单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27708 篇文献，本页显示第 8421 - 8440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8421 | 2024-09-23 |
Transcription Factor Activity Regulating Macrophage Heterogeneity during Skin Wound Healing
2024-Aug-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2400172
PMID:38940624
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研究论文 | 研究通过整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据，推断转录因子在皮肤伤口愈合过程中巨噬细胞异质性中的活性 | 改进了贝叶斯推断转录因子活性模型，结合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据，揭示了转录因子在伤口愈合中巨噬细胞异质性中的调控作用 | NA | 研究转录因子在皮肤伤口愈合过程中巨噬细胞异质性中的调控作用 | 巨噬细胞在皮肤伤口愈合过程中的异质性 | NA | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | 贝叶斯推断模型 | RNA、染色质可及性 | NA |
| 8422 | 2024-09-23 |
Human genetics and epigenetics of alcohol use disorder
2024-Aug-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI172885
PMID:39145449
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综述 | 本文综述了酒精使用障碍（AUD）的遗传学和表观遗传学研究进展 | 本文总结了从早期候选基因研究到当前全基因组扫描的技术进步，揭示了AUD的众多遗传和表观遗传风险因素 | 本文讨论了当前研究的局限性，包括增加GWAS和EWAS研究的能力以及扩大分析中包含的群体多样性 | 探讨酒精使用障碍的遗传学和表观遗传学机制 | 酒精使用障碍（AUD）及其遗传和表观遗传风险因素 | NA | 酒精使用障碍 | 全基因组关联研究（GWAS）、表观基因组关联研究（EWAS）、全基因组测序、多组学、单细胞测序、空间转录组学 | NA | 基因组数据、表观基因组数据、转录组数据 | 超过一百万参与者 |
| 8423 | 2024-09-23 |
Hydrogel crosslinking modulates macrophages, fibroblasts, and their communication, during wound healing
2024-Aug-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50072-y
PMID:39122702
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研究论文 | 研究了交联度对基于明胶的水凝胶在伤口愈合过程中对巨噬细胞和成纤维细胞行为的影响 | 发现轻度交联的水凝胶能促进细胞浸润并减少疤痕形成，而重度交联的水凝胶则增加炎症并导致巨噬细胞亚群的氧化活性和细胞融合 | 研究仅限于雌性小鼠模型，未涉及其他物种或性别 | 探讨水凝胶交联度对伤口愈合过程中免疫和基质细胞行为的影响 | 基于明胶的水凝胶、巨噬细胞、成纤维细胞、伤口愈合 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 雌性小鼠 |
| 8424 | 2024-09-23 |
Integrative single-cell RNA-seq and spatial transcriptomics analyses reveal diverse apoptosis-related gene expression profiles in EGFR-mutated lung cancer
2024-Aug-09, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06940-y
PMID:39122703
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析，揭示了EGFR突变型肺癌中与细胞凋亡相关的基因表达谱的多样性 | 首次综合利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术，系统分析了EGFR突变型肺癌中细胞凋亡相关基因的表达变化 | 研究主要基于细胞系和转基因小鼠模型，可能与人类肺癌的实际情况存在差异 | 探讨EGFR突变型肺癌中细胞凋亡相关基因在EGFR-TKI耐药性发展过程中的表达变化 | EGFR突变型肺癌细胞系和患者样本，以及EGFR驱动型肺癌的转基因小鼠模型 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学（ST） | NA | RNA | EGFR突变型肺癌细胞系和患者样本，以及EGFR驱动型肺癌的转基因小鼠模型 |
| 8425 | 2024-09-23 |
Benchmarking clustering, alignment, and integration methods for spatial transcriptomics
2024-Aug-09, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03361-0
PMID:39123269
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研究论文 | 本文系统地评估了多种最先进的算法在空间转录组学数据上的聚类、对齐和整合性能 | 首次对空间转录组学数据的聚类、对齐和整合方法进行了全面的基准测试 | 未提及具体限制 | 评估和比较不同空间转录组学数据处理方法的性能 | 空间转录组学数据的聚类、对齐和整合方法 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学数据 | 涉及多种真实和模拟数据集，大小、技术、物种和复杂性各异 |
| 8426 | 2024-09-23 |
Transcriptomic changes and gene fusions during the progression from Barrett's esophagus to esophageal adenocarcinoma
2024-Aug-07, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00623-8
PMID:39113153
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研究论文 | 研究了从Barrett食管到食管腺癌进展过程中的转录组变化和基因融合 | 首次全面分析了Barrett食管到食管腺癌进展过程中的转录组变化和基因融合 | 样本量较小，仅包括8个个体 | 揭示Barrett食管到食管腺癌进展过程中的转录组变化和基因融合 | Barrett食管和食管腺癌组织 | 数字病理学 | 食管癌 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 8个个体 |
| 8427 | 2024-09-23 |
Digital Spatial Profiling Identifies Distinct Molecular Signatures of Vascular Lesions in Pulmonary Arterial Hypertension
2024-08-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202307-1310OC
PMID:38568479
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研究论文 | 研究使用数字空间转录组学技术，分析了特发性肺动脉高压（IPAH）血管病变中的独特分子特征 | 首次通过数字空间转录组学技术，揭示了IPAH血管病变中的独特分子特征，并发现了与转化生长因子β信号传导、细胞外基质和内皮-间充质转化相关的基因富集 | 研究样本量较小，且仅限于IPAH和对照组的肺动脉 | 验证特发性肺动脉高压（IPAH）血管病变是否具有独特的分子特征 | 特发性肺动脉高压（IPAH）的血管病变和对照组的肺动脉 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 数字空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 11个IPAH肺样本和5个对照组肺动脉样本 |
| 8428 | 2024-09-23 |
Compound models and Pearson residuals for single-cell RNA-seq data without UMIs
2024-Jul-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.02.551637
PMID:37577688
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研究论文 | 本文提出了一种扩展非UMI单细胞RNA-seq数据标准化方法的复合模型，使用复合Pearson残差进行基因选择和数据嵌入 | 本文创新性地将复合分布应用于非UMI数据的建模，提出了复合Pearson残差方法，并发现放大分布可以用破幂律描述 | NA | 扩展Pearson残差方法至非UMI单细胞RNA-seq数据标准化 | 非UMI单细胞RNA-seq数据 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | 复合模型 | RNA-seq数据 | NA |
| 8429 | 2024-09-23 |
Pan-cancer mapping of single CD8+ T cell profiles reveals a TCF1:CXCR6 axis regulating CD28 co-stimulation and anti-tumor immunity
2024-Jul-16, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101640
PMID:38959885
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据分析，揭示了TCF1与CXCR6轴在调节CD28共刺激信号和抗肿瘤免疫中的作用 | 本文首次揭示了TCF1与CXCR6轴在调节CD8+ T细胞功能和抗肿瘤免疫中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证 | 揭示CD8+ T细胞在不同肿瘤微环境中的表达程序，为下一代免疫疗法提供依据 | CD8+ T细胞在七种人类癌症中的表达模式 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 矩阵分解算法 | 基因表达数据 | 33,161个CD8+ T细胞样本，来自132名患有七种癌症的患者 |
| 8430 | 2024-09-23 |
A brief history of somatostatin interneuron taxonomy or: how many somatostatin subtypes are there, really?
2024, Frontiers in neural circuits
IF:3.4Q2
DOI:10.3389/fncir.2024.1436915
PMID:39091993
|
研究论文 | 本文回顾了催产素中间神经元分类学的历史，并讨论了单细胞RNA测序技术在皮质神经元分类中的应用 | 提出了将催产素中间神经元细分为约十个“超类型”的分类方法，认为这种分类更符合传统形态学、电生理学和神经化学特征 | 指出基于基因表达微小差异的更细分类（如“t-类型”或“集群”）可能对研究人员不太有用，甚至可能违背分类的初衷 | 探讨催产素中间神经元的分类及其在实验神经科学中的应用 | 催产素中间神经元的分类及其在皮质网络中的作用 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 大量皮质神经元样本 |
| 8431 | 2024-09-23 |
Mitophagy Promotes Hair Regeneration by Activating Glutathione Metabolism
2024, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0433
PMID:39091635
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研究论文 | 本文研究了线粒体自噬通过调节谷胱甘肽代谢促进毛发生长的机制 | 首次揭示了线粒体自噬在毛发生长早期通过激活谷胱甘肽代谢促进毛囊干细胞增殖的作用 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚未在人类中验证 | 探讨线粒体自噬在毛发生长中的作用及其分子机制 | 毛囊干细胞和线粒体自噬相关基因 | NA | NA | 单细胞RNA测序、透射电子显微镜、免疫荧光染色、分子对接 | NA | RNA | 小鼠毛囊干细胞样本 |
| 8432 | 2024-09-23 |
CD36 restricts lipid-associated macrophages accumulation in white adipose tissues during atherogenesis
2024, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2024.1436865
PMID:39156133
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研究论文 | 研究探讨了CD36在动脉粥样硬化过程中对白色脂肪组织中脂质相关巨噬细胞积累的调控作用 | 首次发现CD36缺陷通过促进脂质相关巨噬细胞的积累，减少炎症并增加脂质代谢 | 研究仅在饮食诱导的动脉粥样硬化小鼠模型中进行，结果的普适性有待验证 | 探讨CD36在白色脂肪组织中对脂质代谢和炎症的调控作用 | 白色脂肪组织中的巨噬细胞及其亚群 | 心血管疾病 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用饮食诱导的动脉粥样硬化小鼠模型进行研究 |
| 8433 | 2024-09-23 |
Spatial transcriptomics of fetal membrane-Decidual interface reveals unique contributions by cell types in term and preterm births
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0309063
PMID:39159152
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研究论文 | 本研究使用单细胞转录组学方法，分析了足月和早产情况下胎儿膜-蜕膜界面各层的转录组网络，揭示了不同细胞类型在妊娠结局中的独特贡献 | 首次在空间水平上解析了胎儿膜-蜕膜界面各层在足月和早产情况下的转录组网络，识别了不同细胞类型在早产中的关键作用 | 样本量较小，仅包括13名患者的数据，可能影响结果的普适性 | 研究胎儿膜-蜕膜界面各层在足月和早产情况下的转录组特征，揭示其在妊娠结局中的作用 | 胎儿膜-蜕膜界面的各层细胞，包括羊膜上皮细胞、羊膜间质细胞、绒毛膜和蜕膜 | 数字病理学 | 妊娠疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 13名患者，包括足月未分娩、足月分娩、早产和早产伴胎膜早破 |
| 8434 | 2024-09-23 |
Blockade of IL-6R prevents preterm birth and adverse neonatal outcomes
2023-Dec, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2023.104865
PMID:37944273
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研究论文 | 研究探讨了IL-6R阻断剂在预防早产和不良新生儿结局中的作用 | 首次证明了IL-6R阻断剂可以有效预防由无菌性羊膜内炎症引起的早产和不良新生儿结局 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类临床试验中验证 | 探讨IL-6R阻断剂在预防早产和不良新生儿结局中的潜在治疗作用 | IL-6和IL-1α在无菌性羊膜内炎症中的作用，以及IL-6R阻断剂的治疗效果 | NA | 早产 | 蛋白质组学、单细胞RNA测序、QUEST-MRI、宏基因组测序 | NA | 蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据、MRI图像、宏基因组数据 | C57BL/6小鼠模型，具体样本数量未明确提及 |
| 8435 | 2024-09-23 |
Single-cell profiling and zebrafish avatars reveal LGALS1 as immunomodulating target in glioblastoma
2023-11-08, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.15252/emmm.202318144
PMID:37791581
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序和斑马鱼模型揭示了胶质母细胞瘤中LGALS1作为免疫调节靶点的潜力 | 首次通过单细胞RNA测序和斑马鱼模型研究了胶质母细胞瘤相关巨噬细胞与肿瘤细胞的动态相互作用，并识别出LGALS1作为主要的免疫抑制调节因子 | NA | 揭示胶质母细胞瘤中肿瘤异质性和免疫抑制微环境的关键因素，并寻找新的免疫调节靶点 | 胶质母细胞瘤相关巨噬细胞与肿瘤细胞的相互作用 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个胶质母细胞瘤患者样本 |
| 8436 | 2024-09-23 |
Microfluidics-free single-cell genomics with templated emulsification
2023-Nov, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01685-z
PMID:36879006
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研究论文 | 本文介绍了一种无需微流控设备的新型单细胞基因组学方法，基于粒子模板乳化技术 | 开发了一种无需微流控设备和专业硬件的单细胞RNA测序方法，通过粒子模板乳化技术实现单细胞封装和cDNA条码化 | NA | 开发一种简便、灵活且可扩展的单细胞测序工作流程 | 单细胞RNA测序和多组学测量 | 基因组学 | 急性白血病 | RNA测序 | NA | 转录组 | 数千个样本或数百万个细胞 |
| 8437 | 2024-09-23 |
Does Chronic Obstructive Pulmonary Disease Originate from Different Cell Types?
2023-11, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2023-0175PS
PMID:37584669
|
研究论文 | 本文探讨了慢性阻塞性肺病（COPD）是否由不同细胞类型引起，并讨论了当前研究中的知识空白和技术应用 | 本文提出了通过新技术如单细胞转录组学和蛋白质组学来研究COPD的潜在机制 | 本文主要讨论了当前研究的局限性和知识空白，未提供具体实验数据 | 探讨COPD是否由不同细胞类型引起，并研究这些细胞在疾病发展中的作用 | COPD的病理机制和不同细胞类型在疾病发展中的作用 | NA | 慢性阻塞性肺病 | 单细胞转录组学、蛋白质组学 | NA | NA | NA |
| 8438 | 2024-09-23 |
Loss of ANT1 Increases Fibrosis and Epithelial Cell Senescence in Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2023-11, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2022-0315OC
PMID:37487137
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研究论文 | 研究探讨了ANT1在特发性肺纤维化中的作用及其对细胞衰老和纤维化的影响 | 首次揭示了ANT1缺失通过线粒体功能障碍、增加细胞衰老和减少AT2细胞再生能力，促进特发性肺纤维化的机制 | NA | 探究ANT1在特发性肺纤维化中的作用及其对细胞衰老和纤维化的影响 | 特发性肺纤维化患者肺组织中的ANT1和ANT2表达 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序和组织染色 | NA | RNA | 特发性肺纤维化患者肺组织样本 |
| 8439 | 2024-09-23 |
A new Bayesian factor analysis method improves detection of genes and biological processes affected by perturbations in single-cell CRISPR screening
2023-Nov, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-02017-4
PMID:37770710
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研究论文 | 本文介绍了一种新的贝叶斯因子分析方法，用于改进单细胞CRISPR筛选中受扰动影响的基因和生物过程的检测 | 开发了一种名为引导稀疏因子分析（GSFA）的新统计方法，通过推断潜在因子来检测基因扰动效应，显著提高了检测能力 | NA | 改进单细胞CRISPR筛选数据的分析方法，提高基因扰动效应的检测能力 | 单细胞CRISPR筛选数据，特别是受扰动影响的基因和生物过程 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，CRISPR筛选 | 贝叶斯因子分析 | 基因表达数据 | 人类CD8 T细胞和神经前体细胞的单细胞CRISPR数据 |
| 8440 | 2024-09-23 |
Camel nanobody-based B7-H3 CAR-T cells show high efficacy against large solid tumours
2023-09-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-41631-w
PMID:37739951
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研究论文 | 研究基于骆驼纳米抗体的B7-H3 CAR-T细胞对大型实体瘤的高效性 | 开发了基于骆驼纳米抗体识别B7-H3 IgC域的CAR-T细胞，显示出对大型肿瘤的强大抗肿瘤活性 | 研究仅在雌性小鼠模型中进行，尚未在人类临床试验中验证 | 优化基于CAR-T细胞的免疫疗法，特别是针对实体瘤 | B7-H3蛋白及其在实体瘤中的作用 | NA | NA | 单细胞转录组RNA测序，功能性T细胞蛋白质组学分析 | NA | RNA测序数据，蛋白质组学数据 | 雌性小鼠 |