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当前共找到 38047 篇文献,本页显示第 2781 - 2800 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
2781 2026-02-26
Neural network-assisted RNA velocity imputation for empowering transcript dynamics-based analyses
2026-Mar-20, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本文提出了一种名为NARVI的深度学习框架,用于通过神经网络辅助RNA速度插补,以解决现有RNA速度估计工具因技术限制或模型假设而无法计算大量基因速度的问题 利用深度学习学习可计算基因的表达模式与速度之间的关系,从而准确估计原本无法计算的基因速度,扩展了基于转录动力学的下游分析范围 未在摘要中明确提及具体限制 解决RNA速度估计工具在单细胞转录组数据分析中因技术限制或模型假设导致的基因速度计算缺失问题,以增强基于转录动力学的下游分析能力 单细胞转录组数据集中的基因速度估计 机器学习 NA 单细胞RNA测序 深度学习框架(神经网络) 单细胞转录组数据 多个单细胞转录组数据集(未指定具体样本数量) NA 单细胞RNA-seq NA NA
2782 2026-02-26
Tumor cell-derived IFN spatially reprograms osteopontin-enriched macrophage niches to promote PARP inhibitor resistance
2026-Mar-06, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究通过整合空间转录组学、单细胞RNA测序和多重免疫组化技术,揭示了肿瘤细胞来源的IFN通过诱导巨噬细胞表达SPP1,形成免疫抑制微环境,从而导致PARP抑制剂耐药的机制 首次在空间层面揭示了IFN-SPP1轴在PARP抑制剂耐药中的作用,并证明SPP1可作为治疗靶点和预后生物标志物 研究主要基于卵巢癌样本和HRD小鼠模型,在其他癌症类型中的普适性有待验证 探究PARP抑制剂耐药的机制,并寻找克服耐药的治疗策略 高级别浆液性卵巢癌患者样本和HRD小鼠模型 数字病理学 卵巢癌 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 多重免疫组化 NA 空间转录组数据, 单细胞转录组数据, 图像数据 来自前瞻性新辅助尼拉帕利单药治疗试验的样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 PhenoCycler-Fusion PhenoCycler-Fusion空间分析平台
2783 2026-02-26
High-throughput proteomics uncovers molecular clusters and biomarkers of severity in bullous pemphigoid
2026-Mar, Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology : JEADV IF:8.4Q1
研究论文 本研究通过高通量蛋白质组学分析,揭示了天疱疮(BP)中局部和全身炎症反应的分子特征,并识别了与疾病严重程度相关的生物标志物 首次使用Olink Target 96炎症面板全面分析BP的皮肤和血清蛋白质组,识别出CCL13等关键炎症蛋白,并基于蛋白质组数据定义了两种分子亚型,揭示了BP的生物学异质性 样本量相对较小(29例皮肤活检和27例匹配血清),且为观察性研究,需要更大规模的前瞻性研究验证 全面分析BP的局部和系统性炎症反应,探索其与疾病严重程度、临床特征和治疗结果的关联 天疱疮患者的皮肤活检和血清样本,以及健康对照样本 蛋白质组学 天疱疮 Olink Target 96炎症面板蛋白质组学分析,单细胞RNA测序 主成分分析、无监督聚类、差异表达分析、基因集富集分析、k-means聚类 蛋白质组数据、转录组数据 29例BP皮肤活检、27例匹配血清样本、14例健康对照 Olink 高通量蛋白质组学,单细胞RNA测序 Olink Target 96 Inflammation panel Olink Target 96炎症面板用于蛋白质组分析,公开可用的单细胞RNA测序数据集用于外部验证
2784 2026-02-26
Multi-omics analysis identifies SMPD1 as a key contributor in sphingolipid pathway for Type 2 diabetes pathogenesis
2026-Mar, Genes & genomics IF:1.6Q3
研究论文 本研究通过多组学分析,确定SMPD1是2型糖尿病发病机制中鞘脂代谢通路的关键贡献因子 整合基因组、转录组和代谢组数据,并结合孟德尔随机化分析与体内实验,首次系统性地证实了SMPD1在2型糖尿病发病中的因果作用和致病机制 研究主要基于小鼠模型和部分人类数据,需要在更广泛的人类队列中进行验证;对SMPD1影响下游信号通路的分子机制探索尚不全面 识别和表征导致2型糖尿病发病的关键鞘脂通路成分 2型糖尿病患者、代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD)患者的肝脏组织、瘦型和ob/ob肥胖小鼠模型 多组学分析 2型糖尿病 多组学整合分析、孟德尔随机化分析、全基因组关联研究(GWAS)、体内实验 NA 基因组数据、转录组数据、代谢组数据 涉及人类GWAS数据、T2D患者血液代谢组数据、MASLD肝脏组织bulk和单细胞RNA-seq数据集,以及瘦型和ob/ob小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
2785 2026-02-26
Molecular analysis of tumor recurrence using established cancer stem cell-line and drug discovery
2026-Mar, International journal of clinical oncology IF:2.4Q3
研究论文 本文通过开发LGR5特异性单克隆抗体和建立具有干细胞特性的结直肠癌细胞系PLR123,研究了癌症干细胞在肿瘤复发中的作用,并发现RNA聚合酶I抑制剂BMH-21能有效抑制复发 开发了LGR5特异性单克隆抗体和高灵敏度免疫荧光方法,建立了维持干细胞特性的结直肠癌细胞系PLR123及体外复发模型,并通过单细胞RNA测序和小分子筛选发现BMH-21作为新型抑制剂 未明确说明样本量或临床验证的局限性,研究主要基于细胞系和模型系统 阐明癌症干细胞在结直肠癌复发中的作用机制,并开发预防肿瘤复发的新疗法 结直肠癌干细胞、LGR5标记物、PLR123细胞系、肿瘤复发模型 癌症生物学 结直肠癌 单细胞RNA测序、免疫荧光、小分子筛选 体外复发模型 基因表达数据、图像数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2786 2026-02-26
Correction to "A comparison of integration methods for single-cell RNA sequencing data and ATAC sequencing data"
2026-03, Quantitative biology (Beijing, China)
correction 本文是对先前发表的关于单细胞RNA测序数据与ATAC测序数据整合方法比较文章的更正 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
2787 2026-02-26
Distribution and Levels of Insulin-like Growth Factor 2 Receptor Across Mouse Brain Cell Types
2026-Mar, Receptors (Basel, Switzerland)
研究论文 本研究通过免疫荧光染色和单细胞RNA测序数据比较,系统评估了成年雄性C57BL/6J小鼠大脑中胰岛素样生长因子2受体在不同脑细胞类型和脑区的分布与表达水平 首次全面揭示了IGF-2R蛋白在多种脑细胞类型中的特异性分布,特别是在兴奋性和抑制性神经元中的高富集,以及其在树突和轴突区室中的定位 研究仅限于成年雄性C57BL/6J小鼠,未涵盖其他年龄、性别或物种,且依赖公开的单细胞RNA测序数据库进行mRNA表达比较 探究IGF-2R在大脑不同细胞类型和亚细胞区室中的分布与表达水平,以增进对其在脑功能和疾病中作用的理解 成年雄性C57BL/6J小鼠的大脑组织,包括海马体和皮质区域 神经科学 神经发育和神经退行性疾病 双重和多重免疫荧光染色,单细胞RNA测序数据分析 NA 图像数据,公开的RNA测序数据 成年雄性C57BL/6J小鼠 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2788 2026-02-26
Chromatin accessibility landscapes define stromal cell identities across tissues
2026-Feb-25, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究利用单细胞ATAC测序技术绘制了小鼠多种组织的染色质可及性图谱,揭示了染色质可及性在定义基质细胞身份中的关键作用 首次在多种组织中系统绘制单细胞染色质可及性图谱,并证明染色质可及性特征可用于追溯基质细胞的组织来源 研究仅限于小鼠模型,人类组织的验证尚需进一步研究 探索不同组织中染色质可及性景观及其在细胞身份调控中的作用 小鼠九种组织中的51,248个细胞 表观基因组学 NA 单细胞ATAC测序 NA 表观基因组数据 51,248个细胞,来自九种小鼠组织 NA 单细胞ATAC-seq NA NA
2789 2026-02-26
SPP1+ neutrophil and exhausted CD8⁺ T cells infiltration predicting the early recurrence of hepatocellular carcinoma patients after R0 resection
2026-Feb-25, International journal of surgery (London, England)
研究论文 本研究通过整合临床数据、单细胞RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序数据,揭示了与肝细胞癌术后早期复发高风险相关的肿瘤微环境特征,特别是SPP1⁺中性粒细胞和耗竭CD8⁺ T细胞的浸润及其相互作用 首次系统性地结合单细胞RNA测序、空间转录组学和临床数据,识别出SPP1⁺中性粒细胞亚型与耗竭CD8⁺ T细胞在肝细胞癌早期复发患者肿瘤微环境中的关键作用及其空间共定位,并揭示了它们通过SPP1-CD44等轴介导的免疫抑制机制 研究样本量相对有限(如scRNA-seq仅涉及28个HCC样本),且主要基于回顾性队列分析,需要前瞻性研究进一步验证 探究肝细胞癌术后早期复发的肿瘤微环境细胞异质性及其免疫学机制 肝细胞癌患者及其肿瘤组织、外周血样本 数字病理学 肝癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 NA 临床数据, 单细胞RNA测序数据, 空间转录组学数据, 批量RNA测序数据 402例患者(临床分析),28个HCC样本(scRNA-seq发现队列),17个HCC组织和7个匹配外周血样本(scRNA-seq验证队列),365例患者(TCGA-LIHC验证队列) NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq NA NA
2790 2026-02-26
Research trends of tumor-associated macrophages in colorectal cancer: a bibliometric analysis
2026-Feb-25, International journal of surgery (London, England)
文献计量分析 本文通过文献计量学方法,系统分析了结直肠癌中肿瘤相关巨噬细胞的研究趋势与前沿 首次对结直肠癌TAMs研究领域进行全面的文献计量与可视化分析,识别了关键研究集群和未来方向 分析基于Web of Science数据库,可能未涵盖所有相关文献;文献计量方法主要反映趋势,不涉及具体机制验证 描绘结直肠癌肿瘤相关巨噬细胞的研究格局与新兴前沿 全球范围内关于结直肠癌肿瘤相关巨噬细胞的研究出版物 文献计量学 结直肠癌 文献计量分析、可视化分析(VOSviewer、CiteSpace) NA 文献元数据 2861篇出版物 NA NA NA NA
2791 2026-02-26
Single-cell transcriptomics unveils the immunologic landscape of anti-PD-1-associated indirect drug-induced liver injury
2026-Feb-25, Journal of gastroenterology IF:6.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学揭示了抗PD-1治疗诱导的间接药物性肝损伤的免疫学机制 首次在荷瘤条件下提供了抗PD-1诱导肝损伤小鼠模型中肝脏微环境的单细胞图谱,揭示了代谢重编程和促纤维化表型,并发现NETosis激活与肝损伤进展密切相关 研究基于小鼠模型,人类样本验证有限,且机制探索可能未涵盖所有病理因素 探究免疫检查点抑制剂(特别是抗PD-1)引起的肝损伤(ILICI)的病理机制 C57BL/6J小鼠的Lewis肺癌模型及患者肝组织样本 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 小鼠模型组和对照组,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2792 2026-02-26
Single-cell Spatial Transcriptomics Reveals Hepatocyte Reprogramming in Fontan Associated Liver Disease
2026-Feb-24, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究利用单细胞空间转录组学技术,揭示了Fontan相关肝病中肝细胞的重编程现象,特别是在晚期纤维化阶段 首次在FALD中应用单细胞空间转录组学,识别出具有细胞应激和冗余区域基因表达的独特肝细胞亚群,并发现WNT2信号异常驱动肝细胞区域破坏 样本量较小(早期和晚期纤维化各1例用于ST分析),且为横断面研究,难以确定因果关系 探究Fontan相关肝病的病理生理学机制,特别是肝细胞重编程和纤维化进展 FALD患者的肝移植组织样本,包括早期和晚期纤维化阶段 数字病理学 心血管疾病 单细胞空间转录组学,免疫荧光染色,原位杂交 无监督聚类分析,CellChat分析 空间转录组数据,图像数据 ST分析:2例FALD患者(早期和晚期纤维化各1例);免疫荧光验证:18例FALD组织 NA 单细胞空间转录组学 CosMxTM Spatial Molecular Imaging 使用6000个基因的原位杂交进行CosMxTM空间分子成像
2793 2026-02-26
In Silico Reconstruction of Primary and Metastatic Tumor Architecture using Geographic Information System-Augmented Spatial Transcriptomics
2026-Feb-24, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究提出了一种名为GIS-ROTA的计算框架,利用地理信息系统增强的空间转录组学数据,对原发性和转移性肿瘤的架构进行计算机重建 开发了一种生物信息学分析框架,首次在识别空间域之前考虑生物学功能,结合通路或细胞类型富集分析与空间自相关测量,直接提供可解释性并减少传统聚类方法的主观性 NA 揭示肿瘤微环境中细胞群之间的相互作用、肿瘤异质性及治疗反应的空间功能模式 原发性和转移性雌激素受体阳性乳腺癌肿瘤样本 数字病理学 乳腺癌 空间转录组学 地理信息系统增强的计算重建框架 空间转录组学数据 NA 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium Visium空间转录组学平台
2794 2026-02-26
Male obesity causes adipose mitochondrial dysfunction in F1 mouse progeny via a let-7-DICER axis
2026-Feb-24, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究揭示了父代肥胖通过精子中的let-7 microRNAs影响子代脂肪组织线粒体功能的分子机制 首次阐明精子中let-7d/e microRNAs通过靶向DICER1介导父代肥胖代谢表型跨代遗传的机制,并证明该机制在人类中具有保守性 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限;未详细探讨其他潜在的表观遗传调控因子 探究父代肥胖对子代代谢健康影响的分子机制 小鼠(父代肥胖模型及其F1子代)、人类精液样本 表观遗传学 代谢性疾病 单细胞RNA测序、microRNA微注射、基因表达分析 动物模型(小鼠) 基因表达数据、测序数据 小鼠模型及人类精液样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
2795 2026-02-26
A spatial transcriptomics comparison of the adult versus metamorphosed axolotl brain
2026-Feb-24, Scientific data IF:5.8Q1
研究论文 本研究使用空间转录组学比较了成年与变态墨西哥钝口螈大脑的细胞类型和分子特征变化 首次系统性地比较成年与变态墨西哥钝口螈大脑多个区域的细胞动态和分子机制,揭示了变态过程对大脑细胞类型和分子谱的影响 研究仅聚焦于五个代表性大脑区域,可能未覆盖全脑所有变化;样本数量未在摘要中明确说明 研究墨西哥钝口螈大脑在成年与变态状态下的细胞动态和分子机制,以理解再生能力与变态过程的关系 墨西哥钝口螈(Ambystoma mexicanum)的成年与变态个体大脑 空间转录组学 NA 空间转录组学 NA 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
2796 2026-02-26
Unraveling CD4+ T cell heterogeneity and cell death-associated genes in high-grade serous ovarian cancer: a comprehensive analysis of single-cell RNA and spatial transcriptome sequencing
2026-Feb-24, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学,深入解析了高级别浆液性卵巢癌中CD4+ T细胞的异质性及其与细胞死亡相关基因的关联 首次结合单细胞RNA测序与空间转录组学,系统揭示了HGSOC中CD4+ T细胞的异质性,并构建了基于hdWGCNA的预后模型,同时通过共培养实验验证了MAL基因的功能作用 研究样本可能有限,且体外共培养实验可能无法完全模拟体内复杂的肿瘤微环境 阐明CD4+ T细胞在高级别浆液性卵巢癌进展中的作用,并识别关键的细胞死亡相关基因 高级别浆液性卵巢癌患者样本中的CD4+ T细胞 数字病理学 卵巢癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, qPCR, Western blotting inferCNV, 伪时间轨迹分析, SCENIC转录调控网络, hdWGCNA 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 独立的高级别浆液性卵巢癌队列 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
2797 2026-02-26
Single-nucleus transcriptomics of an engineered pig model reveals microglia-T cell interactions driving Huntington's disease neurodegeneration
2026-Feb-24, Nature biomedical engineering IF:26.8Q1
研究论文 本研究利用基因工程猪模型,通过单核和空间转录组学技术揭示了亨廷顿病中微胶质细胞与T细胞相互作用驱动神经退行性病变的机制 首次在生理相关的大型动物模型中揭示亨廷顿病中微胶质细胞通过分泌趋化因子配体八招募细胞毒性CD8阳性T细胞加速神经元丢失的免疫机制 研究主要基于猪模型,其与人类疾病的完全一致性仍需进一步验证,且治疗策略的临床转化潜力有待评估 探究免疫细胞浸润在中枢神经系统中的作用及其在亨廷顿病神经退行性病变中的驱动机制 携带人类亨廷顿突变(扩展CAG重复序列)的基因工程猪模型的纹状体组织 数字病理学 亨廷顿病 单核转录组学, 空间转录组学, 免疫组织化学, T细胞受体测序 NA 转录组数据, 空间表达数据, 免疫染色图像, 序列数据 NA NA 单核RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
2798 2026-02-26
Distinct mutations in the autoimmune regulator gene differentially affect transcriptional and functional properties of medullary thymic epithelial cells
2026-Feb-23, Human molecular genetics IF:3.1Q2
研究论文 本研究探讨了自身免疫调节因子基因不同突变对胸腺髓质上皮细胞转录组和功能特性的差异影响 通过结合小鼠模型和单细胞RNA测序,揭示了AIRE基因杂合和错义突变对mTEC转录异质性、组织限制性抗原表达及细胞行为的特异性影响 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;突变类型覆盖范围可能不全 阐明AIRE基因不同突变如何差异影响胸腺髓质上皮细胞的生物学功能,以深入理解自身免疫多内分泌综合征1型的发病机制 胸腺髓质上皮细胞 单细胞组学 自身免疫多内分泌综合征1型 单细胞RNA测序, CRISPR-Cas9基因编辑, 慢病毒表达 小鼠模型 单细胞转录组数据 未明确具体样本数量,但涉及CRISPR-Cas9生成的杂合突变mTECs及野生型mTECs NA 单细胞RNA-seq NA NA
2799 2026-02-26
Microbiota-host interaction in colorectal cancer: emerging computational technology, multi-omics integration, and mechanisms
2026-Feb-23, Cancer biology & medicine IF:5.6Q1
综述 本文综述了肠道微生物群在结直肠癌发生发展中的作用,以及利用高通量测序、多组学整合和先进计算工具解析宿主-微生物相互作用机制的最新进展 系统总结了微生物群通过诱导基因组不稳定性、重塑宿主转录和表观遗传景观以及重编程肿瘤微环境代谢途径来影响结直肠癌发生的机制,并强调了长读长测序、细菌单细胞空间转录组学等新兴技术以及人工智能驱动的计算整合在提升研究分辨率和准确性方面的潜力 分析上面临数据组成性、稀疏性和高维度等挑战,这些因素阻碍了有意义的生物学解释 解析结直肠癌中宿主与微生物群的相互作用机制,并探索将微生物组见解转化为预防、诊断和治疗创新的途径 结直肠癌及其相关的肠道微生物群 计算生物学 结直肠癌 高通量测序,长读长测序,细菌单细胞空间转录组学 NA 基因组、转录组、表观基因组、代谢组等多组学数据 NA NA NA NA NA
2800 2026-02-26
Radiotherapy disrupts ferroptosis tolerance by reducing DNMT1 levels and uncouples STING silencing in LKB1-deficient lung tumors
2026-Feb-19, Free radical biology & medicine
研究论文 本研究揭示了LKB1缺失通过促进铁死亡抵抗导致肺癌免疫治疗失败,并发现放疗可通过DNMT1-OSGIN1轴破坏铁死亡耐受并激活STING通路,从而逆转免疫检查点抑制剂耐药 首次发现LKB1缺失通过铁死亡抵抗机制导致免疫治疗耐药,并阐明放疗通过DNMT1-OSGIN1轴和STING通路激活的双重作用逆转此耐药 研究主要基于基因工程小鼠模型和临床队列分析,缺乏大规模临床试验验证 探究LKB1缺失导致非小细胞肺癌免疫检查点抑制剂耐药的机制及逆转策略 LKB1缺失的非小细胞肺癌 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 多个临床队列及基因工程小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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