单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 9761 - 9780 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9761 | 2025-10-07 |
Hepatic stellate cell-derived microfibrillar-associated protein 2 prevents liver fibrosis by regulating extracellular matrix and inflammation
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.109771
PMID:40213670
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研究论文 | 本研究揭示了肝星状细胞来源的微纤维相关蛋白2通过调控细胞外基质和炎症反应预防肝纤维化的作用机制 | 首次发现MFAP-2在肝纤维化中的保护作用，并阐明其通过调节肝星状细胞与巨噬细胞相互作用影响纤维化进程的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证尚需进一步研究 | 探究MFAP-2在肝纤维化发生和消退过程中的作用及分子机制 | 人类组织芯片、小鼠肝纤维化模型（CCl4注射和胆管结扎） | 分子病理学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 组织学分析, 生化分析 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 组织图像 | 人类组织阵列和小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 9762 | 2025-10-07 |
A distinct subgroup with Schwann-like differentiation presents immune resistance and poor prognosis in plantar melanoma
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.99526
PMID:40213656
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了足底黑色素瘤中雪旺细胞样分化亚群的演化轨迹及其与免疫抵抗和不良预后的关联 | 首次发现足底黑色素瘤中存在向雪旺细胞样分化的独特演化轨迹，并揭示该过程受特定转录因子调控 | 样本量相对有限，需要更大规模研究验证 | 解析足底黑色素瘤的肿瘤异质性、细胞亚群演化及其对免疫环境和预后的影响 | 足底黑色素瘤患者肿瘤组织和正常组织 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,多重免疫组化,单细胞多组学分析 | NA | 单细胞基因表达数据,空间转录组数据,染色质可及性数据,临床预后数据 | 20例足底黑色素瘤和6例正常样本的218,021个细胞，以及68例黑色素瘤患者的批量RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,单细胞多组学,批量RNA测序 | NA | NA |
| 9763 | 2025-10-07 |
O-GlcNAcylation of circadian clock protein Bmal1 impairs cognitive function in diabetic mice
2024-Nov, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-024-00263-6
PMID:39375536
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研究论文 | 本研究揭示了高血糖通过O-GlcNAc糖基化修饰生物钟蛋白Bmal1导致糖尿病小鼠认知功能障碍的分子机制 | 首次发现Bmal1的O-GlcNAc糖基化修饰在糖尿病认知功能障碍中的关键作用，并开发了特异性阻断该修饰的短肽治疗方法 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 阐明糖尿病相关认知功能障碍的分子机制 | 糖尿病小鼠的海马神经元 | 分子生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 9764 | 2025-10-07 |
Accurate and Flexible Single Cell to Spatial Transcriptome Mapping with Celloc
2024-Oct, Small science
IF:11.1Q1
DOI:10.1002/smsc.202400139
PMID:40212250
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研究论文 | 开发了一种名为Celloc的新方法，用于实现单细胞RNA测序与空间转录组数据之间的精确映射 | 结合图注意力自编码器和综合损失函数，实现灵活的单细胞到空间位点映射，既能解析每个位点内的细胞组成，也能为scRNA-seq数据中的每个细胞分配空间位置 | NA | 解决单细胞RNA测序数据缺乏空间信息和空间转录组数据分辨率有限的问题 | 单细胞RNA测序数据和空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组 | 图注意力自编码器 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组 | NA | NA |
| 9765 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing reveals VEGFR as a potential target for CAR-T cell therapy in chordoma
2024-Jun, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02635-5
PMID:38605247
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研究论文 | 通过单细胞测序鉴定VEGFR作为脊索瘤CAR-T细胞治疗的潜在靶点 | 首次在脊索瘤中通过单细胞测序鉴定VEGFR作为CAR-T治疗靶点，并开发了同时靶向VEGFR和TGF-β的双功能CAR-T细胞 | 样本量较小（14例），仅进行了体外实验验证 | 寻找脊索瘤免疫治疗新靶点并开发有效CAR-T疗法 | 脊索瘤患者肿瘤样本和CAR-T细胞 | 单细胞测序 | 脊索瘤 | 单细胞RNA测序，CAR-T细胞技术 | NA | 单细胞转录组数据 | 14例脊索瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9766 | 2025-10-07 |
Binned multinomial logistic regression for integrative cell-type annotation
2023-Dec, The annals of applied statistics
DOI:10.1214/23-aoas1769
PMID:40206429
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研究论文 | 提出一种分箱多项逻辑回归方法，用于整合不同分辨率标签的单细胞数据集进行细胞类型注释 | 开发了能够整合具有不一致分辨率标签的多个数据集的统一模型，解决了现有监督学习方法在此方面的挑战 | 需要解决非凸优化问题，计算复杂度可能较高 | 开发自动化的细胞类型注释方法，整合多数据集的不一致标签 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型分类 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 分箱多项逻辑回归，块近端梯度下降算法 | 基因表达数据 | 10个单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9767 | 2025-10-07 |
Transcriptome analysis reveals the potential role of neural factor EN1 for long-terms survival in estrogen receptor-independent breast cancer
2025-Jun-18, Molecular therapy. Oncology
DOI:10.1016/j.omton.2025.200965
PMID:40207200
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研究论文 | 通过转录组分析揭示神经因子EN1在雌激素受体非依赖性乳腺癌长期生存中的潜在作用 | 首次发现神经相关通路在TNBC患者10年无复发生存中的差异富集，并开发了基于机器学习的早期复发指数预测模型 | 研究主要基于回顾性数据分析，需要进一步实验验证EN1的功能机制 | 探索雌激素受体阴性乳腺癌复发相关的生物标志物和生物学过程 | 乳腺癌患者，特别是三阴性乳腺癌和HER2阳性乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 机器学习 | 机器学习模型 | 转录组数据 | 285个癌和癌旁样本（来自155名TNBC患者）及7,449名乳腺癌患者的11个独立公共队列数据 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9768 | 2025-10-07 |
Potential Crosstalk Between ANXA1+ Epithelial Cells and FABP4+ TAM Cells of Ferroptosis-Related Molecular Clusters Promotes an Immunosuppressive Microenvironment in Non-Small Cell Lung Cancer
2025-May, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.23899
PMID:40040274
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了铁死亡相关分子簇在非小细胞肺癌中的异质性，发现ANXA1+上皮细胞与FABP4+TAM细胞间的相互作用促进免疫抑制微环境形成 | 首次在单细胞水平系统揭示铁死亡相关分子簇在NSCLC中的异质性，发现ANXA1-FPR2/FPR1配体-受体对在免疫抑制微环境形成中的关键作用 | 样本量相对有限（18例患者），需要更大规模研究验证 | 探究铁死亡如何通过重塑肿瘤微环境影响非小细胞肺癌进展 | 非小细胞肺癌患者肿瘤组织 | 单细胞转录组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 风险评分模型 | 单细胞转录组数据 | 85,562个细胞，来自18例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9769 | 2025-10-07 |
Differential expression of endothelial derived galectins in response to shear stress
2025-Apr-15, Experimental cell research
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.yexcr.2025.114521
PMID:40107440
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研究论文 | 本研究探讨剪切应力对内皮细胞半乳糖凝集素表达的调控作用 | 首次揭示不同类型剪切应力对内皮细胞半乳糖凝集素表达的差异调控 | 研究主要基于体外细胞模型，需要更多体内验证 | 研究剪切应力对内皮细胞半乳糖凝集素表达的调控机制 | 人脐静脉内皮细胞(HUVEC)和人动脉内皮细胞(HAEC) | 细胞生物学 | 心血管疾病 | qPCR, 免疫荧光成像, ELISA, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9770 | 2025-10-07 |
GOLM1 Promotes Atherogenesis by Activating Macrophage EGFR-ERK Signaling Cascade
2025-Apr-11, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.325880
PMID:40026146
|
研究论文 | 本研究揭示了GOLM1通过激活巨噬细胞EGFR-ERK信号通路促进动脉粥样硬化发生的新机制 | 首次发现GOLM1作为动脉粥样硬化的致病介质，通过结合EGFR激活ERK信号通路促进巨噬细胞摄取LDL | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证仍需进一步开展 | 探讨GOLM1在动脉粥样硬化发生发展中的作用机制 | 动脉粥样硬化患者样本和Apoe-/-基因修饰小鼠 | 分子病理学 | 心血管疾病 | 免疫染色, ELISA, 单细胞测序, 磷酸化蛋白质组学, 分子生物学技术 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 单细胞测序数据 | 患者和Apoe-/-小鼠的血清及病变组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9771 | 2025-10-07 |
March2 Alleviates Aortic Aneurysm/Dissection by Regulating PKM2 Polymerization
2025-Apr-11, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.325049
PMID:40079144
|
研究论文 | 本研究揭示了E3泛素连接酶March2通过调节PKM2聚合抑制血管平滑肌细胞凋亡，从而缓解主动脉瘤/夹层的新机制 | 首次发现March2通过促进PKM2的K33连接多聚泛素化调节其二聚体向四聚体转换，抑制组蛋白H3K18乳酸化修饰和p53驱动的细胞凋亡 | 研究主要基于动物模型，临床转化价值需进一步验证 | 探究March2在主动脉瘤/夹层发病机制中的作用及分子机制 | 人类AAD组织样本、March2基因敲除小鼠模型、血管平滑肌细胞 | 心血管疾病研究 | 主动脉瘤/夹层 | 单细胞RNA测序,CUT&Tag,CUT&Tag-qPCR,蛋白质免疫共沉淀 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,蛋白质相互作用数据,表观遗传修饰数据 | 人类AAD组织样本和β-氨基丙腈单富马酸盐诱导的小鼠AAD模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9772 | 2025-10-07 |
Lost in translation: conserved amino acid usage despite extreme codon bias in foraminifera
2025-Apr-09, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03916-24
PMID:40042280
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和系统基因组学分析有孔虫的密码子使用模式，发现尽管核苷酸组成存在极端变异，但氨基酸使用高度保守 | 揭示了在极端密码子偏好性条件下氨基酸使用仍保持保守的悖论现象，挑战了传统关于氨基酸使用受GC压力驱动的认知 | 研究对象主要为不可培养的微生物真核生物，实验验证受限 | 探索有孔虫中密码子使用模式和分子进化规律 | 有孔虫（单细胞真核生物） | 基因组学 | NA | 单细胞转录组学, 系统基因组学 | NA | 转录组数据, 系统发育数据 | 49个个体代表28个属，包含1,044个基因家族 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9773 | 2025-10-07 |
Generation of induced alveolar assembloids with functional alveolar-like macrophages
2025-Apr-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58450-w
PMID:40199883
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研究论文 | 开发了一种结合人多能干细胞来源肺泡上皮类器官和诱导巨噬细胞的共培养系统，创建功能性诱导肺泡组装体 | 首次创建了包含功能性肺泡样巨噬细胞的诱导肺泡组装体，能够模拟人类肺部发育和免疫反应 | NA | 研究肺泡上皮细胞与巨噬细胞之间的相互作用及其在肺部发育和疾病中的作用 | 人类多能干细胞来源的肺泡上皮细胞和诱导巨噬细胞 | 干细胞生物学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序, 功能分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 功能分析数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9774 | 2025-10-07 |
Single-cell atlas of endothelial and mural cells across primary and metastatic brain tumors
2025-Apr-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.02.022
PMID:40107274
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研究论文 | 通过单细胞分析构建了原发性和转移性脑肿瘤中内皮细胞和周细胞的综合图谱 | 首次全面比较了不同类型脑肿瘤（包括低级别胶质瘤、高级别胶质母细胞瘤和脑转移瘤）中血脑屏障细胞的异质性 | 研究样本类型和数量可能有限，需要进一步验证 | 理解脑肿瘤特异性血管特征，为血管和免疫靶向治疗提供基础 | 非肿瘤脑组织、IDH突变低级别胶质瘤、IDH野生型高级别胶质母细胞瘤、多种原发性肿瘤的脑转移瘤 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序, 空间分析 | NA | RNA测序数据, 空间数据 | 多种脑组织样本（包括正常组织和不同类型肿瘤） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 9775 | 2025-10-07 |
Lipid metabolism analysis reveals that DGAT1 regulates Th17 survival by controlling lipid peroxidation in uveitis
2025-Apr-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.184072
PMID:40197365
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现DGAT1通过调控脂质过氧化过程影响Th17细胞存活，为葡萄膜炎治疗提供新靶点 | 首次揭示DGAT1在葡萄膜炎中通过调控脂肪酸代谢和脂质过氧化影响Th17细胞存活的新机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验，临床验证样本有限 | 阐明脂质代谢在葡萄膜炎发病机制中的作用，特别是对Th17细胞存活的影响 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠的颈引流淋巴结细胞、VKH病患者CD4+ T细胞 | 单细胞生物学 | 葡萄膜炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | EAU小鼠模型和VKH病患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9776 | 2025-10-07 |
Unique and shared transcriptomic signatures underlying localized scleroderma pathogenesis identified using interpretable machine learning
2025-Apr-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.185758
PMID:40197368
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析和可解释机器学习方法，揭示局限性硬皮病的分子机制 | 首次在成人和儿童局限性硬皮病患者中应用可解释的潜在因子分析机器学习框架SLIDE，识别细胞类型特异性决定因素和共享信号机制 | NA | 探究局限性硬皮病的发病机制和炎症驱动的纤维化过程 | 成人和儿童局限性硬皮病患者及健康对照 | 机器学习 | 局限性硬皮病 | 单细胞RNA测序 | SLIDE（潜在因子回归框架） | 单细胞转录组数据 | 成人和儿童局限性硬皮病患者及健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9777 | 2025-10-07 |
Identification of DNA damage and repair gene-related markers in pancreatic ductal adenocarcinoma by single-cell and bulk RNA sequencing
2025-Apr-08, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02293-w
PMID:40198431
|
研究论文 | 通过单细胞和批量RNA测序识别胰腺导管腺癌中DNA损伤修复相关基因标志物并构建预后风险模型 | 创新性地整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据构建DNA损伤修复相关预后模型 | NA | 研究DNA损伤反应在胰腺导管腺癌发展中的作用并开发预后评估工具 | 胰腺导管腺癌患者 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | LASSO回归,单变量Cox回归 | 基因表达数据 | 来自GEO、TCGA和GTEx数据库的样本 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 9778 | 2025-10-07 |
Acinar cells modulate the tumor microenvironment through the promotion of M1 macrophage polarization via macrophage endocytosis in pancreatic cancer
2025-Apr-08, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02244-5
PMID:40198509
|
研究论文 | 本研究揭示了胰腺腺泡细胞通过促进巨噬细胞M1极化调节胰腺癌肿瘤微环境的新机制 | 首次发现PRSS1和CTRB1作为腺泡细胞标志基因，通过巨噬细胞内吞作用促进M1极化，从而抑制肿瘤恶性表型 | 研究主要基于生物信息学分析和细胞系实验，缺乏体内动物模型验证 | 探索胰腺癌中与M1巨噬细胞相关的关键基因及其调控机制 | 胰腺导管腺癌患者样本、肿瘤细胞系、免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞测序、免疫组化、细胞培养、生物信息学分析 | WGCNA、PPI网络分析、生存分析 | 基因表达数据、单细胞测序数据、临床数据 | TCGA-PAAD队列和ICGC-PACA队列患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 9779 | 2025-10-07 |
LRP8-dependent cholesterol metabolism modulates mTORC1 signaling and apoptotic pathways in multiple myeloma
2025-Apr-08, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07625-w
PMID:40199866
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研究论文 | 本研究揭示了LRP8通过调节多发性骨髓瘤细胞胆固醇代谢影响mTORC1信号通路和细胞凋亡的机制 | 首次发现LRP8作为多发性骨髓瘤胆固醇代谢的关键调控因子，并阐明其通过mTORC1通路和自噬影响细胞凋亡的新机制 | 研究主要基于临床数据分析和动物模型验证，缺乏更大规模的前瞻性临床研究验证 | 探究多发性骨髓瘤中胆固醇代谢异常的分子机制及其对疾病进展的影响 | 多发性骨髓瘤细胞和703例新诊断多发性骨髓瘤患者 | 肿瘤代谢研究 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序，转录组分析，小鼠异种移植肿瘤模型 | 动物疾病模型 | 临床数据，转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 703例新诊断多发性骨髓瘤患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9780 | 2025-10-07 |
Single-nucleus and spatial transcriptomics identify brain landscape of gene regulatory networks associated with behavioral maturation in honeybees
2025-Apr-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58614-8
PMID:40199930
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研究论文 | 本研究通过单核RNA测序和空间转录组学技术，探索蜜蜂从护理到觅食行为成熟过程中大脑基因调控网络的细胞类型和空间异质性 | 首次整合单核RNA测序和空间转录组学数据，揭示了蜜蜂行为转变过程中特定基因调控网络（如stripe调节子）在特定脑细胞类型中的空间激活模式 | 研究主要聚焦于蜜蜂模型，结果在其他物种中的普适性需要进一步验证；人工控制年龄的群体设置可能无法完全反映自然状态下的行为转变 | 探索大脑基因调控网络与行为成熟之间的关联机制 | 蜜蜂大脑细胞，特别是与空间学习和导航相关的Keyon细胞 | 空间转录组学 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |