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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-11-19 |
Integrated transcriptome profiling of plasma exosomes reveals molecular stratification of exocrine and endocrine disorders and S100A8-mediated cell interactions in chronic pancreatitis
2025-Nov-18, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-025-00832-x
PMID:41249153
|
研究论文 | 本研究通过血浆外泌体转录组测序建立了慢性胰腺炎的三阶段分类系统,并揭示了外泌体miR-24-3p和中性粒细胞S100A8在疾病进展中的关键作用 | 首次建立基于血浆外泌体miRNA表达的慢性胰腺炎三阶段分类系统,并发现外泌体miR-24-3p通过调控S100A8影响胰腺星状细胞纤维化和巨噬细胞炎症的新机制 | 分类系统仅进行了初步验证,需要更大规模的临床研究进一步确认其可靠性 | 开发慢性胰腺炎外分泌和内分泌功能障碍的临床分类方案并探索其分子机制 | 慢性胰腺炎患者血浆外泌体、胰腺病变组织、小鼠模型 | 生物信息学 | 慢性胰腺炎 | 转录组测序、单细胞测序、液体活检 | NA | RNA测序数据、单细胞测序数据 | 慢性胰腺炎患者队列和外部验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 外泌体转录组测序 | NA | NA |
| 22 | 2025-11-19 |
Decoding intratumoral cyclooxygenase-2 signaling through multi-omics: insights from esophageal cancer and beyond
2025-Nov-18, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01919-1
PMID:41249574
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示环氧合酶-2(COX-2)在食管癌等恶性肿瘤中的促癌机制及治疗潜力 | 首次整合单细胞RNA测序、空间转录组学、蛋白质对接分析和实验验证系统解析COX-2在肿瘤微环境中的调控网络 | NA | 探究COX-2在癌症进展中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 食管癌及其他多种癌症类型 | 多组学分析 | 食管癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 蛋白质对接分析 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据, 蛋白质结构数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 23 | 2025-11-19 |
Single-cell transcriptomics identifies SOCS3+ exhausted T cells as a biomarker facilitating clear cell renal cell carcinoma progression
2025-Nov-18, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01894-7
PMID:41249578
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学识别SOCS3+耗竭T细胞作为促进透明细胞肾细胞癌进展的生物标志物 | 首次发现SOCS3+耗竭T细胞在ccRCC中的关键作用,并构建了包含SOCS3和N4BP1的预后预测模型 | 基于现有数据集的再分析,需要进一步实验验证 | 研究耗竭T细胞如何驱动透明细胞肾细胞癌进展 | 透明细胞肾细胞癌患者样本 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | Cox回归分析,列线图预测模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 24 | 2025-11-19 |
Integrated bulk and single-cell transcriptomic profiling reveals NECTIN-TIGIT interaction underlies T cell exhaustion in papillary thyroid carcinoma
2025-Nov-18, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01937-z
PMID:41249602
|
研究论文 | 通过整合bulk和单细胞转录组数据,揭示NECTIN-TIGIT相互作用是甲状腺乳头状癌中T细胞耗竭的潜在驱动机制 | 首次在甲状腺乳头状癌中发现NECTIN-TIGIT轴作为新的免疫调节通路促进T细胞耗竭 | 需要未来湿实验室验证和临床研究来确认该轴的转化医学相关性 | 阐明甲状腺乳头状癌中T细胞耗竭的免疫学机制 | 甲状腺乳头状癌肿瘤微环境中的免疫细胞 | 生物信息学 | 甲状腺癌 | RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自GEO数据库的公开数据集 | NA | bulk RNA-seq,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 25 | 2025-11-19 |
Comprehensive analysis reveals prognostic gene set that could impacts the response to chemotherapy and immunotherapy outcomes in malignant pleural mesothelioma
2025-Nov-18, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01949-9
PMID:41249691
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据开发了一个恶性胸膜间皮瘤的预后基因集模型,用于预测患者生存和治疗反应 | 首次整合转录组、DNA甲基化和SNP数据构建MPM预后模型,并验证其在化疗、放疗和免疫治疗反应预测中的价值 | 模型验证依赖于公共数据库数据,需要进一步的前瞻性临床研究验证 | 开发可靠的恶性胸膜间皮瘤预后评估工具以改善临床治疗效果 | 恶性胸膜间皮瘤患者 | 生物信息学 | 恶性胸膜间皮瘤 | 多组学分析,LASSO-Cox回归,GO富集分析,单细胞RNA-seq | LASSO-Cox回归模型 | 转录组数据,DNA甲基化数据,SNP数据,单细胞RNA-seq数据 | TCGA和GEO数据库中的恶性胸膜间皮瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 26 | 2025-11-19 |
CDKN1A and cellular senescence are associated with immune resistance in advanced lung adenocarcinoma
2025-Nov-18, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01926-2
PMID:41249682
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研究论文 | 本研究探讨CDKN1A和细胞衰老在晚期肺腺癌免疫治疗耐药中的作用机制 | 首次在晚期肺腺癌中系统揭示CDKN1A通过促进细胞衰老和免疫抑制微环境导致免疫治疗耐药的机制 | 研究基于回顾性队列分析,需要前瞻性研究验证;单细胞测序样本量有限 | 探究CDKN1A在晚期肺腺癌免疫治疗耐药中的生物学功能和临床意义 | 晚期肺腺癌患者组织和单细胞测序数据 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析 | Cox回归模型 | 基因表达数据,临床数据 | TCGA和SU2C-MARK队列数据,GSE148071单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 27 | 2025-11-19 |
Integrated machine learning and single-cell analysis identify chromatin-remodeling gene signature for diagnosis and prognosis in nasopharyngeal carcinoma
2025-Nov-18, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01953-z
PMID:41249704
|
研究论文 | 本研究通过整合机器学习与单细胞分析,识别了鼻咽癌中染色质重塑基因的诊断和预后特征 | 首次将机器学习与单细胞RNA测序相结合,系统分析鼻咽癌中染色质重塑基因的功能,并构建了六基因预后特征模型 | 研究依赖于公共数据集,需要进一步实验验证和更大样本量的临床验证 | 探索染色质重塑基因在鼻咽癌中的诊断和预后价值 | 鼻咽癌患者基因表达数据和单细胞转录组数据 | 机器学习 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序, 差异表达分析, 加权基因共表达网络分析, 功能富集分析 | 机器学习模型 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 多个公共数据集(GSE12452, GSE53819, GSE61218, GSE102349) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 28 | 2025-11-19 |
Electron Microscopy and Multi-Omics Reveal Mitochondrial Dysfunction and Structural Remodeling in the Hearts of Elderly Mice
2025-Nov-18, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70286
PMID:41250825
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学方法和电子显微镜技术,揭示了老年小鼠心脏中线粒体功能障碍和结构重塑的分子机制 | 首次将空间转录组学、蛋白质组学、代谢-脂质组学与电子显微镜技术整合,系统研究心脏衰老的多尺度变化 | 研究仅在小鼠模型中进行,需要在人类模型中验证以确认结果的转化相关性 | 探究心脏衰老过程中分子和代谢变化的复杂机制 | 三个生命阶段的小鼠心脏组织:成年(12个月)、中年(24个月)和老年(30个月) | 多组学整合分析 | 老年性心脏疾病 | 空间转录组学, 蛋白质组学, 代谢-脂质组学, 电子显微镜 | NA | 空间转录组数据, 蛋白质组数据, 代谢组数据, 脂质组数据, 电子显微镜图像 | 三个年龄段的小鼠心脏组织样本 | NA | 空间转录组学, 蛋白质组学, 代谢组学, 脂质组学 | NA | NA |
| 29 | 2025-11-19 |
Identification and Mechanisms of Osteocyte Subsets Involved in the Pathological Progression of Osteoporosis
2025-Nov-18, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202513427
PMID:41250977
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序识别骨质疏松小鼠骨组织中的六种骨细胞亚群,发现BHR-Ocys亚群通过Sema5a-Plxna1轴调控破骨细胞分化,揭示了骨质疏松病理进展的新机制 | 首次鉴定出Egfr+Il1r1+Sema5a+骨细胞亚群(BHR-Ocys)及其通过Sema5a-Plxna1轴激活PI3K/AKT/Myc信号通路调控骨稳态的新机制 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探究骨细胞亚群异质性对骨质疏松病理过程的影响及潜在分子机制 | 小鼠骨组织中的骨细胞亚群 | 单细胞生物学 | 骨质疏松 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 30 | 2025-11-19 |
Neutrophil Extracellular Trap Reprograms Cancer Metabolism to Form a Metastatic Niche Promoting Non-Small Cell Lung Cancer Brain Metastasis
2025-Nov-18, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202508478
PMID:41250997
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了中性粒细胞胞外诱捕网通过代谢重编程促进非小细胞肺癌脑转移的机制 | 首次发现LOX Malig-5细胞作为转移起始细胞,并揭示了NET-KRT10信号轴和棕榈酸代谢在脑转移微环境形成中的关键作用 | 样本量相对有限(34例患者),需要在更大队列中验证发现 | 探索非小细胞肺癌脑转移的分子机制和潜在治疗策略 | 34例伴有或不伴有脑转移的非小细胞肺癌患者的肿瘤和血液样本 | 多组学分析 | 肺癌 | 空间转录组学、代谢组学、单细胞RNA测序、蛋白质组学 | AI驱动的预测模型 | 多组学数据 | 34例患者(来自湘雅医院和玛丽医院队列) | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序,代谢组学,蛋白质组学 | NA | NA |
| 31 | 2025-11-19 |
scGeneBank: cross-species screening of functional gene sets at single-cell resolution
2025-Nov-18, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1137
PMID:41251182
|
研究论文 | 介绍scGeneBank数据库和分析平台,用于单细胞分辨率下的基因集驱动探索 | 开发首个整合多物种单细胞转录组数据的基因集分析平台,支持跨物种、器官和细胞类型的系统性比较 | NA | 构建统一的基因集活性比较框架,支持发育、进化、衰老、疾病和细胞死亡的系统研究 | 1134个单细胞转录组数据集,涵盖104.9百万个细胞、136个物种、430个器官和1070个解剖区域 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 104.9百万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 32 | 2025-11-19 |
Inhibiting KDM6A Phosphorylation Suppresses Glycolysis in Oral Squamous Cell Carcinoma
2025-Nov-18, Oral diseases
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/odi.70142
PMID:41251278
|
研究论文 | 本研究揭示了KDM6A-pSer829磷酸化通过FBXW7介导的泛素化降解调控口腔鳞状细胞癌糖酵解代谢和细胞增殖的新机制 | 首次发现KDM6A-pSer829是FBXW7的识别位点,并证明该磷酸化修饰在OSCC糖酵解代谢中的关键调控作用 | 研究主要基于小鼠模型,临床样本验证不足 | 探究KDM6A特定翻译后修饰在口腔鳞状细胞癌代谢调控中的作用机制 | 口腔鳞状细胞癌(OSCC)细胞和小鼠模型 | 癌症代谢研究 | 口腔鳞状细胞癌 | Co-IP、免疫印迹、单细胞RNA测序、免疫荧光成像 | 条件性基因敲入小鼠模型 | 单细胞转录组数据、蛋白质相互作用数据 | Kdm6aS829A条件敲入小鼠舌组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 33 | 2025-11-19 |
Sodium butyrate inhibits colorectal cancer development by reducing M2 macrophage polarization and PD-L1 expression
2025-Nov-18, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00692-25
PMID:41251471
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示丁酸钠通过抑制M2巨噬细胞极化和PD-L1表达抑制结直肠癌发展的机制 | 首次结合单细胞转录组学与小鼠模型阐明丁酸钠通过HDAC/TLR4/MyD88信号通路调控肿瘤免疫微环境的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化效果需进一步验证 | 探索丁酸钠抑制结直肠癌发展的分子机制及其与免疫治疗的协同作用 | 结直肠癌小鼠模型和巨噬细胞-结直肠癌共培养系统 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序,RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 34 | 2025-11-19 |
Adenylosuccinate lyase (ADSL) is a pan-cancer prognostic and immune biomarker with distinct roles in hepatocellular carcinoma
2025-Nov-18, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03749-9
PMID:41251948
|
研究论文 | 本研究通过泛癌分析探讨了腺苷琥珀酸裂解酶(ADSL)作为预后和免疫生物标志物的潜力,特别在肝细胞癌中的作用 | 首次系统评估ADSL在多种癌症中的预后价值和免疫调节作用,并在单细胞水平分析其与细胞通讯网络的关系 | 需要进一步研究验证结果并阐明ADSL影响癌症发展的具体机制 | 探索ADSL作为恶性肿瘤广谱预测因子的可行性 | 多种癌症类型,特别关注肝细胞癌(HCC) | 生物信息学 | 肝癌 | 单细胞转录组分析,甲基化评估,免疫浸润评估,细胞通讯分析 | 列线图建模 | 转录组数据,甲基化数据,单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 35 | 2025-11-19 |
Utilizing a novel mitochondrial-related gene signature for predicting the prognosis and immunological impact in bladder cancer
2025-Nov-18, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03927-9
PMID:41252049
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研究论文 | 本研究构建并验证了一个基于线粒体相关基因的膀胱癌预后预测模型 | 首次将线粒体相关基因特征与膀胱癌预后和免疫治疗疗效进行系统性关联分析 | 研究基于公共数据库的回顾性数据,需要前瞻性临床研究进一步验证 | 探索线粒体相关基因在膀胱癌中的作用并构建预后预测模型 | 膀胱癌患者 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 转录组分析,单细胞RNA测序,LASSO回归,Cox回归分析 | 风险评分模型 | 转录组数据,临床数据 | TCGA-BLCA队列和GEO数据集(具体样本数未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 36 | 2025-11-19 |
ZEB1 promotes chemoimmunotherapy resistance in pancreatic cancer models by downregulating chromatin acetylation of CXCL16
2025-Nov-17, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI195970
PMID:40924501
|
研究论文 | 本研究揭示转录因子ZEB1通过下调CXCL16染色质乙酰化驱动胰腺癌化疗免疫治疗耐药的新机制 | 首次发现ZEB1通过表观遗传调控CXCL16表达和SPP1分泌,同时影响肿瘤焦亡和CD8+ T细胞耗竭的双重耐药机制 | 研究主要基于临床前模型,尚未在人体临床试验中验证 | 探究胰腺癌化疗免疫治疗耐药的分子机制并开发新的治疗策略 | 胰腺癌模型(包括患者来源类器官、异种移植和原位模型) | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组测序、空间转录组学、表观遗传分析 | 患者来源类器官、异种移植模型、原位模型 | 转录组数据、表观遗传数据、临床数据 | 胰腺癌患者样本和多种临床前模型 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 37 | 2025-11-19 |
Simultaneous Measurement of RNA Synthesis and Degradation Rates in Single Cells Unveils the Regulatory Mechanisms of Temporal RNA Dynamics
2025-Nov-17, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202510939
PMID:41017207
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研究论文 | 开发了scDUAL-seq方法,首次在单细胞水平同时测量RNA合成和降解速率 | 整合双核苷类似物脉冲标记、化学核苷转化和单细胞RNA测序,实现单细胞中转录组范围内RNA合成和降解的同时记录 | NA | 解析动态过程中RNA调控机制 | 异质性细胞群体 | 单细胞测序技术 | NA | 双核苷类似物脉冲标记,化学核苷转化,单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 38 | 2025-11-19 |
Functional role of granulocytic myeloid-derived suppressor cells in CAR-T therapy: insights from single-cell RNA sequencing in multiple myeloma
2025-Nov-17, Immunopharmacology and immunotoxicology
IF:2.9Q2
DOI:10.1080/08923973.2025.2585083
PMID:41198058
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析多发性骨髓瘤CAR-T治疗中粒细胞性髓源抑制细胞的功能作用 | 首次在CAR-T治疗背景下系统分析G-MDSCs的免疫抑制功能机制,并构建基于G-MDSC基因特征的预后预测模型 | 样本量有限且存在患者间异质性,结果仅为探索性发现 | 全面分析多发性骨髓瘤患者CAR-T治疗中G-MDSCs的功能作用 | 多发性骨髓瘤患者 | 单细胞测序分析 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序,RNA-seq,基因集富集分析,体外功能实验 | 风险预测模型 | 单细胞转录组数据,RNA-seq数据,生存数据 | 7例多发性骨髓瘤患者(CAR-T治疗前后),713例多发性骨髓瘤患者验证队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 39 | 2025-11-19 |
Clonal expansion of alveolar fibroblast progeny drives pulmonary fibrosis in mouse models
2025-Nov-17, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI191826
PMID:40875468
|
研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示了肺泡成纤维细胞后代的克隆扩增是驱动肺纤维化的关键机制 | 首次系统性地证明成纤维细胞增殖在肺纤维化中的关键作用,并发现成纤维细胞先分化为纤维化表型再进行增殖的新机制 | 主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探究成纤维细胞增殖在肺纤维化发病机制中的功能重要性 | 小鼠肺泡成纤维细胞和人类纤维化肺组织 | 病理生物学 | 肺纤维化 | EdU标记、遗传谱系追踪、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、细胞增殖数据 | 两种独立的小鼠肺纤维化模型和人类纤维化肺组织切片 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 40 | 2025-11-19 |
Spatial GWAS Atlas: a knowledgebase for decoding the genetic architecture of complex traits in spatial resolution
2025-Nov-17, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1103
PMID:41243976
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研究论文 | 开发首个系统整合GWAS汇总统计数据与空间转录组数据的知识库,用于在空间分辨率下解析复杂性状的遗传结构 | 首次构建了系统整合GWAS与空间转录组数据的综合资源,能够在单细胞分辨率和空间背景下定位性状相关细胞 | NA | 解码复杂性状在空间分辨率下的遗传结构 | 3854个经过整理的GWAS数据集和635个空间转录组数据集,涵盖多个物种、组织和平台 | 生物信息学 | 复杂性状疾病 | 空间转录组学,全基因组关联分析 | NA | 基因组关联统计数据,空间基因表达数据 | 3854个GWAS数据集和635个空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |