单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27707 篇文献，本页显示第 13021 - 13040 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 13021 | 2024-08-07 |
Insights into the role of the N6-methyladenosine reader IGF2BP3 in the progression of oral squamous cell carcinoma and its connection to cell-cycle control
2024-Jun, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.101932
PMID:38492500
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研究论文 | 本研究探讨了N6-甲基腺苷阅读器IGF2BP3在口腔鳞状细胞癌进展中的作用及其与细胞周期控制的联系 | 本研究首次揭示了IGF2BP3在口腔鳞状细胞癌中的过度表达，并发现其与细胞周期G2/M转换阶段的关联 | 研究主要基于批量测序和单细胞RNA测序数据，可能需要更多实验验证 | 探究IGF2BP3在口腔鳞状细胞癌中的作用及其对细胞周期的影响 | 口腔鳞状细胞癌中的IGF2BP3表达及其对细胞周期的影响 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 13022 | 2024-08-04 |
Prerequisite endocardial-mesenchymal transition for murine cardiac trabecular angiogenesis
2023-05-08, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.03.009
PMID:37023750
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研究论文 | 本文探讨了小鼠心脏内膜细胞如何通过“血管内皮细胞-间充质转化”机制生成小梁血管 | 首次揭示了小梁血管起源于心室内膜细胞的二步血管内皮细胞-间充质转化机制 | 研究主要集中于小鼠模型，可能对其他物种的应用有限 | 研究心脏小梁血管的起源和发育机制 | 心室内膜细胞及其在小梁血管形成中的作用 | 数字病理学 | 冠心病 | 单细胞转录组学、免疫荧光 | NA | NA | NA |
| 13023 | 2024-08-07 |
Dhaka: variational autoencoder for unmasking tumor heterogeneity from single cell genomic data
2021-Jul-12, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz095
PMID:30768159
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研究论文 | 本文介绍了一种名为'Dhaka'的变分自编码器方法，用于从单细胞基因组数据中揭示肿瘤异质性 | 提出了一种新的变分自编码器方法，能够将单细胞基因组数据转换为更有效的降维特征空间，以区分隐藏的肿瘤亚群 | NA | 旨在通过单细胞测序数据揭示肿瘤内部的异质性 | 单细胞基因组数据中的肿瘤细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞测序（scDNA-Seq和scRNA-Seq） | 变分自编码器（VAE） | 基因组数据 | 测试数据集包括合成数据和六个单细胞癌症数据集，每个样本的细胞数量从250到6000不等 |
| 13024 | 2024-08-07 |
Molecular and anatomical organization of the dorsal raphe nucleus
2019-08-14, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.46464
PMID:31411560
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序、原位杂交、解剖追踪和空间相关性分析，研究了小鼠背侧缝核的转录和空间细胞特征 | 揭示了至少18种不同的神经元亚型和5种血清素能神经元亚型，其中包括一种优先支配基底神经节的血清素能神经元亚型 | NA | 阐明背侧缝核的分子组织结构 | 小鼠背侧缝核的细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 39,411个单细胞 |
| 13025 | 2024-08-07 |
Cell Type- and Sex-Dependent Transcriptome Profiles of Rat Anterior Pituitary Cells
2019, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2019.00623
PMID:31620083
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序技术，分析了6800多个新鲜分散的前叶垂体细胞的转录组，识别并表征了六种特定的垂体细胞类型。 | 本文揭示了多种新的遗传标记，这些标记有助于垂体细胞类型的识别、性二态性和功能，并指出了激素产生细胞和滤泡星形细胞之间的关系。 | NA | 研究前叶垂体细胞的生理和病理机制。 | 前叶垂体细胞的转录组。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 6800多个前叶垂体细胞 |
| 13026 | 2024-08-07 |
Correction: Single-cell RNA sequencing reveals the lineage of malignant epithelial cells and upregulation of TAGLN2 promotes peritoneal metastasis in gastric cancer
2024-May, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-024-03402-x
PMID:38492153
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 13027 | 2024-08-07 |
Decoding the biology and clinical implication of neutrophils in intracranial aneurysm
2024-Apr, Annals of clinical and translational neurology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/acn3.52014
PMID:38317016
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和外部批量mRNA测序数据，深入探讨了侵入颅内动脉瘤（IA）壁的中性粒细胞的特征和功能异质性 | 首次详细描述了中性粒细胞在颅内动脉瘤中的生物学特性和潜在临床意义，揭示了中性粒细胞在IA形成和破裂中的不同亚群及其作用机制 | NA | 阐明中性粒细胞在颅内动脉瘤中的生物学特性和临床意义 | 中性粒细胞在颅内动脉瘤中的功能和临床意义 | NA | 颅内动脉瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | RNA测序数据 | 涉及人和小鼠模型的数据集 |
| 13028 | 2024-08-07 |
Identification of SARS-CoV-2-specific T cell and its receptor
2024-03-27, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-024-01537-6
PMID:38539271
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研究论文 | 本研究开发了一种机器学习模型，能够基于TCR序列特征区分COVID-19患者和健康个体，并识别了与SARS-CoV-2特异性T细胞及其受体相关的TCR库 | 首次精确识别了疫苗诱导的SARS-CoV-2特异性TCR和T细胞免疫机制，并展示了这些T细胞的高细胞毒性和延长生存期 | NA | 识别SARS-CoV-2特异性T细胞及其受体，为开发有效的免疫策略提供理论基础 | SARS-CoV-2特异性T细胞和TCR，以及疫苗诱导的细胞免疫 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），免疫库测序（IR-seq），流式细胞术 | 机器学习模型 | TCR序列 | HLA-A*02疫苗接种个体 |
| 13029 | 2024-08-04 |
Identification of TMZ resistance-associated histone post-translational modifications in glioblastoma using multi-omics data
2024-03, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.14649
PMID:38448295
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研究论文 | 本文探讨了在多组学数据中识别与 TMZ 耐药性相关的组蛋白翻译后修饰。 | 研究发现 H3K9ac 可能通过促进 SP1 转录因子的招募来增强 MGMT 转录，从而驱动 GBM 耐药性。 | 本研究主要分析了 TMZ 处理的少量 GBM 细胞系，可能缺乏临床样本的充分代表性。 | 探讨 GBM 耐药性机制，特别是与组蛋白翻译后修饰相关的机制。 | 建立了两个 TMZ 耐药的 GBM 细胞系，并分析了其转录组序列。 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 转录组测序 | NA | 多组学数据 | 建立了两个 TMZ 耐药的 GBM 细胞系 |
| 13030 | 2024-08-04 |
Exosome-transmitted podoplanin promotes tumor-associated macrophage-mediated immune tolerance in glioblastoma
2024-03, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.14643
PMID:38470096
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研究论文 | 本研究探讨了外泌体转运的podoplanin如何促进胶质母细胞瘤相关巨噬细胞介导的免疫耐受。 | 该研究首次揭示了胶质母细胞瘤细胞来源的外泌体中podoplanin与巨噬细胞功能之间的具体关系，从而为免疫逃逸机制提供了新的理解。 | 研究依赖于公共数据库中的样本，可能存在样本异质性和数据完整性的问题。 | 研究胶质母细胞瘤中巨噬细胞浸润模式及podoplanin的作用，探讨其对免疫抑制的影响。 | 灵长类动物和小鼠的巨噬细胞和T细胞。 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | RNA-seq, 免疫组化 | NA | 转录组数据, 组织切片 | 公共数据库中的胶质瘤患者样本以及BALB/c和OT-II小鼠的巨噬细胞和T细胞 |
| 13031 | 2024-08-07 |
CD8+ T cell infiltration and proliferation in the brainstem during experimental cerebral malaria
2024-03, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.14431
PMID:37697956
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、流式细胞术和免疫荧光技术，探讨了实验性脑型疟疾（ECM）中脑干内CD8+ T细胞的浸润和增殖情况，并分析了脑内浸润CD8+ T细胞与脑实质细胞的相互作用。 | 首次在单细胞分辨率下系统研究了ECM期间脑实质区域的细胞变化，发现脑内浸润的CD8+ T细胞高度激活并表达PD-1，脑实质细胞上调PD-L1表达，揭示了PD-1/PD-L1信号通路在ECM治疗中的潜在价值。 | NA | 探讨实验性脑型疟疾中脑干内CD8+ T细胞的浸润和增殖情况，以及脑内浸润CD8+ T细胞与脑实质细胞的相互作用。 | 实验性脑型疟疾小鼠的脑干组织 | 免疫学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术、免疫荧光 | NA | RNA | 健康和实验性脑型疟疾小鼠的脑干组织 |
| 13032 | 2024-08-07 |
Unraveling the complex pathophysiology of white matter hemorrhage in intracerebral stroke: A single-cell RNA sequencing approach
2024-03, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.14652
PMID:38433011
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研究论文 | 本研究旨在阐明白质出血（WMH）在脑内出血（ICH）中的细胞动态和病理生理机制 | 采用单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术，深入分析了WMH后的细胞变化和基因表达 | NA | 阐明白质出血在脑内出血中的细胞动态和病理生理机制 | 脑内出血中的白质出血 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 从脑内出血后第三天的同侧纹状体出血区域提取的单细胞悬液 |
| 13033 | 2024-08-04 |
Decoding the gene regulatory network of endosperm differentiation in maize
2024-01-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44369-7
PMID:38167709
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研究论文 | 本研究分析了玉米胚乳分化过程中的基因调控网络 | 首次利用单细胞转录组技术解剖玉米胚乳的基因调控网络 | 本研究仅关注于玉米的胚乳，不一定适用于其他作物的研究 | 揭示玉米胚乳发育过程中的基因调控机制 | 发育中的玉米胚乳，分析细胞分化的转录组数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组技术 | NA | 转录组数据 | 17,022个单细胞 |
| 13034 | 2024-08-07 |
Single-cell genome-wide association reveals that a nonsynonymous variant in ERAP1 confers increased susceptibility to influenza virus
2022-Nov-09, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2022.100207
PMID:36465279
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研究论文 | 本文开发了一种名为scHi-HOST的单细胞高通量人类易感性测试方法，用于快速识别影响抵抗力和易感性的遗传变异，并应用于流感A病毒的研究 | scHi-HOST方法结合单细胞RNA测序技术，能够在混合感染的细胞系中同时确定遗传身份，揭示与病毒负担相关的遗传变异，并识别表达数量性状位点 | NA | 研究流感A病毒的遗传易感性 | 流感A病毒及相关的遗传变异 | 基因组学 | 流感 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA数据 | 涉及欧洲、非洲和亚洲起源的细胞系及人类志愿者 |
| 13035 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis of angiotensin-converting enzyme II expression in human kidneys and bladders reveals a potential route of 2019 novel coronavirus infection
2021-Apr-20, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000001439
PMID:33879756
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了人类肾脏和膀胱中血管紧张素转换酶II（ACE2）的表达，探讨了2019新型冠状病毒（2019-nCoV）感染泌尿系统的潜在途径 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了ACE2在肾脏和膀胱细胞中的表达分布，为理解2019-nCoV感染泌尿系统的机制提供了新的视角 | 研究仅限于健康肾脏和膀胱样本，未涉及疾病状态下的ACE2表达情况 | 探讨2019-nCoV感染泌尿系统的潜在途径及肾脏损伤的可能原因 | 人类肾脏和膀胱细胞中ACE2的表达 | 数字病理学 | 新型冠状病毒肺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 三个已发表的肾脏细胞图谱数据集和两个自产的健康肾脏样本，以及三个膀胱样本 |
| 13036 | 2024-08-07 |
Disparate Interferon Signaling and Shared Aberrant Basaloid Cells in Single-Cell Profiling of Idiopathic Pulmonary Fibrosis and Systemic Sclerosis-Associated Interstitial Lung Disease
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.595811
PMID:33859634
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术比较了特发性肺纤维化（IPF）和系统性硬化症相关间质性肺病（SSc-ILD）患者的肺组织样本，以分析细胞类型特异性转录组的共性和差异 | 首次在SSc-ILD中鉴定出表现出细胞衰老和上皮-间质转化标志的异常基底样细胞 | NA | 探讨IPF和SSc-ILD之间细胞类型和信号通路的差异，以及这些差异在两种疾病中的作用 | IPF和SSc-ILD患者的肺组织样本 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 21个移植肺组织样本 |
| 13037 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of lung adenocarcinoma reveals heterogeneity of immune response-related genes
2019-02-21, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.121387
PMID:30821712
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了肺腺癌中的免疫反应相关基因的异质性 | 发现IFN-γ信号通路基因在单个癌细胞中异质表达并与MHC II类基因共同调控，以及肿瘤特异性抗原在单细胞中的表达异质性 | 尚未完全探索影响临床结果和患者选择的异质性类型 | 研究肺腺癌中单细胞水平免疫反应相关基因的异质性及其对免疫治疗效果的影响 | 肺腺癌患者的单细胞RNA测序数据和细胞系 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及肺腺癌患者和细胞系的单细胞RNA测序数据 |
| 13038 | 2024-08-04 |
Set7 Methyltransferase and Phenotypic Switch in Diabetic Glomerular Endothelial Cells
2024-Apr-17, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000345
PMID:38630537
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研究论文 | 本研究探讨了Set7甲基转移酶在糖尿病肾病（DKD）中对肾小管内皮细胞功能的影响 | 揭示了Set7在糖尿病肾小管内皮细胞表型转变中的调控作用，并表明靶向Set7可能保护肾小管细胞损伤 | 本研究主要在小鼠模型中进行，未来需要更多人类样本的验证 | 研究Set7在糖尿病肾病中对内皮细胞功能的作用 | 以糖尿病小鼠模型为研究对象 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞转录组学 | NA | RNA-seq | 小鼠模型和人类肾脏细胞 |
| 13039 | 2024-08-07 |
Dynamic Hippo pathway activity underlies mesenchymal differentiation during lung alveolar morphogenesis
2024-Apr-05, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202430
PMID:38602485
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研究论文 | 研究探讨了Hippo信号通路在肺泡形态发生中调节次级嵴肌成纤维细胞（SCMF）功能的动态变化 | 首次揭示了Hippo信号通路在肺泡形态发生中对SCMF功能、增殖和时间身份的调节作用 | NA | 研究Hippo信号通路在肺泡形态发生中对SCMF的调节作用 | 次级嵴肌成纤维细胞（SCMF）及其在肺泡形态发生中的作用 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | RNA | 从报告鼠中纯化的SCMF细胞 |
| 13040 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of pediatric renal tissues revealed the potential relationship between immunoglobulin A nephropathy and immunoglobulin A vasculitis with nephritis
2024-04, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1651
PMID:38591641
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |