单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 38102 篇文献，本页显示第 761 - 780 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 761 | 2026-03-28 |
Distinct spatial patterning and transcriptomic landscapes of human neural organoids by localized delivery of morphogens
2026-Mar-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2026.01.008
PMID:41734763
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研究论文 | 本研究开发了一种基于被动扩散的形态发生素梯度生成器（PdMG），用于在人类神经类器官中建立稳定的外源性空间形态发生素梯度，以模拟大脑发育中的位置模式 | 开发了无Matrigel的被动扩散形态发生素梯度生成器（PdMG），首次在人类神经类器官中可靠地建立了陡峭的外源性空间形态发生素梯度，并成功模拟了背腹侧前脑、头尾侧前中脑样和头尾侧前后脑样模式 | 未明确说明类器官的长期稳定性或梯度维持时间，可能受限于被动扩散机制的精确控制 | 研究人类大脑发育中局部形态发生素递送对神经类器官空间模式和转录组景观的影响 | 人类神经类器官 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 762 | 2026-03-28 |
Selective B-cell subset depletion underlies increased infection risk in patients with MM treated with anti-BCMA vs anti-GPRC5D bsAbs
2026-Mar-05, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025029572
PMID:41405507
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术揭示了抗BCMA双特异性抗体相比抗GPRC5D抗体在治疗多发性骨髓瘤时导致更高感染风险的机制，即前者会耗竭从早期B细胞前体开始的多个B细胞亚群 | 首次在单细胞水平上揭示了抗BCMA双特异性抗体耗竭骨髓中从small pre-B细胞阶段开始的B细胞谱系，而抗GPRC5D抗体主要靶向浆细胞，这解释了两种疗法感染风险的差异 | 样本量相对有限（单细胞测序n=19，流式细胞术n=62），且主要基于观察性研究，需要更大规模的前瞻性研究验证 | 阐明抗BCMA与抗GPRC5D双特异性抗体治疗多发性骨髓瘤患者时感染风险差异的免疫学机制 | 多发性骨髓瘤患者（n=62）和健康供者（n=8）的骨髓样本，以及MIcγ1小鼠模型 | 单细胞组学与免疫学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序，下一代流式细胞术免疫分型，流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞术数据 | 患者总数62人（其中单细胞RNA测序11人，流式细胞术31人），健康供者8人，小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 763 | 2026-03-28 |
Vascular STING activation facilitates NK cell anti-tumor immunity in small cell lung cancer
2026-Mar-05, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2026.02.008
PMID:41791380
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研究论文 | 本文研究了小细胞肺癌（SCLC）中血管STING激活如何促进NK细胞的抗肿瘤免疫，揭示了微血管作为限制NK细胞外渗/招募的主要检查点 | 开发了动态单细胞RNA测序技术（DynaMITE-seq）并结合空间转录组学，首次揭示了SCLC中微血管对NK细胞浸润的调控作用，并提出通过激活血管STING信号来克服免疫屏障的新策略 | 研究主要基于实验模型和患者样本分析，尚未进行大规模临床试验验证，且具体机制细节需进一步探索 | 探索小细胞肺癌中NK细胞抗肿瘤免疫的调控机制，并寻找克服免疫屏障的治疗策略 | 小细胞肺癌（SCLC）细胞、NK细胞、微血管系统及患者组织样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | RNA-seq数据、空间转录组数据 | 患者组织样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 764 | 2026-03-28 |
Targeted Ferroptosis Improves RPE Phagocytosis via MERTK/NFE2L2/HMOX1 Axis to Alleviate Retinitis Pigmentosa
2026-Mar-02, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.3.42
PMID:41848364
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研究论文 | 本研究通过整合RCS大鼠体内模型和人类原代RPE细胞体外模型，利用单细胞RNA测序揭示了铁死亡在MERTK缺陷型视网膜色素变性中的关键致病作用，并验证了靶向铁死亡可改善RPE吞噬功能 | 首次在视网膜色素变性模型中系统揭示了铁死亡通过MERTK/NFE2L2/HMOX1轴驱动RPE功能障碍的分子机制，并证明铁死亡抑制剂Fer-1的治疗潜力 | 研究主要基于RCS大鼠模型和体外细胞模型，尚未在更广泛的RP亚型或临床患者中进行验证 | 探究视网膜色素变性中RPE细胞的致病性改变，并寻找潜在的治疗策略 | 皇家外科学院大鼠、人类原代视网膜色素上皮细胞 | 单细胞组学 | 视网膜色素变性 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | RCS大鼠与RDY大鼠的视网膜样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 765 | 2026-03-28 |
The RNA-binding protein SRSF3 controls epicardial formation by regulating splicing and proliferation
2026-Mar-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204918
PMID:41601313
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研究论文 | 本研究揭示了RNA结合蛋白SRSF3通过调控剪接和增殖在心脏外膜形成中的关键作用 | 首次发现SRSF3在胚胎前心外膜和心外膜层高表达，并证明其缺失会导致增殖停滞，影响心外膜形成；通过单细胞RNA测序揭示非重组细胞的代偿性增殖现象 | 未完全阐明SRSF3调控细胞周期调节因子的具体分子机制；研究主要基于小鼠模型，人类相关性需进一步验证 | 探究RNA结合蛋白SRSF3在心脏外膜形成和功能调控中的分子机制 | 小鼠胚胎前心外膜和心外膜细胞 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，内源性irCLIP | NA | RNA测序数据，蛋白质-RNA相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 766 | 2026-03-28 |
Identifying Clones in Myelodysplastic Syndromes by Using Single-Cell RNA Sequencing
2026-Mar, Hematological oncology
IF:3.3Q2
DOI:10.1002/hon.70189
PMID:41886772
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 767 | 2026-03-28 |
Circulating tumor cells in myeloma are a compound biomarker for bone marrow high-risk genomic alterations and tumor load
2026-Feb-26, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025030083
PMID:41411148
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和全基因组测序分析，揭示了多发性骨髓瘤中循环肿瘤细胞（CTC）水平与骨髓高风险基因组改变及肿瘤负荷的关联机制 | 首次在单克隆水平上证明CTC与配对骨髓细胞转录相似，无独特循环群体；发现高CTC水平患者骨髓细胞增殖增加和基因组事件不平衡；开发了预测遗传改变和肿瘤负荷对CTC水平影响的模型 | 研究主要基于新诊断多发性骨髓瘤患者，未涵盖复发或难治性病例；样本量可能有限；机制性因果关系需进一步实验验证 | 探究多发性骨髓瘤中CTC水平与预后不良相关的机制，并评估CTC作为基因组驱动高风险疾病的生物标志物价值 | 新诊断多发性骨髓瘤患者的配对骨髓和血液样本 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞转录组学, 全基因组测序, 全外显子组测序, 批量RNA测序 | 预测模型 | 转录组数据, 基因组数据 | 来自新诊断多发性骨髓瘤患者的配对骨髓和血液样本，并利用Multiple Myeloma Research Foundation CoMMpass数据集及内部数据集进行验证 | NA | 单细胞RNA-seq, 全基因组测序, 全外显子组测序, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 768 | 2026-03-28 |
A Single-Cell Perspective on Remapping Human Adult Neurogenesis and Its Clinical Implications
2026-02-22, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom16020331
PMID:41750399
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在成人海马神经发生研究中的应用，及其对神经系统疾病机制和治疗策略的启示 | 整合了单细胞RNA测序技术提供的细胞和分子层面见解，为神经系统疾病的靶向治疗开发提供了新视角 | NA | 探讨成人海马神经发生的细胞和分子景观，以及神经系统疾病的病理机制及其治疗意义 | 成人海马神经发生、神经系统疾病（如癌症、心血管疾病和神经系统疾病） | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 769 | 2026-03-28 |
Lactate-Driven Reprogramming of Monocyte Bridges Bone Loss in Inflammatory Comorbidities
2026-02-14, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom16020308
PMID:41750376
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研究论文 | 本研究揭示了乳酸驱动的单核细胞重编程在牙周炎和类风湿关节炎等炎症共病中连接免疫激活与骨吸收加剧的分子机制 | 首次将乳酸代谢与炎症共病（牙周炎和类风湿关节炎）的骨丢失联系起来，并鉴定出SAT1、TET2和HIF1A作为核心乳酸相关基因和潜在生物标志物 | 研究主要基于小鼠模型和单细胞测序数据，需要在更大规模的人类队列中进行验证 | 揭示炎症共病中骨破坏的分子驱动机制 | 牙周炎和类风湿关节炎作为炎症疾病共病的临床相关模型 | 生物信息学 | 牙周炎, 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | 多种机器学习方法 | 基因表达数据 | PD和RA队列的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 770 | 2026-03-28 |
Neonatal Hyperoxia Induces Metabolic Reprogramming in Senescent Alveolar Macrophages, Leading to Persistent Lung Injury
2026-Feb-10, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/FBL48370
PMID:41761973
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研究论文 | 本研究通过分析单细胞RNA测序数据，揭示了新生小鼠高氧暴露诱导衰老肺泡巨噬细胞的代谢重编程，并证明靶向代谢或清除衰老细胞可减轻持续性肺损伤 | 首次在新生小鼠高氧模型中，利用单细胞RNA测序技术系统描绘了衰老肺泡巨噬细胞的异质性、代谢重编程特征及其在持续性肺损伤中的作用机制 | 研究主要基于小鼠模型，其结论在人类早产儿支气管肺发育不良中的直接适用性仍需进一步验证 | 探究新生儿高氧暴露诱导的衰老肺泡巨噬细胞的分子与功能特征，及其在持续性肺损伤发生发展中的作用 | 新生小鼠的肺组织，特别是高氧暴露后分离的衰老肺细胞（以巨噬细胞为主） | 数字病理学 | 肺损伤/支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序，免疫荧光，通路富集分析 | NA | 单细胞RNA测序数据，图像数据 | 数据集GSE207866中的样本，包括高氧暴露后第7天（SD7）、年龄匹配的空气暴露对照（AirD7）及未富集衰老细胞的高氧暴露组（O2D7）小鼠肺细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 771 | 2026-03-28 |
Integration of imaging-based and sequencing-based spatial omics mapping on the same tissue section via DBiTplus
2026-Jan-15, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02948-0
PMID:41540123
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DBiTplus的新型整合多模态空间组学方法，可在同一组织切片上结合测序型空间转录组学与多重蛋白成像技术 | 开发了DBiTplus整合工作流程，首次实现同一组织切片上测序型空间转录组与多重蛋白成像的同步分析，并采用RNase H介导的cDNA回收技术以保留组织架构 | 方法在极具挑战性的临床样本（如FFPE组织）中的全面性能仍需进一步验证 | 开发一种整合成像与测序的空间组学映射技术，以在单细胞分辨率下探索细胞异质性和功能 | 冷冻小鼠胚胎、福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）的人体淋巴结及淋巴瘤组织 | 空间组学 | 淋巴瘤 | 空间条形码技术、RNase H介导的cDNA回收、多重蛋白成像、空间转录组学 | NA | 空间转录组数据、蛋白成像数据 | 多种样本类型，包括小鼠胚胎和人类淋巴组织 | NA | 空间转录组学, 多重蛋白成像 | DBiTplus | DBiTplus整合工作流程，支持测序型空间转录组学与成像型蛋白分析在同一组织切片上进行 |
| 772 | 2026-03-28 |
Targeting the epithelium in pulmonary fibrosis
2026-Jan, European respiratory review : an official journal of the European Respiratory Society
IF:9.0Q1
DOI:10.1183/16000617.0225-2025
PMID:41881452
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综述 | 本文综述了特发性肺纤维化（IPF）研究中的最新进展，重点探讨了上皮细胞群在疾病中的作用及作为治疗靶点的潜力 | 整合了单细胞测序、空间转录组学等前沿技术，揭示了IPF中新型疾病相关上皮细胞群，并强调了细胞间通讯在疾病机制中的重要性 | 作为综述文章，未提供原始实验数据，且部分新技术（如空间分析）的应用仍处于早期阶段 | 探讨IPF的病理生物学机制，特别是上皮细胞的作用，以寻找新的治疗靶点 | 特发性肺纤维化（IPF）患者肺组织及相关的上皮细胞群 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞测序, 空间转录组学, 功能共培养研究, 计算基因集富集分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 773 | 2026-03-28 |
Exploring hub genes related to adipocytokines in keloids: a combined analysis integrating single-cell, Mendelian randomization and bulk transcriptome data with experimental verification
2026, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2026.1740876
PMID:41889636
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、孟德尔随机化和批量转录组数据分析，结合实验验证，探索了与脂肪细胞因子相关的枢纽基因在瘢痕疙瘩发病机制中的作用 | 首次结合单细胞RNA测序、孟德尔随机化和批量转录组数据进行综合分析，识别出PIK3R3和ANGPTL5作为与脂肪细胞因子相关的潜在枢纽基因，并验证了PIK3R3在瘢痕疙瘩中的因果作用 | ANGPTL5的表达验证结果不一致，可能受样本限制影响，且研究主要基于现有公开转录组数据的再分析 | 识别瘢痕疙瘩形成的潜在治疗靶点，并阐明与脂肪细胞因子相关的病理机制 | 瘢痕疙瘩组织及相关基因表达 | 生物信息学 | 皮肤纤维增生性疾病 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 批量转录组分析, RT-qPCR | 机器学习 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 774 | 2026-03-28 |
CCS-mediated mechanistic link between gestational diabetes mellitus and carpal tunnel syndrome: a multi-omics MR framework
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1766134
PMID:41890708
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研究论文 | 本研究通过多组学孟德尔随机化框架，揭示了妊娠期糖尿病与腕管综合征之间的因果关联及CCS基因介导的分子机制 | 首次整合遗传相关分析、孟德尔随机化、多组学数据（eQTL、pQTL）、单细胞RNA测序及分子对接，系统阐明GDM通过CCS介导的氧化、免疫和纤维化通路导致CTS的因果机制 | 研究主要基于欧洲人群的遗传数据，可能限制其跨人群普适性；动物模型和分子对接结果需进一步实验验证 | 探究妊娠期糖尿病是否因果增加腕管综合征风险及其分子通路 | 妊娠期糖尿病与腕管综合征的遗传关联、CCS基因的介导作用及相关分子通路 | 生物信息学与遗传流行病学 | 妊娠期糖尿病与腕管综合征 | 连锁不平衡评分回归、双样本孟德尔随机化、全血cis-eQTL分析、血浆蛋白QTL分析、批量RNA测序、单细胞RNA测序、组织学、免疫荧光、分子对接 | 孟德尔随机化模型、贝叶斯共定位分析 | 遗传数据、转录组数据、蛋白质组数据、单细胞数据、组织图像数据 | 基于FinnGen和UK Biobank的大规模人群遗传数据，涉及GDM和CTS病例及对照 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 775 | 2026-03-28 |
Comprehensive management of hematopoietic stem cell transplantation complications: from infection prevention to immune microenvironment reconstruction
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1740067
PMID:41890754
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综述 | 本文系统综述了造血干细胞移植（HSCT）关键并发症（包括感染、移植物抗宿主病和肝窦阻塞综合征）的管理策略，并探讨了新兴技术在构建全程风险管理模型中的应用 | 整合了从感染预防到免疫微环境重建的综合管理视角，并强调了单细胞测序、微生物组分析和人工智能等新兴技术在构建全程风险管理模型中的应用潜力 | 作为一篇综述文章，未报告原始研究数据或进行新的临床试验 | 系统回顾并探讨造血干细胞移植并发症的管理策略及未来研究方向 | 造血干细胞移植患者及其并发症（感染、GVHD、VOD/SOS） | NA | 造血干细胞移植相关并发症 | 单细胞测序，微生物组分析，人工智能 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 776 | 2026-03-28 |
Sparse dimensionality reduction for analyzing single-cell-resolved interactions
2026, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbag047
PMID:41890810
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研究论文 | 本文提出了一种针对单细胞细胞间相互作用数据的端到端降维工作流程，旨在简化细胞对间相互作用模式的分析 | 采用稀疏降维方法（特别是Boosting Autoencoder）来精确定位与细胞对簇相关的特定配体-受体相互作用，并提供了包含结果可视化的完整工作流程 | NA | 增强单细胞转录组学数据中细胞间相互作用的下游分析 | 单细胞细胞间相互作用数据，特别是基于已知配体-受体相互作用的细胞对 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学 | Boosting Autoencoder | 单细胞转录组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 777 | 2026-03-28 |
Protocol for decoding immune predictors of response to immunotherapy through pan-cancer multiomics analysis
2025-Dec-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104183
PMID:41187056
|
研究论文 | 本文提出了一种通过单细胞RNA测序、单细胞免疫分析和质谱流式细胞术分析多种癌症中T细胞动态的方案 | 整合了单细胞多组学技术和基因调控网络分析，以识别与免疫检查点阻断反应相关的T细胞亚群和预测性生物标志物 | NA | 解码免疫治疗响应的免疫预测因子 | 多种癌症中的T细胞 | 数字病理学 | 多种癌症 | 单细胞RNA测序, 单细胞免疫分析, 质谱流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 免疫分析数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 778 | 2026-03-28 |
Protocol for preparation of mouse synovium for flow cytometry and RNA-seq
2025-Dec-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104207
PMID:41236928
|
研究论文 | 本文介绍了一种从小鼠滑膜制备单细胞悬浮液用于流式细胞术和RNA-seq分析的实验方案 | 该方案整合了关节炎诱导、细胞收获和单细胞悬浮液制备，支持稳态或炎症状态下的分析，并可选血管内标记 | NA | 开发一种标准化的小鼠滑膜单细胞悬浮液制备方法，以模拟类风湿关节炎和骨关节炎中的无菌炎症 | 小鼠滑膜组织 | 数字病理学 | 骨关节炎 | RNA-seq | NA | 单细胞悬浮液 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 779 | 2026-03-28 |
Protocol to analyze changes in hippocampal neural stem cell quiescence from single-cell RNA sequencing data
2025-Dec-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104226
PMID:41289073
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研究论文 | 本文介绍了一种通过计算分析单细胞RNA测序数据来分离小鼠海马神经干细胞并评估扰动对静息深度影响的协议 | 提出了一种计算协议，通过顺序重聚类、伪时间轨迹分析和统计检验来区分静息神经干细胞与星形胶质细胞，以及增殖神经干细胞与祖细胞，解决了现有挑战 | 协议依赖于单细胞RNA测序数据，可能受数据质量和测序深度限制，且仅针对小鼠海马神经干细胞，未验证于其他组织或物种 | 开发一种计算协议来分析小鼠海马神经干细胞静息状态的变化 | 小鼠海马神经干细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 780 | 2026-03-28 |
Transformer and graph variational autoencoder to identify microenvironments: A deep learning protocol for spatial transcriptomics
2025-Dec-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104206
PMID:41313684
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研究论文 | 本文提出了一个结合Transformer和图变分自编码器的计算框架TG-ME，用于通过空间转录组学和形态学图像识别微环境 | 创新性地整合了Transformer和图变分自编码器，以深度学习方式解析空间生态位，适用于健康、肿瘤和感染组织 | NA | 开发一个计算框架来识别和分析组织中的微环境 | 空间转录组学和形态学图像数据 | 空间转录组学 | 肿瘤 | 空间转录组学 | Transformer, 图变分自编码器 | 空间转录组数据, 形态学图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |