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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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521 | 2025-10-05 |
Integrative in situ mapping of single-cell transcriptional states and tissue histopathology in a mouse model of Alzheimer's disease
2023-03, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-022-01251-x
PMID:36732642
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研究论文 | 开发STARmap PLUS方法,结合空间转录组学和蛋白质检测,绘制阿尔茨海默病小鼠模型的单细胞转录状态与组织病理学图谱 | 首次实现高分辨率空间转录组学与蛋白质检测在同一组织切片中的整合,揭示淀粉样斑块周围的核心-壳结构细胞分布 | 仅在阿尔茨海默病小鼠模型中验证,样本量有限 | 研究阿尔茨海默病发病机制中的时空细胞和分子变化 | 阿尔茨海默病小鼠模型的脑组织 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学,蛋白质检测 | NA | 空间转录组数据,蛋白质表达数据,组织图像 | 8月龄和13月龄阿尔茨海默病小鼠脑组织 | NA | 空间转录组学 | STARmap PLUS | 高分辨率空间转录组学与蛋白质检测整合方法 |
522 | 2025-10-05 |
Decoding molecular and cellular heterogeneity of mouse nucleus accumbens
2021-12, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-021-00938-x
PMID:34663959
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多重错误鲁棒荧光原位杂交技术,构建了小鼠伏隔核的细胞图谱,揭示了其细胞异质性 | 首次结合单细胞转录组和空间信息构建小鼠伏隔核的细胞分类系统,揭示了神经元亚型的转录和空间多样性 | 研究仅限于小鼠模型,未在人类或其他物种中验证 | 解析小鼠伏隔核的分子、细胞和解剖异质性 | 小鼠伏隔核脑区 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 多重错误鲁棒荧光原位杂交 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
523 | 2025-09-30 |
Single-cell transcriptomics unveils iron dysregulation in macrophages: Implicated genes in periodontitis pathogenesis identified via Mendelian randomization
2026-Jan, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101544
PMID:41019505
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
524 | 2025-09-30 |
Uncovering stromal cell fate genes and a novel risk stratification in UCEC by integrating single-cell RNA sequencing and multi-omics analysis
2026-Jan, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101743
PMID:41019513
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
525 | 2025-10-05 |
Activated MAFB in ovarian cancer promotes cytoskeletal remodeling and immune microenvironment suppression by interfering with m6A modifications through WTAP competition
2025-Oct, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03522-w
PMID:40796955
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研究论文 | 本研究揭示了MAFB通过竞争性结合WTAP干扰m6A修饰,促进卵巢癌细胞骨架重塑和免疫微环境抑制的新机制 | 首次发现MAFB通过竞争性结合m6A甲基转移酶复合物核心组分WTAP,建立MAFB-WTAP-CD55调控轴,连接转录调控与表观转录组修饰 | NA | 探索卵巢癌免疫逃逸的分子机制 | 卵巢癌 | 癌症生物学 | 卵巢癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 多个临床队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
526 | 2025-10-05 |
Taurine improves bovine oocyte maturation through recovering mitochondrial dysfunction and oxidative stress-induced apoptosis after microplastics exposure
2025-Oct, Journal of dairy science
IF:3.7Q2
DOI:10.3168/jds.2025-26435
PMID:40818686
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研究论文 | 本研究探讨微塑料暴露对牛卵母细胞成熟的影响及牛磺酸的修复作用 | 首次揭示微塑料通过线粒体功能障碍导致牛卵母细胞成熟失败,并发现牛磺酸具有修复作用 | 研究仅针对牛卵母细胞,对人类生殖系统的直接适用性需要进一步验证 | 探究微塑料对雌性生殖系统的毒性作用及牛磺酸的保护机制 | 牛卵母细胞 | 生殖生物学 | 生殖系统疾病 | 免疫荧光染色,单细胞转录组测序 | NA | 图像数据,基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
527 | 2025-10-05 |
Immunopathogenesis of IgG4-related disease in the era of single-cell RNA sequencing and highly multiplex immunofluorescence
2025-Sep-29, Expert review of clinical immunology
IF:3.9Q2
DOI:10.1080/1744666X.2025.2567589
PMID:40999941
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序和高重免疫荧光技术在IgG4相关疾病免疫发病机制研究中的最新进展 | 利用单细胞技术发现了GZMK+细胞毒性Tfh细胞、MKI67+B细胞和双阴性3型B细胞等新型免疫细胞亚群 | 需要进一步开展空间转录组学和蛋白质组学研究,改进动物模型,加强机制发现与靶向治疗的转化研究 | 阐明IgG4相关疾病的免疫发病机制 | 浆母细胞、活化B细胞、细胞毒性T淋巴细胞、T滤泡辅助细胞、巨噬细胞、树突状细胞等免疫细胞及成纤维细胞 | 免疫学 | IgG4相关疾病 | 单细胞RNA测序, 高重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 免疫荧光图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
528 | 2025-10-05 |
The Biomarkers and Underlying Mechanisms of Mitochondrial and PCD Related Genes in Epilepsy by Combining Transcriptome and Single-Cell Sequencing
2025-Sep-29, Journal of Korean Neurosurgical Society
IF:1.4Q3
DOI:10.3340/jkns.2024.0230
PMID:41017268
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研究论文 | 本研究通过结合转录组和单细胞测序技术,探索线粒体和程序性细胞死亡相关基因在癫痫中的生物标志物及其潜在机制 | 首次结合转录组和单细胞RNA测序分析,识别出与线粒体和程序性细胞死亡相关的癫痫生物标志物LTBR和IRF1 | 样本量有限,仅使用两个数据集和临床样本进行验证 | 探索线粒体和程序性细胞死亡相关基因在癫痫中的作用机制和生物标志物 | 癫痫患者样本和对照样本 | 生物信息学 | 癫痫 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 分子对接 | Spearman相关分析, ROC曲线分析 | 基因表达数据, 单细胞数据 | GSE134697和GSE168375数据集样本,外加临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
529 | 2025-10-05 |
Pathogenicity of Mediator Complex Subunit 27 (MED27) in a Neurodevelopmental Disorder with Cerebellar Atrophy
2025-Sep-29, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202505535
PMID:41017421
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研究论文 | 本研究揭示了MED27基因变异通过破坏中介体复合物稳定性导致神经发育障碍和小脑萎缩的致病机制 | 首次阐明了MED27部分功能缺失导致神经发育障碍的具体分子机制,并建立了研究中介体亚基致病性变异的原型模型 | NA | 研究MED27基因变异导致神经发育障碍和小脑萎缩的致病机制 | 携带患者特异性MED27变异的体外干细胞和Med27功能缺失的小鼠模型 | 神经科学 | 神经发育障碍 | 单细胞空间转录组学,转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
530 | 2025-10-05 |
Extracellular Vesicle-Packaged circTAX1BP1 from Cancer-Associated Fibroblasts Regulates RNA m6A Modification through Lactylation of VIRMA in Colorectal Cancer Cells
2025-Sep-29, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202514008
PMID:41017455
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研究论文 | 本研究揭示了癌症相关成纤维细胞通过细胞外囊泡递送circTAX1BP1调控结直肠癌肝转移的新机制 | 首次发现CAF来源的EV-packaged circTAX1BP1通过VIRMA乳酰化调控RNA m6A修饰,并鉴定出ITGA11 myCAFs亚群在正反馈环路中的关键作用 | 机制研究主要基于体外实验,临床转化价值需进一步验证 | 阐明结直肠癌肝转移的分子机制并探索治疗靶点 | 结直肠癌细胞、癌症相关成纤维细胞、细胞外囊泡 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, PDX模型 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
531 | 2025-10-05 |
Redox Regulation of Microvascular Physiology and Pathophysiology: Insights into Therapeutic Strategies and Limitations
2025-Sep-29, Antioxidants & redox signaling
IF:5.9Q1
DOI:10.1177/15230864251372607
PMID:41020442
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综述 | 本文探讨氧化还原机制在微血管生理和病理生理中的作用及其治疗策略 | 强调微血管与大血管对ROS/RNS反应差异,指出单细胞RNA测序揭示不同血管床内皮细胞具有独特基因特征 | 技术挑战限制了可靠关联ROS/RNS水平与微血管结果的能力,缺乏针对微血管氧化还原信号的特效治疗方法 | 阐明氧化还原介导的微血管功能障碍在疾病发病机制中的具体作用 | 微血管内皮细胞及其对活性氧/活性氮物种(ROS/RNS)的响应 | 病理生理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
532 | 2025-10-05 |
Multi-omics genetic study revealing ferroptosis regulator CTSB driving prostate cancer progression by modulating the immune microenvironment
2025-Sep-29, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04593-y
PMID:41020944
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研究论文 | 本研究通过多组学孟德尔随机化方法揭示了铁死亡调控因子CTSB通过调节免疫微环境驱动前列腺癌进展的因果机制 | 首次提供了铁死亡-免疫相互作用在前列腺癌中因果作用的证据,识别了CTSB作为关键风险因子 | 研究主要基于遗传学证据,需要进一步实验验证机制细节 | 探究铁死亡基因/蛋白表达与前列腺癌的遗传因果关系及免疫介导机制 | 前列腺癌患者样本和免疫细胞类型 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 多组学孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 基因集富集分析, 免疫浸润分析 | 孟德尔随机化模型 | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白组数据 | 涉及731种免疫细胞类型的多组学数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学分析 | NA | NA |
533 | 2025-10-05 |
Simultaneous Measurement of RNA Synthesis and Degradation Rates in Single Cells Unveils the Regulatory Mechanisms of Temporal RNA Dynamics
2025-Sep-28, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202510939
PMID:41017207
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研究论文 | 开发了一种名为scDUAL-seq的新方法,能够在单细胞水平同时测量RNA合成和降解速率 | 整合了双核苷类似物脉冲标记、化学核苷转化和单细胞RNA测序技术,首次实现单细胞水平转录组范围内RNA合成和降解速率的同步测量 | NA | 解析动态过程中RNA调控机制 | 异质性细胞群体中的RNA转录和降解过程 | 单细胞组学 | NA | 双核苷类似物脉冲标记,化学核苷转化,单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
534 | 2025-10-05 |
Immune cell dynamics and their role in cardiac injury: Mechanisms and therapeutic implications
2025-Sep-27, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2025.118608
PMID:41016152
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综述 | 本文综述了心脏损伤中免疫细胞动态变化及其作用机制与治疗前景 | 整合单细胞转录组学、空间组学、免疫代谢和神经内分泌-免疫相互作用等多维度数据,提出精准免疫治疗框架 | NA | 阐明心脏疾病中免疫细胞动态变化机制及其治疗意义 | 中性粒细胞、巨噬细胞、树突状细胞、T细胞等免疫细胞及其与心肌细胞、成纤维细胞、内皮细胞的相互作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学, 空间组学, 免疫代谢分析 | NA | 组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
535 | 2025-10-05 |
Intervention of Rutin and Ochnaflavone in the Attenuation of Neuroinflammation and Neuronal Apoptosis in Spinal Cord Injury
2025-Sep-26, Global spine journal
IF:2.6Q1
DOI:10.1177/21925682251383489
PMID:41001708
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研究论文 | 本研究探讨芦丁和奥那黄酮通过调节PI3K/AKT和NF-κB信号通路减轻脊髓损伤后神经炎症和神经元凋亡的机制 | 首次揭示芦丁和奥那黄酮协同作用通过调控小胶质细胞活化和PI3K/AKT/NF-κB信号通路发挥神经保护作用的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证;机制研究尚未完全阐明所有下游效应分子 | 阐明芦丁和奥那黄酮在脊髓损伤中的神经保护机制 | 脊髓损伤小鼠模型、BV2小胶质细胞系、小胶质细胞-神经元共培养系统 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序, 网络药理学, 蛋白质印迹, 免疫荧光, ELISA | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据, 细胞培养数据 | 小鼠脊髓损伤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
536 | 2025-10-05 |
Integrated multi-omics analysis reveals PTM networks as key regulators of colorectal cancer progression and immune evasion
2025-Sep-26, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03445-8
PMID:41003898
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研究论文 | 通过整合多组学分析揭示翻译后修饰网络作为结直肠癌进展和免疫逃逸的关键调控因子 | 首次全面揭示PTM网络在结直肠癌中的调控作用,发现GALNT6介导的糖基化通过稳定PD-L1和排除CD8+T细胞驱动免疫逃逸 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限 | 探索翻译后修饰在结直肠癌进展和免疫逃逸中的综合作用 | 结直肠癌患者样本和细胞 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 多组学整合分析,孟德尔随机化,空间转录组学 | LASSO,SVM,随机森林 | 转录组数据,单细胞数据 | 1,783例批量RNA-seq样本,41,143个单细胞 | NA | 单细胞转录组学,空间转录组学,批量RNA-seq | NA | NA |
537 | 2025-10-05 |
Multi-omics analysis reveals the prognostic value and immunomodulatory role of CTSW in breast cancer
2025-Sep-26, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03550-8
PMID:41003895
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研究论文 | 通过多组学分析揭示CTSW在乳腺癌中的预后价值和免疫调节作用 | 首次采用多组学框架系统研究CTSW在乳腺癌中的预后意义和免疫调节功能,并通过单细胞RNA测序发现CTSW在活化CD8+T细胞中的表达与预后相关 | 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证 | 探索乳腺癌中新的生物标志物和治疗靶点 | 乳腺癌患者和肿瘤免疫微环境 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 转录组学、甲基化组学、数量性状位点分析、全基因组关联研究、单细胞RNA测序 | Cox回归、Kaplan-Meier生存分析、孟德尔随机化 | 基因组数据、转录组数据、表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
538 | 2025-10-05 |
Data-driven inference of Boolean networks from transcriptomes to predict cellular differentiation and reprogramming
2025-Sep-26, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-025-00569-z
PMID:41006334
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研究论文 | 提出一种从转录组数据自动推断布尔网络的方法,用于预测细胞分化和重编程 | 开发了整合转录组数据和先验知识自动生成布尔网络集合的通用方法,能够处理模型不确定性并预测稳健的重编程靶点 | 方法依赖于转录组数据的质量和对基础基因调控网络的先验知识 | 构建能够再现细胞定性行为的布尔网络模型,用于预测细胞分化和重编程 | 造血系统细胞分化和骨髓基质细胞向脂肪细胞/成骨细胞分化 | 计算生物学 | NA | RNA-seq | 布尔网络 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
539 | 2025-10-05 |
Integrative analysis of molecular mechanisms in prostate cancer via single-cell RNA sequencing and weighted gene co-expression network analysis
2025-Sep-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-15682-6
PMID:41006377
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和加权基因共表达网络分析研究前列腺癌的分子机制 | 首次整合scRNA-seq和bulk RNA-seq与hdWGCNA方法,在更高分辨率下分析前列腺癌肿瘤微环境,识别出6个关键基因 | 需要进一步的临床验证 | 探索前列腺癌进展的分子机制,发现潜在治疗靶点 | 前列腺癌组织样本 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 加权基因共表达网络分析 | Cox回归, LASSO回归, 预后预测模型 | 基因表达数据, 临床数据 | 9,809个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
540 | 2025-10-05 |
Hypersonic levitation and spinning: paving the way for enhanced single-cell analysis via contactless tissue dissociation
2025-Sep-26, Communications engineering
DOI:10.1038/s44172-025-00497-0
PMID:41006575
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研究论文 | 本文介绍了一种新型非接触式组织解离技术——高超声悬浮旋转技术,用于改进单细胞分析 | 开发了基于三声谐振器探针的高超声悬浮旋转技术,实现非接触式组织解离,通过微尺度'液体射流'施加精确流体动力 | NA | 开发高效、温和的组织解离方法以改进单细胞分析 | 人类肾癌组织 | 单细胞分析 | 肾癌 | 高超声悬浮旋转技术 | NA | 流式细胞术、原代细胞培养、免疫荧光、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |