单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 581 - 600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 581 | 2025-10-05 |
Single-Cell transcriptomic profiles of peripheral blood immune cells reveal early monocyte and platelet activation in the transition from high-risk states to clinical sepsis
2025-Sep-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-17078-y
PMID:40998960
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示外周血免疫细胞在脓毒症高风险状态向临床脓毒症转变过程中的早期单核细胞和血小板激活特征 | 首次在单细胞水平上揭示了脓毒症高风险阶段向临床脓毒症转变过程中单核细胞和血小板的早期转录组重编程特征，发现了一个核心基因集(S100A8, S100A9, IFITM2, IFITM3)在不同高危人群中持续上调 | 研究样本量相对有限，需要在更大规模的前瞻性队列中验证这些发现 | 阐明从脓毒症高风险状态向临床脓毒症转变过程中的免疫细胞转录组变化特征 | 健康对照者、脓毒症高风险个体、临床脓毒症患者的外周血免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康对照、高风险个体和临床脓毒症患者的外周血样本，以及独立队列的极早产脓毒症婴儿和糖尿病老年患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 582 | 2025-10-05 |
Evaluation of cell type annotation reliability using a large language model-based identifier
2025-Sep-25, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08745-x
PMID:40998963
|
研究论文 | 开发了一种基于大语言模型的细胞类型注释可靠性评估工具LICT | 利用多模型集成和“人机对话”方法，提供客观的细胞类型注释可靠性评估框架 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中细胞类型注释的准确性问题 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 大语言模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 583 | 2025-10-05 |
MitoDelta: identifying mitochondrial DNA deletions at cell-type resolution from single-cell RNA sequencing data
2025-Sep-25, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-11931-0
PMID:40999372
|
研究论文 | 开发了一种从单细胞RNA测序数据中识别细胞类型特异性线粒体DNA缺失的计算方法 | 首个专门从单细胞RNA测序数据中检测细胞类型特异性mtDNA缺失的计算流程，无需额外DNA测序数据 | 依赖单细胞RNA测序数据的质量和覆盖度，可能受转录组噪音影响 | 开发检测细胞类型特异性线粒体DNA缺失的计算方法 | 线粒体DNA缺失变异 | 生物信息学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序，计算分析 | beta-二项分布模型 | 单细胞RNA测序数据 | 已发表的帕金森病单核RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序，单核RNA测序 | NA | NA |
| 584 | 2025-10-05 |
EMB is essential for enteric nervous system development mediated by PI3K signaling
2025-Sep-25, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-025-01538-1
PMID:40999499
|
研究论文 | 本研究揭示了EMB通过调控PI3K信号通路在肠道神经系统发育中的关键作用 | 首次发现EMB通过招募PP2A磷酸酶复合物至细胞膜促进PI3K-AKT通路激活，调控肠道神经嵴细胞发育的新机制 | EMB罕见变异与HSCR疾病的因果关系需要进一步验证 | 探究EMB在肠道神经系统发育中的功能机制 | 斑马鱼、小鼠模型及人类HSCR患者队列 | 发育生物学 | 先天性巨结肠症 | 单细胞RNA测序、免疫荧光染色、基因敲除、迁移实验、类器官培养 | 基因敲除动物模型 | 基因表达数据、表型数据、临床变异数据 | 斑马鱼和小鼠模型，以及HSCR患者队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 585 | 2025-10-05 |
Tumor-derived CCL5 recruits CCR1+ macrophages to suppress apoptosis and drive proliferation in duodenal adenocarcinoma
2025-Sep-25, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.218064
PMID:41015267
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示十二指肠腺癌中肿瘤细胞通过分泌CCL5趋化因子招募CCR1+巨噬细胞，抑制细胞凋亡并促进肿瘤增殖的机制 | 首次在十二指肠腺癌中发现肿瘤细胞通过CCL5/CCR1轴与巨噬细胞相互作用，揭示了该信号轴在免疫逃逸和化疗耐药中的关键作用 | 研究样本量相对有限，且主要基于体外器官样模型，需要进一步体内验证 | 阐明十二指肠腺癌肿瘤微环境中肿瘤细胞与巨噬细胞的相互作用机制 | 十二指肠腺癌患者肿瘤组织及匹配的正常组织，患者来源的器官样模型 | 单细胞组学 | 十二指肠腺癌 | 单细胞RNA测序，器官样培养，功能实验，转录组分析 | NA | 单细胞RNA测序数据，转录组数据 | 原发性十二指肠腺癌肿瘤组织及匹配的癌旁正常组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 586 | 2025-10-05 |
Molecular Insights into the Role of Tumor-specific Endothelial Cells in Metastasis
2025-Sep-25, Critical reviews in oncology/hematology
DOI:10.1016/j.critrevonc.2025.104964
PMID:41015325
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综述 | 本文综述肿瘤特异性内皮细胞在肿瘤转移中的作用机制及靶向治疗策略 | 系统阐述肿瘤特异性内皮细胞区别于正常内皮细胞的独特基因表达特征及其在转移和免疫逃逸中的双重作用 | NA | 探讨肿瘤特异性内皮细胞在肿瘤进展中的功能及靶向治疗潜力 | 肿瘤特异性内皮细胞 | 肿瘤生物学 | 癌症 | 单细胞转录组学、蛋白质组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 587 | 2025-10-05 |
Mechanically activated snai1b coordinates the initiation of myocardial delamination for trabeculation
2025-Sep-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62285-w
PMID:40993149
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研究论文 | 本研究揭示了斑马鱼心脏发育过程中机械力激活的snai1b阳性心肌细胞通过启动分层过程参与小梁形成的新机制 | 首次发现snai1b阳性心肌细胞在机械力激活下启动心肌分层，且这些细胞不表现典型的上皮-间质转化特征 | 研究主要基于斑马鱼模型，需要在哺乳动物中进一步验证 | 探究心肌小梁形成过程中机械力激活的snai1b在心肌分层启动中的作用机制 | 斑马鱼胚胎心脏发育过程中的心肌细胞 | 发育生物学 | 心血管疾病 | CRISPR激活/抑制, 4-D应变分析, 单细胞转录组测序, 空间转录组测序 | 斑马鱼发育模型 | 基因表达数据, 影像数据, 转录组数据 | 4天受精后斑马鱼胚胎 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 588 | 2025-10-05 |
Lung NR3C1+ and CXCR6high T cells distinguish immunopathogenesis of human emphysema
2025-Sep-24, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08698-1
PMID:40993192
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人类肺组织，揭示NR3C1+和CXCR6high CD4 T细胞在肺气肿免疫病理机制中的关键作用 | 首次发现NR3C1+ CD4 T细胞在非肺气肿型COPD中富集而在肺气肿型COPD中减少，并鉴定CXCR6效应记忆T细胞与肺功能保留的正相关性 | 研究样本量有限，仅基于两个独立的单细胞RNA测序数据集 | 探究T细胞在吸烟者慢性阻塞性肺疾病肺气肿发病机制中的作用 | 人类肺组织样本，包括肺气肿型COPD、非肺气肿型COPD和对照组 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 两个独立的人类肺组织单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 589 | 2025-10-05 |
Multi-omics integration reveals key miRNAs, immune inflammation, and signaling pathways in Alzheimer's disease: Implications for targeted therapy
2025-Sep-24, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.147874
PMID:41005404
|
研究论文 | 通过多组学整合分析揭示阿尔茨海默病中关键miRNAs、免疫炎症和信号通路的作用机制 | 整合三种组学数据集识别出AD相关关键miRNAs和信号通路，并提出免疫调节与神经再生相结合的治疗框架 | 候选miRNAs对成熟神经元标志物影响有限，需要合适的神经元环境才能诱导神经分化 | 阐明阿尔茨海默病的分子机制并探索靶向治疗策略 | 阿尔茨海默病患者的多组学数据和神经元细胞 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | miRNA-seq, RNA-seq, 单细胞转录组学, 多组学整合分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 三种miRNA-seq数据集和血液RNA-seq数据集 | NA | 单细胞转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 590 | 2025-10-05 |
Amyloid-β-driven Alzheimer's disease reshapes the colonic immune system in mice
2025-Sep-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116109
PMID:40885186
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示阿尔茨海默病如何重塑小鼠结肠免疫系统 | 首次在淀粉样蛋白β驱动的小鼠模型中系统揭示肠道免疫系统变化与大脑免疫细胞迁移的关联 | 研究基于小鼠模型，人类相关性需要进一步验证 | 探索阿尔茨海默病中肠道-大脑轴的免疫学特征 | 5XFAD淀粉样蛋白β小鼠模型的结肠免疫细胞 | 单细胞生物学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 光谱调谐流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据 | 5XFAD小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 591 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing in high-burden viral respiratory infections: Decoding immune cell subsets and immune-related differential gene expression
2025-Sep-23, Infection, genetics and evolution : journal of molecular epidemiology and evolutionary genetics in infectious diseases
DOI:10.1016/j.meegid.2025.105834
PMID:40998072
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在高负担病毒性呼吸道感染中解析免疫细胞亚群和免疫相关差异基因表达的研究进展 | 系统总结了scRNA-seq在揭示COVID-19和流感等病毒感染中新型免疫细胞亚群和关键生物标志物的最新发现 | 在其他微生物来源的呼吸道感染中应用scRNA-seq的研究仍然有限 | 解析高负担病毒性呼吸道感染的免疫景观和分子机制 | 人类外周血、支气管肺泡灌洗液、小鼠肺组织及外植体 | 单细胞组学 | 呼吸道感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 592 | 2025-10-05 |
A multi-omic analysis to investigate the causal associations between circulating proteins and risk of spontaneous abortion and their potential implications
2025-Sep-22, JBRA assisted reproduction
DOI:10.5935/1518-0557.20250031
PMID:40674570
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研究论文 | 通过孟德尔随机化和多组学分析研究循环蛋白与自然流产风险的因果关系 | 首次结合顺式和反式pQTLs作为工具变量，并整合单细胞转录组分析识别子宫内易感细胞类型 | 排除了性别间差异表达的蛋白质，可能遗漏部分相关蛋白 | 探索循环蛋白与自然流产风险的因果关系及其分子机制 | 自然流产风险相关的遗传变异和循环蛋白 | 生物信息学 | 自然流产 | 孟德尔随机化, pQTL分析, KEGG通路富集, 单细胞转录组分析 | 孟德尔随机化模型 | 遗传变异数据, 蛋白质表达数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 593 | 2025-10-05 |
Orlistat Confers Neuroprotection in Traumatic Brain Injury by Modulating Microglial Lipid Metabolism
2025-Sep-19, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14181469
PMID:41002434
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研究论文 | 研究奥利司他通过调节小胶质细胞脂质代谢在创伤性脑损伤中发挥神经保护作用 | 首次发现奥利司他通过直接抑制小胶质细胞中脂蛋白脂肪酶（LPL）介导的神经炎症发挥神经保护作用 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证 | 探讨奥利司他在创伤性脑损伤中的神经保护潜力及作用机制 | 小鼠创伤性脑损伤模型及小胶质细胞 | 神经科学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序, 分子对接, 转录组学, 代谢组学 | NA | 基因表达数据, 代谢物数据, 行为学数据, 组织学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 594 | 2025-10-05 |
Astrocytes in Fear Memory Processing: Molecular Mechanisms Across the Amygdala-Hippocampus-Prefrontal Cortex Network
2025-Sep-16, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14181444
PMID:41002409
|
综述 | 本文综述了星形胶质细胞在恐惧记忆处理中的分子机制及其在杏仁核-海马体-前额叶皮层网络中的作用 | 挑战了传统的以神经元为中心的恐惧记忆观点，揭示了星形胶质细胞在不同脑区特异性功能和与神经元的动态相互作用 | NA | 探讨星形胶质细胞在恐惧记忆获取、巩固、消退和提取过程中的分子机制 | 星形胶质细胞在杏仁核-海马体-前额叶皮层网络中的功能 | 神经科学 | 创伤后应激障碍(PTSD)和焦虑症 | 空间转录组学, 光遗传学, 化学遗传学 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 595 | 2025-10-05 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals Cell Heterogeneity and Altered Signaling Pathways in Jellyfish Sting Patients
2025-Sep-15, Marine drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/md23090358
PMID:41003327
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示水母蜇伤患者免疫细胞异质性和信号通路改变 | 首次在单细胞分辨率下揭示水母蜇伤后的免疫失调图谱，发现MMP9+单核细胞和S100A12+中性粒细胞的关键作用 | 仅分析一名严重患者样本，样本量较小 | 探究水母蜇伤后的免疫机制和信号通路变化 | 水母蜇伤患者和健康对照者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 中毒性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 一名严重患者和健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 596 | 2025-10-05 |
Morphological and Transcriptomic Analyses of the Adrenal Gland in Acomys cahirinus: A Novel Model for Murine Adrenal Physiology
2025-Sep-12, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14181431
PMID:41002397
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研究论文 | 本研究通过形态学和转录组学分析比较了Acomys cahirinus与小鼠的肾上腺结构与基因表达差异 | 首次在Acomys cahirinus中发现明确的网状带结构，其肾上腺基因表达谱与人类肾上腺皮质高度相似 | 需要进一步进行单细胞转录组学和功能验证实验来充分评估其转化潜力 | 评估Acomys cahirinus作为人类肾上腺疾病模型的适用性 | Acomys cahirinus和小鼠的肾上腺组织 | 转录组学 | 肾上腺疾病 | RNA-seq, qRT-PCR, CAGE-seq, 通路分析 | NA | 转录组数据, 形态学数据 | NA | NA | 转录组测序 | NA | NA |
| 597 | 2025-10-05 |
Comprehensive Characterization of Long Non-Coding RNAs in Porcine Tissues: Expression Patterns and Functional Insights During Oocyte Development
2025-Sep-09, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14181409
PMID:41002376
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研究论文 | 本研究系统表征了猪组织中长链非编码RNA的表达模式及其在卵母细胞发育中的功能 | 首次系统分析14种猪组织的lncRNA表达谱，并鉴定卵母细胞发育过程中的关键lncRNA | 研究主要基于表达谱分析，功能验证实验相对有限 | 阐明猪组织中lncRNA的表达特征及其在生殖生物学中的功能 | 猪多种组织样本及卵母细胞发育不同阶段的单细胞数据 | 生物信息学 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | RNA测序数据 | 607个组织RNA-seq数据集，63个单细胞RNA-seq数据集，以及37个人鼠比较数据集 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 598 | 2025-10-05 |
Piezo1 promotes M1 macrophage polarization and impairs osteogenic differentiation in bone infection
2025-Sep-07, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2025.168042
PMID:40925468
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研究论文 | 本研究探讨Piezo1在骨感染中促进巨噬细胞M1极化并损害成骨分化的机制 | 首次揭示Piezo1在骨感染微环境中调控巨噬细胞极化并通过PANoptosis影响成骨分化的新机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验，需要进一步临床验证 | 探究Piezo1在骨感染过程中对巨噬细胞极化和成骨分化的调控作用 | 大鼠骨感染模型、人类感染骨组织、小鼠单核巨噬细胞和骨髓间充质干细胞 | 骨生物学 | 骨感染 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 细胞共培养 | NA | RNA测序数据, 细胞实验数据 | 大鼠模型和人类组织样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 599 | 2025-10-05 |
Dissecting microbial communities with single-cell transcriptome analysis
2025-Sep-04, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adp6252
PMID:40906858
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综述 | 本文综述了单细胞转录组分析技术在微生物群落研究中的应用进展与挑战 | 将单细胞基因表达分析技术从人类生物学领域拓展应用于微生物群落功能解析 | 在微生物群落应用中仍面临技术挑战 | 探讨单细胞转录组技术在微生物群落功能研究中的应用 | 微生物群落及其亚群 | 单细胞组学 | 肠道微生物相关疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 600 | 2025-10-05 |
Single-cell analysis of human fibrous dysplasia bone reveals a fibrotic transcriptome and GNAS variants in endothelial, perivascular, and stromal cells
2025-Sep-04, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2025.07.018
PMID:40848713
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人类纤维性发育不良骨组织，揭示纤维化转录组特征和GNAS变异在多种细胞类型中的表达 | 首次在骨骼基质谱系外的内皮细胞和周细胞中发现GNAS c.602G>A和c.601C>T变异，并识别出跨FD细胞谱系的共同纤维化转录组特征 | 样本量有限，仅分析了非造血细胞 | 研究体细胞嵌合对纤维性发育不良疾病机制的细胞和分子影响 | 人类纤维性发育不良和非纤维性发育不良骨组织中的非造血细胞 | 单细胞组学 | 纤维性发育不良 | 单细胞RNA测序，GNAS基因分型，BaseScope检测 | NA | 单细胞RNA测序数据 | FD和非FD人类骨组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |