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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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9581 | 2024-08-15 |
Integrated analysis of spatial transcriptomics and CT phenotypes for unveiling the novel molecular characteristics of recurrent and non-recurrent high-grade serous ovarian cancer
2024-Aug-12, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00632-7
PMID:39135097
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research paper | 本研究通过整合空间转录组学和CT表型数据,揭示了高级别浆液性卵巢癌复发和非复发患者的分子特征 | 本研究首次结合空间转录组学和CT数据,识别了与高级别浆液性卵巢癌复发相关的特定细胞群富集和差异表达基因 | 研究样本量较小,仅包括八名患者,可能影响结果的普遍性 | 探索高级别浆液性卵巢癌的分子特征,为个性化医疗提供诊断和治疗靶点 | 高级别浆液性卵巢癌的复发和非复发患者 | digital pathology | 卵巢癌 | 空间转录组学 (ST) | NA | 转录组数据 | 8名高级别浆液性卵巢癌患者 |
9582 | 2024-08-15 |
Single-cell multiomics analysis reveals cell/tissue-specific associations in bipolar disorder
2024-Aug-06, Translational psychiatry
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41398-024-03044-1
PMID:39107272
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据,探讨了双相情感障碍(BD)的细胞起源和组织异质性 | 本研究首次发现了一个名为ADCY1的新脑细胞簇,并从高分辨率遗传角度揭示了胶质细胞是与BD相关的主要细胞病理 | NA | 探讨双相情感障碍的细胞起源和组织异质性 | 双相情感障碍(BD)的细胞和组织特征 | 数字病理学 | 精神疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、ATAC-seq、RNA-seq、全基因组关联研究(GWAS) | NA | 基因组数据 | 包括8个胚胎和胎儿脑样本(1,266个细胞)、210个成人脑ATAC-seq数据、314个成人脑bulk RNA-seq数据和413,466个GWAS汇总数据 |
9583 | 2024-08-15 |
Single-cell landscape revealed immune characteristics associated with disease phases in brucellosis patients
2024-Aug, iMeta
IF:23.7Q1
DOI:10.1002/imt2.226
PMID:39135683
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research paper | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了布鲁氏菌病患者在不同疾病阶段的免疫特征 | 首次系统地揭示了布鲁氏菌病在不同感染阶段的综合免疫反应,特别是急性期的细胞因子风暴和慢性期的Th1反应失调 | NA | 旨在深入理解布鲁氏菌病的免疫发病机制,并为开发新的有效治疗策略提供依据 | 布鲁氏菌病患者及健康捐赠者的免疫细胞 | digital pathology | brucellosis | scRNA-seq | NA | 细胞 | 290,369个细胞来自35个个体,包括29名布鲁氏菌病患者和6名健康捐赠者 |
9584 | 2024-08-15 |
Cell-type-specific expression analysis of liver transcriptomics with clinical parameters to decipher the cause of intrahepatic inflammation in chronic hepatitis B
2024-Aug, iMeta
IF:23.7Q1
DOI:10.1002/imt2.221
PMID:39135698
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和临床参数,分析了慢性乙型肝炎患者肝脏炎症的细胞类型特异性表达,以揭示其机制 | 采用贝叶斯线性模型和群体特异性表达分析(PSEA)将基因表达与临床参数关联,并验证了多免疫染色技术 | NA | 探讨慢性乙型肝炎患者肝脏炎症的机制 | 慢性乙型肝炎患者的肝脏炎症 | 数字病理学 | 乙型肝炎 | 多组学研究 | 贝叶斯线性模型 | 转录组数据 | 来自慢性乙型肝炎患者的肝脏样本 |
9585 | 2024-08-15 |
Dominant dystrophic epidermolysis bullosa is associated with glycolytically active GATA3+ T helper 2 cells which may contribute to pruritus in lesional skin
2024-Jul-16, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljae110
PMID:38477474
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研究论文 | 研究通过RNA测序分析了主导性营养不良性大疱性表皮松解症(DDEB)患者的皮肤转录组,以识别减轻患者瘙痒的治疗目标。 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了DDEB皮肤中与瘙痒相关的糖酵解活性GATA3+ Th2细胞的存在,并验证了抗Th2药物在治疗DDEB瘙痒中的有效性。 | 研究样本量较小,仅包括六名DDEB患者和四名健康个体,可能影响结果的普遍性。 | 旨在通过分析DDEB患者的皮肤转录组,寻找减轻瘙痒的治疗靶点。 | 主导性营养不良性大疱性表皮松解症(DDEB)患者的受影响和未受影响的皮肤样本。 | NA | 营养不良性大疱性表皮松解症 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 六名DDEB患者和四名健康个体的皮肤活检样本,以及五名个体的单细胞转录组数据。 |
9586 | 2024-08-15 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Immunomodulatory Effects of Stem Cell Factor and Granulocyte Colony-Stimulating Factor Treatment in the Brains of Aged APP/PS1 Mice
2024-Jul-10, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14070827
PMID:39062541
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,探讨了干细胞因子(SCF)和粒细胞集落刺激因子(G-CSF)联合治疗在老年APP/PS1小鼠大脑中的免疫调节作用。 | 首次揭示了SCF+G-CSF治疗通过调节小胶质细胞和外周髓系细胞的转录谱,减轻阿尔茨海默病病理变化的新机制。 | 研究仅限于老年APP/PS1小鼠模型,需要进一步在人类或其他动物模型中验证。 | 探索SCF+G-CSF治疗在老年APP/PS1小鼠大脑中减轻阿尔茨海默病病理变化的潜在机制。 | 老年APP/PS1小鼠大脑中的CD11b细胞。 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 28个月大的APP/PS1小鼠大脑中的CD11b细胞 |
9587 | 2024-08-15 |
Single-Cell and Spatial Transcriptome Profiling Identifies the Transcription Factor BHLHE40 as a Driver of EMT in Metastatic Colorectal Cancer
2024-Jul-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-3264
PMID:38657117
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组测序技术,揭示了BHLHE40转录因子在结直肠癌转移中的作用,特别是在上皮间质转化(EMT)过程中的作用 | 首次通过单细胞和空间转录组测序技术,结合细胞间通讯分析,识别出BHLHE40作为驱动结直肠癌EMT的关键转录因子 | NA | 阐明驱动结直肠癌上皮间质转化(EMT)的细胞机制 | 结直肠癌患者的非转移性和转移性原发性肿瘤 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组测序 | NA | RNA序列 | 22个样本,包括11个非转移性原发性肿瘤和11个转移性原发性肿瘤 |
9588 | 2024-08-07 |
[Applications of single-cell RNA sequencing in chronic rhinosinusitis: the progress and prospect]
2024-Jun-07, Zhonghua er bi yan hou tou jing wai ke za zhi = Chinese journal of otorhinolaryngology head and neck surgery
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
9589 | 2024-08-07 |
[Application and progress of single-cell RNA sequencing in chronic rhinosinusitis]
2024-Jun-07, Zhonghua er bi yan hou tou jing wai ke za zhi = Chinese journal of otorhinolaryngology head and neck surgery
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
9590 | 2024-08-15 |
Placenta accreta spectrum disorder at single-cell resolution: a loss of boundary limits in the decidua and endothelium
2024-04, American journal of obstetrics and gynecology
IF:8.7Q1
DOI:10.1016/j.ajog.2023.10.001
PMID:38296740
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研究论文 | 本研究使用单细胞和空间分辨转录组学技术,分析了胎盘植入谱系障碍中母胎界面的细胞异质性 | 首次在单细胞分辨率下描述胎盘植入谱系障碍的细胞图谱,揭示了母胎界面细胞类型间的显著基因表达差异 | 研究样本量较小,仅包括12个胎盘样本 | 深入理解胎盘植入谱系障碍的病理生理机制 | 胎盘植入谱系障碍中的母胎界面细胞异质性 | 数字病理学 | 胎盘疾病 | 单细胞RNA测序、空间分辨转录组学 | NA | 转录组数据 | 12个胎盘样本,包括6个胎盘植入谱系障碍样本和6个对照样本 |
9591 | 2024-08-15 |
Single-cell atlas of the liver myeloid compartment before and after cure of chronic viral hepatitis
2024-02, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2023.02.040
PMID:36972796
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研究论文 | 本研究利用基于板的单细胞RNA测序技术,深入分析了慢性丙型肝炎病毒(HCV)感染患者在接受直接作用抗病毒药物(DAAs)治疗前后肝脏髓系细胞的变化。 | 发现了治疗后细胞类型的特异性变化,如增殖的CD1C+常规树突状细胞的增加,以及病毒载量与治疗后干扰素刺激基因表达之间的反向关系。 | NA | 研究慢性病毒感染治愈后肝脏免疫系统的变化,为开发新的治疗策略提供见解。 | 慢性丙型肝炎病毒感染患者的肝脏髓系细胞。 | 数字病理学 | 肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 慢性丙型肝炎病毒感染患者的肝脏细针抽吸样本 |
9592 | 2024-08-15 |
A review of single-cell transcriptomics and epigenomics studies in maternal and child health
2024, Epigenomics
IF:3.0Q2
DOI:10.1080/17501911.2024.2343276
PMID:38709139
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学和表观基因组学在母婴健康领域的研究进展 | 单细胞研究提供了胎盘中新型细胞类型以及与母体暴露和并发症相关的细胞类型特异性标志的见解 | NA | 增强对孕期细胞动态变化的理解 | 母婴健康 | 单细胞测序 | 母婴健康 | 单细胞测序技术 | NA | 转录组数据 | 16个人类和哺乳动物胎盘的单细胞图谱,31个关于母体暴露和并发症的单细胞研究 |
9593 | 2024-08-15 |
Single-Cell Histone Modification Profiling with Cell Enrichment Using sortChIC
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4071-5_14
PMID:39141239
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研究论文 | 本文介绍了一种名为sortChIC的排序辅助单细胞染色质免疫切割测序技术,用于在单细胞水平上绘制组蛋白后转录修饰(PTMs)图谱 | 该技术结合了组蛋白PTM位置的映射与基于表面染色的细胞富集,使得可以整合现有的稀有细胞类型富集策略 | NA | 旨在研究细胞类型特异性动态变化,特别是在异质性体内环境中 | 单细胞中的组蛋白后转录修饰(PTMs) | 生物技术 | NA | sortChIC | NA | 单细胞数据 | NA |
9594 | 2024-08-15 |
Characterization of Wnt signaling pathway under treatment of Lactobacillus acidophilus postbiotic in colorectal cancer using an integrated in silico and in vitro analysis
2023-12-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-50047-x
PMID:38151510
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研究论文 | 本研究通过整合计算和体外实验分析,探讨了乳酸菌酸ophilus后生物制剂对结直肠癌中Wnt信号通路的影响 | 首次采用单细胞RNA测序和深度学习方法ExpiMap分析结直肠癌中的差异表达基因,并研究了乳酸菌酸ophilus后生物制剂对其的影响 | 研究仅限于HT-29细胞系,未来研究应扩展到其他细胞系和临床试验 | 探讨乳酸菌酸ophilus后生物制剂对结直肠癌中Wnt信号通路的影响及其治疗潜力 | 结直肠癌中的差异表达基因及乳酸菌酸ophilus后生物制剂对其的影响 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、实时定量PCR(RT-qPCR)、流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | HT-29细胞系及正常邻近组织 |
9595 | 2024-08-15 |
Microglia promote anti-tumour immunity and suppress breast cancer brain metastasis
2023-Dec, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-023-01273-y
PMID:37957324
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和基因工程小鼠模型,发现脑部常驻的微胶质细胞在乳腺癌脑转移中起到抗炎和抑制肿瘤的作用 | 首次明确微胶质细胞在乳腺癌脑转移中的肿瘤抑制作用,并发现其在人类微胶质细胞中的保守性 | NA | 探讨微胶质细胞在乳腺癌脑转移中的作用及其作为免疫治疗靶点的潜力 | 微胶质细胞在乳腺癌脑转移中的功能及其对患者预后的影响 | NA | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用基因工程小鼠模型和人类样本进行研究 |
9596 | 2024-08-15 |
Loss of Mir146b with aging contributes to inflammation and mitochondrial dysfunction in thioglycollate-elicited peritoneal macrophages
2021-08-23, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.66703
PMID:34423778
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研究论文 | 研究探讨了Mir146b在衰老过程中对腹膜巨噬细胞炎症和线粒体功能障碍的影响 | 首次通过RNA测序方法发现Mir146b在衰老的腹膜巨噬细胞中表达下降,并揭示了其对巨噬细胞功能的影响 | 研究主要集中在小鼠模型上,可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 探究巨噬细胞衰老过程中的分子机制及其对免疫功能的影响 | 衰老过程中的腹膜巨噬细胞 | NA | NA | RNA测序 | NA | RNA | 小鼠腹膜巨噬细胞 |
9597 | 2024-08-15 |
CD11b+ lung dendritic cells at different stages of maturation induce Th17 or Th2 differentiation
2021-08-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25307-x
PMID:34413303
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研究论文 | 研究报道了在不同成熟阶段的小鼠肺部CD11b+树突状细胞(DC)如何诱导Th17或Th2分化 | 首次揭示了肺部cDC2在不同成熟阶段对Th17和Th2分化的影响,并通过单细胞RNA测序分析了其发展过程 | 研究主要基于小鼠模型,可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 探讨肺部树突状细胞在不同成熟阶段对T细胞分化的影响 | 小鼠肺部的CD11b+树突状细胞及其在Th17和Th2分化中的作用 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及小鼠肺部的多个树突状细胞亚群 |
9598 | 2024-08-15 |
CoCoA-diff: counterfactual inference for single-cell gene expression analysis
2021-08-17, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02438-4
PMID:34404460
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研究论文 | 本文介绍了一种因果推断框架CoCoA-diff,用于在单细胞RNA-seq数据中优先考虑疾病基因,无需事先了解控制变量即可调整混杂因素 | CoCoA-diff方法在模拟和真实世界数据分析中显著提高了统计能力,并识别了215个在不同细胞类型中差异调节的因果基因 | NA | 寻找基因组医学中的因果基因 | 单细胞RNA-seq数据中的疾病基因 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA-seq | 因果推断框架 | 基因表达数据 | 70,000个脑细胞 |
9599 | 2024-08-15 |
Exploring the Biological Activity and Mechanism of Xenoestrogens and Phytoestrogens in Cancers: Emerging Methods and Concepts
2021-Aug-16, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22168798
PMID:34445499
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综述 | 本文综述了外源性雌激素和植物雌激素在癌症中的生物活性和机制,以及新兴的研究方法和概念 | 介绍了患者来源的异种移植(PDX)模型和单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术的新应用,以及敏感期(WOS)这一新兴概念 | NA | 探讨外源性雌激素和植物雌激素在癌症中的作用及其机制,以及如何利用这些知识开发预防和治疗癌症的新方法 | 外源性雌激素和植物雌激素在癌症中的生物活性和机制 | NA | 癌症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 患者来源的异种移植(PDX)模型 | RNA | 18项临床试验 |
9600 | 2024-08-15 |
Defining the variety of cell types in developing and adult human kidneys by single-cell RNA sequencing
2021-Aug-11, NPJ Regenerative medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41536-021-00156-w
PMID:34381054
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了发育中和成人人类肾脏中的细胞类型多样性 | 本文通过比较单细胞RNA测序时代前后的文献,发现了新的细胞类型和中间细胞阶段,以及复杂的分子特征和谱系途径 | 单细胞RNA测序技术存在局限性,导致细胞类型多样性在文献中仍然存在差异 | 确定人类肾脏中细胞类型的数量 | 发育中和成人人类肾脏组织中的细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 成人肾脏中鉴定出41种肾源性细胞群和32种非肾源性细胞群 |