腺癌免疫治疗中的潜在价值 胰腺导管腺癌患者标本、Gpr34小鼠模型及体外共培养体系 机器学习 胰腺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 接受索凡替尼联合化疗的患者标本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
37 2026-05-01
The emergence of neurogenic lineage motifs in building the vertebrate retina
2026-Apr-28, Current opinion in genetics & development IF:3.7Q2
综述 该综述综合了分子和谱系逻辑,探讨脊椎动物视网膜单个祖细胞池如何产生神经元的多样性 发现并强调了神经源性谱系基序——跨物种的神经源性视网膜祖细胞可重复的神经元输出,揭示了兄弟细胞命运协调的基本约束,并作为理解细胞类型特化的基本单元 主要基于现有单细胞测序研究的整合,可能受限于不同研究间的技术差异和样本覆盖度 解析视网膜神经元多样性产生的分子和谱系逻辑 脊椎动物视网膜祖细胞及其产生的神经元类型 机器学习 NA 单细胞测序 NA 单细胞转录组和表观遗传数据 多发育阶段的多种脊椎动物视网膜样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
38 2026-05-01
Endothelial-perivascular mural partitioning and multicellular signaling in injury-associated corneal neovascularization
2026-Apr-28, Experimental eye research IF:3.0Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析创伤性角膜新生血管中内皮细胞与血管周围壁细胞的分布及多细胞信号通路 首次利用单细胞RNA测序揭示创伤性角膜新生血管中内皮细胞和血管周围壁细胞两种主要血管状态,并系统分析其与周围细胞群体的配体-受体信号交互 仅使用兔子模型,缺乏人体数据验证;样本量未明确;算法依赖标准化表达和表达细胞比例,可能存在偏差 表征创伤性角膜新生血管的血管异质性和细胞间信号传导机制 兔创伤角膜(碱烧伤后2周)与正常角膜的血管细胞 数字病理学 角膜新生血管 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 2组兔角膜(创伤组和对照组),具体数量未说明 NA 单细胞RNA测序 NA Seurat软件用于血管聚类和信号分析
39 2026-05-01
Integrative multi-omics analysis identifies key ubiquitination regulators in prostate cancer
2026-Apr-28, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 整合多组学分析鉴定前列腺癌中关键泛素化调控因子及其功能验证 首次结合单细胞RNA测序、全基因组关联研究总结数据与孟德尔随机化分析,系统筛选前列腺癌中因果关联的泛素化相关基因,并通过多层面实验验证TRIM8的肿瘤抑制功能 未提及具体研究局限性 鉴定前列腺癌中与泛素化过程相关的关键基因,并在多生物层面验证其作用 前列腺癌患者组织样本、前列腺癌细胞系22Rv1、LNCaP、PC-3及正常前列腺上皮细胞系RWPE-1 数字病理学 前列腺癌 单细胞RNA测序、全基因组关联研究、免疫组化、蛋白质印迹、定量PCR、分子对接 NA 基因表达数据、组织样本、细胞系数据 30个前列腺癌组织样本(按Gleason分级分层),4种细胞系 NA 单细胞RNA测序 NA NA
40 2026-05-01
Retraction notice to "Gene expression profile of human placental villous pericytes in the first trimester -an analysis by single-cell RNA sequencing" [Reprod. Biol. 24 (2024) 100919]
2026-04-28, Reproductive biology IF:2.5Q3
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
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