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当前共找到 35027 篇文献，本页显示第 1341 - 1360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1341 | 2025-12-20 |
Single-cell identification of an endothelial cell proximal SPP1+ macrophage population defines the metastatic vascular niche in lymph nodes
2025-Dec-16, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-27796-y
PMID:41402359
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组数据，在头颈鳞状细胞癌的转移淋巴结中发现了一个独特的、高表达SPP1的肿瘤相关巨噬细胞亚群，并揭示了其通过与内皮细胞的相互作用促进血管生成，从而形成转移性血管微环境的机制 | 首次在头颈鳞状细胞癌的转移淋巴结中，通过单细胞分析鉴定出一个特定的、富含SPP1的肿瘤相关巨噬细胞亚群，并阐明了该亚群通过SPP1-ITGa9b1和FN1-ITGa2b1信号轴与内皮细胞相互作用，促进血管生成和淋巴转移的新机制 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据分析，样本量相对有限（n=41），且功能机制验证主要依赖生物信息学分析和免疫组化，缺乏更深入的体内外功能实验验证 | 探究头颈鳞状细胞癌淋巴结转移的细胞和分子机制，特别是肿瘤微环境中细胞间的相互作用 | 头颈鳞状细胞癌患者的原发肿瘤、转移淋巴结和非转移淋巴结组织 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序，免疫组化，多重免疫组化，空间分析 | NA | 单细胞转录组数据，bulk RNA-seq数据，图像数据 | 41个样本（来自多个公共数据库） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1342 | 2025-12-20 |
Single-cell and spatial transcriptomic characterization of pulmonary pleomorphic carcinoma
2025-Dec-16, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09162-w
PMID:41402584
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，对肺多形性癌的分子基础进行了多组学分析，揭示了其上皮和肉瘤样成分的细胞动态及潜在治疗靶点 | 首次结合数字空间分析和单细胞RNA测序对肺多形性癌进行多组学表征，发现MET基因和蛋白仅在上皮成分中过表达，并识别出具有中间EMT状态和ECM重塑特征的细胞群作为新治疗靶点 | 研究样本量较小，且为罕见肺癌亚型，可能限制结果的普遍性 | 阐明肺多形性癌的分子基础，包括其上皮和肉瘤样成分的细胞动态，以识别潜在治疗靶点 | 肺多形性癌（PPC）患者样本，包括上皮和肉瘤样成分 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），数字空间分析，多组学分析 | NA | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 1343 | 2025-12-18 |
ST-FFPE-mIF: integrating spatial transcriptomics and multiplex immunofluorescence in formalin-fixed paraffin-embedded tissues using Stereo-seq
2025-Dec-16, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03900-3
PMID:41402878
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1344 | 2025-12-20 |
M6A-methylated MUC1 drives silica-induced lung inflammation and fibrosis
2025-Dec-16, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.119576
PMID:41411794
|
研究论文 | 本研究揭示了N6-甲基腺苷（m6A）修饰的MUC1在二氧化硅诱导的肺部炎症和纤维化中的关键驱动作用 | 首次发现m6A修饰的MUC1通过激活NF-κB/ZEB1和β-catenin/Snail信号通路驱动硅肺病的炎症和纤维化进程 | NA | 探究m6A修饰的MUC1在二氧化硅诱导的肺部炎症和纤维化中的作用机制 | 硅肺病患者血液样本、肺上皮细胞、支气管上皮细胞 | 分子生物学 | 肺病 | 单细胞RNA测序、染色质免疫沉淀、功能测定 | NA | RNA测序数据、临床数据 | 硅肺病患者血液样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1345 | 2025-12-20 |
Molecular markers in oral squamous cell carcinoma: Insights into the tumor microenvironment, epigenetic regulation, and intercellular communications
2025-Dec-16, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2025.189516
PMID:41412275
|
综述 | 本文综述了口腔鳞状细胞癌中新型生物标志物的最新进展，重点关注肿瘤微环境、表观遗传调控和细胞间通讯 | 强调了细胞外囊泡作为连接肿瘤微环境和表观遗传调控网络的关键介质，并利用单细胞测序等高通量技术揭示分子机制 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据，主要基于现有文献总结，可能未涵盖所有最新研究 | 总结口腔鳞状细胞癌的新型生物标志物研究进展，特别是肿瘤微环境、表观遗传调控和细胞间通讯的作用 | 口腔鳞状细胞癌（OSCC）及其肿瘤微环境、表观遗传改变和细胞外囊泡 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞测序、质谱分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1346 | 2025-12-20 |
Spatial transcriptomic alignment, integration, and 3D reconstruction by STAIR
2025-Dec-15, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03895-x
PMID:41398698
|
研究论文 | 本文提出了一种名为STAIR的端到端解决方案，用于空间转录组学中的切片对齐、整合和3D重建 | 首次提出使用具有点水平和切片水平注意力机制的异构图注意力网络，实现统一嵌入空间并指导无监督3D重建，在平行切片的z轴重建方面表现出首创性性能 | NA | 解决空间转录组学中将多个切片合并为统一3D图谱的挑战 | 空间转录组学数据切片 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 异构图注意力网络 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1347 | 2025-12-20 |
Differential Regulation of APOE4-Mediated Astrocytic Lipid Metabolism by BMP Signaling Exacerbates Alzheimer's Disease Pathologies in Neurons
2025-Dec-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.14.694212
PMID:41415446
|
研究论文 | 本研究探讨了BMP信号如何通过调控APOE4介导的星形胶质细胞脂质代谢，加剧阿尔茨海默病神经元病理 | 首次揭示了BMP信号在APOE4与衰老相互作用中的关键角色，并建立了星形胶质细胞脂质代谢与神经元tau蛋白过度磷酸化之间的因果关系 | 研究主要基于体外iPSC模型，缺乏体内验证；样本规模未明确说明 | 探究衰老相关BMP信号与APOE4多态性在阿尔茨海默病发病机制中的相互作用 | iPSC来源的星形胶质细胞与共培养的神经元 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 细胞共培养模型 | 转录组数据、蛋白质磷酸化数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1348 | 2025-12-20 |
ACADVL upregulation is associated with placental ferroptosis in intrahepatic cholestasis of pregnancy
2025-Dec-13, Biochimica et biophysica acta. Molecular and cell biology of lipids
DOI:10.1016/j.bbalip.2025.159711
PMID:41397582
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、脂质组学和公共RNA-seq数据，探讨了妊娠期肝内胆汁淤积症（ICP）中胎盘铁死亡的机制，并发现ACADVL上调与线粒体功能障碍和铁死亡相关 | 首次提出ACADVL、脂质代谢、线粒体功能障碍和铁死亡在ICP发病机制中的关联模型，并利用多组学方法验证 | 研究机制仍需进一步实验验证，样本量可能有限，且未详细探讨其他潜在影响因素 | 阐明ICP中胎盘功能障碍的分子机制，特别是铁死亡的作用 | 妊娠期肝内胆汁淤积症患者的胎盘组织 | 数字病理学 | 妊娠期肝内胆汁淤积症 | 单细胞RNA测序、LC-MS/MS脂质组学、RNA-seq、免疫组织化学、免疫荧光、Western blotting、透射电子显微镜 | Random Forest、Support Vector Machine、LASSO回归 | 单细胞RNA-seq数据、脂质组学数据、公共RNA-seq数据、图像数据 | 未明确指定样本数量，但涉及ICP患者胎盘组织 | NA | 单细胞RNA-seq、脂质组学 | NA | NA |
| 1349 | 2025-12-20 |
Multi-omics profiling of ACOX3 unveils pan-cancer clinical biomarker potential
2025-Dec-13, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析全面评估了ACOX3作为新型泛癌生物标志物的表达异质性、临床相关性、肿瘤-免疫相互作用及治疗潜力 | 首次将ACOX3作为泛癌生物标志物进行系统性多组学表征，并结合单细胞与空间转录组学揭示其在肿瘤微环境中的免疫相关性 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证仅在HNSCC细胞系中进行，缺乏体内模型验证 | 评估ACOX3作为泛癌生物标志物的诊断、预后及治疗潜力 | 多种癌症类型（包括KICH、PRAD、THCA、COAD、HNSCC等）的肿瘤样本及HNSCC细胞系 | 生物信息学 | 泛癌 | 多组学分析、单细胞转录组学、空间转录组学、分子对接、分子动力学模拟 | Cox回归、Kaplan-Meier生存分析、ROC分析 | 基因表达数据、临床数据、单细胞数据、空间转录组数据 | 多种癌症类型的公共数据库样本及HNSCC细胞系 | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1350 | 2025-12-20 |
A transition zone enriched WIF1 ⁺ basal cell subtype is associated with benign prostatic hyperplasia
2025-Dec-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.08.692826
PMID:41415376
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析，识别出在良性前列腺增生中富集的WIF1⁺基底细胞亚型，并探讨其在前列腺过渡区的分布及潜在病理作用 | 首次通过大规模单细胞RNA测序识别出前列腺过渡区富集的WIF1⁺基底细胞亚型，并揭示其与良性前列腺增生发病机制的关联 | 研究基于前列腺切除标本的良性区域，可能未完全反映疾病进展或不同阶段的细胞变化 | 探究人类前列腺不同区域的细胞组成及其疾病易感性，特别是良性前列腺增生的发病机制 | 人类前列腺的良性区域，包括过渡区和非过渡区 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 前列腺切除标本的良性区域 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1351 | 2025-12-20 |
Acute neuroinflammation induces prolonged transcriptional reprogramming in microglia
2025-Dec-10, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03572-7
PMID:41372988
|
研究论文 | 本研究探讨急性神经炎症对小鼠小胶质细胞的长期转录影响，发现即使炎症消退，小胶质细胞仍存在持续的转录重编程和疾病相关特征 | 首次系统揭示急性神经炎症可诱导小胶质细胞产生持久的转录重编程，并发现这些急性特征与阿尔茨海默病模型及人类神经炎症疾病的小胶质细胞特征重叠 | 观察期短于慢性神经退行性疾病的病程，且主要基于小鼠模型 | 探究急性神经炎症对小胶质细胞的长期影响及其与神经退行性疾病的潜在关联 | 小鼠小胶质细胞 | 单细胞转录组学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1352 | 2025-12-20 |
MoDaH achieves rate optimal batch correction
2025-Dec-10, ArXiv
PMID:41415606
|
研究论文 | 本文提出了一种基于混合模型的数据协调方法（MoDaH），用于单细胞组学数据的批次校正，并首次提供了批次校正的理论保证 | 首次为批次校正问题建立了极小极大最优误差率，并证明所提方法MoDaH能够达到该最优率，这是首个具有理论保证的批次校正算法 | NA | 开发一种具有理论保证的批次校正算法，以解决单细胞组学数据分析中批次效应带来的技术干扰 | 单细胞RNA测序数据和空间蛋白质组学数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序，空间蛋白质组学 | 高斯混合模型 | 单细胞组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 1353 | 2025-12-20 |
Toward a better pan-tumor predictive signature for unleashing precision immuno-oncology
2025-Dec-09, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013213
PMID:41365533
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评论 | 本文探讨了免疫检查点抑制剂（ICI）在实体瘤治疗中的预测生物标志物，并提出了一种新型免疫特征评分以优化精准免疫肿瘤学 | 提出了一种基于DNA和RNA分析的新型免疫特征评分（Immune Profile Score），旨在预测实体瘤患者对免疫检查点抑制剂的反应，并强调了整合多组学数据、单细胞技术和临床因素的重要性 | 该评分系统仍需前瞻性验证和进一步优化，以实现其在精准免疫肿瘤学中的全部潜力 | 开发更准确的预测生物标志物，以改善实体瘤患者对免疫检查点抑制剂的治疗反应和精准医疗应用 | 实体瘤患者，特别是接受免疫检查点抑制剂治疗的群体 | 精准医疗 | 实体瘤 | DNA和RNA分析，单细胞RNA技术，多组学基因特征分析 | NA | 基因表达数据，分子特征数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 1354 | 2025-12-20 |
ALKBH5-Mediated ITGB1 m6A Modification in Ovarian Cancer Progression and Immune Evasion
2025-Dec-09, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01127-w
PMID:41366552
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研究论文 | 本研究揭示了m6A去甲基化酶ALKBH5通过调控ITGB1表达促进卵巢癌进展和免疫逃逸的机制 | 首次发现ALKBH5通过介导ITGB1的m6A修饰调控卵巢癌免疫逃逸，并提出了ALKBH5-ITGB1轴作为新的诊断标志物和治疗靶点 | 未明确说明样本量大小，且主要依赖公共数据库验证，缺乏大规模临床队列验证 | 探究ALKBH5介导的m6A修饰在卵巢癌进展和免疫逃逸中的作用机制 | 卵巢癌细胞及相关的m6A修饰调控机制 | 计算生物学 | 卵巢癌 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, 深度学习, 共表达网络分析 | 深度学习模型 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1355 | 2025-12-20 |
SP140 limits type I interferon-driven pathology, preserving T cell motility and promoting resistance in tuberculosis
2025-Dec-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.05.692491
PMID:41415425
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型探究SP140在结核病中如何通过限制I型干扰素信号通路来维持T细胞免疫和宿主抵抗力 | 首次揭示SP140通过抑制I型干扰素驱动的病理过程来保护T细胞功能和运动性，从而促进结核病抵抗力 | 研究基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需验证 | 探究结核病易感宿主中CD8⁺ T细胞反应的差异及SP140的作用机制 | 感染结核分枝杆菌的小鼠模型，特别是缺乏SP140转录抑制因子的小鼠 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞RNA测序，活体显微镜成像 | NA | 基因表达数据，影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1356 | 2025-12-20 |
Senescence-Linked Fibrosis in the Aging Human Ovary Revealed by p16-Based Histological Profiling and Spatial Transcriptomics
2025-Dec-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.03.692228
PMID:41415409
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研究论文 | 本研究通过p16蛋白表达、空间转录组学和AI引导的数字病理学，揭示了人类绝经后卵巢中衰老细胞的空间分布及其与纤维化的关联 | 首次结合p16免疫组化、多重免疫荧光、空间转录组学和AI分析，系统绘制了绝经后卵巢衰老细胞的空间微环境，并识别出与p16阳性区域相关的32基因特征BuckSenOvary | 研究主要基于绝经后卵巢样本，可能未全面涵盖卵巢衰老的早期阶段；样本数量有限，需进一步验证 | 探究人类绝经后卵巢中衰老细胞的空间分布、特征及其与纤维化的关系，以识别潜在的治疗靶点 | 人类绝经后卵巢组织 | 数字病理学 | 老年疾病 | p16免疫组化、多重免疫荧光、空间转录组学、AI引导的数字病理学 | AI | 图像、空间转录组数据 | 92个空间区域 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1357 | 2025-12-20 |
A deep generative model for deciphering cellular dynamics and in silico drug discovery in complex diseases
2025-Dec, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-025-01423-7
PMID:40542107
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研究论文 | 本研究介绍了一种名为UNAGI的深度生成神经网络，用于分析时间序列单细胞转录组数据，以解析疾病进展中的复杂细胞动态并辅助计算机药物发现 | 开发了首个专门针对时间序列单细胞转录组数据的深度生成模型，能够学习疾病相关的细胞嵌入表示，并用于精准的药物扰动建模和筛选 | 论文未明确说明模型在其他疾病类型中的验证范围和局限性，也未详细讨论计算资源需求或模型可扩展性 | 开发计算工具以深入分析疾病进展的细胞动态，并实现靶向的计算机药物干预发现 | 特发性肺纤维化患者的单细胞转录组数据、COVID-19相关数据 | 机器学习 | 特发性肺纤维化 | 单细胞转录组测序 | 深度生成神经网络 | 时间序列单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1358 | 2025-12-20 |
MMP13-Expressing and COL11A1-Expressing Cancer-Associated Fibroblasts: Key Drivers of Esophageal Squamous Cell Carcinoma Progression and Prognostic Indicators
2025-Dec, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
DOI:10.1016/j.labinv.2025.104247
PMID:41005711
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别了食管鳞状细胞癌中三种关键的癌症相关成纤维细胞亚型，并揭示了其中MMP13和COL11A1表达的CAF亚型与不良预后及癌症进展的关联 | 首次报道了CAF亚型与食管鳞状细胞癌病理分期进展之间的关联，并识别出MMP13和COL11A1表达的myCAF亚型作为关键的预后指标 | 研究样本量有限，且主要关注晚期患者，需要更大规模的前瞻性研究验证 | 探究癌症相关成纤维细胞在食管鳞状细胞癌进展中的作用及其预后价值 | 食管鳞状细胞癌患者组织样本 | 单细胞组学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序，RNA原位杂交 | NA | 单细胞转录组数据，组织切片图像 | 未明确样本数量，但包括单细胞测序样本和手术切除标本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1359 | 2025-12-20 |
Andrias Davidianus Peptide Hydrogel Enables Sustained SR9011 Release to Promote Efferocytosis and Alleviate Colitis
2025-Dec, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202509049
PMID:41163542
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研究论文 | 本研究探讨了NR1D1在溃疡性结肠炎中的作用，并开发了一种基于大鲵肽水凝胶的NR1D1激动剂SR9011递送系统，以促进胞葬作用并缓解结肠炎 | 首次将NR1D1鉴定为溃疡性结肠炎中上皮细胞更新和胞葬作用的核心调节因子，并创新性地设计了一种结合大鲵肽的水凝胶用于靶向、持续肠道递送NR1D1激动剂SR9011 | 药代动力学分析仅限于结肠组织，未全面评估全身分布 | 研究NR1D1在溃疡性结肠炎发病机制中的作用，并开发基于水凝胶的NR1D1激活治疗策略 | 人类溃疡性结肠炎活检样本、小鼠结肠炎模型 | 生物医学工程 | 溃疡性结肠炎 | CUT&Tag分析、ChIP-qPCR、荧光素酶测定、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、染色质占据数据、单细胞转录组数据 | 人类UC活检样本和小鼠结肠炎模型（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1360 | 2025-12-20 |
Cell cycle-driven transcriptome maturation confers multilineage competence to cardiopharyngeal progenitors
2025-Dec, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-025-00613-y
PMID:41184589
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研究论文 | 本研究揭示了多能心咽祖细胞在细胞周期驱动下通过转录组成熟获得多谱系能力的过程 | 结合转基因样本条形码与单细胞RNA测序技术，首次发现心咽祖细胞在G1、S和G2期转录组动态变化，并提出“转录组成熟”和“行为能力”新概念 | 研究基于海鞘模型，可能不直接适用于高等脊椎动物 | 探究发育过程中多能祖细胞如何通过细胞周期调控获得多谱系分化能力 | 海鞘（Ciona）的心咽祖细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |