单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 40356 篇文献,本页显示第 321 - 340 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
321 2026-06-10
Single-Cell Sequencing Combined with RNA Sequencing Reveals the Role of Natural Killer Cells in Prognosis and Immunotherapy Response in Cervical Squamous Cell Carcinoma
2026, Critical reviews in immunology IF:0.8Q4
研究论文 结合单细胞测序和RNA测序揭示自然杀伤细胞在宫颈鳞状细胞癌预后和免疫疗法反应中的作用 首次通过整合单细胞测序和转录组测序数据,鉴定高活性NK细胞相关基因并构建预后风险模型,为宫颈鳞状细胞癌的免疫治疗提供新靶点 未说明明确的局限性(需根据全文推断,但摘要未提及) 探究高活性NK细胞相关基因在宫颈鳞状细胞癌预后和免疫治疗中的潜在价值 宫颈鳞状细胞癌患者的转录组和单细胞测序数据 机器学习 宫颈鳞状细胞癌 RNA-seq, 单细胞测序 Cox回归, LASSO回归, WGCNA 基因表达数据 NA(摘要未明确样本数量) NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
322 2026-06-10
Integrated single-cell and transcriptomic profiling identifies machine-learning-based pyroptosis biomarkers in IBD
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过整合单细胞和转录组数据,利用机器学习方法识别炎症性肠病中与细胞焦亡相关的生物标志物 首次结合单细胞RNA测序和多种机器学习算法(LASSO、GBM、SVM、Boruta、随机森林)筛选出六种具有诊断潜力的细胞焦亡关键基因,并鉴定出巨噬细胞、上皮细胞和中性粒细胞是焦亡最活跃的细胞类型 未提及样本间异质性验证和纵向队列数据支持;单细胞分析仅限于肠道黏膜样本,可能无法完全代表全身性焦亡动态 探索炎症性肠病中细胞焦亡的关键细胞类型和调控基因,并筛选非侵入性诊断生物标志物 炎症性肠病患者的肠道黏膜样本和外周血转录组数据 生物信息学 炎症性肠病 单细胞RNA测序、RNA-seq LASSO, GBM, SVM, Boruta, Random Forest 基因表达数据 未明确提及样本数量(依据单细胞和bulk转录组数据集) NA 单细胞RNA测序 NA NA
323 2026-06-10
UNC93B1 promotes pancreatic cancer progression through modulation of cGAS-STING signaling
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过多组学整合分析,发现UNC93B1通过调控cGAS-STING信号通路促进胰腺癌进展,并验证其作为诊断标志物和治疗靶点的潜力 首次结合单细胞转录组、空间转录组、GWAS和机器学习框架系统鉴定UNC93B1在胰腺癌中的关键作用,并阐明其通过抑制cGAS-STING通路促进免疫抑制微环境和转移的机制 依赖公开数据集中有限的样本量,体外功能验证仅采用部分细胞系,体内模型为皮下移植瘤,未涉及原位模型或患者来源异种移植模型(PDX) 揭示胰腺导管腺癌(PDAC)的分子驱动因素,阐明UNC93B1在肿瘤微环境中的功能及其机制,为精准治疗策略提供依据 胰腺导管腺癌(PDAC)肿瘤组织、PDAC细胞系及异种移植瘤模型 数字病理学, 机器学习 胰腺癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序, 基因组关联研究(GWAS), 基因敲低, 蛋白质印迹, 流式细胞术 Seurat, Harmony, scPagwas, hdWGCNA, LASSO回归, 随机森林, 支持向量机, GSVA, Monocle2, CellChat 单细胞转录组数据、批量转录组数据、空间转录组数据、GWAS数据、蛋白质表达数据 单细胞RNA测序:22个PDAC样本(GSE154778, GSE212966);批量转录组队列:GSE28735、GSE62452;TCGA-PAAD项目:172例生存数据;GWAS数据:196,187例;体外验证:4个PDAC细胞系;体内模型:皮下异种移植瘤 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 NA NA
324 2026-06-10
Single-cell and spatial transcriptomics reveal transplant-associated T cells and myeloid cells in human liver transplantation
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序和空间转录组学分析人类肝移植中的移植相关T细胞和髓系细胞 首次整合单细胞RNA测序与空间转录组学,高分辨率揭示肝移植排斥反应中免疫细胞的动态变化及空间分布 样本量有限,未提供具体样本数量;机制验证缺乏体内功能实验支持 探究肝移植排斥反应中肝内免疫细胞的动态变化及相互作用 人类肝移植术后不同阶段的移植物组织 数字病理学 肝病 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 基因表达数据,空间转录组数据 未明确说明 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
325 2026-06-10
Molecular interplay of ASNS and the PI3K-AKT-mTOR pathway in CMV and HIV co-infections: Therapeutic implications
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究揭示了天冬酰胺合成酶(ASNS)在巨细胞病毒(CMV)和HIV共感染中的关键代谢信号枢纽作用及其与PI3K-AKT-mTOR通路的相互作用,为共感染治疗提供了新靶点 首次发现ASNS作为CMV/HIV共感染中的代谢信号枢纽,并验证其与PI3K-AKT-mTOR通路的相互作用,通过分子对接发现西多福韦以高亲和力结合ASNS 研究主要基于生物信息学分析和计算模拟,缺乏体外或体内实验验证,结论尚需进一步实验确认 探究CMV/HIV共感染中ASNS与PI3K-AKT-mTOR通路的分子相互作用及其治疗意义 CMV/HIV共感染患者,转录组数据及单细胞RNA测序数据 计算机视觉 感染性疾病 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 分子对接 NA 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
326 2026-06-10
Microglia heterogeneity and therapeutic strategies in Parkinson's disease
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 系统描述了帕金森病中小胶质细胞的异质性及靶向治疗策略的进展与挑战 利用单细胞转录组学技术揭示了小胶质细胞在帕金森病中的功能多样性及表型谱变化 未提供具体的实验数据或大规模临床验证结果 总结帕金森病靶向小胶质细胞的干预和治疗策略,为精准治疗提供指导 小胶质细胞 digital pathology 帕金森病 单细胞转录组学 NA NA NA NA single-cell RNA-seq NA NA
327 2026-06-10
Unique chicken B cell development: species-specific mechanisms and contradictory requirements of B cell receptor for post-hatched B cell development
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 综述了鸡B细胞发育的独特三阶段过程,重点围绕法氏囊及其与哺乳动物B细胞发育的差异 发现鸡B细胞发育依赖于替代进化策略,如通过AID介导的基因转换而非V(D)J重组产生抗体多样性,且RAG1敲除鸡仍能维持B细胞群体,揭示了BCR信号在孵化后B细胞发育中的矛盾需求 未提及具体局限性,主要依赖现有基因敲除和单细胞测序研究,可能缺乏体内功能验证 比较鸡与哺乳动物(尤其是人)B细胞发育的物种特异性机制,阐明法氏囊在B细胞发育中的核心作用 鸡B细胞发育各阶段(前法氏囊期、法氏囊期、后法氏囊期)的细胞和分子机制 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
328 2026-06-10
Blinatumomab-driven T-cell activation in αβ and γδ T-cell subsets: insights from in vitro assays
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 双特异性T细胞衔接器Blinatumomab在αβ和γδ T细胞亚群中驱动T细胞激活的比较研究 系统比较了Blinatumomab在αβ T细胞和γδ T细胞亚群中的效应功能,并发现唑来膦酸扩增的Vγ9Vδ2 γδ T细胞系具有与PHA扩增的αβ T细胞相当的细胞毒性,提示γδ T细胞可能补充Blinatumomab介导的细胞毒性 研究基于健康供体体外实验,未包含患者样本;单细胞转录组学仅分析一名供体,样本量有限 阐明Blinatumomab在常规αβ T细胞和非传统γδ T细胞中介导的免疫机制,为γδ T细胞与Blinatumomab联合治疗策略提供框架 健康成人体外扩增的αβ T细胞和γδ T细胞 生物医学研究 B细胞前体急性淋巴细胞白血病 多参数流式细胞术、靶向单细胞转录组学 NA 基因表达数据、细胞表型数据 来自健康供体的新鲜分离和体外扩增的T细胞,单细胞转录组学仅分析一名供体 NA 单细胞转录组学 NA 靶向单细胞转录组学(未指定具体平台型号)
329 2026-06-10
Diversity and function of tumor-associated macrophages in brain metastases: mechanisms and therapeutic prospects
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文综述了脑转移瘤中肿瘤相关巨噬细胞的多样性、功能及治疗前景 通过单细胞研究揭示了超越传统M1/M2二分类的多种功能性亚群,如脂质相关巨噬细胞,并探讨了靶向TAMs的新策略如CAR-巨噬细胞和纳米技术 TAMs高度异质性、靶向特异性不足及血脑屏障递送障碍等挑战 探讨脑转移瘤中TAMs的多样性、功能及其作为治疗靶点的潜力 脑转移瘤中的肿瘤相关巨噬细胞 机器学习 脑转移瘤 单细胞测序、空间转录组学 NA 文本 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 用于单细胞RNA测序和空间转录组学研究的平台
330 2026-06-10
ECM remodeling-associated immune signatures and hub proteins: predictive markers and therapeutic targets for metastatic gastric cancer
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过蛋白质组学和单细胞RNA测序,识别与胃癌转移相关的细胞外基质重塑标志物和枢纽蛋白,并验证其作为预测标志物和治疗靶点的潜力 综合运用蛋白质组学、单细胞RNA测序和轨迹分析,系统揭示细胞外基质重塑在胃癌转移中的复杂机制,并识别RPS29等新枢纽蛋白在转移中的调控作用 具体分子机制理解仍不充分,需要进一步实验验证 识别与胃癌转移相关的细胞外基质重塑免疫特征和枢纽蛋白,探索其作为预测标志物和治疗靶点的价值 胃癌细胞及其细胞外基质蛋白 数字病理学 胃癌 蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 轨迹分析 NA 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
331 2026-06-10
Single-cell transcriptome delineating asymmetric dynamics of CD4+ T and CD8+ T cell lineage commitment in human prenatal thymus
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过整合单细胞转录组数据,解析人类产前胸腺中CD4+和CD8+ T细胞谱系定型的不对称多阶段动态过程 揭示了人类产前胸腺中CD4/CD8细胞谱系定型并非单一事件,而是信号水平、时间维度和微环境水平三个维度上的不对称多阶段动态过程 NA 表征人类产前胸腺中T细胞发育的细胞异质性和分子动力学 人类产前胸腺细胞(7至23孕周) 机器学习 NA 单细胞转录组测序 NA 单细胞转录组数据 来自5个已发表数据集的整合数据,覆盖7至23孕周样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
332 2026-06-10
Exosomal POSTN from cancer-associated fibroblasts drives progression of microinvasive lung adenocarcinoma: insights from single-cell and tissue exosome sequencing analysis
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过单细胞和胞外体RNA测序分析,发现来源于癌症相关成纤维细胞的胞外POSTN驱动微浸润肺腺癌进展 首次结合单细胞RNA测序和组织胞外体RNA测序,揭示POSTN阳性成纤维细胞及其胞外体在微浸润肺腺癌向侵袭性肺腺癌进展中的关键作用 样本量较小,仅涉及4例MIA病灶;功能验证主要依赖体外和异种移植模型,缺乏体内原位模型验证 阐明微浸润肺腺癌的肿瘤微环境细胞生态系统,以及POSTN阳性成纤维细胞及其胞外体在早期肺腺癌进展中的作用和机制 微浸润肺腺癌(MIA)及其配对癌旁组织、肺腺癌细胞系、异种移植小鼠模型 机器学习 肺癌 单细胞RNA测序, 组织胞外体RNA测序 NA 基因表达数据 4例MIA病灶及其配对癌旁组织 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序, 胞外体RNA测序 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒用于单细胞RNA测序,组织胞外体RNA测序在Illumina NovaSeq平台上进行
333 2026-06-10
Primary Cilium Forces Neuroendocrine Shift in Prostate Cancer through YAP1 Repression and Reduced Mitochondrial Activity
2026, Theranostics IF:12.4Q1
研究论文 本研究探讨了初级纤毛在前列腺癌神经内分泌转化中的作用,通过YAP1抑制和线粒体活性降低介导这一过程 首次揭示初级纤毛与前列腺癌神经内分泌转化和代谢重编程之间的直接关联,提出GLI1/IFT20或GLI1/IFT80阳性特征作为纤毛化神经内分泌亚群的标志物 YAP1抑制单独不足以诱导纤毛发生,且神经内分泌转化仅为部分实现 探究初级纤毛在前列腺癌神经内分泌转化中的分布及其功能相关性 去势抵抗性前列腺癌样本和神经内分泌样细胞 数字病理学 前列腺癌 单细胞RNA测序 NA 图像, 文本 去势抵抗性前列腺癌样本中FDG-PET阳性和神经内分泌特征阳性的肿瘤细胞 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium NA
334 2026-06-10
Multi-Omics and Single-Cell Dissection Reveals EXT1 as a Glycosylation-Linked Therapeutic Target in Cancer
2026, Oncology research IF:2.0Q3
研究论文 通过多组学和单细胞分析揭示EXT1作为糖基化相关癌症治疗靶点的作用 首次发现EXT1是连接糖基化和炎症的关键酶,并在泛癌水平验证其作为基质激活、免疫检查点参与和肿瘤进展驱动因子的作用 未提供具体实验验证(如敲除或药物抑制)的体内外功能确认 探究糖基转移酶EXT1在炎症、基质重塑和免疫逃逸驱动的癌症中的机制桥梁作用 泛癌队列(TCGA)、胰腺腺癌和肺腺癌组织微阵列 机器学习 胰腺癌, 肺腺癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序, DNA甲基化分析, 分子对接, 免疫组化 LASSO Cox回归 转录组数据, 单细胞转录组数据, DNA甲基化数据, 组织微阵列图像 TCGA泛癌队列(包含多种癌症类型),PAAD和LUAD组织微阵列(具体样本数未提及) NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
335 2026-06-10
Identification of immunosuppressive neutrophils using multi-omics: why functional testing remains key
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 探讨多组学方法鉴定免疫抑制性中性粒细胞的局限性,强调功能检测在定义中性粒细胞亚群中的关键作用 指出单细胞RNA测序在识别免疫抑制性中性粒细胞方面的不足,提倡结合蛋白质组学等多组学技术与功能验证来精准定义亚群 目前单细胞RNA测序未能明确PMN-MDSC的免疫表型特征,功能检测的临床相关性仍缺乏 分析多组学技术在中性粒细胞亚群鉴定中的现状,强调功能测试的必要性 人类多形核中性粒细胞(PMNs)及髓源性抑制细胞(PMN-MDSCs) 机器学习 癌症 scRNA-seq NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
336 2026-06-10
The MAPK Pathway Coordinates an Immunosuppressive Microenvironment in Colorectal Cancer: A Single-Cell Guided Prognostic Model
2026, Cancer informatics IF:2.4Q3
研究论文 通过单细胞与多组学分析构建结直肠癌免疫抑制微环境预后模型 首次整合单细胞RNA测序与多组学数据,确定MAPK信号通路为免疫抑制微环境核心模块,并构建17基因预后风险评分 未在独立外部队列或前瞻性研究中验证模型的预测性能,且单细胞数据样本量较小可能限制发现的普适性 探索结直肠癌免疫抑制微环境的细胞组成与信号调控网络,开发临床相关的预后模型 结直肠癌肿瘤微环境中的巨噬细胞和成纤维细胞 机器学习 结直肠癌 单细胞RNA测序、多组学分析 NA 转录组数据、单细胞RNA测序数据 9个样本的单细胞RNA测序数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
337 2026-06-09
Wumei Wan restores the colonic mucus barrier by modulating TGF-β/Smad signaling to promote goblet cell differentiation in ulcerative colitis
2026-Sep-15, Journal of ethnopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 该研究通过整合定量蛋白质组学、单细胞RNA测序和结肠类器官等技术,揭示了乌梅丸通过调节TGF-β/Smad信号通路促进杯状细胞分化、恢复溃疡性结肠炎结肠黏液屏障的作用机制 首次系统阐明了乌梅丸通过TGF-β/Smad信号轴调控肠道祖细胞向杯状细胞分化的分子机制,实现了从动物表型到细胞命运的跨尺度验证 研究未提及临床试验验证,且分子机制的深入探索(如具体靶点蛋白)可能仍需进一步实验支持 阐明乌梅丸改善溃疡性结肠炎的分子机制,重点关注杯状细胞命运调控和黏液屏障修复 溃疡性结肠炎小鼠模型、结肠类器官和细胞系 机器学习 溃疡性结肠炎 单细胞RNA测序, 定量蛋白质组学, 超高效液相色谱-高分辨质谱, 分子对接 NA 图像 DSS诱导的结肠炎小鼠模型,未提及具体样本数量 Illumina 单细胞RNA测序 NA NA
338 2026-06-09
LC3B promotes bladder cancer cell proliferation via the Sp1-cyclin D1/p27 axis with pan-cancer clinical associations
2026-Sep, Cellular signalling IF:4.4Q2
研究论文 本研究揭示了LC3B通过Sp1-Cyclin D1/p27轴促进膀胱癌细胞增殖的机制,并在泛癌水平上评估了其临床相关性 首次在膀胱癌中阐明LC3B的非经典功能,即独立于脂化的转录调控作用,并通过单细胞测序和泛癌分析揭示了其与细胞周期及预后的广泛关联 未明确LC3B脂化与非脂化功能的具体分子边界,且泛癌分析主要基于公共数据库,缺乏独立验证队列 明确LC3B在膀胱癌中的表达模式、生物学功能和分子机制,并评估其在多种癌症中的临床意义 膀胱癌上皮细胞及T24T、J82膀胱癌细胞系 癌症生物学 膀胱癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 膀胱癌单细胞样本及泛癌多组学公共数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
339 2026-06-09
GLUL drives metabolic reprogramming and confers docetaxel resistance in prostate cancer
2026-Aug, Biochemical pharmacology IF:5.3Q1
研究论文 该研究发现谷氨酸-氨连接酶在驱动前列腺癌代谢重编程和多西他赛耐药中起关键作用 首次鉴定GLUL作为多西他赛耐药的关键代谢驱动因子,并揭示谷氨酰胺合成是CRPC中可药用的治疗脆弱点 尚未在更多独立队列中验证,且GLUL下游具体分子机制需进一步深入研究 阐明前列腺癌中多西他赛耐药的代谢决定因素 多西他赛耐药的前列腺癌患者标本和细胞系模型 癌症代谢 前列腺癌 转录组学,代谢组学,单细胞RNA测序 NA RNA序列数据,代谢物数据 临床标本及独立验证队列,具体数量未在摘要中说明 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 用于单细胞RNA测序分析
340 2026-06-09
Hypoxia-driven TCF21/CCL11 axis in GCMSCs orchestrates macrophage polarization and lymphatic remodeling to promote gastric cancer lymph node metastasis
2026-Aug, Biochemical pharmacology IF:5.3Q1
研究论文 本研究揭示了低氧驱动的GCMSCs中TCF21/CCL11轴通过调控巨噬细胞极化和淋巴管重塑促进胃癌淋巴结转移的机制 首次发现GCMSCs分泌的CCL11通过非直接作用于肿瘤细胞,而是通过调控巨噬细胞M2极化和淋巴内皮细胞重塑来促进胃癌淋巴结转移,并阐明了低氧-TCF21-CCL11轴的核心调控机制 NA 阐明胃癌相关间充质干细胞(GCMSCs)介导的旁分泌因子在淋巴结转移中的作用及分子机制 胃癌相关间充质干细胞(GCMSCs)、巨噬细胞、淋巴内皮细胞(LECs)、胃癌细胞系 machine learning 胃癌 单细胞RNA测序、转录组分析、细胞因子谱分析 NA 转录组数据、细胞因子数据、单细胞RNA测序数据 临床样本(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
回到顶部