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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-12-18 |
Transgelin defines pro-tumorigenic cancer-associated fibroblasts in pancreatic cancer
2025-Dec-16, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03299-5
PMID:41402556
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了胰腺癌中肌成纤维样癌症相关成纤维细胞的异质性,并识别出转胶蛋白作为促肿瘤进展的关键介质 | 首次结合scATAC-seq和scRNA-seq在KPC小鼠模型中系统表征myCAF的异质性,并发现TAGLN表达与不良预后相关,为靶向治疗提供了新靶点 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;TAGLN的具体作用机制尚未完全阐明 | 探究胰腺导管腺癌中癌症相关成纤维细胞的异质性及其在肿瘤进展中的功能角色 | KPC小鼠胰腺组织及TCGA数据库中的PDAC样本 | 单细胞组学 | 胰腺癌 | scATAC-seq, scRNA-seq | NA | 单细胞染色质可及性数据、单细胞转录组数据 | KPC小鼠胰腺组织(具体数量未明确)及TCGA人类PDAC样本 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 22 | 2025-12-18 |
Single-cell analysis indicating CCR8 modulates CD8+ tissue-resident memory T cells to attenuates rejection in transplantation
2025-Dec-16, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-32785-2
PMID:41402575
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了CCR8在调节CD8+组织驻留记忆T细胞中的作用,并探索了其作为减轻移植排斥新靶点的潜力 | 首次在移植排斥背景下,通过单细胞RNA测序等技术,揭示了CCR8对CD8+ TRM细胞积累和功能的调控作用,并阐明了其通过破坏巨噬细胞-T细胞相互作用来减轻排斥的机制 | 研究主要基于小鼠皮肤移植模型,其在人类器官移植中的直接适用性仍需进一步验证;CCR8靶向治疗的具体临床转化路径和潜在副作用尚未明确 | 探究CCR8在移植排斥过程中对CD8+组织驻留记忆T细胞的调控作用及其作为治疗靶点的潜力 | CD8+组织驻留记忆T细胞、CCR8趋化因子受体、皮肤移植模型中的免疫细胞相互作用 | 单细胞组学、免疫学 | 移植排斥 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞数据、组织图像数据 | 未明确说明具体样本数量,但涉及小鼠皮肤移植模型的多时间点分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 23 | 2025-12-18 |
Single-cell and spatial transcriptomic characterization of pulmonary pleomorphic carcinoma
2025-Dec-16, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09162-w
PMID:41402584
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术,对肺多形性癌的分子基础和细胞动力学进行了表征 | 首次结合空间转录组学和单细胞RNA测序对肺多形性癌进行多组学分析,揭示了上皮成分和肉瘤样成分之间的细胞动态及潜在治疗靶点 | 肺多形性癌是一种罕见亚型,样本量可能有限;研究结果需要更大规模的验证 | 阐明肺多形性癌的分子基础,特别是其上皮和肉瘤样成分的细胞动力学,以发现潜在治疗靶点 | 肺多形性癌(PPC)患者样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),空间转录组学,多组学分析 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 24 | 2025-12-18 |
Integrating RNA-seq and Single-Cell RNA-seq to Uncover Transcriptional Signature of Fibroblasts in Oral Squamous Cell Carcinoma
2025-Dec-16, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-025-11310-0
PMID:41402612
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 25 | 2025-12-18 |
Characterization of T cell markers in endometrial carcinoma through single-cell RNA sequencing
2025-Dec-16, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04289-y
PMID:41402657
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序鉴定子宫内膜癌中的T细胞标记基因,并基于这些基因构建了一个八基因预测模型,用于预测患者预后、免疫治疗反应和药物敏感性 | 利用单细胞RNA测序数据识别T细胞标记基因,并首次基于这些基因构建了一个高精度的子宫内膜癌预后预测模型,该模型与免疫功能和治疗反应相关 | 需要进一步验证模型的临床适用性 | 构建基于T细胞标记基因的子宫内膜癌预后预测模型,并探索其与免疫治疗反应和药物敏感性的关联 | 子宫内膜癌患者 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 预测模型 | RNA测序数据, 临床数据 | 544名子宫内膜癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 26 | 2025-12-18 |
Establishment of a novel brainstem ischemic dysphagia model: single-cell sequencing reveals the molecular mechanisms underlying mPES intervention
2025-Dec-16, Journal of neuroengineering and rehabilitation
IF:5.2Q1
DOI:10.1186/s12984-025-01841-3
PMID:41402839
|
研究论文 | 本研究通过建立一种新型脑干缺血性吞咽困难大鼠模型,并利用单细胞转录组学探索改良咽部电刺激治疗的分子机制 | 首次创建了脑干缺血诱导的吞咽困难动物模型,相比传统的皮质卒中模型更贴近临床实际,并应用单细胞测序技术揭示了mPES治疗的潜在分子机制 | 研究仅使用大鼠模型,结果向人类临床转化的有效性需进一步验证;单细胞测序结果仅为相关性分析,缺乏直接的机制验证实验 | 建立新型脑干缺血性吞咽困难动物模型并探索改良咽部电刺激的治疗机制 | 大鼠脑干缺血模型 | 数字病理学 | 脑卒中后吞咽困难 | 单细胞转录组测序,MRI,病理学检查,视频荧光吞咽研究 | NA | 单细胞转录组数据,影像数据,行为学数据 | 未明确说明具体样本数量的大鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 27 | 2025-12-18 |
A proteogenomic gene signature defines prognostic subgroups highlighting PI3K/AKT/mTOR signaling pathway as a therapeutic vulnerability in myeloid malignancies
2025-Dec-16, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02568-3
PMID:41402890
|
研究论文 | 本研究通过整合蛋白质组学和基因组学数据,开发了一个预后基因签名,用于风险分层,并识别了PI3K/AKT/mTOR信号通路作为髓系恶性肿瘤的治疗脆弱性 | 利用双向孟德尔随机化分析确立MPN为AML的前体,整合血浆蛋白质组学数据识别风险介质,并开发了一个新的预后蛋白质基因组基因签名 | 研究主要基于回顾性队列数据,需要进一步的前瞻性验证;单细胞RNA测序数据仅作为补充证据,未进行深入功能验证 | 探索髓系恶性肿瘤(如AML和MPN)的转化机制、预后因素及治疗靶点 | 急性髓系白血病(AML)、骨髓增殖性肿瘤(MPN)患者及细胞系模型 | 生物信息学 | 髓系恶性肿瘤 | 双向孟德尔随机化分析、血浆蛋白质组学、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、药物基因组学分析 | NA | 基因组数据、蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据 | BEAT-AML队列和TCGA-LAML队列的患者数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 28 | 2025-12-18 |
ST-FFPE-mIF: integrating spatial transcriptomics and multiplex immunofluorescence in formalin-fixed paraffin-embedded tissues using Stereo-seq
2025-Dec-16, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03900-3
PMID:41402878
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 29 | 2025-12-18 |
POU5F1 upregulates SPP1 to sustain stem-like traits and malignant phenotypes via JAK1/STAT3 in clear cell renal cell carcinoma
2025-Dec-16, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004469
PMID:41403335
|
研究论文 | 本研究揭示了POU5F1通过上调SPP1并激活JAK1/STAT3信号通路,维持透明细胞肾细胞癌的干细胞样特性和恶性表型 | 首次系统验证了POU5F1-SPP1-JAK1/STAT3轴在ccRCC中的作用机制,为同时靶向肿瘤细胞和癌症干细胞提供了新的治疗策略 | 研究主要基于细胞系和动物模型,临床样本量有限(30对组织),需要更大规模的临床验证 | 探究SPP1在透明细胞肾细胞癌中的功能及其上游调控机制 | 透明细胞肾细胞癌组织样本(30对)、786-O/769-P细胞系、裸鼠移植瘤模型 | 癌症生物学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA-seq、功能实验(增殖、迁移、肿瘤球形成)、分子机制研究(ChIP、Co-IP、双荧光素酶报告基因检测)、生物信息学分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据、临床生存数据 | 30对ccRCC组织样本、2种细胞系(786-O/769-P)、裸鼠移植瘤模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 30 | 2025-12-18 |
Prognostic role of stress granule-related Gene signatures in pancreatic ductal adenocarcinoma: insights from 101-combination machine learning and single-cell sequencing
2025-Dec-16, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004458
PMID:41403347
|
研究论文 | 本研究通过结合机器学习与单细胞测序技术,开发并验证了一个基于应激颗粒相关基因的胰腺导管腺癌预后风险模型 | 首次利用101种机器学习算法组合识别预后相关的应激颗粒基因,并结合单细胞测序分析关键细胞类型与细胞间通讯 | 研究依赖于公共数据库数据,缺乏独立的前瞻性队列验证 | 探究应激颗粒在胰腺导管腺癌中的机制,重点关注风险分层与治疗策略 | 胰腺导管腺癌患者及其相关基因表达数据 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | 多种机器学习算法组合(包括Cox回归等) | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的多个PDAC数据集,包括单细胞数据集GSE197177 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 31 | 2025-12-18 |
Cancer associated fibroblast exosomal miR-214-3p regulated by hnRNPA2B1 promotes cisplatin resistance by inhibiting ferroptosis
2025-Dec-16, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003946
PMID:41405275
|
研究论文 | 本研究揭示了hnRNPA2B1通过调控CAF中外泌体miR-214-3p的分选,促进骨肉瘤顺铂耐药的新机制 | 首次发现hnRNPA2B1通过识别GGAG基序调控CAF外泌体中miR-214-3p的分选,并阐明该外泌体通过抑制GPX4表达减少铁死亡从而介导顺铂耐药 | 研究主要聚焦于骨肉瘤,未在其他癌症类型中验证该机制;体内实验数据可能有限 | 探究CAF外泌体介导的骨肉瘤顺铂耐药机制 | 骨肉瘤细胞、癌症相关成纤维细胞(CAF)、外泌体 | 单细胞组学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序、RNA免疫沉淀、外泌体功能实验 | NA | 单细胞RNA测序数据、分子表达数据 | 顺铂敏感与耐药样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 32 | 2025-12-18 |
A mouse organoid platform for modeling cerebral cortex development and cis-regulatory evolution in vitro
2025-Dec-15, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.08.001
PMID:40876454
|
研究论文 | 本文开发了一种从小鼠外胚层干细胞生成大脑皮层类器官的可重复协议,用于模拟皮层发育和顺式调控进化 | 首次利用小鼠类器官平台结合单细胞RNA测序,全面绘制了跨进化分歧的发育皮层细胞类型中顺式作用转录调控变异图谱 | NA | 研究大脑皮层发育的基因调控网络及顺式调控进化机制 | 小鼠大脑皮层类器官,源自实验室小鼠与四种野生近交品系杂交的F1杂合外胚层干细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 单细胞转录组数据 | 源自五个小鼠品系(包括C57BL/6J和四种野生近交品系)杂交的F1杂合外胚层干细胞生成的皮层类器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 33 | 2025-12-18 |
Large-scale single-cell profiling of stem cells identifies redundant regulators of shoot development and yield trait variation
2025-Dec-15, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.07.024
PMID:40865519
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研究论文 | 本研究通过大规模单细胞RNA测序技术,对玉米和拟南芥的茎尖分生组织进行单细胞转录组分析,鉴定出保守的干细胞调控因子,并揭示了其与作物产量性状的关联 | 首次在植物中通过优化的单细胞RNA测序技术捕获了数千个表达CLAVATA3和WUSCHEL的稀有干细胞,并进行了跨物种比较和突变体验证 | 未明确说明样本的具体数量或重复次数,且空间转录组验证的覆盖范围可能有限 | 鉴定植物茎尖干细胞的关键调控因子,并探索其与作物产量性状的遗传关联 | 玉米和拟南芥的茎尖分生组织干细胞 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 34 | 2025-12-18 |
Extracellular Matrix-MYCAF Signatures Correlate with Resistance to Neoadjuvant aPD-L1 Immune Checkpoint Inhibition with Durvalumab + Metformin in HPV+ HNSCC
2025-Dec-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-1098
PMID:40932382
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研究论文 | 本研究通过多组学分析,探讨了在HPV阳性头颈鳞状细胞癌中,抗PD-L1免疫检查点抑制剂durvalumab联合二甲双胍新辅助治疗的应答与耐药机制 | 首次在HPV阳性HNSCC新辅助治疗背景下,结合空间转录组学识别了细胞外基质-肌成纤维样癌症相关成纤维细胞特征作为联合治疗耐药的预测标志物,并揭示了应答者中朗格汉斯样树突状细胞状态和抗原呈递基因集的富集 | 研究样本量有限,且仅针对HPV阳性HNSCC患者,未纳入HPV阴性亚型;新辅助治疗为单次输注,可能无法完全反映长期治疗动态 | 评估durvalumab联合二甲双胍在HPV阳性头颈鳞状细胞癌新辅助治疗中的疗效,并探索应答与耐药的生物标志物及机制 | 先前未治疗的非糖尿病HPV阳性头颈鳞状细胞癌患者 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 多组学分析, 空间转录组学 | NA | 临床数据, 病理数据, 多组学数据 | 来自随机新辅助临床试验(NCT03618654)的患者样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 35 | 2025-12-18 |
Single-cell transcriptomic analysis highlights specific cell types manipulated by Fusarium head blight fungus leading to wheat susceptibility
2025-Dec-15, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.07.022
PMID:40845857
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术,分析了小麦胚芽鞘对适应性和非适应性镰刀菌感染的细胞类型特异性响应 | 首次应用单细胞RNA测序技术于小麦-真菌互作研究,揭示了细胞类型特异性免疫响应和适应性病原体诱导的转录活性降低状态 | 研究仅关注了小麦胚芽鞘在特定时间点的响应,可能未涵盖其他组织或更长期的动态变化 | 探究小麦对不同镰刀菌感染的细胞类型特异性免疫响应机制 | 小麦胚芽鞘细胞 | 植物病理学 | 小麦赤霉病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过90,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 36 | 2025-12-18 |
Divergence of immune cell types in chordate blood
2025-Dec-15, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2025.10.032
PMID:41237770
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序、原位杂交和活体报告基因技术,定义了海鞘Ciona robusta血液细胞的状态,揭示了其分化层次和主要谱系 | 首次在无脊椎动物海鞘中系统性地定义了血液细胞类型,并揭示了其与脊椎动物免疫细胞之间的广泛差异,扩展了脊索动物免疫细胞的已知库 | 研究主要基于Ciona robusta,可能无法完全代表所有无脊椎动物或脊索动物的免疫细胞进化情况 | 研究脊索动物免疫细胞的进化适应和细胞类型同源性 | 海鞘Ciona robusta的循环血液细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序, 原位杂交, 活体报告基因 | NA | RNA序列数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 37 | 2025-12-18 |
Development and application of a barcoded rabies viral tracing method for mapping brain-wide inputs to single neurons
2025-Dec-15, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2025.101244
PMID:41338190
|
研究论文 | 本研究开发了一种条形码狂犬病病毒追踪方法,用于在单细胞水平绘制全脑对单个神经元的输入连接图谱 | 结合逆行病毒追踪与单细胞RNA测序,开发了BRT方法,首次实现了在单细胞分辨率下对转录组定义神经元的局部和长程输入连接进行同时绘制 | 未明确说明方法在其它脑区的适用性限制或技术灵敏度边界 | 开发新型神经连接图谱绘制方法,构建细胞分辨率的中观尺度脑连接组 | 小鼠内侧前额叶皮层神经元 | 神经科学 | NA | 逆行病毒追踪,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,神经连接数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 38 | 2025-12-18 |
Natural killer cell infiltration elicits gender-dependent dichotomous clinical outcomes in urothelial carcinoma
2025-Dec-15, Cancer
IF:6.1Q1
DOI:10.1002/cncr.70196
PMID:41368948
|
研究论文 | 本研究通过多队列回顾性分析,揭示了自然杀伤细胞在尿路上皮癌中具有性别依赖性的临床影响 | 首次系统阐明了自然杀伤细胞在尿路上皮癌中的性别二态性临床作用,并揭示了其背后不同的功能状态和肿瘤微环境特征 | 研究为回顾性设计,需前瞻性研究验证;机制探索尚不完整 | 探究自然杀伤细胞如何介导尿路上皮癌的性别差异及其临床意义 | 尿路上皮癌患者 | 数字病理学 | 尿路上皮癌 | 免疫组化、转录组学、单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 图像、文本(转录组数据) | 885名患者(671名男性,214名女性) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 39 | 2025-12-18 |
Targeting KRAS Inhibitor-Resistant Pancreatic Cancer with an MUC1-C Antibody-Drug Conjugate
2025-Dec-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-2333
PMID:41086055
|
研究论文 | 本研究探讨了MUC1-C蛋白在介导胰腺导管腺癌细胞对KRAS抑制剂耐药中的作用,并评估了抗MUC1-C抗体药物偶联物的治疗效果 | 揭示了KRAS G12D抑制通过激活MUC1-C/NF-κB p65自诱导通路上调MUC1-C蛋白,进而驱动耐药的新机制,并首次证明抗MUC1-C ADC能有效克服KRAS抑制剂耐药 | 研究主要基于KRAS G12D突变模型,未涵盖其他KRAS突变类型;临床前模型的转化潜力需进一步验证 | 探究胰腺导管腺癌对KRAS抑制剂耐药的机制,并开发针对耐药的新型治疗策略 | 胰腺导管腺癌KRAS G12D突变细胞系、患者来源的耐药类器官和异种移植模型,以及PDAC患者肿瘤样本 | 癌症生物学与治疗学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学染色、体外和体内药效评估 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、药效数据 | 3个PDAC KRAS G12D突变细胞系、患者来源的耐药类器官和异种移植模型,以及未明确数量的PDAC患者肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 40 | 2025-12-18 |
Mitochondrial complex II orchestrates divergent effects in CD4+ and CD8+ T cells
2025-Dec-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI194134
PMID:41392980
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研究论文 | 本研究揭示了线粒体复合物II在CD4+和CD8+ T细胞中调控代谢和功能的相反作用 | 首次阐明线粒体复合物II作为代谢和功能分化的关键节点,在CD4+和CD8+ T细胞中产生截然不同的效应 | 研究主要基于小鼠模型,人类T细胞中的验证尚需进一步研究 | 探究线粒体复合物II在不同T细胞亚群中的特异性作用 | CD4+和CD8+ T细胞 | 免疫学 | 肿瘤免疫 | 单细胞RNA测序,代谢谱分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,代谢数据 | SDHA缺陷型小鼠的T细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |