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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 2841 - 2860 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2841 | 2025-10-06 |
DNFE: Directed network flow entropy for detecting tipping points during biological processes
2025-Jul, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013336
PMID:40729372
|
研究论文 | 开发了一种基于有向网络流熵的方法，用于检测生物过程中的临界状态和驱动网络 | 提出了有向网络流熵方法，能够将组学数据转换为有向网络，相比传统无向网络方法具有更好的鲁棒性和有效性 | NA | 识别生物过程中的临界状态和驱动网络，预测活跃转录因子和暗基因 | 基因调控网络、转录因子、暗基因 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序、批量测序 | 有向网络流熵算法 | 组学数据、单细胞数据、批量数据 | 六个真实数据集（三个单细胞数据集、两个批量肿瘤数据集、一个血液数据集） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2842 | 2025-10-06 |
Phenotypic Analysis of Nasal CD69+ CD4+ Tissue-Resident Memory T Cells in Eosinophilic Chronic Rhinosinusitis With Nasal Polyps
2025-Jul, Journal of rhinology : official journal of the Korean Rhinologic Society
DOI:10.18787/jr.2025.00025
PMID:40744699
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研究论文 | 本研究通过流式细胞术分析嗜酸性慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者鼻腔CD69+ CD4+组织驻留记忆T细胞的表型和功能特征 | 首次发现鼻腔CD69+ CD103- CD4+ TRM细胞高频率表达Th2细胞标志物，并与疾病严重程度相关 | 样本来源仅限于手术患者，未涉及疾病早期阶段或不同亚型的比较分析 | 阐明嗜酸性慢性鼻窦炎中组织驻留记忆T细胞的表型和功能特征 | 嗜酸性慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者的鼻腔息肉组织和外周血样本 | 免疫学 | 慢性鼻窦炎 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 流式细胞数据, 单细胞RNA测序数据 | 接受内窥镜鼻窦手术的ECRS患者鼻腔组织和/或外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2843 | 2025-10-06 |
Distinct single-cell transcriptional profile in CD4+ T-lymphocytes among obese children with asthma
2025-Mar-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00270.2024
PMID:39868576
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了肥胖哮喘儿童与正常体重哮喘儿童CD4+ T淋巴细胞的转录组差异 | 首次在单细胞水平揭示肥胖哮喘儿童独特的CD4+ T细胞转录特征，发现IL-7R、IL-32、PARP-1等新通路 | 样本量较小（8名参与者），需要进一步验证 | 表征肥胖哮喘儿童与正常体重哮喘儿童的单细胞CD4+转录谱差异 | 肥胖和正常体重哮喘儿童的CD4+ T淋巴细胞 | 单细胞转录组学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 8名哮喘儿童（4名肥胖，4名正常体重） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2844 | 2025-10-06 |
Uncovering the molecular mechanisms of Qingdu Zengye Decoction in the treatment of nasopharyngeal carcinoma: an integrative investigation
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1648294
PMID:40746726
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研究论文 | 通过整合计算药理学、功能实验和单细胞转录组分析揭示清毒增液汤治疗鼻咽癌的分子机制 | 首次结合网络药理学、分子对接和单细胞RNA测序技术系统阐明清毒增液汤在鼻咽癌治疗中的多靶点调控机制 | 未明确说明样本量大小，机制研究主要基于体外实验 | 阐明清毒增液汤治疗鼻咽癌的作用机制 | 鼻咽癌肿瘤细胞和肿瘤微环境 | 计算生物学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序,网络药理学,分子对接,蛋白质印迹,功能实验 | NA | 转录组数据,蛋白质相互作用数据,分子对接数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2845 | 2025-10-06 |
Epiplakin expression is lost in psoriatic skin lesions and is downregulated by IFN-γ in ex vivo skin cultures
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1617737
PMID:40746860
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫荧光分析发现epiplakin在银屑病皮损中特异性下调，并证实IFN-γ是其下调的主要调控因子 | 首次发现epiplakin是plakin家族中唯一在银屑病皮损中特异性下调的成员，并揭示IFN-γ依赖的调控机制 | 研究主要基于外植体皮肤培养和小鼠模型，需要进一步在人体内验证 | 探究epiplakin在炎症性皮肤病银屑病中的表达调控机制 | 人类银屑病皮肤样本、健康皮肤样本、小鼠表皮 | 皮肤病学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 细胞因子处理 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 银屑病和健康皮肤样本（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2846 | 2025-10-06 |
Exploring the prognostic significance and therapeutic potential of SUCLG2 in prostate cancer
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1592779
PMID:40747103
|
研究论文 | 本研究构建了基于脂质代谢的前列腺癌风险模型，并探讨了SUCLG2在肿瘤进展和治疗抵抗中的关键作用 | 首次从脂质代谢角度构建16基因风险预后模型，并发现SUCLG2在管腔和基底/中间细胞亚群中的特异性富集 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证仅限于细胞系和部分临床样本 | 开发前列腺癌有效诊断和治疗策略，探索SUCLG2作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 前列腺癌患者样本（497例TCGA数据）和前列腺癌上皮细胞系22Rv1 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 高通量RNA测序、单细胞RNA测序、实时定量PCR、免疫荧光 | Cox比例风险回归、LASSO回归、基因集富集分析 | RNA测序数据、单细胞测序数据、临床样本数据 | 497例前列腺癌样本和22Rv1细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2847 | 2025-10-06 |
Transcriptome combined single-cell sequencing explores molecular mechanisms of ANGPTL4 in sepsis-induced acute lung injury
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0328551
PMID:40743234
|
研究论文 | 本研究通过转录组分析结合单细胞测序探索ANGPTL4在脓毒症诱导的急性肺损伤中的分子机制 | 首次系统分析ANGPTL4在急性肺损伤进展中的时空表达模式和功能网络，并预测其与药物的相互作用 | ANGPTL4与Q9BY76-槲皮素的相互作用需要进一步研究验证 | 探索ANGPTL4在脓毒症诱导的急性肺损伤中的分子机制 | 急性肺损伤患者和小鼠模型 | 单细胞测序 | 急性肺损伤 | 转录组分析, 单细胞测序, 分子对接 | NA | 基因表达数据 | 从GEO数据库获取的急性肺损伤患者数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2848 | 2025-10-06 |
Integrating single-cell regulatory atlas and multi-omics data for differential treatment response and multimodal predictive modeling in CDK 4/6 inhibitor-treated breast cancer
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1585574
PMID:40746611
|
研究论文 | 整合单细胞调控图谱和多组学数据，开发CDK4/6抑制剂治疗乳腺癌的差异治疗反应预测模型 | 首次构建肿瘤预后调控子指数(TPRI)作为CDK4/6抑制剂反应预测的新型生物标志物，并通过多组学整合和实验验证 | 甲基化数据整合的样本量有限 | 解码CDK4/6抑制剂耐药机制并开发预测性生物标志物 | HR+/HER2-乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA-seq, 多组学分析, qPCR, SCENIC, 逻辑回归 | 逻辑回归, 多模态预测模型 | 基因表达数据, 转录组数据, miRNA数据 | 单细胞数据14个样本, 批量多组学数据1149个样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量多组学 | NA | NA |
| 2849 | 2025-10-06 |
"Molecular pigeon" network of lncRNA and miRNA: decoding metabolic reprogramming in patients with lung cancer
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1578927
PMID:40746614
|
综述 | 本文综述了lncRNA和miRNA在肺癌患者代谢重编程中的关键作用及其分子调控网络 | 提出'分子信鸽'网络概念，系统阐述lncRNA-miRNA网络通过竞争性内源RNA机制调控肺癌代谢重编程的新机制 | NA | 解析lncRNA和miRNA在肺癌代谢重编程中的调控网络，为肺癌靶向治疗提供新见解 | 肺癌患者中的长链非编码RNA和微小RNA | 分子生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2850 | 2025-10-06 |
A low level of tumor necrosis factor α in tumor microenvironment maintains the self-renewal of glioma stem cells by Vasorin-mediated glycolysis
2024-Dec-05, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noae147
PMID:39093693
|
研究论文 | 本研究探讨肿瘤微环境中低水平TNFα通过Vasorin介导的糖酵解维持胶质瘤干细胞自我更新的机制 | 首次揭示低水平TNFα通过VASN介导的糖酵解促进胶质瘤干细胞自我更新的新机制 | 未明确说明样本规模和研究局限性 | 探索肿瘤微环境中TNFα对胶质瘤干细胞自我更新的调控作用及其临床意义 | 胶质瘤干细胞和肿瘤相关巨噬细胞 | 肿瘤生物学 | 胶质母细胞瘤 | 空间转录组学,RNA测序,单细胞RNA测序,质谱分析 | 体外和体内模型 | 基因表达数据,蛋白质数据,单细胞数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2851 | 2025-10-06 |
Integrated immuno-transcriptomic analysis of ovarian cancer identifies a four-chemokine-dominated subtype with antitumor immune-active phenotype and favorable prognosis
2024-Oct, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02803-7
PMID:39095528
|
研究论文 | 通过整合免疫转录组分析识别卵巢癌中由四种趋化因子主导的免疫活性亚型 | 首次在卵巢癌中发现由CXCL9、CXCL10、CXCL11和CXCL13四种趋化因子主导的免疫活性亚型，并揭示其与良好预后的关联 | 研究基于回顾性数据，需要前瞻性研究验证；样本来源多样可能存在批次效应 | 探索卵巢癌中Th-1免疫反应与临床预后的关系，识别免疫活性亚型 | 卵巢癌患者肿瘤样本 | 生物信息学 | 卵巢癌 | 转录组测序，单细胞RNA测序，免疫组织化学 | 免疫特征分类模型 | 基因表达数据，单细胞转录组数据，病理图像数据 | 2850个卵巢癌样本（来自19个数据集），39个单细胞测序样本，39个免疫组化验证样本 | NA | 单细胞RNA测序，转录组分析，免疫组织化学 | NA | NA |
| 2852 | 2025-10-06 |
Basophils Play a Protective Role in the Recovery of Skin Barrier Function from Mechanical Injury in Mice
2024-Aug, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2023.12.024
PMID:38286187
|
研究论文 | 本研究揭示了嗜碱性粒细胞通过下调IL-17A表达在皮肤机械损伤后屏障功能恢复中的保护作用 | 首次发现嗜碱性粒细胞通过拮抗IL-17A对表皮和脂质代谢基因表达的影响，促进皮肤屏障功能恢复 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中得到验证 | 探究皮肤机械损伤后屏障功能恢复的分子机制 | 小鼠皮肤机械损伤模型 | 免疫学 | 皮肤损伤 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 小鼠皮肤组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2853 | 2025-10-06 |
Spock2 Functions as a Key Time-Series Gene of Endothelial Cells in Sepsis-Induced Cardiomyopathy
2024-Aug-01, Journal of cardiovascular pharmacology
IF:2.6Q2
DOI:10.1097/FJC.0000000000001577
PMID:39115722
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研究论文 | 本研究通过分析脓毒症小鼠模型和单细胞测序数据，揭示了Spock2作为内皮细胞关键时间序列基因在脓毒症心肌病中的保护作用 | 首次发现Spock2是脓毒症心肌病中内皮细胞的关键时间依赖性差异表达基因，并证实其具有抗凋亡保护功能 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，尚未在人类脓毒症患者中进行验证 | 探究脓毒症心肌病的发病机制 | 脓毒症小鼠模型和人类脐静脉内皮细胞 | 生物信息学 | 脓毒症心肌病 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 加权基因共表达网络分析, 时间序列分析, 免疫荧光 | NA | 转录组数据, 单细胞测序数据 | GSE171546和GSE207363数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 2854 | 2025-10-06 |
Data-driven selection of analysis decisions in single-cell RNA-seq trajectory inference
2024-03-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae216
PMID:38725155
|
研究论文 | 开发了一个名为Escort的新框架，用于评估单细胞RNA测序数据是否适合轨迹推断并量化分析决策对轨迹属性的影响 | 提出了首个通过数据驱动评估来指导单细胞轨迹分析决策选择的框架，减少了方法选择的不确定性 | NA | 解决单细胞RNA测序轨迹推断中分析方法选择的不确定性问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2855 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA-seq data analysis reveals functionally relevant biomarkers of early brain development and their regulatory footprints in human embryonic stem cells (hESCs)
2024-03-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae230
PMID:38739758
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人类胚胎干细胞早期神经元发育过程中的差异表达基因及其调控网络 | 首次在人类胚胎干细胞神经元分化过程中系统识别了539个差异表达基因，并构建了包含转录因子和miRNA的基因调控网络 | 研究仅基于体外培养的干细胞分化模型，未验证在体内环境中的适用性 | 阐明早期人类大脑发育的分子机制和转录调控动态 | 人类胚胎干细胞(hESCs)及其分化至神经元的细胞 | 单细胞组学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 人类胚胎干细胞分化第26天和第54天的单细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2856 | 2025-10-06 |
Error modelled gene expression analysis (EMOGEA) provides a superior overview of time course RNA-seq measurements and low count gene expression
2024-03-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae233
PMID:38770716
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研究论文 | 提出一种名为EMOGEA的RNA-seq数据分析框架，专门用于处理时序RNA-seq数据和低计数基因表达分析 | 开发了能够整合测量不确定性的分析框架，特别适用于监测动态现象，并能处理低计数转录本和小倍数变化的基因表达 | NA | 改进时序RNA-seq数据的分析方法，提高对动态基因调控过程的理解 | 时序RNA-seq数据，包括斑马鱼胚胎发育和小鼠植入前胚胎的单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | EMOGEA框架 | RNA-seq数据，单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2857 | 2025-10-06 |
Revealing cell-cell communication pathways with their spatially coupled gene programs
2024-03-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae202
PMID:38706319
|
研究论文 | 提出一种名为IGAN的新方法，通过空间相邻细胞间的基因关联网络推断细胞间通讯及其上下游通路 | 首次实现估计两个特定空间相邻单细胞间的基因关联网络，并构建全景细胞互作-通路图谱 | NA | 开发能够探索细胞间通讯上下游通路的新计算方法 | 空间相邻的单个细胞 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 基因关联网络 | 空间转录组数据 | 多个公共数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2858 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing data imputation using bi-level feature propagation
2024-03-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae209
PMID:38706317
|
研究论文 | 提出一种用于单细胞RNA测序数据插值的双层特征传播方法 | 开发了scBFP方法，通过两步图特征传播同时利用基因-基因和细胞-细胞关系，避免影响非零值并减少噪声传播 | 未明确说明方法在极端稀疏数据或特定细胞类型中的性能限制 | 解决单细胞RNA测序数据中的技术噪声、丢失事件和稀疏性问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图特征传播 | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 2859 | 2025-10-06 |
β-cell Jagged1 is sufficient but not necessary for islet Notch activity and insulin secretory defects in obese mice
2024-Mar, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2024.101894
PMID:38311286
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研究论文 | 本研究探讨了Jagged1在肥胖小鼠胰岛Notch信号激活和胰岛素分泌缺陷中的作用 | 首次证明β细胞Jagged1足以但非必要引起肥胖小鼠的胰岛Notch活性和胰岛素分泌缺陷 | 遗传功能丧失实验表明β细胞可能不是Jagged1信号的主要来源，机制仍需进一步阐明 | 研究Jagged1在肥胖诱导的β细胞功能障碍中的作用机制 | 高脂饮食喂养小鼠、瘦素受体缺陷小鼠、2型糖尿病患者胰岛 | 分子生物学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序, 葡萄糖耐量测试, 葡萄糖刺激胰岛素分泌测定 | 转基因小鼠模型, 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 生理功能数据 | 多种小鼠模型和人类胰岛样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2860 | 2025-10-06 |
Data-driven selection of analysis decisions in single-cell RNA-seq trajectory inference
2023-Dec-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.18.572214
PMID:38187768
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研究论文 | 开发了Escort框架用于评估单细胞RNA测序数据是否适合轨迹推断并量化分析决策对轨迹特性的影响 | 提出了首个通过数据驱动评估来指导单细胞轨迹分析决策的框架，减少了方法选择和参数优化的不确定性 | 未提及具体的性能验证数据集规模或与其他方法的详细比较结果 | 解决单细胞RNA测序轨迹推断中分析方法选择不确定性的问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 轨迹推断方法 | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |