单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27438 篇文献，本页显示第 12401 - 12420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12401 | 2024-08-04 |
Molecular mechanisms underlying the therapeutic effects of Linggui Zhugan decoction in stroke: Insights from network pharmacology and single-cell transcriptomics analysis
2024-Mar-29, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000037482
PMID:38552092
|
研究论文 | 本研究探讨了灵桂治肝汤在中风治疗中的作用机制 | 首次结合网络药理学和单细胞转录组分析揭示灵桂治肝汤的关键成分、靶点和通路 | 尚未完全阐明其疗效的具体分子机制 | 研究灵桂治肝汤在中风治疗中的分子机制 | 主要研究灵桂治肝汤的活性成分及其靶点 | 数字病理学 | 中风 | 网络药理学和单细胞转录组分析 | NA | 基因组数据 | 144个潜在靶点与2035个中风相关基因的交集分析 |
| 12402 | 2024-08-04 |
Mechanistic insights into FEN1-mediated drug sensitivity and risk signature in colon cancer: An integrative bioinformatics study
2024-Mar-29, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000037517
PMID:38552056
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研究论文 | 本研究探讨了FEN1在结肠癌中的表达及其与临床病理和预后的关系 | 提出了一个由FEN1导出的多基因预后风险标志，并揭示了FEN1表达水平与结肠癌转移潜力及药物敏感性之间的相互作用 | FEN1表达与预后的明显相关性未能得到确认 | 深入探讨FEN1在结肠癌中的作用，尤其是在药物敏感性和预后方面 | 结肠癌患者的FEN1表达及其与转移的关系 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞测序，基因集富集分析，Cox回归分析 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自The Cancer Genome Atlas和Gene Expression Omnibus的多个数据集 |
| 12403 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics reveals comprehensive microenvironment and highlights the dysfuntional state of NK cells in endometrioid carcinoma
2024-Mar-29, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000037555
PMID:38552055
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析了子宫内膜样癌（EEC）中的肿瘤微环境，重点是自然杀伤（NK）细胞的功能异常状态 | 发现了一种CD56dim_DNAJB1 NK细胞亚群，其具有低细胞毒性和高压力水平，显示出NK细胞在肿瘤微环境中的功能失调 | NA | 更好地理解EEC中的肿瘤微环境的多样性 | 21个样本，包括16个EEC肿瘤组织和5个相邻正常组织，特别关注肿瘤浸润的NK细胞 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 样本 | 21个样本（16个EEC肿瘤组织和5个相邻正常组织） |
| 12404 | 2024-08-05 |
PD-1 Mediated Regulation of Unique Activated CD8 + T Cells by NK Cells in the Submandibular Gland
2023-Sep-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.15.557930
PMID:37745414
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研究论文 | 本文研究了NK细胞如何通过PD-1/PD-L1轴在下颌下腺调控CD8 T细胞的稳态 | 发现PD-1缺乏小鼠的下颌下腺中存在独特的CD8 T细胞群，以及NK细胞在该部位的免疫调节作用 | 研究主要集中在小鼠模型上，缺乏在人体中的验证 | 探讨NK细胞在下颌下腺对CD8 T细胞稳态的调控作用 | PD-1缺乏小鼠及NK细胞缺乏的小鼠模型 | 数字病理学 | 干燥综合症 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 涉及PD-1缺乏和NK细胞缺乏的小鼠样本 |
| 12405 | 2024-08-05 |
Mapping disease regulatory circuits at cell-type resolution from single-cell multiomics data
2023-Jul, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-023-00476-5
PMID:37974651
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研究论文 | 本文介绍了一种新方法MAGICAL，用于从单细胞多组学数据中映射疾病相关的调控电路 | MAGICAL是一种分层贝叶斯方法，可以同时建模不同条件下的细胞信号变异，实现高准确度的电路推断 | 尽管差异表达分析未能显示预测价值，但MAGICAL仍需验证在不同疾病状态下的普适性 | 研究细胞类型分辨率下与疾病状态相关的基因表达变化 | 通过分析外周血单核细胞数据来研究脓毒症 | 数字病理 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序和单细胞转座酶可及染色质测序 | 层次贝叶斯模型 | 单细胞数据 | 生成的样本包括感染和未感染对照的外周血单核细胞数据 |
| 12406 | 2024-08-04 |
Delivery of mitochondria confers cardioprotection through mitochondria replenishment and metabolic compliance
2023-05-03, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2023.02.016
PMID:36805084
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研究论文 | 本研究探讨了线粒体移植在心力衰竭中的保护作用及其机制 | 研究揭示了线粒体移植通过恢复心脏功能和代谢适应性来保护心脏 | 未明确讨论线粒体移植的长期效果及其临床应用的挑战 | 旨在研究线粒体移植在心力衰竭中的效果及机制 | 研究对象为两种不同模型的心力衰竭，包括多柔比星诱导的心力衰竭模型和人诱导的多能干细胞衍生的心肌细胞模型 | 机器学习 | 心血管疾病 | 线粒体移植、单细胞RNA测序 | 人诱导的多能干细胞衍生心肌细胞模型 | RNA序列 | NA |
| 12407 | 2024-08-05 |
Tissue nanotransfection causes tumor regression by its effect on nanovesicle cargo that alters microenvironmental macrophage state
2023-05-03, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2022.11.003
PMID:36380587
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研究论文 | 本研究首次报告了肿瘤来源的细胞外囊泡的纳米尺度荧光可视化，揭示了其对小鼠肿瘤相关巨噬细胞状态的影响 | 揭示了肿瘤源性囊泡携带的miR-126对肿瘤相关巨噬细胞状态改变的肿瘤发生机制 | 未提及具体的临床研究数据或在人类模型中的应用 | 研究肿瘤来源的细胞外囊泡如何影响肿瘤相关巨噬细胞并导致肿瘤退缩 | 主要研究对象是肿瘤相关巨噬细胞和肿瘤来源的细胞外囊泡 | 数字病理学 | 肿瘤 | 纳米转染技术 | 小鼠肿瘤模型 | 分子和基因表达数据 | 涉及的样本数量未具体列出 |
| 12408 | 2024-08-05 |
Determination of the nanoparticle- and cell-specific toxicological mechanisms in 3D liver spheroids using scRNAseq analysis
2022-Dec, Nano today
IF:13.2Q1
DOI:10.1016/j.nantod.2022.101652
PMID:36911538
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研究论文 | 本研究探讨了纳米颗粒在3D肝脏类球体中对肝细胞的毒理学机制 | 使用单细胞RNA测序(scRNAseq)分析不同纳米材料对肝细胞和库普弗细胞的特异性毒性反应 | 未提及具体的局限性 | 研究纳米颗粒对肝细胞的影响及其毒理学机制 | 3D肝脏类球体中的肝细胞和库普弗细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | NA | 基因表达数据 | 三种不同材料成分的体外3D肝脏类球体模型 |
| 12409 | 2024-08-05 |
Pooled CRISPR-activation screening coupled with single-cell RNA-seq in mouse embryonic stem cells
2021-06-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100426
PMID:33899013
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研究论文 | 本文提出了一种在小鼠胚胎干细胞中进行归并CRISPR激活筛选和单细胞RNA测序的协议 | 创新性地将归并CRISPR/Cas9筛选与单细胞RNA测序结合，实现了在细胞水平上无偏见地评估基因功能和调控 | 本文未提及具体的限制因素 | 研究目的在于识别生物过程中关键调控因子 | 研究对象为小鼠胚胎干细胞 | 数字病理学 | NA | CRISPR/Cas9，单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 12410 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing of mouse islets exposed to proinflammatory cytokines
2021-06, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202000949
PMID:33883217
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研究论文 | 这篇文章探讨了小鼠胰岛在炎性细胞因子影响下的单细胞RNA测序结果 | 首次揭示了不同类型的胰岛内分泌细胞对炎性细胞因子的响应及其基因表达变化的异质性 | 主要只研究了IL-1β和IFN-γ的影响，未考虑其他可能的细胞因子 | 理解炎性细胞因子如何影响胰岛细胞的基因表达 | 小鼠胰岛的内分泌细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠胰岛样本，具体样本数未提供 |
| 12411 | 2024-08-05 |
XIAP Knockdown in Alcohol-Associated Liver Disease Models Exhibits Divergent in vitro and in vivo Phenotypes Owing to a Potential Zonal Inhibitory Role of SMAC
2021, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2021.664222
PMID:34025452
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研究论文 | 研究了XIAP在酒精相关肝病模型中的功能及其相应表型差异 | 提出了SMAC在不同区域的抑制作用可能解释了XIAP缺失小鼠未出现疾病加重表型的机制 | 缺乏对XIAP缺失导致炎症反应机制的全面理解 | 探讨XIAP在酒精相关肝病发生中的作用 | 小鼠模型中XIAP基因缺失对肝脏细胞的影响 | 数字病理学 | 肝病 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 使用了多种小鼠模型 |
| 12412 | 2024-08-04 |
Exhaled volatolomics profiling facilitates personalized screening for gastric cancer
2024-May-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216881
PMID:38614384
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研究论文 | 本研究建立了一种非侵入性方法，通过呼气挥发物组学和集成学习来检测胃癌 | 该研究开发了一种基于质谱的程序，筛选出用于区分胃癌与对照组的 biomarkers 面板，并表现出高准确性 | 未提及具体的局限性 | 旨在开发一种有效的非侵入性筛查工具用于胃癌的早期检测 | 研究对象为314个呼吸样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 质谱 | 集成学习 | 呼吸样本 | 314个呼吸样本 |
| 12413 | 2024-08-04 |
BMP signaling maintains auricular chondrocyte identity and prevents microtia development by inhibiting protein kinase A
2024-May-01, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.91883
PMID:38690987
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研究论文 | 本文研究BMP信号在维持耳廓软骨细胞身份及防止微小耳畸形发展中的作用 | 发现BMP-Smad1/5/9信号激活与耳廓软骨细胞再生活性降低相关，提供了微小耳发病机理的新见解 | 目前对于微小耳发病机制的理解仍不完全，研究可能未能涵盖所有相关基因和路径 | 探讨BMP信号如何维持耳廓软骨细胞身份以及防止微小耳的发病 | 研究对象为成人小鼠耳廓软骨细胞以及人类微小耳样本 | 数字病理学 | 微小耳畸形 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 成人小鼠耳廓软骨细胞和人类微小耳样本 |
| 12414 | 2024-08-05 |
Acute Lymphoblastic Leukemia with Myeloid Mutations Is a High-Risk Disease Associated with Clonal Hematopoiesis
2024-May-01, Blood cancer discovery
IF:11.5Q1
DOI:10.1158/2643-3230.BCD-23-0106
PMID:38150184
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研究论文 | 本研究探讨了急性淋巴细胞白血病（ALL）中与骨髓突变相关的克隆性造血的影响 | 该研究首次揭示了急性淋巴细胞白血病中骨髓突变的存在及其对预后的影响 | 本研究的样本量可能不足以全面反映该疾病的所有临床特征 | 研究急性淋巴细胞白血病中骨髓突变的作用及其病理机制 | 成年人急性淋巴细胞白血病患者 | 数字病理学 | 急性淋巴细胞白血病 | 单细胞蛋白基因组分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 研究涉及的成年ALL案例中，包括TP53突变和骨髓克隆突变的患者 |
| 12415 | 2024-08-05 |
Characterization of macrophages in head and neck squamous cell carcinoma and development of MRG-based risk signature
2024-04-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-60516-6
PMID:38688945
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研究论文 | 本研究探讨了头颈部鳞状细胞癌中的巨噬细胞特征，并开发了基于MRG的风险标志。 | 首次识别了8个具有预后潜力的巨噬细胞相关基因，并构建了预测模型，探讨了它们在HNSCC中的作用。 | 研究可能未考虑到所有可能影响HNSCC预后的因素，样本量和分类可能存在局限性。 | 研究巨噬细胞在头颈部鳞状细胞癌中的作用及其与疾病预后的关系。 | 头颈部鳞状细胞癌的患者样本及其巨噬细胞特征。 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | scRNA-seq，bulk RNA-seq | Cox回归模型 | 临床数据，基因表达数据 | 包含特定的HNSCC患者数据，样本量在文中未具体说明 |
| 12416 | 2024-08-05 |
Functional specialization of hippocampal somatostatin-expressing interneurons
2024-Apr-23, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2306382121
PMID:38640347
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研究论文 | 该文章探讨了海马体中表达生长抑素的GABA能抑制神经元的功能特化。 | 该研究为功能性不同的海马CA1抑制神经元亚群提供了一种新的识别和访问方法，揭示了它们在功能上的多样性。 | 该研究未完全解决神经元的具体功能与其转录组特征之间的联系。 | 研究海马抑制神经元的亚群特征及其功能特化。 | 研究对象为海马CA1区的抑制神经元亚群。 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组分析 | 小鼠模型 | 转录组数据 | 四种小鼠模型 |
| 12417 | 2024-08-04 |
Spatiotemporal transcriptomic changes of human ovarian aging and the regulatory role of FOXP1
2024-Apr, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-024-00607-1
PMID:38594460
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研究论文 | 该研究系统性地表征人类卵巢衰老过程中的时空转录组变化 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学的方法，首次揭示了八种卵巢细胞在衰老过程中的时空分子特征 | 本文对衰老机制的理解仍有限，可能需要更多的实验进行验证 | 旨在全面理解人类卵巢衰老过程中的时空转录组变化 | 研究对象为人类卵巢细胞的岁月变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 12418 | 2024-08-05 |
BAP1 is required prenatally for differentiation and maintenance of postnatal murine enteric nervous system
2024-Mar-12, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI177771
PMID:38690732
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研究论文 | 本文发现BAP1在胎儿期对小鼠肠道神经系统的分化和维持至关重要 | 首次阐明BAP1缺失对肠道神经元分化和早期存活的影响 | 未能探讨其他可能的表观遗传调节因子对ENS发育的影响 | 研究BAP1在胎儿期对肠道神经系统发展的重要性 | Tyr-Cre Bap1fl/fl小鼠的肠道神经系统 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | RNA序列数据 | Tyrosinase-Cre Bap1fl/fl小鼠的肠道神经元样本 |
| 12419 | 2024-08-05 |
Predicting mitophagy-related genes and unveiling liver endothelial cell heterogeneity in hepatic ischemia-reperfusion injury
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1370647
PMID:38694511
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研究论文 | 本研究探讨了线粒体自噬相关基因在肝脏缺血再灌注损伤中的作用 | 该研究识别了8个关键基因并建立了基于这些基因的诊断模型，揭示了内皮细胞的异质性 | 研究仅基于有限的样本和单细胞数据分析，可能需要更广泛的验证 | 探究线粒体自噬相关基因在肝脏缺血再灌注损伤中的重要性 | 研究对象包括44个肝脏缺血再灌注损伤样本及44个正常对照样本 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序 | 逻辑回归模型 | 基因表达数据 | 44个肝脏缺血再灌注损伤样本和44个正常对照样本 |
| 12420 | 2024-08-05 |
The bone marrow of mouse-rat chimeras contains progenitors of multiple pulmonary cell lineages
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1394098
PMID:38694819
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研究论文 | 本研究使用小鼠-大鼠嵌合体以增强骨髓中的呼吸道前体细胞，以研究其在放射性肺损伤后的贡献 | 使用小鼠-大鼠嵌合体创造了一个独特的骨髓细胞移植模型，能够提供多种呼吸道细胞类型的前体 | 研究主要集中在小鼠模型中，尚未在临床转化中验证其有效性 | 探讨小鼠-大鼠嵌合体中骨髓细胞对放射性肺损伤的修复作用 | 小鼠-大鼠嵌合体的骨髓细胞及其对放射性肺损伤小鼠的贡献 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 造模用小鼠-大鼠嵌合体的骨髓细胞和致死性放射照射小鼠 |