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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 761 | 2026-01-03 |
ScRNA-Seq Analysis of Tongue Tissues in Chronic Hyperplastic Candidiasis
2025-Jan, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345241282948
PMID:39586800
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研究论文 | 本研究首次对慢性增生性念珠菌病(CHC)影响的舌组织进行了单细胞RNA测序分析,揭示了其微环境变化和免疫学病因 | 首次对CHC舌组织进行单细胞RNA测序分析,构建了全面的细胞图谱和免疫景观,揭示了成纤维细胞在细胞间相互作用中的核心作用,并识别了与炎症和癌变相关的配体-受体对 | NA | 揭示慢性增生性念珠菌病的微环境变化、免疫学病因和潜在恶性转化机制 | 慢性增生性念珠菌病(CHC)影响的舌组织 | 数字病理学 | 口腔念珠菌病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 762 | 2026-01-03 |
Matrix glycosaminoglycans and proteoglycans in human cornea organoids and similarities with fetal corneal stages
2025-Jan, The ocular surface
DOI:10.1016/j.jtos.2024.11.007
PMID:39615587
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫组织化学分析,比较了人角膜类器官与胎儿角膜的糖胺聚糖和蛋白聚糖表达模式,评估其成熟度 | 首次利用单细胞RNA测序技术详细比较人角膜类器官与不同发育阶段胎儿角膜的相似性,并评估糖胺聚糖沉积作为成熟度指标 | 类器官的糖胺聚糖沉积模式仍显示为未成熟组织特征,且不同iPSC系间存在差异,需进一步优化以获得更成熟的基质细胞 | 评估人角膜类器官的发育成熟度,并比较其与胎儿角膜的相似性 | 人角膜类器官(来自iPSC系IMR90.4和NCRM-1)和不同发育阶段的人胎儿角膜 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 图像数据 | 两个iPSC系(IMR90.4和NCRM-1)生成的角膜类器官,以及不同发育阶段的人胎儿角膜样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 763 | 2026-01-03 |
Induction of a Müller Glial Cell-Specific Protective Pathway Safeguards the Retina From Diabetes-Induced Damage
2025-Jan-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db24-0199
PMID:39446557
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析糖尿病大鼠视网膜中不同细胞类型的转录变化,揭示了糖尿病敏感细胞类型及Müller胶质细胞通过Zfp36基因发挥保护作用的机制 | 首次利用单细胞转录组学系统描绘糖尿病进展中视网膜细胞类型特异性响应,并鉴定出Zfp36作为Müller胶质细胞保护性通路的关键基因 | 研究仅基于大鼠模型,人类视网膜的响应机制可能不同;单细胞转录组学未能完全揭示蛋白质水平变化 | 阐明糖尿病诱导视网膜病变的细胞类型特异性分子机制,并探索保护性干预靶点 | 糖尿病大鼠模型的视网膜细胞 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 764 | 2024-12-28 |
Advances in Single-Cell Sequencing and Spatial Profiling of Kidney Disease
2025-Jan, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2024.10.010
PMID:39722281
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 765 | 2026-01-03 |
Visium spatial transcriptomics and proteomics identifies novel hepatic cell populations and transcriptomic signatures of alcohol-associated hepatitis
2025-Jan, Alcohol, clinical & experimental research
DOI:10.1111/acer.15494
PMID:39592394
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研究论文 | 本研究利用Visium空间转录组学和蛋白质组学技术,识别了酒精性肝炎中的新型肝细胞群及其转录组和蛋白质组变化 | 首次结合空间转录组学和蛋白质组学分析人类酒精性肝炎,揭示了细胞类型、转录组和蛋白质组的全局性改变,并识别了疾病相关肝细胞的基因和蛋白质特征 | 样本量较小(仅2例AH患者和2例非ALD对照),可能限制结果的普遍性和统计效力 | 研究酒精性肝炎的细胞群和分子变化,以识别新型治疗靶点 | 人类酒精性肝炎患者的肝组织样本 | 数字病理学 | 酒精性肝炎 | 空间转录组学,空间蛋白质组学 | NA | 空间转录组数据,空间蛋白质组数据 | 4例样本(2例AH患者,2例非ALD对照) | 10x Genomics | 空间转录组学,空间蛋白质组学 | 10x Visium | 10x Visium FFPE(用于福尔马林固定石蜡包埋组织) |
| 766 | 2026-01-03 |
Inhibition of A2AR alleviates adenosine-mediated suppression of plasma cell differentiation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1702402
PMID:41472728
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研究论文 | 本研究探讨了A2AR在腺苷介导的B细胞向抗体分泌细胞分化抑制中的作用,并评估了A2AR拮抗剂inupadenant的逆转效果 | 首次通过空间转录组学分析揭示inupadenant治疗患者肿瘤活检中抗体分泌细胞在三级淋巴结构中特异性增加 | 样本量较小(10个肿瘤样本用于质谱成像,5名患者用于体内评估),且主要基于体外和临床前模型 | 研究A2AR对人类B细胞在肿瘤微环境中分化的影响 | 人类B细胞、浆细胞、肿瘤浸润免疫细胞、扁桃体和肿瘤相关B细胞 | 免疫学 | 癌症 | 定量质谱成像、GeoMx分析、免疫组化、多重免疫荧光、scRNA-seq、流式细胞术、LegendPLEX、Visium空间转录组学 | NA | 图像、单细胞RNA-seq数据、空间转录组数据 | 10个肿瘤样本用于质谱成像,5名癌症患者肿瘤活检用于体内评估 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Visium | Visium空间转录组学平台用于肿瘤活检分析 |
| 767 | 2026-01-03 |
EGR3 as a dual tumor-immune regulator: a machine learning-driven prognostic target for cold breast cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1627133
PMID:41472745
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研究论文 | 本研究通过整合多组学方法和机器学习,识别并验证了EGR3作为乳腺癌预后标志物和免疫调节靶点 | 利用机器学习优化的3基因预后模型,并首次验证EGR3在肿瘤抑制和免疫调节中的双重功能 | 研究基于多个公共数据集,可能受数据异质性影响,且需进一步临床验证 | 识别乳腺癌的关键分子驱动因子并验证其临床相关性 | 乳腺癌患者的多组学数据及临床样本 | 机器学习 | 乳腺癌 | 差异表达分析、加权基因共表达网络分析、单细胞RNA测序 | StepCox-Random Survival Forest | 基因表达数据、临床数据 | TCGA、GEO(GSE42568、GSE9893、GSE7390)和METABRIC数据集中的多个队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 768 | 2026-01-03 |
The Neuroimmune Axis in Atopic Dermatitis: From Pathogenic Mechanisms to Targeted Neuroimmunotherapy
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S578036
PMID:41473600
|
综述 | 本文综述了神经免疫轴在特应性皮炎发病机制中的核心作用,并探讨了基于该机制的靶向神经免疫疗法 | 将神经免疫轴置于AD发病机制的核心位置,系统整合了从分子机制到多组学、系统生物学方法的最新发现,并强调了生物标志物指导下的精准治疗策略 | 文中提到的生物标志物和新型疗法的临床验证、长期安全性、可及性以及在多样化患者群体中的实施仍面临挑战 | 阐明特应性皮炎的神经免疫发病机制,并探索基于该机制的精准诊断和靶向治疗策略 | 特应性皮炎 | NA | 特应性皮炎 | 单细胞转录组学、空间转录组学、神经影像学、微生物组分析 | NA | 多组学数据、神经影像数据、微生物组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 769 | 2026-01-03 |
DIAPH3 is upregulated in high-grade gliomas and linked to chromosomal instability
2025 Jan-Dec, Neuro-oncology advances
IF:3.7Q2
DOI:10.1093/noajnl/vdaf233
PMID:41473744
|
研究论文 | 本研究探讨了DIAPH3在胶质瘤中的表达及其与染色体不稳定性的关联 | 首次在临床胶质瘤样本中确认DIAPH3在高级别胶质瘤中特异性上调,并验证其与染色体不稳定性及不良预后的关联 | DIAPH3的预后价值未超越WHO CNS5胶质瘤分类,且研究主要依赖公开数据集和细胞系实验 | 研究DIAPH3在胶质瘤中的表达模式及其对染色体稳定性的影响 | 胶质瘤样本(包括低级别和高级别)及胶质母细胞瘤细胞系 | 癌症生物学 | 胶质瘤 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 来自公开数据集的胶质瘤样本及胶质母细胞瘤细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 770 | 2026-01-03 |
Deciphering the immune landscape of head and neck squamous cell carcinoma: A single-cell transcriptomic analysis of regulatory T cell responses to PD-1 blockade therapy
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0295863
PMID:38096229
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析,探讨了PD-1阻断疗法(Nivolumab)对头颈鳞状细胞癌中调节性T细胞(Treg)的影响 | 首次在单细胞水平上揭示了Nivolumab治疗后HNSCC肿瘤微环境中Treg数量增加、抑制活性增强的机制,并识别了CD44-SSP1轴、NKG2C/D-HLA-E轴及KRAS信号通路等关键变化 | 样本量较小(仅4名供体的8个组织),且为观察性研究,需进一步验证机制 | 研究PD-1阻断疗法如何影响HNSCC肿瘤微环境中的Treg细胞 | 头颈鳞状细胞癌(HNSCC)患者的肿瘤组织 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 4名HNSCC供体的8个组织(治疗前后配对样本) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 771 | 2026-01-02 |
Single-Cell RNA Sequencing of Murine Limbal Epithelia Reveals Gas1 as a Novel Stem/Progenitor Cell Marker for the Corneal Epithelium
2026-Feb-01, Cornea
IF:1.9Q2
DOI:10.1097/ICO.0000000000003938
PMID:40704715
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠角膜缘上皮中Gas1作为角膜上皮干细胞/祖细胞的新标记物 | 首次将Gas1鉴定为角膜缘上皮干细胞/祖细胞的统一表面标记物,并验证其在年轻和年老小鼠中的表达及损伤后的上调 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类样本中验证Gas1的标记功能 | 识别角膜缘上皮干细胞/祖细胞的特定标记物,以促进角膜疾病的细胞治疗 | 小鼠角膜缘上皮细胞 | 数字病理学 | 角膜疾病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 免疫荧光, PCR | NA | 转录组数据, 图像数据 | 5至60周龄的小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | SmartSeq-2 | SmartSeq-2单细胞转录组学技术 |
| 772 | 2026-01-02 |
Mechanisms of immune escape and extramedullary tropism in leukemia cutis
2026-Jan-01, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025029121
PMID:41026928
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研究论文 | 本研究通过批量及单细胞转录组分析,揭示了急性髓系白血病皮肤浸润(白血病皮肤浸润)的免疫逃逸机制及髓外趋向性特征 | 首次系统描绘了白血病皮肤浸润的免疫微环境特征,发现其T细胞耗竭特征与骨髓复发不同,并鉴定出8种归巢受体分子的差异表达 | 样本量较小(23例活检来自10名患者),部分发现需要更大规模验证 | 探究急性髓系白血病髓外浸润(特别是皮肤)的免疫微环境特征及致病机制 | 急性髓系白血病患者的皮肤/皮下组织活检样本及骨髓样本 | 单细胞组学 | 白血病 | 单细胞转录组测序,批量转录组测序 | NA | 转录组数据 | 23例白血病皮肤浸润活检(来自10名患者),7例骨髓复发样本 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 773 | 2026-01-02 |
Meningioma cell reprogramming and microenvironment interactions underlie brain invasion
2025-Dec-31, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf292
PMID:41476144
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了脑膜瘤脑侵袭的分子机制,包括肿瘤细胞重编程与微环境相互作用 | 首次整合bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq和空间转录组学数据,结合功能实验验证脑膜瘤脑侵袭界面的关键分子特征和细胞间通讯 | 样本量相对有限(特别是脑侵袭肿瘤仅33例),功能机制研究仍需进一步深入验证 | 探究脑膜瘤脑侵袭的分子和细胞机制 | 脑膜瘤患者肿瘤组织(包括肿瘤核心和脑-肿瘤界面) | 数字病理学 | 脑膜瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 多重免疫荧光, 共培养实验 | NA | 转录组数据, 图像数据, 电生理数据 | 199例脑膜瘤(含33例脑侵袭肿瘤)的bulk RNA-seq数据,患者匹配的单细胞RNA-seq和空间转录组样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 774 | 2026-01-02 |
Single-cell analysis of B cell dysregulation in pediatric sepsis stratified by disease severity
2025-Dec-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-34126-9
PMID:41476192
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,分析了不同严重程度儿科脓毒症患者外周血白细胞,揭示了B细胞耗竭是疾病严重程度的核心特征 | 首次在儿科脓毒症中应用单细胞RNA测序技术,系统描绘了B细胞亚群的耗竭和转录重编程模式,并鉴定和验证了自然杀伤样B细胞(NKB)这一新细胞群体 | 样本量较小(3例轻度、3例重度脓毒症患者及4例健康对照),且为观察性研究,无法确定因果关系 | 探究儿科脓毒症中B细胞失调的细胞和分子机制,特别是其与疾病严重程度的关系 | 儿科脓毒症患者(轻度与重度)及健康对照儿童的外周血白细胞 | 单细胞组学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 10例样本(3例轻度脓毒症、3例重度脓毒症、4例健康对照) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 775 | 2026-01-02 |
Single-cell transcriptomics and spatial validation reveal dysfunction of keratinocytes and NK cells driving acne development
2025-Dec-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-34373-w
PMID:41476262
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研究论文 | 本研究整合单细胞转录组学和空间免疫荧光技术,揭示了健康皮肤、轻度痤疮和重度痤疮中角质形成细胞和自然杀伤(NK)细胞的功能失调如何驱动痤疮发展 | 提出了“双重免疫-屏障失衡”的病理模型,并通过单细胞转录组学与空间验证相结合的方法,首次系统阐述了角质形成细胞和NK细胞在痤疮进展中的动态功能转变 | 未明确说明样本的具体数量或来源,且研究主要基于转录组和蛋白水平,缺乏功能实验的直接验证 | 阐明痤疮发生发展的细胞和分子机制,为早期诊断和精准干预提供理论依据 | 健康皮肤、轻度痤疮和重度痤疮的组织样本 | 数字病理学 | 皮肤疾病(痤疮) | 单细胞RNA测序,空间免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据,空间蛋白表达图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学/空间蛋白组学 | NA | NA |
| 776 | 2026-01-02 |
LAPTM5 drives omental metastasis in high-grade serous ovarian cancer via TGF-β/Smad-mediated epithelial plasticity
2025-Dec-30, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07319-z
PMID:41462255
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研究论文 | 本研究通过整合分析单细胞RNA测序数据,揭示了LAPTM5在高级别浆液性卵巢癌网膜转移中的关键作用机制 | 首次发现LAPTM5作为转移相关上皮亚群的标志物,通过激活TGF-β/Smad信号通路驱动上皮可塑性和网膜转移 | 研究主要基于体外实验和小鼠模型,临床样本验证和机制深度有待进一步扩展 | 探究高级别浆液性卵巢癌网膜转移的分子机制 | 高级别浆液性卵巢癌(HGSOC)细胞和组织样本 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、免疫组化、免疫荧光、qPCR、Western blot、Transwell迁移/侵袭实验、伤口愈合实验、流式细胞术、单核苷酸变异(SNV)和可变剪接(AS)分析 | NA | 单细胞RNA测序数据、基因表达数据、蛋白质表达数据 | 正常卵巢、原发性肿瘤和网膜转移组织的单细胞RNA测序数据,TCGA数据集,以及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 777 | 2026-01-02 |
Single-cell and spatial transcriptome sequencing analysis reveals characteristics of a unique subpopulation in high-grade IDH-mutant astrocytoma
2025-Dec-29, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-025-01139-5
PMID:41460424
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研究论文 | 本研究利用单细胞和空间转录组测序技术,分析了高级别IDH突变型星形细胞瘤中一个独特亚群的特征 | 首次结合单细胞RNA测序、空间转录组测序以及TCGA和CGGA数据库,系统识别了高级别IDH突变型星形细胞瘤中一个具有免疫抑制表型且富集于发育生物学和钙信号通路的独特肿瘤细胞亚群 | 未明确说明样本的具体数量,且研究主要基于测序数据分析,缺乏实验验证 | 识别高级别IDH突变型星形细胞瘤中独特肿瘤细胞亚群的特征,以期为治疗策略开发提供新见解 | 高级别(WHO 3-4级)和低级别(WHO 2级)IDH突变型星形细胞瘤样本 | 数字病理学 | 星形细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 778 | 2026-01-02 |
Geometry-preserving vector field reconstruction of high-dimensional cell-state dynamics using ddHodge
2025-Dec-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67782-6
PMID:41461643
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研究论文 | 本文开发了一种基于Hodge分解的ddHodge框架,用于从稀疏高维单细胞RNA测序数据中精确重建细胞状态动力学的向量场,并揭示发育过程中的基因表达动态遵循由势能景观塑造的梯度系统 | 首次提出基于Hodge分解的ddHodge框架,能够从稀疏高维数据中准确恢复向量场的所有基本分量(梯度、旋度、散度),包括作为二阶导数的细胞状态加速度,并将方法扩展到在低维数据流形上近似高维基因表达动态 | 未明确说明方法在计算效率或处理超大规模数据集时的具体限制 | 开发计算框架以分析复杂生物系统中的细胞命运决定,特别是从单细胞RNA测序数据中重建细胞状态动力学 | 小鼠胚胎发生过程中的单细胞RNA测序数据 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | Hodge分解框架 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 779 | 2026-01-02 |
Construction of an early diagnostic model for pulmonary hypertension based on aging-related signature genes and identification of potential therapeutic targets
2025-Dec-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-28921-7
PMID:41461777
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研究论文 | 本研究基于衰老相关特征基因构建了肺动脉高压的早期诊断模型,并识别了潜在的治疗靶点 | 首次整合多个转录组数据集,结合三种机器学习算法筛选特征基因,构建了高精度的诊断列线图,并通过单细胞测序和体外模型验证了核心基因,同时利用cMAP分析和分子对接识别了潜在的多靶点治疗化合物 | 研究主要基于生物信息学分析和体外模型,缺乏体内实验和临床样本的直接验证,潜在治疗化合物的疗效尚未经过实验验证 | 开发肺动脉高压的早期诊断工具并寻找新的治疗靶点 | 肺动脉高压相关的衰老相关基因和潜在治疗小分子 | 生物信息学 | 肺动脉高压 | 转录组分析,单细胞RNA测序,qPCR,分子对接 | LASSO回归,随机森林,支持向量机 | 基因表达数据 | 多个公共数据集(具体数量未明确说明),体外缺氧模型 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 780 | 2026-01-02 |
Robust subspace structure discovery for cell type identification in scRNA-seq data
2025-Dec-29, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06317-8
PMID:41462067
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研究论文 | 本文提出了一种新颖的深度子空间聚类方法,用于从单细胞RNA测序数据中识别细胞类型 | 该方法采用鲁棒的自表示学习框架,并结合结构引导方法与最优传输算法的集成优化策略,以捕获更可靠的子空间结构,从而提升聚类过程的鲁棒性 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中细胞类型识别的挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度子空间聚类 | 基因表达数据 | 18个真实单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |