单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 8721 - 8740 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8721 | 2024-09-11 |
SpatialCorr identifies gene sets with spatially varying correlation structure
2022-12-19, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2022.100369
PMID:36590683
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为SpatialCorr的方法，用于识别具有空间变化相关结构的基因集 | SpatialCorr能够检测基因集在组织区域内的空间诱导相关性差异，这是现有方法无法实现的 | NA | 开发一种新的统计方法，用于识别空间转录组数据中基因集的空间变化相关结构 | 空间转录组数据中的基因集 | 生物信息学 | 皮肤鳞状细胞癌 | 空间转录组技术 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 8722 | 2024-09-11 |
Do Corticosteroid Receptor mRNA Levels Predict the Expression of Their Target Genes?
2022-Dec-15, Journal of the Endocrine Society
IF:3.0Q2
DOI:10.1210/jendso/bvac188
PMID:36578881
|
研究论文 | 研究皮质类固醇受体mRNA水平与其靶基因表达之间的关系 | 探讨了MR和GR mRNA水平与GILZ mRNA表达的相关性，并发现MR mRNA水平在某些情况下可能限制受体作用 | 研究仅限于小鼠模型，且在单细胞水平上的相关性较弱 | 探究皮质类固醇受体mRNA水平与其靶基因表达之间的关系 | 皮质类固醇受体（MR和GR）及其靶基因GILZ的mRNA表达 | NA | NA | 原位杂交 | NA | mRNA | 雄性小鼠 |
| 8723 | 2024-09-11 |
DeepST: identifying spatial domains in spatial transcriptomics by deep learning
2022-12-09, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac901
PMID:36250636
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为DeepST的深度学习框架，用于在空间转录组学中识别空间域 | DeepST在基准数据集上表现优于现有的最先进方法，并能有效整合来自多个批次或不同技术的空间转录组数据 | NA | 开发一种准确且通用的深度学习框架，用于在空间转录组学中识别空间域 | 人类背外侧前额叶皮层和乳腺癌的空间转录组数据 | 机器学习 | 乳腺癌 | 深度学习 | 深度学习框架 | 空间转录组数据 | 涉及人类背外侧前额叶皮层和乳腺癌的空间转录组数据集 |
| 8724 | 2024-09-11 |
A dietary change to a high-fat diet initiates a rapid adaptation of the intestine
2022-11-15, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111641
PMID:36384107
|
研究论文 | 研究了高脂饮食对小鼠肠道上皮细胞的快速适应性反应 | 首次使用生理指标和单细胞转录组学研究高脂饮食对肠道上皮细胞的即时反应 | 研究仅限于小鼠模型，未探讨其他物种的反应 | 探讨高脂饮食对肠道上皮细胞的即时反应 | 小鼠肠道上皮细胞 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠样本 |
| 8725 | 2024-09-11 |
Podocalyxin-Like Protein 1 Regulates Pluripotency through the Cholesterol Biosynthesis Pathway
2022-Nov-14, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202205451
PMID:36373710
|
研究论文 | 研究了膜蛋白podocalyxin-like蛋白1（PODXL）通过胆固醇生物合成途径调节多能性的机制 | 首次报道了膜蛋白PODXL调节从头胆固醇生物合成，并发现人类多能干细胞（hPSCs）对胆固醇耗竭比成纤维细胞更敏感 | NA | 揭示信号机制对扩展多能干细胞（EPSC）状态和原始多能性的关键作用，以理解胚胎发育 | 膜蛋白PODXL在扩展和原始多能性中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 8726 | 2024-09-11 |
Increased SARS-CoV-2 Infection, Protease, and Inflammatory Responses in Chronic Obstructive Pulmonary Disease Primary Bronchial Epithelial Cells Defined with Single-Cell RNA Sequencing
2022-09-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202108-1901OC
PMID:35549656
|
研究论文 | 研究了慢性阻塞性肺病（COPD）患者的原代支气管上皮细胞在SARS-CoV-2感染后的反应 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了COPD患者的支气管上皮细胞对SARS-CoV-2感染的更高易感性及其背后的机制 | 研究仅限于COPD患者的原代支气管上皮细胞，未涉及其他类型的细胞或组织 | 探讨COPD患者对SARS-CoV-2感染的易感性及其背后的分子机制 | COPD患者的原代支气管上皮细胞 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 健康受试者和COPD患者的原代支气管上皮细胞 |
| 8727 | 2024-09-11 |
Electrical stimulation of the splenic nerve bundle ameliorates dextran sulfate sodium-induced colitis in mice
2022-Jun-17, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-022-02504-z
PMID:35715845
|
研究论文 | 研究电刺激脾神经束对小鼠DSS诱导的结肠炎的治疗效果 | 首次探讨了电刺激脾神经束在炎症性肠病中的治疗价值 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在临床患者中验证 | 探讨电刺激脾神经束在炎症性肠病中的治疗效果 | 小鼠DSS诱导的结肠炎 | NA | 炎症性肠病 | RNA测序 | NA | RNA | 小鼠和人类脾细胞样本 |
| 8728 | 2024-09-11 |
A Dual-Filtration System for Single-Cell Sequencing of Circulating Tumor Cells and Clusters in HCC
2022-06, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/hep4.1900
PMID:35068084
|
研究论文 | 本文评估了一种双过滤系统在肝细胞癌患者中分离和测序循环肿瘤细胞和细胞团的可行性 | 开发了一种简单的双过滤系统用于分离和测序肝细胞癌患者的循环肿瘤细胞和细胞团，并发现这些细胞和细胞团的基因表达与患者的预后相关 | 样本量较小，仅涉及8名患者 | 评估双过滤系统在肝细胞癌患者中分离和测序循环肿瘤细胞和细胞团的可行性，并探讨其与患者预后的关系 | 肝细胞癌患者的循环肿瘤细胞和细胞团 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 8名肝细胞癌患者，其中6名患者的循环肿瘤细胞或细胞团可识别，共测序38个循环肿瘤细胞和33个细胞团 |
| 8729 | 2024-09-11 |
Alternative neural systems: What is a neuron? (Ctenophores, sponges and placozoans)
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.1071961
PMID:36619868
|
研究论文 | 本文探讨了神经系统的多样性，特别是早期动物分支中独立进化的不同神经整合系统 | 提出了神经元的新定义，并支持神经元和突触的多重起源假说 | NA | 重新定义神经元，并探讨早期动物分支中神经系统的多样性 | 早期动物分支中的神经整合系统，包括栉水母、海绵和扁形虫 | 神经科学 | NA | scRNA-seq 和显微镜技术 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 8730 | 2024-09-11 |
Benchmarking automated cell type annotation tools for single-cell ATAC-seq data
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.1063233
PMID:36583014
|
研究论文 | 本文评估了五种单细胞ATAC-seq注释方法的分类准确性和可扩展性 | 首次对单细胞ATAC-seq数据注释方法进行了基准测试 | 研究主要集中在小鼠和人类组织数据上，未涵盖其他物种 | 评估现有单细胞ATAC-seq数据自动注释工具的性能 | 五种单细胞ATAC-seq注释方法在不同数据集上的表现 | 单细胞测序 | NA | 单细胞ATAC-seq | NA | 单细胞数据 | 使用来自小鼠和人类组织的公开单细胞数据集，包括脑、肺、肾、PBMC和BMMC |
| 8731 | 2024-09-11 |
Nuclear envelope, chromatin organizers, histones, and DNA: The many achilles heels exploited across cancers
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.1068347
PMID:36589746
|
综述 | 本文综述了核膜蛋白、染色质组织者、组蛋白和DNA在癌症中的异常调控及其对癌症发生的影响 | 本文探讨了核膜蛋白、组蛋白变体和癌组蛋白在癌症中对染色质组织和基因表达的异常调控，并介绍了单细胞测序、成像技术和高级数据挖掘方法在设计靶向癌症细胞生长和增殖的小分子药物中的应用 | NA | 探讨核膜蛋白、组蛋白变体和癌组蛋白在癌症中的异常调控及其对癌症发生的影响 | 核膜蛋白、染色质组织者、组蛋白和DNA | NA | 癌症 | 单细胞测序、成像技术、高级数据挖掘 | NA | NA | NA |
| 8732 | 2024-09-11 |
A Molecular Calcium Integrator Reveals a Striatal Cell Type Driving Aversion
2020-12-23, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.11.015
PMID:33308478
|
研究论文 | 本文介绍了一种分子技术FLiCRE，用于稳定标记表现出细胞内钙浓度增加的细胞，并在小鼠伏隔核中使用单细胞RNA测序检测FLiCRE转录本 | 开发了一种新的分子技术FLiCRE，能够在细胞内钙浓度增加时稳定标记细胞，并利用单细胞RNA测序同时读取细胞类型和钙激活历史 | NA | 开发一种分子技术，用于精确分析、选择和重新编程异质细胞群体 | 小鼠伏隔核中的神经元群体 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠伏隔核中的神经元群体 |
| 8733 | 2024-09-11 |
Single-cell transcriptome analysis of the novel coronavirus (SARS-CoV-2) associated gene ACE2 expression in normal and non-obstructive azoospermia (NOA) human male testes
2020-07, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-020-1705-0
PMID:32361911
|
研究论文 | 研究分析了新型冠状病毒（SARS-CoV-2）相关基因ACE2在正常和非梗阻性无精子症（NOA）男性睾丸中的单细胞转录组表达 | 首次通过单细胞RNA测序分析了ACE2在不同睾丸细胞类型中的表达，并发现了ACE2在Sertoli细胞中的高表达 | 研究样本量有限，仅包括853个胚胎原始生殖细胞和2854个正常睾丸细胞，以及228个NOA患者的Sertoli细胞 | 评估SARS-CoV-2病毒对男性生殖系统的潜在影响 | 正常和非梗阻性无精子症（NOA）男性睾丸中的ACE2表达 | 基因组学 | 男性生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 853个胚胎原始生殖细胞，2854个正常睾丸细胞，228个NOA患者的Sertoli细胞 |
| 8734 | 2024-09-10 |
Single-cell analysis reveals the disparities in immune profiles between younger and elder patients
2024-Sep-08, European geriatric medicine
IF:3.5Q2
DOI:10.1007/s41999-024-01032-8
PMID:39244673
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了年轻和老年非小细胞肺癌患者之间的免疫特征差异 | 揭示了老年患者与年轻患者在肿瘤微环境中的免疫细胞组成和功能通路的显著差异 | NA | 旨在解码年轻和老年肺癌患者之间肿瘤微环境的差异 | 年轻和老年非小细胞肺癌患者的免疫特征 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 96,491个老年患者细胞和169,207个年轻患者细胞 |
| 8735 | 2024-09-10 |
A primer on single-cell RNA-seq analysis using dendritic cells as a case study
2024-Sep-08, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.15009
PMID:39245787
|
review | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在树突状细胞（DCs）研究中的应用，旨在为免疫学家提供全面的单细胞转录组分析入门 | 揭示了DC亚群的先前未被认识的复杂性和异质性，扩展了对DC生物学的理解 | NA | 为免疫学家提供单细胞转录组分析的全面介绍，并探讨其在DC生物学中的应用 | 树突状细胞（DCs）及其亚群 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 8736 | 2024-09-10 |
Defining cell type-specific immune responses in a mouse model of allergic contact dermatitis by single-cell transcriptomics
2024-Aug-30, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.94698
PMID:39213029
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学分析，研究了小鼠过敏性接触性皮炎模型中细胞类型特异性免疫反应 | 揭示了过敏性接触性皮炎中不同细胞类型的特异性免疫反应，并识别了真皮成纤维细胞在塑造1型皮肤炎症中的关键作用 | NA | 研究过敏性接触性皮炎中细胞类型特异性免疫反应 | 小鼠过敏性接触性皮炎模型中的免疫细胞和皮肤常驻细胞 | 单细胞转录组学 | 过敏性接触性皮炎 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠和人类过敏性接触性皮炎皮肤样本 |
| 8737 | 2024-09-10 |
CRISPR-CasRx-mediated disruption of Aqp1/Adrb2/Rock1/Rock2 genes reduces intraocular pressure and retinal ganglion cell damage in mice
2024-Jul-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50050-4
PMID:39080269
|
研究论文 | 研究使用CRISPR-CasRx技术干扰Aqp1/Adrb2/Rock1/Rock2基因在小鼠中的表达，以降低眼内压并保护视网膜神经节细胞 | 首次使用CasRx技术干扰与房水循环相关的基因，显著降低小鼠眼内压并保护视网膜神经节细胞 | 研究仅在雌性小鼠中进行，结果的普遍性有待验证 | 探索通过基因干扰降低眼内压并保护视网膜神经节细胞的新方法 | 雌性小鼠的眼内压和视网膜神经节细胞 | 基因编辑 | 青光眼 | CRISPR-CasRx | NA | 单细胞测序数据 | 雌性小鼠 |
| 8738 | 2024-09-10 |
Data normalization for addressing the challenges in the analysis of single-cell transcriptomic datasets
2024-May-06, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10364-5
PMID:38711017
|
综述 | 本文综述了单细胞转录组数据分析中的数据标准化方法 | 本文详细讨论了不同标准化方法的分类及其优缺点 | 没有一种标准化方法在所有情况下都表现最佳，需要根据具体指标评估 | 指导读者选择最合适的数据标准化方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 8739 | 2024-09-10 |
Inhibition of heme oxygenase 1 alleviates thoracic aortic aneurysm via restoration of extracellular matrix
2024-01-29, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2023.149405
PMID:38147696
|
研究论文 | 研究探讨了血红素氧合酶1（HO-1）在胸主动脉瘤（TAA）中的作用及其通过抑制HO-1减轻TAA的机制 | 首次揭示了HO-1阳性巨噬细胞在TAA中的重要作用，并证明了通过抑制HO-1可以减轻TAA并恢复细胞外基质（ECM） | 研究主要基于小鼠模型和临床样本，缺乏更大规模的人类临床试验验证 | 探讨HO-1在胸主动脉瘤中的作用及其潜在的治疗机制 | 胸主动脉瘤（TAA）及其相关细胞和分子机制 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、Western blot、组织学检测 | NA | RNA序列、蛋白质表达数据 | 113,800个胸主动脉细胞样本，BAPN诱导的TAA小鼠模型及TAA患者样本 |
| 8740 | 2024-09-10 |
SARS-CoV-2 niches in human placenta revealed by spatial transcriptomics
2023-09-08, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2023.06.003
PMID:37423216
|
研究论文 | 研究利用空间转录组学揭示了SARS-CoV-2在人类胎盘中的微环境 | 首次利用空间转录组学技术生成高分辨率的胎盘转录图谱，揭示了SARS-CoV-2在胎盘微环境中的动态响应 | 样本量较小，仅包括少数健康对照和COVID-19感染者 | 探究SARS-CoV-2在人类胎盘中的微环境及其对胎盘功能的影响 | 人类胎盘中的SARS-CoV-2感染及其转录组变化 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组 | 13个胎盘样本，包括4个健康对照、4个无症状感染者和5个有症状感染者 |