单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
16161 2024-08-07
Diverse contribution of amniogenic somatopleural cells to cardiovascular development: With special reference to thyroid vasculature
2024-Jan, Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists IF:2.0Q3
研究论文 本文通过鹌鹑-鸡嵌合体分析,展示了胚胎内ASC细胞分化为多种细胞类型,包括心肌细胞、平滑肌细胞、心脏间质细胞和血管内皮细胞,并特别关注了其在甲状腺血管形成中的作用。 本研究揭示了ASC细胞在心脏和甲状腺发育中的新角色,特别是其在甲状腺内血管形成中的作用。 文中提到的胚胎内ASC细胞的分化过程和最终分布的详细情况仍大部分未知。 研究ASC细胞在心血管发育中的作用,特别是其在甲状腺血管形成中的作用。 研究对象包括ASC细胞的分化过程及其在胚胎内的分布,特别是其在心脏和甲状腺发育中的作用。 心血管疾病 NA 单细胞转录组分析 NA 细胞 鹌鹑-鸡嵌合体
16162 2024-08-07
Single-cell transcriptome sequencing of plant leaf expressing anti-HER2 VHH-FcK cancer therapeutic protein
2023-Dec-19, Scientific data IF:5.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了表达抗HER2 VHH-Fc抗癌治疗蛋白的转基因烟草叶片的基因表达模式 首次使用单细胞RNA测序技术分析转基因植物叶片中特定细胞的基因表达模式,以优化重组抗体的生产 NA 研究如何通过优化转基因植物的基因表达来提高生物治疗蛋白的生产效率 转基因烟草叶片,表达抗HER2 VHH-Fc抗癌治疗蛋白 生物技术 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 转基因烟草叶片的特定细胞
16163 2024-08-07
Single-Cell Atlas of Neonatal Mouse Hearts Reveals an Unexpected Cardiomyocyte
2023-12-05, Journal of the American Heart Association IF:5.0Q1
研究论文 本文通过设计新生小鼠心脏细胞的分离程序,提供了出生后四个不同阶段心脏细胞的单细胞分辨率详细图谱 本文发现了意外的红细胞样心肌细胞-终末期心肌细胞,并提供了心肌细胞与其他心脏细胞之间全面相互作用的初步蓝图 NA 研究心肌细胞的异质性并提供在不同生理条件和疾病中的参考 新生小鼠心脏的心肌细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 细胞图谱 10,000个心肌细胞
16164 2024-08-05
Unveiling Hypothalamic Molecular Signatures via Retrograde Viral Tracing and Single-Cell Transcriptomics
2023-12-04, Scientific data IF:5.8Q1
研究论文 本研究通过逆行病毒追踪和单细胞转录组学揭示了下丘脑分子的特征 本研究创新地结合了多样化数据集进行验证,提供了更细致的下丘脑细胞类型多样性 本研究的局限性未在摘要中提及 深入理解下丘脑神经回路及其分子身份 来自CRH-IRES-Cre小鼠的1,533个下丘脑细胞 数字病理学 NA 单核RNA测序(snRNA-seq) NA 细胞转录组数据 1,533个来自CRH-IRES-Cre小鼠的细胞
16165 2024-08-05
CD133+ endothelial-like stem cells restore neovascularization and promote longevity in progeroid and naturally aged mice
2023-Nov, Nature aging IF:17.0Q1
研究论文 这篇文章研究了CD133+内皮样干细胞如何恢复新生血管形成并促进前老化和自然衰老小鼠的寿命 首次识别出CD133骨髓源性内皮样细胞作为潜在内皮祖细胞,并阐明其在衰老小鼠中新生血管形成和寿命延长的机制 缺乏在人体研究中的验证,或对临床应用的直接影响未进行评估 探讨干细胞在衰老和组织退化中的作用,并提出基于干细胞的治疗策略 使用前老化和自然衰老的小鼠作为研究对象 数字病理学 老年病 单细胞转录组学 NA 生物样本 包含前老化和自然衰老小鼠
16166 2024-08-05
Spatiotemporal molecular dynamics of the developing human thalamus
2023-10-13, Science (New York, N.Y.)
研究论文 本研究探讨了人类丘脑发育过程中分子动态的时空特征 首次使用单细胞和多重空间转录组技术描绘人类丘脑神经元的分子轨迹 尚未深入了解丘脑发育的分子架构 阐明人类正在发育的丘脑中细胞命运特征和组织的分子轨迹 人类发育中的丘脑神经元及其分子特征 数字病理学 NA 单细胞空间转录组 NA 转录组数据 NA
16167 2024-08-05
Identification of efferocytosis-related subtypes in gliomas and elucidating their characteristics and clinical significance
2023, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 本研究识别了胶质瘤中的吞噬凋亡相关亚型,并探讨了其特征和临床意义 首次通过分析137个与吞噬凋亡相关的基因,建立了与吞噬凋亡相关的胶质瘤亚型分类,并探讨了其在免疫环境、细胞间通信和代谢过程中的特征 未提及特定实验设计或样本选择的限制 探讨胶质瘤中吞噬凋亡相关亚型的特征和临床意义 胶质瘤中的吞噬凋亡相关亚型及其相关特征 数字病理学 NA RNA-seq NMF算法 基因表型数据 NA
16168 2024-08-07
Single-cell RNA landscape of osteoimmune microenvironment in osteoporotic vertebral compression fracture and Kümmell's disease
2023, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了骨质疏松性椎体压缩骨折和Kümmell病在骨免疫微环境中的细胞组成和相互作用 首次在单细胞水平上揭示了骨质疏松性椎体压缩骨折和Kümmell病在骨免疫微环境中的分子途径、细胞群组成和细胞间相互作用的差异 NA 探讨骨质疏松性椎体压缩骨折和Kümmell病在骨免疫微环境中的细胞组成和相互作用 骨质疏松性椎体压缩骨折和Kümmell病 数字病理学 骨质疏松症 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 8741个单细胞
16169 2024-08-07
APOL1 Induces Pyroptosis of Fibroblasts Through NLRP3/Caspase-1/GSDMD Signaling Pathway in Ulcerative Colitis
2023, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 本研究探讨了APOL1通过NLRP3/Caspase-1/GSDMD信号通路诱导纤维母细胞焦亡在溃疡性结肠炎中的作用 首次揭示了APOL1通过NLRP3-Caspase1-GSDMD信号通路诱导纤维母细胞焦亡,并促进趋化因子CXCL1的释放,这一发现有助于理解溃疡性结肠炎的发病机制 NA 研究APOL1在溃疡性结肠炎中诱导纤维母细胞焦亡的作用及其分子机制 溃疡性结肠炎中的纤维母细胞 NA 溃疡性结肠炎 生物信息学分析、免疫组织化学、免疫荧光、Western blot NA 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 使用了来自Gene Expression Omnibus (GEO)数据库的GSE193677和GSE231993数据集
16170 2024-08-07
Urinary PART1 and PLA2R1 Could Potentially Serve as Diagnostic Markers for Diabetic Kidney Disease Patients
2023, Diabetes, metabolic syndrome and obesity : targets and therapy
研究论文 本研究通过bulk-seq、scRNA-seq和snRNA-seq数据分析,识别出与糖尿病肾病相关的尿液-肾脏特异性基因,特别是PART1和PLA2R1,这些基因可能作为早期诊断糖尿病肾病的标志物 首次识别出尿液中的PART1和PLA2R1作为糖尿病肾病的潜在诊断标志物,并探讨了它们与肾脏损伤和蛋白尿的关系 研究样本量较小,且仅包括糖尿病肾病患者和健康对照组,未来研究需扩大样本量并考虑更多疾病阶段的患者 探索糖尿病肾病的非侵入性诊断方法,特别是早期诊断 糖尿病肾病患者和健康对照组的尿液样本 NA 糖尿病肾病 bulk-seq, scRNA-seq, snRNA-seq NA 尿液样本 56个尿液样本,包括11个来自糖尿病肾病患者和11个来自健康对照组
16171 2024-08-07
Single-cell analyses EMP1 as a marker of the ratio of M1/M2 macrophages is associated with EMT, immune infiltration, and prognosis in bladder cancer
2023, Bladder (San Francisco, Calif.)
研究论文 本研究探讨了单细胞分析中EMP1作为M1/M2巨噬细胞比例的标志物与膀胱癌的EMT、免疫浸润及预后的关联 首次研究了M1和M2巨噬细胞联合作用在膀胱癌发展、生长、进展和转移中的意义,并识别了EMP1作为关键基因 研究样本量较小,仅涉及32名患者 探究EMP1在膀胱癌中的作用及其作为预后标志物的潜力 膀胱癌中的M1/M2巨噬细胞比例及EMP1基因 数字病理学 膀胱癌 Cibersortx算法、流式细胞术、Gene Set Enrichment Analysis (GSEA)、Gene Set Variation Analysis (GSVA)、Gene Ontology (GO)、单细胞转录组分析(scRNA-seq)、Cellchat NA 基因表达数据 32名膀胱癌患者
16172 2024-08-07
Deciphering the Divergent Gene Expression Landscapes of m6A/m5C/m1A Methylation Regulators in Hepatocellular Carcinoma Through Single-Cell and Bulk RNA Transcriptomic Analysis
2023, Journal of hepatocellular carcinoma IF:4.2Q2
研究论文 本研究通过单细胞和批量RNA转录组分析,探索了m6A/m5C/m1A甲基化调控基因在肝细胞癌中的表达差异 本研究首次在单细胞水平上探索了m6A/m5C/m1A甲基化调控基因的表达,并验证了其在癌组织和邻近非癌肝组织中的表达 本研究仅分析了m6A/m5C/m1A甲基化调控基因的表达差异,未深入探讨其具体功能和机制 探索m6A/m5C/m1A甲基化调控基因在肝细胞癌中的表达差异 m6A/m5C/m1A甲基化调控基因在肝细胞癌中的表达 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序 NA RNA 收集了成人肝细胞癌患者的癌组织和邻近非癌肝组织样本
16173 2024-08-07
Titration of 124 antibodies using CITE-Seq on human PBMCs
2022-12-02, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 研究使用CITE-Seq技术在人外周血单个核细胞(PBMCs)上滴定124种抗体的最佳浓度 首次系统地评估了188种CITE-Seq抗体在PBMCs上的检测能力,并找到了最佳的染色浓度 研究仅限于人外周血单个核细胞,未涉及其他细胞类型 确定哪些CITE-Seq抗体能在PBMCs上检测到其抗原,并找到最佳的染色浓度 188种CITE-Seq抗体及其在PBMCs上的检测能力 单细胞测序 NA CITE-Seq NA 单细胞RNA测序数据 人外周血单个核细胞(PBMCs)
16174 2024-08-07
Single-cell transcriptomes and T cell receptors of vaccine-expanded apolipoprotein B-specific T cells
2022, Frontiers in cardiovascular medicine IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了接种ApoB肽P6疫苗的小鼠中ApoB特异性T细胞的转录组和T细胞受体 首次深入表征了疫苗扩增的ApoB特异性T细胞,并揭示了T细胞受体与ApoB肽P6:MHC-II相互作用的特异性 研究仅限于C57BL/6J小鼠模型,尚未在人类中进行验证 探究疫苗接种对ApoB表位的诱导反应 ApoB特异性T细胞的单细胞转录组和T细胞受体 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 C57BL/6J小鼠接种ApoB肽P6疫苗后的T细胞
16175 2024-08-05
Single-cell transcriptomics reveals the pulmonary inflammation induced by inhalation of subway fine particles
2024-02-05, Journal of hazardous materials IF:12.2Q1
研究论文 本研究揭示了地铁细颗粒物如何引起肺部炎症。 首次实验研究地铁PM引起的肺部炎症损伤 研究主要在小鼠模型中进行,可能不完全适用于人类 探索地铁细颗粒物对肺部炎症的影响及其机制 小鼠及其免疫细胞亚群 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 NA 组织样本和生物液体 小鼠样本,具体数量未提及
16176 2024-08-07
Isolation and functional identification of immune cells in hemolymph of blood clams Tegillarca granosa
2024-Jan, Fish & shellfish immunology IF:4.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序技术,对血蛤Tegillarca granosa的血液细胞进行了分子层面的分类和功能鉴定 首次报道了血蛤Tegillarca granosa免疫细胞的分离和鉴定,为理解其免疫防御机制提供了新视角 NA 旨在深入研究红血软体动物的先天免疫系统 血蛤Tegillarca granosa的免疫细胞 NA NA 单细胞转录组测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 具体样本数量未在摘要中提及
16177 2024-08-07
Convergent differentiation of multiciliated cells
2023-12-27, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 研究通过跨物种数据整合分析了人类和小鼠的鼻上皮细胞、支气管、输卵管和室下区室管膜细胞的单细胞转录组数据,探讨了多纤毛细胞(MCCs)在不同组织中的相似性和差异性 研究确认了MCCs在最终分化步骤中具有收敛的基因集表达,为理解发育过程中的纤毛生成提供了新的见解 NA 理解多纤毛细胞在多个组织中的相似性和差异性 多纤毛细胞在不同组织中的分化过程 NA NA 单细胞转录组测序 NA 转录组数据 人类和小鼠的鼻上皮细胞、支气管、输卵管和室下区室管膜细胞
16178 2024-08-07
Host CD34+ cells are replacing donor endothelium of transplanted heart
2023-12, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和诱导性谱系追踪小鼠模型,探讨了心脏移植后供体内皮细胞被宿主CD34+细胞替代的机制 首次通过单细胞RNA测序和谱系追踪技术,揭示了宿主CD34+细胞在心脏移植后替代供体内皮细胞的详细过程和机制 研究主要基于小鼠模型,其结果在人类心脏移植中的适用性需要进一步验证 探讨心脏移植后内皮细胞再生的来源及其机制 心脏移植后的内皮细胞再生和宿主CD34+细胞的作用 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA RNA序列 小鼠模型
16179 2024-08-07
Colonic L-cell impairment in aged subjects with type 2 diabetes leads to diminished GLP-1 production
2023-Dec, Diabetes & metabolic syndrome
研究论文 研究探讨了2型糖尿病老年患者结肠L细胞功能障碍及其导致GLP-1分泌减少的机制 通过单细胞RNA测序分析揭示了L细胞功能障碍的分子机制,为改善GLP-1分泌提供了新的靶点 NA 解析2型糖尿病条件下L细胞生物学变化的机制,为基于肠道的2型糖尿病治疗策略提供研究支持 2型糖尿病老年患者的结肠L细胞及其GLP-1分泌功能 NA 2型糖尿病 单细胞RNA测序 NA RNA 包括年轻和老年2型糖尿病患者以及非糖尿病患者,以及长期高脂肪高果糖饮食诱导的老年2型糖尿病Wistar大鼠模型
16180 2024-08-05
High-dimensional analysis reveals an immune atlas and novel neutrophil clusters in the lungs of model animals with Actinobacillus pleuropneumoniae-induced pneumonia
2023-Sep-13, Veterinary research IF:3.7Q1
研究论文 本研究揭示了模型动物肺部因Actinobacillus pleuropneumoniae引起的肺炎中的免疫图谱和新型中性粒细胞亚群 首次识别了具有抗原呈递细胞特征的MHC-II中性粒细胞,并发现了它们在APP感染后数量的增加 该研究主要集中在小鼠模型中,尚需在其他动物模型或人类中进行验证 研究肺部特异的免疫反应和参与细菌感染的关键免疫细胞亚群 Actinobacillus pleuropneumoniae感染的小鼠及幼猪 数字病理学 猪肺炎 高维质谱细胞术和单细胞RNA-seq NA 细胞谱系和转录组数据 小鼠与感染APP和克雷伯氏肺炎杆菌的幼猪样本
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