单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 39345 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-05-12 |
Deciphering the immunological landscape of HR + metastatic breast cancer: insights from single-cell transcriptomics
2026-May-08, Human cell
IF:3.4Q3
DOI:10.1007/s13577-026-01384-2
PMID:42101520
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示激素受体阳性转移性乳腺癌的免疫微环境特征 | 首次专注于HR+乳腺癌卵巢转移的肿瘤微环境单细胞转录组分析，鉴定出与巨噬细胞功能相关的五个关键基因（GPR183、BHLHE41、CD83、SLC25A37和SELL） | 样本量较小，仅10例卵巢转移乳腺癌患者的临床样本用于体内验证 | 表征HR+乳腺癌肿瘤微环境，尤其是卵巢转移中的免疫细胞组成和关键基因 | HR+乳腺癌患者的原发肿瘤组织和配对的正常组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、免疫组化 | NA | 单细胞转录组数据、临床样本病理图像 | 10例HR+乳腺癌伴卵巢转移患者的原发肿瘤及配对正常组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 22 | 2026-05-12 |
Persistence of alveolar fibroblast-derived ADAMTS4+ cells in a preclinical model of delayed pulmonary fibrosis resolution
2026-May-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72419-3
PMID:42103706
|
研究论文 | 通过谱系追踪和单细胞转录组学方法，研究肺泡成纤维细胞来源的ADAMTS4+细胞在迟发性肺纤维化消退过程中的持续存在及其机制 | 首次发现脂成纤维细胞向肌成纤维细胞的可逆转换在纤维化消退中起关键作用，并鉴定ADAMTS4+细胞为延迟消退的潜在治疗靶点 | 主要基于小鼠模型，人类样本验证有限；结论可能受模型和样本量的影响 | 探究肺纤维化消退的机制，特别是脂成纤维细胞向肌成纤维细胞转化及其退行过程 | 老年小鼠的肺泡成纤维细胞和ADAMTS4+细胞，以及人类肺移植组织 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 谱系追踪、单细胞转录组学、组织学分析、外植模型 | 卷积神经网络 | 转录组数据、组织图像 | 老年小鼠（数量未明确）及人类肺移植组织样本 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 23 | 2026-05-12 |
A transcriptionally distinct population of human adipocytes with end-of-trajectory signature (hEOS) emerges during obesity to drive maladaptive inflammation
2026-May-08, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2026.108240
PMID:42107509
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学分析，发现肥胖期间出现一种具有终末轨迹特征的人脂肪细胞（hEOS），驱动适应不良性炎症 | 识别出一种疾病相关、空间组织化且保守的免疫代谢模块，揭示hEOS脂肪细胞与Mac3巨噬细胞形成共适应空间单元，并阐明HIF1A-LAMA4-ITGB1-NF-κB信号轴在肥胖炎症中的机制 | 尚未提及研究的局限性 | 阐明肥胖相关脂肪组织炎症中脂肪细胞与免疫细胞的病理互作机制，探索潜在治疗靶点 | 人类白色脂肪组织中的脂肪细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 肥胖 | 单核RNA测序、空间转录组学、批量RNA测序 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | 来自489名个体的247,406个细胞核 | 10x Genomics | 单核RNA测序、空间转录组学、批量RNA测序 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium 单核3'测序, 10x Visium 空间转录组学 |
| 24 | 2026-05-12 |
A stem and progenitor cell-derived gene expression signature is prognostic for survival in myelofibrosis
2026-May-07, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025030094
PMID:41481381
|
研究论文 | 通过分析骨髓纤维化患者的造血干祖细胞转录组特征，开发了一种24基因加权表达评分（MPN24），该评分能独立于现有风险分层模型预测患者总生存期 | 首次利用单细胞RNA测序数据指导构建基于bulk RNA-seq的预后模型，揭示了造血干祖细胞来源的基因表达特征在骨髓纤维化风险分层中的独立预后价值，并证明其能显著提升现有临床-基因组风险模型的预测能力 | 研究未明确MPN24评分在动态监测治疗反应或指导治疗决策中的应用价值，且样本均来自同一机构可能存在选择偏倚 | 探索造血干祖细胞转录组特征是否能改善骨髓纤维化的风险分层 | 骨髓纤维化患者的血液样本及Lin-CD34+造血干祖细胞 | 机器学习 | 骨髓纤维化 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, NanoString | 加权基因表达评分模型 | 基因表达数据 | 358例骨髓纤维化患者（训练+测试队列），两个独立验证队列共270例患者 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 25 | 2026-05-12 |
A D-dimer and ADAMTS8 based multi-marker score for the diagnosis of acute aortic dissection
2026-May-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-51121-w
PMID:42098242
|
研究论文 | 基于空间转录组学和蛋白验证，开发了包含D-二聚体与ADAMTS8的多标志物评分用于急性主动脉夹层诊断 | 首次结合空间转录组学筛选AAD相关基因并验证其编码蛋白，构建多标志物评分模型实现高诊断效能（AUC 0.921） | 样本量有限（302例参与者），多标志物评分的临床推广需更大规模验证 | 寻找优化急性主动脉夹层诊断的生物标志物 | 急性主动脉夹层患者及对照人群的血浆样本与主动脉组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据、蛋白表达数据、临床参数 | 302名参与者（173例AAD患者，129例对照） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 26 | 2026-05-12 |
Hopx(+) optic nerve head-astrocytes counter neuronal stress and glaucoma damage
2026-May-05, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2515277123
PMID:42044330
|
研究论文 | 该研究发现视神经头内的Hopx阳性星形胶质细胞通过分泌细胞外囊泡增强视网膜神经节细胞存活，并在青光眼模型中发挥保护作用，其丢失与年龄相关视神经疾病有关 | 首次揭示Hopx阳性视神经头星形胶质细胞通过细胞外囊泡分泌因子与视网膜神经节细胞双向通讯，并证明其年龄相关丢失是视神经疾病的关键因素，提出替代视神经头相关因子的治疗范式转变 | 未提供明确的局限性说明，但可能包括动物模型与人类疾病的差异、细胞外囊泡临床应用转化复杂性等 | 探究视神经头星形胶质细胞在青光眼等视神经疾病中的作用机制及潜在治疗策略 | 年轻大鼠视神经头Hopx阳性星形胶质细胞及视网膜神经节细胞 | 机器学习 | 青光眼 | 单细胞RNA测序、细胞外囊泡蛋白质组学分析 | NA | 基因表达数据 | 大鼠模型，包括对照组和视神经挫伤组 | 10x Genomics, Broad Institute | 单细胞RNA测序, 细胞外囊泡蛋白质组学 | 10x Chromium, Broad Institute在线数据库 | 大鼠视神经头单细胞RNA测序与在线Broad研究所scRNA-seq数据库分析 |
| 27 | 2026-05-12 |
In Vitro Single-Cell Transcriptomic Profiling of Cultured Stem Cells From Apical Papilla and Dental Pulp Stem Cells: Unveiling Cellular Heterogeneity
2026-May-05, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2026.109577
PMID:42090950
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较培养的根尖乳头干细胞和牙髓干细胞的转录组图谱，揭示细胞异质性 | 首次在单细胞水平上对培养的根尖乳头干细胞和牙髓干细胞进行详细比较，鉴定出先前未描述的NOTCH3+/PDGFRB+前体样细胞亚群 | 基于培养细胞的转录组相似性构建的伪时间轨迹仅为假设生成模型，未经验证的谱系关系，需要功能性验证 | 通过单细胞RNA测序比较根尖乳头干细胞和牙髓干细胞的细胞组成，鉴定其差异性再生行为背后的细胞亚群和相关标志物 | 来自3名人类供体的根尖乳头干细胞和牙髓干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3名人类供体的根尖乳头干细胞和牙髓干细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |
| 28 | 2026-05-12 |
Viral orchitis and male infertility: A comprehensive review of pathogenic mechanisms and outcomes
2026-May-05, Journal of reproductive immunology
IF:2.9Q2
DOI:10.1016/j.jri.2026.104910
PMID:42107396
|
综述 | 全面综述病毒性睾丸炎导致男性不育的发病机制及最新治疗策略 | 系统整合病毒性睾丸炎从流行病学到分子机制的证据，并引入单细胞测序、多组学技术和睾丸类器官模型等新兴转化研究方法 | 当前抗病毒和抗炎药物疗效欠佳，且缺乏针对病毒介导睾丸损伤的特定治疗策略 | 阐明病毒性睾丸炎影响男性生育力的致病机理并展望未来干预方向 | 病毒性睾丸炎及相关男性不育的病理机制 | 自然语言处理 | 男性不育症 | 单细胞测序、多组学技术 | 睾丸类器官模型 | 文本 | 不适用 | 不适用 | 单细胞RNA测序, 多组学技术 | 不适用 | 不适用 |
| 29 | 2026-05-12 |
Benchmarking sketching methods on spatial transcriptomics data
2026-May-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag434
PMID:42109248
|
研究论文 | 系统评估了空间转录组学数据中多种采样方法的性能 | 首次系统性地对空间转录组学数据中的多种采样方法进行基准测试，并提出了结合空间信息的加权杠杆评分方法，以平衡转录组异质性和组织覆盖度 | 仅基于少量真实数据集和模拟进行验证，缺乏更大规模或更多样化的数据集检验；方法对空间权重矩阵的选择较为敏感，可能影响泛化能力 | 探讨不同采样方法对空间转录组学分析的影响，并寻找能兼顾转录组异质性和组织空间覆盖度的最优采样策略 | 空间转录组学数据集，包括小鼠卵巢、MERFISH脑组织、人类乳腺癌和肺组织样本 | 空间转录组学，生物信息学 | 乳腺癌，肺癌 | 空间转录组学 | 无（基于随机奇异值分解和空间权重矩阵的采样方法） | 空间中配准的表达数据 | 多个数据集：小鼠卵巢、MERFISH脑组织、人类乳腺癌、肺组织，及模拟数据 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 30 | 2026-05-12 |
InSituPREP enables 3D single-cell mapping of interaction-associated gene programs in the breast cancer tumor microenvironment
2026-May-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag406
PMID:42109251
|
研究论文 | 提出InSituPREP计算框架，用于在三维组织中单细胞分辨率下量化空间环境与转录状态的关系 | 首次实现三维肿瘤微环境中单细胞分辨率的邻近关联基因程序定量解析，并整合空间RNA速度分析揭示细胞间距离对转录轨迹的影响 | 当前仅应用于10例乳腺癌活检组织及299个癌症相关基因，样本量和基因覆盖有限；依赖Expansion Sequencing技术可能引入特定技术偏倚 | 建立计算框架量化三维组织中空间环境对单细胞转录状态的影响 | 10例乳腺癌活检组织中的细胞及其microenvironment相互作用 | 计算生物学 | 乳腺癌 | Expansion Sequencing, RNA速度分析, 线性建模 | 线性模型 | 基因表达数据 | 10例乳腺癌活检组织 | NA | 空间转录组学 | Expansion Sequencing | Expansion Sequencing技术用于三维空间基因表达谱分析 |
| 31 | 2026-05-12 |
An Advanced Single-Cell RNA Sequencing (scRNA-seq) Protocol Utilizing Custom-Designed Multiplexing
2026-May-05, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5678
PMID:42111707
|
研究论文 | 介绍了一种利用定制设计多重标记技术的高级单细胞RNA测序协议，解决了商业小鼠标签在特定品系中的不兼容问题 | 开发基于生物素化抗体鸡尾酒和链霉亲和素结合寡核苷酸的稳健替代方案，实现可靠样本多重标记，并兼容多组学5'工作流程 | 未明确提及局限性 | 提出针对品系特异性或定制设计多重标记策略的实用解决方案，用于单细胞转录组学研究 | FVB/N小鼠肺组织样本 | 数字病理学 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 单细胞转录组数据 | FVB/N小鼠肺组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium 单细胞5'化学试剂盒 |
| 32 | 2026-05-12 |
Histone deacetylases and cell-cycle regulators orchestrate cell-identity transitions during Arabidopsis root regeneration
2026-05-04, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2026.03.013
PMID:41889170
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序、ATAC测序、成像和突变体分析，研究拟南芥根再生过程中细胞身份转变的轨迹 | 揭示了组蛋白去乙酰化酶和细胞周期调控因子协同调控植物细胞重编程顺序的机制，发现HDA9/HDA19抑制旧身份及应激反应，OBP1与SMRs调节分裂速率 | 未提及具体限制 | 阐明拟南芥根再生过程中细胞重编程的连续状态及其分子调控机制 | 拟南芥根再生过程中的细胞 | 单细胞组学， 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序， ATAC测序， 成像， 突变体分析 | NA | 单细胞基因表达数据， 染色质可及性数据， 图像数据 | 拟南芥根再生过程中的细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq， 单细胞ATAC-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序和ATAC测序 |
| 33 | 2026-05-12 |
scPASU: A computational protocol for quantifying polyadenylation site usage and alternative polyadenylation from 3' scRNA-seq data
2026-May-04, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2026.104544
PMID:42085187
|
研究方案 | 提出scPASU：一种从3'单细胞RNA测序数据中量化多聚腺苷酸化位点使用和可变多聚腺苷酸化的计算协议 | 开发了Snakemake工作流程scPASU，可灵活配置生物体和样本特定参数，支持多聚腺苷酸化位点发现 | 未明确说明 | 构建从3'scRNA-seq数据中量化多聚腺苷酸化位点使用和可变多聚腺苷酸化的计算协议 | 3'单细胞RNA测序数据中的多聚腺苷酸化位点 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 34 | 2026-05-12 |
TCF1+CD4+ T cells and microglia co-orchestrate tertiary lymphoid structures to enhance prognosis and immunotherapy in non-small cell lung cancer with brain metastases
2026-May-04, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2026.106280
PMID:42085932
|
研究论文 | 研究非小细胞肺癌脑转移中TLS（三级淋巴结构）的特征、功能及其对预后和免疫治疗的影响，发现TCF1+CD4+ T细胞和小胶质细胞通过LTβ/LTβR信号共同促进TLS形成，而CXCL12作为关键化学吸引剂与免疫治疗良好结局相关 | 首次阐明脑转移瘤内TLS的独特异质性及TCF1+CD4+ T细胞与小胶质细胞在TLS形成中的协同作用，并揭示CXCL12作为关键化学吸引因子预测免疫治疗效果 | 回顾性研究设计，样本量有限（120例），未进行前瞻性验证；机制研究主要基于小鼠模型和公共数据，缺乏人体直接验证 | 探究非小细胞肺癌脑转移中三级淋巴结构的特征、形成机制及其作为预后生物标志物和免疫治疗靶点的潜力 | 非小细胞肺癌脑转移患者手术切除的肿瘤样本（120例）以及LC-BrM小鼠模型 | 数字病理学 | 肺癌 | 多重免疫组化, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 图像, 基因表达数据 | 120例人类手术切除样本及小鼠模型 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于公共数据集分析 |
| 35 | 2026-05-12 |
GR2ST: spatial transcriptomics prediction based on graph-enhanced multimodal contrastive learning
2026-May-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag209
PMID:42036805
|
研究论文 | 提出GR2ST深度学习模型，利用图增强多模态对比学习从组织学图像预测空间转录组 | 创新性地结合动态阈值功能图和半径约束空间图的双分支图架构，并通过多模态对比学习与细胞类型引导的回归头实现图像特征与基因表达的精准对齐 | 未详细说明模型在更多组织类型或低质量图像上的泛化能力，以及计算资源需求 | 开发从组织学图像高效预测空间转录组的方法，降低实验成本和时间 | 皮肤鳞状细胞癌和两种人类乳腺癌的空间转录组数据 | 数字病理学 | 皮肤癌, 乳腺癌 | 空间转录组学 | 图神经网络, 对比学习, 回归模型 | 组织学图像, 基因表达数据 | 三个癌症空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 36 | 2026-05-12 |
TransGRN: A Transfer Learning-Based Framework for Inferring Gene Regulatory Networks Across Cell Lines
2026-May, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3628564
PMID:41191474
|
研究论文 | 提出TransGRN，一种基于迁移学习的框架，用于跨细胞系推断基因调控网络 | 采用跨细胞系预训练策略，结合多个源细胞系的单细胞RNA测序数据和大语言模型的生物学知识，实现通用调控模式的迁移 | 依赖源细胞系数据的质量和多样性，可能影响在目标细胞系数据极度稀缺时的性能 | 开发无需大量先验调控信息即可推断基因调控网络的方法 | 基因调控网络推断、细胞系间调控模式迁移 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 迁移学习模型 | 基因表达数据 | 多个源细胞系和目标细胞系样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 37 | 2026-05-12 |
Bispecific T-cell Engager (CD3 × EGFR)-Based Triplet Therapy Unlocks CD40/CD40L Crosstalk to Revert Immunosuppression in Third-Generation EGFR-Tyrosine Kinase Inhibitor-Refractory NSCLC
2026-May, Journal of thoracic oncology : official publication of the International Association for the Study of Lung Cancer
IF:21.0Q1
DOI:10.1016/j.jtho.2026.103607
PMID:41672197
|
研究论文 | 研究针对第三代EGFR-TKI耐药的非小细胞肺癌，提出了一种基于双特异性T细胞衔接器（CD3×EGFR）的三联疗法，通过激活CD40/CD40L信号通路逆转免疫抑制 | 首次提出三联疗法结合双特异性T细胞衔接器、组蛋白去乙酰化酶抑制剂和4-1BB激动剂，以克服EGFR-TKI耐药肿瘤中的免疫抑制微环境 | 文中未明确提及具体局限性，但可能需要进一步验证该疗法在更大样本中的安全性和有效性 | 开发一种新的三联组合疗法，以恢复T细胞抗肿瘤活性，解决第三代EGFR-TKI耐药非小细胞肺癌的免疫抑制问题 | 非小细胞肺癌患者样本、人源化NOG-EXL小鼠模型 | 机器学习 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序、多色荧光染色 | NA | 基因表达数据、图像数据 | 文中未明确样本数量，但包括非小细胞肺癌患者样本和小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3 |
| 38 | 2026-05-12 |
Deubiquitinase USP2 promotes hepatic stellate cell activation via p300 stabilization
2026-May, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.70301
PMID:41703985
|
研究论文 | 该研究通过去泛素化酶抑制剂筛选发现USP2在肝星状细胞活化中稳定p300，促进肝纤维化 | 首次识别USP2作为p300的新型去泛素化酶，揭示其在肝星状细胞活化和肝纤维化中的关键调控作用，为纤维化治疗提供新靶点 | 未明确说明研究局限 | 探索肝星状细胞活化过程中p300稳定性的上游调控机制 | 肝星状细胞、纤维化肝脏组织、慢性肝病患者样本 | 数字病理学 | 肝纤维化、代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 单细胞RNA测序、去泛素化酶抑制剂筛选 | NA | 单细胞转录组数据 | 人纤维化肝脏组织样本（具体数量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 39 | 2026-05-12 |
Comparison of single-cell sequencing technologies for allele-specific expression analysis in rabbit spermatids
2026-May, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2026.111224
PMID:41780767
|
研究论文 | 通过比较单细胞测序技术，分析兔子精子细胞中等位基因特异性表达，以识别可用于遗传生物防治的候选基因 | 首次对欧洲兔精子细胞进行等位基因特异性表达分析，并比较短读长和长读长测序技术的适用性 | 仅对三个候选基因进行了分析，且未来需要进一步评估这些基因在遗传生物防治中的适用性 | 识别欧洲兔中可能存在的自然基因驱动，探索其在遗传生物防治中的应用潜力 | 欧洲兔的精子细胞 | 自然语言处理 | NA | 单细胞测序，短读长测序，长读长测序 | NA | 基因表达数据 | 兔子精子细胞样本 | Illumina | 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq | 短读长测序平台，长读长测序平台 |
| 40 | 2026-05-12 |
Single-cell transcriptomics identifies NF-κB/STAT3-associated neutrophil inflammatory reprogramming in rheumatoid arthritis synovium
2026-May, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2026.111231
PMID:41831621
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析了类风湿关节炎滑膜中中性粒细胞的炎症重编程 | 首次揭示NF-κB/STAT3轴在类风湿关节炎中性粒细胞炎症重编程中的候选调控作用，并通过计算敲除实验验证 | 基于计算预测，缺乏直接功能实验验证NF-κB/STAT3轴的关键作用 | 阐明类风湿关节炎滑膜中中性粒细胞的异质性和炎症重编程机制 | 类风湿关节炎患者滑膜组织中的中性粒细胞 | 单细胞转录组学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq)，hdWGCNA共表达分析，计算敲除 | NA | 单细胞转录组数据，批量RNA-seq数据 | 8例类风湿关节炎患者（66,539个细胞），独立批量RNA-seq队列（n=19） | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |