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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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9881 | 2025-10-07 |
Novel Perspective on Sevoflurane-Induced Cognitive Dysfunction: Implications of Neuronal SIRPα and Microglial Synaptic Remodeling
2024-12-18, ACS chemical neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.1021/acschemneuro.4c00485
PMID:39644326
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研究论文 | 本研究探讨神经元SIRPα和小胶质细胞突触重塑在七氟醚诱导新生小鼠认知功能障碍中的作用 | 首次揭示神经元SIRPα通过调控小胶质细胞功能改善七氟醚诱导的认知障碍,并发现IRF8与SIRPα表达的相关性 | 研究仅针对新生小鼠,未验证其他年龄阶段;转录组分析显示皮质小胶质细胞和神经元无显著变化 | 阐明七氟醚诱导认知功能障碍的分子机制 | 新生小鼠 | 神经科学 | 认知功能障碍 | 单细胞转录组测序, 慢病毒过表达, SCENIC分析 | NA | 基因表达数据, 行为学数据 | 新生小鼠皮质细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9882 | 2025-10-07 |
Emerging drug targets for triple-negative breast cancer: a guided tour of the preclinical landscape
2022-05, Expert opinion on therapeutic targets
IF:4.6Q1
DOI:10.1080/14728222.2022.2077188
PMID:35574694
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综述 | 本文系统综述了三阴性乳腺癌的潜在治疗靶点及其临床前研究进展 | 基于可药性、治疗效力、TNBC特异性及免疫治疗应用等标准,全面评估癌细胞膜分子、细胞内信号通路和肿瘤微环境等新兴靶点 | 靶点识别验证面临分子异质性、临床前到临床转化失败等挑战,缺乏统一评估标准 | 探索三阴性乳腺癌的新型有效靶向治疗策略 | 三阴性乳腺癌的分子靶点和肿瘤微环境 | 肿瘤学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 热稳定II型内含子逆转录酶测序, 人源化小鼠模型 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
9883 | 2025-10-07 |
Individualized patient tumor organoids faithfully preserve human brain tumor ecosystems and predict patient response to therapy
2025-Apr-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.01.002
PMID:39938519
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研究论文 | 开发了一种快速高效的个体化患者肿瘤类器官(IPTO)培养系统,能够准确模拟人脑肿瘤的细胞和分子病理特征 | 利用iPSC来源的脑类器官培养患者来源的肿瘤外植体,首次实现了包括成人、儿童和转移性脑癌在内的多种中枢神经系统肿瘤的体外培养 | 未明确说明样本规模和研究队列的具体细节 | 建立能够预测患者特异性治疗反应的临床前肿瘤模型 | 人脑肿瘤组织样本,包括成人、儿童和转移性脑癌 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 基因组学, 表观基因组学, 组织病理学分析 | IPTO(个体化患者肿瘤类器官)模型 | 基因组数据, 转录组数据, 表观基因组数据, 图像数据 | 前瞻性患者队列(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9884 | 2025-10-07 |
Interferon-responsive intestinal BEST4/CA7+ cells are targets of bacterial diarrheal toxins
2025-Apr-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.02.003
PMID:40010349
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研究论文 | 本研究通过人类肠道类器官模型揭示了BEST4/CA7+细胞在细菌感染引起的腹泻中的作用机制 | 首次建立人类肠道类器官中BEST4/CA7细胞的分化方法,发现其对细菌毒素的响应机制及去甲肾上腺素-ADRA2A轴的调控作用 | 缺乏小鼠模型验证,人类体外模型数量有限 | 探究肠道BEST4/CA7细胞在电解质平衡和免疫应答中的功能 | 人类肠道BEST4/CA7细胞 | 单细胞生物学 | 细菌性腹泻 | 单细胞RNA测序, 类器官培养 | 人类肠道类器官模型 | 基因表达数据, 功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9885 | 2025-10-07 |
Exploring Human Brain Metabolism via Genome-Scale Metabolic Modeling with Highlights on Multiple Sclerosis
2025-04-02, ACS chemical neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.1021/acschemneuro.5c00006
PMID:40091499
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA-seq数据和基因组规模代谢模型,构建了人脑细胞特异性代谢模型并应用于多发性硬化症研究 | 首次构建了包含神经元、星形胶质细胞、小胶质细胞、少突胶质细胞和少突胶质前体细胞的脑细胞特异性GEMs,并创建了整合的iHumanBrain2690脑代谢网络模型 | 模型基于计算推断,需要实验验证;未考虑所有脑细胞类型和复杂的细胞间相互作用 | 探索人脑代谢机制,特别关注多发性硬化症中的代谢改变 | 人脑细胞(神经元、星形胶质细胞、小胶质细胞、少突胶质细胞、少突胶质前体细胞) | 系统生物学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA-seq, 基因组规模代谢建模, tINIT算法 | 基因组规模代谢模型 | 基因表达数据, 代谢网络数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9886 | 2025-10-07 |
IL-25 Enhances B Cell Responses in Type 2 Inflammation Through IL-17RB Receptor
2025-Apr, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.16472
PMID:39829150
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研究论文 | 本研究揭示了IL-25通过IL-17RB受体增强B细胞在2型炎症中的抗体应答机制 | 首次发现B细胞在IgE诱导条件下表达IL-17RB受体,并证实IL-25能增强其抗体产生能力 | 研究主要基于体外实验和有限的组织样本,需要更多体内实验验证 | 探究B细胞中IL-25受体(IL-17RB)的表达调控及其在2型炎症中的功能 | 外周血来源的B细胞和鼻息肉组织中的B细胞 | 免疫学 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 流式细胞术, RT-PCR, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 外周血B细胞和鼻息肉组织样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9887 | 2025-10-07 |
Lineage Tracing Reveals Clone-Specific Responses to Doxorubicin in Triple-Negative Breast Cancer
2025-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.18.643980
PMID:40166195
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研究论文 | 使用谱系追踪系统研究三阴性乳腺癌对阿霉素治疗的克隆特异性反应 | 开发结合遗传克隆标识与单细胞RNA测序的谱系追踪系统ClonMapper,揭示治疗反应与克隆身份无关的 divergent phenotypes | 研究基于单一TNBC模型,未验证其他癌症类型或治疗药物 | 阐明三阴性乳腺癌对阿霉素治疗的克隆特异性反应机制 | 三阴性乳腺癌模型中的肿瘤克隆 | 单细胞生物学 | 三阴性乳腺癌 | 谱系追踪,单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9888 | 2025-10-07 |
BET inhibitor in combination with BCG vaccine enhances antitumor efficacy and orchestrates T cell reprogramming for melanoma
2025-Mar-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.101995
PMID:40107246
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研究论文 | 本研究证明BET抑制剂NHWD-870与BCG疫苗联合治疗可通过重编程T细胞增强黑色素瘤抗肿瘤疗效 | 首次发现BET抑制剂与BCG疫苗联合治疗可重编程T细胞至免疫激活状态,并鉴定MT1为BRD4直接下游靶点 | NA | 开发增强黑色素瘤免疫治疗效果的新型联合疗法 | 黑色素瘤模型和T细胞 | NA | 黑色素瘤 | 单细胞转录组分析,人源化PDX模型 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9889 | 2025-10-07 |
Intrinsic OASL expression licenses interferon induction during influenza A virus infection
2025-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.14.643375
PMID:40166309
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了宿主因子OASL在流感病毒感染期间调控干扰素诱导的关键作用 | 首次发现干扰素非依赖性的OASL本征表达是决定细胞间干扰素诱导异质性的关键因素 | 研究主要聚焦于甲型流感病毒感染,未验证其他病毒类型中的普适性 | 识别决定细胞在病毒感染期间产生干扰素反应能力的关键宿主因子 | 甲型流感病毒感染的细胞 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9890 | 2025-10-07 |
FOXO4-DRI induces keloid senescent fibroblast apoptosis by promoting nuclear exclusion of upregulated p53-serine 15 phosphorylation
2025-Feb-24, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-07738-0
PMID:39994346
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现瘢痕疙瘩中衰老成纤维细胞增加,并揭示了FOXO4-DRI通过促进p53-serine15磷酸化核外排诱导衰老成纤维细胞凋亡的机制 | 首次在瘢痕疙瘩中发现p53-serine15磷酸化上调并通过FOXO4-DRI促进其核外排诱导衰老细胞凋亡 | 研究主要基于体外模型,需要进一步体内实验验证 | 探究瘢痕疙瘩中衰老成纤维细胞的分子机制及潜在治疗策略 | 瘢痕疙瘩组织样本和成纤维细胞 | 细胞生物学 | 瘢痕疙瘩 | 单细胞RNA测序,磷酸化特异性蛋白芯片,Western blotting | NA | 基因表达数据,蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9891 | 2025-10-07 |
Gene expression patterns of the developing human face at single cell resolution reveal cell type contributions to normal facial variation and disease risk
2025-Feb-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.18.633396
PMID:39868299
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研究论文 | 通过单细胞分辨率构建人类面部发育基因表达图谱,揭示细胞类型对正常面部变异和疾病风险的贡献 | 首次构建人类颅面发育的单细胞核RNA测序图谱,涵盖胚胎期6个关键时间点,识别了颅神经嵴细胞等主要细胞类型及其亚型 | 样本数量有限(24个胚胎),仅涵盖4-8周胚胎期,未覆盖更早或更晚发育阶段 | 解析人类颅面发育的细胞和遗传机制,探索面部形态变异和颅面疾病的发育起源 | 人类胚胎颅面组织(24个胚胎,涵盖4-8孕周6个时间点) | 发育生物学 | 颅面畸形 | 单核RNA测序(snRNA-seq),空间转录组学 | NA | 基因表达数据,空间定位数据 | 24个人类胚胎 | NA | 单核RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
9892 | 2025-10-07 |
Gene interactions analysis of brain spatial transcriptome for Alzheimer's disease
2024-Nov, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2024.101337
PMID:39281834
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研究论文 | 本研究通过分析阿尔茨海默病脑空间转录组数据,揭示了淀粉样蛋白-β积累过程中基因相互作用的动态变化 | 首次基于空间转录组学识别淀粉样蛋白-β积累过程中的多种基因关联,从时空依赖的基因相互作用角度为AD病因研究提供新视角 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据验证相对有限 | 揭示阿尔茨海默病中基因相互作用的时空动态特征 | 小鼠和人类大脑组织 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组测序,单核RNA测序 | NA | 空间转录组数据,单核RNA-seq数据 | 敲除AD和野生型小鼠模型,不同AD小鼠模型,人类单核RNA-seq数据 | NA | 空间转录组学,单核RNA-seq | NA | NA |
9893 | 2025-10-07 |
Esophageal epithelial Ikkβ deletion promotes eosinophilic esophagitis in experimental allergy mouse model
2024-Jul-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.05.602313
PMID:39026724
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研究论文 | 本研究通过构建食管上皮细胞Ikkβ条件性敲除小鼠模型,揭示了上皮IKKβ/NFκB信号通路在嗜酸性食管炎发病机制中的关键保护作用 | 首次在实验性过敏小鼠模型中证明食管上皮细胞特异性Ikkβ缺失会加剧嗜酸性食管炎病理特征,并利用单细胞RNA测序技术深入解析了上皮分化和屏障完整性的破坏机制 | 研究基于小鼠模型,其病理特征与人类疾病的完全对应性仍需进一步验证 | 探究上皮IKKβ/NFκB信号通路在嗜酸性食管炎发病机制中的作用 | 食管上皮细胞条件性Ikkβ敲除小鼠 | 单细胞测序分析 | 嗜酸性食管炎 | 单细胞RNA测序,RNA测序,组织学分析 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,组织学图像数据 | Ikkβ EEC-KO小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9894 | 2025-10-07 |
Single-cell analysis identifies PLK1 as a driver of immunosuppressive tumor microenvironment in LUAD
2024-Jun, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011309
PMID:38885192
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析发现PLK1是肺腺癌免疫抑制肿瘤微环境的关键驱动因子 | 首次揭示PLK1通过调控CXCL2细胞因子分泌促进肿瘤相关巨噬细胞M2极化和抑制抗原呈递过程的新机制 | 研究主要基于基因工程小鼠模型,人类临床样本验证尚不充分 | 探究PLK1在肺腺癌免疫抑制肿瘤微环境形成中的作用机制 | 肺腺癌小鼠模型和肿瘤微环境中的免疫细胞 | 单细胞分析 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | 基因工程小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9895 | 2025-10-07 |
Targeting mTOR in myeloid cells prevents infection-associated inflammation
2025-Apr-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112163
PMID:40177636
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现mTOR通路在COVID-19患者髓系细胞调控中的关键作用,并开发了靶向髓系细胞的mTOR抑制纳米生物制剂 | 首次开发靶向髓系细胞及其骨髓前体细胞的mTOR抑制纳米生物制剂,证明其能有效抑制感染相关炎症 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床应用效果需进一步验证 | 探索mTOR通路在感染相关炎症中的作用并开发相应治疗策略 | COVID-19患者循环免疫细胞、人原代免疫细胞、高炎症和急性呼吸窘迫综合征小鼠模型 | 单细胞测序 | COVID-19 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, F-FDG摄取检测 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞术数据, 代谢活性数据 | COVID-19患者循环免疫细胞、人原代免疫细胞和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9896 | 2025-10-07 |
AXL-Mediated Drug Resistance in ALK-Rearranged NSCLC Enhanced by GAS6 From Macrophages and MMP11 Positive Fibroblasts
2025-Apr, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.70006
PMID:39904499
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研究论文 | 本研究揭示了AXL介导的ALK重排非小细胞肺癌耐药机制,发现肿瘤微环境中巨噬细胞和MMP11阳性成纤维细胞分泌的GAS6增强耐药性 | 首次发现肿瘤微环境中特定CAFs和TAMs亚群是Gas6主要来源,并揭示MMP11上调与耐药性关联 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系实验,人类患者样本验证有限 | 探究ALK重排NSCLC对alectinib耐药的分子机制 | ALK重排非小细胞肺癌细胞系H3122、小鼠模型、患者样本 | 癌症生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 患者耐药样本、细胞系和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9897 | 2025-10-07 |
High-throughput single cell -omics using semi-permeable capsules
2025-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.14.642805
PMID:40166174
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研究论文 | 本文介绍了一种基于半透性胶囊的高通量单细胞多组学技术 | 开发了半透性胶囊技术,克服了液滴微流控系统长期培养的限制,支持单细胞克隆扩增并提供优异的转录本捕获能力 | NA | 开发适用于多种高通量核酸分析的单细胞多组学技术 | 造血系统疾病患者的白细胞,特别是急性髓系白血病样本 | 单细胞多组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序,数字PCR,基因组测序,FACS分选 | NA | 单细胞转录组数据 | 造血系统疾病患者的白细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | CapSeq(胶囊测序) | 基于半透性胶囊的单细胞测序技术 |
9898 | 2025-10-07 |
Mouse-Geneformer: A deep learning model for mouse single-cell transcriptome and its cross-species utility
2025-Mar, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011420
PMID:40106407
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研究论文 | 开发了针对小鼠单细胞转录组的深度学习模型mouse-Geneformer,并验证其跨物种应用潜力 | 构建了首个基于2100万小鼠单细胞转录组数据预训练的Geneformer模型,并首次系统评估了该模型在跨物种分析中的效用 | 在人类COVID-19模型中的预测结果与人类专用Geneformer仅部分一致,表明物种特异性模型对某些疾病机制捕获存在局限 | 开发适用于小鼠单细胞转录组分析的深度学习模型,并探索其跨物种应用能力 | 小鼠和人类的单细胞转录组数据 | 自然语言处理, 机器学习 | 心肌梗死, COVID-19 | 单细胞RNA测序 | Transformer Encoder | 单细胞转录组数据 | 2100万个小鼠单细胞转录组图谱 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9899 | 2025-10-07 |
Chemokine Ligands and Receptors Regulate Macrophage Polarization in Atherosclerosis: A Comprehensive Database Mining Study
2025-Mar, CJC open
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.cjco.2024.11.018
PMID:40182401
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研究论文 | 通过生物信息学方法研究趋化因子配体和受体在动脉粥样硬化中调控巨噬细胞极化的作用机制 | 首次通过公共数据库挖掘和单细胞RNA测序数据系统分析趋化因子在动脉粥样硬化中调控巨噬细胞极化的网络机制 | 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证 | 研究趋化因子在动脉粥样硬化发生发展中的作用机制 | 巨噬细胞极化过程及相关趋化因子 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 数据库挖掘, 信号通路富集分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9900 | 2025-10-07 |
Spatial profiling of the interplay between cell type- and vision-dependent transcriptomic programs in the visual cortex
2025-Feb-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2421022122
PMID:39946537
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研究论文 | 本研究通过空间转录组分析揭示了视觉经验对初级视觉皮层L2/3神经元细胞类型空间组织和转录程序的调控机制 | 首次结合空间转录组学和单核RNA-seq数据,应用多任务理论揭示L2/3细胞类型空间分区与基因表达连续性的关联,并识别出视觉剥夺诱导的两个独立转录程序 | 研究仅聚焦于L2/3细胞类型,分析基于500个基因的空间转录组数据,可能未涵盖所有相关基因 | 探究视觉经验在关键期内如何影响哺乳动物新皮层神经元细胞类型的空间组织和转录调控 | 初级视觉皮层(V1)的L2/3神经元细胞类型 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组分析, 单核RNA-seq | 多任务理论, 2D流形模型 | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 正常饲养和暗饲养条件下的L2/3细胞 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |