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当前共找到 35174 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 21 | 2026-01-13 |
The role of insulin-like growth factor binding proteins in TGF-β1-induced fibroblast-myofibroblast transition during endometriosis fibrosis
2026-Jan-09, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2026.112362
PMID:41520746
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研究论文 | 本研究探讨了胰岛素样生长因子结合蛋白（IGFBPs）在子宫内膜异位症（EMS）纤维化过程中TGF-β1诱导的成纤维细胞-肌成纤维细胞转化（FMT）中的作用 | 首次定义了IGFBPs在EMS纤维化中的角色，并突出IGFBP6作为潜在的抗纤维化因子和治疗靶点 | NA | 研究IGFBPs在EMS相关纤维化中TGF-β1诱导的FMT过程中的作用 | 子宫内膜异位症（EMS）中的异位子宫内膜细胞，特别是异位子宫内膜基质细胞（EcESCs） | 数字病理学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 22 | 2026-01-13 |
Leveraging single cell multiomic analyses to identify gene regulatory networks that drive human articular cartilage cell fate
2026-Jan-09, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2025.12.025
PMID:41520766
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研究论文 | 本研究利用单细胞多组学和空间转录组学数据，识别驱动人类关节软骨细胞命运的基因调控网络，并建立了一个人类多能干细胞平台来验证预测的转录因子功能 | 首次联合使用单细胞多组学（转录组和开放染色质区域）与高分辨率空间转录组学分析人类胎儿股骨远端发育过程中的软骨细胞亚群，并建立体外实验平台验证计算预测的转录因子功能 | 研究主要基于胎儿发育时间点的样本，成年或病变软骨的调控网络可能有所不同；体外平台可能无法完全模拟体内复杂的微环境 | 识别驱动人类关节软骨细胞命运的基因调控网络，为开发治疗退行性关节疾病的新疗法奠定基础 | 人类胎儿股骨远端软骨细胞、人类多能干细胞分化产生的软骨细胞 | 单细胞组学 | 骨关节炎 | 单细胞多组学分析（转录组与开放染色质联合测序）、空间转录组学 | 基因调控网络预测模型 | 单细胞多组学数据、空间转录组数据 | 2个胎儿时间点的股骨远端样本（单细胞多组学），另加1个时间点进行空间转录组分析 | NA | 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 23 | 2026-01-13 |
Integrative Spatial Omics and Artificial Intelligence: Transforming Cancer Research with Omics Data and AI
2026-Jan-09, Seminars in cancer biology
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.semcancer.2026.01.002
PMID:41520911
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综述 | 本文探讨了空间组学与人工智能在癌症研究中的整合应用，包括空间转录组学和空间蛋白质学等技术的进展及其在肿瘤学中的应用 | 整合多组学数据与组织空间数据，结合人工智能和机器学习技术，以增强对肿瘤微环境空间动态的理解，并推动预测模型和个性化治疗策略的发展 | 面临高维数据复杂性、计算限制以及分析流程标准化等挑战 | 通过整合空间组学和人工智能技术，改善癌症研究中的数据分析、预测建模和临床转化 | 多组学数据（包括基因组学、转录组学、蛋白质组学、表观基因组学、代谢组学）和组织空间数据，以及肿瘤微环境 | 机器学习 | 癌症 | 空间条形码、原位测序、数字空间分析 | 深度学习模型、基于空间图的分析 | 多组学数据、空间数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质学 | NA | NA |
| 24 | 2026-01-13 |
Integrated human and mouse single-cell profiling reveals immune-stromal niche driving silicosis
2026-Jan-09, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2026.01.003
PMID:41520918
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研究论文 | 本研究通过整合人类和小鼠的单细胞RNA测序数据，揭示了矽肺病中免疫-基质微环境的关键驱动机制 | 首次在矽肺病中鉴定出中间CCL2高表达的单核样巨噬细胞（MLM）亚群及其分化为炎症和纤维化前亚型，并开发了位点特异性小鼠模型以揭示免疫-基质相互作用 | 研究主要基于单细胞测序数据，缺乏功能验证实验来确认预测的细胞间相互作用在疾病中的直接作用 | 探究矽肺病中巨噬细胞与基质细胞之间的相互作用如何驱动纤维化进程 | 矽肺病患者和小鼠模型的肺灌洗液细胞 | 数字病理学 | 矽肺病 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | 细胞-细胞通讯建模 | 单细胞RNA测序数据 | 未明确指定样本数量，涉及人类患者和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 25 | 2026-01-13 |
Biomarkers Informed by Single-Cell and Spatial Transcriptomics - Biomarkers for Grade 3 Follicular Lymphoma
2026-Jan-09, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2026.100958
PMID:41521011
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组学数据，识别并验证了AID、CXCR4、CD71和Ki67作为滤泡性淋巴瘤3级的客观生物标志物，旨在改善预后分层 | 首次结合单细胞和空间转录组学数据，从正常生发中心和滤泡性淋巴瘤样本中识别出与中心母细胞和中心细胞相关的基因表达谱，并通过免疫组化验证了这些生物标志物在区分滤泡性淋巴瘤3级中的潜力 | 研究样本量相对较小（59例滤泡性淋巴瘤标本），且需要进一步在统一治疗的队列中进行临床验证 | 识别客观的生物标志物以改进滤泡性淋巴瘤的预后分层，特别是针对3级滤泡性淋巴瘤 | 正常生发中心细胞和滤泡性淋巴瘤样本（包括1-2级和3级） | 数字病理学 | 滤泡性淋巴瘤 | 单细胞RNA测序，空间转录组学，免疫组化 | NA | 转录组数据，图像数据 | 59例滤泡性淋巴瘤标本（42例1-2级，17例3级）及扁桃体样本 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 26 | 2026-01-13 |
Single-cell transcriptomics reveals the landscape of immune phenotypes in pituitary neuroendocrine tumors
2026-Jan-09, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003918
PMID:41521161
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了垂体神经内分泌肿瘤中免疫表型的异质性及细胞间通讯网络 | 首次在单细胞水平上系统描绘了三种主要PitNET谱系（PIT1、SF1、TPIT）中免疫细胞组成的差异，并鉴定出由CTLA4-CD86通路介导的Treg细胞与巨噬细胞/小胶质细胞之间新的免疫抑制性相互作用 | 样本量相对有限（22例），且为单中心研究，可能影响结果的普适性 | 阐明垂体神经内分泌肿瘤的免疫异质性及肿瘤微环境中的细胞间通讯网络 | 22例来自手术患者的新鲜垂体神经内分泌肿瘤样本 | 数字病理学 | 垂体神经内分泌肿瘤 | 单细胞RNA测序，多重免疫组化，流式细胞术，体外共培养实验 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据，流式数据 | 22例新鲜PitNET样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 27 | 2026-01-13 |
Single-cell transcriptome analysis of patient-derived organoids captures inter- and intratumor heterogeneity and uncovers targetable pathways in high grade serous ovarian cancer
2026-Jan-08, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2026.101354
PMID:41520487
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析患者来源的类器官，揭示了高级别浆液性卵巢癌的肿瘤间和肿瘤内异质性，并识别了可靶向的治疗通路 | 首次在患者来源的类器官模型中利用单细胞转录组学全面表征高级别浆液性卵巢癌的细胞异质性，并发现化疗耐药性与氧化磷酸化代谢转换的关联，以及化疗诱导的MHC-II上调作为免疫治疗新靶点 | 研究样本量有限，仅基于类器官模型和少量患者样本，未进行大规模临床验证 | 表征高级别浆液性卵巢癌患者来源类器官的细胞异质性，并探索化疗耐药性的潜在机制和可靶向脆弱性 | 高级别浆液性卵巢癌患者来源的类器官、腹水来源的卵巢癌细胞以及独立患者的组织样本 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞转录组学、免疫组织化学分析、化疗处理实验 | NA | 单细胞转录组数据、组织图像数据 | 来自铂耐药和铂敏感高级别浆液性卵巢癌患者的活检样本衍生的类器官，以及独立患者的组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 28 | 2026-01-13 |
STAN, a computational framework for inferring spatially informed transcription factor activity
2026-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1473
PMID:41521668
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研究论文 | 本文介绍了一种名为STAN的计算框架，用于从空间转录组学数据中推断空间信息化的转录因子活性 | 提出了一个线性混合效应计算方法，整合了TF-靶基因先验知识、mRNA表达、空间坐标和组织学特征，以预测具有空间信息的、斑点特异性的转录因子活性 | NA | 系统性地推断转录因子活性及其在细胞身份中的作用，以充分利用空间转录组学数据的潜力 | 淋巴结、背外侧前额叶皮层、乳腺癌和胶质母细胞瘤的空间转录组学数据集 | 计算生物学 | 乳腺癌, 胶质母细胞瘤 | 空间转录组学 | 线性混合效应模型 | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 29 | 2026-01-13 |
Characterize Oral-to-Blood Microbial DNA Translocation in Individuals with Cocaine Use Disorder
2026-Jan-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.03.686400
PMID:41280052
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研究论文 | 本研究首次证明通过吸烟或鼻吸方式摄入可卡因的个体存在口腔微生物失调及选择性口腔-血液微生物易位 | 首次在人体中证实可卡因使用障碍（CUD）通过吸烟或鼻吸方式导致口腔微生物失调及选择性口腔-血液微生物易位，并发现口腔屏障受损（而非可卡因本身）是免疫紊乱的主要驱动因素 | 样本量较小（10例CUD患者，24例对照），横断面研究设计无法确定因果关系 | 探究口腔是否为可卡因使用障碍患者循环微生物DNA易位的来源 | 可卡因使用障碍患者（CUD）及人口统计学匹配的非药物对照组 | 微生物组学 | 物质使用障碍 | 16S rRNA V4区测序，单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 微生物DNA序列，单细胞转录组数据 | 10例可卡因使用障碍患者，24例非药物对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 30 | 2026-01-13 |
Radial-glia-to-astrocyte trans-differentiation and astrocyte transcriptional convergence are coordinated by CEH-43/DLX in C. elegans
2026-Jan-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.17.682973
PMID:41279325
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研究论文 | 本研究揭示了线虫中CEH-43/DLX转录因子协调径向胶质细胞向星形胶质细胞转分化和星形胶质细胞转录趋同的分子机制 | 首次在线虫中通过谱系限制性单细胞RNA测序，解析了无细胞分裂条件下径向胶质细胞向星形胶质细胞转化的两阶段分子程序，并发现CEH-43/DLX转录因子的保守调控作用 | 研究主要基于线虫模型，在哺乳动物系统中的直接验证尚不充分 | 探究径向胶质细胞向星形胶质细胞转化过程中转录趋同的分子调控机制 | 线虫CEPsh星形胶质细胞及其前体细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 31 | 2026-01-13 |
STAHD: a scalable and accurate method to detect spatial domains in high-resolution spatial transcriptomics data
2026-Jan-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf619
PMID:41212773
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研究论文 | 本文提出了一种名为STAHD的可扩展且高效的方法，用于在高分辨率空间转录组学数据中检测空间域 | 结合图注意力自编码器和多层次k路图分割技术，将大型图分解为紧凑子图并生成低维嵌入，从而提高了计算效率和聚类准确性 | NA | 开发一种可扩展且准确的方法，以检测高分辨率空间转录组学数据中的空间域 | 人类和小鼠的空间转录组学数据集 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 图注意力自编码器 | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 32 | 2026-01-13 |
Spider: a flexible and unified framework for simulating spatial transcriptomics data
2026-Jan-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf562
PMID:41237053
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研究论文 | 本文提出了一个名为Spider的灵活统一框架，用于模拟空间转录组学数据，无需真实数据作为参考 | Spider通过使用细胞类型比例和相邻细胞间的转移矩阵来表征空间模式，能够生成更真实、更多样化的模拟数据，并提供比现有方法更强的建模灵活性 | NA | 解决空间转录组学分析工具基准测试中因“金标准”数据集多样性和准确性有限而导致的有效性和公平性问题 | 空间转录组学数据模拟 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达谱和细胞位置信息 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 33 | 2026-01-13 |
Disruption of Pre-Bötzinger Complex neuropeptidergic tonality controls fear and metabolic response
2026-Jan-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.01.697304
PMID:41509333
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研究论文 | 本研究揭示了脑干preBötzinger复合体通过PACAP信号通路整合应激、呼吸与代谢的神经肽能环路机制 | 首次发现呼吸节律发生器preBötC作为应激响应枢纽，通过PACAP受体信号协调棕色脂肪和肝脏的代谢适应 | 未明确PACAP信号在人类对应系统中的保守性，缺乏长期应激模型的验证 | 解析应激反应与外周代谢调控的中枢神经环路 | 小鼠脑干preBötzinger复合体神经元及其外周投射靶器官 | 神经科学 | 代谢紊乱 | 病毒示踪、空间转录组学、c-Fos全脑图谱、基因敲降 | NA | 基因表达数据、神经示踪数据、代谢表型数据 | 未明确 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 34 | 2026-01-13 |
Tumor-infiltrating natural killer cell profiling for therapeutic stratification in patients with resectable non-small cell lung cancer
2026-Jan-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.01.696292
PMID:41509400
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，识别了与非小细胞肺癌患者吸烟状态相关的自然杀伤细胞亚群，并探讨了这些细胞亚群在手术和辅助化疗免疫治疗中的预后和治疗分层价值 | 首次在非小细胞肺癌中识别出与吸烟和慢性阻塞性肺疾病严重程度相关的两种自然杀伤细胞亚群，并揭示了它们在治疗选择中的潜在指导作用 | 样本量相对有限，且为回顾性研究，需要前瞻性验证 | 识别与吸烟相关的免疫细胞决定因素，以指导非小细胞肺癌患者的治疗策略 | 非小细胞肺癌患者的肺组织样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 计算机细胞反卷积分析 | NA | RNA测序数据 | 61例肺组织用于单细胞RNA测序，102例切除的非小细胞肺癌和24例接受新辅助化疗免疫治疗后手术的患者用于批量RNA测序分析 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 35 | 2026-01-13 |
Single cell RNA-sequencing reveals an association between testosterone treatment and reduced hormone signaling in the human mammary gland
2026-Jan-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.31.697241
PMID:41509433
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序，揭示了睾酮治疗与人类乳腺中激素信号传导减少之间的关联 | 首次在人口统计学匹配的队列中，使用单细胞RNA测序比较了接受睾酮替代治疗的跨性别男性与顺性别女性的乳腺组织，直接观察了睾酮对乳腺细胞转录组的影响 | 样本量相对较小，且为观察性研究，无法完全排除混杂因素的影响 | 探究睾酮替代治疗对乳腺生物学的影响及其长期安全性 | 接受睾酮替代治疗的跨性别男性和顺性别女性的乳腺组织 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 一个人口统计学匹配的队列（具体数量未在摘要中明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 36 | 2026-01-13 |
Integrative Single-Cell and Machine Learning Analysis Identifies a Nucleotide Metabolism-Related Signature Predicting Prognosis and Immunotherapy Response in LUAD
2026-Jan-02, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers18010160
PMID:41514669
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据和机器学习算法，构建了一个核苷酸代谢相关特征，用于预测肺腺癌的预后和免疫治疗反应 | 首次在单细胞水平上系统描绘了肺腺癌中核苷酸代谢的异质性，并将其与肿瘤微环境中的细胞通讯和免疫抑制联系起来，构建了一个跨队列稳健的预后和免疫治疗反应预测特征 | 研究主要基于公共数据集进行生物信息学分析，关键基因ENO1的功能验证仅在体外细胞系中进行，缺乏体内实验和临床样本的进一步验证 | 探究核苷酸代谢重编程在肺腺癌肿瘤异质性、免疫微环境塑造及恶性进展中的作用，并开发相关的预后和疗效预测工具 | 肺腺癌患者肿瘤组织中的细胞（重点关注恶性上皮细胞） | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 机器学习 | 多种机器学习算法组合（共101种） | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据 | 来自公共数据库（如TCGA、GEO）的多个肺腺癌患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 37 | 2026-01-13 |
Squidiff: predicting cellular development and responses to perturbations using a diffusion model
2026-Jan, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02877-y
PMID:41184550
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研究论文 | 本文介绍了一种基于扩散模型的生成框架Squidiff，用于预测不同细胞类型在环境变化下的转录组变化 | 通过连续去噪和语义特征整合，Squidiff能够学习瞬时细胞状态并预测高分辨率的转录组景观 | NA | 预测细胞发育和对扰动的响应，以揭示细胞命运决定的调控原则 | 细胞分化、基因扰动和药物响应预测，以及血管类器官发育和细胞对中子辐射及生长因子的响应 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 扩散模型 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 38 | 2026-01-13 |
Lipidomics and single-cell transcriptomics uncover aberrant lipid metabolism in metaplasia lesions during gastric carcinogenesis
2026-Jan, Journal of gastroenterology
IF:6.9Q1
DOI:10.1007/s00535-025-02315-y
PMID:41239006
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研究论文 | 本研究通过脂质组学和单细胞转录组学分析，揭示了胃黏膜肠化生病变中异常的脂质代谢特征，特别是甘油三酯和脂滴的积累，并探索了靶向脂质代谢的治疗潜力 | 首次结合脂质组学和单细胞转录组学技术，系统揭示了胃黏膜肠化生病变中独特的脂质代谢特征，并利用基因敲除小鼠模型和患者来源的类器官模型验证了靶向脂质代谢通路（如DGAT1）的治疗效果 | 研究主要基于小鼠模型和有限的临床样本，需要在更大规模的人群队列中验证脂质代谢标志物的临床意义和治疗靶点的有效性 | 阐明胃黏膜肠化生在胃癌发生过程中的脂质代谢特征，并探索靶向脂质代谢的预防和治疗策略 | 幽门螺杆菌感染的Ddit4基因敲除小鼠、人类胃黏膜肠化生组织、慢性非萎缩性胃炎组织、患者来源的胃癌类器官 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序、脂质组学分析、免疫组织化学、免疫荧光、BODIPY染色 | NA | 单细胞转录组数据、脂质组学数据、组织图像数据 | 未明确说明具体样本数量，但涉及小鼠模型、人类组织样本和类器官模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 39 | 2026-01-13 |
Meta single-cell atlas and xQTL post-GWAS analysis revealed the pathogenic features of thyroid cancer for target therapy: A multi-omics study
2026-Jan, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-025-00988-4
PMID:41249621
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研究论文 | 本研究整合单细胞转录组学、批量转录组学和GWAS数据，通过多组学方法揭示甲状腺癌的致病特征，并构建机器学习模型用于疾病预测 | 首次结合单细胞图谱、xQTL后GWAS分析和多机器学习建模，系统识别甲状腺癌的致病基因和免疫亚型，并开发交互式网页应用 | 未明确说明样本来源的种族或地理多样性，可能影响结果的普适性 | 识别甲状腺癌的致病基因特征和免疫微环境，开发诊断预测模型 | 甲状腺癌患者样本 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞转录组学, 批量转录组学, GWAS, 免疫组化 | 多机器学习建模（包括glmBoost, RF等） | 转录组数据, 遗传数据, 图像数据 | 未明确指定具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 40 | 2026-01-13 |
Lung Microphysiological System Validates Novel Cell Therapy for Acute Respiratory Distress Syndrome
2026-Jan, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202500225
PMID:41263118
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研究论文 | 本研究开发了一种新型肺微生理系统来模拟急性呼吸窘迫综合征（ARDS）环境，并评估了人脐带血来源的间充质干细胞（hUCB-pMSCs）作为潜在替代疗法的疗效 | 开发了一种新型肺微生理系统（MPS）来模拟ARDS环境，并首次将hUCB-pMSCs与地塞米松在该系统中进行比较评估 | 研究基于体外微生理系统模拟，可能无法完全复制体内复杂的生理环境 | 评估hUCB-pMSCs作为ARDS替代治疗方法的疗效 | 人脐带血来源的间充质干细胞（hUCB-pMSCs）和地塞米松在模拟ARDS的肺微生理系统中的治疗效果 | 数字病理学 | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序，荧光成像 | NA | 图像，测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |