单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27747 篇文献，本页显示第 22421 - 22440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 22421 | 2024-08-08 |
CTLA4-Mediated Immunosuppression in Glioblastoma is Associated with the Infiltration of Macrophages in the Tumor Microenvironment
2021, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S341981
PMID:34992419
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研究论文 | 本研究探讨了CTLA4在胶质母细胞瘤（GBM）中的免疫抑制作用及其与肿瘤微环境中巨噬细胞浸润的关系 | 开发了一个预测模型来计算每个GBM病例的风险评分，并发现CTLA4表达与巨噬细胞在GBM肿瘤微环境中的浸润水平和功能正相关 | CTLA4抑制剂在GBM中的临床效果有限 | 全面评估CTLA4在GBM中的作用 | CTLA4在GBM中的免疫抑制作用及其与肿瘤微环境中巨噬细胞浸润的关系 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | 预测模型 | 组织样本 | 471例GBM病例 |
| 22422 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals CXCLs Enriched Fibroblasts Within Odontogenic Keratocysts
2021, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S342951
PMID:34992422
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了牙源性角化囊肿中的细胞亚群，特别是与血管生成相关的细胞亚群，并探讨了血管生成的潜在调控机制 | 首次揭示了CXCLs富集的成纤维细胞在牙源性角化囊肿中的重要作用，并发现静水压力可以部分调控这些细胞的CXCL12分泌 | 研究样本仅来自3名捐赠者，可能影响结果的普遍性 | 定义牙源性角化囊肿的细胞亚群，特别是与血管生成相关的细胞亚群，并探索血管生成的潜在调控机制 | 牙源性角化囊肿中的细胞亚群及其与血管生成的关系 | 数字病理学 | 口腔疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 14,072个细胞来自3名捐赠者 |
| 22423 | 2024-08-08 |
Prognostic Significance of NLR About NETosis and Lymphocytes Perturbations in Localized Renal Cell Carcinoma With Tumor Thrombus
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.771545
PMID:34993135
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研究论文 | 本文探讨了中性粒细胞与淋巴细胞比率（NLR）在伴有肿瘤血栓的局部肾细胞癌中的预后意义，特别是与NETosis和淋巴细胞扰动的关系。 | 首次证明了中性粒细胞相关的NETosis和系统性淋巴细胞扰动在伴有肿瘤血栓的局部肾细胞癌患者中的肿瘤进展作用，并指出NLR≥4是一个独立的预后风险因素。 | NA | 研究NLR在伴有肿瘤血栓的非转移性肾细胞癌中的预后意义，特别是与NETosis和淋巴细胞扰动的关系。 | 214名接受手术治疗的伴有肿瘤血栓的肾细胞癌患者。 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | RNA测序, TCR测序, 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据, 基因表达数据 | 214名患者 |
| 22424 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals the Molecular Anatomy of Sheep Hair Follicle Heterogeneity and Wool Curvature
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.800157
PMID:34993204
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术揭示了羊毛囊的分子结构及其与羊毛弯曲度的关系 | 首次在羊中应用单细胞RNA测序技术，揭示了羊毛囊的细胞组成和分子机制，并阐明了羊毛弯曲度的潜在分子机制 | NA | 探究羊毛囊发育的分子机制及其与羊毛弯曲度的关系 | 羊的毛囊细胞及其转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 15,830个单细胞转录组 |
| 22425 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Analysis and Weighted Co-Expression Network Analysis Based on Public Databases Identified That TNC Is a Novel Biomarker for Keloid
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.783907
PMID:35003102
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析和加权共表达网络分析，基于公共数据库识别出TNC作为瘢痕瘤的新型生物标志物 | 首次识别出Tenascin-C (TNC)作为瘢痕瘤的敏感生物标志物，并通过伪时间分析探讨了其在成纤维细胞分化中的潜在作用 | 研究样本量较小，且仅基于公共数据库和中心数据进行验证，可能影响结果的普遍性 | 旨在识别瘢痕瘤的生物标志物，为设计新的靶向治疗提供依据 | 瘢痕瘤的生物标志物及成纤维细胞分化过程中的潜在作用 | 数字病理学 | 瘢痕瘤 | 单细胞RNA测序分析，加权共表达网络分析 | NA | RNA测序数据 | 16名瘢痕瘤患者及其邻近正常组织 |
| 22426 | 2024-08-08 |
Molecular Subtypes Based on Cell Differentiation Trajectories in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma: Differential Prognosis and Immunotherapeutic Responses
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.791621
PMID:35003112
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研究论文 | 本研究基于单细胞测序分析识别的HNSCC细胞分化相关基因，全面分析了866例HNSCC病例的分子亚型及其免疫、代谢和干细胞特性，并开发了HNSCC细胞分化评分（HCDscore）以量化个体样本的独特异质性。 | 本研究首次将HNSCC分为三个基于HDRGs的分子亚型：活跃基质型（Cluster-A）、活跃代谢型（Cluster-B）和活跃免疫型（Cluster-C），并展示了HCDscore与免疫微环境、亚型、致癌生物过程、遗传变异和预后的相关性。 | NA | 旨在研究头颈鳞状细胞癌（HNSCC）的细胞分化轨迹及其临床相关性。 | 头颈鳞状细胞癌（HNSCC）的细胞分化轨迹及其临床相关性。 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞测序 | 机器学习 | 多组学数据 | 866例HNSCC病例 |
| 22427 | 2024-08-08 |
Statistical methods for analysis of single-cell RNA-sequencing data
2021, MethodsX
IF:1.6Q2
DOI:10.1016/j.mex.2021.101580
PMID:35004214
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研究论文 | 本文提出了一种新的统计方法，用于分析单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据中的独特分子标识符（UMI）计数数据 | 该方法考虑了导致严重丢失事件的生物过程，在模型中对观察到的UMI基因计数进行建模 | NA | 研究单细胞RNA测序数据分析中的统计方法 | 单细胞RNA测序数据中的UMI计数数据 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 22428 | 2024-08-08 |
Single-Cell Analysis Identify Transcription Factor BACH1 as a Master Regulator Gene in Vascular Cells During Aging
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.786496
PMID:35004685
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研究论文 | 本研究通过分析已发表的单细胞RNA测序数据，揭示了转录因子BACH1在血管细胞衰老中的主要调控作用 | 首次识别BACH1为血管细胞衰老的主调控基因，并阐明了其在氧化应激下加剧内皮细胞衰老的机制 | 研究主要基于已发表的数据，未涉及实验验证 | 探索衰老心脏血管的细胞和分子特性，并证明转录因子BACH1在内皮细胞衰老中的作用及其机制 | 猴子和老鼠的心脏血管细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括猴子的冠状动脉和大动脉以及老鼠的心脏 |
| 22429 | 2024-08-08 |
MAP3K8 Is a Prognostic Biomarker and Correlated With Immune Response in Glioma
2021, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2021.779290
PMID:35004849
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研究论文 | 研究探讨了MAP3K8在胶质瘤中的表达、临床意义及其与免疫反应的关系 | 首次揭示了MAP3K8在胶质瘤中的异常高表达及其与不良临床病理特征的相关性，并探讨了其在胶质瘤免疫反应中的作用 | NA | 探索MAP3K8作为胶质瘤预后标志物的潜力及其在胶质瘤免疫反应中的作用 | MAP3K8在胶质瘤中的表达及其生物学功能 | 数字病理学 | 脑瘤 | 免疫组化染色，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个数据集和组织样本 |
| 22430 | 2024-08-08 |
Transcriptomes of MPO-Deficient Patients with Generalized Pustular Psoriasis Reveals Expansion of CD4+ Cytotoxic T Cells and an Involvement of the Complement System
2022-08, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2021.12.021
PMID:34973310
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和RNA测序分析了MPO缺陷患者的外周血单个核细胞（PBMCs）和中性粒细胞的转录组，揭示了CD4+细胞毒性T细胞的扩增和补体系统的参与 | 首次系统分析了MPO基因型对中性粒细胞和PBMC亚群及其差异基因表达的影响 | 未来的研究需要评估受影响的细胞类型和通路对泛发性脓疱型银屑病发病机制的贡献，并探讨这些发现是否可转移到急性表皮情况 | 研究MPO缺陷患者中泛发性脓疱型银屑病的免疫细胞变化及其分子机制 | MPO缺陷患者的PBMCs和中性粒细胞 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 22431 | 2024-08-08 |
Surgical resection of glioblastomas induces pleiotrophin-mediated self-renewal of glioblastoma stem cells in recurrent tumors
2022-07-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noab302
PMID:34964899
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研究论文 | 本文研究了手术切除胶质母细胞瘤后，肿瘤复发细胞中多能蛋白（PTN）介导的自我更新现象 | 首次揭示了手术切除胶质母细胞瘤后，PTN在肿瘤复发细胞中的作用及其对治疗抵抗和肿瘤复发的促进作用 | 研究主要基于动物模型和患者样本，未来需进一步在更大规模的人体研究中验证 | 探讨手术切除胶质母细胞瘤对肿瘤复发细胞表型的影响及其机制 | 胶质母细胞瘤及其复发肿瘤细胞 | NA | 脑肿瘤 | 18F-FET PET/CT成像，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 23名匹配原发/复发肿瘤患者，190名胶质母细胞瘤患者 |
| 22432 | 2024-08-08 |
CellDepot: A Unified Repository for scRNA-seq Data and Visual Exploration
2022-06-15, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2021.167425
PMID:34971674
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研究论文 | CellDepot是一个集成网络应用，用于探索和比较来自多种研究的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据集 | CellDepot通过用户友好的界面和先进的可视化及分析功能，提供了一个高效的数据管理系统，支持多属性查询和快速数据筛选 | NA | 促进大规模单细胞数据共享，便于元分析和可视化 | 单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 数据集 | 超过270个数据集，来自8个物种和多种组织 |
| 22433 | 2024-08-08 |
Molecular insights into the early stage of glomerular injury in IgA nephropathy using single-cell RNA sequencing
2022-04, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2021.12.011
PMID:34968552
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术探讨了IgA肾病早期肾小球损伤的分子机制 | 揭示了内皮细胞在IgA肾病早期发病机制中的关键作用，并发现了多种肾小球内旁分泌途径和肾小球-肾小管细胞间相互作用途径 | NA | 深入理解IgA肾病早期肾小球损伤的分子机制 | IgA肾病早期阶段的肾小球相关细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用ddY小鼠模型进行研究 |
| 22434 | 2024-08-08 |
Regulation of axial elongation by Cdx
2022-03, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2021.12.011
PMID:34958748
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研究论文 | 本文研究了Cdx家族转录因子在轴向延长中的作用，特别是Cdx2在维持神经中胚层前体细胞（NMP）微环境和指定NMP后代中的作用 | 通过RNA测序和基因本体分析，识别了349个Cdx依赖基因，并揭示了多个与轴向延长相关的潜在直接Cdx目标基因 | NA | 深入理解Cdx家族在轴向延长中的作用 | 神经中胚层前体细胞（NMP）及其在胚胎发育中的作用 | NA | NA | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 349个Cdx依赖基因 |
| 22435 | 2024-08-08 |
Examining the Development of Chronic Thromboembolic Pulmonary Hypertension at the Single-Cell Level
2022-03, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了慢性血栓栓塞性肺动脉高压（CTEPH）患者的肺动脉内膜切除组织中的单个细胞类型及其相互作用。 | 首次在单细胞水平上揭示了CTEPH的发展轨迹及其细胞间的紧密通信关系。 | 研究样本仅来自5名患者，可能影响结果的普遍性。 | 探讨慢性血栓栓塞性肺动脉高压的分子机制。 | CTEPH患者的肺动脉内膜切除组织中的单个细胞类型。 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 5名CTEPH患者 |
| 22436 | 2024-08-08 |
Differential Survival and Therapy Benefit of Patients with Breast Cancer Are Characterized by Distinct Epithelial and Immune Cell Microenvironments
2022-Mar-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-21-1442
PMID:34965952
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研究论文 | 本文研究了乳腺癌患者中不同微环境细胞对生存和治疗效果的影响 | 首次在乳腺癌患者中识别出非免疫细胞类型（如成纤维细胞、肌上皮细胞等）对生存和治疗效果的相关性 | NA | 探讨微环境细胞在乳腺癌患者生存和治疗效果中的作用 | 乳腺癌患者的微环境细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | mRNA序列数据 | 超过3,500个乳腺癌患者的原发性肿瘤样本 |
| 22437 | 2024-08-08 |
Per- and polyfluoroalkyl substances target and alter human prostate stem-progenitor cells
2022-03, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2021.114902
PMID:34968493
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研究论文 | 研究探讨了全氟和多氟烷基物质（PFAS）对人类前列腺干细胞-祖细胞（SPCs）的影响及其潜在机制 | 首次发现人类前列腺SPCs是PFAS的直接作用目标，并揭示了PFAS暴露导致的转录组和代谢组重编程，这可能增加前列腺癌的风险 | NA | 探究PFAS长期暴露与前列腺癌风险增加之间的潜在机制 | 人类前列腺干细胞-祖细胞（SPCs） | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 使用了10 nM的PFOA或PFOS处理的人类前列腺干细胞-祖细胞（SPCs） |
| 22438 | 2024-08-08 |
Single cell transcriptomics in human osteoarthritis synovium and in silico deconvoluted bulk RNA sequencing
2022-03, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2021.12.007
PMID:34971754
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研究论文 | 本研究旨在揭示骨关节炎（OA）滑膜组织中不同细胞类型的异质性，并通过新颖的方法确定是否可以通过基因反卷积技术将批量RNA测序数据转化为模拟的单细胞RNA测序数据 | 本研究首次通过基因反卷积技术将批量RNA测序数据转化为模拟的单细胞RNA测序数据，并创建了针对关节炎的特异性签名矩阵，提高了预测性能 | NA | 揭示骨关节炎滑膜组织中细胞类型的异质性，并探索批量RNA测序数据反卷积的可行性 | 骨关节炎患者的滑膜组织 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | 机器学习工具CIBERSORTx | RNA测序数据 | 102,077个滑膜细胞，来自17名接受全膝关节置换术的患者 |
| 22439 | 2024-08-08 |
Fatal COVID-19 and Non-COVID-19 Acute Respiratory Distress Syndrome Is Associated with Incomplete Alveolar Type 1 Epithelial Cell Differentiation from the Transitional State without Fibrosis
2022-03, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2021.11.014
PMID:34973949
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研究论文 | 本文研究了急性呼吸窘迫综合征（ARDS）中肺泡上皮细胞（AEC）的再生过程，特别是从过渡状态到肺泡上皮细胞1型（AEC1）的分化，以及这一过程与肺纤维化的关系。 | 首次揭示了在人类ARDS中，过渡细胞可以分化为AEC1而不伴随纤维化的现象，并探讨了这一过程与肺纤维化的潜在关联。 | 研究主要基于免疫染色和单细胞RNA测序，未涉及更深入的分子机制研究。 | 探讨ARDS中肺泡上皮细胞的再生机制及其与肺纤维化的关系。 | ARDS患者的肺组织，特别是肺泡上皮细胞的分化和过渡状态。 | 数字病理学 | 急性呼吸窘迫综合征 | 免疫染色，单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 22440 | 2024-08-08 |
Optical Cell Tagging for Spatially Resolved Single-Cell RNA Sequencing
2022-02-07, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202113929
PMID:34970821
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研究论文 | 本文开发了一种名为OpTAG的新型化学平台，用于在空间解析的方式下将功能标签附着在细胞表面，从而实现空间解析的单细胞RNA测序（scRNA-seq）。 | OpTAG-seq方法的创新之处在于它能够提供细胞在多细胞样本中的位置信息，从而实现空间解析的scRNA-seq。 | NA | 研究目的是开发一种新的方法来克服单细胞RNA测序数据中缺乏细胞位置信息的问题。 | 研究对象是迁移性癌细胞中的空间定义转录程序。 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |