单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 8601 - 8620 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8601 | 2024-09-13 |
Esm-1 mediates transcriptional polarization associated with diabetic kidney disease
2024-Jun-01, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00419.2023
PMID:38601985
|
研究论文 | 研究探讨了Esm-1在糖尿病肾病中的转录极化作用 | 利用公开的单细胞RNA测序数据和bulk转录组数据，首次详细描述了Esm-1在肾脏内皮细胞中的表达及其在糖尿病肾病中的变化 | 研究主要基于小鼠和人类的数据，缺乏其他物种的验证 | 探究Esm-1在糖尿病肾病中的转录极化作用及其对疾病进展的影响 | 肾脏内皮细胞和糖尿病肾病患者 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 27,786个肾脏内皮细胞，20个健康受试者和41个糖尿病肾病患者 |
| 8602 | 2024-09-13 |
Coordinated immune dysregulation in juvenile dermatomyositis revealed by single-cell genomics
2024-May-14, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.176963
PMID:38743491
|
研究论文 | 本文通过单细胞基因组学研究了青少年皮肌炎（JDM）中的免疫失调 | 揭示了JDM中B细胞向未成熟幼稚状态的偏移以及T细胞的Th2介导炎症特征，并发现了免疫群体中超激活的I型IFN反应与先前未被发现的细胞状态之间的协调关系 | NA | 探讨青少年皮肌炎（JDM）中免疫系统的失调机制 | JDM患者的血液样本 | NA | 青少年皮肌炎 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 不同疾病活动阶段的JDM患者血液样本 |
| 8603 | 2024-09-13 |
Machine learning and single-cell transcriptome profiling reveal regulation of fibroblast activation through THBS2/TGFβ1/P-Smad2/3 signalling pathway in hypertrophic scar
2024-Mar, International wound journal
IF:2.6Q1
DOI:10.1111/iwj.14481
PMID:37986676
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序和机器学习方法，揭示了肥厚性瘢痕中纤维母细胞激活的调控机制 | 首次通过单细胞转录组测序和多种机器学习算法，识别出与肥厚性瘢痕相关的关键基因模块，并建立了基于卷积神经网络的诊断和预测模型 | 研究样本量较小，且仅限于皮肤样本，未来需扩大样本量和研究范围以验证结果的普适性 | 揭示肥厚性瘢痕形成机制，并开发新的诊断和治疗标志物 | 肥厚性瘢痕中的纤维母细胞及其相关基因 | 机器学习 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序 | 卷积神经网络 | 基因表达数据 | 正常皮肤和肥厚性瘢痕样本 |
| 8604 | 2024-09-13 |
Polycystic ovarian syndrome (PCOS) and recurrent spontaneous abortion (RSA) are associated with the PI3K-AKT pathway activation
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.17950
PMID:39253602
|
研究论文 | 研究探讨了多囊卵巢综合征（PCOS）和复发性自然流产（RSA）的共同病理机制，并揭示了PI3K-AKT信号通路在其中的作用 | 首次揭示了PCOS和RSA之间共同的病理机制，并探讨了PI3K-AKT信号通路在两种疾病中的作用 | NA | 阐明导致多囊卵巢综合征（PCOS）和复发性自然流产（RSA）的机制 | 多囊卵巢综合征（PCOS）和复发性自然流产（RSA）的病理机制 | NA | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序（RNA-seq）、实时定量PCR（RT-qPCR）、细胞计数试剂盒-8（CCK-8）、流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自Gene Expression Omnibus（GEO）数据库的PCOS和RSA患者的单细胞RNA-seq数据集 |
| 8605 | 2024-09-13 |
Chemokine receptors in primary and secondary lymphoid tissues
2024, International review of cell and molecular biology
DOI:10.1016/bs.ircmb.2023.11.003
PMID:39260934
|
综述 | 本文综述了趋化因子受体在初级和次级淋巴组织中的存在和功能 | 介绍了新技术如高维光谱流式细胞术和单细胞测序在趋化因子受体网络及其配体研究中的应用 | NA | 探讨趋化因子受体在免疫细胞中的作用及其在初级和次级淋巴器官中的分布 | 趋化因子受体及其在骨髓、胸腺、脾脏、淋巴结和派尔集合淋巴结等淋巴组织中的功能 | NA | NA | 高维光谱流式细胞术、单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 8606 | 2024-09-13 |
Gestational ozone inhalation elicits maternal cardiac dysfunction and transcriptional changes to placental pericytes and endothelial cells
2023-11-28, Toxicological sciences : an official journal of the Society of Toxicology
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/toxsci/kfad092
PMID:37695302
|
研究论文 | 研究了孕期臭氧吸入对母体心脏功能和胎盘细胞转录变化的影响 | 首次揭示了孕期臭氧暴露对母体心脏功能和胎盘细胞转录组的显著影响 | 研究仅限于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类 | 探讨孕期臭氧暴露对母体心血管功能和胎盘发育的影响 | 孕期吸入臭氧对母体心脏功能和胎盘细胞转录组的影响 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 孕期第10.5天暴露于1PPM臭氧或过滤空气的小鼠样本 |
| 8607 | 2024-09-13 |
Human-specific genetics: new tools to explore the molecular and cellular basis of human evolution
2023-10, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-022-00568-4
PMID:36737647
|
综述 | 本文综述了利用现代和古代人类、大猩猩和其他灵长类动物的基因组测序数据，以及新兴的单细胞测序、基因操作和干细胞培养技术，来探索人类特异性遗传变化及其对人类进化分子和细胞基础的影响 | 本文介绍了利用单细胞测序、基因操作和干细胞培养等新兴技术，结合基因组测序数据，来研究人类特异性遗传变化及其对人类进化分子和细胞基础的影响 | 由于大量低效应大小的遗传变化、细胞类型水平上发育差异的有限描述以及缺乏实验模型，将人类特异性遗传变化与物种差异联系起来一直具有挑战性 | 理解人类特异性遗传变化如何影响人类的形态、认知和代谢变化，从而揭示人类进化的分子和细胞基础 | 现代和古代人类、大猩猩和其他灵长类动物的基因组，以及人类特异性遗传变化对人类进化分子和细胞基础的影响 | 基因组学 | NA | 单细胞测序、基因操作、干细胞培养 | NA | 基因组数据 | 现代和古代人类、大猩猩和其他灵长类动物的基因组样本 |
| 8608 | 2024-09-13 |
Cross-site reproducibility of human cortical organoids reveals consistent cell type composition and architecture
2023-Jul-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.28.550873
PMID:37546772
|
研究论文 | 本文研究了人类皮质类器官（hCO）在不同研究站点之间的可重复性，揭示了细胞类型组成和结构的稳定性 | 首次评估了使用统一协议在多个站点生成的人类皮质类器官的可重复性 | 研究中发现了类器官大小和形态的跨站点差异，以及代谢和细胞应激的差异 | 评估人类皮质类器官在不同研究站点之间的可重复性，为神经发育障碍的建模提供基础 | 人类皮质类器官的细胞类型组成和结构 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、三维荧光成像、相位对比成像、qPCR和流式细胞术 | NA | 细胞 | 三个独立研究组使用一个诱导多能干细胞（iPSC）系生成的类器官 |
| 8609 | 2024-09-13 |
Batch alignment of single-cell transcriptomics data using deep metric learning
2023-02-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-36635-5
PMID:36810607
|
研究论文 | 本文开发了一种基于深度度量学习的scRNA-seq数据批次对齐模型scDML | scDML能够去除批次效应，提高聚类性能，准确恢复真实细胞类型，并在不同物种和组织中表现优于现有方法 | NA | 解决scRNA-seq数据中的批次效应问题，提高细胞类型检测的准确性 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 深度度量学习 | 深度度量学习模型 | 转录组数据 | 涉及不同物种和组织的多个数据集 |
| 8610 | 2024-09-13 |
Spatial transcriptomics analysis of zone-dependent hepatic ischemia-reperfusion injury murine model
2023-02-18, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-04564-0
PMID:36804628
|
研究论文 | 本研究结合组织病理学检查与空间转录组学，分析了小鼠肝脏缺血再灌注损伤模型的区域依赖性损伤模式及其相关分子变化 | 揭示了肝组织中对缺血再灌注损伤最敏感的区域，并预测了celastrol通过诱导缺血预处理来保护肝脏免受缺血再灌注损伤的机制 | NA | 探讨缺血再灌注损伤与肝脏异质性之间的关系 | 小鼠肝脏缺血再灌注损伤模型 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 8611 | 2024-09-13 |
Single-cell pair-wise relationships untangled by composite embedding model
2023-Feb-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106025
PMID:36824286
|
研究论文 | 本文提出了一种名为SPRUCE的可扩展机器学习方法，用于解析单细胞RNA-seq数据中的细胞间通信模式 | 本文提出的SPRUCE方法能够系统地确定单细胞RNA-seq数据中的常见细胞间通信模式，并揭示了肿瘤异质性的一部分可以通过差异交互模式而非静态标记基因表达来更好地理解 | NA | 研究肿瘤微环境中的细胞间通信模式 | 乳腺癌数据集中的细胞间通信模式 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA-seq | 复合嵌入模型 | RNA-seq数据 | 多个乳腺癌数据集 |
| 8612 | 2024-09-13 |
Genomic and microenvironmental heterogeneity shaping epithelial-to-mesenchymal trajectories in cancer
2023-02-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-36439-7
PMID:36774358
|
研究论文 | 本文提出了一种基于转录组信号评估单个肿瘤中EMT转变的方法，并应用于7180个上皮来源的肿瘤，识别出具有预后和治疗价值的三种宏观状态 | 本文创新性地提出了评估EMT转变的方法，并结合空间转录组学和单细胞数据集，深入探讨了EMT转变的空间异质性和与肿瘤微环境中细胞的相互作用模式 | 本文主要基于转录组数据，未涉及其他类型的组学数据，可能限制了对EMT转变机制的全面理解 | 研究EMT转变的分子标志物及其在癌症进展中的作用 | 上皮来源的肿瘤及其EMT转变过程 | 数字病理学 | NA | 转录组学 | NA | 转录组数据 | 7180个上皮来源的肿瘤样本 |
| 8613 | 2024-09-13 |
SampleQC: robust multivariate, multi-cell type, multi-sample quality control for single-cell data
2023-02-10, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-02859-3
PMID:36765378
|
研究论文 | 介绍了一种名为SampleQC的单细胞RNA测序数据质量控制方法，该方法通过高斯混合模型在多个样本中进行稳健拟合，提高了对稀有细胞类型的检测敏感性并减少了偏差 | 引入了一种新的质量控制方法SampleQC，通过高斯混合模型在多个样本中进行稳健拟合，相比现有方法提高了对稀有细胞类型的检测敏感性并减少了偏差 | NA | 开发一种新的单细胞RNA测序数据质量控制方法，以提高对稀有细胞类型的检测敏感性并减少偏差 | 单细胞RNA测序数据的质量控制 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 高斯混合模型 | 单细胞RNA测序数据 | 867,000个细胞，172个样本 |
| 8614 | 2024-09-13 |
ZBTB12 is a molecular barrier to dedifferentiation in human pluripotent stem cells
2023-02-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-36178-9
PMID:36759523
|
研究论文 | 本文报道了ZBTB12作为人类多能干细胞去分化分子屏障的作用 | 首次揭示了ZBTB12在防止人类多能干细胞去分化中的关键作用，并阐明了其通过调节HERVH和lncRNAs表达的机制 | NA | 探讨细胞命运单向转变的分子机制 | 人类多能干细胞及其去分化过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 8615 | 2024-09-13 |
Common molecular features of H3K27M DMGs and PFA ependymomas map to hindbrain developmental pathways
2023-02-09, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-023-01514-z
PMID:36759899
|
研究论文 | 本文研究了H3K27M DMG和PFA室管膜瘤的共同分子特征，并将其映射到后脑发育途径 | 通过比较基因组、整体转录组、染色质相关特征和单细胞RNA测序数据，发现了两种肿瘤类别的共同分子特征 | NA | 探讨H3K27M DMG和PFA室管膜瘤的共同分子特征及其与后脑发育途径的关系 | H3K27M DMG和PFA室管膜瘤 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、转录组数据、染色质相关数据 | NA |
| 8616 | 2024-09-13 |
In vivo imaging of inflammatory response in cancer research
2023-Feb-07, Inflammation and regeneration
IF:5.0Q1
DOI:10.1186/s41232-023-00261-x
PMID:36750856
|
综述 | 本文综述了使用双光子激发显微镜（2P-IVM）进行活体成像技术，以揭示癌症微环境中细胞间相互作用的研究现状 | 讨论了红移指示剂和光遗传学工具在2P-IVM中的潜在应用，并强调了2P-IVM在单细胞转录组学和数据驱动研究时代中的关键作用 | 体外重现肿瘤微环境中的动态事件尚未实现 | 总结2P-IVM在癌症研究中的应用，并探讨其未来发展方向 | 癌症微环境中的炎症反应和细胞间相互作用 | 数字病理学 | 癌症 | 双光子激发显微镜（2P-IVM） | NA | 图像 | NA |
| 8617 | 2024-09-13 |
Single-cell transcriptome analysis reveals liver injury induced by glyphosate in mice
2023-Feb-04, Cellular & molecular biology letters
IF:9.2Q1
DOI:10.1186/s11658-023-00426-z
PMID:36739397
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了草甘膦对小鼠肝脏的损伤效应 | 首次生成了草甘膦暴露小鼠肝脏的单细胞RNA测序图谱，揭示了草甘膦引起的细胞组成变化、转录改变以及细胞间通讯失调 | NA | 探讨草甘膦对肝脏的毒性及其分子机制 | 草甘膦处理和未处理的小鼠肝脏组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 草甘膦处理和未处理的小鼠肝脏组织样本 |
| 8618 | 2024-09-13 |
ScRNA-seq and ST-seq in liver research
2023-Feb-03, Cell regeneration (London, England)
DOI:10.1186/s13619-022-00152-5
PMID:36732412
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组测序（ST-seq）在肝脏研究中的应用及其对肝脏发育、再生和疾病研究的贡献 | 探讨了scRNA-seq和ST-seq，特别是ST-seq，在肝脏研究中的新机遇 | 讨论了ST-seq在肝脏研究中的局限性，包括敏感性、获取精确单细胞信息的能力有限以及数据处理方法等问题 | 探索scRNA-seq和ST-seq在肝脏研究中的进展及其对基础问题的研究潜力 | 肝脏发育、再生和疾病 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组测序（ST-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 8619 | 2024-09-13 |
Integrated Single-Cell (Phospho-)Protein and RNA Detection Uncovers Phenotypic Characteristics and Active Signal Transduction of Human Antibody-Secreting Cells
2023-02, Molecular & cellular proteomics : MCP
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.mcpro.2023.100492
PMID:36623694
|
研究论文 | 本文结合体外分化B细胞为抗体分泌细胞（ASCs）的方法与多组学单细胞测序技术，检测和量化免疫球蛋白亚类特异性表面标记、转录组和信号转导通路成分 | 本文创新性地整合了mRNA、蛋白质表达和磷酸化蛋白质检测，形成了一个综合数据集，并揭示了不同ASCs在分泌不同抗体时的差异特征 | NA | 深入理解人类抗体分泌细胞的表型特征和活性信号转导 | 人类抗体分泌细胞（ASCs） | NA | NA | 多组学单细胞测序技术 | NA | mRNA、蛋白质表达、磷酸化蛋白质 | NA |
| 8620 | 2024-09-13 |
A topographic atlas defines developmental origins of cell heterogeneity in the human embryonic lung
2023-02, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-022-01064-x
PMID:36646791
|
研究论文 | 本文创建了一个早期人类肺发育的综合地形图谱，揭示了细胞异质性的发育起源 | 本文首次整合了单细胞RNA测序和空间转录组学，创建了一个交互式网络平台，展示了细胞分化和成熟的基因表达程序 | NA | 阐明人类胚胎肺中细胞异质性的起源和生成机制 | 早期人类肺发育中的83种细胞状态及其空间发育轨迹 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |