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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-03-14 |
Transcriptome profiling of peripheral blood for inflammatory subtype classification and diagnostic model construction in asthma
2026-Mar-13, The Journal of asthma : official journal of the Association for the Care of Asthma
DOI:10.1080/02770903.2026.2633354
PMID:41732097
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研究论文 | 本研究利用外周血转录组学数据识别哮喘的炎症亚型,并通过多层次验证推导候选生物标志物 | 整合了bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据,结合WGCNA和共识聚类方法识别哮喘炎症亚型,并通过单细胞水平映射和qRT-PCR验证关键基因 | 研究主要基于公开数据集,且qRT-PCR验证仅在LPS刺激的THP-1衍生巨噬细胞样模型中进行,未涉及临床样本验证 | 识别哮喘的炎症亚型并构建诊断模型 | 哮喘患者的外周血转录组数据 | 自然语言处理 | 哮喘 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qRT-PCR | LASSO回归, SVM-RFE | 转录组数据 | 基于公开数据集GSE69683和GSE172495,具体样本数量未明确说明 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 22 | 2026-03-14 |
Cytoskeletal remodeling promotes tunneling nanotube formation and drives cardiac resident cell mitochondrial transfer in sepsis
2026-Mar-13, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adz3266
PMID:41811940
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研究论文 | 本研究揭示了脓毒症中隧道纳米管(TNTs)作为促进线粒体转移的动态纳米结构,及其在心脏重塑中的关键作用 | 首次发现Drp1驱动的细胞骨架重塑调控TNT形成,并阐明其在脓毒症心脏细胞间线粒体转移中的核心机制 | 研究主要基于小鼠CLP模型,人类临床样本验证尚需进一步开展 | 探究脓毒症诱导心脏功能障碍的纳米尺度细胞间通讯机制 | 小鼠心脏内皮细胞、成纤维细胞、巨噬细胞及其亚群 | 细胞生物学与纳米医学 | 脓毒症相关心脏功能障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠CLP模型样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 23 | 2026-03-14 |
miR-203 facilitates timely cell fate transitions via epigenetic modulation during early embryogenesis
2026-Mar-13, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adr1776
PMID:41811946
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研究论文 | 本研究通过基因工程小鼠模型和单细胞RNA测序,揭示了miR-203在小鼠早期胚胎植入前发育中作为关键调节因子,通过表观遗传调控促进细胞命运及时转变 | 首次在严格体内方法中识别miR-203为早期哺乳动物胚胎发生中发育过渡的关键调节因子,并揭示其通过靶向组蛋白乙酰化酶如EP300来调控表观遗传重编程 | 研究主要基于小鼠模型,结果在人类或其他哺乳动物中的普适性尚未验证,且机制探索可能仅部分解释了miR-203的作用 | 探究microRNAs在早期哺乳动物胚胎发生中如何调节最早的发育过渡,特别是细胞命运获取和谱系分离 | 小鼠早期胚胎,特别是植入前胚胎,以及相关的基因工程小鼠模型 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,表观遗传分析 | NA | 转录组数据,表观遗传数据 | 未明确指定样本数量,但涉及基因工程小鼠模型和早期胚胎 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 24 | 2026-03-14 |
Type 2 lymphocytes restrict type 3 lymphocytes during liver fibrosis and colocalize in fibroblast niches
2026-Mar-13, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aea6805
PMID:41811951
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研究论文 | 本研究通过小鼠肝损伤和纤维化模型,结合三维显微镜和空间转录组学,揭示了2型淋巴细胞(T2Ls)与3型淋巴细胞(T3Ls)在肝纤维化过程中的空间相互作用及其对成纤维细胞微环境的调控机制 | 意外发现T2Ls(主要是ILC2s)通过限制T3Ls(主要是γδ T细胞)来调节肝纤维化,而非传统认为的促进纤维化,并揭示了淋巴细胞与成纤维细胞微环境之间的空间关联性交叉对话 | 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类肝纤维化;空间转录组学技术可能受分辨率限制,影响细胞类型识别的精确性 | 探究T2Ls和T3Ls在肝纤维化中的空间定位如何影响器官重塑,特别是它们与成纤维细胞微环境的相互作用 | 小鼠肝损伤和纤维化模型中的T2Ls(如ILC2s)、T3Ls(如γδ T细胞)、成纤维细胞和肌成纤维细胞 | 空间转录组学 | 肝纤维化 | 三维显微镜,空间转录组学 | NA | 图像,空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 25 | 2026-03-14 |
Systematic evaluation of single-cell multimodal data integration enhances cell type resolution and discovery of clinically relevant states in complex tissues
2026-Mar-13, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04002-4
PMID:41821037
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研究论文 | 本文系统评估了单细胞多模态数据整合策略,以肾脏为例,通过整合scRNA-seq和snATAC-seq数据,提升细胞类型分辨率并发现临床相关状态 | 开发了可解释的机器学习工具scOMM,用于对齐细胞身份并进行一致比较,同时通过水平和垂直整合策略,首次在肾脏图谱中检测到WFDC2表达的厚升支和Norn细胞等罕见细胞类型 | 研究主要聚焦于肾脏皮质,且样本来自19名捐赠者,可能限制结果的普遍性,未涉及其他复杂组织的广泛验证 | 评估单细胞多模态数据整合策略,以增强复杂组织中细胞类型的分辨率和发现临床相关状态 | 肾脏皮质组织,包括119,744个高质量细胞核/细胞,来自19名捐赠者 | 单细胞分析 | NA | scRNA-seq, snRNA-seq, snATAC-seq | 机器学习 | 单细胞多模态数据 | 119,744个高质量细胞核/细胞,来自19名捐赠者 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 26 | 2026-03-14 |
Monocytes Defined by Platelet Interactions and Oxidative Stress Signaling Underlie HIV-Associated Atherosclerosis
2026-Mar-13, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.125.046482
PMID:41823228
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和血浆微粒蛋白质组学分析,揭示了HIV感染者中特定单核细胞亚群(如血小板-单核细胞复合物)通过炎症、氧化应激和内皮功能障碍促进动脉粥样硬化的机制 | 首次在HIV相关动脉粥样硬化背景下,结合单细胞RNA测序和血浆微粒蛋白质组学,鉴定出血小板-单核细胞复合物这一特定单核细胞亚群,并阐明其通过促进内皮间质转化和氧化应激信号通路加速血管病理的独立作用 | 样本量相对较小(32名个体),且研究主要聚焦于早期HIV相关动脉粥样硬化,可能无法完全代表晚期疾病或更广泛人群的情况 | 探究HIV感染者中特定单核细胞亚群如何促进早期动脉粥样硬化的血管病理机制 | HIV感染者和非感染者的循环单核细胞,以及血小板-单核细胞复合物 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 血浆微粒蛋白质组学, 逆转录定量聚合酶链反应, 流式细胞术, ELISA | 监督学习 | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组学数据, 流式细胞术数据 | 32名个体(按HIV和动脉粥样硬化状态分层),共分析123,965个循环单核细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 27 | 2026-03-14 |
Maternal obesity induces activator protein 1-mediated inflammatory response to impair embryonic neurogenesis
2026-Mar-13, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP289326
PMID:41823327
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研究论文 | 本研究探讨母体肥胖如何通过激活蛋白1介导的炎症反应损害胚胎神经发生 | 首次结合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序揭示母体肥胖通过AP-1转录因子增强炎症基因可及性,直接抑制神经发生关键因子 | 研究基于小鼠模型,人类胚胎中的直接验证尚需进一步研究 | 阐明母体肥胖影响胎儿神经发育的分子机制 | 母体肥胖小鼠模型中的胚胎(E11.5和E13.5) | 发育生物学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, Gene Ontology分析 | 小鼠模型 | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | 未明确样本数量,但使用E11.5和E13.5胚胎 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 28 | 2026-03-14 |
A global screen for magnetically induced neuronal activity in the pigeon brain
2026-Mar-12, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aea6425
PMID:41264677
|
研究论文 | 本研究通过全脑活动图谱、组织透明化和光片显微镜技术,揭示了鸽子大脑中由磁场刺激激活的神经元群体及其分子机制 | 首次在全脑范围内无偏倚地识别了鸽子大脑中受磁场激活的神经元群体,并发现半规管嵴中存在表达电磁感应检测分子机制的特化II型毛细胞 | 研究主要聚焦于鸽子模型,其发现是否适用于其他磁感应动物仍需进一步验证 | 探究动物感知地球磁场的神经环路和分子机制 | 鸽子大脑神经元群体及半规管嵴毛细胞 | 神经生物学 | NA | 全脑活动图谱、组织透明化、光片显微镜、单细胞RNA测序 | NA | 图像数据、转录组数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 29 | 2026-03-14 |
Multistep genomics on single cells and live cultures in subnanoliter capsules
2026-Mar-12, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.ady7209
PMID:41411409
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研究论文 | 本研究开发了一种名为CAGEs的胶囊技术,用于在亚纳升尺度上对单细胞和活体培养进行多步基因组学分析 | CAGEs胶囊技术允许在保持细胞和大型分析物选择性的同时,实现培养基、酶和试剂的自由访问,从而支持高通量多步活细胞与全基因组读出的结合 | 未明确提及具体的技术限制,但可能涉及胶囊制备的复杂性或特定应用场景的适应性 | 开发一种能够支持高通量多步基因组学分析的技术平台,扩展单细胞高通量测量的现有方法并延伸至活细胞检测 | 单细胞和活体培养 | 基因组学 | NA | 单细胞测序,全基因组读出 | NA | 转录组数据 | 数万个扩展克隆 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 30 | 2026-03-14 |
Integrated intraocular-plasma proteomics reveals conserved biomarkers for diabetic retinopathy progression: a multi-fluid biopsy study
2026-Mar-12, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-026-06708-3
PMID:41817688
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研究论文 | 本研究通过整合眼内液和血浆蛋白质组学,识别了糖尿病视网膜病变进展的保守生物标志物,特别是神经丝轻链(NFL) | 首次结合多流体活检(眼内液和血浆)和高通量蛋白质组学,识别出跨阶段保守的生物标志物NFL,并验证其在血浆中的可检测性和临床预测价值 | 样本量相对较小(发现数据集n=32),且主要基于特定人群(广东和美国数据集),可能需要更广泛验证 | 识别糖尿病视网膜病变进展的微创生物标志物,以跟踪疾病全程 | 糖尿病患者的眼内液、血浆样本以及氧诱导视网膜病变小鼠模型 | 生物信息学 | 糖尿病视网膜病变 | 高通量蛋白质组学(SomaScan v4.1)、单细胞RNA-seq、时间轨迹软聚类 | NA | 蛋白质组数据、单细胞RNA-seq数据、临床数据 | 发现数据集32例(广东DR多组学研究),验证数据集来自UK Biobank(n=2495) | SomaLogic | 高通量蛋白质组学 | SomaScan v4.1 | SomaScan v4.1平台用于蛋白质组分析 |
| 31 | 2026-03-14 |
Glioma-Immune crosstalk in the tumor microenvironment: mechanistic insights and therapeutic translation
2026-Mar-12, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-026-03239-0
PMID:41817826
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综述 | 本文综述了胶质瘤肿瘤微环境中胶质瘤细胞与免疫细胞之间的相互作用机制,并探讨了其对免疫治疗反应的影响及治疗策略的转化 | 强调了空间转录组学和蛋白质组学在揭示胶质瘤分子区域异质性方面的进展,并指出多区域、纵向采样对于捕捉肿瘤演变和指导个性化免疫治疗的重要性 | 目前研究主要集中于肿瘤相关巨噬细胞,对其他免疫细胞亚群的研究尚不充分,且放疗和化疗对免疫细胞动态及治疗耐药性的影响仍未完全阐明 | 探讨胶质瘤肿瘤微环境中肿瘤-免疫串扰的机制,并寻求更有效的个性化治疗策略 | 胶质瘤及其肿瘤微环境中的免疫细胞(如调节性T细胞、肿瘤相关巨噬细胞) | 数字病理学 | 胶质瘤 | 空间转录组学,空间蛋白质组学 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学,空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 32 | 2026-03-14 |
Single-cell Analysis of Human Kidney Biopsy Tissue Reveals Epithelial and Immune Cell Responses to BK Polyomavirus Infection
2026-Mar-12, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.198227
PMID:41818285
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析人类肾移植活检组织,揭示了BK多瘤病毒感染期间上皮细胞和免疫细胞的反应机制 | 首次在单细胞分辨率下描述了BK多瘤病毒感染期间肾移植组织中的细胞类型特异性反应,包括代谢适应和免疫激活,这些在体外培养模型中未观察到 | 研究为横断面设计,无法确定因果关系;样本量有限;体外模型缺乏先天和适应性免疫系统,可能限制与体内结果的直接比较 | 探究BK多瘤病毒感染导致肾移植损伤的分子机制,以改善临床管理和移植结果 | 人类肾移植活检组织,包括未感染对照组和BK病毒感染的不同阶段(病毒血症高峰期和消退期) | 数字病理学 | 肾移植相关感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量,但涉及肾移植活检组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 33 | 2026-03-14 |
Heterogeneity and regulatory mechanisms of ALK-mutant and wild-type epithelial cells in non-small-cell lung cancer: Single-cell transcriptomics and chromatin accessibility
2026-Mar-12, Pharmacology
IF:2.9Q2
DOI:10.1159/000550967
PMID:41818350
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组和染色质可及性数据,揭示了ALK突变与非小细胞肺癌上皮细胞异质性及调控机制的差异 | 首次在单细胞多组学水平上整合分析ALK突变与野生型NSCLC,发现了CEACAM6通过AKT-EGR1轴促进恶性进展的新机制 | 样本量较小(5个WT和4个ALK突变样本),且为回顾性分析,需要更大队列和体内实验验证 | 解析ALK突变与非小细胞肺癌中上皮细胞的异质性及表观遗传调控机制,以克服ALK-TKI耐药 | 非小细胞肺癌(NSCLC)中的上皮细胞,特别是ALK突变型与野生型细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, qRT-PCR, CCK-8, 克隆形成, 伤口愈合实验 | Seurat, Harmony, Monocle, CellChat, Signac | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | 9个NSCLC样本(5个野生型,4个ALK突变型) | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 34 | 2026-03-14 |
Whole-embryo spatial transcriptomics at subcellular resolution from gastrulation to organogenesis
2026-Mar-12, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adt3439
PMID:41818362
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研究论文 | 本文介绍了一种名为weMERFISH的全胚胎成像平台,用于在亚细胞分辨率下量化斑马鱼胚胎中基因表达,并生成了胚胎发育期间的基因表达和染色质可及性在线图谱 | 开发了全胚胎空间转录组学平台weMERFISH,首次在亚细胞分辨率下系统检测胚胎发育过程中的基因表达模式 | NA | 研究胚胎发育过程中基因表达模式的调控和动态变化 | 斑马鱼胚胎 | 空间转录组学 | NA | 多重错误鲁棒荧光原位杂交(MERFISH) | NA | 图像 | NA | NA | 空间转录组学 | weMERFISH | 全胚胎成像平台,使用多重错误鲁棒荧光原位杂交技术 |
| 35 | 2026-03-14 |
From Cell-Free Transcriptomes to Single-Cell Landscapes: Biomarker Discovery and Originating Cell Alteration Analysis via Graph Matrix Factorization
2026-Mar-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.74814
PMID:41818613
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研究论文 | 提出了一种名为CellFreeGMF的工具,用于基于图矩阵分解对临床样本进行诊断分类、识别cfRNA生物标志物并分析其来源细胞的改变 | 开发了首个通过图矩阵分解将细胞游离RNA(cfRNA)转录组数据映射到单细胞景观的工具,能够同时识别生物标志物并追溯其细胞来源及功能改变 | 方法依赖于外部单细胞参考数据集的质量和完整性,且在当前验证中主要应用于胰腺导管腺癌 | 整合cfRNA分析到临床工作流程和精准医疗策略中,解析cfRNA的细胞起源及疾病驱动的动态变化 | 细胞游离RNA(cfRNA)转录组数据及其来源细胞 | 生物信息学 | 胰腺导管腺癌 | 单细胞RNA测序,细胞-细胞通讯分析 | 图矩阵分解 | 转录组数据(bulk cfRNA和单细胞RNA-seq) | 多个细胞游离RNA转录组临床数据集(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 36 | 2026-03-14 |
Cryoablation Activates the cGAS-STING-CXCL10 Axis in Macrophages to Enhance Anti-Tumor Immunity in NSCLC
2026-Mar-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202521931
PMID:41818612
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研究论文 | 本研究探讨了冷冻消融通过激活cGAS-STING-CXCL10轴在巨噬细胞中增强非小细胞肺癌抗肿瘤免疫的机制 | 首次在免疫治疗时代比较冷冻消融与热消融的疗效,并揭示冷冻消融通过释放肿瘤DNA激活巨噬细胞cGAS-STING通路,增加CXCL10巨噬细胞和CXCL10分泌,从而增强系统性抗肿瘤免疫 | 研究主要基于患者和小鼠模型,临床样本量可能有限,且机制细节需进一步验证 | 探究冷冻消融在非小细胞肺癌治疗中优于热消融的免疫机制 | 非小细胞肺癌患者和小鼠肿瘤模型 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 患者外周血单核细胞和小鼠肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 37 | 2026-03-14 |
The roles of NF-κB-Activated Theca Cell Subtypes in Subclinical Premature Ovarian Insufficiency
2026-Mar-12, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1093/reprod/xaag032
PMID:41818683
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序分析,探讨了早发性卵巢功能不全患者卵泡微环境中NF-κB信号通路的激活及其对颗粒细胞分化的影响 | 首次在早发性卵巢功能不全患者中鉴定出三种NF-κB激活的炎症细胞亚群,并发现NF-κB激活的卵泡膜/基质细胞可能通过特定分子相互作用影响颗粒细胞分化 | 样本量有限(单细胞测序每组仅1例),初步发现需在大样本研究中进一步验证 | 探究早发性卵巢功能不全的早期发病机制,重点关注卵泡微环境中的炎症通路变化 | 早发性卵巢功能不全患者的卵泡微环境细胞(特别是颗粒细胞和卵泡膜/基质细胞) | 单细胞组学 | 卵巢功能不全 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 计算反卷积分析, 轨迹分析 | RNA测序数据 | 单细胞测序:每组1例(共2例);批量RNA测序:每组4例(共8例) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 38 | 2026-03-14 |
The landscape of B and plasma cells in breast cancer: insights from single-cell and spatial transcriptomics
2026-Mar-12, NPJ breast cancer
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s41523-026-00917-0
PMID:41820356
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,构建了乳腺癌中B细胞和浆细胞的全面图谱,揭示了肿瘤相关B细胞的异质性及其在免疫治疗中的作用 | 整合了公开的单细胞RNA测序数据集与新生成的单细胞RNA测序及单细胞BCR测序数据,首次系统性地鉴定了乳腺癌中21个不同的肿瘤相关B细胞亚群,并特别强调了CD200 naïve B细胞和ISG15非典型记忆B细胞在肿瘤免疫中的关键作用 | 研究主要基于已有数据集和新生成数据,样本量相对有限(79个样本来自35名患者),且功能验证主要在鼠类肿瘤模型中进行,人类临床应用的直接转化仍需进一步研究 | 探究乳腺癌肿瘤微环境中B细胞和浆细胞的异质性、功能角色及其对免疫治疗的影响 | 乳腺癌患者的肿瘤相关B细胞和浆细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单细胞BCR测序、空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据、单细胞BCR测序数据、空间转录组学数据 | 79个样本来自35名患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞BCR测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 39 | 2026-03-14 |
Artificial intelligence assisted multi-model pathological diagnosis of breast cancer based on multispectral autofluorescence images
2026-Mar-12, NPJ breast cancer
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s41523-026-00915-2
PMID:41820369
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研究论文 | 本研究提出了一种基于多光谱自发荧光成像与优化深度学习架构的新型框架,用于生成高质量、免标记的H&E等效虚拟染色图像,以辅助乳腺癌病理诊断 | 通过结合多光谱自发荧光成像与增强的CycleGAN(引入显著性和全局特征一致性损失),实现了无需像素级配对的非配对数据集学习,显著提升了虚拟染色性能 | 未明确说明样本量的具体规模及模型在不同亚型乳腺癌中的泛化能力评估 | 开发一种快速、非破坏性的乳腺癌病理诊断虚拟染色技术,以克服传统染色方法的耗时与样本消耗问题 | 乳腺癌临床标本、小鼠模型及类器官共培养样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 多光谱自发荧光成像、虚拟染色技术 | 增强型CycleGAN(生成对抗网络) | 多光谱自发荧光图像、H&E染色图像 | 包含临床标本、小鼠模型和类器官共培养的多模态数据库(具体数量未明确) | NA | NA | NA | NA |
| 40 | 2026-03-14 |
STHELAR, a multi-tissue dataset linking spatial transcriptomics and histology for cell type annotation
2026-Mar-12, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-026-06937-6
PMID:41820393
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研究论文 | 本文介绍了一个名为STHELAR的大规模数据集,该数据集整合了空间转录组学和H&E全玻片图像,用于细胞类型注释 | 通过整合空间转录组学和H&E图像,创建了一个包含多组织类型、超过1100万个细胞的参考数据集,并采用基于Tangram的对齐方法进行细胞类型注释 | 数据集成本和技术复杂性可能限制其广泛应用,且注释依赖于单细胞参考图谱的准确性 | 为癌症研究提供肿瘤微环境组成的理解,并开发从组织学图像预测细胞类型注释的模型 | 31个人类Xenium FFPE切片,涵盖16种组织类型,来自22名癌症患者和9名非癌症患者 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学,单细胞RNA-seq,H&E染色 | Tangram,聚类分析 | 图像,空间转录组数据 | 31个FFPE切片,超过1100万个独特生物细胞 | 10x Genomics | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | Xenium | Xenium FFPE切片 |