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当前共找到 44270 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-10-17 |
Spatial transcriptomics unveils the in situ cellular and molecular hallmarks of the lung in fatal COVID-19
2026-Oct-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-78188-3
PMID:42881179
|
研究论文 | 利用Visium空间转录组学技术分析COVID-19患者和对照肺组织样本，揭示致命性COVID-19肺部细胞和分子特征 | 首次使用空间转录组学技术全面揭示致命性COVID-19肺部原位细胞和分子特征，包括细胞类型变化、空间组织、细胞间通讯、转录因子活性和时空轨迹分析 | 研究样本量有限，可能无法完全代表所有COVID-19患者群体；空间转录组学分辨率可能限制单细胞水平的详细分析 | 揭示驱动致命性COVID-19的细胞和分子事件，理解弥漫性肺泡损伤的机制 | COVID-19患者和对照组的肺组织样本 | 空间转录组学 | COVID-19 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据、图像 | COVID-19和对照肺组织样本（具体数量未在摘要中说明） | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | Visium空间转录组学 |
| 22 | 2026-10-17 |
IRF7 signalling in tanycytes controls brain-body-immune response across the ovarian cycle
2026-Oct-15, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-026-01635-4
PMID:42881274
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研究论文 | 该研究利用单细胞转录组学构建了小鼠和人类下丘脑正中隆起的细胞图谱，揭示了伸展细胞中IRF7信号通路在动情周期中调控脑-体-免疫反应的机制 | 首次发现伸展细胞具有免疫细胞样状态，揭示了伸展细胞中干扰素调节因子7（Irf7）在动情周期中的周期性表达及其对白细胞浸润和循环单核细胞比例的调控作用，阐明了脑-免疫系统通过伸展细胞的通讯机制 | 研究主要基于小鼠模型，虽然有人类样本的跨物种比较，但人类功能验证有限；具体分子机制和临床转化意义仍需进一步研究 | 探究下丘脑伸展细胞在脑-体-免疫通讯中的作用及其在动情周期中的动态变化，理解性别偏向性疾病的神经内分泌和免疫学机制 | 小鼠和人类的伸展细胞（下丘脑正中隆起区域的室管膜胶质细胞） | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 23 | 2026-10-17 |
SALL1 as a marker for distinguishing microglia from blood-derived myeloid cells in stroke brain scRNA-seq data
2026-10-15, Molecular neurodegeneration
IF:14.9Q1
DOI:10.1186/s13024-026-01003-6
PMID:42881417
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研究论文 | 本文提出SALL1作为标志物，用于在中风脑部scRNA-seq数据中区分常驻小胶质细胞与浸润性髓系细胞 | 发现SALL1相比常用标志物（TMEM119、CX3CR1、P2RY12）对小胶质细胞具有更高的特异性，并将SALL1与这些常用标志物联合使用以提高区分能力 | 摘要中未提及该研究的局限性 | 解决中风scRNA-seq数据中因髓系标志物共享而难以区分常驻小胶质细胞与浸润性髓系细胞的问题 | 中风脑部scRNA-seq数据中的小胶质细胞与浸润性髓系细胞 | 机器学习 | 中风 | scRNA-seq | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 24 | 2026-10-17 |
SLC25A4high Hepatocytes Enhance Lifestyle Intervention Response in MASLD by Recruiting Eating Macrophages
2026-Oct-15, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.78004
PMID:42881487
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研究论文 | 该研究揭示SLC25A4高表达肝细胞通过Pannexin 1释放ATP招募脂质吞噬巨噬细胞，经GDF15-PPARα轴增强脂肪酸氧化，从而改善MASLD患者对生活方式干预的响应 | 首次发现SLC25A4高表达肝细胞通过Pannexin 1介导的ATP外排招募Clec4f+Timd4+P2ry12+脂质吞噬巨噬细胞，并揭示肝细胞-巨噬细胞间GDF15-PPARα轴在生活方式干预响应中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床患者样本验证有限，SLC25A4作为治疗靶点的安全性和有效性仍需进一步临床试验验证 | 探究生活方式干预响应MASLD患者中驱动组织学和代谢改善的分子机制 | MASLD患者和小鼠模型（C57BL/6N小鼠） | 机器学习 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 单细胞RNA测序, 代谢组学, 共培养实验, 流体动力学注射 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 25 | 2026-10-17 |
Targeting Nupr1-Mediated p53 Mitochondrial Sequestration Alleviates Aortic Dissection by Restoring the Gadd45b-Dependent Survival Program
2026-Oct-15, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.78143
PMID:42881547
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研究论文 | 该研究揭示了Nupr1通过将p53隔离于线粒体内、抑制Gadd45b依赖性生存程序，从而促进血管平滑肌细胞凋亡和主动脉夹层进展的机制 | 首次发现Nupr1作为病理空间开关，通过线粒体富集将p53隔离于线粒体内，驱动不依赖转录的凋亡，同时抑制Gadd45b介导的保护性生存程序 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 阐明连接应激信号与线粒体凋亡级联的上游调控因子，并探索预防主动脉夹层进展的治疗策略 | 主动脉夹层患者的主动脉组织、小鼠模型、血管平滑肌细胞 | 心血管疾病 | 主动脉夹层 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 26 | 2026-10-17 |
BHLHE40 as a transcriptional rheostat: decoding microenvironmental signals in context-dependent tumor plasticity
2026-Oct-12, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-025-3343-2
PMID:42879103
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综述 | 本文综述了转录因子BHLHE40在肿瘤生物学中作为分子变阻器的功能，探讨其在不同肿瘤类型中依赖背景的促癌或抑癌双重作用 | 系统整合了BHLHE40的结构特征、生理信号整合功能及其在泛癌中的差异性表达模式，提出其作为肿瘤可塑性的转录变阻器概念，并讨论了靶向蛋白降解和患者来源类器官等新兴治疗策略 | 作为综述文章，未提供原始实验数据验证；BHLHE40的背景依赖性双重功能为临床靶向治疗带来重大挑战，目前缺乏有效的临床转化方案 | 总结BHLHE40在肿瘤生物学中的研究进展，阐明其作为转录变阻器在不同微环境信号下调控肿瘤可塑性的机制，并探讨其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 多种肿瘤类型，包括胶质母细胞瘤、急性髓系白血病、卵巢癌、乳腺癌、肾癌、肝细胞癌、胃癌、结直肠癌、胰腺导管腺癌、前列腺癌和子宫内膜癌 | 机器学习 | 肺癌 | 多组学数据分析，空间转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 27 | 2026-10-17 |
Spatial Transcriptomics in Thyroid Cancer: A PRISMA-Style Systematic Review of Platforms, Architecture, and Clinical Applications
2026-Oct-02, Journal of clinical medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jcm15197636
PMID:42882098
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系统综述 | 本文按照PRISMA 2020规范系统综述了空间转录组学在甲状腺癌中的平台、应用及研究发现 | 首次针对甲状腺癌领域空间转录组学研究进行PRISMA式系统综述，系统梳理了所用平台、互补方法及主要发现，并对纳入研究逐条进行设计匹配的JBI方法学质量评价 | 纳入研究多为小样本、选择性队列，无独立外部验证；仅1/12病例系列报告连续完整纳入，8项研究未报告所分析患者的结局，9项研究以spot或细胞而非患者为分析单位；未纳入甲状腺髓样癌研究 | 系统综述空间转录组学在甲状腺癌中的平台、研究架构与临床应用 | 应用空间分辨转录组学技术研究甲状腺癌组织的英文原始研究 | 空间转录组学 | 甲状腺癌 | 空间转录组学，捕获式全转录组测序，数字空间图谱分析 | NA | 图像，文本 | 21项研究（12项病例系列、4项分析性横断面研究、3项单病例报告、2项同一公共数据集再分析） | 10x Genomics, NanoString | 空间转录组学 | 10x Visium, GeoMx DSP | 19项研究使用基于捕获的全转录组平台（以10x Visium为主），2项研究使用GeoMx数字空间图谱分析 |
| 28 | 2026-10-17 |
Graph attention network-driven single-cell omics analysis reveals how B4GALNT1-mediated glycosylation remodelling of the ferroptosis-pyroptosis network promotes drug resistance in hepatocellular carcinoma
2026-Oct, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70873
PMID:42878060
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研究论文 | 该研究结合单细胞转录组学、图注意力网络建模及功能实验，揭示B4GALNT1通过重塑神经节苷脂组成和脂筏结构，协调铁死亡抵抗与caspase-1/GSDMD相关信号，从而促进肝细胞癌对索拉非尼的耐药 | 首次发现B4GALNT1作为神经节苷脂生物合成糖基转移酶，通过改变GM1富集的膜微域结构，将神经节苷脂组成与脂筏架构同铁死亡调控及caspase-1/GSDMD信号偶联，构建了“铁死亡抵抗增强+膜通透化受限”的耐药适应模型，并利用图注意力网络辅助单细胞组学分析 | 研究主要基于相关性分析和体外/动物模型验证，尚需更多临床队列验证B4GALNT1作为治疗靶点的有效性；图注意力网络模型的具体预测性能和可解释性未在摘要中充分说明；耐药机制的完整信号通路网络仍需进一步解析 | 探究B4GALNT1是否通过改变神经节苷脂组成和脂筏架构，偶联铁死亡调控与caspase-1/GSDMD相关信号，进而驱动肝细胞癌对索拉非尼的获得性耐药 | 肝细胞癌（HCC）患者样本、索拉非尼耐药Huh7-SR细胞、Huh7细胞及其他肝肿瘤模型、异种移植瘤模型 | 机器学习, 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞转录组学, TCGA-LIHC分析, 通路水平分析, 神经节苷脂谱分析, 去垢剂抗性膜分离, 功能获得与缺失实验 | 图注意力网络 | 图像, 文本, 组学数据 | 92例接受索拉非尼治疗的肝细胞癌患者局部队列，以及TCGA-LIHC公共数据集和多种细胞及动物模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 29 | 2026-10-17 |
Ion Channels in Cardiac Non-Excitable Cells: From Single-Cell Atlases to Disease
2026-Sep-30, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15191790
PMID:42882488
|
综述 | 本文综述了心脏非兴奋性细胞（如成纤维细胞、内皮细胞、壁细胞、免疫细胞和脂肪细胞）中离子通道的表达及其在心血管疾病中的机制性作用，强调从单细胞图谱到疾病的功能验证 | 聚焦于有机制支持的“通道-细胞-疾病”轴，而非简单罗列非心肌细胞中检测到的离子通道，并区分图谱层面的关联与因果性通道功能 | 许多基于表达谱的通道提名仍缺乏在人体组织和疾病相关心脏模型中的直接功能验证，存在关键证据缺口 | 综合心脏非兴奋性细胞中离子通道的功能证据，建立优先排序框架，以推动非心肌细胞离子通道机制成为心血管疾病治疗靶点 | 心脏非兴奋性细胞，包括心脏成纤维细胞、内皮细胞、壁细胞、免疫细胞和脂肪细胞 | 心血管疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 30 | 2026-10-17 |
HLA-Engineered iPSC-Derived Mesenchymal Stromal Cells for the Treatment of Osteoarthritis in Mice
2026-Sep-29, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15191777
PMID:42882475
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研究论文 | 该研究利用CRISPR/Cas9技术构建B2M和CIITA双敲除iPSC并分化为间充质基质细胞，用于治疗小鼠骨关节炎 | 首次通过B2M/CIITA双敲除实现iPSC来源间充质基质细胞的HLA持续低表达，同时保留MSC表型和免疫调节活性，并在小鼠OA模型中展现出优于野生型iMSC和组织来源MSC的治疗效果 | 研究仅在小鼠模型中验证，尚未在人体临床试验中评估安全性和有效性；长期体内移植后的致瘤性和免疫逃逸风险需进一步研究 | 开发低HLA表达的iPSC来源间充质基质细胞用于同种异体细胞治疗骨关节炎 | B2M/CIITA双敲除iPSC来源间充质基质细胞（dKO-iMSCs）、野生型iMSCs、组织来源MSCs、DMM小鼠骨关节炎模型 | 再生医学、细胞治疗 | 骨关节炎 | CRISPR/Cas9基因编辑、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 31 | 2026-10-17 |
Single-Cell Transcriptomic Landscape of the Gill in Hypoxia-Stressed Tachysurus vachellii (Richardson, 1846): Insights into Cell-Type-Specific Responses of Different Epithelial Cells and Erythrocytes
2026-Sep-24, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15191747
PMID:42882445
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研究论文 | 该研究构建了黄颡鱼鳃的单细胞图谱，并探究了急性缺氧胁迫下鳃细胞的响应模式 | 首次构建了黄颡鱼鳃的单细胞转录组图谱，揭示了不同上皮细胞和红细胞在缺氧应激下的细胞类型特异性响应 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 构建黄颡鱼鳃的单细胞图谱，并探索急性缺氧胁迫下鳃细胞的响应模式 | 黄颡鱼（Tachysurus vachellii）的鳃组织 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序，组织学观察 | NA | 单细胞转录组数据，图像 | 37,090个细胞，33个细胞聚类，18种细胞类型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 32 | 2026-10-17 |
B-Cell Immune Responses in Myocarditis: Mechanisms, B-Cell Receptor Repertoire, and Clinical Translation
2026-Sep-23, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15191734
PMID:42882432
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综述 | 本文综述了B细胞免疫反应在心肌炎中的作用机制，包括自身抗体介导的心肌损伤、B细胞亚群的功能异质性以及B细胞受体（BCR）库的重塑，并探讨了其临床转化前景 | 系统整合了单细胞测序和BCR库测序在心肌炎B细胞免疫研究中的最新证据，揭示了B细胞克隆扩增、免疫球蛋白类别转换和功能亚群动态变化，并强调了BCR库特征和自身抗体谱作为潜在生物标志物的可能性 | BCR库特征和自身抗体谱作为临床生物标志物的效用仍不确定，缺乏标准化的检测方法以及经过充分验证的灵敏度、特异性和可重复性 | 综合当前关于BCR库重塑、自身抗体介导的心肌损伤、B细胞亚群功能异质性及其临床转化的证据，探讨B细胞在心肌炎发病机制中的作用 | 心肌炎（包括感染性、自身免疫性和免疫检查点抑制剂相关心肌炎）中的B细胞免疫反应 | 免疫学 | 心肌炎 | 单细胞测序, B细胞受体（BCR）库测序, 多组学分析 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, BCR库测序 | NA | NA |
| 33 | 2026-10-17 |
Ablation of CDK6 and STAT5B rewires T cell developmental dynamics and prevents ALK+ lymphoma formation
2026-Sep-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-77466-4
PMID:42881166
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研究论文 | 该研究通过在NPM-ALK小鼠模型中同时敲除Cdk6和Stat5b，发现可完全阻止肿瘤形成，并利用单细胞转录组学揭示了肿瘤特异性分化轨迹及CDK6/STAT5B共享靶点，在人类ALCL细胞中证实双重缺失诱导合成致死，并鉴定了高风险患者亚群 | 首次证明同时敲除Cdk6和Stat5b能完全预防NPM-ALK小鼠模型中的肿瘤形成；鉴定出未成熟DN2/3胸腺细胞是ALK驱动恶性肿瘤的细胞起源；揭示了CDK6和STAT5B在肿瘤起始阶段共享的转录靶点；在人类ALCL细胞中发现CDK6和STAT5B双重缺失诱导情境依赖性合成致死；建立了基于CDK6/STAT5B依赖性肿瘤起始基因的转录特征，可识别预后较差的ALCL高风险亚群 | 研究主要基于NPM-ALK小鼠模型和体外人类ALCL细胞系，缺乏临床患者样本的直接验证；CDK6/STAT5B双重靶向治疗策略的体内安全性和有效性尚需进一步评估；转录特征的临床适用性需在更大队列中验证 | 探究CDK6和STAT5B在ALK+淋巴瘤转化过程中的相互作用，以及同时靶向这两个因子是否可以预防肿瘤形成并揭示治疗脆弱性 | NPM-ALK小鼠模型、人类ALCL细胞、ALCL患者转录组数据 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 34 | 2026-10-17 |
Spatiotemporal multi-omics reveals lineage, spatial and functional heterogeneity of tumor-associated macrophages and therapeutic vulnerabilities in the tumor microenvironment
2026-Jul-25, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01622-8
PMID:42881205
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综述 | 该综述聚焦于新兴的单细胞和空间多组学技术如何重新定义肿瘤相关巨噬细胞（TAM）的起源、表型多样性、空间组织及治疗脆弱性，并探讨了TAM相关基因特征及基于多组学的评分在预测治疗反应或耐药中的作用 | 不同于以往主要总结巨噬细胞极化或TAM亚型分类的综述，本文重点阐述了单细胞和空间多组学技术如何重新定义TAM的个体发生、表型多样性、空间组织和治疗脆弱性，并整合了空间转录组学、多重成像和影像组学证据来勾勒TAM富集生态位，同时提出了结合AI辅助数字病理和纵向采样的TAM指导患者分层策略 | 作为一篇综述，本文未提供原始实验数据，其结论主要基于对现有文献的整合分析，缺乏对所述技术和方法在临床转化中具体挑战（如成本、标准化、可重复性等）的深入讨论 | 总结单细胞和空间多组学技术如何推动对TAM生物学的新认识，并探讨基于TAM的治疗策略和精准肿瘤学应用前景 | 肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）及其在肿瘤微环境中的亚群、空间生态位和相互作用网络 | 数字病理 | 泛癌种 | 单细胞转录组学、空间转录组学、多重成像、影像组学、命运图谱分析 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 35 | 2026-10-17 |
Ceramidase is involved in metabolic reprogramming of fibroblasts under hypoxia conditions
2026, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2026.1914022
PMID:42876482
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研究论文 | 本文研究了酸性神经酰胺酶（ASAH1）在缺氧条件下成纤维细胞代谢重编程中的作用，并结合特发性肺纤维化（IPF）肺组织的公共RNA测序数据进行分析 | 首次揭示酸性神经酰胺酶/ASAH1参与成纤维细胞在缺氧应激下的代谢和氧化还原适应，并可能影响IPF中成纤维细胞的活化状态 | 研究主要基于体外细胞实验和公共数据集分析，缺乏体内功能验证实验 | 探究酸性神经酰胺酶（ASAH1）在成纤维细胞适应缺氧应激中的作用及其与IPF的关联 | 人成纤维细胞及特发性肺纤维化（IPF）肺组织 | 机器学习 | 肺纤维化 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | 文本, 图像 | 人成纤维细胞在缺氧条件下处理24、48、72小时，以及公共IPF肺组织bulk和单细胞RNA测序数据集 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 36 | 2026-10-17 |
Integration of bulk and single-cell transcriptomics with spatial analysis identifies candidate hub genes and inferred regulatory programs in atopic dermatitis
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1863607
PMID:42876554
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研究论文 | 该研究整合了公共微阵列、单细胞RNA测序和空间转录组数据集，识别了特应性皮炎中的候选枢纽基因和推断的调控程序 | 整合了批量转录组学、单细胞转录组学和空间转录组学三种模态的数据，结合WGCNA、调控子活性推断和空间解卷积分析，识别了与树突状细胞和T细胞相关的候选分子信号 | 研究为探索性和假设生成性质，未建立验证的生物标志物、因果调控机制或治疗反应预测因子，需要独立队列复制以及功能性和细胞类型特异性验证 | 识别特应性皮炎中的候选枢纽基因和推断的调控程序，以深入理解组织微环境中细胞类型相关的分子程序 | 特应性皮炎患者的皮肤样本，包括病变型、非病变型和健康对照样本 | 机器学习 | 特应性皮炎 | 微阵列、单细胞RNA测序、空间转录组学、免疫组织化学 | WGCNA、调控子活性推断、细胞群体解卷积 | 基因表达数据、图像 | GSE130588含124例病变AD皮肤样本；GSE59294含18例患者的40例皮肤活检样本；单细胞查询队列含25例样本的66,846个细胞，下游分析限制于19例水疱来源样本；GSE197023含20例空间转录组样本（7例病变AD、7例非病变AD、6例健康对照）；免疫组化独立样本每组n=5 | NA | 微阵列、单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 37 | 2026-10-17 |
TXN/TXNIP signatures point to plasma cells as a potential immune hub in periodontitis based on integrated transcriptomic analysis and preliminary experimental validation
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1937134
PMID:42876656
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研究论文 | 本研究通过整合批量转录组和单细胞RNA测序数据，结合机器学习与动物实验验证，发现TXN和TXNIP是牙周炎的关键基因，并揭示浆细胞可能作为免疫调控枢纽参与牙周炎进展 | 首次将细胞衰老和昼夜节律相关基因与牙周炎整合分析，鉴定TXN/TXNIP为关键诊断基因，并通过单细胞分析揭示浆细胞在牙周炎中从免疫孤立群体转变为通过MIF信号轴发挥调控作用的免疫枢纽 | 研究主要基于公共数据库的转录组数据，样本量有限，TXN/TXNIP在牙周炎中的具体分子机制尚未完全阐明，仍需更大规模临床样本和功能实验进一步验证 | 探索细胞衰老和昼夜节律相关基因在牙周炎进展中的作用，鉴定潜在生物标志物并构建诊断模型，揭示关键基因的细胞特异性和生物学功能 | 牙周炎患者的牙周组织转录组数据、单细胞RNA测序数据及动物模型牙周组织 | 机器学习 | 牙周炎 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, 免疫荧光分析, 组织学分析 | 机器学习 | 文本, 图像 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 38 | 2026-10-17 |
Spatial compartmentalization shapes distinct germinal center states during respiratory viral infection
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1930085
PMID:42876739
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研究论文 | 结合免疫荧光与Xenium空间转录组技术，在SARS-CoV-2感染的食蟹猴纵隔淋巴结中鉴定出LYVE1+窦相关髓质生发中心（mGC），并揭示其与皮层生发中心（cGC）不同的分子与细胞生态位特征 | 首次在呼吸道病毒感染模型中鉴定并系统刻画了位于髓质的LYVE1+窦相关生发中心结构（mGC），发现其虽共享核心GC模块但在基因表达、细胞组成、FDC与T细胞网络拓扑及IgM/IgG比例上与cGC显著不同，提出淋巴结微解剖结构塑造独特GC状态的新模型 | 研究基于SARS-CoV-2感染的食蟹猴模型，样本量有限且结论向人类及其他呼吸道病毒感染的可推广性有待验证，空间转录组在单细胞分辨率与低丰度细胞类型检测上可能存在局限 | 探究髓质中增殖性B细胞聚集体是否执行真正的生发中心程序，抑或代表一种独特的GC样分化状态，并阐明淋巴结微解剖结构对GC状态的塑造作用 | SARS-CoV-2感染的食蟹猴纵隔淋巴结中的生发中心结构，包括髓质生发中心（mGC）和皮层生发中心（cGC） | 空间转录组学 | COVID-19 | 免疫荧光、空间转录组测序 | NA | 图像、文本 | SARS-CoV-2感染的食蟹猴纵隔淋巴结样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Xenium | 10x Genomics Xenium空间转录组平台，结合免疫荧光染色 |
| 39 | 2026-10-17 |
Keratinocyte-derived CXCL-CXCR2 ligand-receptor axis by MED1 orchestrates neutrophil phenotypes during psoriasis
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1935554
PMID:42876837
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研究论文 | 该研究通过构建表皮特异性Med1条件性敲除小鼠并结合IMQ诱导的银屑病模型，利用单细胞RNA测序揭示了角质形成细胞来源的CXCL-CXCR2配体-受体轴通过Med1调控银屑病中中性粒细胞表型的机制 | 首次发现三种新型中性粒细胞亚型，其中Cluster Nb具有显著趋化表型；首次证明表皮Med1通过转录调控CXCL1/2/3促进CXCR2依赖的中性粒细胞趋化，揭示了免疫-实质配体-受体通讯在银屑病中的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类银屑病患者样本中验证；Med1调控CXCL1/2/3的具体转录机制细节仍需进一步解析 | 探究表皮角质形成细胞与浸润免疫细胞之间的分子通讯机制在银屑病发病过程中的作用 | 表皮特异性Med1条件性敲除小鼠和野生型小鼠的银屑病皮损组织 | 单细胞组学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | Med1条件性敲除小鼠和野生型小鼠的银屑病皮损样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 40 | 2026-10-17 |
Loss of CLIC3 in CD8+ cytotoxic T lymphocytes is associated with immune dysfunction and poor prognosis in lung adenocarcinoma
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1975159
PMID:42877053
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序、空间转录组学、TCGA-LUAD批量RNA测序分析和流式细胞术验证，揭示了CLIC3在CD8+细胞毒性T淋巴细胞中的表达与肺腺癌免疫功能障碍和不良预后相关 | 首次发现CLIC3是肺腺癌中细胞毒性T淋巴细胞功能能力的新型标志物，并揭示其阶段相关性下调反映了肿瘤进展过程中的T细胞功能障碍 | 研究样本量相对较小，仅涉及9例单细胞RNA测序样本和32例流式验证样本，需要更大规模队列验证CLIC3作为预测生物标志物的临床适用性 | 探究CLIC3在肺腺癌肿瘤微环境中T细胞免疫中的作用及其与免疫功能障碍和预后的关系 | 肺腺癌患者的肿瘤组织和CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序, 流式细胞术 | NA | 图像, 文本 | 9例肺腺癌患者的肿瘤组织进行单细胞RNA测序（涵盖三个病理阶段：原位腺癌、微浸润腺癌和浸润性腺癌），32例肺腺癌患者进行流式细胞术验证 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | 10x Chromium, 10x Visium, Illumina NovaSeq | NA |