本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']
”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!
除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
6921 | 2025-10-06 |
Combinatorial expression of GPCR isoforms affects signalling and drug responses
2020-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2888-2
PMID:33149304
|
研究论文 | 本研究探讨了GPCR异构体组合表达如何影响信号传导和药物反应 | 揭示了单个GPCR基因可通过不同异构体组合在组织中形成独特信号状态,为组织选择性药物开发提供新靶点 | NA | 研究GPCR异构体组合表达对信号传导和药物反应的影响机制 | G蛋白偶联受体(GPCR)异构体 | 分子生物学 | NA | 转录组测序,蛋白质组学,单细胞转录组学,遗传关联研究,药理学实验 | NA | 序列数据,结构数据,转录组数据,蛋白质组数据,单细胞数据,遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq,蛋白质组学 | NA | NA |
6922 | 2025-10-06 |
Tumor-Infiltrating Regulatory T-cell Accumulation in the Tumor Microenvironment Is Mediated by IL33/ST2 Signaling
2020-11, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-19-0828
PMID:32878747
|
研究论文 | 本研究揭示了IL33/ST2信号轴通过促进调节性T细胞在肿瘤微环境中的优先增殖和积累来增强肿瘤进展的分子机制 | 首次证明IL33/ST2信号轴是驱动肿瘤浸润调节性T细胞在肿瘤微环境中特异性积累的关键通路 | 研究主要基于小鼠肿瘤模型,人类临床相关性仍需进一步验证 | 探究调节性T细胞在肿瘤微环境中积累的分子机制 | 肿瘤浸润调节性T细胞 | 免疫学 | 癌症 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, T细胞受体测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 多种肿瘤模型小鼠 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6923 | 2025-10-06 |
A molecular cell atlas of the human lung from single-cell RNA sequencing
2020-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2922-4
PMID:33208946
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术构建了人类肺部的全面分子细胞图谱 | 首次系统性地识别和定位了人类肺部所有分子细胞类型,发现了14种新型细胞类型,并揭示了肺进化过程中的细胞类型可塑性 | NA | 创建人类肺部的全面分子细胞图谱 | 人类肺部所有组织区室和循环血液中的约75,000个细胞 | 单细胞生物学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 约75,000个人类细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | 液滴式和板式单细胞RNA测序平台 | 结合液滴式和板式单细胞RNA测序技术 |
6924 | 2025-10-06 |
Single-cell genomics and spatial transcriptomics: Discovery of novel cell states and cellular interactions in liver physiology and disease biology
2020-11, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2020.06.004
PMID:32534107
|
综述 | 综述单细胞基因组学与空间转录组学在肝脏生理和疾病生物学中揭示新细胞状态及细胞间相互作用的研究进展 | 整合单细胞RNA测序与空间转录组学技术,首次系统揭示肝脏中未知细胞类型、罕见细胞群体及原位细胞互作网络 | 未涉及具体实验数据验证,主要基于已有研究进行系统性综述 | 探讨单细胞和空间转录组技术在肝脏研究中的应用与发现 | 人类肝脏组织中的肝细胞、非实质细胞及肝脏前体细胞 | 空间转录组学 | 慢性肝病与肝癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
6925 | 2025-10-06 |
Modeling neural tube development by differentiation of human embryonic stem cells in a microfluidic WNT gradient
2020-11, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-020-0525-0
PMID:32451506
|
研究论文 | 通过微流体WNT梯度分化人类胚胎干细胞模拟神经管发育 | 开发了名为MiSTR的微流体控制干细胞区域化方法,首次在体外模拟人类神经管头尾轴向发育模式 | 研究仅限于早期神经管发育阶段,未验证长期发育结果和功能成熟 | 研究人类神经管早期发育的分子机制和模式形成过程 | 人类胚胎干细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组测序,微流体技术 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6926 | 2025-10-06 |
Inflammatory Bowel Disease Through the Lens of Single-cell RNA-seq Technologies
2020-10-23, Inflammatory bowel diseases
IF:4.5Q1
DOI:10.1093/ibd/izaa089
PMID:32386055
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在炎症性肠病研究中的应用进展 | 利用多模式单细胞技术重新定义肠道黏膜细胞群体,为精准医疗提供新见解 | NA | 总结单细胞技术在IBD研究中的进展并探讨其临床应用潜力 | 肠道黏膜中的上皮细胞、间充质细胞和免疫细胞 | 生物信息学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6927 | 2025-10-06 |
Second-Strand Synthesis-Based Massively Parallel scRNA-Seq Reveals Cellular States and Molecular Features of Human Inflammatory Skin Pathologies
2020-10-13, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2020.09.015
PMID:33053333
|
研究论文 | 开发了一种名为Seq-Well S的大规模并行单细胞RNA测序方法,用于分析人类炎症性皮肤病的细胞状态和分子特征 | 采用随机引物第二链合成技术,显著提高了转录本捕获效率和基因检测能力,相比之前版本分别提升10倍和5倍 | NA | 开发高保真、高通量的单细胞RNA测序平台,以准确报告细胞关键表型特征的表达 | 人类炎症性皮肤病的细胞 | 单细胞测序 | 炎症性皮肤病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 五种人类炎症性皮肤病样本 | NA | 单细胞RNA-seq | Seq-Well S | 基于第二链合成的大规模并行单细胞RNA测序协议 |
6928 | 2025-10-06 |
RUNX1 marks a luminal castration-resistant lineage established at the onset of prostate development
2020-10-07, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.60225
PMID:33025905
|
研究论文 | 本研究揭示了RUNX1标记的前列腺近腔细胞亚群在发育早期形成并具有内在去势抵抗特性 | 发现RUNX1标记的特定近腔细胞亚群,不同于已知的NKX3.1阳性细胞,且具有独特的发育起源和去势抵抗特性 | 研究主要基于小鼠模型,人类前列腺中的相关性尚需验证 | 解析前列腺上皮细胞层次结构和谱系异质性 | 小鼠前列腺发育和成年期的近腔细胞亚群 | 发育生物学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 遗传谱系追踪 | NA | 基因表达数据, 谱系追踪数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6929 | 2025-10-06 |
Circulating testican-2 is a podocyte-derived marker of kidney health
2020-10-06, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2009606117
PMID:32958645
|
研究论文 | 本研究通过蛋白质组学分析发现testican-2是足细胞来源的肾脏健康生物标志物 | 首次发现testican-2在肾脏动脉-静脉梯度中显著增加,并证实其与肾功能正相关 | 研究样本量相对有限,需要更多人群验证 | 寻找能够反映肾脏健康的循环生物标志物 | 人类肾脏组织、循环蛋白质、足细胞 | 生物医学研究 | 肾脏疾病 | aptamer-based proteomics, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 免疫荧光, 电子显微镜 | NA | 蛋白质组数据, 基因表达数据, 影像数据 | 22人(动脉-静脉采样)+ 1,928人(Jackson Heart Study)+ 1,621人(Framingham Heart Study) | NA | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | NA |
6930 | 2025-10-06 |
A single-cell transcriptome atlas of marsupial embryogenesis and X inactivation
2020-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2629-6
PMID:32814901
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了有袋类动物胚胎发育和X染色体失活过程 | 首次对有袋类哺乳动物胚胎进行单细胞转录组分析,揭示了X染色体失活的新机制和保守的谱系标记 | 研究仅针对单一有袋类物种(灰短尾负鼠),可能无法完全代表所有有袋类动物 | 探索哺乳动物胚胎发育和X染色体剂量补偿的进化机制 | 灰短尾负鼠(Monodelphis domestica)胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6931 | 2025-10-06 |
Pathway identification through transcriptome analysis
2020-10, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2020.109701
PMID:32649993
|
综述 | 本文综述了通过转录组学方法研究多囊肾病发病机制的最新进展 | 系统回顾了转录组学技术在多囊肾病研究中的应用,重点关注Pkd1失活后的转录级联反应 | NA | 通过转录组学分析识别多囊肾病相关信号通路 | 多囊肾病发病机制 | 自然语言处理 | 多囊肾病 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | NA | NA |
6932 | 2025-10-06 |
Impact of Local Alloimmunity and Recipient Cells in Transplant Arteriosclerosis
2020-09-25, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.119.316470
PMID:32689904
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示移植动脉粥样硬化的细胞异质性和潜在机制 | 首次在移植动脉粥样硬化小鼠模型中通过单细胞RNA测序鉴定出21个细胞亚群,发现三级淋巴组织局部形成现象,并揭示CCL21/CXCR3信号轴在免疫细胞趋化中的关键作用 | 研究仅基于小鼠模型,人类疾病中的验证尚需进一步研究 | 阐明移植动脉粥样硬化的细胞异质性和疾病进展机制 | 小鼠移植动脉粥样硬化模型中的细胞群体 | 单细胞基因组学 | 移植动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序,遗传谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据 | 11,868个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6933 | 2025-10-06 |
Gene-Specific Linear Trends Constrain Transcriptional Variability of the Toll-like Receptor Signaling
2020-09-23, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2020.08.007
PMID:32918862
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和单分子mRNA计数技术,揭示了Toll样受体信号通路中基因特异性线性趋势对转录变异性的约束机制 | 发现尽管不同基因采用不同调控模式,但其转录变异度均受到线性约束,且这种约束源于转录爆发的调控 | 研究主要关注Toll样受体信号通路,未验证是否适用于其他信号通路 | 探究单细胞基因表达变异性在刺激响应中的调控机制 | 免疫Toll样受体系统中的诱导基因表达 | 单细胞生物学 | 免疫系统疾病 | 单细胞RNA-seq, 单分子mRNA计数(smFISH) | 标准随机开关模型 | 单细胞基因表达数据, mRNA计数数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单分子荧光原位杂交 | NA | NA |
6934 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing reveals clonal expansions of pro-inflammatory synovial CD8 T cells expressing tissue-homing receptors in psoriatic arthritis
2020-09-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-18513-6
PMID:32958743
|
研究论文 | 通过单细胞测序技术揭示银屑病关节炎患者关节中促炎性滑膜CD8 T细胞的克隆扩增现象 | 首次结合质谱流式细胞术和单细胞RNA测序技术,在单细胞水平系统揭示银屑病关节炎关节中CD8 T细胞的克隆扩增特征及其组织归巢受体表达模式 | 样本来源仅限于银屑病关节炎患者,缺乏其他类型关节炎的对照比较 | 研究银屑病关节炎关节内免疫细胞的分子特征和克隆扩增机制 | 银屑病关节炎患者的关节滑膜组织和外周血中的白细胞 | 单细胞生物学 | 银屑病关节炎 | 质谱流式细胞术, 单细胞RNA测序, T细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据 | 银屑病关节炎患者的配对关节滑膜组织和外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 液滴法和板式法单细胞RNA测序 |
6935 | 2025-10-06 |
β2 Integrins differentially regulate γδ T cell subset thymic development and peripheral maintenance
2020-09-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1921930117
PMID:32848068
|
研究论文 | 本研究揭示了β2整合素通过不同机制调控γδ T细胞亚群在胸腺发育和外周维持中的作用 | 首次发现β2整合素对γδ T细胞亚群具有双向调控作用:抑制IL-17产生型Vγ6Vδ1细胞的存活,同时促进IFNγ产生型Vγ4亚群的胸腺发育 | 研究主要基于小鼠模型,人类γδ T细胞中是否存在相同机制尚需验证 | 探究β2整合素在γδ T细胞稳态维持中的调控机制 | γδ T细胞亚群,特别是Vγ6Vδ1和Vγ4亚群 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | β-整合素缺陷小鼠和野生型小鼠的γδ T细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6936 | 2025-10-06 |
Inflammatory Signals Induce AT2 Cell-Derived Damage-Associated Transient Progenitors that Mediate Alveolar Regeneration
2020-09-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.06.020
PMID:32750316
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和谱系追踪技术揭示了肺泡再生过程中AT2细胞衍生的损伤相关短暂祖细胞(DATPs)的作用机制 | 首次发现并表征了肺泡再生过程中的新型AT2细胞亚群DATPs,揭示了IL-1β/HIF1α/糖酵解通路在调控干细胞命运中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类肺泡再生的机制可能有所不同 | 阐明肺泡组织再生过程中细胞命运转换的分子机制 | 肺泡谱系细胞,特别是AT2细胞及其衍生的DATP细胞 | 单细胞生物学 | 肺疾病 | 单细胞RNA测序,体内谱系追踪,类器官模型 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6937 | 2025-10-06 |
Therapy-Induced Evolution of Human Lung Cancer Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2020-09-03, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.07.017
PMID:32822576
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示靶向治疗诱导的人类肺癌演化过程 | 首次在靶向治疗前后对转移性肺癌进行纵向单细胞RNA测序分析,揭示了治疗诱导的原始细胞状态转变和肿瘤微环境动态变化 | 样本量相对有限(30名患者),仅针对转移性肺癌 | 探究靶向治疗如何影响肺癌细胞和肿瘤微环境的演化 | 转移性肺癌患者治疗前后的肿瘤活检样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 30名患者的49个临床活检样本,包含超过20,000个癌细胞和肿瘤微环境细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6938 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomic Profiling of Vascular Smooth Muscle Cell Phenotype Modulation in Marfan Syndrome Aortic Aneurysm
2020-09, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.120.314670
PMID:32698686
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究马凡综合征主动脉瘤中血管平滑肌细胞的表型调控动态 | 首次在马凡综合征主动脉瘤中鉴定出转录组调控的平滑肌细胞亚群,并揭示其特异性基因特征和TGF-β信号通路的作用机制 | 研究样本主要来自小鼠模型,人类样本验证有限 | 阐明马凡综合征主动脉瘤发展过程中血管平滑肌细胞表型调控的时空动态 | Fbn1C1041G/+马凡综合征模型小鼠和人类马凡综合征患者的主动脉组织 | 单细胞转录组学 | 马凡综合征主动脉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 马凡综合征模型小鼠和人类患者主动脉组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6939 | 2025-10-06 |
Adaptable haemodynamic endothelial cells for organogenesis and tumorigenesis
2020-09, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2712-z
PMID:32908310
|
研究论文 | 本研究通过ETV2转录因子重编程成熟内皮细胞,创建了可适应器官发育和肿瘤形成的血管化平台 | 首次通过ETV2瞬时重激活将成熟内皮细胞重置为可塑性血管生成细胞,建立了无需合成半透膜的器官-血管网络模型 | 研究主要基于体外实验和小鼠模型,尚未在更复杂的生理环境中验证 | 开发能够模拟生理血管化的平台,用于器官修复和肿瘤靶向研究 | 人类内皮细胞、小鼠模型、人类胰腺胰岛、大鼠肠道和人结肠类器官 | 组织工程 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序、表观遗传分析、三维培养 | 器官-血管网络模型 | 基因表达数据、表观遗传数据、影像数据 | 人类内皮细胞、小鼠模型、多种人类器官类器官 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6940 | 2025-10-06 |
Single-cell atlas of colonic CD8+ T cells in ulcerative colitis
2020-09, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-020-1003-4
PMID:32747828
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序和质谱流式技术构建了健康人群和溃疡性结肠炎患者结肠CD8+ T细胞的综合图谱 | 首次系统揭示结肠CD8+ T细胞的异质性,发现表达IL-26的终末分化功能障碍性CD8+ T细胞具有调节功能 | 研究样本量未明确说明,人类源化小鼠模型可能无法完全模拟人类疾病 | 阐明健康状态和溃疡性结肠炎中结肠CD8+ T细胞的表型特征和功能机制 | 人类结肠CD8+ T细胞 | 单细胞生物学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞转录组测序, T细胞受体谱分析, 质谱流式技术 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术 | NA | NA |