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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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9801 | 2025-10-07 |
Integrating multi-omics and machine learning methods reveals the metabolism of amino acids and derivatives-related signature in colorectal cancer
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1565090
PMID:40206583
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和机器学习方法,揭示了氨基酸及其衍生物代谢在结直肠癌中的关键作用 | 首次整合批量转录组和单细胞转录组数据,结合多种机器学习方法构建MAAD相关预后模型,并实验验证LSM8基因的功能 | 研究样本量有限,需要更大规模的数据验证模型的普适性 | 探索氨基酸及其衍生物代谢在结直肠癌进展中的作用,识别潜在治疗靶点 | 结直肠癌患者数据和结直肠癌细胞系 | 机器学习 | 结直肠癌 | 转录组测序,单细胞转录组测序,基因敲低实验 | 机器学习预后模型 | 转录组数据,单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
9802 | 2025-10-07 |
Identification of FDFT1 and PGRMC1 as New Biomarkers in Nonalcoholic Steatohepatitis (NASH)-Related Hepatocellular Carcinoma by Deep Learning
2025, Journal of hepatocellular carcinoma
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JHC.S505752
PMID:40206734
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研究论文 | 本研究通过深度学习技术识别出FDFT1和PGRMC1作为非酒精性脂肪性肝炎相关肝细胞癌的新型生物标志物 | 首次结合深度学习、WGCNA和PPI网络分析筛选NASH相关HCC的特征基因,并发现FDFT1和PGRMC1在胆固醇代谢通路中的关键作用 | 研究主要基于生物信息学分析和动物模型验证,尚未进行大规模临床样本验证 | 探索NASH相关肝细胞癌的新型生物标志物 | 非酒精性脂肪性肝病小鼠模型和NASH相关肝细胞癌的基因表达数据 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 深度学习,实时定量PCR,单细胞测序分析,WGCNA,蛋白质相互作用网络分析 | 神经网络 | 基因组数据,基因表达数据 | NAFLD小鼠模型 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
9803 | 2025-10-07 |
Neutrophils in Rheumatoid Arthritis Synovium: Implications on Disease Activity and Inflammation State
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S503144
PMID:40206809
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研究论文 | 通过分析类风湿关节炎患者滑膜组织中的中性粒细胞分布,探讨其与疾病活动度和炎症状态的关系 | 首次结合组织病理学和单细胞RNA测序技术,系统揭示滑膜中性粒细胞在特定RA亚型中的临床意义 | 回顾性研究设计,样本量有限(55例患者),缺乏外部验证队列 | 研究中性粒细胞在类风湿关节炎滑膜组织中的分布特征及其临床意义 | 55例类风湿关节炎患者的滑膜组织和临床数据 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | H&E染色, 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 基因表达数据 | 55例RA患者滑膜组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9804 | 2025-10-07 |
Prognostic and immunotherapeutic potential of disulfidptosis-associated signature in pancreatic cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1568976
PMID:40207217
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研究论文 | 本研究构建了一个基于二硫化物死亡相关基因的胰腺癌预后特征,并评估其在免疫治疗预测中的潜力 | 首次在胰腺导管腺癌中系统研究二硫化物死亡的作用,构建了8基因预后特征,并揭示了其与肿瘤微环境中癌症相关成纤维细胞的相互作用机制 | 研究主要基于生物信息学分析,需要更多实验验证;样本量相对有限 | 阐明二硫化物死亡在胰腺导管腺癌中的临床意义和免疫治疗预测价值 | 胰腺导管腺癌患者 | 生物信息学 | 胰腺癌 | RNA测序,单细胞RNA测序,空间转录组,微阵列分析 | LASSO-Cox回归模型 | 转录组数据,单细胞数据,空间转录组数据 | 20对PDAC样本和癌旁正常组织,多个外部PDAC队列 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组,bulk RNA-seq | NA | NA |
9805 | 2025-10-07 |
CD14+ monocytes: the immune communication hub in early vasculitis symptoms of Kawasaki disease
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1557231
PMID:40207219
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了川崎病血管炎早期免疫细胞通讯的动态变化,发现CD14+单核细胞在细胞间通讯中发挥核心作用 | 首次利用单细胞测序技术系统揭示川崎病病程中免疫细胞通讯网络,识别出CD14+单核细胞作为通讯枢纽的关键作用及SELPLG、ITK等重要信号基因 | 样本量较小(仅7例患儿),需要在更大队列中验证发现 | 研究川崎病病程中免疫细胞通讯的变化并识别潜在生物标志物 | 川崎病患儿外周血单个核细胞 | 单细胞生物学 | 川崎病 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 7例川崎病患儿 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9806 | 2025-10-07 |
Integrating machine learning and multi-omics analysis to reveal nucleotide metabolism-related immune genes and their functional validation in ischemic stroke
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1561544
PMID:40207230
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研究论文 | 本研究整合机器学习与多组学分析,揭示了与缺血性卒中相关的核苷酸代谢免疫基因及其功能验证 | 首次系统整合机器学习算法(LASSO回归、SVM-RFE、随机森林)与多组学数据(单细胞RNA测序、分子对接)来识别核苷酸代谢相关的免疫基因,并通过体内实验进行功能验证 | 研究依赖于公共数据库的基因表达数据,样本来源和数量可能存在限制;体内实验验证的规模有限 | 识别与缺血性卒中相关的核苷酸代谢基因,探索其在疾病机制中的作用,为诊断和治疗提供新策略 | 缺血性卒中患者基因表达数据和小鼠模型 | 机器学习 | 缺血性卒中 | 单细胞RNA测序,分子对接,差异表达分析,加权基因共表达网络分析 | LASSO回归,SVM-RFE,随机森林 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的缺血性卒中基因表达数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9807 | 2025-10-07 |
Understanding the heterogeneity of natural killer cells at the maternal-fetal interface: implications for pregnancy health and disease
2024-Nov-14, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaae040
PMID:39570646
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综述 | 本文系统回顾了母胎界面自然杀伤细胞的异质性研究及其与妊娠健康的关系 | 整合了基于表面标志物、功能分子和单细胞RNA测序的NK细胞分类方法,并总结了dNK细胞分化途径 | 作为综述文章,未提供原始实验数据验证 | 探讨母胎界面NK细胞异质性及其在妊娠相关疾病中的作用 | 子宫NK细胞亚群和蜕膜NK细胞 | 单细胞生物学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文献数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9808 | 2025-10-07 |
Expansion effect of romiplostim on hematopoietic stem and progenitor cells versus thrombopoietin and eltrombopag
2024-Nov, International journal of hematology
IF:1.7Q3
DOI:10.1007/s12185-024-03853-6
PMID:39302624
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研究论文 | 比较罗米司亭与重组人血小板生成素和艾曲波帕对造血干细胞和祖细胞的体外扩增效果及分子机制 | 首次在单细胞水平揭示罗米司亭对最原始造血干细胞亚群中RHOA信号通路相关分子变化的特异性诱导作用 | 仅为体外研究,需要进一步体内实验验证 | 阐明罗米司亭与其他TPO受体激动剂的生物学效应差异 | 人CD34+造血干细胞和祖细胞 | 单细胞生物学 | 血液疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9809 | 2025-10-07 |
Gene expansions contributing to human brain evolution
2024-Sep-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.26.615256
PMID:39386494
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研究论文 | 本研究通过分析完整的人类基因组序列,识别了与人类大脑进化相关的基因复制事件 | 首次利用完整端粒到端粒人类基因组序列(T2T-CHM13)系统识别人类特异性基因复制,并通过斑马鱼模型验证这些基因在大脑发育中的功能 | 研究主要关注基因复制事件,可能忽略了其他类型的基因组变异对大脑进化的贡献 | 探索人类大脑进化过程中基因复制事件的贡献 | 人类基因组序列、大脑转录组数据、斑马鱼模型 | 基因组学 | NA | 长读长DNA测序、单细胞RNA-seq、CRISPR基因编辑 | NA | 基因组序列、转录组数据、图像、行为数据 | 200个不同祖先背景的现代人类样本,多个斑马鱼模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 长读长测序 | NA | NA |
9810 | 2025-10-07 |
A multi-platform analysis of human gingival crevicular fluid reveals ferroptosis as a relevant regulated cell death mechanism during the clinical progression of periodontitis
2024-05-27, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-024-00306-y
PMID:38802345
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研究论文 | 通过多平台分析揭示铁死亡在牙周炎临床进展中的重要作用 | 首次在牙周炎患者中发现与铁死亡相关的蛋白质和生物学过程 | 样本量较小(16名患者),观察时间有限(12周) | 研究铁死亡在牙周炎进展中的作用机制 | 牙周炎患者的龈沟液和牙龈组织 | 生物信息学 | 牙周炎 | 蛋白质组学分析、单细胞RNA测序、Western blot、生物信息学分析 | NA | 蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据、临床数据 | 16名牙周炎诊断患者,12周临床监测 | NA | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | 使用公共单细胞RNA测序数据集GSE164241 |
9811 | 2025-10-07 |
Machine learning and deep learning to identifying subarachnoid haemorrhage macrophage-associated biomarkers by bulk and single-cell sequencing
2024-05, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18296
PMID:38702954
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量转录组测序分析蛛网膜下腔出血大鼠模型中的巨噬细胞亚群,并开发诊断模型识别关键生物标志物 | 结合单细胞测序和批量RNA测序识别SAH特异性巨噬细胞亚群,并开发基于机器学习和卷积神经网络的诊断模型 | 需要进一步的实验和临床研究来验证研究结果并探索治疗靶点的临床意义 | 识别蛛网膜下腔出血巨噬细胞相关生物标志物以改进诊断和治疗策略 | 蛛网膜下腔出血大鼠模型的脑组织样本 | 机器学习, 深度学习 | 蛛网膜下腔出血 | 单细胞转录组测序, 批量RNA测序 | 卷积神经网络, 机器学习算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
9812 | 2025-10-07 |
The Tabula Sapiens: A multiple-organ, single-cell transcriptomic atlas of humans
2022-05-13, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abl4896
PMID:35549404
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研究论文 | 构建了一个包含24种人类组织器官、近50万个细胞的单细胞转录组图谱 | 首次使用同一供体的多个组织器官创建单细胞转录组图谱,能够分析T细胞在不同组织间的克隆分布、B细胞的组织特异性突变率以及共享细胞类型在不同组织中的细胞周期状态 | NA | 创建人类多器官单细胞转录组参考图谱,研究细胞类型在不同组织中的分布和基因表达差异 | 人类24种不同组织和器官的细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 近500,000个细胞,来自24种不同组织器官,多数来自同一供体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9813 | 2025-10-07 |
Integrated bioinformatics analysis to develop diagnostic models for malignant transformation of chronic proliferative diseases
2025-Jun, Blood science (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/BS9.0000000000000226
PMID:40201199
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研究论文 | 通过整合生物信息学分析开发慢性增殖性疾病恶性转化的诊断模型 | 首次识别PV和AML之间的共享基因并构建诊断列线图,为AML相关PV的诊断提供新途径 | 慢性疾病转化特性使纵向高通量测序研究复杂化 | 开发慢性增殖性疾病恶性转化的诊断模型,解决早期检测和干预的挑战 | 真性红细胞增多症(PV)和急性髓系白血病(AML)患者 | 生物信息学 | 血液系统恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序, 分子对接, 机器学习算法 | 机器学习, 列线图 | 基因表达数据, 临床样本 | 公共数据集和临床标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9814 | 2025-10-07 |
Single-Cell Transcriptomics Identifies a Prominent Role for the MIF-CD74 Axis in Myasthenia Gravis Thymus
2025-May, Neurology(R) neuroimmunology & neuroinflammation
DOI:10.1212/NXI.0000000000200384
PMID:40117520
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示MIF-CD74轴在重症肌无力胸腺中的关键作用 | 首次构建EOMG患者胸腺淋巴细胞的单细胞转录谱,发现B细胞通过MIF-CD74轴获得生存信号的新机制 | 样本量较小(11例患者),仅针对未接受免疫治疗的患者 | 探究早发型AChR抗体阳性重症肌无力的胸腺增生机制 | 11例未接受免疫治疗的EOMG患者的胸腺组织 | 单细胞组学 | 重症肌无力 | 单细胞RNA测序, 多重组织染色, ELISA | NA | 单细胞转录组数据, 组织图像, 蛋白浓度数据 | 11例EOMG患者胸腺样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9815 | 2025-10-07 |
Regulatory T Cell Infiltration-Driven Single-Cell Transcriptomic Analysis Identifies SAP18 as a Prognostic Marker for Esophageal Squamous Cell Carcinoma
2025-Apr-10, Journal of gastrointestinal cancer
IF:1.6Q4
DOI:10.1007/s12029-025-01174-3
PMID:40208395
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研究论文 | 通过整合单细胞转录组数据构建预后模型,鉴定SAP18作为食管鳞状细胞癌的预后标志物 | 首次整合单细胞转录组数据构建Tregs相关预后模型,并发现SAP18在ESCC中的关键作用 | 研究样本量有限,需要更大规模临床验证 | 开发食管鳞状细胞癌的预后模型并识别关键生物标志物 | 食管鳞状细胞癌患者临床标本和细胞系 | 单细胞转录组学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR, Western blot, 免疫组化, 体外功能实验 | 预后预测模型 | 转录组数据, 单细胞数据, 临床数据 | 临床标本和细胞系(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
9816 | 2025-10-07 |
Comprehensive bioinformatics analysis identified HMGB3 as a promising immunotherapy target for glioblastoma multiforme
2025-Apr-07, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02235-6
PMID:40192954
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研究论文 | 通过生物信息学分析鉴定HMGB3作为胶质母细胞瘤免疫治疗的潜在靶点 | 首次通过单细胞RNA测序和批量RNA-seq综合分析HMGB3在GBM中的异质性和免疫抑制作用 | 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证 | 探索GBM发展机制并寻找相关预后生物标志物 | 胶质母细胞瘤组织和肿瘤微环境 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA-seq, 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA-seq | NA | NA |
9817 | 2025-10-07 |
Integrating multi-omics data reveals the antitumor role and clinical benefits of gamma-delta T cells in triple-negative breast cancer
2025-Apr-07, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-14029-8
PMID:40197136
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据揭示了γδ T细胞在三阴性乳腺癌中的抗肿瘤作用及临床价值 | 首次系统整合单细胞测序、影像组学和基因组学数据,揭示γδ T细胞在三阴性乳腺癌中的特异性抗肿瘤机制和临床预后价值 | 研究结果主要基于三阴性乳腺癌,在其他乳腺癌亚型中的适用性有限 | 探究γδ T细胞在乳腺癌中的作用机制和临床意义 | 乳腺癌患者,特别是三阴性乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 基因组分析, 免疫组化, 影像组学 | 影像组学模型 | 基因组数据, 转录组数据, 影像数据, 病理图像 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 基因组分析, 免疫组化, 影像组学 | NA | NA |
9818 | 2025-10-07 |
CXCL12/CXCR4 axis mediates CD8 + T cell overactivation in the progression of viral myocarditis
2025-Apr-04, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06394-6
PMID:40186195
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示CXCL12/CXCR4轴在病毒性心肌炎中驱动CD8+T细胞过度活化的新机制 | 首次发现CXCL12/CXCR4轴介导CD8+T细胞在暴发性心肌炎中的过度活化作用 | 研究主要聚焦于儿科患者和小鼠模型,需要在更广泛人群中验证 | 探究病毒性心肌炎中免疫细胞异常活化的分子机制 | 儿科暴发性心肌炎患者外周血单个核细胞和CVB3诱导的病毒性心肌炎小鼠模型 | 单细胞基因组学 | 心肌炎 | 单细胞RNA测序 | 小鼠疾病模型 | 单细胞转录组数据 | 儿科患者急性期和恢复期外周血单个核细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9819 | 2025-10-07 |
NAALAD2 mutations disrupt the fate of photoreceptor cells and retinal pigment epithelial cells during early retinal development
2025-Apr-02, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2025.107724
PMID:40185296
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研究论文 | 本研究通过发现NAALAD2基因新突变并利用点突变敲入小鼠模型,揭示了该突变通过影响光感受器细胞和视网膜色素上皮细胞的命运导致病理性近视的机制 | 首次报道人类NAALAD2基因突变与病理性近视的关联,并通过单细胞RNA测序揭示了该突变对视网膜细胞组成和转录谱的影响 | 研究基于单个中国家族的突变发现,样本规模有限,需要更大样本验证 | 探究NAALAD2突变在病理性近视发病机制中的作用 | NAALAD2点突变敲入小鼠模型,特别是视锥细胞、视杆细胞和视网膜色素上皮细胞 | 单细胞组学 | 病理性近视 | 单细胞RNA测序 | 点突变敲入小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 一个中国家族和对应的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9820 | 2025-10-07 |
S100A8/A9 innate immune signaling as a distinct mechanism driving progression of smoking-related breast cancers
2025-Apr, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03276-5
PMID:39856330
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研究论文 | 本研究揭示了吸烟通过S100A8/A9先天免疫信号通路促进乳腺癌进展的新机制 | 首次发现α7 nAChR-S100A8/A9-Syntaphilin免疫信号模块驱动尼古丁诱导的肿瘤进展,并识别出吸烟相关乳腺癌作为侵袭性乳腺癌的独特亚型 | NA | 探索吸烟促进乳腺癌进展的分子机制 | 乳腺癌细胞、吸烟相关的乳腺癌患者样本 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |