单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27279 篇文献，本页显示第 9521 - 9540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9521 | 2024-08-17 |
The spatial distribution of intermediate fibroblasts and myeloid-derived cells dictate lymph node metastasis dynamics in oral cancer
2024-Aug-13, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05511-1
PMID:39138492
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研究论文 | 研究口腔鳞状细胞癌（GB-OSCC）肿瘤边缘基因和细胞类型的空间分布，以及这些分布如何影响淋巴结转移的动力学 | 发现了肿瘤-基质界面是GB-OSCC疾病进展最活跃的区域，并识别了与淋巴结转移和疾病进展相关的空间定位基因 | NA | 探讨口腔鳞状细胞癌肿瘤边缘基因和细胞类型的空间分布，以及这些分布如何影响淋巴结转移 | 口腔鳞状细胞癌（GB-OSCC）肿瘤边缘的基因和细胞类型 | 数字病理学 | 口腔癌 | 数字空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 23个切除的GB-OSCC样本 |
| 9522 | 2024-08-17 |
Single-cell long-read targeted sequencing reveals transcriptional variation in ovarian cancer
2024-Aug-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51252-6
PMID:39134520
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研究论文 | 本文开发了一种名为scTaILoR-seq的单细胞靶向长读长测序方法，用于揭示卵巢癌中的转录变异 | scTaILoR-seq方法通过靶向捕获感兴趣的基因，提高了单细胞中目标转录本的检测数量，增强了RNA异构体的全面表征能力 | 长读长测序技术在单细胞RNA异构体检测中受到通量较低和非预期序列伪影的影响 | 开发一种新的单细胞长读长靶向测序方法，以探索单细胞分辨率下的转录变异 | 卵巢癌细胞系和原发性肿瘤中的RNA异构体 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞靶向异构体长读长测序（scTaILoR-seq） | NA | 转录组数据 | 10,796个单细胞转录组 |
| 9523 | 2024-08-17 |
Mutual exclusivity and co-occurrence patterns of immune checkpoints indicate NKG2A relates to anti-PD-1 resistance in gastric cancer
2024-Aug-03, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05503-1
PMID:39097734
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和多元线性回归交互模型，分析了胃癌中CD8+ T细胞的免疫检查点表达特征及其与抗PD-1治疗抵抗的关系。 | 揭示了两种不同的免疫检查点表达模式（ICEP），并阐明了NKG2A与PD-1的互斥性和共现特征，为胃癌提供了新的免疫治疗靶点。 | NA | 探索克服胃癌中抗PD-1治疗抵抗的新机会，并识别与抗PD-1抑制剂联合使用的最佳免疫检查点抑制剂组合方案。 | 胃癌中的CD8+ T细胞及其免疫检查点表达模式。 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 多元线性回归交互模型 | RNA | NA |
| 9524 | 2024-08-17 |
The shared role of neutrophils in ankylosing spondylitis and ulcerative colitis
2024-Aug, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-024-00286-3
PMID:39060428
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序数据分析，探讨了强直性脊柱炎和溃疡性结肠炎中免疫细胞的相互作用 | 发现了中性粒细胞在两种疾病中的重要作用，并识别出XBP1作为潜在的治疗靶点 | 样本量较小，仅包括三名强直性脊柱炎患者 | 研究强直性脊柱炎和溃疡性结肠炎中免疫细胞的相互作用 | 强直性脊柱炎和溃疡性结肠炎患者的椎骨骨髓血液 | NA | 强直性脊柱炎, 溃疡性结肠炎 | 10X单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | 三名强直性脊柱炎患者 |
| 9525 | 2024-08-17 |
Toward universal cell embeddings: integrating single-cell RNA-seq datasets across species with SATURN
2024-Aug, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02191-z
PMID:38366243
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SATURN的深度学习方法，用于学习跨物种的通用细胞嵌入，通过结合蛋白质语言模型的蛋白质嵌入和RNA表达，实现不同物种单细胞RNA测序数据集的整合 | SATURN方法能够检测跨物种共同表达的功能相关基因，并为跨物种分析重新定义差异表达 | NA | 开发一种方法以整合来自不同物种的单细胞RNA测序数据集，揭示细胞类型的保守性和多样性进化过程 | 跨物种的单细胞RNA测序数据集 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 深度学习模型 | RNA测序数据 | 涉及三种物种的整体器官图谱以及蛙和斑马鱼胚胎发育数据集 |
| 9526 | 2024-08-17 |
Comparative single-cell analysis reveals IFN-γ as a driver of respiratory sequelae after acute COVID-19
2024-Jul-17, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adn0136
PMID:39018367
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研究论文 | 本研究通过比较来自临床PASC样本和PASC小鼠模型的支气管肺泡灌洗液单细胞RNA测序数据，揭示了IFN-γ在呼吸系统后遗症中的作用 | 首次在单细胞水平上比较了人类和鼠类的PASC样本，并发现IFN-γ是调节呼吸系统PASC免疫异常的关键因子 | 研究主要集中在动物模型和小规模的临床样本上，需要进一步的大规模临床研究来验证结果 | 探讨SARS-CoV-2感染后呼吸系统后遗症的病因 | PASC患者的支气管肺泡灌洗液样本和小鼠模型 | 数字病理学 | COVID-19相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 涉及人类和小鼠的样本 |
| 9527 | 2024-08-17 |
Dysfunction of infiltrating cytotoxic CD8+ T cells within the graft promotes murine kidney allotransplant tolerance
2024-Jun-18, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI179709
PMID:38888968
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研究论文 | 研究探讨了在小鼠肾脏同种异体移植中，浸润的细胞毒性CD8+ T细胞功能障碍如何促进移植耐受 | 首次揭示了细胞毒性CD8+ T细胞在移植器官内被重新编程为耗竭/调节样表型，并通过IFN-γ介导的机制促进肾脏移植耐受 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能需要进一步的人体研究来验证这些发现 | 探讨细胞毒性CD8+ T细胞在肾脏同种异体移植中的作用及其对移植耐受的影响 | 小鼠肾脏同种异体移植中的细胞毒性CD8+ T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 涉及小鼠肾脏同种异体移植模型 |
| 9528 | 2024-08-17 |
Advances and challenges in investigating B-cells via single-cell transcriptomics
2024-Jun, Current opinion in immunology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.coi.2024.102443
PMID:38968762
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research paper | 本文探讨了通过单细胞转录组学研究B细胞的进展与挑战 | 利用单细胞RNA测序（scRNAseq）和VDJ分析，揭示了B细胞的中间状态及其在免疫反应中的保护作用 | 在研究跨组织的人类B细胞状态、空间位置与B细胞表型和功能的关系、抗体同型转换事件以及克隆关系的明确确定方面仍存在挑战 | 旨在通过单细胞转录组学技术深化对B细胞发育和分化的理解 | B细胞的中间状态、其在免疫反应中的作用以及克隆关系的确定 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 9529 | 2024-08-17 |
Deciphering novel TCF4-driven mechanisms underlying a common triplet repeat expansion-mediated disease
2024-May, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011230
PMID:38713708
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研究论文 | 本文研究了Fuchs角膜内皮营养不良（FECD）中由CTG18.1重复元素扩展驱动的分子机制，通过分析患者来源的角膜内皮细胞的转录组数据，揭示了扩展特异性的转录组标志物和TCF4异构体比例偏斜。 | 首次全面描述了CTG18.1扩展在FECD中的分子机制，包括全局剪接改变和独特的转录本，以及TCF4异构体比例的偏斜。 | NA | 揭示由CTG18.1重复元素扩展介导的FECD的分子机制 | 患者来源的角膜内皮细胞 | 数字病理学 | 眼科疾病 | 长读长测序、短读长测序和空间转录组技术 | NA | 转录组数据 | 134例FECD患者 |
| 9530 | 2024-08-17 |
NOP16 promotes hepatocellular carcinoma progression and triggers EMT through the Keap1-Nrf2 signaling pathway
2024, Technology and health care : official journal of the European Society for Engineering and Medicine
IF:1.4Q3
DOI:10.3233/THC-231256
PMID:38251077
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研究论文 | 本研究分析了NOP16在肝细胞癌中的表达及其临床意义，并探讨了其通过Keap1-Nrf2信号通路促进肝细胞癌进展和触发上皮-间质转化的机制。 | 首次报道NOP16在肝细胞癌中的高表达及其作为独立不良预后因素的作用，并揭示了NOP16通过激活Keap/Nrf2信号通路影响细胞周期、细胞凋亡和上皮-间质转化的功能。 | 研究主要基于TCGA和GEO数据库的分析以及体外实验，缺乏体内实验验证。 | 探讨NOP16在肝细胞癌中的表达及其临床意义，并揭示其促进肝细胞癌进展的分子机制。 | NOP16在肝细胞癌中的表达及其与临床特征的关系，以及其通过Keap1-Nrf2信号通路影响肝细胞癌进展的机制。 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA干扰、单细胞测序 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 包括20种癌症类型的泛癌分析，以及肝细胞癌患者的肿瘤组织和正常组织样本。 |
| 9531 | 2024-08-17 |
Evaluating the causal effect of circulating proteome on the risk of inflammatory bowel disease-related traits using Mendelian randomization
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1434369
PMID:39144148
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化（MR）分析框架，旨在识别与炎症性肠病（IBD）特征因果关联的循环蛋白质 | 本研究采用大规模的两样本MR方法，结合单细胞测序分析、蛋白质-蛋白质相互作用评估、通路富集分析和药物靶点评估，以深入探讨IBD的潜在机制和治疗靶点 | NA | 识别与炎症性肠病特征因果关联的循环蛋白质 | 循环蛋白质与炎症性肠病及其亚型的遗传关联 | 生物信息学 | 炎症性肠病 | 孟德尔随机化（MR） | NA | 蛋白质 | 利用炎症性肠病遗传学联盟的信息进行分析 |
| 9532 | 2024-08-17 |
Upregulation of exosome secretion from tumor-associated macrophages plays a key role in the suppression of anti-tumor immunity
2023-10-31, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113224
PMID:37805922
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研究论文 | 本文报道了肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)分泌的外泌体在抑制抗肿瘤免疫中的关键作用 | 首次揭示了TAMs通过增加外泌体分泌来抑制CD8 T细胞的增殖和功能，并提出靶向外泌体作为改善免疫疗法的潜在策略 | NA | 探讨肿瘤相关巨噬细胞分泌的外泌体在抑制抗肿瘤免疫中的作用及机制 | 肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)、外泌体、CD8 T细胞 | 免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及患者黑色素瘤组织和小鼠黑色素瘤模型 |
| 9533 | 2024-08-17 |
Spatial transcriptomic profiling of coronary endothelial cells in SARS-CoV-2 myocarditis
2023, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2023.1118024
PMID:36968839
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研究论文 | 本研究利用数字空间转录组学技术，探讨了严重COVID-19患者冠状动脉内皮细胞和心肌细胞的编程变化。 | 本研究首次采用空间转录组学技术，在保留心脏解剖结构和未改变的局部SARS-CoV-2表达的情况下，进行了原位转录组分析。 | 研究样本量较小，且仅基于尸检心脏组织，可能限制了结果的普遍性。 | 旨在研究严重COVID-19患者冠状动脉内皮细胞和心肌细胞的编程变化。 | 严重COVID-19患者的冠状动脉内皮细胞和心肌细胞。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学 | NA | 组织 | 控制组4例，COVID-19组8例 |
| 9534 | 2024-08-17 |
Quantification of extracellular proteins, protein complexes and mRNAs in single cells by proximity sequencing
2022-12, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-022-01684-z
PMID:36456784
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研究论文 | 本文介绍了近端测序（Prox-seq）技术，该技术能够在数千个单细胞中同时测量蛋白质、蛋白质复合物和mRNA | Prox-seq结合了近端连接 assay 和单细胞测序，能够从所有目标蛋白质的成对组合中测量蛋白质及其复合物，提供了平方级扩展的多重分析能力 | NA | 验证Prox-seq技术并分析其在不同细胞类型中的应用，探索蛋白质相互作用 | T细胞、B细胞、人外周血单个核细胞、人巨噬细胞 | 生物技术 | NA | 近端测序（Prox-seq） | NA | 蛋白质、蛋白质复合物、mRNA | 数千个单细胞 |
| 9535 | 2024-08-17 |
Unsupervised discovery of tissue architecture in multiplexed imaging
2022-12, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-022-01657-2
PMID:36316562
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研究论文 | 本文开发了一种名为UTAG的方法，用于在无监督的情况下识别和量化多重成像中的微解剖组织结构 | UTAG方法能够结合细胞表型信息和细胞物理接近度，准确识别健康和疾病组织中的器官特异性微解剖域 | NA | 解决多重成像和空间转录组学中对组织高阶模式理解不足的问题 | 多重成像中的微解剖组织结构 | 数字病理学 | NA | 多重成像 | NA | 图像 | 多种健康和疾病状态的图像 |
| 9536 | 2024-08-17 |
Targeting Glutamine Metabolism to Enhance Immunoprevention of EGFR-Driven Lung Cancer
2022-09, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202105885
PMID:35861366
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研究论文 | 本文报道了一种口服活性谷氨酰胺拮抗剂前药JHU083，其在EGFR驱动的肺癌小鼠模型中显示出强大的抗癌效果，并与EGFR肽疫苗EVax联合使用时显著抑制肺癌发展 | JHU083通过抑制谷氨酰胺代谢，增加CD8 T细胞和CD4 Th1细胞的浸润，减少免疫抑制细胞，从而增强EVax的免疫预防效果 | NA | 研究谷氨酰胺代谢在EGFR驱动的肺癌免疫预防中的作用 | EGFR驱动的肺癌小鼠模型 | 数字病理学 | 肺癌 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 小鼠模型 |
| 9537 | 2024-08-17 |
Single-Cell RNA-Seq of T Cells in B-ALL Patients Reveals an Exhausted Subset with Remarkable Heterogeneity
2021-10, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202101447
PMID:34365737
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了B细胞急性淋巴细胞白血病（B-ALL）患者和健康个体的外周血T细胞，发现了患者中具有显著异质性的耗竭T细胞亚群 | 首次揭示了B-ALL患者中耗竭T细胞的异质性及其亚群特征，并探讨了其可能的起源 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术揭示B-ALL患者中T细胞的功能集群，为免疫治疗和临床反应预测提供策略 | B-ALL患者和健康个体的外周血T细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 健康个体和B-ALL患者的T细胞样本 |
| 9538 | 2024-08-17 |
CD177 modulates the function and homeostasis of tumor-infiltrating regulatory T cells
2021-10-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-26091-4
PMID:34599187
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析肾透明细胞癌患者的免疫细胞，发现肿瘤浸润调节T细胞（TI Treg）存在两种不同的转录命运，其中Fate-1与较差的预后相关，并发现CD177在Fate-1 TI Treg细胞上特异性表达，阻断CD177可减少Treg细胞的抑制活性，为TI Treg特异性免疫治疗提供新靶点 | 首次发现CD177在Fate-1 TI Treg细胞上特异性表达，并揭示其对Treg细胞功能和肿瘤生长的影响 | 研究主要在体外和小鼠模型中进行，需要进一步在临床试验中验证 | 探索肿瘤浸润调节T细胞的功能和潜在治疗靶点 | 肾透明细胞癌患者的免疫细胞及肿瘤浸润调节T细胞 | 免疫学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 肾透明细胞癌患者 |
| 9539 | 2024-08-17 |
Escape of hair follicle stem cells causes stem cell exhaustion during aging
2021-10, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-021-00103-w
PMID:37118327
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研究论文 | 本研究探讨了衰老过程中毛囊干细胞（HF-SCs）耗竭的机制 | 首次在活体动物中观察到衰老过程中毛囊干细胞的耗竭过程，并揭示了上皮细胞从毛囊干细胞微环境中逃逸的新机制 | NA | 阐明衰老过程中毛囊干细胞耗竭的机制及其对组织退化的影响 | 衰老小鼠的毛囊干细胞及其上皮细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序和转座酶可及染色质测序（ATAC-seq） | NA | 细胞 | 衰老小鼠 |
| 9540 | 2024-08-17 |
Spatial Transcriptomics of Nematodes Identifies Sperm Cells as a Source of Genomic Novelty and Rapid Evolution
2021-01-04, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msaa207
PMID:32785688
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研究论文 | 本文通过比较两种远缘线虫的空间转录组，揭示了精子细胞中新基因的富集及其在快速进化中的作用 | 首次在线虫中发现“睾丸外”假说，表明精子相关区域中新基因的富集 | NA | 探究基因表达的进化和新基因在空间分辨率下的作用 | 两种远缘线虫Caenorhabditis elegans和Pristionchus pacificus的空间转录组 | 基因组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 两种线虫的成年虫体 |