单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 11801 - 11820 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11801 | 2024-08-04 |
Zinc-a2-Glycoprotein Acts as a Component of PNN to Protect Hippocampal Neurons from Apoptosis
2024-Jun, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-023-03771-4
PMID:38001359
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研究论文 | 本文首次展示了锌-α-糖蛋白(ZAG)在鼠脑中的分布与功能 | 本研究首次揭示ZAG在PNN中定位及其对神经元凋亡的保护作用 | 研究主要集中在小鼠模型，可能无法完全推及人类 | 探讨锌-α-糖蛋白在成年人脑中的作用及其对神经元的保护机制 | 成人小鼠的海马、皮层及其它包含PNN的神经元 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序、分子对接 | NA | 细胞数据 | HT22细胞 |
| 11802 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing reveals the impact of endothelial cell PIEZO1 expression on thoracic aortic aneurysm
2024-Jun, Journal of molecular and cellular cardiology
IF:4.9Q2
DOI:10.1016/j.yjmcc.2024.04.015
PMID:38718563
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研究论文 | 本研究探讨了内皮细胞中PIEZO1表达对胸主动脉瘤（TAA）的影响 | 首次揭示了PIEZO1在胸主动脉瘤发展中的作用，并建议其作为治疗靶点的潜力 | 研究中使用的动物模型可能与人类病理情况存在差异 | 研究PIEZO1在胸主动脉瘤中的作用及其潜在的治疗价值 | TAA患者的单细胞数据库及小鼠模型 | 数字病理学 | 胸主动脉瘤 | 单细胞测序 | 条件性敲除小鼠模型 | RNA及蛋白质水平数据 | 使用了小鼠模型进行的实验 |
| 11803 | 2024-08-04 |
The upregulation and transcriptional regulatory mechanisms of Extra spindle pole bodies like 1 in bladder cancer: An immunohistochemistry and high-throughput screening Evaluation
2024-May-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e31192
PMID:38813236
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研究论文 | 本研究探讨了在膀胱癌中Extra Spindle Pole Bodies Like 1 (ESPL1)的表达水平和转录调控机制 | 本研究首次揭示了ESPL1在膀胱癌中的上调表达及其与转录因子的相关性，提出ESPL1可能作为膀胱癌的免疫相关预测和诊断标志物 | 该研究样本虽多，但对特定亚型膀胱癌的适用性可能存在局限性，需进一步验证 | 研究ESPL1在膀胱癌中的表达及其转录调控机制 | 膀胱癌患者样本及其相关的细胞分子机制 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 免疫组化(IHC), 单细胞测序(scRNA-seq), ATAC-seq, ChIP-seq, Hi-C | NA | 组织和血液样本 | 1391个样本用于数据库分析，202个样本用于IHC验证，6625个血液样本和537个组织样本用于miR-299-5p检测 |
| 11804 | 2024-08-05 |
Non-apoptotic regulatory cell death scoring system to predict the clinical outcome and drug choices in breast cancer
2024-May-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e31342
PMID:38813233
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研究论文 | 本研究提出了一种新型的非凋亡调节细胞死亡评分系统，用于预测乳腺癌的临床结果和药物选择 | 提出了一个与非凋亡调节细胞死亡相关的新风险特征，有望成为乳腺癌的潜在预后标记 | 未提及具体的局限性 | 研究非凋亡调节细胞死亡在乳腺癌中的作用及其预后价值 | 乳腺癌患者的RNA序列和临床数据 | 机器学习 | 乳腺癌 | RNA测序 | Lasso回归、随机森林、XGBoost | 基因表达数据 | 从TCGA数据库和GEO数据库使用的样本数量未具体说明 |
| 11805 | 2024-08-05 |
GHSR in a subset of GABA neurons controls food deprivation-induced hyperphagia in male mice
2024-May-30, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqae061
PMID:38815068
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研究论文 | 本研究探讨了生长激素分泌素受体（GHSR）在特定GABA神经元中对食物剥夺引起的贪食的调控作用 | 确定了GHSR主要作用于下丘脑弓形核中的非AgRP GABA神经元子集 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能不适用于其他物种或更广泛的生理条件 | 验证GHSR在特定GABA神经元中的表达是否足以介导其对进食的影响 | 选择性表达GHSR的特定GABA神经元 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 生物样本数据 | 涉及多个基因型小鼠 |
| 11806 | 2024-08-04 |
Integration of single-cell sequencing and bulk RNA-seq to identify and develop a prognostic signature related to colorectal cancer stem cells
2024-05-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-62913-3
PMID:38806611
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序与传统RNA测序相结合，识别并开发与结直肠癌干细胞相关的预后标记。 | 首次提出基于结直肠癌干细胞相关基因的预后风险模型，并鉴定关键基因RPS17作为潜在的预后标记和治疗靶点。 | 目前尚无临床可用的基于CRCSC相关基因的预后标记。 | 研究结直肠癌干细胞在肿瘤转移、复发和化疗耐药中的作用，并开发相关的预后标记。 | 本研究对象为结直肠癌相关干细胞及其相关基因。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因数据 | 使用TCGA和GEO数据库的数据进行分析，样本数量未具体列出 |
| 11807 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals the evolution of the immune landscape during perihematomal edema progression after intracerebral hemorrhage
2024-May-28, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-024-03113-8
PMID:38807233
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了脑出血后周围血肿水肿的免疫环境演变。 | 首次在单细胞水平上全面描绘了人类周围血肿水肿组织中的多样免疫细胞群体。 | 研究仅限于9名患者，样本量较小，可能影响结果的普遍性。 | 目标是表征人类周围血肿水肿组织中免疫细胞群体的转录组特征。 | 9名基底节脑出血患者的周围血肿水肿组织样本。 | 数字病理学 | 脑出血 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 9名患者的周围血肿水肿组织样本 |
| 11808 | 2024-08-05 |
GLI1+ Cells Contribute to Vascular Remodeling in Pulmonary Hypertension
2024-May-24, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.323736
PMID:38639105
|
研究论文 | 这篇文章探讨了GLI1+细胞在肺动脉高压中对血管重塑的贡献 | 阐明了GLI1+细胞作为肺动脉高压中血管平滑肌细胞的新来源，并探索了其信号通路的潜在治疗作用 | 尚未完全阐明GLI1+细胞在动态血管重塑过程中的具体机制 | 研究GLI1+细胞在肺动脉高压中的作用及其在血管重塑中的重要性 | 主要研究GLI1+细胞在肺动脉高压小鼠模型中的表型和功能 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 组织样本 | 使用了GLI1Cre-ERT2; tdTomatoflox小鼠进行实验分析 |
| 11809 | 2024-08-04 |
Analysis of synthetic cellular barcodes in the genome and transcriptome with BARtab and bartools
2024-May-20, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100763
PMID:38670101
|
研究论文 | 本文介绍了一种用于细胞条形码分析的工具BARtab和bartools | 提出了一个综合的端到端细胞条形码分析工具包，包含多个功能以简化数据提取和分析 | 未提及具体的局限性 | 研究细胞条形码在基因组和转录组中的应用 | 针对细胞条形码的网络状况进行分析，包含人群水平、单细胞和空间转录组实验 | 数字病理学 | NA | 高通量测序 | NA | 转录组数据 | 多个示例样本，包括大样本、单细胞及空间转录组实验 |
| 11810 | 2024-08-04 |
Semaglutide ameliorates obesity-induced cardiac inflammation and oxidative stress mediated via reduction of neutrophil Cxcl2, S100a8, and S100a9 expression
2024-May, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-023-04784-2
PMID:37318712
|
研究论文 | 本研究探讨了塞马鲁肽在肥胖导致的心脏炎症和氧化压力中的作用。 | 揭示了塞马鲁肽通过降低中性粒细胞Cxcl2、S100a8和S100a9表达来减轻肥胖引起的心脏炎症和氧化压力的新机制。 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全代表人类的生理情况。 | 探究肥胖引起的心肌损伤机制及塞马鲁肽的心脏保护影响。 | 肥胖小鼠模型及其心脏组织和血清中的炎症和氧化压力水平。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 血清和心脏组织样本 | 肥胖小鼠模型 |
| 11811 | 2024-08-04 |
Enhancing Vasculogenesis in Dental Pulp Development: DPSCs-ECs Communication via FN1-ITGA5 Signaling
2024-May, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-024-10695-6
PMID:38418738
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研究论文 | 研究牙髓再生治疗中血管形成的调控机制 | 首次揭示DPSCs与ECs之间通过FN1-ITGA5信号通路的细胞间通讯在牙髓发育中的重要性 | 研究未涉及不同类型牙髓的长期效果及其临床应用 | 探讨人类牙髓发育中血管形成的调控机制以促进相关治疗 | 开发中和成熟牙髓中的牙髓干细胞（DPSCs）和血管内皮细胞（ECs） | 数字病理 | NA | 单细胞测序分析、免疫组化、西方印迹、实时定量PCR | NA | 基因表达数据、细胞生物学实验数据 | 使用小鼠进行动物实验，具体样本量未说明 |
| 11812 | 2024-08-04 |
The guardians of pulmonary harmony: alveolar macrophages orchestrating the symphony of lung inflammation and tissue homeostasis
2024-Apr-30, European respiratory review : an official journal of the European Respiratory Society
IF:9.0Q1
DOI:10.1183/16000617.0263-2023
PMID:38811033
|
综述 | 该文章全面论述了肺泡巨噬细胞在肺部炎症和组织稳态中的重要作用 | 整合了单细胞测序、细胞和组织成像技术等多项最新研究，提供了肺泡巨噬细胞功能可塑性的综合视角 | 未提供具体的实验数据或样本分析结果 | 探讨肺泡巨噬细胞在维持肺部健康和应对疾病环境中的作用 | 主要研究肺泡巨噬细胞及其相应的信号通路和功能特点 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序、细胞成像技术 | NA | NA | NA |
| 11813 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA-seq analysis reveals the Wnt/Ca2+ signaling pathway with inflammation, apoptosis in nucleus pulposus degeneration
2024-Apr-23, BMC musculoskeletal disorders
IF:2.2Q3
DOI:10.1186/s12891-024-07368-3
PMID:38654287
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研究论文 | 本研究揭示了正常与退变的人类髓核细胞中Wnt/Ca2+信号通路的差异表达 | 首次通过单细胞RNA测序分析发现人类退变髓核细胞中Wnt/Ca2+信号通路的表达差异 | 研究主要集中在特定人群的细胞，样本的多样性和广泛性可能会影响结果的普适性 | 研究正常与退变髓核细胞中Wnt/Ca2+信号通路的表达差异及其机制 | 正常与退变的人类髓核细胞 | 数字病理学 | 脊椎间盘退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | NA |
| 11814 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA-seq of Drosophila miranda testis reveals the evolution and trajectory of germline sex chromosome regulation
2024-Apr, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002605
PMID:38687805
|
研究论文 | 这篇文章揭示了发育中性染色体的调控及其对性染色体结构演化的影响 | 本研究利用D. miranda的年轻性染色体，展示了以前的常染色体是如何获得特定于性染色体的调控程序 | 本研究主要集中在D. miranda的性染色体，可能不适用于其他物种 | 研究性染色体的演变及生殖系调控机制 | 使用单细胞和大规模RNA测序分析D. miranda的生殖细胞 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 11815 | 2024-08-04 |
Studying plant vascular development using single-cell approaches
2024-04, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2024.102526
PMID:38479078
|
研究论文 | 研究通过单细胞方法理解植物血管发育 | 总结和反思了最近使用单细胞转录组技术研究血管细胞类型的新进展 | NA | 理解血管细胞发育中的转录调控 | 植物血管细胞及其发育过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和单核RNA测序 (snRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA |
| 11816 | 2024-08-05 |
Single-cell multi-omics analysis identifies context-specific gene regulatory gates and mechanisms
2024-Mar-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae180
PMID:38653489
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研究论文 | 该研究介绍了一种名为scGATE的新计算工具，用于推断特定细胞类型或状态的转录因子与基因之间的调控关系 | scGATE通过使用贝叶斯框架推断布尔规则，无需为每个布尔规则单独进行公式和可能性计算，从而显著减少了时间复杂度 | NA | 推断特定细胞类型或状态的基因调控网络 | 转录因子与基因的相互作用网络 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq, scATAC-seq | NA | 单细胞多组学数据 | 使用小鼠组织和人血的合成及真实单细胞数据 |
| 11817 | 2024-08-04 |
Non-coding genome contribution to ALS
2024, International review of neurobiology
DOI:10.1016/bs.irn.2024.04.002
PMID:38802183
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研究论文 | 总结了非编码基因组在肌肉萎缩侧索硬化症（ALS）中的贡献 | 提出细胞特异性功能注释对于发现ALS相关遗传变异的重要性 | 缺乏针对大多数ALS患者的特定遗传驱动因素的理解 | 探索非编码基因组中的遗传风险变异对ALS的影响 | ALS患者的非编码基因组遗传变异 | 数字病理学 | 肌肉萎缩侧索硬化症 | 单细胞表观遗传学分析和空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 11818 | 2024-08-04 |
Comparative Methods for Demystifying Spatial Transcriptomics
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3838-5_17
PMID:38819570
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研究论文 | 本文探讨了空间转录组技术(ST)的比较方法。 | 提出了通过比较不同基因组或转录组参考对ST实验结果影响的新见解。 | 研究中只集中于Visium平台提供的分析软件，未涵盖其他可能的ST平台。 | 分析空间转录组实验中的基因表达特征并优化分析流程。 | 研究对象包括使用ST技术的细胞群体及其基因表达数据。 | 数字病理学 | NA | RNA-Seq | NA | 图像和基因表达数据 | 使用了不同点的多组RNA读取数据 |
| 11819 | 2024-08-04 |
Dynamic changes of immunocyte subpopulations in thermogenic activation of adipose tissues
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1375138
PMID:38812501
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研究论文 | 本研究探讨了不同冷暴露期间脂肪组织内免疫细胞的动态变化 | 识别了几种新的免疫细胞亚群，这些亚群可能有助于脂肪组织在冷暴露下的产热激活 | 研究主要集中在小鼠模型，可能不完全反映人类的情况 | 探讨冷暴露对热生成脂肪组织内免疫细胞的整体变化 | 不同冷暴露期间的热生成性脂肪组织中的免疫细胞 | NA | 代谢疾病 | 单细胞测序, 流式细胞术, 免疫荧光, 定量实时PCR | NA | 免疫细胞数据 | 使用了两个不同类型的热生成性脂肪组织的样本 |
| 11820 | 2024-08-04 |
Dissecting Spatiotemporal Structures in Spatial Transcriptomics via Diffusion-Based Adversarial Learning
2024, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0390
PMID:38812530
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研究论文 | 本文介绍了一种计算框架PearlST，用于准确推断空间转录组数据中的时空结构 | 提出了结合偏微分方程增强对抗图自编码器的新方法，显著提升从空间转录组数据中提取特征的能力 | 未知所涉及的具体技术限制和数据集限制 | 研究空间转录组数据中的时空结构推断 | 空间转录组数据及其相关生物学背景 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 对抗图自编码器 | Wasserstein对抗正则化图自编码器 | 空间转录组数据 | 多个不同分辨率的空间转录组数据集 |