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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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11961 | 2024-08-04 |
Reference-free inferring of transcriptomic events in cancer cells on single-cell data
2024-May-20, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-12331-5
PMID:38769480
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研究论文 | 本文研究了在单细胞数据上无参考文献地推断癌细胞转录组事件的方式 | 提出了一种不依赖参考的k-mer分解方法,以更详细地识别致病变异 | 没有针对特定的参考基因组进行分析,可能会忽略一些特定变异 | 探讨癌细胞的转录组变异及其与肿瘤相关事件的关系 | 食管癌和胶质母细胞瘤患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 食管癌,胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 涉及食管癌和胶质母细胞瘤患者的数据集 |
11962 | 2024-08-05 |
Integrating single-cell RNA-sequencing and bulk RNA-sequencing data to explore the role of mitophagy-related genes in prostate cancer
2024-May-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e30766
PMID:38774081
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研究论文 | 本文通过综合分析前列腺癌样本的RNA-seq和单细胞RNA-seq数据,探讨线粒体自噬相关基因在前列腺癌中的作用 | 创新点在于建立了前列腺癌亚型和预后模型,并识别了与线粒体自噬相关的预后基因 | 研究受限于所使用的数据来源,仅基于公开数据库的样本进行分析 | 研究前列腺癌中线粒体自噬相关基因的作用及其对预后的影响 | 前列腺癌样本及其对照组样本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | RNA-seq, scRNA-seq | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 多个前列腺癌样本和对照样本 |
11963 | 2024-08-05 |
Circulating hematopoietic stem/progenitor cell subsets contribute to human hematopoietic homeostasis
2024-May-09, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023022666
PMID:38446574
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研究论文 | 这项研究揭示了循环造血干/祖细胞亚群在维持人类造血稳态中的作用。 | 创新点在于通过结合单细胞转录组测序和功能分析,深入了解了人类循环造血干/祖细胞亚群的生物特性及其与骨髓相应群体的关系。 | 本研究未详细探讨特定疾病情况下cHSPCs的行为及其临床应用。 | 研究的目的是揭示循环造血干/祖细胞在维持人类造血稳态中的作用及其特征。 | 研究对象为人类循环造血干/祖细胞及其在不同生理状态下的表现。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 涉及患者的临床试验数据,具体样本量未在摘要中提供 |
11964 | 2024-08-04 |
The p21+ perinecrotic hepatocytes produce the chemokine CXCL14 after a severe acetaminophen overdose promoting hepatocyte injury and delaying regeneration
2024-May, Toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.tox.2024.153804
PMID:38614205
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研究论文 | 该文章探讨了p21+的肝细胞在严重的对乙酰氨基酚(APAP)过量后产生化学因子CXCL14,导致肝细胞损伤和再生延迟 | 揭示了p21肝细胞的分泌表型及其在APAP过量后对肝脏恢复的直接阻碍作用 | 研究主要依赖动物模型,可能无法完全反映人类的病理情况 | 探讨APAP过量后肝细胞p21的持续诱导和CXCL14分泌对急性肝衰竭的影响 | p21+肝细胞及其分泌的CXCL14化学因子 | 数字病理学 | 急性肝衰竭 | 单核RNA测序,空间转录组学 | 小鼠模型 | 生物样本(肝脏组织) | 包含多个性别的小鼠样本 |
11965 | 2024-08-05 |
Targeting dysregulated phago-/auto-lysosomes in Sertoli cells to ameliorate late-onset hypogonadism
2024-May, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-024-00614-2
PMID:38649614
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研究论文 | 该文章探讨了Sertoli细胞在晚发性性腺功能减退症中的功能及其潜在治疗策略 | 首次揭示了老化Sertoli细胞中吞噬体/自噬体功能失调的机制以及其在晚发性性腺功能减退症中的作用 | 尚未完全理解年龄相关睾丸功能障碍的所有机制 | 研究Sertoli细胞在晚发性性腺功能减退症中的角色,寻找可能的治疗方法 | 人类睾丸组织及其Sertoli细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 人类睾丸组织样本和小鼠模型 |
11966 | 2024-08-05 |
Envelope protein-specific B cell receptors direct lentiviral vector tropism in vivo
2024-May-01, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2024.03.002
PMID:38449314
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研究论文 | 本文研究了慢病毒载体在体内如何通过特异性B细胞受体影响其转导。 | 发现不同伪类型的包膜蛋白通过独特的B细胞受体对特定B细胞亚群体进行选择性转导,提出了新的基因递送概念。 | 研究未详细探讨不同伪类型对B细胞行为的全面影响。 | 探讨慢病毒载体的转导机制及其在B细胞亚群体中的生物分布。 | 转导的脾脏B细胞及其特异性B细胞受体。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
11967 | 2024-08-04 |
Error modelled gene expression analysis (EMOGEA) provides a superior overview of time course RNA-seq measurements and low count gene expression
2024-Mar-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae233
PMID:38770716
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研究论文 | 本文介绍了一种名为EMOGEA的RNA-seq数据分析框架,能够处理时间序列测量的基因表达数据 | 该框架综合考虑了测量不确定性,适用于低计数转录本的数据分析,有助于提取基因表达的动态特征 | 本文未提到具体的局限性 | 改善对动态现象中基因调控的理解,尤其是在肿瘤进展和药物反应过程中 | 主要涉及RNA-seq数据,特别是低计数转录本 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 时间序列数据 | 使用了斑马鱼胚胎和小鼠早期植入的实验数据进行验证 |
11968 | 2024-08-05 |
Analyzing Immune Cell Infiltration and Copper Metabolism in Diabetic Foot Ulcers
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S452609
PMID:38774446
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研究论文 | 本研究分析了糖尿病足溃疡中免疫细胞渗透和铜代谢的关系 | 首次探讨了铜代谢在糖尿病足溃疡发展中的作用及其与免疫细胞渗透的联系 | 未提供对其他类型伤口或非糖尿病患者的比较数据 | 研究糖尿病足溃疡中与铜代谢相关的基因,以发现潜在的治疗靶点 | 分析糖尿病伤口中免疫细胞的失调及与铜代谢相关的基因 | 数字病理学 | 糖尿病足溃疡 | qRT-PCR和单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 两个糖尿病伤口GEO数据集 |
11969 | 2024-08-05 |
Mendelian Randomization and Transcriptomic Analysis Reveal the Protective Role of NKT Cells in Sepsis
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S459706
PMID:38774448
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研究论文 | 本研究揭示了NKT细胞在脓毒症中的保护作用及其与28天死亡率的关系 | 首次通过孟德尔随机化分析揭示NKT细胞在脓毒症中的保护作用,并发现了独特的FOS+NKT亚型 | 未能探索NKT细胞在脓毒症中的具体机制 | 研究NKT细胞在脓毒症中的角色及其对28天死亡率的影响 | 脓毒症患者和健康对照的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | 孟德尔随机化分析 | 基因组数据 | 115名脓毒症患者 |
11970 | 2024-08-05 |
Exploring dendritic cell subtypes in cancer immunotherapy: unraveling the role of mature regulatory dendritic cells
2024, Upsala journal of medical sciences
IF:1.5Q2
DOI:10.48101/ujms.v129.10627
PMID:38716077
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综述 | 本文探讨了树突细胞在癌症免疫治疗中的亚型及成熟调节树突细胞的作用 | 文章通过单细胞RNA测序分析揭示了树突细胞的表型获取、转录状态和功能程序的最新研究成果 | 文章未提及具体的实验研究和数据支持 | 研究树突细胞在肿瘤免疫微环境中的功能和激活 | 重点研究树突细胞亚型及其在抗肿瘤免疫中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
11971 | 2024-08-04 |
The Functional Roles of MDSCs in Severe COVID-19 Pathogenesis
2023-12-23, Viruses
DOI:10.3390/v16010027
PMID:38257728
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评论 | 本文总结了骨髓来源抑制细胞(MDSCs)在严重COVID-19发病机制中的功能角色 | 文章提出MDSCs的早期扩展可能是严重COVID-19进展的关键特征,并探讨其作为潜在预后生物标志物的作用 | 缺乏对严重COVID-19进展的全面分子决定因素的阐明 | 探讨骨髓来源抑制细胞在严重COVID-19发病机制中的作用 | 严重COVID-19患者的MDSCs及其功能 | 数字病理学 | COVID-19 | RNA测序, 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 通过转录组RNA-seq和单细胞测序数据的荟萃分析得出的数据 |
11972 | 2024-08-05 |
Anatomical Diversity of the Adult Corticospinal Tract Revealed by Single-Cell Transcriptional Profiling
2023-11-22, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.0811-22.2023
PMID:37748862
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研究论文 | 文章通过单细胞转录组分析揭示了成人皮质脊髓束的解剖多样性 | 首次通过结合脊髓逆行追踪与单细胞RNA测序的方式,详细索引了不同类型的皮质脊髓神经元 | 当前对皮质脊髓束的修复策略仍不理想,部分原因是对分子异质性了解不够全面 | 研究皮质脊髓神经元的亚型及其在运动皮层中的分布模式 | 成年小鼠的皮质脊髓神经元亚型 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 成年小鼠(男女各一) |
11973 | 2024-08-05 |
IL-1β inhibition partially negates the beneficial effects of diet-induced lipid lowering
2023-Oct-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.13.562255
PMID:37873280
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研究论文 | 本研究探讨了IL-1β抑制对饮食诱导的脂质降低效果的部分抵消作用 | 研究揭示了IL-1β在饮食诱导的斑块负担减少和斑块稳定性提高中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,可能无法完全适用于人类 | 探讨饮食改变对动脉粥样硬化病变的影响及其机制 | 采用Apoe-/-小鼠作为研究对象,以分析饮食对动脉粥样硬化病变的影响 | 医学 | 心血管疾病 | scRNA-seq, CyTOF, 免疫染色, 高分辨率共聚焦显微镜z堆叠分析 | NA | 组织样本 | Apoe-/-小鼠,18周喂养西方饮食后切换到低脂饮食 |
11974 | 2024-08-04 |
Single-cell and spatial transcriptomics identify a macrophage population associated with skeletal muscle fibrosis
2023-07-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.add9984
PMID:37418531
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研究论文 | 该文章研究了与骨骼肌纤维化相关的巨噬细胞群体 | 通过单细胞转录组分析,揭示了骨骼肌巨噬细胞的新型转录程序和其在肌肉病中的作用 | 未详细讨论巨噬细胞在不同类型肌病中的具体功能 | 探讨巨噬细胞在肌肉疾病发展中作用机制 | 骨骼肌中的健康和病变的巨噬细胞 | 数字病理学 | 肌肉萎缩症 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 发现六个巨噬细胞群体,涉及不同的肌肉病变样本 |
11975 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq analyses show that long non-coding RNAs are conspicuously expressed in Schistosoma mansoni gamete and tegument progenitor cell populations
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.924877
PMID:36204320
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研究论文 | 该研究分析了Schistosoma mansoni的单细胞RNA测序数据,发现长非编码RNA在生殖细胞和外表细胞群体中显著表达 | 首次揭示了Schistosoma mansoni中长非编码RNA的细胞类型特异性表达模式 | 研究主要依赖公开的数据,可能存在数据质量和完整性的问题 | 探索Schistosoma mansoni中长非编码RNA的表达模式及其潜在的治疗靶点 | Schistosoma mansoni的成人细胞类型及其长非编码RNA表达特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 8023个长非编码RNA |
11976 | 2024-08-05 |
Next-generation molecular diagnosis: single-cell sequencing from bench to bedside
2017-03, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-016-2368-x
PMID:27738745
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综述 | 本综述提供了单细胞测序在基因组医学中诊断应用的现状和前景概述 | 该文章强调了单细胞测序在新生物标志物识别和靶向治疗中的潜力,促进了基因组医学的下一步发展 | NA | 简要说明单细胞测序在早期疾病检测和诊断中的应用 | 单细胞测序在胚前基因诊断、非侵入性产前诊断和循环肿瘤细胞分析中的使用 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA |
11977 | 2024-08-05 |
NK Cell-Monocyte Cross-talk Underlies NK Cell Activation in Severe COVID-19
2024-Jun-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300731
PMID:38578283
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研究论文 | 这篇文章探讨了重症COVID-19患者外周血中的NK细胞与单核细胞之间的相互作用及其对NK细胞激活和功能障碍的影响 | 首次结合了细胞间通讯分析与体外原代细胞共培养实验,以揭示COVID-19中NK细胞功能障碍的机制 | 仅在体外模型中进行验证,尚未在活体系统中进行全面观察 | 了解重症COVID-19中NK细胞功能障碍的机制 | 重症COVID-19患者的NK细胞和单核细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序,体外共培养实验 | NA | 细胞数据 | 健康供体的NK细胞与来自重症COVID-19患者或健康供体的单核细胞共培养 |
11978 | 2024-08-04 |
Transcriptomic profiling and regulatory pathways of cardiac resident macrophages in aging
2024-May-20, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-024-05235-x
PMID:38763956
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研究论文 | 本研究探讨了衰老对心脏常驻巨噬细胞的转录组特征及其调控通路 | 揭示了衰老过程中心脏常驻巨噬细胞亚群的功能差异,特别是 CCR2 巨噬细胞在炎症反应中的作用 | 仅使用了老鼠模型,结果可能不适用于人类 | 探究衰老对心脏常驻巨噬细胞的影响及其与心血管疾病的关系 | 老龄小鼠的心脏常驻巨噬细胞及其亚群 | 数字病理学 | 心血管疾病 | Smart-Seq | NA | 基因表达数据 | 20 个月大的老鼠 |
11979 | 2024-08-05 |
Decoding the complexity of delayed wound healing following Enterococcus faecalis infection
2024-May-20, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.95113
PMID:38767331
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研究论文 | 本文研究了肠球菌感染后延迟伤口愈合的复杂性 | 通过单细胞RNA测序创建了感染伤口的综合单细胞图谱,揭示了感染时细胞和转录组的独特变化 | 该研究主要依赖于小鼠模型,可能限制了对人类伤口愈合的直接适用性 | 探讨肠球菌感染对伤口愈合过程的影响和分子机制 | 对比感染与未感染的伤口,分析超过23000个细胞的转录组特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 细胞转录组数据 | 超过23000个细胞 |
11980 | 2024-08-07 |
Correction: ScRNA-seq revealed an immunosuppression state and tumor microenvironment heterogeneity related to lymph node metastasis in prostate cancer
2024-May-20, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-024-00517-3
PMID:38769580
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |