单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 3181 - 3200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3181 | 2025-10-06 |
TNF drives aberrant BMP signaling to induce endothelial and mesenchymal dysregulation in pulmonary hypertension
2025-Jul-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.174456
PMID:40569693
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析TNF-Tg肺动脉高压模型中内皮细胞和间充质细胞的分子互作机制 | 首次揭示TNF信号通过激活内皮细胞NF-κB和SMAD2/3信号通路导致BMP信号传导异常的新机制 | 研究仅使用小鼠模型，未在人类样本中验证 | 阐明肺动脉高压发病过程中内皮细胞与间充质细胞的分子互作机制 | 野生型和TNF-Tg转基因小鼠的肺内皮细胞和间充质细胞 | 单细胞生物学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序，免疫荧光染色，配体-受体相互作用分析，转录因子结合分析，RNA速率评估 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | WT和TNF-Tg小鼠的肺细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3182 | 2025-10-06 |
Pathogenesis of Graves' Disease Determined Using Single-Cell Sequencing with Thyroid Autoantigen Peptide Stimulation in B Cells
2025-Jul-17, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14141102
PMID:40710355
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析格雷夫斯病患者B细胞对甲状腺自身抗原肽刺激的免疫反应 | 首次在单细胞水平上比较了格雷夫斯病患者外周血和甲状腺内B细胞对多种甲状腺自身抗原的差异反应 | 样本量有限，仅分析了接受甲状腺切除术的患者 | 阐明格雷夫斯病中B细胞对甲状腺自身抗原的免疫应答机制 | 格雷夫斯病患者的B细胞 | 单细胞测序 | 格雷夫斯病 | 单细胞RNA测序，B细胞受体分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 接受甲状腺切除术的格雷夫斯病患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3183 | 2025-10-06 |
A pluripotent stem cell atlas of multilineage differentiation
2025-Jul-15, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-025-05549-w
PMID:40664685
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了人多能干细胞多谱系分化的综合图谱 | 首次提供了从多能性到所有胚层细胞类型的全面单细胞转录组时间序列数据，涵盖从原肠胚形成到祖细胞和定型细胞状态 | 研究基于体外分化系统，可能与体内发育存在差异 | 研究发育信号通路在多谱系分化中的作用，推进对分化信号调控的理解 | 人多能干细胞及其分化产生的各类细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过60,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3184 | 2025-10-06 |
Regulation of Hindbrain Vascular Development by rps20 in Zebrafish
2025-Jul-13, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14141070
PMID:40710323
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研究论文 | 本研究通过斑马鱼模型揭示了rps20基因在后脑血管发育中的关键作用及其与衰老相关脑血管缺陷的关联 | 首次发现rps20基因在衰老过程中下调，并通过CRISPR/Cas9技术证明其对后脑中央动脉发育和血管稳态维持的关键作用 | 研究主要基于斑马鱼模型，在哺乳动物中的适用性需要进一步验证 | 探究衰老相关基因在脑血管发育中的作用机制 | 斑马鱼胚胎和成年个体 | 发育生物学 | 神经系统疾病 | scRNA-seq, CRISPR/Cas9, qPCR, 整体原位杂交 | 斑马鱼体内模型 | 基因表达数据, 影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3185 | 2025-10-06 |
Computational and Imaging Approaches for Precision Characterization of Bone, Cartilage, and Synovial Biomolecules
2025-Jul-09, Journal of personalized medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jpm15070298
PMID:40710415
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综述 | 本文综述了用于精确表征骨骼、软骨和滑膜生物分子的计算与成像方法的最新进展 | 整合了先进成像技术、计算建模和测序方法，实现关节组织的高分辨率非侵入性表征 | 临床广泛应用需要健全的数据基础设施、监管合规性和医生教育 | 通过多学科方法实现肌肉骨骼疾病的精准诊断和治疗 | 骨骼、软骨和滑膜组织的生物分子和微观结构 | 医学影像分析 | 退行性关节疾病 | RNA-seq, 空间转录组学, 蛋白质组学, 影像组学 | CNN, 有限元模型, 基于代理的模型 | 医学影像, 分子数据 | NA | NA | 空间转录组学, 蛋白质组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3186 | 2025-10-06 |
An amphiregulin reporter mouse enables transcriptional and clonal expansion analysis of reparative lung Tregs
2025-Jul-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.187245
PMID:40626358
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研究论文 | 本研究开发了一种能够检测活细胞中双调蛋白表达的报道小鼠模型，用于研究修复性肺Treg细胞的转录组特征和克隆扩增 | 首次创建了能够分离活的双调蛋白产生细胞的报道小鼠模型，实现了对修复性Treg细胞的功能性分析 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床应用的转化价值需要进一步验证 | 研究修复性肺Treg细胞的转录特征和克隆扩增机制 | 小鼠肺组织中的调节性T细胞 | 单细胞生物学 | 肺损伤 | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序 | NA | 单细胞转录组数据, TCR序列数据 | 使用流感A和博来霉素诱导的肺损伤小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3187 | 2025-10-06 |
Allergen induces pulmonary neuroendocrine cell hyperplasia in a model of asthma
2025-Jul-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.187018
PMID:40626365
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研究论文 | 本研究揭示了过敏原通过诱导肺神经内分泌细胞增生加剧哮喘反应的机制 | 首次发现过敏原暴露可导致肺神经内分泌细胞通过增殖和俱乐部细胞转分化两种途径发生增生 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类哮喘患者中验证 | 探究肺神经内分泌细胞在过敏原诱导哮喘反应中的调控机制 | 小鼠肺神经内分泌细胞 | 呼吸疾病研究 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3188 | 2025-10-06 |
The Integrated Function of the Lateral Hypothalamus in Energy Homeostasis
2025-Jul-08, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14141042
PMID:40710295
|
综述 | 本文整合近期分子与功能研究发现，系统阐述外侧下丘脑区在能量稳态调控中的核心作用 | 通过单细胞转录组学揭示LHA中30余种神经元亚型的分子异质性，并建立其与代谢信号感知-行为响应的完整调控网络 | 作为综述文章未提供原始实验数据，主要基于现有研究进行整合分析 | 阐明外侧下丘脑区在能量稳态和动机行为中的整合功能 | 外侧下丘脑区神经元亚型及其神经环路 | 神经科学 | 肥胖及相关代谢疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3189 | 2025-10-06 |
EVscope: A Comprehensive Bioinformatics Pipeline for Accurate and Robust Analysis of Total RNA Sequencing from Extracellular Vesicles
2025-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.24.660984
PMID:40666973
|
研究论文 | 开发了一个专门用于细胞外囊泡RNA测序数据分析的生物信息学流程EVscope | 采用优化的全基因组期望最大化算法，显著提高多映射读段分配精度，并首次生成基于EM的BigWig文件用于下游分析 | NA | 解决细胞外囊泡RNA测序数据分析中的技术挑战，提供标准化计算工作流程 | 细胞外囊泡RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | RNA测序 | 期望最大化算法 | RNA测序数据 | NA | NA | 总RNA测序 | NA | NA |
| 3190 | 2025-10-06 |
Spatial Proofreading Amplification of in situ Transcript and Protein Signals
2025-Jun-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.11.659176
PMID:40661487
|
研究论文 | 本文提出了一种受动力学校对原理启发的无酶信号放大方法，用于增强空间转录组学中的原位转录本和蛋白质信号 | 首次将动力学校对原理应用于信号放大，通过短寡核苷酸探针在靶位点的迭代沉积和光交联形成高度稳定的DNA组装体 | NA | 开发更明亮的信号放大方法以提高空间转录组学实验的检测效率和缩短成像时间 | 原位转录本和蛋白质信号 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，信号放大技术 | NA | 图像信号 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3191 | 2025-10-06 |
Uncovering Heterogeneous Effects via Localized Feature Selection
2025-Jun-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.03.657761
PMID:40661389
|
研究论文 | 提出一种利用局部化特征选择方法识别疾病相关特征的创新框架 | 开发了基于局部化检验统计量的特征选择框架，能够针对个体特征识别疾病相关特征，并利用knockoffs方法控制选择集的噪声水平 | 未明确说明方法在更大规模数据集上的可扩展性和计算效率 | 开发能够识别个体层面异质性的疾病相关特征选择方法 | 阿尔茨海默病的单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 局部化特征选择框架 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3192 | 2025-10-06 |
Genetic and genomic insights into male reproductive tract development
2025-Jun, Fertility and sterility
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.fertnstert.2025.03.024
PMID:40174856
|
综述 | 通过遗传和基因组学方法探讨男性生殖道发育机制的研究综述 | 整合单细胞测序数据构建发育图谱，首次系统识别269个MRT相关基因及其在关键发育阶段的表达模式 | 人类与小鼠模型表型术语存在差异，知识体系需要进一步统一 | 解析男性生殖道发育的遗传基础及其与成年疾病的关系 | 男性生殖道发育相关基因与细胞类型 | 基因组学 | 男性生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序, 空间分子测量 | NA | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | 人类表型本体35个术语对应269个基因，含小鼠对比数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3193 | 2025-10-06 |
Immune cell type divergence in a basal chordate
2025-May-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.20.655184
PMID:40661343
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术定义了基础脊索动物血细胞状态的身份 | 首次在基础脊索动物中发现循环血液中存在至少八种主要形态类型的分化层次结构 | 无脊椎动物免疫细胞的分子特征研究有限，与脊椎动物免疫细胞类型的同源性仍不明确 | 研究基础脊索动物免疫细胞类型的分化与进化 | 基础脊索动物的血细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序,原位杂交,活体报告基因 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3194 | 2025-10-06 |
A systematic review of single-cell RNA sequencing applications and innovations
2025-Apr, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
综述 | 本文系统综述了单细胞RNA测序技术的应用与创新，重点关注胰岛细胞研究 | 全面总结了scRNA-seq在理解细胞类型、基因活性和细胞相互作用方面的最新进展 | 作为综述文章，不包含原始实验数据，主要基于现有文献分析 | 系统评估单细胞RNA测序技术的应用、创新和挑战 | 胰岛细胞及复杂组织中的细胞多样性 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3195 | 2025-10-06 |
Graph neural networks for single-cell omics data: a review of approaches and applications
2025-Mar-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf109
PMID:40091193
|
综述 | 系统回顾图神经网络在单细胞组学数据分析中的应用方法和研究成果 | 首次系统综述了107个图神经网络及其六种变体在单细胞组学中的成功应用，并总结了77个常用公开数据集 | 当前研究存在潜在不足，未来需要进一步探索改进方向 | 探讨图神经网络在单细胞组学数据分析中的应用现状和发展前景 | 单细胞组学数据及其分析任务 | 机器学习 | NA | 单细胞测序技术 | 图神经网络(GNN)及其六种变体 | 单细胞组学数据 | 77个公开数据集 | NA | 单细胞表观基因组学, 单细胞转录组学, 空间转录组学, 蛋白质组学, 多组学 | NA | NA |
| 3196 | 2025-10-06 |
Retinoic acid antagonizes estrogen signaling to maintain adult uterine cell fate
2025-Feb-04, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2416089122
PMID:39874292
|
研究论文 | 本研究揭示了视黄酸通过拮抗雌激素信号维持成年小鼠子宫上皮细胞命运的重要机制 | 首次发现视黄酸与雌激素信号通路在维持成年子宫上皮细胞命运中的拮抗平衡机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类子宫中的类似机制需要进一步验证 | 探究成年子宫上皮细胞命运维持的分子机制 | 小鼠子宫上皮细胞 | 发育生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序，基因敲除模型 | 遗传学小鼠模型 | 基因表达数据，组织学图像 | 三种相关基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3197 | 2025-10-06 |
Intercellular TIMP-1-CD63 signaling directs the evolution of immune escape and metastasis in KRAS-mutated pancreatic cancer cells
2025-Jan-18, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02207-4
PMID:39825392
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研究论文 | 本研究揭示了KRAS突变胰腺癌细胞通过TIMP-1-CD63信号通路逃避免疫清除和促进转移的机制 | 首次发现早期浸润巨噬细胞通过TIMP-1-CD63信号维持ERKactiveDUSP2low癌细胞群体，形成恶性循环促进胰腺癌进展 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探究KRAS突变上皮细胞如何获得逃逸衰老和免疫清除能力，进展为晚期胰腺导管腺癌 | 胰腺导管腺癌(PDAC)细胞、巨噬细胞、基因工程小鼠模型 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 数字空间转录组分析 | 基因工程小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 体内实验数据 | 原发PDAC肿瘤样本、人和小鼠原代胰腺癌细胞系、免疫健全小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3198 | 2025-10-06 |
FGFR2 directs inhibition of WNT signaling to regulate anterior fontanelle closure during skull development
2025-Jan-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204264
PMID:39775862
|
研究论文 | 本研究通过小鼠遗传学和单细胞转录组学揭示了FGFR2通过调控WNT信号通路影响前囟闭合的机制 | 首次发现FGFR2通过非自主性调控WNT信号通路影响前囟细胞分化，揭示了FGF-WNT信号回路在颅缝形成中的作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床应用需进一步验证 | 探究FGFR2如何调控前囟闭合的分子机制 | 小鼠前囟细胞和颅骨成骨前沿细胞 | 发育生物学 | 颅缝早闭综合征 | 单细胞转录组测序, 遗传学分析 | 小鼠遗传模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3199 | 2025-10-06 |
Immune cell single-cell RNA sequencing analyses link an age-associated T cell subset to symptomatic benign prostatic hyperplasia
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1585446
PMID:40692782
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析发现与年龄相关的T细胞亚群与症状性良性前列腺增生的关联 | 首次鉴定出与年龄相关的GZMKhi GZMBlow CD8+ T细胞亚群（Taa），并揭示其通过颗粒酶K介导的机制促进前列腺基质细胞衰老相关分泌表型 | 样本量有限，仅分析了少量年轻和老年前列腺样本 | 探究年龄相关免疫细胞变化在良性前列腺增生发病机制中的作用 | 人类前列腺组织中的免疫细胞和BPH患者来源的成纤维细胞 | 单细胞组学 | 前列腺疾病 | 单细胞RNA测序，ELISA，速度分析 | NA | 单细胞RNA测序数据，细胞因子测量数据 | 老年男性大小前列腺样本（≤40g和≥90g）及3个年轻器官捐赠者前列腺样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3200 | 2025-10-06 |
Mapping the immunological landscape and emerging immunotherapeutic strategies in cervical cancer: a comprehensive review
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1620501
PMID:40708940
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综述 | 本文全面综述宫颈癌免疫景观特征及新兴免疫治疗策略 | 整合单细胞RNA测序、空间转录组学等前沿技术解析肿瘤免疫微环境异质性 | 缺乏预测免疫治疗疗效的可靠生物标志物，患者间免疫景观存在高度异质性 | 开发针对宫颈癌的有效个体化免疫疗法 | 宫颈癌肿瘤免疫微环境（肿瘤细胞、免疫浸润细胞、基质成分） | 肿瘤免疫学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重成像 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |