单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27279 篇文献，本页显示第 9621 - 9640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9621 | 2024-08-14 |
Sex-specific circulating unconventional neutrophils determine immunological outcome of auto-inflammatory Behçet's uveitis
2024-May-04, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-024-00671-2
PMID:38704363
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析、中性粒细胞特异性基因敲除和转移实验，揭示了两种非常规（干扰素-α响应和T细胞调节）中性粒细胞亚群的失调导致男性在自身炎症性Behçet眼炎中的发病率、严重程度和预后较差 | 首次在单细胞分辨率下识别出正常和自身炎症条件下中性粒细胞组成的广泛性别特异性异质性，并发现非常规中性粒细胞亚群在性别特异性治疗目标中的重要性 | NA | 研究中性粒细胞在性别特异性炎症疾病中的机制 | 中性粒细胞及其在自身炎症性Behçet眼炎中的作用 | 免疫学 | 自身炎症性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 9622 | 2024-08-14 |
Diabetes Accelerates Steatohepatitis in Mice: Liver Pathology and Single-Cell Gene Expression Signatures
2024-05, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2024.01.007
PMID:38309428
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研究论文 | 本研究探讨了糖尿病对非酒精性脂肪性肝炎的影响，并建立了一种新的糖尿病性非酒精性脂肪性肝炎小鼠模型 | 本研究建立了新的糖尿病性非酒精性脂肪性肝炎模型，并利用单细胞RNA测序分析了糖尿病对肝脏非实质细胞的影响 | NA | 研究糖尿病如何加速小鼠的非酒精性脂肪性肝炎 | C57BL/6J雄性小鼠 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达 | NA |
| 9623 | 2024-08-14 |
Age-related dysregulation of the retinal transcriptome in African turquoise killifish
2024-Mar-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.21.581372
PMID:38559206
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研究论文 | 研究使用非洲蓝绿杀鱼作为模型，通过批量和单细胞RNA测序分析不同年龄组的视网膜转录组变化，揭示与年龄相关的视网膜退行性病变和视觉下降的分子机制 | 首次在非洲蓝绿杀鱼模型中结合批量和单细胞RNA测序技术，揭示了视网膜细胞类型特异性基因表达的变化，以及与年龄相关的分子通路变化 | 研究主要集中在分子层面，未来研究需要进一步验证这些分子变化如何影响视网膜的生理功能 | 探究年龄对视网膜稳态的生理和分子影响，以及这些变化如何导致视觉下降和相关疾病 | 非洲蓝绿杀鱼的视网膜 | 数字病理学 | 视网膜疾病 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 三个年龄组（6周、12周和18周）的非洲蓝绿杀鱼视网膜样本 |
| 9624 | 2024-08-14 |
The GATA transcriptional program dictates cell fate equilibrium to establish the maternal-fetal exchange interface and fetal development
2024-Feb-20, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2310502121
PMID:38346193
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研究论文 | 本文研究了GATA转录因子在胎盘发育中的作用，特别是其在母胎交换界面建立中的关键角色 | 揭示了GATA2和GATA3在胎盘发育中的协同作用，以及它们在促进滋养层祖细胞向合体滋养层细胞分化中的重要性 | NA | 探讨GATA转录因子在胎盘发育和母胎交换界面建立中的作用 | 小鼠和人类的胎盘发育 | NA | 妊娠失败 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠胚胎和人类滋养层干细胞 |
| 9625 | 2024-08-14 |
Sleep Deprivation Impairs Intestinal Mucosal Barrier by Activating Endoplasmic Reticulum Stress in Goblet Cells
2024-01, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2023.10.004
PMID:37918798
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研究论文 | 研究探讨了睡眠剥夺对肠道杯状细胞的影响及其机制 | 首次揭示了睡眠剥夺通过激活内质网应激损害肠道黏膜屏障的机制 | 研究仅使用了小鼠模型，可能需要进一步的人体研究验证 | 探究睡眠剥夺对肠道杯状细胞的影响及其机制 | 肠道杯状细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 小鼠模型 |
| 9626 | 2024-08-14 |
Integrating Mendelian randomization and single-cell RNA sequencing to identify therapeutic targets of baicalin for type 2 diabetes mellitus
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1403943
PMID:39130628
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研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化分析和单细胞RNA测序技术，从遗传角度识别了黄芩苷治疗2型糖尿病的潜在治疗靶点 | 本研究创新性地结合了孟德尔随机化分析和单细胞RNA测序技术，为天然产物开发提供了一种新的分析框架 | 需要进一步的基础实验和临床研究来深入探讨2型糖尿病的分子机制 | 从遗传角度识别黄芩苷治疗2型糖尿病的潜在治疗靶点 | 黄芩苷的治疗靶点及其与胰岛细胞的关联 | NA | 2型糖尿病 | 孟德尔随机化分析, 单细胞RNA测序 | NA | 基因数据, 转录组数据 | 74,124例病例 vs. 824,006例对照, 9,978例病例 vs. 12,348例对照 |
| 9627 | 2024-08-14 |
Prognostic and immunotherapeutic significances of M2 macrophage-related genes signature in lung cancer
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.98044
PMID:39132146
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研究论文 | 研究旨在探讨M2巨噬细胞相关基因在肺癌患者中的免疫学意义，特别是构建一个风险评分来预测患者的预后和免疫治疗反应 | 开发了一种新的风险评分，通过识别和整合12个M2巨噬细胞相关基因，并探索了高风险和低风险组之间的潜在功能差异 | NA | 研究M2巨噬细胞相关基因在肺癌中的预后和免疫治疗意义 | 肺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | qRT-PCR, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用TCGA数据集和免疫治疗反应数据库进行分析 |
| 9628 | 2024-08-14 |
ELF4 was a prognostic biomarker and related to immune infiltrates in glioma
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.96886
PMID:39132148
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研究论文 | 本研究探讨了ELF4作为胶质瘤的预后生物标志物及其与免疫浸润的关系 | 首次详细分析了ELF4在胶质瘤病理中的作用及其对临床结果的影响，并揭示了ELF4在免疫调节中的作用 | NA | 研究ELF4在胶质瘤中的作用及其对预后的影响 | ELF4在胶质瘤中的表达及其与恶性表型和不良临床结果的关系 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组（ST-seq） | NA | 基因组数据 | 使用了CGGA、TCGA和Gravendeel等多个数据库的数据 |
| 9629 | 2024-08-14 |
Screening of PDSS1 as a Potential Biomarker for Hepatocellular Carcinoma Based on a Copper-Related Prognostic Signature through Bulk and Single-cell RNA-sequencing Analysis
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.96867
PMID:39132167
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研究论文 | 本研究通过批量和单细胞RNA测序分析，探讨了铜相关基因在肝细胞癌中的作用，并鉴定PDSS1作为潜在的生物标志物。 | 首次综合分析了铜死亡相关基因在肝细胞癌中的作用，并利用单细胞RNA测序技术揭示了PDSS1在肿瘤微环境中的表达特征和功能。 | NA | 旨在通过多组学方法全面分析铜死亡相关基因在肝细胞癌中的作用。 | 肝细胞癌中的铜死亡相关基因及其潜在生物标志物PDSS1。 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA测序 | LASSO回归分析 | RNA表达数据 | 使用了来自TCGA和ICGC数据库的数据，以及单细胞RNA测序数据。 |
| 9630 | 2024-08-14 |
The combination of single-cell and RNA sequencing analysis decodes the melanoma tumor microenvironment and identifies novel T cell-associated signature genes
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.96484
PMID:39132169
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了34个黑色素瘤样本，识别出与免疫治疗相关的T细胞标志性基因，并探讨了这些基因与免疫微环境的关系 | 首次揭示了标志性基因PEB4B与黑色素瘤免疫微环境的潜在关联，并通过多种免疫荧光和免疫浸润评估进行了探索 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术解码黑色素瘤肿瘤微环境，并识别新的T细胞相关标志性基因 | 黑色素瘤患者的免疫治疗反应 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO和COX回归分析 | 基因数据 | 34个黑色素瘤样本 |
| 9631 | 2024-08-14 |
Systematic analysis on the horse-shoe-like effect in PCA plots of scRNA-seq data
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbae109
PMID:39132288
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研究论文 | 本研究系统分析了单细胞RNA测序数据PCA图中马蹄形效应的现象 | 首次系统解释了PCA图中马蹄形效应，并提出了一个数学模型来解释这一现象 | NA | 探索并解释单细胞RNA测序数据PCA图中的马蹄形效应 | 单细胞RNA测序数据的PCA图中的马蹄形效应 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | PCA | 数据集 | 使用模拟和真实单细胞RNA测序数据集 |
| 9632 | 2024-08-14 |
First-in-human clinical trial of personalized neoantigen vaccines as early intervention in untreated patients with lymphoplasmacytic lymphoma
2023-Sep-21, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3315017/v1
PMID:37790486
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临床试验 | 本文报道了一项针对淋巴浆细胞性淋巴瘤（LPL）患者的个性化新抗原疫苗的首次人体临床试验，旨在早期干预未治疗的患者 | 该研究首次在人体中测试了一种新型治疗性DNA异型新抗原疫苗，并观察到疫苗对肿瘤免疫微环境的积极影响 | 研究样本量较小，且未探讨与其他治疗策略的联合应用 | 评估个性化新抗原疫苗在未治疗淋巴浆细胞性淋巴瘤患者中的安全性和有效性 | 淋巴浆细胞性淋巴瘤患者 | NA | 淋巴瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 9名患者 |
| 9633 | 2024-08-14 |
Spatial Transcriptomic Cell-type Deconvolution Using Graph Neural Networks
2023-Jun-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.10.532112
PMID:37333198
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研究论文 | 本文介绍了一种基于图神经网络的细胞类型反卷积模型STdGCN，用于空间转录组数据的细胞类型解析 | STdGCN是首个结合单细胞RNA测序数据表达谱和空间转录组数据空间定位信息进行细胞类型反卷积的模型 | NA | 开发一种新的方法来解析空间转录组数据中的细胞类型 | 空间转录组数据中的细胞类型 | 机器学习 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 图神经网络 | 转录组数据 | 多个空间转录组数据集，包括人类乳腺癌Visium数据集和人类心脏空间转录组数据集 |
| 9634 | 2024-08-14 |
Early Deregulation of Cholangiocyte NR0B2 During Primary Sclerosing Cholangitis
2023, Gastro hep advances
DOI:10.1016/j.gastha.2022.07.023
PMID:39130146
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研究论文 | 本文通过PubMed数据挖掘，研究了原发性硬化性胆管炎（PSC）中胆管细胞NR0B2的早期失调，并探讨了其与代谢和癌前重编程的关系。 | 首次揭示了PSC中胆管细胞NR0B2的早期失调及其在代谢和癌前重编程中的作用，并提出了针对NR0B2的治疗策略。 | NA | 研究PSC中胆管细胞NR0B2的早期失调及其在疾病进展中的作用。 | 胆管细胞NR0B2的表达及其在PSC中的作用。 | NA | 原发性硬化性胆管炎 | 转录组学 | NA | 转录组数据 | 多个PSC肝脏转录组训练和验证队列，FXR激动剂或FXR敲除小鼠肝脏转录组，Abcb4-/-小鼠PSC模型肝脏单细胞转录组。 |
| 9635 | 2024-08-14 |
A Transcriptionally Distinct Subpopulation of Healthy Acinar Cells Exhibit Features of Pancreatic Progenitors and PDAC
2021-08-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-21-0427
PMID:34049974
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研究论文 | 本研究重新分析了多个胰腺和胰腺导管腺癌（PDAC）的单细胞RNA测序数据集，发现了一组非恶性腺泡细胞亚群，称为腺泡边缘（AE）细胞，其转录组与典型腺泡细胞有显著差异 | 发现了在健康胰腺组织中随年龄增长的AE-like细胞亚群，这些细胞显示出胰腺祖细胞和癌前状态的特征，且这一现象在多个器官中普遍存在 | NA | 探讨胰腺导管腺癌（PDAC）肿瘤起源细胞的特征及其与健康细胞亚群的关系 | 胰腺和胰腺导管腺癌的单细胞RNA测序数据集 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个胰腺和PDAC样本 |
| 9636 | 2024-08-14 |
Single-cell RNA sequencing reveals ex vivo signatures of SARS-CoV-2-reactive T cells through 'reverse phenotyping'
2021-07-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-24730-4
PMID:34312385
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，通过'反向表型'方法识别并分析了COVID-19患者中SARS-CoV-2反应性T细胞的特征 | 首次采用'反向表型'方法，利用T细胞受体序列作为条形码，识别SARS-CoV-2反应性T细胞，并揭示了抗原特异性刺激引入的表型效应 | NA | 揭示SARS-CoV-2抗原反应性T细胞在体内的表型特征 | COVID-19患者的SARS-CoV-2反应性T细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 独立队列中的严重疾病患者呼吸道的T细胞 |
| 9637 | 2024-08-14 |
Single-cell transcriptomics reveals immune response of intestinal cell types to viral infection
2021-07, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.20209833
PMID:34309190
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研究论文 | 本文通过结合单细胞RNA测序和高度多重RNA荧光原位杂交技术，研究了人肠道类器官在人星状病毒感染下的免疫反应 | 开发了一种新框架，结合单细胞RNA测序和高度多重RNA荧光原位杂交技术，揭示了不同肠道上皮细胞系在病毒感染下的独特免疫反应 | NA | 探索人肠道上皮细胞在病毒感染下的个体免疫反应 | 人肠道类器官在人星状病毒感染下的免疫反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，高度多重RNA荧光原位杂交 | NA | RNA | NA |
| 9638 | 2024-08-14 |
Aortic heterogeneity across segments and under high fat/salt/glucose conditions at the single-cell level
2020-May, National science review
IF:16.3Q1
DOI:10.1093/nsr/nwaa038
PMID:34692110
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，分析了在正常和高血糖、高盐饮食或高脂肪摄入条件下，小鼠升主动脉、主动脉弓以及胸腹主动脉段的细胞异质性 | 首次揭示了主动脉不同段在单细胞水平上的异质性，并探讨了代谢病理条件对其的影响 | NA | 研究主动脉不同段在单细胞水平上的异质性及其在代谢病理条件下的变化 | 小鼠的升主动脉、主动脉弓、胸腹主动脉段细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 216,612个单细胞样本 |
| 9639 | 2024-08-13 |
Cold-adapted influenza vaccine carrying three repeats of a respiratory syncytial virus (RSV) fusion glycoprotein epitope site protects BALB/c mice and cotton rats against RSV infection
2024-Sep, Antiviral research
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.antiviral.2024.105960
PMID:38986872
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研究论文 | 本研究开发了一种携带三个呼吸道合胞病毒（RSV）融合糖蛋白表位重复序列的冷适应流感疫苗，用于保护BALB/c小鼠和棉鼠免受RSV感染 | 首次开发了一种携带RSV融合蛋白中和表位重复序列的冷适应流感疫苗，显示出双重保护作用 | 需要进一步的临床前和临床研究来验证其安全性和有效性 | 开发一种新型双价疫苗，用于预防流感和RSV感染 | BALB/c小鼠和棉鼠 | NA | 呼吸道病毒感染 | 反向遗传技术，单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞T细胞抗原受体（TCR）测序 | NA | RNA | BALB/c小鼠和棉鼠 |
| 9640 | 2024-08-13 |
Identification of autophagy-related signatures in nonalcoholic fatty liver disease and correlation with non-parenchymal cells of the liver
2024-Aug-12, Molecular omics
IF:3.0Q3
DOI:10.1039/d4mo00060a
PMID:38982979
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研究论文 | 本研究通过基因表达数据和生物信息学方法，识别了与非酒精性脂肪肝病相关的自噬相关枢纽基因，并探讨了这些基因与肝脏非实质细胞的关系 | 首次通过加权基因共表达网络分析和单细胞RNA测序数据，揭示了非酒精性脂肪肝病中自噬相关枢纽基因与肝脏非实质细胞的关系 | 研究仅基于两个基因表达数据集和一个单细胞RNA测序数据集，可能存在样本代表性不足的问题 | 探索非酒精性脂肪肝病中自噬相关枢纽基因的分子机制及其与肝脏非实质细胞的关系 | 非酒精性脂肪肝病中的自噬相关枢纽基因及其与肝脏非实质细胞的关系 | NA | 非酒精性脂肪肝病 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA），CIBERSORT算法，单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据 | 使用了GSE48452和GSE89632两个基因表达数据集，以及GSE129516单细胞RNA测序数据集 |