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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-04-02 |
Identification of suicide brain transcriptomic signatures using meta-analysis of multiple cohorts
2026-Mar-31, Translational psychiatry
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41398-026-03978-8
PMID:41916959
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研究论文 | 本研究通过整合多个公开的死后脑转录组数据集和一个国内队列,进行了一项全面的荟萃分析,以识别自杀相关的脑转录组特征 | 首次通过整合16个队列的转录组数据进行大规模荟萃分析,识别出自杀相关的多个基因和长链非编码RNA,并揭示了小胶质细胞、星形胶质细胞、免疫反应和髓鞘调控等潜在分子通路 | 研究主要基于死后脑组织样本,可能受到死后变化、样本异质性和技术平台差异的影响,且识别出的基因仅达到名义显著性水平 | 识别自杀的脑转录组生物标志物,以促进有效的预防和治疗策略的开发 | 死后人脑组织样本 | 生物信息学 | 精神疾病 | RNA测序, 微阵列, 单细胞RNA测序 | 荟萃分析, 差异表达分析, 通路富集分析, 细胞集富集分析 | 转录组数据 | 16个队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 22 | 2026-04-02 |
Complement 5a receptor 2 attenuates diabetic kidney disease by promoting mitochondria-associated endoplasmic reticulum membrane formation mediated by PSS-MFN2 interaction
2026-Mar-31, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-026-00873-w
PMID:41916963
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研究论文 | 本研究揭示了补体5a受体2(C5aR2)通过促进PSS-MFN2相互作用介导的线粒体相关内质网膜形成,从而改善糖尿病肾病(DKD)的新机制 | 首次阐明了C5aR2在DKD中的非经典代谢调控作用,发现其通过c-FOS/PSS/MFN2信号轴促进MAM形成和磷脂酰丝氨酸生物合成,并证实C5aR2特异性激动剂P59的治疗潜力 | 研究主要在动物模型中进行,临床转化效果需进一步验证;单细胞测序分析样本量有限 | 探究C5aR2在糖尿病肾病代谢调控中的作用机制 | 糖尿病肾病患者组织样本、糖尿病小鼠模型(包括C5aR2缺陷小鼠和db/db小鼠)、近端肾小管细胞 | 单细胞组学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、组织病理数据 | 糖尿病肾病患者组织、多种基因修饰小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 23 | 2026-04-02 |
Pulmonary fibroblast activation during Aspergillus fumigatus infection enhances lung defense via immunomodulation and tissue remodeling
2026-Mar-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71027-5
PMID:41917025
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研究论文 | 本研究揭示了肺成纤维细胞在烟曲霉感染期间被激活,通过免疫调节和组织重塑增强肺部防御功能 | 首次在免疫正常和免疫抑制宿主中,利用细胞谱系追踪、靶向细胞消融和单细胞RNA测序技术,系统研究了肺成纤维细胞对烟曲霉感染的功能响应,并发现了一个具有获得性免疫调节特性和增强细胞外基质分泌能力的成纤维细胞亚群 | NA | 探究肺成纤维细胞在烟曲霉感染引起的肺部损伤中的功能响应及其在宿主防御中的作用 | 烟曲霉感染的小鼠模型中的肺成纤维细胞 | 数字病理学 | 肺部感染/侵袭性曲霉病 | 单细胞RNA测序,细胞谱系追踪,靶向细胞消融 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 24 | 2026-04-02 |
Generative cerebral vasculature visualization using spatial transcriptomic data
2026-Mar-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-46455-4
PMID:41917199
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研究论文 | 本文提出了一种基于空间转录组数据的生成式AI模型,用于预测大脑血管系统的空间组织结构 | 利用空间mRNA引导的生成模型Tera-MIND,通过Cldn5和Acta2基因的共表达模式及其学习到的注意力图,在细胞级别分辨率上预测大脑血管空间组织 | NA | 探索大脑血管系统的结构变异性和区域特异性功能,以解释疾病模型中的神经学改变 | 小鼠大脑血管系统 | 数字病理学 | 神经疾病 | 空间转录组学 | 生成式AI模型,基于patch和边界感知的扩散模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 25 | 2026-04-02 |
Perspectives from machine learning and multi-omics to decoding the effects of VDAC2 malignant subsets on tumor evolution
2026-Mar-31, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01394-1
PMID:41917254
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和机器学习方法,系统性地揭示了VDAC2在泛癌中的致癌作用及其通过VDAC2-BAK1-IFNγ通路影响肿瘤进展和免疫逃逸的机制 | 首次在泛癌层面系统性地整合了批量RNA测序、单细胞RNA测序和空间转录组学数据来研究VDAC2,并识别了VDAC2-BAK1-IFNγ这一在消化系统癌症中重要的新通路 | 体外实验验证主要集中于胃癌细胞,需要在更多癌症类型和体内模型中进行进一步验证 | 系统性地挖掘VDAC2在泛癌中的作用,探索其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | 泛癌数据集、胃癌细胞系 | 机器学习 | 泛癌(重点关注消化系统癌症) | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, RT-PCR, 细胞共培养, CCK-8检测, Transwell侵袭实验, ELISA | NA | 转录组数据, 细胞实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 26 | 2026-04-02 |
Spatial transcriptomics of urothelial carcinoma with basal/squamous differentiation identifies Galectin-7 as a specific marker of squamous lineage commitment
2026-Mar-31, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04927-z
PMID:41917522
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 27 | 2026-04-02 |
Compact and informative representation learning for scRNA-seq data clustering with masked information bottleneck
2026-Mar-31, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-026-02590-y
PMID:41917934
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研究论文 | 提出了一种名为scMIB的掩码信息瓶颈框架,用于从单细胞RNA测序数据中学习紧凑且信息丰富的表示,以提升细胞聚类的准确性和鲁棒性 | 结合了基于掩码的去噪策略与信息瓶颈目标,通过扰动基因表达模式并训练模型恢复信息结构,同时压缩冗余信号并保留对聚类最相关的信息,还引入了掩码一致性学习机制以捕获稳定的基因水平模式 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中高稀疏性、噪声和冗余性对细胞聚类准确性的挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 掩码信息瓶颈框架 | 基因表达数据 | 多个公共scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 28 | 2026-04-02 |
Translation of scRNA-Seq to a clinical blood test for infection diagnostics
2026-Mar-31, Expert review of molecular diagnostics
IF:3.9Q1
DOI:10.1080/14737159.2026.2647154
PMID:41918251
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DIRECT LS-TA的新型血液检测方法,用于感染诊断,通过单细胞类型特异性基因表达分析提高准确性 | 开发了无需细胞分选的单细胞类型(单核细胞)特异性基因表达定量方法,相比传统方法更经济且易于临床实施 | 方法主要针对单核细胞,可能不适用于其他细胞类型;且依赖于广泛可用的PCR设备,可能受限于特定实验室条件 | 开发一种临床可用的血液检测方法,用于早期和准确诊断发热性疾病 | 发热性疾病患者的外周血样本,特别是单核细胞的基因表达 | 数字病理学 | 感染性疾病 | 单细胞RNA测序,定量PCR,数字PCR | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 29 | 2026-04-02 |
Identification of biomarkers associated with endoplasmic reticulum stress-related cell death in osteoporosis based on bulk and single-cell transcriptomic analyses and experimental validation
2026-Mar-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-43744-w
PMID:41905994
|
研究论文 | 本研究通过批量转录组和单细胞转录组分析,结合实验验证,鉴定了与骨质疏松症中内质网应激相关细胞死亡相关的诊断生物标志物CAMKK2和DAPK3 | 整合批量转录组、单细胞转录组分析和实验验证,首次将CAMKK2和DAPK3鉴定为骨质疏松症中与内质网应激相关细胞死亡相关的诊断生物标志物,并揭示了其在骨髓间充质干细胞分化中的动态表达模式 | 研究主要依赖于公共数据集,样本量可能有限,且实验验证仅通过RT-qPCR进行,需要进一步的功能实验验证生物标志物的具体机制 | 鉴定与骨质疏松症中内质网应激相关细胞死亡相关的诊断生物标志物,并探索其潜在机制 | 骨质疏松症患者与对照组的骨组织样本,以及骨髓间充质干细胞 | 生物信息学 | 骨质疏松症 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, RT-qPCR | 机器学习 | 转录组数据 | 训练数据集GSE56815、验证数据集GSE56814和单细胞RNA-seq数据集GSE147287,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 30 | 2026-04-02 |
Bisphenol a exposure and major depressive disorder: an integrative analysis combining network toxicology, molecular docking, genetic epidemiology, and transcriptomic validation
2026-Mar-30, Translational psychiatry
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41398-026-03862-5
PMID:41912493
|
研究论文 | 本研究通过整合网络毒理学、分子对接、遗传流行病学和转录组学验证,系统探讨了双酚A暴露与重度抑郁症之间的分子机制 | 首次将网络毒理学、孟德尔随机化、单细胞RNA测序和分子对接等多种方法整合,全面解析BPA暴露与MDD的关联机制,并识别出六个核心靶点 | 研究主要基于数据库和公开数据集,部分验证在动物模型中进行,人类样本的直接实验证据有限 | 揭示双酚A暴露导致重度抑郁症的分子机制,并识别潜在的治疗靶点 | 双酚A相关靶点、MDD相关基因、小鼠模型 | 生物信息学 | 重度抑郁症 | 网络毒理学、孟德尔随机化、单细胞RNA测序、分子对接、ELISA、qRT-PCR | NA | 基因表达数据、GWAS数据、eQTL数据、scRNA-seq数据、bulk RNA-seq数据 | 涉及多个公共数据库和MDD患者scRNA-seq数据,以及BPA诱导的MDD小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 31 | 2026-04-02 |
Neutrophil aconitate decarboxylase 1/itaconate axis suppresses extracellular traps via alkylating GSDMD and alleviates murine liver injury
2026-Mar-30, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116578
PMID:41915992
|
研究论文 | 本文探讨了ACOD1/ITA轴通过烷基化GSDMD抑制中性粒细胞胞外陷阱形成,从而减轻小鼠肝损伤的机制 | 首次揭示了ACOD1/ITA轴通过烷基化GSDMD抑制NETs形成,为肝病治疗提供了新思路 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探索ACOD1与NETs在肝损伤中的关系及其机制 | 小鼠中性粒细胞和肝损伤模型 | NA | 肝损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 32 | 2026-04-02 |
Tobacco exposure and peripheral artery disease: A multi-omics investigation integrating epidemiology, genetics, toxicology, and single-cell transcriptomics
2026-Mar-30, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2026.120083
PMID:41916120
|
研究论文 | 本研究通过整合流行病学、遗传学、毒理学和单细胞转录组学方法,探讨烟草暴露与血清可替宁水平对周围动脉疾病的影响及其炎症通路机制 | 首次将流行病学分析、网络毒理学、孟德尔随机化、分子对接动力学和单细胞转录组学整合,系统揭示可替宁通过IL6/STAT3信号通路介导烟草暴露与周围动脉疾病关联的新机制 | 分子对接和动力学分析仅提示可替宁与IL6/STAT3可能存在瞬时相互作用,需进一步实验验证;单细胞数据未明确说明样本来源和数量 | 阐明烟草暴露通过血清可替宁介导的炎症通路导致周围动脉疾病的分子机制 | 烟草暴露人群、周围动脉疾病患者、血管相关免疫细胞和基质细胞 | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、孟德尔随机化、分子对接与动力学、网络毒理学 | NA | 流行病学数据、遗传数据、分子模拟数据、单细胞转录组数据 | 基于NHANES数据库的流行病学队列(具体样本数未说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 33 | 2026-04-02 |
Pre-existing cell states predict resistance to multiple treatments
2026-Mar-30, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2026.101191
PMID:41916275
|
研究论文 | 本研究通过多治疗、高通量克隆追踪和单细胞RNA测序技术,揭示了癌症细胞在治疗前的预存状态如何预测其对多种治疗产生耐药性 | 首次在平行多治疗条件下追踪稀有克隆的耐药性发展过程,并识别出与多治疗耐药相关的细胞状态,特别是发现治疗前CD44高表达可作为多治疗耐药的预测指标 | 研究主要基于体外实验模型,尚未在临床样本中得到充分验证 | 探究癌症细胞预存状态对多种治疗耐药性的预测机制 | 癌症细胞克隆 | 单细胞组学 | 癌症 | DNA条形码技术、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 34 | 2026-04-02 |
Single-cell spatial transcriptomics reveals tumor microenvironment heterogeneity in primary and lymph node-metastatic small cell lung cancer
2026-Mar-30, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2026.102713
PMID:41916294
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研究论文 | 本研究利用单细胞空间转录组学技术,揭示了小细胞肺癌原发灶和淋巴结转移灶中肿瘤微环境的异质性 | 首次在小细胞肺癌中应用单细胞空间转录组学技术,系统描绘了淋巴结转移过程中的空间细胞生态系统,并识别了与免疫排斥相关的恶性亚群及血管-免疫互作机制 | 研究样本主要来自特定患者群体,可能无法完全代表所有小细胞肺癌亚型;空间转录组学技术分辨率虽高,但仍受限于检测通量和基因覆盖度 | 探究小细胞肺癌淋巴结转移过程中肿瘤微环境的空间异质性及其对预后的影响 | 75名小细胞肺癌患者的105个原发灶和转移淋巴结样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 105个组织标本,超过600,000个细胞 | NA | 单细胞空间转录组学 | CosMx Spatial Molecular Imager | CosMx空间分子成像仪 |
| 35 | 2026-04-02 |
Multiscale domain identification for spatial transcriptomics via persistent homology
2026-Mar-30, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101376
PMID:41916308
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研究论文 | 本文提出了一种基于持续同调的多尺度空间域识别方法PHD-MS,用于分析空间转录组数据 | 首次将拓扑数据分析(TDA)中的持续同调方法应用于空间转录组学,能够识别跨多个形态尺度的组织空间结构 | 未在摘要中明确说明 | 开发能够识别多尺度空间域的算法,以克服传统聚类方法仅关注单一尺度的问题 | 空间转录组数据中的基因表达空间模式 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 持续同调(拓扑数据分析) | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 36 | 2026-04-02 |
Perturb-seq uncovers pathological obstacles to direct cardiac reprogramming in vivo
2026-Mar-30, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2026.03.006
PMID:41916284
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研究论文 | 本研究利用Perturb-seq平台系统识别了体内心脏重编程的障碍,发现calreticulin (Calr)是主要抑制剂,其敲除可显著提高诱导心肌细胞效率并改善心肌梗死后的心脏功能 | 开发了适用于复杂病理环境的Perturb-seq平台,首次系统比较并排名了140个潜在体内心脏重编程障碍,揭示了Calr作为关键抑制剂的新机制 | 研究主要基于shRNA筛选和单细胞RNA-seq数据,体内实验验证可能受模型特异性限制,未全面探讨其他潜在障碍的长期影响 | 识别并克服体内直接心脏重编程的病理障碍,以提高心肌细胞诱导效率,促进心脏再生 | 成纤维细胞向心肌细胞的直接转分化过程,特别是在心肌梗死后的病理微环境中 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | Perturb-seq, 单细胞RNA-seq, shRNA筛选 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 涉及140个潜在障碍的筛选 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 定制化Perturb-seq平台,适用于复杂病理环境 |
| 37 | 2026-04-02 |
mRNA lipid-nanoparticle-mediated mitochondrial apoptosis augments adoptive T cell immunotherapy
2026-Mar-30, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2026.102706
PMID:41916290
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研究论文 | 本研究开发了一种基于mRNA脂质纳米颗粒的组合策略,通过编码激活型蛋白的BH3结构域触发线粒体凋亡,以增强过继性T细胞免疫疗法的抗肿瘤效果 | 利用mRNA脂质纳米颗粒递送BH3结构域来特异性诱导肿瘤细胞的免疫原性细胞死亡,并重塑免疫抑制微环境,与过继性T细胞疗法协同增强疗效 | NA | 增强过继性T细胞免疫疗法对实体瘤的治疗效果 | 肿瘤细胞和过继性T细胞 | NA | 癌症 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 38 | 2026-04-02 |
Robust transcriptomic hallmarks targeting intratumor heterogeneity in intrahepatic cholangiocarcinoma
2026-Mar-30, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2026.102708
PMID:41916296
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研究论文 | 本研究通过整合多区域、单区域和单细胞RNA测序数据,系统表征了肝内胆管癌的基因表达瘤内异质性,并开发了一种瘤内异质性不敏感的分类系统 | 识别了低瘤内异质性/高瘤间变异性基因集,并基于此定义了五个具有不同临床和分子特征的亚组,提供了新的生物标志物和治疗策略 | 未明确说明样本来源的多样性或潜在的技术偏差 | 克服肝内胆管癌中瘤内异质性对转录组分层的影响,建立稳健的分子分类框架 | 肝内胆管癌肿瘤组织 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 多组学数据整合、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据、多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 39 | 2026-04-02 |
Taming Autoimmunity: Alpha-1 Antitrypsin Overexpressing Mesenchymal Stem/Stromal Cells Promote Regulatory T Cell Crosstalk to Reverse Diabetes
2026-Mar-30, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2026.03.032
PMID:41918165
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研究论文 | 本研究探讨了过表达α-1抗胰蛋白酶的间充质干细胞/基质细胞(AAT-MSCs)如何通过调节T细胞反应来逆转小鼠糖尿病 | 首次结合单细胞RNA测序、流式细胞术和功能分析,系统揭示了AAT-MSCs通过增强调节性T细胞(Tregs)的细胞间通讯来抑制自身免疫反应的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类细胞的体外实验结果仍需体内验证,且长期疗效和安全性未评估 | 阐明AAT-MSCs在1型糖尿病治疗中的免疫调节机制,为其临床转化提供依据 | 非肥胖糖尿病(NOD)小鼠的胰腺淋巴结和胰岛细胞,以及小鼠和人类的体外细胞 | 单细胞组学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,功能分析 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | 未明确样本数量,但涉及NOD小鼠模型及体外小鼠/人类细胞实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 40 | 2026-04-02 |
Association between craniosynostosis and phospholipid metabolism: Insights from single-cell and transcriptomic analysis
2026-Mar-27, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000048030
PMID:41894269
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研究论文 | 本研究通过多组学方法探讨了颅缝早闭与磷脂代谢之间的关联 | 首次从磷脂代谢角度系统研究颅缝早闭的发病机制,并结合单细胞RNA测序、孟德尔随机化和网络药理学方法 | 样本量有限导致统计显著性受限,遗传证据尚属探索性 | 阐明颅缝早闭的发病机制,探索潜在治疗靶点 | 儿童颅缝早闭患者和实验小鼠的颅缝组织 | 数字病理学 | 颅缝早闭 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 孟德尔随机化, 网络药理学, 分子对接 | NA | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 临床样本和实验小鼠组织,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组学 | NA | NA |