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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 821 | 2026-03-24 |
Senescence-associated metabolic alterations aggravate calcific aortic valve disease
2026-Mar-17, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehag191
PMID:41841768
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研究论文 | 本研究揭示了衰老相关的NAD+代谢紊乱通过内皮细胞和巨噬细胞的不同机制,共同驱动钙化性主动脉瓣疾病的炎症和钙化过程 | 首次结合人类主动脉瓣的bulk RNA-seq和单细胞转录组学,系统绘制了NAD+通路图谱,并阐明了内皮细胞NAD+缺乏与巨噬细胞代谢多样性在疾病中的协同作用 | 动物模型和细胞实验的结果需要在更大规模的人类队列中进一步验证,且延迟治疗的疗效有限 | 探究细胞类型特异性的NAD+补救代谢紊乱是否驱动瓣膜炎症和钙化 | 人类主动脉瓣组织、Nampt基因敲除小鼠、瓣膜内皮细胞和巨噬细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞转录组学, 蛋白质组学, 孟德尔随机化 | 基因敲除小鼠模型 | 转录组数据, 蛋白质组数据, 遗传数据 | 涉及人类瓣膜组织、基因工程小鼠模型及UK Biobank队列数据 | NA | 单细胞转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 822 | 2026-03-24 |
ADAMTS7 promotes smooth muscle foam cell expansion in atherosclerosis
2026-Mar-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI187451
PMID:41609669
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研究论文 | 本研究揭示了ADAMTS7通过AP-1/PU.1/CD36调控轴驱动平滑肌细胞泡沫细胞形成,从而促进动脉粥样硬化的机制 | 首次在单细胞水平解析了ADAMTS7在人类颈动脉粥样硬化中的细胞特异性表达,并建立了平滑肌细胞和内皮细胞特异性基因修饰小鼠模型,揭示了ADAMTS7通过调控CD36表达促进平滑肌细胞摄取氧化低密度脂蛋白的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限;未涉及其他血管细胞类型(如巨噬细胞)中ADAMTS7的功能 | 阐明ADAMTS7促进动脉粥样硬化的细胞特异性机制 | 人类颈动脉粥样硬化样本、平滑肌细胞特异性Adamts7条件敲除和转基因小鼠、内皮细胞特异性Adamts7条件敲除和转基因小鼠 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, RNA-seq | 条件敲除小鼠模型, 转基因小鼠模型 | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据, 基因表达数据 | 人类颈动脉粥样硬化单细胞RNA-seq数据集(具体样本数未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 823 | 2026-03-24 |
Reactive astrocyte subpopulations with high Gfap and C4b expression in different Alzheimer's disease mouse models: Single-cell nuclear transcriptome analysis
2026-Mar-14, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-25-00789
PMID:41837502
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研究论文 | 本研究通过单细胞核转录组测序分析,在阿尔茨海默病小鼠模型中识别出具有高Gfap和C4b表达的反应性星形胶质细胞亚群,并揭示了其在疾病早期发病机制中的潜在作用 | 首次在阿尔茨海默病小鼠模型中,利用单细胞核转录组测序技术,识别出具有高Gfap和C4b表达的反应性星形胶质细胞亚群,并发现其与RNA剪接通路相关,为疾病异质性提供了新的细胞和分子基础 | 研究样本量较小(仅涉及4只阿尔茨海默病模型小鼠和1只对照小鼠),且仅基于小鼠模型,可能无法完全反映人类阿尔茨海默病的复杂性 | 探究阿尔茨海默病早期阶段的细胞异质性和细胞类型特异性分子扰动,以识别新的靶向治疗策略 | 阿尔茨海默病小鼠模型(载脂蛋白E4敲入和淀粉样前体蛋白/早老素1小鼠)的海马组织 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞核转录组测序 | NA | 转录组数据 | 4只阿尔茨海默病模型小鼠(3只8月龄淀粉样前体蛋白/早老素1小鼠和1只6月龄载脂蛋白E4敲入小鼠)和1只6月龄载脂蛋白E3敲入对照小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 824 | 2026-03-24 |
Integrative transcriptomic profiling reveals molecular signatures of disease progression from gastroesophageal reflux disease to Barrett's esophagus: A foundation for single-cell resolution studies
2026-Mar-14, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2026.100412
PMID:41839318
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研究论文 | 本研究通过整合性批量RNA测序分析,系统表征了胃食管反流病(GERD)和巴雷特食管(BE)的转录组景观,揭示了从GERD到BE进展的分子特征,为未来单细胞转录组研究奠定基础 | 首次通过整合性批量RNA测序系统比较GERD和BE的转录组差异,识别出关键差异表达基因和通路,并建立了临床-分子关联分析框架,为单细胞分辨率研究提供分子基础 | 研究样本量有限(N=40),且为横断面设计,无法完全捕捉疾病进展的动态过程;未来需要单细胞分辨率数据验证批量测序发现 | 系统表征GERD和BE的转录组景观,识别疾病进展的分子特征,为未来单细胞转录组研究建立基础框架 | 胃食管反流病(GERD)和巴雷特食管(BE)患者的食管组织样本 | 转录组学 | 食管疾病(胃食管反流病、巴雷特食管) | RNA测序(RNA-seq)、差异表达分析、功能富集分析 | DESeq2(差异表达分析工具)、HISAT2(序列比对工具)、StringTie(基因表达定量工具) | 转录组测序数据 | 40例患者(20例GERD,20例BE) | NA | 批量RNA测序 | NA | NA |
| 825 | 2026-03-24 |
Candidate pharmacogenetic signals at CCL2 and ITPA associated with JAK inhibitor response in Taiwanese rheumatoid arthritis
2026-Mar-12, Clinical and experimental rheumatology
IF:3.4Q2
DOI:10.55563/clinexprheumatol/17yc25
PMID:41841677
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研究论文 | 本研究旨在通过遗传学和单细胞分析,识别与台湾类风湿关节炎患者对JAK抑制剂治疗反应相关的候选基因信号 | 整合了候选SNP分析、细胞类型特异性eQTL资源(scQTLbase)和单细胞RNA测序数据,以支持基因水平关联,并优先确定了CCL2和ITPA作为JAK抑制剂反应的候选药物遗传学信号 | 研究使用基于持续性的有效性终点,且次要EULAR结果评估为探索性,需要独立复制使用标准化ACR/EULAR结果 | 识别台湾类风湿关节炎患者中JAK抑制剂有效性的遗传预测因子 | 台湾类风湿关节炎患者 | 自然语言处理 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 遗传数据、单细胞RNA测序数据 | 275名接受JAK抑制剂治疗的RA患者(有效组217人,无效组58人) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 826 | 2026-03-24 |
RPS14 as an aging-related biomarker for early-onset alterations of testicular senescence-associated genes in spermatogenic dysfunction at childbearing age
2026-03-10, The journals of gerontology. Series A, Biological sciences and medical sciences
DOI:10.1093/gerona/glag020
PMID:41592225
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研究论文 | 本研究识别了RPS14作为与衰老相关的生物标志物,用于早期检测年轻男性精子生成功能障碍中睾丸衰老相关基因的改变 | 首次将RPS14确定为年轻男性精子生成功能障碍中睾丸衰老相关基因早期改变的生物标志物,并揭示了其与睾丸免疫微环境及肥大细胞的关联 | 研究样本量有限,且机制研究主要基于相关性分析,需要进一步实验验证 | 识别与衰老相关的生物标志物,以早期检测年轻男性精子生成功能障碍中睾丸衰老相关基因的改变 | 年轻男性(生育年龄)的睾丸组织,包括精子生成功能正常和功能障碍的患者,以及老年小鼠和老年男性的睾丸组织 | 生殖医学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、微阵列分析、免疫荧光 | NA | RNA测序数据、微阵列数据、图像数据 | 两个单细胞RNA测序数据集、三个批量微阵列数据集、老年小鼠、老年男性、生育年龄患者的睾丸组织 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 827 | 2026-03-24 |
[Crosstalk of keratin 17-positive epithelial cells with CD8+ T cells in oral lichen planus and clinical relevance]
2026-Mar-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
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研究论文 | 本研究探讨了口腔扁平苔藓中角蛋白17阳性上皮细胞与CD8⁺ T细胞的相互作用,并评估了KRT17表达与临床严重程度的相关性 | 首次在单细胞水平上揭示了KRT17⁺上皮细胞在OLP中的关键作用及其通过HLA-A/B/C-CD8等信号通路与CD8⁺ T细胞的相互作用 | 样本量相对较小(单细胞数据仅5例,验证队列45例),且为单中心研究 | 探究口腔扁平苔藓的发病机制,特别是上皮细胞与免疫细胞的相互作用 | 口腔扁平苔藓患者(非糜烂型和糜烂型)及健康对照的口腔黏膜组织 | 单细胞组学 | 口腔扁平苔藓 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,多重免疫荧光染色 | NA | 单细胞RNA-seq数据,bulk RNA-seq数据,组织图像 | 单细胞测序:5例(2例NEOLP,2例EOLP,1例HC);bulk RNA-seq:40例(27例NEOLP,13例EOLP);验证队列:45例(20例NEOLP,20例EOLP,5例HC) | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 828 | 2026-03-24 |
A Zero-Inflated Hierarchical Generalized Transformation Model to Address Non-Normality in Spatially-Informed Cell-Type Deconvolution
2026-Mar-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.24.600480
PMID:41867857
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研究论文 | 本文提出了一种零膨胀分层广义变换模型(ZI-HGT),用于解决口腔鳞状细胞癌(OSCC)空间转录组数据中的非正态性和高零膨胀问题,以改进细胞类型反卷积的准确性 | 开发了零膨胀分层广义变换模型(ZI-HGT)作为辅助贝叶斯技术,结合条件自回归反卷积(CARD)框架,首次解决了OSCC空间转录组数据的高零膨胀问题,并量化了细胞类型比例估计的不确定性 | NA | 改进口腔鳞状细胞癌(OSCC)空间转录组数据中的细胞类型反卷积方法,以更准确地解析肿瘤微环境 | 口腔鳞状细胞癌(OSCC)的空间转录组数据 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 空间转录组学 | 零膨胀分层广义变换模型(ZI-HGT)与条件自回归反卷积(CARD)结合 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 829 | 2026-03-24 |
Hormone signaling and immune programs define differential endocrine responsiveness in high-risk breast tissue
2026-Mar-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.02.709108
PMID:41867809
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研究论文 | 本研究通过整合单核RNA测序和空间转录组学,揭示了激素信号和免疫程序作为乳腺组织内分泌反应性的关键决定因素 | 首次在背景实质强化(BPE)背景下,结合单核RNA测序和空间转录组学技术,识别出激素驱动和免疫相关上皮细胞程序,并验证了它们对内分泌治疗的不同敏感性 | 研究样本可能有限,未详细说明BPE患者亚组的临床特征或长期随访结果 | 探究乳腺组织中内分泌反应性的决定因素,以解释与癌症预防相关的放射学标记 | 高风险乳腺组织,特别是与背景实质强化(BPE)相关的组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单核RNA测序,空间转录组学 | NA | RNA测序数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单核RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 830 | 2026-03-24 |
Restoration of Keratinocyte Homeostasis Drives Resolution of Skin Inflammation
2026-Mar-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.04.708224
PMID:41867805
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研究论文 | 本研究通过调节表皮脂质代谢,揭示了皮肤炎症消退过程中表皮转录网络的重组机制 | 发现表皮状态通过调控保守的上皮调节三联体主动控制炎症消退,而非仅受免疫系统驱动 | 研究基于小鼠模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 探究表皮稳态恢复是否主动驱动皮肤炎症消退的机制 | 小鼠炎症性皮肤疾病模型及人类银屑病样本 | 单细胞组学 | 皮肤炎症疾病 | 单细胞RNA测序、转录组分析、蛋白质组分析 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 831 | 2026-03-24 |
Mechanistic insights into B-cell activation and autoreactivity regulation in active SLE and remission
2026-Mar-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.27.708589
PMID:41867791
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术,分析了活动性系统性红斑狼疮、药物免费缓解期和健康对照中B细胞的分子机制,揭示了疾病活动与缓解的免疫特征 | 首次在单细胞水平上定义了活动性SLE与缓解期B细胞的转录组差异,并识别了与“免疫重置”状态相关的特定B细胞亚群和信号通路 | 研究样本量有限,且仅分析了外周血B细胞,未涉及组织驻留细胞或其他免疫细胞类型 | 阐明活动性系统性红斑狼疮与缓解期之间的细胞和分子机制差异 | 系统性红斑狼疮患者(活动期和缓解期)及健康对照的外周血B细胞 | 单细胞组学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 三个队列:活动性SLE患者、长期药物免费缓解期SLE患者和健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 832 | 2026-03-24 |
Spatially Resolved Multiomics Reveals Metabolic Remodeling and Autophagy Activation in Adamantinomatous Craniopharyngiomas
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202516965
PMID:41489092
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研究论文 | 本研究通过整合空间分辨多组学技术,揭示了颅咽管瘤中代谢重塑和自噬激活是其进展和复发的关键驱动因素 | 首次在颅咽管瘤中整合应用单细胞空间转录组学(CosMx SMI)和空间分辨代谢组学(AFADESI-MSI),揭示了肿瘤上皮细胞亚群的空间分离、分子异质性以及“囊液-肿瘤细胞”和“胆碱/乙醇胺-PC/PE”代谢轴的空间代谢重塑 | NA | 揭示颅咽管瘤进展和复发的驱动因素,为该难治性肿瘤提供精准生物标志物驱动的治疗机会 | 颅咽管瘤组织 | 数字病理学 | 颅咽管瘤 | 单细胞空间转录组学,空间分辨代谢组学,批量代谢组学,多重免疫组织化学 | NA | 空间转录组数据,空间代谢组数据,批量代谢组数据,免疫组织化学图像 | NA | NA | 单细胞空间转录组学,空间分辨代谢组学,批量代谢组学 | CosMx SMI, AFADESI-MSI | CosMx 空间分子成像仪,AFADESI 质谱成像系统 |
| 833 | 2026-03-24 |
S3RL: Enhancing Spatial Single-Cell Transcriptomics With Separable Representation Learning
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202516178
PMID:41556263
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研究论文 | 本文提出了一种名为S3RL的可分离表示学习框架,旨在增强空间转录组原始数据的保真度,以解决数据稀疏性和技术噪声问题 | S3RL通过有效去噪稀疏测量并放大生物学相关信号,能够恢复原本丢失的精细空间表达模式和调控关系,在空间域识别和多切片对齐方面实现了高达170%的调整兰德指数改进 | 未在摘要中明确说明 | 提升空间转录组数据的分析能力,以解码复杂的组织微环境 | 人类、小鼠和植物等多种生物组织的空间转录组数据 | 空间转录组学 | 肿瘤免疫交互作用 | 空间转录组学 | 可分离表示学习框架 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 834 | 2026-03-24 |
Mitochondrial Calcium Uniporter Drives Chemoresistance in Pancreatic Cancer via Glutathione-Mediated Stemness Maintenance
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202507346
PMID:41560687
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研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序发现,线粒体钙单向转运体(MCU)的上调通过谷胱甘肽介导的干细胞特性维持,驱动胰腺癌的化疗耐药性 | 首次揭示MCU通过触发内质网应激和PERK-eIF2α通路,激活ATF4和NRF2,促进谷胱甘肽合成以清除活性氧并维持干细胞特性,从而驱动胰腺癌化疗耐药的新机制 | 研究主要基于临床前模型,尚未在人体临床试验中验证MCU抑制剂NB-598与化疗联合疗法的安全性和有效性 | 探究胰腺导管腺癌(PDAC)化疗耐药性的分子机制,并寻找潜在的治疗靶点 | 胰腺导管腺癌(PDAC)肿瘤细胞,特别是化疗耐药性肿瘤和癌症干细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,高通量筛选 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 835 | 2026-03-24 |
Spatial Profiling Reveals Distinct Molecular and Immune Evolution of Mouse Lung Adenocarcinoma Precancers with or Without Carcinogen Exposure
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202512597
PMID:41580978
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研究论文 | 本文整合全外显子组测序、成像质谱流式细胞术和空间转录组学,研究了两种小鼠肺腺癌模型(遗传工程模型和致癌物诱导模型)的分子演化和免疫响应 | 首次在空间维度上比较了遗传工程和致癌物诱导的肺腺癌前癌模型的分子和免疫演化差异,揭示了致癌物暴露导致更高的突变和新抗原负担,以及更强的免疫浸润 | 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类肺腺癌;空间分析技术虽先进,但分辨率仍有局限 | 探究肺腺癌前癌在有无致癌物暴露下的空间分子和免疫演化差异 | 小鼠肺腺癌模型(遗传工程模型129S4 K和致癌物诱导模型129S4 U) | 数字病理学 | 肺腺癌 | 全外显子组测序(WES)、成像质谱流式细胞术(IMC)、空间转录组学(ST) | NA | 基因组测序数据、空间蛋白质表达数据、空间转录组数据 | 141只小鼠中的156个病变区域,包括284个IMC感兴趣区域和51,531个空间转录组斑点,总计超过140万个空间单细胞 | NA | 空间转录组学, 单细胞蛋白质组学 | NA | NA |
| 836 | 2026-03-24 |
Humoral IgG1 responses to tumor antigens underpin clinical outcomes in immune checkpoint blockade
2026-Mar, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-025-04177-6
PMID:41593194
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研究论文 | 本研究揭示了在接受免疫检查点阻断治疗的肝细胞癌患者中,肿瘤特异性IgG1浆细胞反应对临床疗效的关键作用 | 首次系统证明了PD-1阻断疗法能诱导肿瘤特异性IgG1浆细胞反应,该反应与细胞免疫互补并共同促进临床获益,揭示了体液-细胞免疫协同轴在抗肿瘤免疫中的重要性 | 研究主要聚焦于肝细胞癌,其他癌种的普适性需进一步验证;样本量相对有限(核心队列38例) | 探究B细胞和浆细胞在免疫检查点阻断治疗反应中的作用机制 | 肝细胞癌患者 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序、空间转录组学、批量测序 | NA | 单细胞RNA测序数据、批量测序数据、空间转录组数据、临床生存数据 | 核心队列38例肝细胞癌患者,验证队列共500例患者测序数据、7例空间转录组数据、1582例生存分析数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 837 | 2026-03-24 |
Scavenging of Isolevuglandins Attenuates Neutrophil Migration and Neutrophil Extracellular Trap Formation in Systemic Lupus Erythematosus
2026-Mar, ACR open rheumatology
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/acr2.90015
PMID:41852193
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研究论文 | 本研究探讨了异亮戊二醛在系统性红斑狼疮中通过驱动中性粒细胞迁移和中性粒细胞胞外陷阱形成促进自身免疫和血管炎症的作用 | 首次揭示异亮戊二醛清除剂能有效抑制SLE患者中性粒细胞胞外陷阱形成,并在小鼠模型中减少中性粒细胞计数和主动脉NETosis | 样本量较小(SLE患者n=6,小鼠n=11-15),且未涉及长期治疗效果评估 | 探究异亮戊二醛在系统性红斑狼疮中对中性粒细胞迁移和NETosis的驱动作用 | 系统性红斑狼疮患者的中性粒细胞和SLE易感小鼠的淋巴组织及主动脉 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞测序、流式细胞术、免疫荧光 | NA | 细胞图像、基因表达数据、流式细胞数据 | 6名SLE患者的中性粒细胞,11-15只B6.SLE123小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 838 | 2026-03-24 |
Chronic cerebral hypoperfusion exacerbates amyloid and tau pathology by impairing glymphatic transport via AQP4- and VEGF-mediated pathways: insights from a vascular to mixed-type dementia model
2026-Mar, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.71290
PMID:41841574
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研究论文 | 本研究探讨了慢性脑灌注不足如何通过影响AQP4和VEGF通路损害类淋巴运输,从而加剧淀粉样蛋白和tau蛋白病理,揭示了血管功能障碍与神经退行性变之间的机制联系 | 首次在血管性至混合型痴呆模型中,结合单细胞RNA测序和影像学技术,系统阐明了CCH通过AQP4去极化和VEGF抑制损害类淋巴功能的具体分子通路 | 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类;且未探讨其他潜在通路或长期干预效果 | 探究慢性脑灌注不足导致认知障碍的机制,特别是其对类淋巴系统功能及神经病理蛋白积累的影响 | APP/PS1转基因小鼠和野生型小鼠 | 神经科学 | 痴呆(包括血管性和阿尔茨海默病相关病理) | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、免疫荧光染色、对比增强磁共振成像(MRI)、实时股静脉成像 | NA | 影像数据、测序数据、染色数据 | 未明确指定样本数量,涉及APP/PS1和野生型小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 839 | 2026-03-24 |
Prior-guided factorization for reliable imputation of scRNA-seq data
2026-Mar, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014051
PMID:41860953
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研究论文 | 本文提出了一种名为scZN的单细胞RNA测序数据插补框架,通过先验知识引导的非负因子分解来区分生物零和技术噪声,以重建细胞表达图谱 | scZN框架首次将scRNA-seq数据建模为RNA双态转录过程与丢失事件的组合,并利用先验知识和多重正则化约束进行非负因子分解,从而在基因和细胞层面准确捕获真实分布特征,显著抑制不应表达基因的虚假激活 | 未明确说明模型对大规模数据集的扩展性、计算效率或对特定细胞类型的适用性限制 | 开发一种可靠的单细胞RNA测序数据插补方法,以区分生物零和技术噪声,提高下游分析准确性 | 单细胞RNA测序数据,包括胚胎干细胞、小鼠齿状回数据和阿尔茨海默病数据 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 非负因子分解模型 | 单细胞RNA测序计数矩阵 | 多个真实数据集,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 840 | 2026-03-24 |
Spontaneous aging-associated inflammation and genome instability in the immune system of turquoise killifish
2026-Mar, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-026-01086-2
PMID:41862756
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术,探讨了短寿命脊椎动物绿松石鳉鱼免疫系统中的自发衰老相关炎症和基因组不稳定性 | 首次在绿松石鳉鱼中系统揭示了免疫系统随年龄变化的分子和细胞特征,包括炎症增加和DNA损伤积累 | 研究局限于鳉鱼模型,可能不完全适用于人类衰老机制 | 探究鳉鱼免疫系统衰老的分子和细胞基础,以开发针对免疫系统的抗衰老干预策略 | 绿松石鳉鱼的肾脏骨髓细胞和血浆 | 单细胞组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序, 细胞计数, 体外功能实验, 蛋白质组学分析 | NA | RNA序列数据, 蛋白质组数据 | 年轻成年和老年鳉鱼的肾脏骨髓细胞及血浆样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |