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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
21 2026-03-15
Defining subcellular synovial responses in TMJ osteoarthritis onset via mechanical stress and articular disk derangement models
2026-Mar-12, International journal of oral science IF:10.8Q1
研究论文 本研究通过整合亚细胞空间转录组学和单细胞RNA测序技术,在小鼠模型中探索颞下颌关节骨关节炎(TMJ-OA)发病机制中滑膜对机械和炎症刺激的分子响应 首次结合亚细胞空间转录组学和单细胞RNA测序技术,在机械应力和关节盘紊乱模型中系统分析滑膜的分子变化,揭示了与脂肪生成、纤维化和巨噬细胞激活相关的关键通路 研究基于小鼠模型,结果可能无法完全反映人类TMJ-OA的复杂性;样本量未明确说明,可能影响统计效力 探究TMJ-OA发病机制中滑膜对机械和炎症刺激的分子响应,为靶向治疗策略提供基础 小鼠颞下颌关节滑膜组织 数字病理学 颞下颌关节骨关节炎 空间转录组学, 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
22 2026-03-15
Whole-embryo spatial transcriptomics at subcellular resolution from gastrulation to organogenesis
2026-Mar-12, Science (New York, N.Y.)
研究论文 本研究开发了一种名为weMERFISH的全胚胎成像平台,用于在亚细胞分辨率下对斑马鱼胚胎进行空间转录组分析 首次实现了从原肠胚形成到器官发生过程中全胚胎空间转录组学的亚细胞分辨率检测 仅分析了495个基因的表达,虽然通过图谱推断了更多基因,但直接检测的基因数量有限 系统检测胚胎发育过程中的基因表达模式及其调控机制 斑马鱼胚胎 空间转录组学 NA 多重错误鲁棒荧光原位杂交(MERFISH) NA 空间基因表达数据、染色质可及性数据、活体成像数据 斑马鱼胚胎(具体数量未明确说明) NA 空间转录组学 weMERFISH 全胚胎多重错误鲁棒荧光原位杂交成像平台
23 2026-03-15
Persistent histone H3K27 acetylation contributes to excessive scar formation after spinal cord injury through the regulation of microglial cholesterol accumulation
2026-Mar-12, Neurotherapeutics : the journal of the American Society for Experimental NeuroTherapeutics IF:5.6Q1
研究论文 本研究揭示了脊髓损伤后组蛋白H3K27乙酰化通过调控小胶质细胞胆固醇代谢促进过度瘢痕形成的表观遗传机制 首次发现H3K27ac通过调控小胶质细胞胆固醇积累和SPP1分泌,介导小胶质细胞-星形胶质细胞-成纤维细胞通讯,从而驱动脊髓损伤后过度瘢痕形成 研究主要基于小鼠模型,临床转化需进一步验证;L002的药理抑制作用可能存在脱靶效应 探究脊髓损伤后过度瘢痕形成的表观遗传调控机制 成年小鼠脊髓损伤模型中的小胶质细胞 表观遗传学 脊髓损伤 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 多组学整合分析 NA 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 公开数据集GSE230765中的成年小鼠脊髓损伤样本 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
24 2026-03-15
Scalable nonparametric clustering with unified marker gene selection for single-cell RNA-seq data
2026-Mar-12, Cell reports methods IF:4.3Q2
研究论文 本文提出了一种名为NCLUSION的非参数无限混合模型,用于同时进行单细胞RNA测序数据的聚类和标记基因选择 NCLUSION模型通过贝叶斯稀疏先验同时实现聚类和标记基因识别,避免了传统方法中用户指定启发式规则和事后差异表达分析导致的假阳性率膨胀问题 NA 开发一种可扩展的非参数聚类方法,用于单细胞RNA测序数据分析 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 非参数无限混合模型 基因表达数据 数百万个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
25 2026-03-15
Multi-omics study on tumor-associated macrophages remodeling the tumor microenvironment via the CXCL5-CXCR2 axis to drive immune escape in bladder cancer
2026-Mar-11, Cancer immunology, immunotherapy : CII
研究论文 本研究通过多组学方法探讨了肿瘤相关巨噬细胞通过CXCL5-CXCR2轴重塑膀胱癌肿瘤微环境以驱动免疫逃逸的机制 从肿瘤微环境视角出发,首次系统揭示了CXCL5+ TAMs与FOLR2+ TAMs在膀胱癌预后和免疫治疗反应中的不同作用,并发现了CXCL5-CXCR2-NF-κB轴在促进免疫抑制和肿瘤进展中的关键功能 研究主要基于体外和动物模型,临床样本验证有限,且未涉及其他潜在信号通路的交叉作用 探究膀胱癌中肿瘤相关巨噬细胞与肿瘤细胞相互作用的机制及其对免疫治疗疗效的影响 膀胱癌细胞、肿瘤相关巨噬细胞、小鼠异种移植模型 单细胞组学 膀胱癌 单细胞测序、批量测序、靶向代谢组学测序 共培养模型、异种移植模型、尾静脉转移模型 单细胞RNA-seq数据、批量RNA-seq数据、代谢组学数据 未明确说明具体样本数量,涉及体外细胞培养和动物模型 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 代谢组学 NA NA
26 2026-03-15
Inhibition of NFAT after human uterus transplant promotes loss of tissue-resident NK cells and attendant pregnancy complications
2026-Mar-11, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 本研究通过比较子宫移植受者与健康对照的样本,揭示了NFAT信号抑制导致组织驻留子宫自然杀伤细胞减少,进而引发妊娠并发症的机制 首次在人类中揭示了NFAT信号通路在调控子宫自然杀伤细胞组织驻留程序中的关键作用,并阐明了其与妊娠并发症(如子痫前期)的生物学联系 研究样本来源于高风险子宫移植受者队列,可能无法完全代表普通人群;体外实验使用他克莫司抑制NFAT,其效应在体内环境的复杂性可能未被完全模拟 探究人类子宫移植后妊娠并发症的细胞与分子机制,特别是组织驻留子宫自然杀伤细胞的作用 子宫移植受者的子宫内膜和蜕膜组织样本,以及健康对照的相应组织 数字病理学 妊娠并发症 流式细胞术,免疫荧光显微镜,单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据,图像数据,流式细胞数据 一个高风险人类子宫移植受者队列的组织样本及健康对照样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
27 2026-03-15
Multidimensional profiling of heterogeneity in supratentorial ependymomas
2026-Mar-11, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞和空间转录组学以及活细胞成像技术,定义了幕上室管膜瘤的细胞状态、空间组织和动态行为 首次在幕上室管膜瘤中识别出两种不同的祖细胞样状态,并揭示了肿瘤的空间组织模式和脑内细胞对肿瘤异质性的影响 NA 探究幕上室管膜瘤的发育特征和微环境因素,以理解其异常细胞转化和行为 幕上室管膜瘤的细胞状态、空间组织和动态行为 数字病理学 脑癌 单细胞转录组学, 空间转录组学, 活细胞成像 NA 转录组数据, 图像数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
28 2026-03-15
Single-cell proteomics reveal lesion-specific aberrant T cells and immunological profiles in Mycosis Fungoides
2026-Mar-11, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞蛋白质组学技术,揭示了蕈样肉芽肿(MF)中病变特异性异常T细胞及免疫微环境的特征 首次利用质谱流式细胞术结合公共单细胞RNA-seq数据,系统分析了MF不同病变阶段(斑片与肿瘤)的异常T细胞和免疫细胞组成,并关联临床预后 研究样本量有限,且主要依赖回顾性数据,未来需扩大队列验证 探究MF病变特异性免疫异质性及其与疾病严重程度的关系 MF皮肤病变中的异常T细胞和肿瘤微环境免疫细胞 单细胞蛋白质组学 皮肤T细胞淋巴瘤 质谱流式细胞术,单细胞RNA-seq NA 蛋白质表达数据,RNA-seq数据 未明确样本数量,但涉及MF皮肤病变组织 NA 单细胞蛋白质组学,单细胞RNA-seq NA NA
29 2026-03-15
Expression of CD25 in Human Lung Mast Cells and its Regulation by IL-33
2026-Mar-11, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1
研究论文 本研究探讨了IL-33对人肺肥大细胞中CD25表达的调控作用 首次揭示了IL-33能上调正常成熟组织驻留肥大细胞中CD25的表达,并发现CD25+肥大细胞是一个具有独特IL-33反应特征的亚群 研究主要基于体外实验和公开数据集,体内功能验证可能不足 研究IL-33对人肺肥大细胞CD25表达的调控机制 纯化的人肺肥大细胞 NA NA RNA测序, RT-qPCR, 流式细胞术, 免疫荧光染色 NA RNA-seq数据, 流式数据, 免疫荧光图像 未明确样本数量,使用纯化的人肺肥大细胞和公开单细胞RNA-seq数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
30 2026-03-15
Identification of altered immune landscape at single-cell resolution in NSCLC brain metastasis and its association with poor immune checkpoint inhibitor responses
2026-Mar-10, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了非小细胞肺癌脑转移灶中独特的免疫抑制微环境,并开发了一个与免疫检查点抑制剂反应相关的七基因标志物 首次在单细胞分辨率下系统描绘了NSCLC脑转移的免疫景观,发现了HSP70高表达应激反应性T细胞和PLTP⁺肿瘤相关巨噬细胞等新的免疫抑制特征,并构建了具有预后预测价值的脑转移免疫标志物 研究样本量相对有限,需要更多独立队列验证BMIS标志物的临床适用性,机制研究尚待深入 阐明非小细胞肺癌脑转移对免疫检查点抑制剂反应减弱的免疫学机制 非小细胞肺癌原发灶和脑转移灶中的肿瘤浸润免疫细胞 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 101,959个肿瘤浸润免疫细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
31 2026-03-15
Multi-omics validation of myelin water fraction as a myelin-specific MRI biomarker
2026-Mar-10, NeuroImage IF:4.7Q1
研究论文 本文通过整合高级MRI、血浆蛋白质组学和空间转录组学数据,验证了髓鞘水分数作为髓鞘特异性MRI生物标志物的生物学相关性 首次将BMC-mcDESPOT MRI方法与高通量血浆蛋白质组学和空间转录组学相结合,为MWF的髓鞘特异性提供了多组学验证证据 血浆蛋白分析仅显示名义关联(p<0.05未校正),且样本可能仅限于成人,缺乏纵向或疾病特异性验证 验证髓鞘水分数作为体内髓鞘含量的特异性生物标志物 成人主要白质束和深部灰质区域的髓鞘含量 神经影像学 NA BMC-mcDESPOT MRI成像、血浆蛋白质组学(SomaScan 7k平台)、空间转录组学 NA MRI图像、蛋白质组数据、基因表达数据 NA SomaLogic, Allen Institute 血浆蛋白质组学、空间转录组学 SomaScan 7k, Allen Human Brain Atlas SomaScan 7k平台用于血浆蛋白分析,Allen Human Brain Atlas用于MBP基因表达空间映射
32 2026-03-15
Metabolic reprogramming by baicalein disrupts fibroblast-macrophage crosstalk in idiopathic pulmonary fibrosis
2026-Mar-10, Chemico-biological interactions IF:4.7Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了黄芩素通过抑制成纤维细胞和巨噬细胞的糖酵解,破坏两者间的代谢串扰,从而减轻特发性肺纤维化的分子机制 首次发现黄芩素能同时靶向成纤维细胞和巨噬细胞的糖酵解通路,并揭示了一种新的代谢-细胞间信号轴在肺纤维化中的作用 研究基于小鼠模型,人类临床相关性尚需进一步验证;单细胞测序数据可能受样本量和技术限制 探究黄芩素在特发性肺纤维化中的治疗机制及细胞特异性效应 博来霉素诱导的小鼠特发性肺纤维化模型中的肺组织细胞 数字病理学 肺纤维化 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确样本数量的小鼠肺组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
33 2026-03-15
Sidaxue ameliorates rheumatoid arthritis by inhibiting synovial neutrophil migration: Insights from an integrated multi-omics analysis
2026-Mar-09, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1
研究论文 本研究通过整合多组学分析,揭示了苗药四达雪通过抑制RAC1/PAK1/LIMK1/Cofilin1信号轴来抑制滑膜中性粒细胞迁移和活化,从而改善类风湿关节炎的机制 首次将bulk RNA-seq、scRNA-seq与孟德尔随机化分析相结合,系统性地识别了RA中中性粒细胞迁移的关键通路,并验证了传统苗药四达雪对该通路的作用 研究主要基于胶原诱导的关节炎大鼠模型,其在人类RA中的完全转化性仍需进一步临床验证 评估苗药四达雪对类风湿关节炎中性粒细胞迁移的影响并揭示其分子机制 类风湿关节炎(RA)及其相关的滑膜中性粒细胞 多组学整合分析 类风湿关节炎 bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq (scRNA-seq), 孟德尔随机化分析, 超高效液相色谱-质谱联用, 分子对接, 分子动力学模拟 胶原诱导的关节炎大鼠模型 RNA测序数据、质谱数据、体外功能实验数据、体内模型表型数据 研究中使用了胶原诱导的关节炎大鼠模型进行体内验证,具体样本数量未在摘要中明确说明 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
34 2026-03-15
Single-cell RNA sequencing reveals the neuronal transcriptional differentiation program associated with ferroptosis-related heterogeneity in human hepatoblastoma
2026-Mar-07, Computational biology and chemistry IF:2.6Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了人肝母细胞瘤中与铁死亡相关异质性相关的神经元转录分化程序 首次在单细胞水平上结合铁死亡相关转录程序分析肝母细胞瘤的肿瘤异质性,并揭示了神经元肿瘤细胞中铁死亡程序的特定激活模式 研究依赖于公开数据集,样本量有限,且主要基于转录组数据,缺乏功能验证实验 探究肝母细胞瘤中铁死亡相关转录程序的失调及其与肿瘤异质性和神经元分化的关联 人肝母细胞瘤肿瘤样本、患者来源的异种移植模型及正常肝脏组织 数字病理学 肝母细胞瘤 单细胞RNA测序、批量转录组分析 监督学习方法、Slingshot伪时间轨迹分析 转录组数据 两个独立队列的批量转录组数据(GSE131329和GSE104766)及单细胞RNA测序数据(GSE180665,包含正常肝脏、异种移植模型和肿瘤样本) NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
35 2026-03-15
From antigen to atlas: A multi-omics, single-cell pipeline for discovering safe and effective CAR targets in ovarian cancer
2026-Mar-06, Critical reviews in oncology/hematology
综述 本文提出了一种用于卵巢癌CAR靶点发现与验证的多组学、单细胞整合分析流程 提出了一个结合多组学、单细胞技术和空间转录组学的综合性分析流程,并建立了一个三层同质性分级系统来指导CAR靶点的工程化策略 作为一篇综述,未提供原始实验数据验证,且流程的实际临床应用可行性有待进一步评估 为卵巢癌开发安全有效的CAR-T细胞疗法发现和验证靶点 卵巢癌肿瘤抗原及肿瘤微环境 数字病理学 卵巢癌 单细胞转录组学,空间转录组学,糖蛋白组学,免疫表型分析 NA 多组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学,bulk RNA-seq NA NA
36 2026-03-15
Amino acid metabolism-related model for prognosis and immunity in gastric cancer
2026-Mar-05, Amino acids IF:3.0Q3
研究论文 本研究构建了一个基于氨基酸代谢相关基因的胃癌预后模型,并探讨了其与免疫细胞浸润的关联 系统性地研究了胃癌中的氨基酸代谢重编程,构建了一个包含16个关键基因的预后模型,并通过单细胞RNA-seq数据集揭示了8个枢纽基因与免疫细胞的关联 研究主要基于公共数据库(TCGA和GEO)的回顾性数据,需要进一步的前瞻性临床研究验证 系统研究胃癌中的氨基酸代谢重编程,构建预后模型并验证其预测价值,以指导临床决策 胃癌细胞及肿瘤组织 生物信息学 胃癌 PCR, scRNA-seq, 生物信息学分析(GO, GSEA, GSVA, PPI网络) 预后模型 基因表达数据(RNA-seq, scRNA-seq) 基于TCGA和GEO数据库的胃癌样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
37 2026-03-15
Distinct NK Cell Signatures Define Prognosis in HPV-Positive Versus HPV-Negative Head and Neck Cancer
2026-Mar-05, Cancers IF:4.5Q1
研究论文 本研究通过分析头颈鳞状细胞癌的单细胞RNA测序数据,揭示了HPV状态如何差异性地调节肿瘤浸润自然杀伤细胞的功能,并识别了与预后相关的NK细胞亚群和可靶向的免疫逃逸轴 首次在头颈鳞状细胞癌中,基于HPV状态对肿瘤浸润NK细胞进行单细胞水平的全面表征,识别了HPV阳性肿瘤中特有的细胞毒性CX3CR1KLRB1 NK细胞亚群,并发现了HPV阴性肿瘤中CLEC2-KLRB1这一新的抑制性免疫检查点轴 研究样本量较小,且为回顾性分析;需要在前瞻性设计、解剖部位匹配的大规模队列中验证,以区分HPV特异性效应与解剖部位依赖的免疫微环境差异 阐明HPV阳性和阴性头颈鳞状细胞癌患者预后差异的免疫学机制,并寻找新的治疗靶点 头颈鳞状细胞癌患者肿瘤组织中的自然杀伤细胞 单细胞组学 头颈癌 单细胞RNA测序,免疫组织化学,生物信息学分析 伪时间轨迹推断,细胞间相互作用分析 单细胞RNA测序数据,组织切片图像,临床预后数据 28名HNSCC患者(10名HPV阳性,18名HPV阴性)用于scRNA-seq分析;10个FFPE组织切片用于IHC验证;TCGA-HNSC队列用于预后评估 NA 单细胞RNA-seq NA NA
38 2026-03-15
Single-cell profiling of tumor lineage plasticity and the immune microenvironment in transformed small cell lung cancer
2026-Mar-04, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了非小细胞肺癌向小细胞肺癌转化过程中的肿瘤细胞异质性和免疫微环境,揭示了干细胞样恶性细胞亚群和干扰素刺激基因阳性淋巴细胞在转化中的关键作用 首次在单细胞水平上系统描绘了肺癌转化过程中的谱系可塑性和免疫微环境变化,并发现了干细胞样恶性细胞亚群作为转化先驱力量,以及ISG+淋巴细胞通过I型干扰素促进神经内分泌分化的新机制 样本量相对有限(12例患者),且为横断面研究,难以追踪转化过程的动态变化 探究非小细胞肺癌向小细胞肺癌转化的分子机制和免疫微环境特征 肺癌患者肿瘤组织样本,包括5例肺腺癌、3例转化型小细胞肺癌和4例小细胞肺癌 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序,多重免疫荧光染色,体外细胞共培养实验 NA 单细胞转录组数据,免疫荧光图像数据 73,195个细胞来自12例患者(5例LUAD、3例T-SCLC、4例SCLC) NA 单细胞RNA-seq NA NA
39 2026-03-15
Identification of Novel Drug Targets for Pulmonary Arterial Hypertension through Integrated Plasma Proteomics
2026-Mar-03, Journal of proteome research IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过整合血浆蛋白质组学与遗传学数据,识别了与肺动脉高压(PAH)因果相关的血浆蛋白,并评估了其作为药物靶点的潜力 首次采用蛋白质组范围孟德尔随机化(PWMR)方法,结合多组学数据(包括scRNA-seq和分子对接),系统性地识别并验证了PAH的新药物靶点,强调了CASP10和NOTCH3的潜在治疗价值 研究主要基于遗传关联数据,缺乏直接的实验验证;PheWAS分析未发现经FDR校正后的显著不良反应关联,但可能受样本量或统计方法限制 识别肺动脉高压(PAH)的因果相关血浆蛋白,并评估其作为药物靶点的可行性 血浆蛋白质、肺动脉高压(PAH)相关遗传数据 生物信息学 心血管疾病 蛋白质组范围孟德尔随机化(PWMR)、贝叶斯共定位、SMR、分子对接、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、表型范围关联研究(PheWAS) NA 蛋白质组数据、基因组关联研究(GWAS)数据、scRNA-seq数据 整合了两个大型蛋白质组GWAS数据集和两个PAH GWAS数据集,具体样本量未在摘要中明确 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA NA
40 2026-03-15
Sihe Tufuling formula alleviates imiquimod-induced psoriasis-like skin lesions in mice by modulating the HIF-1 signaling pathway
2026-Mar-03, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1
研究论文 本研究探讨了四和土茯苓方及其主药土茯苓通过调节HIF-1信号通路缓解咪喹莫特诱导的小鼠银屑病样皮损的作用机制 首次结合转录组测序和单细胞RNA测序技术,系统揭示了四和土茯苓方及其主药土茯苓通过抑制HIF-1信号通路来缓解银屑病样皮损的分子机制 研究基于小鼠模型,其结论在人体中的适用性有待进一步验证 探究四和土茯苓方及其主药土茯苓的抗银屑病活性及其作用机制 咪喹莫特诱导的银屑病样小鼠模型 NA 银屑病 超高效液相色谱-质谱联用,转录组测序,单细胞RNA测序,基因敲低,免疫荧光,定量逆转录PCR NA 化学组分数据,组织病理学图像,基因表达数据 小鼠模型(具体数量未在摘要中明确说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
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