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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
21 2026-04-25
Semaphorin 3C/Plexin D1 Interaction Regulates Collagen Metabolism in Keloid Fibroblasts via the Transforming Growth Factor-β1 Signaling Pathway
2026-May, The American journal of pathology
研究论文 通过单细胞RNA测序和实验验证,揭示SEMA3C/PLXND1通路通过TGF-β1信号调控瘢痕疙瘩成纤维细胞胶原代谢 首次证明SEMA3C/PLXND1轴通过激活TGF-β1驱动瘢痕疙瘩纤维化,促进细胞外基质沉积,为瘢痕疙瘩治疗提供新靶点 未提及明显局限性 探究SEMA3C/PLXND1通路在瘢痕疙瘩发病机制中的作用 瘢痕疙瘩成纤维细胞 机器学习 瘢痕疙瘩 scRNA-seq, 转录组测序, RT-qPCR, Western blot, 免疫荧光 NA 基因表达数据 8个瘢痕疙瘩和8个正常皮肤样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
22 2026-04-25
Single-cell and spatial transcriptomics identify PGK1-sensitized hypoxia macrophages as a therapeutic target to overcome PDT resistance in glioma
2026-May, Journal of photochemistry and photobiology. B, Biology
研究论文 通过单细胞和空间转录组学鉴定PGK1致敏的缺氧肿瘤相关巨噬细胞,并揭示其在胶质瘤光动力疗法抵抗中的关键作用 首次结合单细胞和空间转录组学技术,在配对的人胶质瘤样本中系统解析缺氧肿瘤相关巨噬细胞的代谢重编程机制,并发现PGK1-PDHK1磷酸化与SPP1-CD44旁分泌轴共同驱动光动力疗法抵抗 研究主要基于体外功能实验和原位小鼠模型,仍需在更大临床队列中验证靶向PGK1或SPP1的治疗潜力 阐明缺氧肿瘤相关巨噬细胞在胶质瘤光动力疗法抵抗中的作用机制,并探索新的治疗靶点 人胶质瘤配对样本(治疗前与复发后),以及原位小鼠模型 数字病理学 胶质瘤 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫共沉淀, 原位小鼠模型 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 配对的人胶质瘤样本(治疗前与复发后) 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium FFPE
23 2026-04-25
[Half a century of gene expression analysis : The path to modern spatial transcriptomics in autopsy tissue]
2026-May, Pathologie (Heidelberg, Germany)
综述 回顾基因表达分析五十年发展,重点介绍现代空间转录组学在尸检组织中的应用并评估当前平台 首次系统评估Visium HD、GeoMx、CosMx和Xenium等平台在FFPE和尸检组织中的分辨率、适用性和挑战 RNA质量对FFPE和尸检样本分析可靠性构成关键制约因素 呈现基因表达分析的方法学发展并评估当前空间转录组学平台 FFPE组织和尸检组织样本 数字病理学 NA 空间转录组学 NA 图像 NA 10x Genomics, NanoString, 华大智造 空间转录组学 Visium HD, GeoMx, CosMx, Xenium Visium HD用于FFPE组织分析,GeoMx和CosMx用于空间转录组学分析,Xenium用于亚细胞分辨率基因表达分析
24 2026-04-25
The intestinal microbiota impacts nutritional immunity and resistance to Acinetobacter baumannii pneumonia
2026-Apr-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究探讨肠道微生物群如何影响营养免疫及对鲍曼不动杆菌肺炎的抵抗力 首次揭示抗生素治疗通过破坏肠道微生物群,进而削弱吞噬细胞介导的营养免疫(如脂质运载蛋白2和钙卫蛋白),增加鲍曼不动杆菌肺炎易感性的因果机制 未提及明显局限性 阐明抗生素治疗后肠道微生物群失调与鲍曼不动杆菌肺炎易感性增加之间的分子机制 医院患者队列和抗生素处理小鼠模型 机器学习 肺炎 单细胞RNA测序 基因表达数据 医院患者队列(具体样本量未指定)和小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
25 2026-04-25
Patterns of mitochondrial ATP predict tissue folding
2026-Apr-24, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 研究发现线粒体ATP模式可预测组织折叠 首次揭示化学能以空间模式驱动组织折叠,并通过多物种实验验证线粒体富集与ATP增加对组织折叠的预测能力 NA 探索胚胎发育中组织形状构建的化学能量模式及其调控机制 果蝇、鸡和小鼠胚胎中的上皮细胞 计算生物学 NA 时间延时成像、空间转录组学、氧消耗速率测量 计算预测模型 时间序列图像、空间转录组数据、代谢率数据 果蝇、鸡和小鼠胚胎样本 NA 空间转录组学 NA NA
26 2026-04-25
High altitude-mediated immune remodeling accelerates aging
2026-Apr-24, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 通过多组学分析揭示高原环境诱导的免疫重塑加速衰老进程的机制 首次结合人类群体数据和模拟高原缺氧的小鼠模型,利用单细胞RNA测序和空间增强分辨率组学测序,系统描绘高原免疫重塑特征,并发现其与加速肠道衰老的关联 研究主要基于高海拔人群和小鼠模型,可能无法完全反映其他海拔环境或长期暴露的影响 探究高海拔介导的免疫重塑如何加速衰老轨迹 青藏高原海拔3656米(拉萨)和5070米(推瓦村)的居民,以及模拟5000米缺氧条件下的小鼠 免疫学与衰老研究 高原相关病理生理过程 单细胞RNA测序、空间增强分辨率组学测序(Stereo-seq) NA 单细胞基因表达数据、空间转录组数据 高海拔人群队列(具体样本量未说明)和小鼠模型 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, Stereo-seq 10x Chromium单细胞3'测序, Stereo-seq空间转录组学
27 2026-04-25
MMP9 in macrophages: A pivotal biomarker associated with immune dysregulation in interstitial cystitis/bladder pain syndrome
2026-Apr-24, Urologia
研究论文 本研究整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,揭示MMP9在巨噬细胞中作为间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征的关键生物标志物,并与免疫失调相关 首次通过整合单细胞与批量转录组数据,明确MMP9在IC/BPS巨噬细胞中高表达并增强吞噬活性,筛选出潜在的靶向药物 未提及具体局限性,但可能包括样本量有限、缺乏功能验证实验等 探索间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征中关键的免疫靶点和生物标志物 IC/BPS患者来源的单细胞和批量RNA测序数据 机器学习 间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 二元分类机器学习模型(14种算法) 基因表达数据 未明确说明样本数量(涉及GSE164557等数据集) NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
28 2026-04-25
Distinct fibrosis-associated macrophage subsets coordinate iron metabolism in pulmonary fibrosis
2026-Apr-24, International immunology IF:4.8Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序分析间质性肺病患者的支气管肺泡灌洗液,发现与纤维化相关的巨噬细胞亚群通过协调铁代谢促进肺纤维化进展 鉴定了SPP1和APOE表达的共同存在的巨噬细胞群体,并进一步细分为SLC40A1+和HAMP+两个亚群,揭示了它们通过铁代谢调控成纤维细胞向肌成纤维细胞转化的新机制 研究基于样本量有限的临床数据,体外机制验证可能需更深入的动物模型在体验证 阐明肺纤维化中巨噬细胞与成纤维细胞相互作用的分子机制 间质性肺疾病患者的支气管肺泡灌洗液细胞及肺组织 单细胞组学 间质性肺疾病、特发性肺纤维化、进行性肺纤维化 单细胞RNA测序、转录组分析、组织学分析 NA 单细胞转录组数据、组织切片图像 间质性肺疾病患者的支气管肺泡灌洗液样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒进行单细胞RNA测序
29 2026-04-25
The dual molecular identity of vestibular kinocilia bridges structural and functional traits of primary and motile cilia
2026-Apr-24, eLife IF:6.4Q1
研究论文 揭示前庭动纤毛具有原发纤毛和运动纤毛双重分子特性,并存在自发性运动 首次通过单细胞RNA测序发现前庭毛细胞中动纤毛同时表达原发纤毛和运动纤毛相关基因,并利用活体成像观察到其自发性运动,提出动纤毛作为毛束内主动力产生元件的新功能 未在标题和摘要中明确提及局限性 阐明前庭动纤毛的结构、分子组成和功能特性 成年前庭和耳蜗毛细胞、斑马鱼及人类前庭毛细胞、牛蛙和小鼠壶腹嵴毛细胞 分子生物学 NA 单细胞RNA测序、免疫染色、活体成像 NA 基因表达数据、图像 成年小鼠前庭和耳蜗毛细胞(具体数量未报道),斑马鱼和人类前庭毛细胞(来源数据),牛蛙和小鼠壶腹嵴毛细胞(活体成像) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium 单细胞3'测序
30 2026-04-25
NMB+ CXCL13+ CD4+ T cells -derived neuromedin-B promotes neuropeptide S receptor 1 positive malignant cells senescence and malignancy
2026-Apr-24, Cancer immunology research IF:8.1Q1
研究论文 通过整合单细胞RNA测序数据和实验验证,发现NMB+ CXCL13+ CD4+ T细胞通过NMB-NPSR1轴促进结直肠癌肝转移中肿瘤细胞的衰老-恶性转化 首次鉴定出促转移的NMB⁺CXCL13⁺CD4⁺ T细胞亚群,并揭示其通过NMB-NPSR1轴调控肿瘤细胞“衰老-恶性转变”的新机制 作为概念验证研究,需在更大样本和临床环境中进一步验证NPSR1抑制剂SHA68联合抗PD1的疗效 阐明CXCL13+ CD4+ T细胞亚群在结直肠癌肝转移中的功能异质性及其调控肿瘤转移的机制 NMB+ CXCL13+ CD4+ T细胞和NPSR1+ 恶性细胞 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 结直肠癌临床样本及泛癌数据集 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3' 测序平台
31 2026-04-25
Fibrotic differentiation profile of skeletal and cardiac muscle fibroadipogenic progenitors in D2-mdx mouse
2026-Apr-24, Journal of neuromuscular diseases IF:3.2Q2
研究论文 通过双报告基因小鼠模型研究D2-mdx小鼠骨骼肌和心肌纤维脂肪生成祖细胞的纤维化分化特征 首次利用双报告基因小鼠(PRURD2)揭示纤维脂肪生成祖细胞(FAPs)在杜氏肌营养不良症(DMD)中纤维化的动态和谱系分化机制,并通过单细胞RNA测序鉴定出与纤维化相关的CD55簇 文章未提供具体局限性信息,可能涉及小鼠模型与人类DMD的差异或样本量等问题 探究DMD中肌肉纤维化的病理机制,特别是FAPs的动态变化和谱系分化 D2-mdx小鼠的骨骼肌(膈肌和胫骨前肌)和心肌组织 数字病理学 杜氏肌营养不良症 单细胞RNA测序、流式细胞术(FACS)、组织学分析 NA 基因表达数据 12月龄PRURD2和对照PRURDBA小鼠的心肌、膈肌和胫骨前肌样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序用于FAPs亚群分析
32 2026-04-25
Perspectives on human adipose tissue: from cellular mechanisms to clinical complications
2026-Apr-24, Diabetologia IF:8.4Q1
综述 基于2025年Camillo Golgi奖讲座,综述了人类白色脂肪组织从细胞机制到临床并发症的研究进展,重点阐述了脂肪细胞更新、脂质周转、脂肪记忆和细胞异质性在肥胖相关疾病中的作用 利用碳定年与临床研究揭示了脂肪细胞持续更新及脂质周转受损导致体重增加与胰岛素抵抗的机制;发现肥胖诱导的持续性转录和结构改变即'脂肪记忆'解释了减重维持困难;通过空间转录组学鉴定出人类WAT中至少三种主要脂肪细胞状态,其胰岛素反应性和脂质处理能力存在差异 主要基于作者及其合作者的研究成果,可能未全面涵盖该领域所有重要工作;综述性质限制了对具体机制的深度实验验证 重新定义人类白色脂肪组织作为心血管代谢疾病的主动驱动者,并突出靶向脂肪细胞可塑性和免疫-代谢相互作用的治疗策略 人类白色脂肪组织 机器学习 肥胖, 2型糖尿病, 心血管疾病 空间转录组学 NA 转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
33 2026-04-25
Macrophage signaling associates with fibrogenic program activation in periductal fibroblasts in pediatric primary sclerosing cholangitis
2026-Apr-23, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 该研究通过整合空间转录组学、RNA测序和蛋白质组学,揭示了儿童原发性硬化性胆管炎(PSC)中巨噬细胞信号与导管周围成纤维细胞纤维化程序激活的关联 首次采用多组学方法(空间转录组、RNA-seq和蛋白质组学)全面描绘PSC纤维化导管区域的细胞间通讯,并鉴定出巨噬细胞亚群与肝星状细胞之间涉及17个纤维化驱动基因和6个效应基因的潜在相互作用 文中未明确提及该研究的具体局限性 阐明儿童原发性硬化性胆管炎中驱动导管周围纤维化的细胞间相互作用机制 儿童原发性硬化性胆管炎(PSC)患者的肝脏组织样本 数字化病理学 肝胆疾病 空间转录组学, RNA-seq, 蛋白质组学, 免疫荧光, 二次谐波成像 NA 组织切片图像, 转录组数据, 蛋白质组数据 包括PSC患者(早发性和已形成纤维化阶段)和健康对照者的肝脏活检样本,具体样本量文中未明确给出 NA 空间转录组学, 批量RNA测序, 蛋白质组学 NA NA
34 2026-04-25
Mechanical load inhibits cancer growth in mouse and human hearts
2026-Apr-23, Science (New York, N.Y.)
research paper 研究了机械负荷如何抑制小鼠和人类心脏中的癌症生长,揭示了机械力通过影响表观遗传机制保护心脏的机制 首次揭示了机械负荷通过减少组蛋白甲基化和染色质压缩来抑制心肌中癌细胞增殖的机制,并识别Nesprin-2为关键机械传感器 NA 探究机械负荷在心脏抗癌症中的作用及其分子机制 小鼠心脏和人类心脏转移瘤样本 NA 癌症 空间转录组学 NA 基因表达数据 小鼠和人类心脏转移瘤样本 NA 空间转录组学 NA NA
35 2026-04-25
Targeting PTDSS1 to modulate GSH synthesis triggers mitophagy and induces ferroptosis in esophageal squamous cell carcinoma cells
2026-Apr-23, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析,发现PTDSS1高表达恶性上皮亚群具有铁死亡和线粒体自噬抗性,揭示了PTDSS1通过调节GSH合成和线粒体自噬促进食管鳞癌细胞存活的机制 首次阐明PTDSS1通过调控GSH合成和线粒体自噬保护食管鳞癌细胞免于死亡的分子机制,包括TRIM21与SLC3A2相互作用及MFN2转位等新发现 NA 探究PTDSS1在食管鳞癌中的调控机制和治疗潜力 食管鳞癌细胞 癌症生物学 食管鳞癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
36 2026-04-25
Charting the transition from in vitro gliogenesis to the in vivo maturation of human glial progenitor cells transplanted into the hypomyelinated mouse brain
2026-Apr-23, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序和CUT&TAG技术,追踪人多能干细胞来源的胶质祖细胞在体外生成和体内分化过程中的分子特征 首次结合scRNA-seq、scATAC-seq和CUT&TAG技术,系统描绘了人胶质祖细胞从体外生成到体内成熟的全过程分子图谱,并揭示了宿主环境通过激活不同的基因调控网络促进细胞命运决定的机制 仅使用小鼠模型(shiverer小鼠),可能无法完全模拟人脑微环境;未评估移植细胞的长期功能整合和安全性 阐明人胶质祖细胞从体外生成到体内分化为星形胶质细胞和少突胶质细胞的分子调控机制 人多能干细胞来源的胶质祖细胞及其在体外和体内(小鼠脑内)的分化产物 数字病理学 髓鞘发育不良性疾病 scRNA-seq, scATAC-seq, CUT&TAG NA 单细胞基因表达数据,染色质可及性数据,组蛋白修饰数据 未明确提及具体样本数量,涉及体外培养细胞和移植后小鼠脑组织 10x Genomics 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序平台
37 2026-04-25
Mapping glioblastoma's isoform diversity using long-read single-cell analysis
2026-Apr-23, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 利用长读单细胞RNA测序技术构建胶质母细胞瘤的异构体图谱,揭示肿瘤特异性异构体及其作为潜在新抗原和治疗靶点的价值 首次应用单细胞长读RNA测序构建胶质母细胞瘤的异构体分辨率图谱,鉴定出大量未被注释的肿瘤特异性异构体,并提出基于肿瘤限制性异构体的双特异性靶向治疗策略 未提及具体的局限性,但可能包括样本量有限、长读测序技术成本高、验证实验不足等 解析胶质母细胞瘤中RNA剪接异构体的多样性及其在肿瘤异质性和治疗耐药中的作用 胶质母细胞瘤患者肿瘤组织中的细胞群体 生物信息学, 癌症基因组学 胶质母细胞瘤 单细胞长读RNA测序 NA RNA测序数据 来自7名胶质母细胞瘤患者的肿瘤样本 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞长读RNA测序
38 2026-04-25
Multiomics immune profiling of a patient-relevant orthotopic lung cancer model using SEPARATE-Seq
2026-Apr-23, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 利用SEPARATE-Seq技术对与患者相关的原位肺癌模型进行多组学免疫分析 开发了一种可注射的原位肺腺癌模型,结合SEPARATE-Seq和空间转录组学,实现了血管内和血管外免疫细胞的分离及空间定位分析 未提及 建立更贴近人类肺癌患者的临床前小鼠模型,并利用多组学方法全面解析其肿瘤免疫微环境 原位肺腺癌小鼠模型中的肿瘤及非肿瘤相邻组织中的免疫细胞 数字病理学 肺癌 SEPARATE-Seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 基因表达数据, 空间转录组数据 小鼠模型,具体样本数量未提及 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
39 2026-04-25
Type I interferon drives T cell responses to amyloid beta in the central nervous system
2026-Apr-23, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 利用单细胞转录组学揭示APP23转基因小鼠中枢神经系统淀粉样蛋白病理中T细胞免疫微环境的动态变化 首次发现CD8+ T细胞在淀粉样蛋白斑块周围聚集并表达干扰素刺激基因,通过I型干扰素信号和CXCL10-CXCR3轴介导T细胞招募,揭示了从小胶质细胞驱动到T细胞介导神经炎症的转变 主要在APP23转基因小鼠模型中进行研究,人类样本验证仅检测到类似I型干扰素反应,未深入分析人类T细胞亚群的具体功能 研究中枢神经系统淀粉样蛋白病理中适应性免疫系统的作用,特别是T细胞在神经炎症中的角色 APP23转基因小鼠和人类中枢神经系统淀粉样蛋白病理样本 单细胞转录组学 阿尔茨海默病、脑淀粉样血管病 单细胞转录组学 NA 单细胞转录组数据 APP23转基因小鼠(不同疾病阶段)和人类中枢神经系统样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
40 2026-04-25
Oocyte-specific acylglycerol kinase loss leads to infertility in mice via mitochondrial dysfunction
2026-Apr-23, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 通过卵母细胞特异性敲除AGK的小鼠模型,揭示AGK缺失导致线粒体功能障碍,进而引起不孕 首次在卵母细胞中揭示AGK通过维持线粒体功能调控卵泡发育及卵母细胞成熟,并识别AGK为女性不孕的潜在诊断标志物和治疗靶点 未在人类卵母细胞中验证AGK功能,且机制探索主要依赖转录组和代谢组学,缺乏更直接的蛋白互作或信号通路验证 探究AGK在卵母细胞发育及卵巢功能中的作用,并为女性不孕提供潜在生物标志物和治疗靶点 卵母细胞特异性敲除Agk的小鼠 机器学习 女性不孕 单细胞RNA测序、空间代谢组学 NA 基因表达数据、代谢物数据 卵母细胞特异性Agk敲除小鼠样本 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间代谢组学 10x Chromium 单细胞RNA测序使用10x Chromium平台,空间代谢组学未指定具体产品
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