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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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9561 | 2024-08-16 |
DNMT1-targeting remodeling global DNA hypomethylation for enhanced tumor suppression and circumvented toxicity in oral squamous cell carcinoma
2024-May-16, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-01993-1
PMID:38755637
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研究论文 | 本研究通过靶向DNMT1调控口腔鳞状细胞癌(OSCC)中的全局DNA低甲基化,以增强肿瘤抑制并减少毒性 | 本研究首次揭示了DNMT1调控的全新全局DNA低甲基化模式,通过平衡信号协同作用来增强抗癌效果并减少潜在毒性 | NA | 探讨DNMT1在口腔鳞状细胞癌中的作用及其对全局DNA甲基化的影响 | 口腔鳞状细胞癌(OSCC) | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | shRNA敲低技术,DNA甲基化微阵列,单细胞RNA测序 | NA | DNA甲基化数据,RNA序列数据 | 包括体外口腔癌细胞和异种移植OSCC小鼠模型 |
9562 | 2024-08-16 |
A Mettl16/m6A/mybl2b/Igf2bp1 axis ensures cell cycle progression of embryonic hematopoietic stem and progenitor cells
2024-May, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-024-00082-9
PMID:38605226
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研究论文 | 本文通过跨物种单细胞RNA测序分析,揭示了METTL16在胚胎造血干细胞和祖细胞(HSPCs)中的高表达及其在细胞周期进展中的关键作用。 | 首次发现METTL16通过m6A修饰调控细胞周期转录因子mybl2b,并通过METTL16-mA-MYBL2-IGF2BP1轴在人类中保守控制G1/S进展。 | NA | 阐明METTL16介导的m6A修饰在早期胚胎发育中对HSPC细胞周期进展的关键功能。 | 胚胎造血干细胞和祖细胞(HSPCs)及其细胞周期进展。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及斑马鱼和人类样本 |
9563 | 2024-08-16 |
Primary nasal viral infection rewires the tissue-scale memory response
2024-Mar-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.11.539887
PMID:38562902
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析了小鼠鼻黏膜在初次和再次流感感染前后的细胞变化,揭示了组织层面记忆反应的重塑 | 首次详细描述了初次感染后鼻黏膜中细胞类型、亚型和状态的逐步变化,以及再次感染时加速和协调的髓样和淋巴样细胞反应 | NA | 探讨初次病毒感染如何塑造组织层面的记忆反应,为鼻靶向治疗和疫苗的合理设计提供依据 | 小鼠鼻黏膜在初次和再次流感感染前后的细胞变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 三个不同区域的鼻黏膜样本,包括初次和再次流感感染前后的样本 |
9564 | 2024-08-16 |
Single-cell profiling reveals immune aberrations in progressive idiopathic pulmonary fibrosis
2023-Apr-29, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2023.04.29.23289296
PMID:37163015
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术,详细描述了特发性肺纤维化患者外周血免疫系统的变化 | 首次在单细胞分辨率下详细描述了特发性肺纤维化患者外周血细胞群体的变化,并揭示了与疾病进展和生存率相关的免疫细胞亚群 | NA | 提供特发性肺纤维化稳定期和进展期外周免疫系统的变化图谱 | 特发性肺纤维化患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 10x Chromium 5' 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 38份外周血单个核细胞样本,来自25名特发性肺纤维化患者和13名匹配的对照 |
9565 | 2024-08-16 |
Cell-to-cell interaction analysis of prognostic ligand-receptor pairs in human pancreatic ductal adenocarcinoma
2021-Dec, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2021.101126
PMID:34522794
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研究论文 | 本文通过整合生存分析和单细胞细胞间相互作用预测,研究了人胰腺导管腺癌中与预后相关的配体-受体对 | 首次系统地分析了细胞间相互作用通过配体-受体对与胰腺导管腺癌预后的关联,并识别了潜在的治疗靶点 | 需要进一步确定这些配体-受体对的临床意义 | 识别与胰腺导管腺癌患者预后相关的配体-受体对,为治疗提供潜在靶点 | 胰腺导管腺癌中的细胞间相互作用及其与预后的关联 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多个癌症队列的基因表达数据 |
9566 | 2024-08-16 |
High-throughput RNA sequencing of paraformaldehyde-fixed single cells
2021-09-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25871-2
PMID:34561439
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研究论文 | 本文介绍了一种名为FD-seq的高通量方法,用于固定、通透和分选的单细胞的液滴RNA测序,适用于甲醛固定的细胞。 | FD-seq方法在固定和通透处理后能保持RNA完整性和相对基因表达水平,且能检测到比甲醇固定更多的基因和转录本。 | NA | 开发一种新的高通量单细胞RNA测序方法,以克服现有方法在处理甲醛固定细胞时的限制。 | 甲醛固定的单细胞,特别是支持人类肿瘤病毒KSHV裂解再激活的稀有细胞亚群和感染人类冠状病毒OC43的细胞。 | 基因组学 | 肿瘤病毒感染 | RNA测序 | NA | RNA | 文中未具体说明样本数量 |
9567 | 2024-08-16 |
Fifty Generations of Amitosis: Tracing Asymmetric Allele Segregation in Polyploid Cells with Single-Cell DNA Sequencing
2021-Sep-17, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms9091979
PMID:34576874
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研究论文 | 研究利用单细胞全基因组测序技术,追踪多倍体细胞中不对称等位基因分离的现象,特别是在50次无丝分裂后的情况 | 首次使用单细胞全基因组测序技术研究无丝分裂对等位基因分离的影响,并通过数学模型验证实验结果 | 研究依赖于特定生物模型和特定的基因组特征,可能限制了结果的普遍性 | 探讨无丝分裂在生物医学和进化生物学中的意义 | 多倍体细胞中的不对称等位基因分离 | NA | NA | 单细胞全基因组测序 | 数学模型 | 基因组数据 | 涉及多个细胞样本,具体数量未明确 |
9568 | 2024-08-16 |
Hippocampal glucose uptake as a surrogate of metabolic change of microglia in Alzheimer's disease
2021-Aug-31, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-021-02244-6
PMID:34465358
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研究论文 | 本文研究了阿尔茨海默病中微胶质细胞代谢变化与海马体葡萄糖摄取之间的关系 | 发现海马体葡萄糖摄取可以作为评估微胶质细胞介导炎症的可行成像生物标志物 | NA | 研究阿尔茨海默病中微胶质细胞代谢变化与海马体葡萄糖摄取的关系 | 阿尔茨海默病中的微胶质细胞和海马体葡萄糖代谢 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | FDG PET, 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 生物标志物 | 8个月和12个月大的5xFAD小鼠模型, 以及来自阿尔茨海默病神经影像倡议的人脑FDG PET数据 |
9569 | 2024-08-16 |
A systematic dissection of human primary osteoblasts in vivo at single-cell resolution
2021-08-24, Aging
DOI:10.18632/aging.203452
PMID:34428745
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术对从一名31岁男性髋关节置换术后新鲜分离的人类原代成骨细胞进行了系统的细胞分类学剖析 | 首次在单细胞水平上识别出三种不同的人类原代成骨细胞亚型,包括前成骨细胞、成熟成骨细胞和一个未确定的稀有成骨细胞亚群,并揭示了这些亚型在骨形成、血管生成和造血调节中的潜在生物学功能 | 研究样本仅来自一名31岁男性,可能限制了结果的普遍性 | 旨在揭示人类原代成骨细胞的细胞异质性和潜在生物学功能 | 人类原代成骨细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 一名31岁男性 |
9570 | 2024-08-16 |
Current Methodological Challenges of Single-Cell and Single-Nucleus RNA-Sequencing in Glomerular Diseases
2021-08, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2021020157
PMID:34140401
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综述 | 本文综述了单细胞和单核RNA测序技术在肾小球疾病研究中的方法学挑战 | 介绍了单细胞和单核RNA测序技术在肾小球疾病研究中的应用前景 | 肾小球细胞的分离困难,依赖于多种因素,如组织材料少、细胞分离协议不统一等 | 探讨单细胞转录组学实验在肾小球疾病研究中的技术挑战 | 肾小球疾病 | 数字病理学 | 肾小球疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单核RNA测序(snRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 需要多个样本以识别肾小球细胞 |
9571 | 2024-08-16 |
3D Atlas of the Pituitary Gland of the Model Fish Medaka (Oryzias latipes)
2021, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2021.719843
PMID:34497587
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研究论文 | 本研究使用多色荧光杂交技术,首次展示了模式鱼(Medaka)垂体前叶中七种内分泌细胞类型的三维分布图谱 | 首次在模式鱼Medaka中构建了垂体前叶内分泌细胞的三维分布图谱,并揭示了性二态性和双激素细胞的存在 | NA | 旨在通过比较和综合了解内分泌细胞类型的空间分布,以更好地理解其生理功能 | 模式鱼Medaka的垂体前叶内分泌细胞 | 数字病理学 | NA | 多色荧光杂交技术,免疫荧光技术,单细胞转录组学分析 | NA | 图像 | 成年Medaka鱼 |
9572 | 2024-08-16 |
Single-Cell RNA Sequencing Identifies New Inflammation-Promoting Cell Subsets in Asian Patients With Chronic Periodontitis
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.711337
PMID:34566966
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了慢性牙周炎患者和健康志愿者的牙龈组织,识别出与炎症促进相关的新细胞亚群 | 本研究首次识别出HLA-DR表达的血管内皮细胞和CXCL13成纤维细胞,这些细胞与免疫调节高度相关,并揭示了促炎性NLRP3巨噬细胞在牙周炎中的作用 | 研究样本量较小,仅包括10名牙周炎患者和10名健康志愿者,可能影响结果的普遍性 | 旨在探究慢性牙周炎中炎症反应的局部微环境,并识别新的炎症促进细胞亚群 | 慢性牙周炎患者和健康志愿者的牙龈组织 | 数字病理学 | 牙周病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 10名牙周炎患者和10名健康志愿者 |
9573 | 2024-08-16 |
A Novel Oral Arginase 1/2 Inhibitor Enhances the Antitumor Effect of PD-1 Inhibition in Murine Experimental Gliomas by Altering the Immunosuppressive Environment
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.703465
PMID:34504786
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研究论文 | 本文研究了一种新型口服精氨酸酶1/2抑制剂OAT-1746,通过改变免疫抑制环境增强PD-1抑制在小鼠实验性胶质瘤中的抗肿瘤效果。 | 发现OAT-1746能有效穿过血脑屏障,增加脑内精氨酸水平,并与PD-1抑制剂联合使用,显著减少胶质瘤生长并增强抗肿瘤效果。 | NA | 探索精氨酸酶1/2抑制剂在胶质母细胞瘤中的抗肿瘤潜力及其与PD-1抑制剂联合使用的疗效。 | 人及小鼠的胶质瘤细胞、肿瘤浸润性小胶质细胞和单核/巨噬细胞。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | RNA测序 | NA | RNA | 涉及人及小鼠的胶质瘤样本 |
9574 | 2024-08-16 |
Single Cell Transcriptome Helps Better Understanding Crosstalk in Diabetic Kidney Disease
2021, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2021.657614
PMID:34485320
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学在糖尿病肾病(DKD)中细胞间对话方面的最新进展 | 利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术深入理解DKD在细胞水平上的异质性和遗传易感性 | NA | 旨在回顾单细胞转录组分析在DKD中的最新进展,特别是肾内或肾外细胞间的对话 | 糖尿病肾病(DKD)中的细胞间对话、细胞靶点和潜在治疗策略 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组 | NA |
9575 | 2024-08-16 |
Systematic evaluation of transcriptomic disease risk and diagnostic biomarker overlap between COVID-19 and tuberculosis: a patient-level meta-analysis
2020-Nov-26, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2020.11.25.20236646
PMID:33269371
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研究论文 | 本文通过患者层面的荟萃分析,评估了COVID-19和结核病之间转录组疾病风险和诊断生物标志物的重叠。 | 首次系统地分析了COVID-19和结核病在转录组层面的相互作用,并识别了共享的基因本体论扰动。 | 研究主要基于RNA测序数据,可能无法全面反映所有相关生物标志物。 | 旨在理解COVID-19和结核病之间的相互作用,并识别潜在的共享生物标志物。 | COVID-19和结核病患者的转录组数据。 | 数字病理学 | 肺结核 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 35个COVID-19基因签名来自9项研究,共98个样本;1181个结核病RNA测序数据样本来自853名个体。 |
9576 | 2024-08-16 |
Immune cell profiling of COVID-19 patients in the recovery stage by single-cell sequencing
2020, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-020-0168-9
PMID:32377375
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,全面描述了COVID-19恢复期患者外周血单个核细胞的转录变化 | 首次揭示了COVID-19恢复早期阶段的炎症免疫特征,并识别了新的B细胞受体信号,可能促进COVID-19疫苗和抗体的开发 | NA | 旨在阐明COVID-19恢复期患者免疫细胞亚群的变化及其状态 | COVID-19恢复期患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过1,200,000名COVID-19患者 |
9577 | 2024-08-15 |
A novel STING variant triggers endothelial toxicity and SAVI disease
2024-09-02, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20232167
PMID:38953896
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研究论文 | 本文报道并描述了一种新的STING变异体(F269S),该变异体在SAVI患者中发现,并探讨了其在细胞和分子水平上的功能及其对疾病的影响。 | 首次报道了STING F269S变异体,并揭示了其在SAVI发病机制中的作用,特别是在内皮细胞和免疫细胞之间的相互作用。 | NA | 研究STING F269S变异体在SAVI疾病中的病理作用及其分子机制。 | STING F269S变异体及其在SAVI患者中的功能和影响。 | NA | 肺间质疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 单个SAVI患者 |
9578 | 2024-08-15 |
Single-cell RNA sequencing data analysis utilizing multi-type graph neural networks
2024-Sep, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.108921
PMID:39059210
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研究论文 | 本文提出了一种新的单细胞RNA测序数据分析模型scDMG,利用去噪自编码器和多类型图神经网络学习细胞间的拓扑信息和潜在表示 | 引入零膨胀负二项分布模型到去噪自编码器中进行数据降维和去噪,并集成多类型图神经网络作为编码器处理不同类型的单细胞RNA测序数据集 | NA | 改进单细胞RNA测序数据的分析和处理方法 | 单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图神经网络 | 序列数据 | NA |
9579 | 2024-08-15 |
Single-cell Transcriptome Landscape of DNA Methylome Regulators Associated with Orofacial Clefts in the Mouse Dental Pulp
2024-Sep, The Cleft palate-craniofacial journal : official publication of the American Cleft Palate-Craniofacial Association
DOI:10.1177/10556656231172296
PMID:37161276
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组测序分析了与小鼠牙髓中DNA甲基化调控因子相关的转录组图谱,探讨其与口腔颌面裂的关系 | 首次在单细胞分辨率下研究了与DNA甲基化和去甲基化相关的调控基因在小鼠牙髓间充质干细胞中的表达情况 | 研究未涉及人类患者,且仅限于小鼠模型 | 旨在研究与DNA甲基化和去甲基化相关的调控基因在单细胞水平的转录组图谱 | 小鼠牙髓中的间充质干细胞及其在不同骨分化阶段的亚群 | 数字病理学 | 口腔颌面裂 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
9580 | 2024-08-15 |
Prdm1 positively regulates liver Group 1 ILCs cancer immune surveillance and preserves functional heterogeneity
2024-Aug-12, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.92948
PMID:39133873
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研究论文 | 本研究揭示了Prdm1在调节肝脏cNK细胞和ILC1s功能中的作用,特别是在肝癌免疫监视中的重要性 | 首次揭示了Prdm1在维持cNK细胞和肝脏ILC1s功能异质性中的新机制 | 研究主要基于Ncr1驱动的条件性敲除小鼠模型,可能需要进一步的人体研究验证 | 探索Prdm1在肝脏cNK细胞和ILC1s中的调控机制及其在肝癌免疫治疗中的潜在应用 | 肝脏cNK细胞和ILC1s的功能及其在肝癌中的作用 | 免疫学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 使用Ncr1驱动的条件性敲除小鼠模型进行研究 |