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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-04-02 |
Single-Cell RNA-Sequencing Analysis Provides Insights into IgA Nephropathy
2025-01-29, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15020191
PMID:40001494
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在IgA肾病研究中的应用进展 | 利用scRNA-seq技术揭示了IgA肾病中免疫特征的全景,包括外周血B细胞和Th细胞活化、细胞毒性T细胞耗竭、肾脏浸润细胞亚型,以及系膜细胞和内皮细胞在肾损伤早期的关键作用 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在IgA肾病研究中的进展,以理解其复杂分子机制并开发生物标志物和特异性治疗策略 | IgA肾病(IgAN) | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 102 | 2026-04-02 |
Integrated single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq analysis to investigate key adipogenesis genes in adipose-derived stem cells
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0335152
PMID:41325391
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA-seq和bulk RNA-seq数据,探索了脂肪来源干细胞(ADSCs)在脂肪生成过程中的关键基因及其阶段特异性调控网络 | 整合了bulk和单细胞RNA-seq数据,识别了脂肪生成早期和晚期的阶段特异性调控基因,并构建了包含mRNA、miRNA和lncRNA的ceRNA调控网络 | 研究主要基于转录组数据,未涉及蛋白质水平或功能验证,且样本来源和数量可能有限 | 探究ADSCs脂肪生成过程中的关键调控基因和阶段特异性转录调控网络 | 脂肪来源干细胞(ADSCs) | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, qPCR | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 103 | 2026-04-02 |
Single-cell multi-omics map of human fetal blood in Down syndrome
2024-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07946-4
PMID:39322663
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学、染色质可及性和空间转录组学数据,构建了人类唐氏综合征胎儿血液的高分辨率多组学图谱 | 首次结合单细胞多组学与空间转录组学,揭示了唐氏综合征中造血干细胞被“启动”分化的分子机制,并发现了非编码元件与基因调控网络的重构 | 样本量相对较小(仅18个胎儿),且仅关注胎儿期,未涉及出生后或成人阶段的造血异常 | 理解唐氏综合征中失调的造血过程及其分子基础 | 人类胎儿肝脏和骨髓样本,包括3个二倍体和15个三倍体(唐氏综合征)胎儿 | 数字病理学 | 唐氏综合征 | 单细胞转录组学,染色质可及性分析,空间转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq数据,ATAC-seq数据,空间转录组数据 | 18个胎儿样本(3个二倍体,15个三倍体),超过110万个细胞 | 10x Genomics | 单细胞多组学,空间转录组学 | 10x Chromium,10x Visium | 10x Chromium Single Cell Multiome ATAC + Gene Expression,10x Visium空间转录组技术 |
| 104 | 2026-04-02 |
Cholinergic Neuronal Activity Promotes Diffuse Midline Glioma Growth through Muscarinic Signaling
2024-Sep-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.21.614235
PMID:39386427
|
研究论文 | 本研究揭示了胆碱能神经元活动通过毒蕈碱信号通路促进弥漫性中线胶质瘤生长的机制 | 首次发现中脑胆碱能神经元的长程投射通过M1和M3毒蕈碱受体促进DMG生长,并揭示了其与健康少突胶质前体细胞增殖的平行效应 | 研究主要基于小鼠模型和体外共培养,人类患者样本验证有限,且胆碱能神经元亚群的具体作用机制仍需进一步探索 | 探究胆碱能神经元活动对弥漫性中线胶质瘤生长的影响及其分子机制 | 弥漫性中线胶质瘤细胞、健康少突胶质前体细胞、胆碱能神经元 | 神经科学 | 弥漫性中线胶质瘤 | 光遗传学刺激、单细胞RNA测序、体外共培养、药理学阻断 | 小鼠模型、hiPSC衍生神经元模型 | 基因表达数据、细胞增殖数据 | 原发性患者DMG样本、DMG荷瘤小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 105 | 2026-04-02 |
Spatial transcriptomics of fetal membrane-Decidual interface reveals unique contributions by cell types in term and preterm births
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0309063
PMID:39159152
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析了胎儿膜-蜕膜界面在足月和早产中的细胞类型特异性贡献 | 首次在空间水平上揭示胎儿膜各层(羊膜上皮、羊膜间质、绒毛膜和蜕膜)在足月与早产中的差异基因表达模式 | 样本量较小(13例患者),且未涉及更广泛的妊娠并发症或种族多样性 | 探究胎儿膜-蜕膜界面在足月分娩和早产中的分子机制 | 人类胎儿膜组织(包括羊膜上皮、羊膜间质、绒毛膜和母体蜕膜) | 空间转录组学 | 早产 | 单细胞转录组学 | 分层聚类分析 | 转录组数据 | 13例患者(包括足月未临产、足月临产、早产和早产胎膜早破) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 106 | 2026-04-02 |
Reprogramming the tumor microenvironment leverages CD8+ T cell responses to a shared tumor/self antigen in ovarian cancer
2023-Mar-16, Molecular therapy oncolytics
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.omto.2023.02.002
PMID:36875325
|
研究论文 | 本研究探讨了使用CXCR4拮抗剂武装的溶瘤病毒疗法,通过重编程肿瘤微环境来增强对卵巢癌共享肿瘤/自身抗原的CD8+ T细胞反应 | 揭示了在耐受性肿瘤微环境中,靶向免疫抑制性癌症相关成纤维细胞与巨噬细胞之间的相互作用,可以诱导肿瘤/自身特异性CD8 T细胞反应,从而提高治疗效果 | 研究基于小鼠模型,结果在人类患者中的转化应用仍需进一步验证 | 研究CXCR4拮抗剂武装的溶瘤病毒疗法对肿瘤进展和抗肿瘤免疫的影响,特别是在耐受性肿瘤微环境中 | SV40 T抗原卵巢癌模型小鼠(包括抗原初始野生型小鼠和表达SV40 T抗原作为自身抗原的Tg转基因小鼠) | 肿瘤免疫学 | 卵巢癌 | 免疫染色,单细胞RNA测序 | NA | 图像,转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 107 | 2026-04-02 |
Senescent cancer cell vaccines induce cytotoxic T cell responses targeting primary tumors and disseminated tumor cells
2023-02, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2022-005862
PMID:36792123
|
研究论文 | 本文研究了衰老癌细胞疫苗通过诱导细胞毒性T细胞反应来靶向原发性肿瘤和播散性肿瘤细胞 | 利用辐射和veliparib处理诱导癌细胞衰老,将其作为疫苗或激活树突状细胞,以增强抗肿瘤免疫反应,特别是针对播散性肿瘤细胞 | 将肿瘤细胞重新注射到患者体内可能不切实际,但研究通过体外激活的树突状细胞解决了这一问题 | 开发基于衰老癌细胞的治疗性疫苗,以改善基因毒性和免疫疗法,并限制肿瘤复发或转移 | 小鼠CT26结肠癌细胞和4T1乳腺癌细胞 | 免疫学 | 癌症 | scRNA-seq, 流式细胞术, T细胞增殖实验 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 108 | 2026-04-02 |
Tumor-on-a-chip platform to interrogate the role of macrophages in tumor progression
2020-09-30, Integrative biology : quantitative biosciences from nano to macro
IF:1.5Q4
DOI:10.1093/intbio/zyaa017
PMID:32930334
|
研究论文 | 本研究利用微生理“肿瘤芯片”平台,探究了特定巨噬细胞亚群对肿瘤行为的影响 | 开发了一种新型的3D体外模型,能够高时空分辨率地捕捉细胞间动态,并首次在TOC设备中展示了M1和M2巨噬细胞对肿瘤生长、血管生成和迁移的不同作用机制 | 研究依赖于体外模型,可能无法完全模拟体内肿瘤微环境的复杂性,且样本类型和数量有限 | 探究肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)在肿瘤微环境中的作用机制 | 人类胰腺癌和结直肠癌细胞,以及M1和M2极化巨噬细胞 | 数字病理 | 胰腺癌,结直肠癌 | 单细胞RNA测序,蛋白质分析,抗体中和研究 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 109 | 2026-04-01 |
Integrating tumor and immune cell transcriptomics to predict immune checkpoint inhibitor primary resistance in metastatic melanoma
2026-Dec-31, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2026.2650234
PMID:41913413
|
研究论文 | 本研究通过整合肿瘤和免疫细胞的转录组学数据,旨在预测转移性黑色素瘤患者对免疫检查点抑制剂的原发性耐药 | 提出一个由82个基因组成的转录组特征,结合单细胞RNA测序和流式细胞术分析,识别出与原发性耐药相关的关键免疫细胞亚群 | 样本量相对有限(组织样本46例,验证队列54例),且为回顾性研究 | 预测转移性黑色素瘤患者对免疫检查点抑制剂的原发性耐药 | 转移性皮肤黑色素瘤患者 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | 预测模型 | 转录组数据, 单细胞数据 | 组织样本:46例(发现队列)+54例(验证队列);液体活检:8例(scRNA-seq)+46例(流式细胞术) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 110 | 2026-04-01 |
Integrative bulk and single-cell transcriptome analyses reveal RNA modification-related biomarkers of spinal cord injury
2026-Jul-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-25-00080
PMID:41914077
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 111 | 2026-04-01 |
LAMC3 promotes the development of prostate cancer via modulating the cell cycle progression
2026-May-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116544
PMID:41864013
|
研究论文 | 本研究探讨了LAMC3通过调节细胞周期进程促进前列腺癌发展的分子机制 | 首次建立并验证了与衰老相关分泌表型相关的基因特征,并揭示了LAMC3通过PI3K/Akt通路调控细胞周期的新机制 | 研究主要基于体外和动物实验,临床样本验证有限,且未深入探讨LAMC3在其他癌症类型中的作用 | 阐明LAMC3在前列腺癌发病机制中的具体作用及其作为治疗靶点的潜力 | 前列腺癌患者血清样本、良性前列腺增生对照样本以及前列腺癌细胞系 | 数字病理学 | 前列腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, CCK-8, 集落形成, EdU检测 | NA | RNA-seq数据, 单细胞RNA-seq数据, 实验数据 | 多个批量RNA-seq数据集和两个单细胞RNA-seq队列,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 112 | 2026-04-01 |
Repurposing Azilsartan medoxomil attenuates periodontitis by targeting SERPINB9 to promote apoptosis of IL1B+ macrophages
2026-May-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116523
PMID:41864017
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组数据和机器学习算法,发现SERPINB9是调控牙周炎中促炎性IL1B+巨噬细胞存活的关键因子,并筛选出阿齐沙坦酯作为其潜在抑制剂,在实验性牙周炎模型中验证了其治疗潜力 | 首次将SERPINB9鉴定为牙周炎中IL1B+巨噬细胞存活的关键调控因子,并通过药物重定位筛选发现阿齐沙坦酯可作为其抑制剂,为牙周炎提供了新的生物标志物和治疗靶点 | 研究主要基于实验性动物模型和体外验证,临床转化效果仍需进一步人体试验证实 | 探索牙周炎中巨噬细胞存活的分子机制,并寻找新的治疗靶点和药物 | 牙周炎中的巨噬细胞,特别是IL1B+巨噬细胞亚群 | 生物信息学与计算生物学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序,机器学习算法,药物重定位筛选 | 五种机器学习算法(未具体说明) | 单细胞转录组数据 | 多个来自GEO数据库的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 113 | 2026-04-01 |
CD19 chimeric antigen receptor T-cell therapy for the treatment of a patient with refractory Burkitt lymphoma after kidney transplant
2026-May, Cytotherapy
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.jcyt.2026.102055
PMID:41762962
|
研究论文 | 本文报告了一例肾移植后难治性伯基特淋巴瘤患者在接受CD19 CAR T细胞治疗后使用环孢素A的可行性研究 | 首次在肾移植后淋巴增殖性疾病患者中,结合CD19 CAR T细胞疗法与环孢素A使用,并通过单细胞RNA测序分析其影响 | 仅为单病例报告,样本量小,需要更大规模研究验证 | 评估CD19 CAR T细胞疗法后使用环孢素A降低移植排斥风险的可行性 | 肾移植后难治性伯基特淋巴瘤患者 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 1例患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 114 | 2026-04-01 |
Cytotoxic T cell recognition of α-synuclein drives pathogenic immune responses in multiple system atrophy
2026-Apr-07, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2537271123
PMID:41911451
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学、流式细胞术和抗原特异性功能实验,揭示了多系统萎缩(MSA)患者外周和中枢T细胞对α-突触核蛋白的细胞毒性识别,驱动了致病性免疫反应 | 首次证明MSA患者的外周T细胞被激活并偏向细胞毒性和炎症表型,且CD4和CD8 T细胞以HLA I/II依赖方式识别α-突触核蛋白单体及原纤维,导致克隆扩增和细胞毒性特征获得 | 研究主要基于患者样本和死后脑组织,未涉及动物模型验证,且样本量相对有限,需进一步扩大以确认普遍性 | 探究多系统萎缩(MSA)中适应性免疫机制,特别是T细胞对α-突触核蛋白的识别及其在神经炎症和疾病进展中的作用 | 多系统萎缩(MSA)患者、帕金森病(PD)患者和健康对照者的外周和中枢T细胞 | 免疫学 | 多系统萎缩 | 单细胞转录组学、流式细胞术、抗原特异性功能实验 | NA | 转录组数据、流式细胞数据、功能实验数据 | MSA患者、PD患者和健康对照者队列,具体样本数未明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 115 | 2026-04-01 |
Dissociable perfusion chip (DPC): perfusable microfluidic chip for single-cell screening of anti-cancer drugs in live glioblastoma explants
2026-Mar-31, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d5lc01105a
PMID:41778300
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研究论文 | 本研究介绍了一种可拆卸灌注芯片,用于在活体胶质母细胞瘤组织切片中进行单细胞水平的抗癌药物筛选 | 开发了一种新型微流控芯片,通过机械夹层而非化学附着的方式固定组织切片,实现了正压灌注和非破坏性组织解离,从而允许对厚组织切片进行并行培养、药物扰动以及下游单细胞RNA测序 | 这是一项概念验证工作,未来需要用于多种药物的筛选,并在更多新鲜人源胶质母细胞瘤切片上进行进一步验证 | 开发一种能够直接在人源肿瘤组织中快速、高分辨率地识别细胞类型特异性药物反应的新方法 | 人源胶质母细胞瘤手术切除的新鲜组织切片 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,微流控技术 | NA | 单细胞RNA测序数据,荧光测定数据 | 来自人类患者和小鼠模型的胶质母细胞瘤组织切片 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 116 | 2026-04-01 |
[Preliminary study on the role of IL-1β+neutrophils in bone regulation of periodontitis mice]
2026-Mar-31, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
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研究论文 | 本研究探讨了IL-1β+中性粒细胞在小鼠牙周炎骨调节中的作用及机制 | 首次在牙周炎模型中结合单细胞转录组测序和体外共培养模型,揭示了IL-1β+中性粒细胞通过TLR4-NFκB信号通路抑制成骨分化的新机制 | 研究为初步探索,样本量较小(每组10只小鼠),且为动物模型研究,结论需在人体中进一步验证 | 探究IL-1β+中性粒细胞在牙周炎骨调节中的作用及分子机制 | 8周龄雄性C57BL/6J小鼠、小鼠胚胎成骨前体细胞(MC3T3-E1细胞) | NA | 牙周炎 | 单细胞转录组测序、流式细胞术、免疫荧光染色、免疫组化染色、Western blotting、碱性磷酸酶染色、茜素红染色、Micro-CT | NA | 基因表达数据、图像数据、蛋白质表达数据 | 20只8周龄雄性C57BL/6J小鼠(对照组10只,牙周炎组10只) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 117 | 2026-04-01 |
Human Papillomavirus (HPV) Infected Epithelial Cells and FBLN1+ Fibroreticular Cells Govern the Immunogenic Tumor Microenvironment in HPV-Associated Oropharyngeal Squamous Cell Carcinoma
2026-Mar-31, Clinical and experimental otorhinolaryngology
IF:2.9Q1
DOI:10.21053/ceo.2025-00282
PMID:41913707
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了HPV相关口咽鳞状细胞癌中FBLN1+纤维网状细胞在塑造免疫原性肿瘤微环境中的关键作用 | 首次在HPV相关口咽鳞状细胞癌中鉴定出FBLN1+纤维网状细胞亚群,并通过空间定位分析揭示了其与肿瘤细胞和免疫细胞的密切关联,阐明了其通过表达SLIT2分子促进免疫细胞招募的机制 | 样本量相对较小(10个样本),未进行功能验证实验,研究结果需要在更大队列中验证 | 探究HPV相关口咽鳞状细胞癌预后较好的肿瘤微环境机制 | 口咽鳞状细胞癌患者组织样本(包括HPV阳性和阴性)及正常扁桃体组织 | 数字病理学 | 口咽鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 10个样本(2个非HPV相关OPSCC, 5个HPV相关OPSCC, 3个正常扁桃体) | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 118 | 2026-04-01 |
Heterogeneity of bacterial host-pathogen interactions across biological scales
2026-Mar-31, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.01804-25
PMID:41914736
|
综述 | 本文综述了单细胞技术在揭示宿主-病原体相互作用异质性方面的进展,探讨了从单细胞到组织及整个生物体多个尺度上的感染结果变异性 | 整合单细胞分辨率技术(如显微镜、单细胞转录组学、蛋白质组学、双RNA-seq和空间方法)来解析宿主-病原体相互作用的异质性,并强调计算和数学模型在跨尺度整合这些事件中的作用 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据或具体样本分析,主要基于现有文献进行讨论 | 探讨宿主-病原体相互作用在多个生物尺度上的异质性及其对感染结果的影响 | 细菌病原体(如文中提及的未指定具体菌种)与宿主细胞之间的相互作用 | 自然语言处理 | NA | 显微镜、单细胞转录组学、蛋白质组学、双RNA-seq、空间方法 | 计算和数学模型 | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、单细胞多组学、空间转录组学 | NA | NA |
| 119 | 2026-04-01 |
scDenorm: a denormalisation tool for integrating single-cell transcriptomics data
2026-Mar-31, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag032
PMID:41915012
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为scDenorm的算法,用于将经过delta方法归一化的单细胞组学数据还原为原始计数,以解决数据整合中的偏差问题 | 开发了scDenorm算法,能够逆转归一化处理,恢复原始计数数据,从而减少批次效应和基因表达失真,提高数据整合的准确性 | NA | 解决单细胞转录组学数据整合中因不同归一化方法导致的偏差问题 | 单细胞组学数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 120 | 2026-04-01 |
Mass cytometry uncovers distinct blood myeloid phenotypes linked to clinical responses during gastric cancer chemoimmunotherapy
2026-Mar-31, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04263-1
PMID:41915048
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研究论文 | 本研究通过质谱流式细胞术和单细胞RNA测序,探索了胃癌患者在接受化疗免疫联合治疗期间循环免疫细胞的变化及其与临床反应的关联 | 首次利用高维质谱流式细胞术结合单细胞RNA测序,系统揭示了胃癌化疗免疫联合治疗期间血液髓系细胞表型的动态变化及其与治疗反应的关联 | 样本量较小(24例患者),且为回顾性研究,需要更大规模的前瞻性研究验证 | 探索胃癌患者接受帕博利珠单抗联合卡培他滨/奥沙利铂(XELOX)化疗免疫联合治疗期间循环免疫细胞的变化机制 | 转移性胃癌患者 | 数字病理学 | 胃癌 | 质谱流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 细胞表型数据, 基因表达数据 | 24例胃癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |