单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27747 篇文献，本页显示第 22361 - 22380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 22361 | 2024-08-08 |
T cell characteristics associated with toxicity to immune checkpoint blockade in patients with melanoma
2022-02, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-021-01623-z
PMID:35027754
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研究论文 | 研究探讨了黑色素瘤患者在接受免疫检查点抑制剂治疗前后，循环中的T细胞特征与免疫相关不良事件（irAEs）之间的关系 | 首次发现激活的CD4记忆T细胞丰度和TCR多样性这两个预处理因素与严重irAE的发展相关，无论器官系统是否受累 | 研究样本量相对较小，且仅限于黑色素瘤患者 | 探究免疫检查点抑制剂治疗中，T细胞特征与免疫相关不良事件之间的关系 | 黑色素瘤患者的循环T细胞 | NA | 黑色素瘤 | 质谱流式细胞术、单细胞RNA测序、单细胞V(D)J测序、批量RNA测序和批量T细胞受体（TCR）测序 | NA | 血液样本 | 93份治疗前和早期治疗血液样本，涉及27、26和18名患者的三组队列 |
| 22362 | 2024-08-08 |
CellRank for directed single-cell fate mapping
2022-02, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-021-01346-6
PMID:35027767
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research paper | 本文介绍了一种名为CellRank的方法，用于在方向未知的多样化场景中进行单细胞命运映射，包括再生、重编程和疾病。 | CellRank结合了轨迹推断的鲁棒性和来自RNA速度的方向信息，考虑了细胞命运决定的渐进性和随机性，以及速度向量的不确定性。 | NA | 开发一种新的计算方法，用于在方向未知的生物过程中进行单细胞命运映射。 | 单细胞RNA测序实验中的细胞状态动态。 | digital pathology | NA | single-cell RNA sequencing | NA | RNA velocity | NA |
| 22363 | 2024-08-08 |
Galectin-3 promotes the adipogenic differentiation of PDGFRα+ cells and ectopic fat formation in regenerating muscle
2022-02-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.199443
PMID:35029658
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研究论文 | 本文研究了Galectin-3在PDGFRα+细胞中的脂肪生成分化作用及其在肌肉再生中异位脂肪形成的影响 | 通过单细胞RNA测序和质谱分析，揭示了Galectin-3在肥胖相关IMAT形成中的作用及其分子机制 | NA | 探讨肥胖相关IMAT形成的分子机制及其在肌肉再生中的作用 | PDGFRα+细胞在肥胖和肌肉再生中的脂肪生成分化过程 | NA | 肥胖 | 单细胞RNA测序，质谱分析 | NA | RNA序列，蛋白质组数据 | 肥胖小鼠模型 |
| 22364 | 2024-08-08 |
Decoding the role of macrophages in periodontitis and type 2 diabetes using single-cell RNA-sequencing
2022-02, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202101198R
PMID:35032412
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术探讨了巨噬细胞在牙周炎和2型糖尿病中的作用及其异质性 | 首次揭示了牙周炎中巨噬细胞的基因表达异质性，并展示了这些细胞在2型糖尿病患者中的转录和信号异质性 | 研究样本仅限于牙周炎和2型糖尿病患者，可能限制了结果的普遍性 | 探讨巨噬细胞在牙周炎和2型糖尿病中的作用及其异质性 | 牙周炎和2型糖尿病患者的牙龈组织中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 牙周病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自牙周炎和健康部位以及有无2型糖尿病的患者的牙龈组织样本 |
| 22365 | 2024-08-08 |
Macrophages-aPKCɩ-CCL5 Feedback Loop Modulates the Progression and Chemoresistance in Cholangiocarcinoma
2022-Jan-15, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-021-02235-8
PMID:35033156
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研究论文 | 本研究探讨了巨噬细胞与aPKCɩ-CCL5反馈环在胆管癌进展和化学抗性中的作用 | 首次揭示了巨噬细胞-aPKCɩ-CCL5反馈环在胆管癌中的作用，并提出了一种新的治疗策略 | NA | 研究巨噬细胞与胆管癌细胞之间的相互作用及其在肿瘤进展和化学抗性中的机制 | 胆管癌中的巨噬细胞、aPKCɩ和CCL5 | 数字病理学 | 胆管癌 | 10x Genomics单细胞测序技术 | NA | 组织样本 | 70个人类胆管癌组织样本 |
| 22366 | 2024-08-08 |
Integrated single-cell RNA sequencing analysis reveals distinct cellular and transcriptional modules associated with survival in lung cancer
2022-01-14, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-021-00824-9
PMID:35027529
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和公共批量RNA测序数据，揭示了肺腺癌和鳞状细胞癌中与生存率相关的细胞和转录模块 | 本研究首次建立了包含52个单细胞RNA测序和2342个公共批量RNA测序的多组学图谱，揭示了肺腺癌和鳞状细胞癌中特定的基因扩增、细胞组成和表达模块 | NA | 研究肺腺癌和鳞状细胞癌的细胞和转录特征，以及这些特征与患者生存率的关系 | 肺腺癌和鳞状细胞癌的细胞组成和转录模块 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 52个单细胞RNA测序样本和2342个公共批量RNA测序样本 |
| 22367 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics of human iPSC differentiation dynamics reveal a core molecular network of Parkinson's disease
2022-01-13, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-021-02973-7
PMID:35027645
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研究论文 | 研究使用单细胞转录组学分析人类诱导多能干细胞（hiPSCs）分化为多巴胺能神经元（mDA）的过程，揭示了帕金森病（PD）的核心分子网络 | 首次通过单细胞RNA测序和基因表达分析，揭示了与帕金森病相关的核心分子网络，并展示了这些基因在mDA神经元分化过程中的差异表达 | NA | 探究帕金森病的疾病机制，并寻找可能的治疗靶点 | 人类诱导多能干细胞（hiPSCs）分化为多巴胺能神经元（mDA）的过程及其与帕金森病相关的基因表达 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序（RNAseq） | NA | 基因表达数据 | 包含PINK1-ILE368ASN突变和对照细胞系的多个样本 |
| 22368 | 2024-08-08 |
baredSC: Bayesian approach to retrieve expression distribution of single-cell data
2022-Jan-12, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-021-04507-8
PMID:35021985
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研究论文 | 本文介绍了一种名为baredSC的新工具，用于通过贝叶斯方法从单细胞RNA测序数据中推断内在表达分布 | baredSC能够处理多模态情况下的稀疏数据，并揭示基因表达的复杂分布 | NA | 开发一种新工具以从单细胞RNA测序数据中检索感兴趣基因的表达分布 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达分布 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 高斯混合模型 | 基因表达数据 | 模拟数据和两个真实生物数据集 |
| 22369 | 2024-08-08 |
Danger signal extracellular calcium initiates differentiation of monocytes into SPP1/osteopontin-producing macrophages
2022-01-12, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-022-04507-3
PMID:35022393
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研究论文 | 研究探讨了在没有初级信号的情况下，细胞外钙和钙蛋白颗粒如何诱导单核细胞分化为钙巨噬细胞，并分析了其形态和功能特征。 | 首次展示了在没有初级信号的情况下，细胞外钙和钙蛋白颗粒可以直接诱导单核细胞分化为钙巨噬细胞，并详细描述了这一过程的分子机制。 | 研究主要集中在健康对照和类风湿关节炎患者的单核细胞上，未涉及其他疾病状态或更广泛的人群。 | 揭示在没有初级信号的情况下，细胞外钙对单核细胞的影响及其分化机制。 | 健康对照和类风湿关节炎患者的单核细胞及其分化后的巨噬细胞。 | 细胞生物学 | 类风湿关节炎 | scRNA-seq, DNA微阵列, 蛋白质组学, 成像流式细胞术 | NA | 细胞 | 健康对照和类风湿关节炎患者的血液样本 |
| 22370 | 2024-08-08 |
The immune-suppressive landscape in lepromatous leprosy revealed by single-cell RNA sequencing
2022-Jan-11, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-021-00353-3
PMID:35013182
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术揭示了瘤型麻风病中的免疫抑制性景观 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了瘤型麻风病中免疫细胞的特定表达模式和相互作用 | NA | 探究瘤型麻风病中细胞内细菌逃避或调节宿主免疫反应的分子机制 | 瘤型麻风病患者的皮肤活检和外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 麻风病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 瘤型麻风病患者和健康对照组的外周血单个核细胞及皮肤活检样本 |
| 22371 | 2024-08-08 |
Zero-preserving imputation of single-cell RNA-seq data
2022-01-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-27729-z
PMID:35017482
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研究论文 | 本文提出了一种基于低秩矩阵近似的方法，用于填补单细胞RNA测序数据中的大量假零值，同时保持生物学上未表达的基因（真正的生物学零值）在零表达水平 | 本文的创新点在于提出了一种新的方法，能够在填补假零值的同时保留真正的生物学零值，并通过理论证明和实验验证了其相对于其他方法的优势 | NA | 研究目的是解决单细胞RNA测序数据分析中的一个关键挑战，即大量假零值的问题 | 研究对象是单细胞RNA测序数据中的假零值 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 低秩矩阵近似 | 基因表达数据 | NA |
| 22372 | 2024-08-08 |
Spatial transcriptomics using combinatorial fluorescence spectral and lifetime encoding, imaging and analysis
2022-01-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-27798-0
PMID:35013281
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研究论文 | 本文介绍了一种名为MOSAICA的空间转录组技术，该技术结合了mRNA和蛋白质标记的原位标记、组合式荧光光谱和寿命编码探针、光谱和时间分辨荧光成像以及基于机器学习的解码方法 | MOSAICA技术通过组合式荧光光谱和寿命编码探针，实现了在空间背景下多重mRNA分析的高效性和简化性 | NA | 开发一种新的空间转录组技术，以提高多重mRNA分析的效率和简化性 | 固定的大肠癌细胞和临床黑色素瘤福尔马林固定石蜡包埋组织 | 数字病理学 | 大肠癌, 黑色素瘤 | 组合式荧光光谱和寿命编码探针, 光谱和时间分辨荧光成像 | 机器学习 | 图像 | 10-plex目标检测 |
| 22373 | 2024-08-08 |
Pembrolizumab and decitabine for refractory or relapsed acute myeloid leukemia
2022-01, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-003392
PMID:35017151
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研究论文 | 本文报告了一项针对复发或难治性急性髓系白血病（AML）患者的初步研究，评估了pembrolizumab和decitabine联合治疗的可行性 | 首次在人体中测试了pembrolizumab和decitabine联合治疗的可行性，并观察到免疫相关的不良事件与免疫学变化 | 这是一项单机构、单臂、开放标签的初步研究，样本量较小 | 探索免疫检查点阻断和去甲基化药物在急性髓系白血病中的协同作用 | 复发或难治性急性髓系白血病患者 | NA | 急性髓系白血病 | T细胞受体β测序、单细胞免疫表型和RNA表达分析 | NA | 免疫学数据 | 10名患者 |
| 22374 | 2024-08-08 |
Genetic and Transcriptional Contributions to Relapse in Normal Karyotype Acute Myeloid Leukemia
2022-01, Blood cancer discovery
IF:11.5Q1
DOI:10.1158/2643-3230.BCD-21-0050
PMID:35019859
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研究论文 | 研究旨在深入理解急性髓系白血病（AML）复发后的克隆和转录适应性 | 通过增强的全基因组测序和深度覆盖的单细胞RNA测序，识别了个体细胞中的表达突变，区分正常细胞和AML细胞，并识别了亚克隆特异性细胞状态 | 研究样本仅限于六例正常核型AML病例，可能限制了结果的普遍性 | 探究AML复发后克隆和转录的适应性变化 | 急性髓系白血病患者的初诊和复发样本 | 数字病理学 | 血液病 | 全基因组测序，单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据，转录组数据 | 六例正常核型AML病例，共142,642个高质量细胞 |
| 22375 | 2024-08-08 |
Cell trajectory modeling identifies a primitive trophoblast state defined by BCAM enrichment
2022-01-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.199840
PMID:35020896
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了早期胎盘发育中的细胞状态，特别是滋养层细胞的分化轨迹，并识别出由BCAM富集定义的原始滋养层细胞状态 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了早期胎盘中滋养层细胞的异质性，并解析了人类滋养层前体细胞中的基因网络，识别出BCAM作为原始前体细胞标记物和可能的调节因子 | NA | 研究人类滋养层前体细胞的维持和分化过程 | 早期胎盘发育中的滋养层细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自第一孕期胎盘的样本 |
| 22376 | 2024-08-08 |
Contribution of Transcriptome to Elucidate the Biology of Plasmodium spp
2022, Current topics in medicinal chemistry
IF:2.9Q3
|
综述 | 本文综述了应用于阐明疟原虫如何逃避免疫系统和颠覆宿主生理以调控其生物途径的新技术 | 介绍了微阵列、RNA测序和单细胞RNA测序等技术在发现转录本和改变基因表达调控概念方面的贡献 | NA | 探讨新技术在揭示疟原虫生物学、生理学、疫苗靶点和寄生虫信号传导中新角色方面的贡献 | 疟原虫的生物学和生理学 | 基因组学 | 疟疾 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 22377 | 2024-08-08 |
Itaconate and derivatives reduce interferon responses and inflammation in influenza A virus infection
2022-01, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1010219
PMID:35025971
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研究论文 | 研究评估了内源性衣康酸及其衍生物在外源应用下对流感A病毒感染宿主反应的影响 | 发现衣康酸及其衍生物能减少干扰素反应和炎症，具有免疫调节和抗病毒作用 | NA | 探索衣康酸及其衍生物在流感A病毒感染中的免疫调节和抗病毒效果 | 衣康酸及其衍生物对流感A病毒感染的宿主反应 | NA | 流感 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括感染流感A病毒的小鼠、人外周血单个核细胞和人肺组织 |
| 22378 | 2024-08-08 |
Data-driven modeling predicts gene regulatory network dynamics during the differentiation of multipotential hematopoietic progenitors
2022-01, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1009779
PMID:35030198
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研究论文 | 本研究利用瞬态基因表达模式推断包含关键转录因子和细胞因子受体的十二基因基因调控网络（GRN）的遗传结构和动态 | 研究展示了高分辨率时间序列数据与数据驱动动态模型的结合如何揭示可能被掩盖的发育事件的动态和因果关系 | NA | 预测多能造血祖细胞分化过程中基因调控网络的动态 | 多能造血祖细胞分化过程中的基因调控网络 | 基因调控 | NA | 基因表达数据分析 | 动态模型 | 基因表达数据 | 诱导细胞系分化为红细胞和嗜中性粒细胞的高时间分辨率基因表达数据 |
| 22379 | 2024-08-08 |
Triple-Decker Sandwich Cultures of Intestinal Organoids for Long-Term Live Imaging, Uniform Perturbation, and Statistical Sampling
2022-Jan, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.330
PMID:35030297
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研究论文 | 本文介绍了一种名为“三层三明治”的新型肠道类器官培养方法，该方法通过多层水凝胶嵌入，实现了类器官在共面z轴上的均匀排列，从而改善了类器官的生长和存活率，并便于长期共聚焦成像和分子扰动。 | 开发了一种新的“三层三明治”培养方法，通过多层水凝胶嵌入，实现了类器官在共面z轴上的均匀排列，改善了类器官的生长和存活率，并便于长期共聚焦成像和分子扰动。 | NA | 研究肠道类器官的长期活体成像、均匀扰动和统计采样。 | 肠道类器官，包括小鼠和人类的肠道类器官。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | 小鼠和人类的肠道类器官 |
| 22380 | 2024-08-08 |
Role of Human Antigen R (HuR) in the Regulation of Pulmonary ACE2 Expression
2021-12-22, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11010022
PMID:35011584
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研究论文 | 研究HuR蛋白在调节肺部ACE2表达中的作用 | 首次探讨ACE2与HuR之间的关联 | 需要进一步研究ACE2表达调控的机制 | 探究COPD患者中ACE2表达的调控机制 | COPD患者和吸烟者的肺组织及人肺细胞 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺病 | 单细胞RNA测序, 多重免疫组织化学, 成像流式细胞术 | NA | scRNA-seq数据, 免疫组织化学图像 | COPD患者和吸烟者的肺组织及人肺细胞 |