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当前共找到 41850 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-07-29 |
MatriCom, a single-cell RNA-sequencing data mining tool to infer cell-extracellular matrix interactions
2025-Jul-01, Journal of cell science
IF:3.3Q3
DOI:10.1242/jcs.263927
PMID:40501363
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研究论文 | 介绍MatriCom，一种从单细胞RNA测序数据推断细胞与细胞外基质相互作用的生物信息学工具 | 创建了首个包含25,000余条matrisome组件相互作用的数据库MatriComDB，并开发配套网络应用和R包，能够从单细胞RNA测序数据中系统推断ECM组件间及细胞群与ECM的相互作用 | 未提及具体限制 | 开发一种从单细胞RNA测序数据中推断细胞外基质相互作用的新工具 | 单细胞RNA测序数据中的细胞群与细胞外基质 | 计算机视觉 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 46个健康成人组织的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 22 | 2026-07-29 |
3D organoids containing endothelial and neural cells generation by serial inductions of differentiation on human iPSC-derived embryoid bodies
2025-May-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.20.653559
PMID:40475416
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研究论文 | 通过顺序诱导分化人类iPSC衍生的胚状体，生成包含内皮细胞和神经细胞的3D类器官 | 首次在无需外源添加内皮细胞或移植至动物的情况下，通过顺序诱导分化人类iPSC衍生胚状体，成功生成包含血管样结构的内皮细胞和神经细胞的3D类器官 | 未提及具体局限性 | 模拟体内神经和内皮细胞发育，构建包含内皮细胞的3D脑类器官，用于研究脑发育和神经感染性疾病 | 人类iPSC衍生的胚状体 | NA | 神经系统疾病 | scRNA-Seq, RNA-Seq,免疫染色,siRNA处理 | 3D类器官模型 | 基因表达数据,图像数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 23 | 2026-07-29 |
High-resolution reconstruction of cell-type specific transcriptional regulatory processes from bulk sequencing samples
2025-Apr-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.02.646189
PMID:40291712
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研究论文 | 介绍DeepDETAILS框架，利用深度学习从批量测序样本中重建细胞类型特异的高分辨率转录调控过程 | DeepDETAILS核心创新在于利用scATAC-seq参考库对其他批量数据集进行跨模态反卷积，实现碱基对精度的细胞类型特异基因组信号重建，传统统计方法无法比拟 | 依赖scATAC-seq参考库的可用性和质量，可能不适用于所有组织或细胞类型；对新兴转录测序和染色质修饰ChIP-seq数据的适用性需进一步验证 | 开发一种从批量测序样本中重建细胞类型特异基因组信号的高分辨率方法，以解析发育机制和疾病病因 | 39种人类组织和86种不同细胞类型的新生转录和组蛋白修饰信号 | 机器学习 | 原发性硬化性胆管炎 | 深度学习反卷积、scATAC-seq、新生转录测序（PRO-cap、PRO-seq）、ChIP-seq | 深度学习模型（DeepDETAILS） | 批量测序数据、scATAC-seq参考数据、新生转录数据、ChIP-seq数据 | 39种人类组织和86种细胞类型 | NA | 单细胞ATAC测序、批量RNA测序、ChIP-seq | NA | NA |
| 24 | 2026-07-29 |
Single-cell analysis of the epigenome and 3D chromatin architecture in the human retina
2025-Apr-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.28.630634
PMID:39764062
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研究论文 | 通过单细胞多组学分析绘制人类视网膜的表观基因组和三维染色质结构图谱 | 首次在单细胞水平上对人类视网膜的表观基因组和三维染色质结构进行综合分析，并利用深度学习预测非编码风险变异 | 未明确说明 | 研究人类视网膜中基因表达调控的表观遗传机制及与眼部疾病相关的非编码风险变异 | 人类视网膜、黄斑、视网膜色素上皮/脉络膜组织及其23个视网膜细胞亚类 | 数字病理学 | 视网膜疾病 | 单细胞多组学测序 | 深度学习预测模型 | 单细胞基因表达、染色质可及性、DNA甲基组、三维染色质结构数据 | 人类视网膜、黄斑和RPE/脉络膜样本（具体数量未说明） | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'测序和单细胞ATAC-seq, Illumina NovaSeq测序平台 |
| 25 | 2026-07-29 |
Molecular evidence for pre-chordate origins of ovarian cell types and neuroendocrine control of reproduction
2025-Mar-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.24.644836
PMID:40196654
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研究论文 | 利用海星作为非脊索动物后口动物代表，通过单细胞RNA测序和3D成像揭示卵巢细胞类型及其空间组织，为卵子发生和神经内分泌控制进化提供分子证据 | 首次在非脊索动物后口动物海星中发现与哺乳动物相似的卵原干细胞、颗粒样细胞和膜样细胞，并证实存在类似脊椎动物下丘脑-垂体-性腺轴的内在神经内分泌系统 | 未提供具体限制信息 | 探究卵巢细胞类型及其信号相互作用的进化起源 | 海星卵巢细胞类型 | 数字病理学 | 未涉及 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 海星卵巢组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序结合高分辨率3D成像 |
| 26 | 2026-07-29 |
Interleukin-1β Drives Disease Progression in Arrhythmogenic Cardiomyopathy
2024-Dec-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.11.628020
PMID:39763850
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研究论文 | 通过单核RNA测序和空间转录组学揭示IL-1β在致心律失常性心肌病疾病进展中的驱动作用 | 首次使用单核RNA测序和空间转录组学鉴定ACM患者心肌中的疾病相关空间微环境，并发现IL-1β作为潜在治疗靶点 | 未提及具体限制 | 探究IL-1β在致心律失常性心肌病发展中的作用及其作为治疗靶点的可能性 | ACM患者心肌样本和Desmoglein-2突变小鼠模型 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单核RNA测序和空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | ACM患者和对照捐献者的心肌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 27 | 2026-07-29 |
Magnetic soft microrobots for erectile dysfunction therapy
2024-12-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2407809121
PMID:39556757
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研究论文 | 开发了一种用于治疗勃起功能障碍的磁性软体微型机器人，通过递送间充质基质细胞并清除活性氧，改善细胞滞留和存活率 | 创新性地将超软水凝胶微球与磁性纳米粒子链结合，设计出能适应狭窄血管形态的微型机器人，同时具备活性氧清除功能，显著提高间充质基质细胞的递送效率和治疗效果 | 文中未明确提及局限性 | 开发新型磁性软体微型机器人，用于改善间充质基质细胞在勃起功能障碍治疗中的递送和存活 | 勃起功能障碍的大鼠和比格犬模型 | 机器人与再生医学 | 勃起功能障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 大鼠和比格犬勃起功能障碍模型样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 28 | 2026-07-29 |
IFN-γ-induced Th1-Treg polarization in inflamed brains limits exacerbation of experimental autoimmune encephalomyelitis
2024-11-26, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2401692121
PMID:39560646
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研究论文 | 本文揭示了IFN-γ在实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）期间极化调节性T细胞（Treg）为Th1型Treg（Th1-Treg）以减轻疾病的关键机制 | 首次阐明IFN-γ通过极化Treg为Th1-Treg来改善EAE，并利用单细胞RNA测序分析及交叉遗传学方法证明T细胞来源的IFN-γ在此过程中的关键作用 | NA | 探究IFN-γ与Treg在EAE中的关系及其对疾病改善的影响 | 小鼠EAE模型中的脑部Treg细胞、T细胞来源的IFN-γ及巨噬细胞 | 机器学习 | 多发性硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠EAE模型样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于分析脑部Treg细胞 |
| 29 | 2026-07-29 |
Differential developmental blueprints of organ-intrinsic nervous systems
2023-Dec-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.12.571306
PMID:38168446
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研究论文 | 本研究通过整合高分辨率全胚胎成像、单细胞基因组学、空间转录组学、蛋白质组学和生物信息学，揭示了肠神经系统和心脏内在神经系统在器官特异性组织形成中的不同发育蓝图 | 首次系统比较了肠神经系统与心脏内在神经系统的发育策略，发现心脏内在神经系统通过富集细胞外基质基因和中间神经元祖细胞状态实现稳定组织，而肠神经系统则高度迁移并定植整个胃肠道 | 未详细说明研究在人类或其他哺乳动物中的验证，以及具体样本量等实验细节 | 探究器官内在神经元如何实现器官特异性的分子和功能特化 | 小鼠胚胎的肠神经系统和心脏内在神经系统 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、蛋白质组学、高分辨率全胚胎成像 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、蛋白质组数据、成像数据 | 小鼠胚胎样本，具体数量未在摘要中提及 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 30 | 2026-07-29 |
Single cell RNA-seq in phytohormone signaling: a promising future
2023-11, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2023.07.010
PMID:37550122
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在植物激素信号传导研究中的应用前景 | 强调了scRNA-seq在解析激素介导的时空基因调控网络中的新机遇，并以Nolan等人的研究为例展示了时间序列scRNA-seq在识别油菜素内酯信号关键位点和细胞期转化网络中的创新应用 | NA | 探讨scRNA-seq技术在植物激素信号传导研究中的潜力和未来发展 | 植物激素信号传导中的单细胞转录组 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 31 | 2026-07-28 |
A salivary protein panel for detecting malignant transformation of oral leukoplakia
2026-Sep, Oral oncology
IF:4.0Q2
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研究论文 | 通过唾液蛋白质组学分析，识别出一个五蛋白组合用于检测口腔白斑的恶性转化 | 首次利用唾液蛋白质组学结合机器学习方法，开发出非侵入性的五蛋白生物标志物组合用于检测口腔白斑向口腔鳞状细胞癌的恶性转化 | 样本量相对较小（131例），且未在独立大样本队列中验证 | 探索基于唾液蛋白质组学的非侵入性方法以检测口腔白斑的恶性转化 | 口腔白斑患者和口腔白斑相关口腔鳞状细胞癌患者 | 机器学习 | 口腔癌 | 质谱蛋白质组学 | XGBoost, LASSO回归 | 蛋白质表达数据 | 131例（48例口腔白斑和83例口腔白斑相关口腔鳞状细胞癌患者） | NA | NA | NA | NA |
| 32 | 2026-07-28 |
Senescent CD4+ T Cells Drive Diabetic Periodontitis via JAK-STAT-ROS-p38 MAPK
2026-Aug, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345251400253
PMID:41408493
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研究论文 | 该研究揭示了衰老CD4+ T细胞通过JAK-STAT-ROS-p38 MAPK信号通路驱动糖尿病牙周炎进展的免疫病理机制 | 首次阐明衰老CD4+ T细胞在糖尿病牙周炎中的致病作用及其通过JAK-STAT-mtROS与TNF-α-p38 MAPK信号交叉对话促进炎症因子释放和骨丢失的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，可能存在物种差异；未明确衰老CD4+ T细胞在其他糖尿病并发症中的普遍性作用 | 探究糖尿病牙周炎中CD4+ T细胞的功能动态及其致病机制 | 糖尿病牙周炎模型小鼠的牙龈组织、CD4+ T细胞 | 机器学习 | 糖尿病牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 糖尿病牙周炎小鼠牙龈组织样本（具体数量未报告） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 33 | 2026-07-28 |
A self-perpetuating cycle of Type H vessel proliferation and T-2 induced inflammation drives KBD pathogenesis
2026-08, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2026.04.004
PMID:42000119
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研究论文 | 揭示H型血管增殖与T-2毒素诱导的炎症在Kashin-Beck病发病机制中的恶性循环 | 首次发现H型血管在Kashin-Beck病中作为关键介导因子，连接T-2毒素运输、炎症和软骨损伤，并揭示其增殖与炎症信号的恶性循环 | 未提及 | 研究H型血管在Kashin-Beck病发病机制中的潜在作用 | Kashin-Beck病大鼠模型 | 数字病理学 | 大骨节病 | 单细胞RNA测序，qPCR | NA | 基因表达数据 | 大鼠模型，分为安慰剂组、T-2组、T-2+Roxadustat组和T-2+Halofuginone组 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 未指定具体平台 |
| 34 | 2026-07-28 |
Metabolic Checkpoints in Cutaneous Squamous Cell Carcinoma: ACSL1 and PPARD Orchestrate Lipid-Ferroptosis Crosstalk via Keratinocyte Remodeling
2026-Aug, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-026-05734-6
PMID:42154143
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研究论文 | 本研究整合生物信息学和单细胞RNA测序分析，鉴定皮肤鳞状细胞癌中与铁死亡和脂质代谢相关的生物标志物ACSL1和PPARD，并揭示其通过角质形成细胞重塑协调脂质-铁死亡串扰的潜在机制 | 首次在皮肤鳞状细胞癌中通过单细胞转录组测序揭示ACSL1和PPARD在角质形成细胞分化过程中的动态表达模式，并提出其调控脂质-铁死亡串扰的新机制 | 研究仅揭示ACSL1/PPARD与脂质-铁死亡串扰的关联性，未建立因果关系，且缺乏蛋白水平和功能性验证 | 阐明皮肤鳞状细胞癌中铁死亡与脂质代谢紊乱的具体分子机制，识别关键生物标志物 | 皮肤鳞状细胞癌患者组织和细胞样本 | 数字病理学 | 皮肤鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR | NA | 基因表达数据, 转录组数据 | 临床皮肤鳞状细胞癌组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 35 | 2026-07-28 |
Decoding anemoside B4: Core mechanistic axes and an omics-to-atom paradigm
2026-Aug, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2026.108270
PMID:42217593
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研究论文 | 解析白头翁皂苷B4（AB4）的核心作用机制轴，并提出一种从组学到原子的新范式以突破传统分析方法的分辨率限制 | 识别出AB4的四种核心机制轴，并揭示其在不同疾病背景下对PI3K/Akt通路的矛盾双向调控现象，提出整合单细胞/空间转录组学、细胞类型特异性化学蛋白质组学、冷冻电镜和CRISPR功能基因组学的"组学到原子"范式以解析细胞异质性和动态药物-蛋白质相互作用 | 传统组织分析方法固有的分辨率上限掩盖了细胞类型特异性的相互作用组，无法解释AB4的矛盾双向调控 | 阐明AB4的精确分子机制，建立从组学到原子的研究范式以推动天然产物药理学向精准医学转型 | 白头翁皂苷B4（AB4）及其在不同疾病（炎症、肿瘤、病毒和代谢疾病）中的作用机制 | 机器学习 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 化学蛋白质组学, 冷冻电镜, CRISPR功能基因组学 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 36 | 2026-07-28 |
Targeting tumor‑associated macrophages in osteosarcoma: From molecular reprogramming to immuno-regenerative scaffolds
2026-Aug, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2026.108294
PMID:42285386
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综述 | 评估骨肉瘤中靶向肿瘤相关巨噬细胞的干预策略，重点关注从单型吞噬检查点阻断向多模式协同方案的转变，并探讨免疫再生支架等新型生物材料的发展 | 系统阐述骨肉瘤治疗中从传统免疫检查点阻断向多模式协同方案（如纳米医学、代谢应激诱导、药理学重编程）的范式转变，并首次聚焦免疫再生支架这一双功能生物材料在术后肿瘤清除与骨再生同步中的创新应用 | 未明确提及具体局限性，但作为综述可能受限于现有研究数据的时效性和临床转化验证的缺乏 | 评估骨肉瘤中肿瘤相关巨噬细胞靶向干预的研究进展，突破传统治疗瓶颈 | 骨肉瘤中的肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）及其M2样免疫抑制表型 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 空间转录组学, 仿生平台, 铁磁氧醇MRI, 高分辨率生物标志物（PSME2） | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 空间转录组学 | 不适用 | 空间转录组学用于绘制物理免疫排斥屏障和新型治疗亚群 |
| 37 | 2026-07-28 |
A spatial and temporal atlas of tubulin isotype gene expression during vertebrate embryonic development
2026-Aug, Molecular biology of the cell
IF:3.1Q3
DOI:10.1091/mbc.E26-03-0116
PMID:42275208
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研究论文 | 建立了脊椎动物胚胎发育过程中微管蛋白同型基因表达的时空图谱 | 首次在脊椎动物胚胎中系统解析了α-和β-微管蛋白同型基因在神经嵴上皮间充质转化和分化过程中的空间表达模式 | 需要进一步研究验证这些转录模式与微管蛋白组成的关联性 | 阐明微管蛋白同型基因在脊椎动物胚胎发育过程中细胞状态转变时的表达调控 | 鸡胚神经嵴细胞及其相关细胞类型 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 荧光原位杂交链式反应 | NA | 基因表达数据 | 公开可用的单细胞RNA测序数据集及鸡胚发育阶段样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 38 | 2026-07-28 |
Crosstalk between ion homeostasis and lipid peroxidation: Mechanisms and translational opportunities in regulated cell death
2026-Aug, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2026.108308
PMID:42315070
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综述 | 系统性综述了离子稳态与脂质过氧化在调节性细胞死亡中的交叉对话机制及其转化医学潜力 | 提出脂质过氧化作为金属催化氧化应激与离子通道介导的细胞器功能障碍的核心生化交汇点，并揭示肿瘤免疫微环境中离子驱动RCD的双重作用 | 未涉及体内实时离子动态监测技术的具体验证数据 | 解析离子稳态与脂质过氧化的交互机制，为肿瘤、心血管及神经疾病的治疗提供新靶点 | 调节性细胞死亡（铁死亡、铜死亡、焦亡、凋亡）中的离子信号网络 | 机器学习 | 心血管疾病, 肿瘤 | NA | NA | 综述文献 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 39 | 2026-07-28 |
Single-cell analysis reveals crosstalk between TREM1-positive myeloid cells and cancer-associated fibroblasts in colorectal cancer progression
2026-Aug, Journal of gastroenterology
IF:6.9Q1
DOI:10.1007/s00535-026-02430-4
PMID:42045486
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示结直肠癌中TREM1阳性髓系细胞与癌相关成纤维细胞之间的交互作用 | 首次系统性描绘TREM1阳性髓系细胞与ACTA2阳性癌相关成纤维细胞在结直肠癌微环境中的双向通讯机制，并发现TREM1-SPP1轴是潜在治疗靶点 | 样本量较小（仅8例配对样本），且主要依赖生物信息学分析推断细胞间相互作用 | 解析结直肠癌肿瘤微环境中基质-免疫细胞的交互作用机制 | 结直肠癌患者的肿瘤组织及配对正常黏膜组织中的髓系细胞和成纤维细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 8例结直肠癌患者的配对肿瘤和正常黏膜样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 平台 |
| 40 | 2026-07-28 |
The Impact of Ageing on Skeletal Muscle: Roles of Mitochondrial Dysregulation, Systemic Communication, and Exercise
2026-Aug, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.70212
PMID:42503896
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综述 | 探讨衰老对骨骼肌的影响，包括线粒体失调、系统通讯和运动的作用 | 综合讨论了从细胞自主代谢失调到局部和全身细胞环境年龄相关变化的过程，并强调了运动对肌肉组织健康的重要作用以及新兴技术（如人类肌肉图谱和空间转录组学）在识别新型生物标志物和治疗靶点中的应用 | 作为综述，未提供原创实验数据，可能未涵盖所有最新研究进展 | 总结当前对衰老过程中肌少症和肌肉修复效率低下的认识，并探索运动干预的作用 | 衰老过程中的骨骼肌及其再生能力 | 数字病理学 | 老年疾病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |