本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-04-02 |
Pharmacologic targeting of the dopamine D2 receptor impacts the efficacy of immune checkpoint blockade in melanoma
2026-Mar-27, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-014080
PMID:41895714
|
研究论文 | 本研究探讨了通过药物靶向多巴胺D2受体(D2R)来调节催乳素(PRL)水平,从而影响免疫检查点抑制剂(ICIs)在黑色素瘤治疗中的疗效 | 首次使用FDA批准的D2R激动剂(溴隐亭)和拮抗剂(甲氧氯普胺)来调节系统性PRL水平,并揭示D2R靶向治疗可能通过独立于PRL的机制增强抗肿瘤免疫,为克服ICI耐药性提供了新策略 | 研究主要基于小鼠模型(如B16F0和MEL11443),尚未在人类患者中进行验证,且机制探索虽涉及单细胞和bulk RNA测序,但具体信号通路仍需进一步阐明 | 评估药物靶向D2R对免疫检查点抑制剂在黑色素瘤治疗中疗效的影响,并探索其潜在机制 | 小鼠黑色素瘤模型(B16F0和MEL11443),以及相关的免疫细胞(如CD8+ T细胞和骨髓来源巨噬细胞) | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,流式细胞术,免疫组织化学 | NA | RNA测序数据,流式细胞数据,免疫组织化学图像 | 使用小鼠模型进行实验,具体样本数量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 42 | 2026-04-02 |
Circulating exhausted CD8+ effector memory cells differentiate immune checkpoint inhibitor-induced liver injury from other acute immune-mediated liver injuries
2026-Mar-27, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-014178
PMID:41895713
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析,鉴定了一种循环耗竭CD8+效应记忆T细胞亚群,可作为区分免疫检查点抑制剂诱导的肝损伤与其他急性免疫介导性肝损伤的潜在生物标志物 | 首次系统性地比较了免疫检查点抑制剂诱导的肝损伤与其他免疫介导性肝损伤的免疫特征差异,并鉴定出具有诊断潜力的特异性循环T细胞亚群 | 样本量相对有限,且为观察性研究,需要更大规模的前瞻性研究验证生物标志物的临床实用性 | 寻找能够区分免疫检查点抑制剂诱导的肝损伤与其他急性免疫介导性肝损伤的生物标志物 | 接受免疫治疗的癌症患者(包括发生和未发生肝损伤者)、健康对照者、药物性肝损伤患者、自身免疫性肝炎患者 | 免疫学 | 肝损伤 | 质谱流式细胞术、流式细胞术、单细胞RNA测序、bulk RNA测序、细胞因子分析、共聚焦显微镜 | NA | 单细胞转录组数据、bulk转录组数据、蛋白质表达数据、细胞图像数据 | 多个队列的患者样本,包括急性肝损伤期、治疗前及治疗后12周的样本,以及健康对照和疾病对照样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 43 | 2026-04-02 |
Endothelial cells recruit pro-inflammatory macrophage clusters via App-Cd74 exacerbating ICI-associated myocarditis
2026-Mar-27, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2026.111238
PMID:41905617
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析小鼠ICI相关心肌炎模型,发现内皮细胞通过App-Cd74轴招募促炎性巨噬细胞簇,揭示了ICI心肌炎的新免疫病理机制 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定出ICI心肌炎中由Cxcl9和Cxcl10共表达的巨噬细胞亚群,并发现内皮细胞通过App-Cd74信号轴驱动其聚集,为靶向治疗提供了新方向 | 研究基于小鼠模型,人类临床样本验证尚缺;单细胞测序技术可能受限于细胞捕获效率和基因检测灵敏度 | 探究免疫检查点抑制剂相关心肌炎的发病机制,寻找潜在治疗靶点 | 小鼠心脏组织中的免疫细胞,特别是巨噬细胞亚群和内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 深度学习框架scTenifoldXct | 单细胞转录组数据 | 小鼠ICI心肌炎模型的心脏组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 44 | 2026-04-02 |
Spatiotemporal multiomics reveal a default CD4 fate and a stem-like CD8 T cell subset in the thymus
2026-Mar-25, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.03.053
PMID:41895464
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学、蛋白质分析、染色质可及性和空间转录组学技术,构建了小鼠胸腺T细胞发育的多模态图谱,揭示了αβ和γδ谱系的早期分叉、CD4谱系的默认程序以及一个干细胞样CD8 T细胞亚群 | 首次结合单细胞多组学和空间转录组学技术,高分辨率地解析了胸腺T细胞发育的时空动态,明确了αβ和γδ谱系在DN1阶段的早期分叉,并发现CD4谱系是转录默认程序,而CD8谱系需要Runx3激活和I类MHC信号 | 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类;空间转录组学分辨率有限,可能无法完全捕捉细胞间相互作用的细节 | 构建胸腺T细胞发育的全面多模态图谱,以阐明早期谱系决定、中间状态和空间检查点的分子机制 | 小鼠胸腺中的胸腺细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞转录组学、CITE-seq、scATAC-seq、空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质表达数据、染色质可及性数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 45 | 2026-04-02 |
Immune gene MMP9 as a potential key mediator in TCDD exposure-associated atherosclerosis: An integrated study based on network toxicology and experimental validation
2026-Mar-25, Food and chemical toxicology : an international journal published for the British Industrial Biological Research Association
IF:3.9Q1
DOI:10.1016/j.fct.2026.116073
PMID:41895505
|
研究论文 | 本研究结合网络毒理学与实验验证,探索了环境污染物TCDD暴露与动脉粥样硬化之间的潜在分子机制,并识别出核心免疫基因MMP9作为关键介质 | 首次通过整合网络毒理学、机器学习筛选与分子模拟,系统性地识别并验证了MMP9作为TCDD暴露相关动脉粥样硬化的核心免疫介质,并揭示了其通过结合TCDD调控炎症反应和血管基质重塑的分子机制 | 研究主要基于生物信息学分析和体外细胞模型,缺乏体内动物实验或临床样本的直接验证;分子对接和动力学模拟的结果需要进一步的实验证实 | 探索环境污染物TCDD暴露与动脉粥样硬化发生发展的分子联系,识别关键免疫基因及其调控通路 | 动脉粥样硬化相关转录组数据集、TCDD暴露相关基因表达谱、人脐静脉内皮细胞(HUVEC) | 生物信息学 | 心血管疾病 | 网络毒理学、机器学习、单细胞RNA测序、RT-qPCR、Western blot、分子对接、分子动力学模拟 | 机器学习诊断模型(结合多种基础算法)、SHAP分析、WGCNA | 转录组数据、基因表达谱、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 46 | 2026-04-02 |
NT-I7, a long-acting interleukin-7, increases lymphocyte counts and induces CD8+ T cell clonotype expansion in patients with newly diagnosed high-grade gliomas
2026-Mar-25, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-2953
PMID:41880597
|
研究论文 | 本研究通过I期临床试验评估了长效白细胞介素-7(NT-I7)在新诊断高级别胶质瘤患者中的安全性、最大耐受剂量及其对淋巴细胞计数和免疫细胞的影响 | 首次在高级别胶质瘤患者中评估长效IL-7(NT-I7)的临床效果,并利用单细胞RNA测序技术揭示NT-I7诱导CD8+ T细胞克隆型选择性扩增的免疫机制 | 研究为I期临床试验,样本量有限,且主要关注安全性和剂量探索,长期疗效和生存获益需进一步验证 | 评估NT-I7在新诊断高级别胶质瘤患者中的安全性、最大耐受剂量及其对淋巴细胞和免疫系统的影响 | 新诊断的高级别胶质瘤患者 | 临床医学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据、单细胞RNA测序数据 | I期临床试验患者(具体数量未在摘要中明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 47 | 2026-04-02 |
Targeting SPP1 +TAMs associated with liver metastasis reverses immunosuppression and synergizes with immunotherapy in colorectal cancer
2026-Mar-25, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-014128
PMID:41881501
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序揭示了结直肠癌中SPP1+肿瘤相关巨噬细胞的空间和代谢异质性,并验证了靶向该亚群联合免疫疗法可逆转免疫抑制并抑制肿瘤生长与转移 | 首次在结直肠癌中系统描绘了SPP1+ TAMs在原发性肿瘤和转移灶(尤其是肝转移)中的空间分布、发育轨迹和代谢异质性,并发现其两个代谢亚型(糖酵解型ATP5F1E+和氧化磷酸化主导型MT-CO1+)具有组织特异性,且MT-CO1+亚型特异富集于肝转移灶的富氧侵袭边缘 | 研究主要基于观察性数据和临床前模型,其治疗策略在人体中的有效性和安全性仍需进一步临床试验验证 | 阐明结直肠癌中肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)在原发性肿瘤和转移微环境中的空间与代谢异质性,并探索靶向特定TAM亚群以增强免疫治疗效果的策略 | 结直肠癌患者的原发性肿瘤组织、癌旁正常组织、肝转移灶、淋巴结转移灶以及外周血样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,多重免疫组化,空间转录组学 | UMAP聚类,伪时间推断,RNA速率,CellChat | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,免疫组化图像数据 | 来自多中心队列的998,204个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 48 | 2026-04-02 |
Targeted inhibition of Nrf2 potentiates antitumor immunity and enhances the efficacy of immunotherapy in hepatocellular carcinoma
2026-Mar-24, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010841
PMID:41876134
|
研究论文 | 本研究揭示了靶向抑制Nrf2可增强肝细胞癌的抗肿瘤免疫,并通过下调PD-L1、上调MHC-I表达以及促进CD8+ T细胞浸润,提高PD-1抗体和CAR-T细胞疗法的疗效 | 首次将Nrf2确定为肿瘤免疫微环境的新调控因子,并证明其特异性抑制剂Brusatol可通过双重机制(下调PD-L1和上调MHC-I)克服肝细胞癌的免疫治疗耐药 | 研究主要基于小鼠同种异体移植肿瘤模型,尚未在人体临床试验中验证;单细胞RNA测序分析的样本规模和细节未明确说明 | 探究Nrf2抑制在肝细胞癌免疫治疗耐药中的作用机制,并评估其与现有免疫疗法(PD-1抗体和CAR-T)联合的治疗潜力 | 肝细胞癌(HCC)小鼠模型、肿瘤细胞、CD8+ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、生化检测 | NA | RNA测序数据、体内实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 49 | 2026-04-02 |
CXCR6+ T cells promote apoptosis and necroptosis in proximal tubules during AKI-to-CKD transition
2026-Mar-24, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08644-x
PMID:41876471
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞RNA测序等技术,揭示了在AKI向CKD转变过程中,CXCR6+ T细胞通过CXCL16-CXCR6轴促进近端小管细胞凋亡和坏死性凋亡的关键机制 | 首次确定了CXCR6+ T细胞是适应性不良修复过程中免疫驱动肾小管细胞死亡的关键介质,并提出了靶向CXCL16-CXCR6轴的治疗潜力 | 研究主要基于小鼠模型,其结论在人类中的适用性仍需进一步验证 | 探究在急性肾损伤向慢性肾病转变过程中,免疫细胞如何促进肾小管损伤和细胞死亡 | 小鼠肾脏近端小管细胞、CXCR6+ T细胞、巨噬细胞 | 单细胞组学 | 肾脏疾病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 蛋白质分析 | NA | RNA测序数据, 图像数据, 蛋白质数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 50 | 2026-04-02 |
Multiomic characterisation of the clinical efficacy of guselkumab induction therapy in ulcerative colitis
2026-Mar-23, BMJ open gastroenterology
IF:3.3Q2
DOI:10.1136/bmjgast-2025-002153
PMID:41871904
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法详细评估了古塞奇尤单抗诱导治疗在中重度活动性溃疡性结肠炎患者中的临床疗效及相关的细胞和分子变化 | 首次详细描述了通过拮抗IL-23p19亚基选择性抑制IL-23在炎症性肠病中产生临床疗效的分子变化,并整合了bulk RNA测序、单细胞RNA测序和流式细胞术等多种技术进行多组学分析 | 研究样本量相对有限(单细胞RNA测序n=52,流式细胞术n=30),且为短期诱导研究(12周),缺乏长期疗效数据 | 评估古塞奇尤单抗治疗溃疡性结肠炎的临床疗效及其分子机制 | 中重度活动性溃疡性结肠炎患者 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 血清蛋白质组学分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据, 临床数据 | 313名患者(随机分组),其中bulk RNA测序257例,单细胞RNA测序52例,流式细胞术30例,血清蛋白质组学302例 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 流式细胞术, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 51 | 2026-04-02 |
Dynamic changes of the immune microenvironment in ovarian cancer following neoadjuvant chemotherapy
2026-Mar-23, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-026-03070-6
PMID:41872134
|
研究论文 | 本研究通过分析已发表的单细胞RNA测序数据并结合体外和体内实验,揭示了卵巢癌新辅助化疗后前列腺素介导的免疫抑制微环境形成是化疗耐药的关键机制 | 首次系统揭示了前列腺素在卵巢癌新辅助化疗后免疫抑制微环境形成中的关键作用,并证明联合使用顺铂和前列腺素特异性抑制剂可恢复CD8T细胞功能 | 研究主要基于已发表的单细胞测序数据,样本量可能有限;体内外实验模型可能无法完全模拟人体肿瘤微环境的复杂性 | 探索卵巢癌新辅助化疗后肿瘤免疫微环境的动态变化及化疗耐药机制 | 高级别浆液性卵巢癌患者样本及相应的体外和体内实验模型 | 单细胞组学与肿瘤免疫学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 基于已发表数据,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 52 | 2026-04-02 |
TRIM21-Mediated ubiquitination of FBL suppresses PI3K/AKT signaling and tumor progression in clear cell renal cell carcinoma
2026-Mar-21, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-026-06113-4
PMID:41863623
|
研究论文 | 本研究揭示了TRIM21通过介导FBL的泛素化降解,抑制PI3K/AKT信号通路,从而调控透明细胞肾细胞癌的进展 | 首次发现TRIM21作为FBL的新型E3泛素连接酶,催化其K48连接的多聚泛素化,促进其蛋白酶体降解,并阐明该轴通过PI3K/AKT信号调控ccRCC进展 | NA | 探究FBL在透明细胞肾细胞癌中的致癌机制及其与TRIM21的相互作用 | 透明细胞肾细胞癌细胞和组织 | 生物信息学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序、转录组学、蛋白质组学、免疫沉淀-质谱、分子对接 | NA | RNA测序数据、蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 53 | 2026-04-02 |
Enhanced endocrine-metabolic support and axonemal assembly in high-sperm-motility geese: insights from testicular cellular heterogeneity by scRNA-seq
2026-Mar-21, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2026.106840
PMID:41916058
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术,揭示了高精子活力鹅睾丸细胞异质性,并探讨了内分泌代谢支持和轴丝组装在精子活力差异中的作用 | 首次在鹅中应用单细胞RNA测序技术,系统分析了高、低精子活力个体睾丸细胞的转录组差异,并关联了内分泌、抗氧化和代谢指标 | 样本量较小(每组仅3只鹅用于单细胞测序),且研究仅针对早期成熟公鹅,未涵盖其他年龄或品种 | 探究鹅精子活力差异的细胞和分子基础 | 高、低精子活力公鹅的睾丸组织 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 60只公鹅(高、低活力组各6只,其中每组3只用于单细胞测序) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 54 | 2026-04-02 |
Histone lactylation-driven feedback loop modulates pyrimidine metabolism to promote oral carcinogenesis
2026-Mar-19, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08580-w
PMID:41857010
|
研究论文 | 本研究揭示了组蛋白乳酸化,特别是H3K18la,通过激活胸苷激酶1(TK1)转录和嘧啶代谢,在口腔鳞状细胞癌(OSCC)发生中起关键作用,并发现了一个糖酵解/H3K18la/TK1/β-catenin正反馈环路 | 首次阐明了组蛋白乳酸化(H3K18la)在口腔癌变中的具体分子机制,发现了一个连接表观遗传修饰、代谢重编程和经典信号通路(Wnt/β-catenin)的新型正反馈环路 | 研究主要基于体外细胞实验和4NQO诱导的小鼠舌癌模型,其发现需要在更广泛的临床样本和体内模型中进一步验证 | 探究组蛋白乳酸化在口腔癌变(从口腔白斑到口腔鳞癌)过程中的作用及分子机制 | 口腔白斑(OLK)和口腔鳞状细胞癌(OSCC)组织、OSCC细胞系、4NQO诱导的小鼠舌癌模型 | 表观遗传学、肿瘤代谢 | 口腔鳞状细胞癌 | 免疫组织化学、CUT&Tag、scRNA-seq、ChIP-qPCR、糖酵解抑制、基因沉默 | NA | 组织切片图像、单细胞RNA测序数据、ChIP-qPCR数据 | 未在摘要中明确说明具体样本数量,涉及人体OLK和OSCC组织、细胞系及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 55 | 2026-04-02 |
Frequency-domain kernels enable atlas-scale detection of spatially variable genes
2026-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.12.711372
PMID:41890107
|
研究论文 | 本文提出了一种名为FLASHS的新方法,用于在空间转录组学中检测空间可变基因,该方法通过频域核实现高精度、良好校准和大规模计算 | FLASHS方法将空间测试移至频域,利用随机傅里叶特征和稀疏草图技术,无需构建距离矩阵即可在零膨胀数据上进行多尺度核测试,并通过峰度校正零假设保持校准 | NA | 开发一种准确、校准良好且可扩展的方法,用于识别空间转录组学中的空间可变基因 | 空间转录组学数据,包括艾伦大脑MERFISH图谱中的394万个细胞和人类心脏组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 频域核方法 | 空间转录组数据 | 50个数据集,覆盖9个平台,包括艾伦大脑MERFISH图谱中的394万个细胞 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 56 | 2026-04-02 |
COUP-TFII promotes macrophage-myofibroblast transition by attenuating HIF-1α-mediated glycolysis
2026-Mar-18, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153640
PMID:41916009
|
研究论文 | 本研究探讨了COUP-TFII在糖尿病肾病纤维化中通过抑制HIF-1α介导的糖酵解促进巨噬细胞-肌成纤维细胞转化的机制 | 揭示了COUP-TFII在糖尿病肾病纤维化中的新作用机制,即通过调控HIF-1α依赖的糖酵解途径促进巨噬细胞向肌成纤维细胞转化 | 研究主要基于体外细胞实验和动物模型,未涉及人类临床样本验证,且具体信号通路细节需进一步探索 | 探究COUP-TFII在糖尿病肾病纤维化进程中的调控机制 | 巨噬细胞、DB/DB糖尿病肾病小鼠模型 | NA | 糖尿病肾病 | Western blotting、单细胞测序、免疫荧光 | NA | 蛋白质表达数据、单细胞测序数据、GEO数据库数据 | 未明确样本数量,使用DB/DB糖尿病肾病小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 57 | 2026-04-02 |
Epigenetic context defines the transcriptional activity of canonical and noncanonical NF-κB signaling in pancreatic cancer
2026-Mar-17, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-026-03019-9
PMID:41844578
|
研究论文 | 本研究通过转录组、基因组和表观基因组分析,探讨了胰腺导管腺癌中RELA和RELB的差异激活与功能,揭示了TNFα和TWEAK在调控NF-κB信号通路中的独特作用 | 揭示了TNFα通过RELA激活经典NF-κB信号,而TWEAK通过RELB选择性激活非经典信号,并发现RELB与AP1基序的强关联及其在可及染色质区域的专一结合 | 未明确说明样本数量或实验设计的潜在限制,如细胞系或动物模型的代表性 | 阐明胰腺导管腺癌中经典和非经典NF-κB信号通路的激活机制及其转录调控作用 | 胰腺导管腺癌细胞和组织 | 表观遗传学 | 胰腺癌 | 转录组基因表达谱分析、全基因组占据图谱、表观基因组分析、单细胞RNA测序、多重免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据、染色质可及性数据、单细胞转录组数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 58 | 2026-04-02 |
Lysine attenuates acute lung injury by restoring α-tubulin acetylation and ciliary activity
2026-Mar-16, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-026-03025-x
PMID:41839843
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序分析和靶向血浆代谢组学,揭示了赖氨酸在急性肺损伤中通过恢复α-微管蛋白乙酰化和纤毛活性来促进肺上皮修复的作用机制 | 首次将赖氨酸代谢与α-微管蛋白乙酰化、纤毛信号传导及钙稳态联系起来,阐明了赖氨酸作为代谢-结构协调器在肺再生中的新功能 | 研究主要基于动物模型和非人灵长类模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 探究氨基酸代谢在急性肺损伤修复中的作用,特别是赖氨酸对肺上皮再生的调控机制 | 人类急性肺损伤样本、小鼠和非人灵长类急性肺损伤模型、肺上皮细胞(特别是SFTPC+肺泡上皮II型细胞) | 数字病理学 | 肺损伤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、靶向血浆代谢组学 | NA | 单细胞转录组数据、代谢组学数据 | 人类ALI样本、小鼠和非人灵长类模型,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 59 | 2026-04-02 |
High-Fidelity Long-term Whole-embryo Lineage and Fate Reconstruction by Iterative Tracking with Error Correction
2026-Mar-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.12.711203
PMID:41889864
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为ITEC的无监督方法,用于高保真地自动重建胚胎中每个细胞的完整谱系和命运图 | 提出ITEC方法,通过迭代追踪与错误校正实现无监督的细胞谱系重建,在斑马鱼胚胎数据中达到超过99.7%的准确率 | NA | 重建活体胚胎的完整细胞谱系和命运图,以探索发育生物学中的关键形态发生过程 | 斑马鱼、小鼠等胚胎的细胞 | 计算机视觉 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像 | 四个跨物种数据集,包括斑马鱼和小鼠胚胎,总计1850万个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 60 | 2026-04-02 |
UniST: A Unified Computational Framework for 3D Spatial Transcriptomics Reconstruction
2026-Mar-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.12.711362
PMID:41889901
|
研究论文 | 本文提出了一个名为UniST的统一生成式人工智能框架,用于从稀疏的连续切片中计算重建密集且连续的三维空间转录组学景观 | 提出了一个统一的生成式AI框架,整合了核点卷积与交叉注意力层、基于光流的插值以及图自编码器与隐式神经表示三个互补模块,以解决稀疏、异质的三维ST数据重建问题,而无需改变底层实验技术 | 未明确提及该计算框架在处理极低质量或高度降解组织样本时的性能,也未讨论其计算资源需求或在不同物种间的普适性限制 | 开发一个通用的计算解决方案,以经济高效且可扩展的方式重建三维空间转录组学景观,从而更真实地研究组织结构和疾病生物学 | 小鼠胚胎数据集和三维人类癌症组织 | 空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组学 | 生成式AI框架(整合核点卷积、交叉注意力层、光流插值、图自编码器、隐式神经表示) | 三维空间转录组学数据(点云、连续切片) | 未明确指定具体样本数量,涉及小鼠胚胎数据集和两种三维人类癌症组织 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |