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当前共找到 37491 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-03-18 |
A malignant subpopulation of H2AFZ+ cells interacts with myeloid cells to promote an anti-inflammatory microenvironment and drive hepatic metastasis, revealing an immunotherapeutic strategy for pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Mar-16, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-3359
PMID:41837750
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据，揭示了胰腺导管腺癌中与肝转移相关的恶性亚群及其与免疫抑制微环境的相互作用，并提出了针对PDCD1和LAG3的联合免疫治疗策略 | 识别出与肝转移风险相关的恶性亚群H2AFZ+细胞，并发现其在肝转移中促进抗炎微环境，首次提出针对PDCD1和LAG3的联合疗法在转移性PDAC小鼠模型中有效抑制肿瘤生长 | 研究主要基于测序数据和动物模型，临床转化效果需进一步验证，且样本来源和数量可能限制结论的普适性 | 阐明胰腺导管腺癌肝转移的细胞和分子机制，并开发新的治疗策略 | 胰腺导管腺癌患者的原发肿瘤和肝转移组织，以及小鼠转移模型 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 免疫组织化学 | NA | RNA测序数据, 图像数据 | 数百名患者的组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 22 | 2026-03-18 |
Size-Modulated Mesoderm-Endoderm Divergence and Myocardial Cavitation in Micropatterned Cardioids
2026-Mar-16, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202515661
PMID:41837870
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研究论文 | 本研究利用微图案化心脏类器官模型，结合单细胞RNA测序等技术，探索了中胚层与内胚层在心脏发育过程中的协同发育机制 | 首次将微图案化心脏类器官、CRISPR工程化报告hiPSCs、深层组织成像和单细胞RNA测序整合，系统研究中胚层-内胚层协同发育，并发现微图案尺寸可调控类器官腔化及功能 | 模型仍为体外简化系统，可能无法完全模拟体内复杂的胚胎微环境及长期发育过程 | 探究心脏发育过程中中胚层与内胚层之间的信号互作及协同发育机制 | 人类诱导多能干细胞（hiPSCs）衍生的微图案化心脏类器官 | 发育生物学与类器官模型 | 心血管发育 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、CRISPR基因编辑、深层组织成像、轨迹分析（PHATE） | 类器官模型 | 单细胞转录组数据、成像数据 | 未明确提及具体样本数量，但基于hiPSCs衍生的类器官进行实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 23 | 2026-03-18 |
Integrated Single-Cell and Spatial Transcriptomics Reveal Cell-Type-Specific Immune Regulatory Networks in Maize Responding to Southern Corn Rust
2026-Mar-16, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202512295
PMID:41837846
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研究论文 | 本研究通过整合单核RNA测序和空间转录组测序，揭示了玉米在应对南方锈病早期感染过程中的细胞类型特异性免疫调控网络 | 首次在玉米中整合单核RNA测序和空间转录组技术，构建了高分辨率的时空防御图谱，并鉴定出关键易感基因ZmXET1和抗性基因ZmRBG | 研究仅关注早期感染阶段（24和48小时），未涵盖整个病程；功能验证仅通过病毒诱导的基因沉默进行，可能需要更多遗传学证据 | 阐明玉米在南方锈病感染过程中的细胞类型特异性防御机制 | 玉米叶片细胞在Puccinia polysora感染下的转录动态 | 植物病理学与单细胞组学 | 南方玉米锈病 | 单核RNA测序（snRNA-seq）、空间转录组测序（stRNA-seq）、病毒诱导基因沉默（VIGS） | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 在感染后24小时和48小时采集的玉米叶片样本 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 24 | 2026-03-18 |
Integrative bibliometrics and spatial transcriptomics identify CAF-associated genes and immune niches in hepatocellular carcinoma
2026-Mar-16, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04694-x
PMID:41838222
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 25 | 2026-03-18 |
SAD: Sparse-Aware Diffusion Model for Single-Cell Gene Expression Completion
2026-Mar-16, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3674362
PMID:41838515
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研究论文 | 本文提出了一种名为SAD的扩散模型，用于完成单细胞RNA测序数据中的基因表达，以解决数据稀疏性问题 | 首创了针对scRNA-seq的基因完成任务，并提出了一个专门为极稀疏数据设计的扩散框架，能够在高缺失率下完成基因并纠正稀疏性偏差 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中基因覆盖不全和大量技术性零值的问题，为下游任务提供更完整、可靠的数据基础 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 扩散模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 26 | 2026-03-18 |
A benchmark of semi-supervised scRNA-seq integration methods in real-world scenarios
2026-Mar-16, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014008
PMID:41838767
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研究论文 | 本文首次在真实场景下系统性地比较了半监督与无监督单细胞RNA测序整合方法 | 首次在真实条件下系统评估半监督方法对不完美细胞类型标签的鲁棒性，并考察了四种额外现实场景 | 研究仅基于六个数据集，且未涉及最新的半监督方法 | 评估半监督单细胞RNA测序整合方法在真实场景中的性能与鲁棒性 | 单细胞RNA测序数据整合方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | scANVI, ssSTACAS | 单细胞RNA测序数据 | 六个不同数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 27 | 2026-03-18 |
singIST: An integrative method for comparative single-cell transcriptomics between disease models and humans
2026-Mar-16, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014002
PMID:41838773
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研究论文 | 本文介绍了一种名为singIST的计算方法，用于疾病模型与人类条件之间的比较单细胞转录组学分析 | 提出了一种可解释且通用的单细胞分辨率方法，用于量化评估疾病模型与人类疾病的相似性，整合了基因同源性、细胞类型存在、基因重要性及基因表达变化等多个因素 | 方法主要基于转录组数据，可能未涵盖其他分子层面的差异；在模拟研究中仅与基于重叠差异表达基因的基线方法进行了比较 | 开发一种计算工具，以评估疾病模型在单细胞水平上与人类疾病的分子相似性，辅助药物发现中的模型选择 | 疾病模型（如小鼠模型）和人类疾病条件（如特应性皮炎和化脓性汗腺炎） | 单细胞转录组学 | 特应性皮炎，化脓性汗腺炎 | 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 28 | 2026-03-18 |
From noise to models to numbers: Evaluating negative binomial models and parameter estimations in single-cell RNA-seq
2026-Mar-16, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014014
PMID:41838800
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研究论文 | 本文通过计算高效的模型选择技术，评估了负二项分布模型在单细胞RNA测序数据中的适用性及其参数估计的准确性 | 揭示了负二项分布在不同参数区间内近似模拟数据的条件，并指出其在缺乏转录爆发时仍广泛适用 | 参数估计在稳态条件下可能具有较大的相对误差，即使经过技术噪声校正 | 评估负二项分布模型在单细胞RNA测序数据中的拟合效果和参数估计的可靠性 | 单细胞RNA测序数据中的转录计数分布 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 负二项分布、Beta-Poisson、Poisson | 转录计数数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 29 | 2026-03-18 |
Lysine attenuates acute lung injury by restoring α-tubulin acetylation and ciliary activity
2026-Mar-16, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-026-03025-x
PMID:41839843
|
研究论文 | 本研究揭示了赖氨酸通过恢复α-微管蛋白乙酰化和纤毛活性来减轻急性肺损伤的机制 | 首次发现赖氨酸在急性肺损伤中通过补充乙酰辅酶A、恢复α-微管蛋白乙酰化、挽救纤毛TRPC1定位，从而协调代谢与结构修复的新机制 | 研究主要基于小鼠和非人灵长类动物模型，人类临床转化效果仍需进一步验证 | 探究氨基酸代谢在急性肺损伤肺泡上皮修复中的作用 | 急性肺损伤（ALI）模型中的肺上皮细胞，特别是SFTPC+肺泡上皮II型（AT2）细胞 | NA | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、靶向血浆代谢组学 | NA | 基因表达数据、代谢物数据 | 人类ALI样本和小鼠及非人灵长类ALI模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 30 | 2026-03-18 |
Dynamics of phage-host interactions in Bacteroides fragilis resolved by single-cell transcriptomics
2026-Mar-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70381-8
PMID:41839859
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研究论文 | 本研究利用细菌单细胞RNA测序技术，分析了约50,000个感染裂解噬菌体的脆弱拟杆菌细胞的转录组，揭示了噬菌体-宿主相互作用的动态过程及细菌防御机制 | 首次将细菌单细胞RNA测序应用于噬菌体-宿主相互作用研究，量化了单个细菌细胞中噬菌体感染的异步进程，并发现了未感染细菌的表型亚群及其防御相关基因表达 | 研究仅针对一种人类病原共生菌（脆弱拟杆菌）和一种裂解噬菌体，样本来源和感染条件可能限制结果的普适性 | 探究噬菌体与宿主细菌相互作用的动态过程及细菌防御机制 | 脆弱拟杆菌（Bacteroides fragilis）及其感染的裂解噬菌体 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 约50,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 31 | 2026-03-18 |
Illuminating cell states by a comprehensive and interpretable single cell foundation model
2026-Mar-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70071-5
PMID:41839876
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研究论文 | 本文介绍了一个名为CellVQ的综合可解释单细胞基础模型，旨在解决单细胞数据稀疏性、异质性和可解释性差的问题 | 提出了CellVQ模型，包含单细胞离散化（SCD）模块以有效表示细胞嵌入，并引入了CellVQ-Graph插件工具，用于构建知识图谱以促进生物学发现 | 未明确提及具体限制，但可能涉及模型在更广泛或更复杂数据集上的泛化能力验证 | 开发一个适用于细胞生物学社区的可应用和可泛化的AI工具，以增强单细胞数据的表示和解释 | 单细胞数据，包括基因、细胞通信和注释等多模态信息 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 基础模型 | 单细胞数据 | 6800万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 32 | 2026-03-18 |
Single-cell multi-omic analysis of mitochondrial mutational mosaicism and dynamics
2026-Mar-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70399-y
PMID:41839886
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研究论文 | 本研究利用单细胞多组学技术分析线粒体DNA突变镶嵌现象和动态变化 | 引入了两个新指标scmtMPM和scwMSS来量化单细胞水平的线粒体DNA突变负荷和体细胞镶嵌现象 | 研究主要基于POLG敲入的HEK293细胞系和有限的人类样本，可能无法完全代表所有线粒体疾病类型 | 探究线粒体DNA突变的细胞异质性和体细胞镶嵌现象 | POLG敲入HEK293细胞系、健康供体和线粒体病患者样本 | 单细胞组学 | 线粒体病 | 单细胞ATAC-seq | NA | 单细胞表观基因组数据 | POLG细胞系及人类供体/患者样本（具体数量未明确） | NA | 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 33 | 2026-03-18 |
FineST: contrastive learning integrates histology and spatial transcriptomics for nuclei-resolved ligand-receptor analysis
2026-Mar-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70528-7
PMID:41839892
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研究论文 | FineST是一种深度对比学习模型，通过整合组织学图像和空间转录组数据，实现高分辨率RNA表达估算和细胞间通讯模式分析 | 首次利用组织学基础模型融合空间转录组和组织学图像，实现核级分辨率的配体-受体相互作用分析 | 方法依赖于组织学图像的可用性，且在数据稀疏性极高的情况下可能仍有局限性 | 开发一种整合组织学与空间转录组数据的深度学习方法，以提升细胞间通讯分析的精度 | 结直肠癌和乳腺癌的空间转录组数据，包括VisiumHD和Xenium平台生成的数据 | 数字病理学 | 结直肠癌, 乳腺癌, 鼻咽癌, 肝细胞癌 | 空间转录组学, 深度对比学习 | 对比学习模型 | 空间转录组数据, 组织学图像 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | VisiumHD, Xenium | 10x VisiumHD, 10x Xenium |
| 34 | 2026-03-18 |
Single-cell transcriptomics reveals heterogeneity and immune microenvironment in lymphatic metastasis of head and neck squamous cell carcinoma
2026-Mar-16, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-026-00392-4
PMID:41839993
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学分析头颈部鳞状细胞癌淋巴转移的异质性和免疫微环境 | 首次对头颈部鳞状细胞癌的淋巴结转移组织和正常淋巴结组织进行单细胞RNA测序比较分析，揭示了与肿瘤发生和转移相关的特定细胞亚群 | 样本量相对较小（7个转移组织和5个非转移组织），可能限制统计功效和普遍性 | 探究头颈部鳞状细胞癌淋巴转移的细胞异质性和免疫微环境特征 | 头颈部鳞状细胞癌患者的淋巴结转移组织和非转移淋巴结组织 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 预后模型（基于基因表达） | 单细胞转录组数据 | 7个淋巴转移组织和5个非转移组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 35 | 2026-03-18 |
Decoding clone evolution in HER2 amplified breast cancer through single-cell and spatial transcriptomics analysis of copy number variations
2026-Mar-16, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-44476-7
PMID:41840060
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 36 | 2026-03-18 |
Spatial transcriptomic map of the mouse urinary bladder
2026-Mar-16, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-42931-z
PMID:41840076
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研究论文 | 本研究利用Visium HD技术构建了小鼠膀胱的空间转录组图谱，以近单细胞分辨率揭示了膀胱主要组织区域的基因表达模式 | 首次以8×8微米分辨率绘制小鼠膀胱空间转录组图谱，发现平滑肌存在四个空间簇，与传统单细胞RNA测序的单簇识别形成对比 | 研究仅基于小鼠模型，未涉及人类膀胱组织；空间分辨率虽高但未达到完全单细胞水平 | 构建小鼠膀胱的空间转录组图谱以补充传统组织学和单细胞RNA测序的不足 | 小鼠膀胱组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组测序 | NA | 空间转录组数据 | 66,471个空间区域（bins）和9,364个基因 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium HD | Visium HD技术，使用8×8微米空间区域 |
| 37 | 2026-03-18 |
SPP1high fibrogenic macrophages mediate protective fibrotic remodeling and promote vascular stability in hypertension-associated aortic dissection
2026-Mar-16, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-026-04798-9
PMID:41840626
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术，揭示了高血压相关主动脉夹层中SPP1高表达纤维化巨噬细胞在促进血管稳定性和保护性纤维化重塑中的关键作用 | 首次识别并验证了SPP1高表达纤维化巨噬细胞在主动脉夹层中的保护性作用，并揭示了TGF-β1-SPP1轴在驱动这一修复性髓系程序中的机制 | 样本量相对较小（每组3例主动脉样本），且部分患者配对样本有限（n=10），可能影响结果的普遍性 | 旨在识别与血管完整性相关的巨噬细胞状态，并探索其在高血压相关主动脉夹层中的机制和治疗潜力 | 高血压相关主动脉夹层、马凡综合征相关主动脉夹层患者及健康捐赠者的主动脉组织、外周血和撕裂邻近血液样本 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、ELISA | NA | 单细胞RNA测序数据、流式细胞数据、血清细胞因子数据 | 主动脉样本每组3例，血液样本每组30例，配对撕裂邻近样本10例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 38 | 2026-03-18 |
A cross-scale multimodal framework identifies clinically actionable immunotherapy biomarkers in melanoma through bulk to single-cell and spatial transcriptomics integration
2026-Mar-16, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-026-00919-w
PMID:41840725
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 39 | 2026-03-18 |
BGN/MDK Axis in the Melanoma Tumor Microenvironment Strengthens Tumor Malignancy by Modulating Cancer Cells and Cancer-Associated Fibroblasts Crosstalk
2026-Mar-15, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202514590
PMID:41833003
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研究论文 | 本研究揭示了黑色素瘤肿瘤微环境中BGN/MDK轴通过调控癌细胞与癌症相关成纤维细胞的相互作用，增强肿瘤恶性程度的关键机制 | 首次发现m6A修饰蛋白协同上调BGN表达，并阐明BGN通过AEBP1调控MDK信号通路，驱动CAFs激活并减少CD8⁺ T细胞浸润的空间转录组学证据 | 研究主要基于体外/体内实验和测序分析，临床样本验证和长期疗效数据尚不充分 | 探究黑色素瘤肿瘤微环境中BGN的功能及其调控CAFs形成的分子机制 | 黑色素瘤细胞、癌症相关成纤维细胞、正常成纤维细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 体外/体内实验, 功能分析, 分子检测 | NA | 转录组数据, 空间表达数据, 单细胞数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 40 | 2026-03-18 |
Exosomal Rspondin3 serves as a master regulator of immunometabolic repair in sepsis: synergistic activation of macrophage M2 polarization and endothelial BMP10 signaling
2026-Mar-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116372
PMID:41839470
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研究论文 | 本研究揭示了内皮祖细胞来源的外泌体中的Rspondin3（Rspo3）是脓毒症中免疫代谢修复的关键调控因子，能协同调控巨噬细胞M2极化和内皮修复 | 首次发现Rspo3作为脓毒症中巨噬细胞-内皮轴的关键调控因子，并阐明其通过协同激活巨噬细胞M2极化（Wnt/β-catenin通路）和内皮细胞BMP10信号通路来促进免疫代谢修复的双重机制 | 研究主要基于LPS诱导的脓毒症模型，人体内的复杂病理环境可能有所不同；外泌体疗法的临床转化仍需进一步验证 | 探究脓毒症诱导的急性肺损伤中免疫细胞与血管细胞相互作用的分子机制，并寻找新的治疗靶点 | 内皮祖细胞来源的外泌体、巨噬细胞、内皮细胞、LPS诱导的脓毒症模型 | 单细胞组学 | 脓毒症/急性肺损伤 | 单细胞RNA测序、代谢组学 | NA | 基因表达数据、代谢数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |