单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27707 篇文献，本页显示第 8401 - 8420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8401 | 2024-09-24 |
RGS19: A novel prognostic biomarker for tumor immunity in clear cell renal cell carcinoma revealed through comprehensive bulk and single-cell sequencing analysis
2024-Sep-21, Asian journal of surgery
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.asjsur.2024.09.057
PMID:39307631
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8402 | 2024-09-24 |
Gene regulatory mechanisms of T cell exhaustion in diffuse large B cell lymphoma based on single-cell transcriptome data
2024-Sep-19, Leukemia research
IF:2.1Q3
DOI:10.1016/j.leukres.2024.107588
PMID:39307100
|
研究论文 | 研究基于单细胞转录组数据分析弥漫性大B细胞淋巴瘤中T细胞耗竭的基因调控机制 | 首次全面分析了弥漫性大B细胞淋巴瘤中T细胞耗竭的基因表达特征，并发现了ID3基因在T细胞耗竭中的关键作用 | 研究依赖于公开的单细胞转录组数据，可能存在数据质量和样本多样性的限制 | 深入理解弥漫性大B细胞淋巴瘤中T细胞耗竭的分子病理机制，寻找新的治疗靶点 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤中的T细胞耗竭及其相关基因表达特征 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 使用公开的单细胞转录组数据 |
| 8403 | 2024-09-23 |
Constructing a disulfidptosis-related prognostic signature of hepatocellular carcinoma based on single-cell sequencing and weighted co-expression network analysis
2024-Oct, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-024-01968-z
PMID:38760515
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研究论文 | 本研究基于单细胞测序和加权共表达网络分析构建了与硫氧还蛋白相关的肝细胞癌预后标志物 | 首次构建了基于硫氧还蛋白相关基因的肝细胞癌预后模型，并探讨了高硫氧还蛋白组和低硫氧还蛋白组在肝细胞癌中的差异 | 研究仅基于TCGA和GSE14520数据集，样本量有限，需要进一步验证 | 探讨硫氧还蛋白相关基因在肝细胞癌中的临床预后特征 | 肝细胞癌患者及其预后 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序、加权共表达网络分析 | COX回归、Lasso回归 | 基因表达数据 | TCGA和GSE14520数据集中的肝细胞癌患者 |
| 8404 | 2024-09-23 |
Metabolic Heterogeneity and Potential Immunotherapeutic Responses Revealed by Single-Cell Transcriptomics of Breast Cancer
2024-Oct, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-024-01952-7
PMID:38578322
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学揭示了乳腺癌的代谢异质性和潜在的免疫治疗反应 | 首次全面阐明了乳腺癌在单细胞水平的转录组异质性，并揭示了癌症相关成纤维细胞在治疗抵抗中的作用 | 研究样本仅来自14名患者，可能影响结果的普适性 | 揭示乳腺癌的异质性及其与化疗抵抗和免疫治疗反应的关系 | 乳腺癌患者的肿瘤样本及其单细胞转录组 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 14名乳腺癌患者的样本 |
| 8405 | 2024-09-23 |
Spatiotemporal single-cell RNA sequencing reveals the role of steroid hormone pathway during chicken primordial follicle formation
2024-Oct, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2024.104090
PMID:39096826
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研究论文 | 研究通过时空单细胞RNA测序揭示了鸡原始卵泡形成过程中类固醇激素通路的作用 | 首次通过单细胞mRNA测序和空间转录组分析探索了鸡原始卵泡形成过程中的卵巢微环境和调控通路 | 研究仅限于鸡的卵巢组织，未涉及其他物种 | 揭示鸡原始卵泡形成过程中的分子调控机制 | 鸡的卵巢组织和原始卵泡形成过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞mRNA测序 | NA | mRNA | 收集了2天、5.5天和10.5天孵化的鸡的左侧卵巢组织 |
| 8406 | 2024-08-07 |
B-cell repertoire and functions in idiopathic nephrotic syndrome: what to learn from single-cell RNA sequencing?
2024-Oct, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2024.05.032
PMID:38977075
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8407 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Interaction between CCL19+ Inflammatory Keratinocytes and CCR7+ Dendritic Cells and B Cells in Pemphigus
2024-Oct, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2024.03.016
PMID:38537931
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8408 | 2024-09-23 |
Single-cell RNA sequencing identifies interferon-inducible monocytes/macrophages as a cellular target for mitigating the progression of abdominal aortic aneurysm and rupture risk
2024-Sep-21, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvae117
PMID:38836630
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序识别出干扰素诱导的单核细胞/巨噬细胞作为减轻腹主动脉瘤进展和破裂风险的细胞靶点 | 首次识别出干扰素诱导的单核细胞/巨噬细胞（IFNICs）在腹主动脉瘤发展中的作用，并发现其通过cGAS-STING和JAK-STAT通路促进I型干扰素的分泌 | 研究主要基于AngII诱导的ApoE-/-小鼠模型，结果的普适性有待进一步验证 | 探讨腹主动脉瘤发展过程中细胞类型和信号通路的变化，为开发治疗手段提供依据 | 腹主动脉瘤及其破裂风险 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | AngII诱导的ApoE-/-小鼠的腹主动脉样本 |
| 8409 | 2024-09-23 |
Immune profiling-based targeting of pathogenic T cells with ustekinumab in ANCA-associated glomerulonephritis
2024-Sep-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52525-w
PMID:39300109
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研究论文 | 本文通过空间和单细胞转录组分析，研究了ANCA相关性肾小球肾炎中致病性T细胞的特征，并探索了ustekinumab作为潜在治疗药物的效果 | 首次通过单细胞转录组分析识别出ANCA相关性肾小球肾炎中的致病性T细胞，并验证了ustekinumab作为治疗药物的潜力 | 研究样本量较小，仅涉及34名患者，且治疗效果需在更大规模的临床试验中进一步验证 | 探索ANCA相关性肾小球肾炎中致病性T细胞的特征，并寻找有效的治疗药物 | ANCA相关性肾小球肾炎患者及其肾脏样本 | NA | 肾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 34名ANCA相关性肾小球肾炎患者 |
| 8410 | 2024-09-23 |
Multi-omics features of immunogenic cell death in gastric cancer identified by combining single-cell sequencing analysis and machine learning
2024-09-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-73071-x
PMID:39294296
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研究论文 | 本文通过结合单细胞测序分析和机器学习，识别了胃癌中免疫原性细胞死亡的多组学特征 | 本文创新性地利用机器学习框架整合101种算法，构建了与免疫原性细胞死亡相关的基因特征，并验证了这些基因与胃癌免疫微环境和侵袭转移的关系 | NA | 阐明免疫原性细胞死亡在胃癌中的精确作用 | 胃癌中的免疫原性细胞死亡相关基因及其与免疫微环境和侵袭转移的关系 | 机器学习 | 胃癌 | 单细胞测序分析、转录组测序分析、蛋白质组分析 | 机器学习算法 | 基因数据 | 大量临床样本 |
| 8411 | 2024-09-23 |
AtML: An Arabidopsis thaliana root cell identity recognition tool for medicinal ingredient accumulation
2024-Sep-16, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2024.09.010
PMID:39293728
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研究论文 | 本文开发了一种名为AtML的机器学习系统，用于识别拟南芥根细胞阶段并识别生物标志物，以促进对药用化合物积累机制的理解 | AtML系统通过完全的模型可解释性，识别了160个重要的标记基因，有助于细胞类型的注释 | NA | 开发一种工具，用于识别拟南芥根细胞阶段，并揭示药用化合物积累的机制 | 拟南芥根细胞及其药用化合物的合成与积累模式 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组测序 | 机器学习系统 | 转录组数据 | 6000个细胞，来自六个细胞亚群 |
| 8412 | 2024-09-23 |
Altered Cell Clusters and Upregulated Aqp1 in Connexin 50 Knockout Lens Epithelium
2024-Sep-03, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.65.11.27
PMID:39287589
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研究论文 | 研究了连接蛋白50敲除后晶状体上皮细胞的异质性和细胞簇，并探讨了其下游靶点对晶状体稳态和生长的调控作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了连接蛋白50敲除后晶状体上皮细胞中差异表达基因，特别是Aqp1的上调 | 研究仅限于一个月大的Cx50KO和野生型小鼠，样本量较小 | 研究连接蛋白50敲除后晶状体上皮细胞的异质性和细胞簇，以及其对晶状体稳态和生长的影响 | 一个月大的连接蛋白50敲除和野生型小鼠的晶状体上皮细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | Cx50KO和野生型小鼠各一组 |
| 8413 | 2024-09-23 |
SCIntRuler: guiding the integration of multiple single-cell RNA-seq datasets with a novel statistical metric
2024-Sep-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae537
PMID:39226185
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研究论文 | 介绍了一种名为SCIntRuler的新统计度量方法，用于指导多个单细胞RNA测序数据集的整合 | 提出了SCIntRuler，一种新的统计度量方法，帮助研究人员在数据整合时做出明智的决策 | NA | 解决在整合多个单细胞RNA测序数据集时面临的挑战，提供一个有效的决策工具 | 单细胞RNA测序数据集的整合方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 统计度量方法 | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 8414 | 2024-09-23 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals 2 Subtypes of Tumor Cells of Sclerosing Pneumocytoma With Distinct Molecular Features and Clinical Implications
2024-Sep, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2024.100560
PMID:38972356
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了硬化性肺细胞瘤中两种具有不同分子特征和临床意义的肿瘤细胞亚型 | 首次提供了硬化性肺细胞瘤的单细胞转录组全面图谱，并鉴定出两种不同的肿瘤细胞亚型 | 样本量较小，仅涉及4个病例 | 阐明硬化性肺细胞瘤肿瘤细胞的分子特征，并加深对参与其形成和生物学行为的细胞过程的理解 | 硬化性肺细胞瘤及其对应的正常肺组织 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序和微阵列空间转录组分析 | NA | 转录组数据 | 4例硬化性肺细胞瘤及其对应的正常肺组织 |
| 8415 | 2024-09-23 |
Synergistic activation by Glass and Pointed promotes neuronal identity in the Drosophila eye disc
2024-Aug-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51429-z
PMID:39154080
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研究论文 | 研究了果蝇眼盘中Glass和Pointed转录因子与EGFR信号的协同作用对神经元身份的促进作用 | 揭示了EGFR信号通过多层转录网络的协同激活机制诱导Glass表达细胞中神经元身份的形成 | NA | 探讨果蝇眼盘中外部信号与细胞内转录因子的整合如何指导前体细胞分化为特定细胞命运 | 果蝇眼盘中的光感受器R1-R7的分化过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 8416 | 2024-09-23 |
Transcription Factor Activity Regulating Macrophage Heterogeneity during Skin Wound Healing
2024-Aug-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2400172
PMID:38940624
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研究论文 | 研究通过整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据，推断转录因子在皮肤伤口愈合过程中巨噬细胞异质性中的活性 | 改进了贝叶斯推断转录因子活性模型，结合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据，揭示了转录因子在伤口愈合中巨噬细胞异质性中的调控作用 | NA | 研究转录因子在皮肤伤口愈合过程中巨噬细胞异质性中的调控作用 | 巨噬细胞在皮肤伤口愈合过程中的异质性 | NA | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | 贝叶斯推断模型 | RNA、染色质可及性 | NA |
| 8417 | 2024-09-23 |
Human genetics and epigenetics of alcohol use disorder
2024-Aug-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI172885
PMID:39145449
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综述 | 本文综述了酒精使用障碍（AUD）的遗传学和表观遗传学研究进展 | 本文总结了从早期候选基因研究到当前全基因组扫描的技术进步，揭示了AUD的众多遗传和表观遗传风险因素 | 本文讨论了当前研究的局限性，包括增加GWAS和EWAS研究的能力以及扩大分析中包含的群体多样性 | 探讨酒精使用障碍的遗传学和表观遗传学机制 | 酒精使用障碍（AUD）及其遗传和表观遗传风险因素 | NA | 酒精使用障碍 | 全基因组关联研究（GWAS）、表观基因组关联研究（EWAS）、全基因组测序、多组学、单细胞测序、空间转录组学 | NA | 基因组数据、表观基因组数据、转录组数据 | 超过一百万参与者 |
| 8418 | 2024-09-23 |
Hydrogel crosslinking modulates macrophages, fibroblasts, and their communication, during wound healing
2024-Aug-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50072-y
PMID:39122702
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研究论文 | 研究了交联度对基于明胶的水凝胶在伤口愈合过程中对巨噬细胞和成纤维细胞行为的影响 | 发现轻度交联的水凝胶能促进细胞浸润并减少疤痕形成，而重度交联的水凝胶则增加炎症并导致巨噬细胞亚群的氧化活性和细胞融合 | 研究仅限于雌性小鼠模型，未涉及其他物种或性别 | 探讨水凝胶交联度对伤口愈合过程中免疫和基质细胞行为的影响 | 基于明胶的水凝胶、巨噬细胞、成纤维细胞、伤口愈合 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 雌性小鼠 |
| 8419 | 2024-09-23 |
Integrative single-cell RNA-seq and spatial transcriptomics analyses reveal diverse apoptosis-related gene expression profiles in EGFR-mutated lung cancer
2024-Aug-09, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06940-y
PMID:39122703
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析，揭示了EGFR突变型肺癌中与细胞凋亡相关的基因表达谱的多样性 | 首次综合利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术，系统分析了EGFR突变型肺癌中细胞凋亡相关基因的表达变化 | 研究主要基于细胞系和转基因小鼠模型，可能与人类肺癌的实际情况存在差异 | 探讨EGFR突变型肺癌中细胞凋亡相关基因在EGFR-TKI耐药性发展过程中的表达变化 | EGFR突变型肺癌细胞系和患者样本，以及EGFR驱动型肺癌的转基因小鼠模型 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学（ST） | NA | RNA | EGFR突变型肺癌细胞系和患者样本，以及EGFR驱动型肺癌的转基因小鼠模型 |
| 8420 | 2024-09-23 |
Benchmarking clustering, alignment, and integration methods for spatial transcriptomics
2024-Aug-09, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03361-0
PMID:39123269
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研究论文 | 本文系统地评估了多种最先进的算法在空间转录组学数据上的聚类、对齐和整合性能 | 首次对空间转录组学数据的聚类、对齐和整合方法进行了全面的基准测试 | 未提及具体限制 | 评估和比较不同空间转录组学数据处理方法的性能 | 空间转录组学数据的聚类、对齐和整合方法 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学数据 | 涉及多种真实和模拟数据集，大小、技术、物种和复杂性各异 |