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当前共找到 39644 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-05-25 |
Ubiquitous and Brain Cell-Type-Specific Promoters and Enhancers in Lentiviral Vectors
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4807-0_7
PMID:41273642
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综述 | 讨论了在慢病毒载体中构建和运用组成型及脑细胞类型特异性启动子和增强子以实现精准高效基因递送的方法 | 利用单细胞转录组学和ATAC测序新技术发现新型增强子区域，为开发更精准的靶向慢病毒载体铺平道路 | 未明确说明 | 开发用于慢病毒载体的脑细胞类型特异性启动子和增强子，提高转基因在脑细胞中的表达特异性和效率 | 脑细胞类型包括兴奋性和抑制性神经元、星形胶质细胞、小胶质细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学, ATAC测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 22 | 2026-05-25 |
Engineered vasculature induces functional maturation of pluripotent stem cell-derived islet organoids
2025-Sep-22, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.04.024
PMID:40412386
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研究论文 | 通过构建三维血管化胰岛类器官，改善多能干细胞来源的胰岛细胞功能成熟度 | 首次将血管内皮细胞和成纤维细胞与干细胞来源胰岛细胞组装成三维血管化类器官，并在微流控装置中实现灌注；揭示血管通过形成胰岛样基底膜和BMP信号通路促进β细胞功能成熟 | 未提及具体局限性 | 研究血管化对干细胞来源胰岛类器官功能成熟的影响及其机制 | 人干细胞来源的胰岛细胞、人原代内皮细胞、成纤维细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 23 | 2026-05-25 |
Decoding Cellular Stress States for Toxicology Using Single-Cell Transcriptomics
2025-Aug-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.10.657506
PMID:40766395
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研究论文 | 利用单细胞转录组学技术对毒物暴露下的细胞应激状态进行解码 | 首次利用TempO-LINC平台生成大规模单细胞转录组图谱，系统分析多种化学物质诱导的适应性应激反应通路，并通过广义Jaccard度量聚类识别出五种不同细胞状态表型组 | 未明确提及局限性 | 探究单细胞转录组学在解析毒物诱导的细胞应激状态及适应性终末转变中的应用价值 | 暴露于依托泊苷、布雷菲德菌素A、环己酰亚胺、鱼藤酮、tBHQ、曲格列酮和衣霉素三种浓度24小时的HepaRG细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 约40000个HepaRG细胞 | BioSpyder | 单细胞转录组学 | TempO-LINC | TempO-LINC单细胞转录组分析平台 |
| 24 | 2026-05-25 |
Association of DNA damage response signals and oxidative stress status with nivolumab efficacy in patients with Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2025-Aug, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03032-2
PMID:40410274
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研究论文 | 评估头颈部鳞状细胞癌患者外周血单核细胞中DNA损伤反应信号与氧化应激状态对纳武利尤单抗疗效的关联 | 首次在HNSCC患者中研究基线PBMCs中DDR相关信号和氧化应激状态与免疫检查点抑制剂疗效的关联，并利用空间转录组学分析肿瘤、白细胞和巨噬细胞三个分子定义的组织区室 | 样本量较小（26例健康对照和50例患者），且未提及外部验证队列，结果需进一步验证才能作为非侵入性生物标志物 | 检验基线HNSCC患者PBMCs中DDR相关信号与免疫检查点抑制剂（纳武利尤单抗）反应相关的假说 | 26例健康对照和50例复发性/转移性头颈部鳞状细胞癌患者 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据、血液样本数据 | 26例健康对照和50例复发性/转移性HNSCC患者 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学分析肿瘤、白细胞和巨噬细胞三个组织区室 |
| 25 | 2026-05-25 |
Down-regulation of IGFBP2 mediates endometrial epithelial cells senescence in thin endometrium
2025-07-03, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaaf032
PMID:40700608
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析发现，薄型子宫内膜中IGFBP2表达下调导致子宫内膜上皮细胞衰老，并揭示了其通过PI3K/AKT信号通路调控PTEN活性的机制 | 首次阐明IGFBP2下调通过PTEN/PI3K/AKT通路介导子宫内膜上皮细胞衰老，并在体内外模型中验证重组IGFBP2蛋白抗衰老效果优于传统药物达沙替尼 | 未明确IGFBP2上游调控机制；小鼠模型与人类TE病理差异需进一步验证 | 阐明薄型子宫内膜中IGFBP2调控上皮细胞衰老的分子机制及治疗潜力 | 人类原代子宫内膜上皮细胞、Ishikawa细胞系、薄型子宫内膜小鼠模型 | 数字病理学 | 子宫内膜相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 薄型子宫内膜和正常对照组织的单细胞RNA测序数据；小鼠模型数量未明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 26 | 2026-05-25 |
The Dual Molecular Identity of Vestibular Kinocilia: Bridging Structural and Functional Traits of Primary and Motile Cilia
2025-Jun-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.16.647417
PMID:40568142
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和活细胞成像，揭示了前庭动纤毛兼具初级纤毛和运动纤毛的分子特征及其主动运动功能 | 首次证明前庭动纤毛具有初级纤毛和运动纤毛的双重分子身份，并发现其能自发产生运动，挑战了传统认为动纤毛仅为感觉结构的观点 | 未详细说明成像技术的分辨率限制及跨物种比较中可能存在的差异 | 阐明前庭动纤毛的结构、分子组成和功能特征 | 成年小鼠、斑马鱼、牛蛙和人类的前庭毛细胞及动纤毛 | 分子生物学, 细胞生物学 | 前庭疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫染色, 活细胞成像 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 成年小鼠和人类的前庭毛细胞（未明确具体数量） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 27 | 2026-05-25 |
PANoptosis-related gene biomarkers in aortic dissection
2025-06, Archives of biochemistry and biophysics
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.abb.2025.110385
PMID:40086567
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研究论文 | 本研究探讨了PANoptosis相关基因在主动脉夹层中的生物标志物作用 | 首次在单细胞水平上评估血管平滑肌细胞中PANoptosis（包括焦亡、凋亡和坏死性凋亡）评分，并鉴定出关键基因GADD45B、CDKN1A和SOD2 | 未在更大规模临床样本中验证，机制研究依赖于公共数据集 | 阐明PANoptosis相关基因在主动脉夹层发病机制中的作用 | 主动脉夹层患者和动物模型中的血管平滑肌细胞 | 机器学习和生物信息学 | 主动脉夹层 | 单细胞测序 | 加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据 | GSE213740（单细胞测序数据集）、GSE153434、GSE147026和GSE52093共4个公共数据集，以及患者和小鼠血管组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | GSE213740单细胞测序数据集 |
| 28 | 2026-05-25 |
SpaceBar enables clone tracing in spatial transcriptomic data
2025-Feb-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.10.637514
PMID:39990434
|
研究论文 | 报道了一种名为SpaceBar的细胞条形码策略，可同时在空间转录组数据中进行克隆追踪和基因表达分析 | 首次将合成条形码库与成像空间转录组技术结合，实现单细胞水平的克隆追踪和空间基因表达同步分析 | 条形码库仅包含96个合成序列，可能限制大规模克隆追踪的分辨率 | 开发一种能够同时追踪克隆动态和空间基因表达的方法 | 黑色素瘤细胞在肿瘤异种移植模型中的克隆和基因表达 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间转录组测序 | NA | 图像和基因表达数据 | 黑色素瘤异种移植模型中的肿瘤样本 | NA | 空间转录组学 | seqFISH | 使用seqFISH技术进行成像空间转录组检测 |
| 29 | 2026-05-25 |
Blockade of purine metabolism reverses macrophage immunosuppression and enhances anti-tumor immunity in non-small cell lung cancer
2025-01, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2024.101175
PMID:39608215
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研究论文 | 本研究揭示了嘌呤代谢阻断可逆转巨噬细胞免疫抑制并增强非小细胞肺癌的抗肿瘤免疫 | 首次发现非小细胞肺癌细胞分泌的CXCL8通过激活嘌呤代谢促进巨噬细胞PD-L1表达，并揭示NLRP3/caspase-1/IL-1β信号通路在嘌呤代谢介导的巨噬细胞免疫抑制中的作用 | NA | 评估巨噬细胞是否通过代谢串扰调节非小细胞肺癌进展并影响免疫治疗疗效 | 非小细胞肺癌组织中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 非小细胞肺癌 | 单细胞测序, 流式细胞术, 免疫荧光, 多重检测, ELISA, RNA-seq | NA | 图像, 文本 | 非小细胞肺癌组织样本及C57BL/6J小鼠肿瘤模型 | 10x Genomics, NA | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞测序系统 |
| 30 | 2026-05-25 |
Interleukin-1β Drives Disease Progression in Arrhythmogenic Cardiomyopathy
2024-Dec-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.11.628020
PMID:39763850
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研究论文 | 通过单核RNA测序和空间转录组学分析，揭示IL-1β在致心律失常性心肌病疾病进展中的驱动作用 | 首次在人类ACM样本中采用单核RNA测序和空间转录组学联合分析，鉴定出疾病相关的炎症-纤维化空间微环境，并证明抗IL-1β中和抗体在ACM小鼠模型中可减轻纤维化、保护心脏功能 | 主要基于小鼠模型验证治疗策略，人类样本数量有限且未进行干预性临床试验验证 | 阐明IL-1β在ACM发病机制中的作用并评估其作为治疗靶点的潜力 | 人类ACM心肌样本和Dsg2突变小鼠模型 | 数字病理学 | 致心律失常性心肌病 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 人类ACM患者与对照供体的心肌样本，以及Dsg2基因纯合突变小鼠 | 10x Genomics | 单核RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Genomics单核RNA测序和Visium空间转录组学平台 |
| 31 | 2026-05-25 |
Local Controlled Delivery of IL-4 Decreases Inflammatory Bone Loss in a Murine Model of Periodontal Disease
2024-Dec-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2400332
PMID:39465979
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研究论文 | 通过局部控制释放IL-4减少牙周炎小鼠模型中的炎症性骨丢失 | 首次证明使用可控药物递送策略局部释放IL-4可逆转炎症性骨丢失并促进骨再生，并利用单细胞RNA测序揭示其通过将巨噬细胞转向修复表型的作用机制 | 未提及具体局限性，但可能包括小鼠模型与人类的差异、递送系统的长期效果及安全性需进一步验证 | 评估使用可控药物递送策略靶向口腔巨噬细胞治疗慢性炎症的可行性 | 牙周炎小鼠模型中的巨噬细胞和牙周组织 | 数字化病理学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 牙周炎小鼠模型，具体数量未在摘要中提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 32 | 2026-05-25 |
CRISPRi-based screens in iAssembloids to elucidate neuron-glia interactions
2024-Nov-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.26.538498
PMID:37163077
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研究论文 | 开发iAssembloids三维共培养系统并结合CRISPRi筛选，揭示神经元与胶质细胞相互作用机制 | 首次在三维类脑体结构中进行大规模CRISPRi筛选，发现GSK3β抑制NRF2介导的氧化应激保护反应的新机制 | 未提及具体局限性 | 阐明神经元-胶质细胞相互作用在脑健康与疾病中的分子机制 | 人类诱导多能干细胞衍生的神经元和胶质细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | CRISPRi筛选 | na | 单细胞转录组数据 | 未提及具体样本量 | 10x Genomics | 单细胞转录组测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |
| 33 | 2026-05-25 |
Spatial transcriptomics data and analytical methods: An updated perspective
2024-03, Drug discovery today
IF:6.5Q1
DOI:10.1016/j.drudis.2024.103889
PMID:38244672
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综述 | 综述空间转录组学数据分析方法的最新进展与未来展望 | 系统总结了基于深度学习模型在空间转录组数据处理中的最新应用，并指出了提升生物学相关性的持续需求 | 未提供具体实验验证或量化比较不同方法的性能 | 探讨空间转录组学数据分析技术的现状及未来在生物医学中的应用前景 | 空间转录组数据及相关分析方法和数据库 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 深度学习 | 图像、转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 34 | 2026-05-25 |
Tissue nanotransfection causes tumor regression by its effect on nanovesicle cargo that alters microenvironmental macrophage state
2023-05-03, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2022.11.003
PMID:36380587
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研究论文 | 本研究首次通过纳米级荧光可视化，揭示肿瘤来源携带miR-126的细胞外囊泡如何改变肿瘤相关巨噬细胞状态，促进肿瘤形成，并通过组织纳米转染技术实现肿瘤消退 | 首次实现肿瘤来源细胞外囊泡及其miR-126 cargo的纳米级荧光可视化，并阐明其通过诱导肿瘤相关巨噬细胞向血管生成状态转变来促进肿瘤形成的新机制，同时利用局部组织纳米转染技术有效靶向该过程 | 研究基于小鼠血管肿瘤模型，结论向人类肿瘤的转化尚需验证；未明确组织纳米转染技术应用于深层肿瘤的可行性 | 探究肿瘤来源细胞外囊泡携带的miR-126如何通过改变肿瘤微环境中的巨噬细胞状态来促进肿瘤形成，并评估局部组织纳米转染技术作为治疗手段的效果 | 小鼠致死性血管肿瘤模型中的肿瘤细胞、肿瘤相关巨噬细胞及肿瘤来源细胞外囊泡 | 数字病理学 | 肿瘤（血管肿瘤） | NA | NA | 图像（纳米级荧光可视化）、测序数据（单细胞RNA-seq） | 小鼠模型，未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 35 | 2026-05-25 |
Improving cellular phylogenies through the integrated use of mutation order and optimality principles
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.07.018
PMID:37602230
|
研究论文 | 开发了一种整合突变顺序和最优性原则的计算方法，用于从单细胞测序数据中推断细胞系统发育关系 | 首次将标准系统发育最优性原则与序列变异共现模式整合应用于单细胞测序数据，生成更准确且更完整的细胞系统发育树 | 未提及具体局限性 | 提高单细胞测序数据的系统发育推断准确性，用于肿瘤演化研究 | 单细胞测序数据中的体细胞变异及CRISPR/Cas9基因编辑数据集 | 机器学习 | 肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 序列数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 36 | 2026-05-25 |
Mitochondrial variant enrichment from high-throughput single-cell RNA sequencing resolves clonal populations
2022-07, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01210-8
PMID:35210612
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研究论文 | 通过结合高通量单细胞RNA测序与线粒体转录组富集，提高线粒体DNA变异检测的覆盖度，从而解析克隆群体 | 将常见3' 单细胞RNA测序协议与线粒体转录组富集结合，使覆盖度提高50倍以上，实现高置信度突变检测 | NA | 开发一种可扩展的方法，利用单细胞转录组学结合线粒体DNA变异检测，建立人类原代细胞中的谱系关系 | 人类原代细胞中的免疫细胞扩增和克隆造血 | 机器学习 | 克隆造血 | 单细胞RNA测序，线粒体转录组富集 | NA | 转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 协议 |
| 37 | 2026-05-25 |
Processing single-cell RNA-seq data for dimension reduction-based analyses using open-source tools
2021-06-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100450
PMID:33982010
|
研究论文 | 演示使用开源软件构建模块化单细胞RNA测序数据分析流程 | 提供模块化、灵活的开源数据分析流程，克服商业平台的固定性限制 | 未提及通用解决方案区分信息性或非信息性包裹细胞材料，流程灵活性优先但无特定创新方法 | 构建并展示单细胞RNA测序数据的完整分析流程 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | RNA-seq | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 38 | 2026-05-25 |
Cell population analysis of the adult murine subependymal neurogenic lineage by flow cytometry
2021-06-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100425
PMID:33899012
|
protocol | 本文提供了一个基于流式细胞术的协议，用于成体小鼠室管膜下神经源性谱系的细胞群体分析 | 无需报告小鼠即可将成体啮齿类动物室膜下区神经源性谱系的所有细胞分类和分离为不同细胞群体，包括三个具有与单细胞转录组学一致的分子特征的神经干细胞组分 | NA | 提供一种基于流式细胞术的分类和分离方法，用于研究成体神经干细胞群体的循环异质性和静止-激活转换 | 成体小鼠室膜下区神经源性谱系细胞，包括三个神经干细胞组分 | machine learning | NA | 流式细胞术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 39 | 2026-05-25 |
Spatial transcriptomics of the nematode Caenorhabditis elegans using RNA tomography
2021-06-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100411
PMID:33870220
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protocol | 本文介绍了一种结合mRNA测序与冷冻切片技术的RNA断层扫描方法，用于在秀丽隐杆线虫中生成近乎细胞分辨率的前后轴基因表达图谱 | 将该技术适配到线虫模型，并提供了两种实验方案：一种最大化灵敏度，另一种适用于部分自动化以节省时间 | 未明确说明局限性信息 | 提供详细的RNA tomography实验协议，用于线虫空间转录组分析 | 秀丽隐杆线虫（Caenorhabditis elegans） | NA | NA | RNA tomography (tomo-seq), mRNA sequencing, cryo-sectioning | NA | gene expression data | NA | NA | spatial transcriptomics | NA | NA |
| 40 | 2026-05-25 |
Single-cell RNA sequencing of human liver reveals hepatic stellate cell heterogeneity
2021-Jun, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2021.100278
PMID:34027339
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示人类肝脏中肝星状细胞的异质性 | 首次在人类肝脏中描绘出肝星状细胞存在两种具有独特基因表达特征和不同小叶内定位的亚群 | 未提及具体局限性 | 利用单细胞RNA测序揭示人类肝细胞尤其是肝细胞和肝星状细胞的异质性 | 新鲜分离的人类肝脏细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 约25,000个新鲜分离的人类肝脏细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 使用基于液滴的RNA测序技术 |