单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27773 篇文献，本页显示第 12961 - 12980 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12961 | 2024-08-05 |
MAIT cells accumulate in ovarian cancer-elicited ascites where they retain their capacity to respond to MR1 ligands and cytokine cues
2022-May, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-021-03118-9
PMID:34854949
|
研究论文 | 本研究探讨了卵巢癌引起的腹水中MAIT细胞的特征及其免疫功能 | 揭示了MAIT细胞在卵巢癌腹水中的功能，及其在肿瘤进展中的作用 | 样本量相对较小，且仅展示了功能标志而未进行深入机制研究 | 研究MAIT细胞在卵巢癌中的积累及其免疫反应能力 | 主要研究了卵巢癌患者及小鼠模型中的MAIT细胞 | 免疫学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 生物样本 | 23名卵巢癌患者的腹水样本 |
| 12962 | 2024-08-05 |
Construction of TME and Identification of crosstalk between malignant cells and macrophages by SPP1 in hepatocellular carcinoma
2022-Jan, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-021-02967-8
PMID:34028567
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析探讨了肝细胞癌中的肿瘤微环境及SPP1在恶性细胞与巨噬细胞之间的交互作用 | 提出了一种新的表观遗传免疫评分系统(EIRS)，并揭示SPP1作为HCC患者预后差的免疫相关预测因子 | 研究主要依赖于已有的数据库，可能限制了对内在机制的更深入理解 | 探讨肝细胞癌的免疫微环境及其对疾病进展的影响 | 以肝细胞癌(HCC)患者为研究对象，分析肿瘤微环境的特征及与巨噬细胞的相互作用 | 数字病理学 | 肝癌 | 多组学分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据，转录组数据 | NA |
| 12963 | 2024-08-05 |
CD74+ macrophages are associated with favorable prognosis and immune contexture in hepatocellular carcinoma
2022-Jan, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-021-02962-z
PMID:34009409
|
研究论文 | 本研究探讨了CD74+巨噬细胞在肝细胞癌中的作用及其与预后和免疫环境的关系 | 本研究首次展示了CD74在肝细胞癌肿瘤微环境中的重要作用，并揭示了其与CD8细胞毒性T淋巴细胞浸润之间的关联 | 研究主要依赖于来自单一医院和TCGA的数据，可能存在样本代表性问题 | 探讨CD74在肝细胞癌中的功能及其对肿瘤微环境的影响 | 肝细胞癌患者的肿瘤组织样本和相关的免疫细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 免疫组化, 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本, 单细胞数据 | 来自中山医院的肝细胞癌组织样本和TCGA数据 |
| 12964 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals cellular and molecular immune profile in a Pembrolizumab-responsive PD-L1-negative lung cancer patient
2021-Aug, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-021-02848-0
PMID:33506299
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了一例Pembrolizumab反应的PD-L1阴性肺癌患者的细胞和分子免疫特征 | 首次在PD-L1阴性患者中识别与PD-1阻断相关的新细胞特征和潜在的预测标记 | 样本量有限，可能不足以广泛推广发现的应用 | 探索PD-L1阴性肺癌患者在Pembrolizumab治疗中的细胞及分子特征 | PD-L1阴性肺癌患者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | 16个细胞簇中的3423个细胞 |
| 12965 | 2024-08-05 |
Cryopreservation of microglia enables single-cell RNA sequencing with minimal effects on disease-related gene expression patterns
2021-Apr-23, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102357
PMID:33870145
|
研究论文 | 本文研究了冷冻保存小胶质细胞对单细胞RNA测序的影响 | 探索了冷冻保存小胶质细胞的使用，证明其在单细胞RNA测序中具有良好的适用性 | 未明确指出冷冻保存对其他细胞类型的影响 | 研究冷冻保存小胶质细胞对疾病相关基因表达模式的影响 | 冷冻保存的小胶质细胞 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 使用了配对的新鲜和冷冻保存的小胶质细胞样本 |
| 12966 | 2024-08-05 |
Integrated analysis of single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq unravels tumour heterogeneity plus M2-like tumour-associated macrophage infiltration and aggressiveness in TNBC
2021-Jan, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-020-02669-7
PMID:32681241
|
研究论文 | 本研究分析了三阴性乳腺癌中的肿瘤异质性和M2型肿瘤相关巨噬细胞浸润及其侵袭性 | 结合单细胞和整体组织转录组分析揭示了肿瘤异质性和免疫微环境与临床结果之间的关联 | 研究的局限性未在摘要中明确提及 | 探索三阴性乳腺癌中肿瘤异质性及M2型肿瘤相关巨噬细胞的作用 | 三阴性乳腺癌患者的肿瘤细胞和肿瘤浸润的免疫细胞 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序和整体RNA测序 | 随机森林和支持向量机（SVM），深度学习神经网络 | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 12967 | 2024-08-05 |
Dynamics of peripheral T cell clones during PD-1 blockade in non-small cell lung cancer
2020-Dec, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-020-02642-4
PMID:32591861
|
研究论文 | 本文探讨了在非小细胞肺癌中PD-1阻断期间外周T细胞克隆的动态变化 | 通过Smart-seq2单细胞RNA测序分析，首次对T细胞克隆在免疫治疗中的动态进行了全面监测 | 研究样本仅限于非小细胞肺癌患者，可能影响结果的普遍适用性 | 研究PD-1阻断患者外周T细胞克隆的功能状态和动态变化 | 分析了3,110个非小细胞肺癌患者的外周T细胞 | 数字病理学 | 非小细胞肺癌 | Smart-seq2单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 3,110个外周T细胞 |
| 12968 | 2024-08-05 |
Tumor-infiltrating CD39+CD8+ T cells determine poor prognosis and immune evasion in clear cell renal cell carcinoma patients
2020-Aug, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-020-02563-2
PMID:32306075
|
研究论文 | 该研究评估了肾透明细胞癌患者中肿瘤浸润CD39+CD8+ T细胞的临床价值 | 首次展示了CD39+CD8+ T细胞积累与肾透明细胞癌差预后的相关性 | 研究基于回顾性队列，缺乏前瞻性验证 | 探究CD39+CD8+ T细胞在肾透明细胞癌中的预后价值及其作为潜在治疗靶点 | 243例肾透明细胞癌患者的肿瘤微环境及其免疫细胞功能 | 数字病理学 | 肾癌 | 免疫组化分析，流式细胞术，生物信息学分析 | Kaplan-Meier分析，COX回归模型 | 样本 | 243例肾透明细胞癌患者，48个新鲜肿瘤样本 |
| 12969 | 2024-08-05 |
Interpretable factor models of single-cell RNA-seq via variational autoencoders
2020-06-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa169
PMID:32176273
|
研究论文 | 本文提出了一种基于变分自编码器的可解释单细胞RNA-seq因子模型 | 提出了一种修改过的变分自编码器框架，为大规模数据集中的基因程序识别提供可解释性 | 由于论文中未详细描述具体的限制，故此处为NA | 探索单细胞RNA-seq中基因表达变异和细胞类型依赖的统计推断方法 | 通过对大规模数据集的分析，识别基因程序 | 数字病理学 | NA | 变分自编码器 | 因子模型 | 基因表达数据 | NA |
| 12970 | 2024-08-05 |
Linking single-cell measurements of mass, growth rate, and gene expression
2018-11-27, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-018-1576-0
PMID:30482222
|
研究论文 | 本文介绍了一种微流体平台，可直接测量单细胞质量和生长速率。 | 创新之处在于将单细胞质量和生长速率的测量与高倍单细胞分析技术结合起来 | 未提及特定的局限性 | 研究单细胞生理特征与转录特征之间的关系 | 研究L1210和FL5.12细胞系及激活的CD8+ T细胞 | 数字病理学 | NA | 微流体平台 | NA | NA | 涉及的细胞系包括L1210、FL5.12和患者来源的胶质母细胞瘤细胞系 |
| 12971 | 2024-08-04 |
NIFK, a Potential Prognostic and Immunological Biomarker in Pan-- Cancer Analysis, Significantly Regulates Proliferation and Metastasis of Colorectal Cancer
2024-Apr-24, Recent patents on anti-cancer drug discovery
IF:2.5Q3
|
研究论文 | 该研究系统分析了NIFK在全癌种中的表达及其在结直肠癌中的作用 | 揭示了NIFK在大多数肿瘤中过表达，并显示出显著的预后效能和与免疫特征的相关性 | 目前缺乏对NIFK在其他癌种的系统分析，如在非结直肠癌中的具体作用 | 探讨NIFK作为潜在预后和免疫生物标志物在癌症中的作用 | 研究NIFK在多种癌症中表达、突变及其在结直肠腺癌中的免疫特征 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 通过TCGA进行的大规模分析，具体样本数量未提供 |
| 12972 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of human lung innate lymphoid cells in the vascular and tissue niche reveals molecular features of tissue adaptation
2023, Discovery immunology
DOI:10.1093/discim/kyad007
PMID:38650756
|
研究论文 | 本研究利用人源化小鼠模型，通过单细胞RNA测序技术，揭示了人体肺部血管和组织微环境中先天淋巴细胞（ILCs）的基因特征及其组织适应性的分子机制 | 首次在人源化小鼠模型中定义了肺部血管和组织微环境中人体ILCs的基因特征，并揭示了微环境信号对ILCs分子程序的塑造作用 | NA | 研究人体肺部不同解剖微环境中先天淋巴细胞（ILCs）的分子特征及其组织适应性 | 人体肺部的先天淋巴细胞（ILCs）及其在血管和组织微环境中的适应性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人源化MISTRG小鼠模型中的肺部ILCs和NK细胞 |
| 12973 | 2024-08-04 |
Co-expression of immune checkpoints in glioblastoma revealed by single-nucleus RNA sequencing and spatial transcriptomics
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.04.014
PMID:38633388
|
研究论文 | 本研究揭示了胶质母细胞瘤中的免疫检查点的共表达及其分子特征 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组分析，首次揭示了胶质母细胞瘤中免疫检查点表达模式及其潜在的免疫逃逸机制 | 本研究基于未治疗的胶质母细胞瘤样本，可能无法完全反映治疗后的情况 | 为了更好地理解胶质母细胞瘤的肿瘤微环境及其免疫逃逸机制 | 未治疗的胶质母细胞瘤样本 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序和空间转录组 | NA | RNA数据 | 180名胶质瘤患者用于预后验证 |
| 12974 | 2024-08-04 |
Comprehensive single-cell transcriptomic profiling reveals molecular subtypes and prognostic biomarkers with implications for targeted therapy in esophageal squamous cell carcinoma
2024-Jun, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.101948
PMID:38582059
|
研究论文 | 这篇文章揭示了食道鳞状细胞癌的分子亚型和预后生物标志物。 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了食道鳞状细胞癌的分子异质性和新的预后生物标志物。 | 该研究可能未涵盖所有可能的分子亚型和标志物，需进一步实验验证。 | 本研究旨在识别食道鳞状细胞癌中与DNA复制压力相关的生物标志物，以改善预后风险分层。 | 研究对象为食道鳞状细胞癌（ESCC）样本。 | 数字病理学 | 食道癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | ESCC样本（具体样本数未提供） |
| 12975 | 2024-08-07 |
Optimizing cryopreservation of nasal polyp tissue for cellular functional studies and single-cell RNA sequencing
2024-May, International forum of allergy & rhinology
IF:7.2Q1
DOI:10.1002/alr.23275
PMID:37742089
|
研究论文 | 研究优化鼻息肉组织冷冻保存方法，以进行细胞功能研究和单细胞RNA测序 | 探讨了不同冷冻保存方法对鼻息肉组织中肥大细胞数量和上皮细胞增殖率的影响 | NA | 优化鼻息肉组织的冷冻保存方法，以适应不同的研究目标和细胞类型 | 鼻息肉组织中的肥大细胞和上皮细胞 | NA | 鼻息肉 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 12976 | 2024-08-07 |
Transcriptomic and Proteomic Characterization of the Immune Response to Elective Spinal Reconstructive Surgery: Impact of Aging and Comparison with Traumatic Injury Response
2024-May-01, Journal of the American College of Surgeons
IF:3.8Q1
DOI:10.1097/XCS.0000000000000922
PMID:38095316
|
研究论文 | 研究了选择性脊柱重建手术对不同年龄组患者的免疫反应的影响，并与创伤患者的反应进行了比较 | 首次详细比较了选择性脊柱重建手术与创伤在免疫反应上的差异，并探讨了年龄因素的影响 | 样本量较小，可能影响研究结果的普遍性 | 探讨选择性脊柱重建手术与创伤在免疫反应上的差异，并评估年龄对这些反应的影响 | 选择性脊柱重建手术患者和创伤患者 | NA | NA | 单细胞RNA测序，双平台蛋白质组分析 | NA | 血液样本 | 老年组5例，年轻组6例，创伤患者8例 |
| 12977 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals an Immune Landscape of CD4+ T Cells in Coronary Culprit Plaques With Acute Coronary Syndrome in Humans-Brief Report
2024-May, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.320409
PMID:38572648
|
简报 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了急性冠状动脉综合征患者冠状动脉罪犯斑块中CD4+ T细胞的免疫景观 | 首次在单细胞水平上揭示了急性冠状动脉综合征患者中CD4+ T细胞的特征 | 样本量较小，仅包括4例慢性冠状动脉综合征和3例急性冠状动脉综合征患者 | 旨在通过单细胞RNA测序技术，分析T细胞在单细胞水平的特征，评估T细胞的克隆扩增，并寻找预防急性冠状动脉综合征的治疗靶点 | 急性冠状动脉综合征患者的冠状动脉罪犯斑块中的CD4+ T细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 4例慢性冠状动脉综合征和3例急性冠状动脉综合征患者的罪犯斑块样本 |
| 12978 | 2024-08-07 |
Identification of CNKSR1 as a biomarker for "cold" tumor microenvironment in lung adenocarcinoma: An integrative analysis based on a novel workflow
2024-Apr-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e29126
PMID:38628722
|
研究论文 | 本研究通过综合分析，将CNKSR1鉴定为免疫冷型肺腺癌的新型潜在生物标志物，并探讨了其在调节T细胞浸润中的作用。 | 本研究开发了一种新的策略来识别针对免疫冷肿瘤的抗PD1/PD-L1免疫治疗局限性的有希望的生物标志物，并首次将CNKSR1鉴定为免疫冷型肺腺癌的生物标志物。 | NA | 旨在识别对PD1/PD-L1免疫治疗无反应的肺腺癌患者的新型生物标志物，以扩大治疗选择。 | 肺腺癌（LUAD）患者的RNA-seq数据和临床样本。 | 数字病理学 | 肺腺癌 | RNA-seq | 机器学习方法 | RNA-seq数据 | 使用了来自TCGA数据库的肺腺癌RNA-seq数据，并在三个独立的bulk数据集和一个scRNA-seq数据集中进行了验证。 |
| 12979 | 2024-08-04 |
scMoresDB: A comprehensive database of single-cell multi-omics data for human respiratory system
2024-Apr-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109567
PMID:38617561
|
研究论文 | 本研究介绍了一个针对人类呼吸系统的单细胞多组学数据库平台 scMoresDB | scMoresDB 提供了一个用户友好的界面，具有跨组学搜索能力和交互式可视化工具 | NA | 创建一个方便的数据共享和综合分析的平台，专注于人类呼吸系统的单细胞多组学数据 | 人类呼吸系统相关的单细胞多组学数据 | 数字病理学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞测序 | NA | 多组学数据 | NA |
| 12980 | 2024-08-04 |
[Dynamic trajectory and cell communication of different cell clusters in malignant progression of glioblastoma]
2024-Apr-18, Beijing da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Peking University. Health sciences
PMID:38595234
|
研究论文 | 本研究深入探讨了胶质母细胞瘤恶性进展过程中的细胞亚群以及免疫细胞亚群之间的通信网络 | 该研究结合单细胞测序和临床信息，提供了对胶质母细胞瘤动态演变及潜在生物标志物的新见解 | 本研究未提及样本的地区或具体实验方法的局限性 | 探讨胶质母细胞瘤恶性进展中的细胞动态和识别关键风险生物标志物 | 胶质母细胞瘤患者的细胞亚群及免疫细胞亚群 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞测序 | NA | 细胞数据 | 27,151个细胞，包括低级别胶质瘤患者的3,881个细胞、新诊断胶质母细胞瘤患者的10,166个细胞以及复发胶质瘤患者的13,104个细胞 |