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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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16341 | 2024-08-05 |
Somatosensory neurons express specific sets of lincRNAs, and lincRNA CLAP promotes itch sensation in mice
2023-02-06, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202154313
PMID:36524339
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研究论文 | 这篇文章探讨了体感神经元中特定类型的长非编码RNA(lincRNAs)的分布及其在痒感中的作用 | 首次揭示了特定类型的lincRNAs在体感神经元中的丰富性及其与痒感的关系 | 对lincRNAs在其他神经元类型中的作用尚未进行探索 | 研究体感神经元中特定lincRNAs的分布及其在感觉传递中的功能 | 小鼠的体感神经元及其特定类型的lincRNAs | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和Smart-seq2全长测序 | NA | RNA数据 | 分析了位于背根神经节(DRG)的单个神经元中的200个lincRNAs |
16342 | 2024-08-07 |
Decoding the Spermatogenesis Program: New Insights from Transcriptomic Analyses
2022-11-30, Annual review of genetics
IF:8.7Q1
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了精细的细胞图谱,揭示了测试中已知和新型细胞类型及其功能状态,为跨物种比较提供了参考系统 | 利用单细胞RNA测序技术提供了对测试细胞类型多样性和分子特征的深入见解,并构建了精细的细胞图谱 | 目前缺乏高分辨率数据来探索组织环境中生殖细胞与体细胞的相互作用 | 旨在通过单细胞研究提高对配子发生机制的理解,以探索不孕的潜在原因并开发新的治疗干预措施 | 研究对象为精子的发生过程及其细胞和分子特征 | NA | 不孕症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
16343 | 2024-08-05 |
Functional Pdgfra fibroblast heterogeneity in normal and fibrotic mouse lung
2023-Nov-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.164380
PMID:37824216
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研究论文 | 本研究探讨了正常与纤维化小鼠肺中Pdgfra+成纤维细胞的功能异质性 | 首次通过单细胞RNA测序和PdgfraGFP谱系追踪描绘了在小鼠肺损伤后的Pdgfra+成纤维细胞的转录组谱 | 尚不清楚肺损伤对LipoFB功能的具体影响 | 揭示肺损伤对Pdgfra+成纤维细胞功能和转录组变化的影响 | 正常与受损小鼠肺中的Pdgfra+成纤维细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | 3D器官模型 | 转录组数据 | 包含正常和受损小鼠的Pdgfra+成纤维细胞 |
16344 | 2024-08-05 |
Altered Sox9 and FGF signaling gene expression in Aga2 OI mice negatively affects linear growth
2023-Nov-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.171984
PMID:37796615
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研究论文 | 本研究探讨了Osteogenesis imperfecta (OI)小鼠中Sox9和FGF信号基因表达的改变对线性生长的负面影响 | 揭示了OI中突变型I胶原蛋白对软骨生长板的影响,以及FGF和MAPK信号通路的激活与细胞分化加速之间的关系 | 研究局限于Aga2+/-小鼠模型,可能无法完全外推至其他类型的OI或人类病例 | 探讨OI对软骨生长板的影响及其对线性生长的生物学机制 | 使用Aga2+/-小鼠模型分析生长板细胞类型的转录后果 | 数字病理学 | 骨生成不全症 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | Aga2+/-小鼠的胫骨和股骨生长板组织 |
16345 | 2024-08-07 |
Virus-specific TRM cells of both donor and recipient origin reside in human kidney transplants
2023-Nov-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.172681
PMID:37751288
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研究论文 | 本研究旨在描述人类肾移植中的组织驻留淋巴细胞(TRLs)并探讨其在抗病毒免疫中的潜在作用 | 首次揭示了肾移植中存在供体和受体来源的组织驻留记忆T细胞(TRM),并展示了它们在抗病毒免疫中的作用 | NA | 研究肾移植中的组织驻留淋巴细胞及其在抗病毒免疫中的作用 | 人类肾移植中的组织驻留淋巴细胞 | NA | NA | 单细胞转录组和T细胞受体(TCR)测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 43%的肾移植样本 |
16346 | 2024-08-07 |
Islet-autoreactive CD4+ T cells are linked with response to alefacept in type 1 diabetes
2023-Nov-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.167881
PMID:37751304
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研究论文 | 本文研究了胰岛自身反应性CD4+ T细胞与alefacept治疗在1型糖尿病中的反应之间的关系 | 首次发现具有特定转录组特征的胰岛抗原反应性CD4+ T细胞(集群3)的频率与alefacept治疗后的C肽保留呈负相关 | 研究仅限于T1DAL试验中的样本,需要进一步研究以验证这些发现 | 探索胰岛自身反应性CD4+ T细胞作为预测1型糖尿病治疗反应的潜在生物标志物 | 胰岛抗原反应性CD4+ T细胞的表型和转录组特征 | 免疫学 | 1型糖尿病 | 流式细胞术和单细胞RNA测序 | NA | 外周血单个核细胞样本 | 来自alefacept和安慰剂治疗个体的样本 |
16347 | 2024-08-07 |
Mutant RB1 enhances therapeutic efficacy of PARPis in lung adenocarcinoma by triggering the cGAS/STING pathway
2023-Nov-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.165268
PMID:37937640
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研究论文 | 研究探讨了突变型RB1基因如何通过激活cGAS/STING途径增强PARPi在肺腺癌中的治疗效果 | 首次揭示了RB1突变通过激活cGAS/STING途径和上调免疫浸润,介导肺腺癌对PARPi的敏感性 | NA | 探索RB1突变对肺腺癌中PARPi敏感性的影响 | 肺腺癌细胞系及RB1突变的影响 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了多种LUAD细胞系和RB1-KO小鼠模型 |
16348 | 2024-08-05 |
Ubiquitin Ligases Siah1a/2 Control Alveolar Macrophage Functions to Limit Carcinogen-Induced Lung Adenocarcinoma
2023-06-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-0258
PMID:37078793
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研究论文 | 本文主要探讨了泛素连接酶Siah1a/2在调节肺腺癌中的肺泡巨噬细胞功能方面的作用 | 本研究首次揭示了Siah1a/2作为肺泡巨噬细胞的调节因子在致癌物诱导的肺腺癌中的关键角色 | 研究中仅针对巨噬细胞特异性Siah1a/2的作用进行了观察,未探讨其他细胞类型的影响 | 研究Siah1a/2在肺腺癌进展中调节肺泡巨噬细胞功能的机制 | 主要观察肺泡巨噬细胞及其在肺腺癌发展中的作用 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 基因剔除模型 | 细胞、基因表达数据 | 研究涉及野生型小鼠及肺腺癌患者的样本 |
16349 | 2024-08-07 |
As in Real Estate, Location Matters: Cellular Expression of Complement Varies Between Macular and Peripheral Regions of the Retina and Supporting Tissues
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.895519
PMID:35784369
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研究论文 | 本研究通过基因表达分析、质谱分析和免疫组织化学方法,探讨了视网膜和脉络膜细胞类型在决定补体稳态中的作用,特别是在年龄相关性黄斑变性(AMD)中的作用 | 本研究发现早期AMD中,脉络膜中的成纤维细胞、周细胞和内皮细胞对补体反应更为强烈;晚期AMD中,视网膜中补体变化更为显著,尤其是经典途径启动子的表达。此外,研究还揭示了这些差异的空间偏好性 | NA | 探讨视网膜和脉络膜细胞类型在决定补体稳态中的作用,特别是在年龄相关性黄斑变性(AMD)中的作用 | 视网膜和脉络膜细胞类型 | NA | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、质谱分析、免疫组织化学 | NA | 基因表达数据 | NA |
16350 | 2024-08-07 |
Cell Type Catalog of Middle Turbinate Epithelium (Cell Catalog of Turbinate Epithelium)
2023 Oct-Dec, OTO open
IF:1.8Q2
DOI:10.1002/oto2.91
PMID:38093720
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术创建了人类中鼻甲黏膜的首个单细胞转录组目录 | 首次为中鼻甲黏膜创建了单细胞转录组目录 | NA | 揭示健康中鼻甲上皮的细胞层级基因表达谱,为鼻窦疾病的分子发病机制和靶向治疗研究奠定基础 | 中鼻甲黏膜的细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自一名健康志愿者的中鼻甲头部样本 |
16351 | 2024-08-05 |
Deciphering the age-dependent changes of pulmonary fibroblasts in mice by single-cell transcriptomics
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1287133
PMID:38094618
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研究论文 | 这项研究揭示了小鼠肺组织中肺成纤维细胞随年龄变化的转录组特征。 | 本研究首次系统性描述了老化过程中肺成纤维细胞的分化轨迹和转录表型变化。 | 该研究主要基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类。 | 本研究旨在阐明年老肺组织中成纤维细胞的转录谱和分化途径。 | 本研究的研究对象为小鼠的肺成纤维细胞及其在衰老过程中的变化。 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞转录组测序 | NA | 细胞数据 | 共分析了22,826个细胞 |
16352 | 2024-08-07 |
Retracted: Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals the Importance of IRF1/FSTL1 in Synovial Fibroblast Subsets for the Development of Rheumatoid Arthritis
2023, Computational and mathematical methods in medicine
DOI:10.1155/2023/9765730
PMID:38094339
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correction | 该文章已被撤回 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
16353 | 2024-08-07 |
SARS-CoV-2 receptor ACE2 is upregulated by fatty acids in human MASH
2024-Jan, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2023.100936
PMID:38074511
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研究论文 | 本文研究了代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD)中SARS-CoV-2受体ACE2的表达及其细胞来源 | 首次揭示了脂肪酸在人类MASLD中上调ACE2表达的现象 | NA | 探讨MASLD患者中SARS-CoV-2受体ACE2的表达水平及其细胞来源 | 人类MASLD患者的肝脏组织 | NA | 脂肪性肝病 | 转录组学, 免疫组织化学, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据, 图像 | 243个MASLD样本, 161个纤维炎症性肝病样本, 9个脂肪肝样本, 7个对照样本, 5个肝硬化样本, 14个正常肝脏样本, 745个初级细胞样本 |
16354 | 2024-08-05 |
Visium spatial transcriptomics reveals intratumor heterogeneity and profiles of Gleason score progression in prostate cancer
2023-Dec-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108429
PMID:38077153
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研究论文 | 本研究利用Visium空间转录组学分析前列腺癌组织的转录组特征,揭示了肿瘤内异质性及Gleason评分的进展特征 | 首次通过空间转录组学系统分析前列腺癌不同Gleason评分的组织异质性和基因表达模式 | 样本数量较少,可能影响结果的普适性和可靠性 | 研究前列腺癌Gleason评分进展过程中的转录组表达模式 | 四个具有不同Gleason评分的前列腺癌组织样本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 四个前列腺癌组织样本 |
16355 | 2024-08-07 |
A single-cell atlas of the peripheral immune response in patients with influenza A virus infection
2023-Dec-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108507
PMID:38089584
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了流感A病毒感染患者外周血免疫反应的细胞亚型和分子特征 | 首次详细描述了流感A病毒感染患者中特定免疫细胞亚群的IFN-α诱导蛋白27(IFI27)的显著上调,并识别出与IFN信号相关的特定中性粒细胞亚群 | NA | 深入理解流感A病毒感染患者外周血免疫反应的细胞亚型和分子特征 | 流感A病毒感染患者的外周血免疫细胞 | 数字病理学 | 流感 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞全血(scWB) | 来自不同人群的单细胞全血样本 |
16356 | 2024-08-07 |
Deciphering the role of immunoglobulin secreting malignant lineages in the invasive frontiers of small cell lung cancer by scRNA-seq and spatial transcriptomics analysis
2023-Dec-12, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-023-00621-4
PMID:38081849
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
16357 | 2024-08-05 |
Increased PAFAH1B3 was associated with poor prognosis and T-cell exhaustion microenvironment in hepatocellular carcinoma
2023-Dec-08, Discover. Oncology
DOI:10.1007/s12672-023-00845-6
PMID:38063949
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研究论文 | 这篇文章探讨了PAFAH1B3与肝细胞癌中的T细胞耗竭的关系。 | 提出PAFAH1B3是肝细胞癌患者预后不良的独立效应因子,并与肿瘤微环境中的T细胞耗竭密切相关。 | 可能未涵盖所有相关的生物标志物或者机制。 | 研究PAFAH1B3在肝细胞癌中的作用以及其与T细胞耗竭的关联。 | 肝细胞癌患者的临床样本和公共数据集中的肿瘤样本。 | 数字病理学 | 肝癌 | qRT-PCR, 免疫组化, 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 50对临床组织切片样本 |
16358 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing in cancer research: discovering novel biomarkers and therapeutic targets for immune checkpoint blockade
2023-Dec-08, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-023-03158-4
PMID:38066642
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在癌症研究中的应用,特别是在发现免疫检查点阻断疗法的新生物标志物和治疗靶点方面 | 单细胞RNA测序技术能够揭示单个细胞的基因表达谱,有助于高分辨率地研究肿瘤微环境的异质性 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在免疫检查点阻断疗法中的应用,以发现新的生物标志物和治疗靶点 | 癌症患者的肿瘤微环境及其对免疫检查点阻断疗法的反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
16359 | 2024-08-07 |
Characterization of the cellular heterogeneity and bone regenerative potential of cultured human periosteal cells
2023-Dec, Regenerative therapy
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.reth.2023.11.006
PMID:38074190
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了培养的人骨膜细胞的细胞异质性及其骨再生潜力 | 首次揭示了培养的人骨膜细胞在不同培养区域的组成多样性及其不同的成骨能力 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术表征培养的人骨膜细胞的异质性,并研究其在体内的成骨潜力 | 培养的人骨膜细胞 | 细胞生物学 | 骨骼疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了通过组织移植方法培养的人骨膜细胞,并在大鼠皮下植入模型中进行了实验 |
16360 | 2024-08-07 |
A deep lung cell atlas reveals cytokine-mediated lineage switching of a rare cell progenitor of the human airway epithelium
2023-Nov-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.28.569028
PMID:38076853
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研究论文 | 本研究通过构建深度肺细胞图谱,分析了311,748个单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据,揭示了人类气道中罕见的细胞前体及其在成熟tuft细胞分化中的作用 | 发现了罕见的双能前体细胞,即tuft-ionocyte前体细胞(TIP细胞),并揭示了其在哮喘和囊性纤维化中的免疫信号通路对细胞分化的影响 | 研究样本来自无法用于器官移植的捐赠肺,可能存在一定的局限性 | 识别人类气道中的罕见细胞前体并定义其与成熟tuft细胞的谱系关系 | 人类气道中的罕见上皮细胞及其在呼吸疾病中的作用 | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 311,748个单细胞RNA测序数据 |