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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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561 | 2025-10-05 |
Longitudinal single cell RNA-sequencing reveals evolution of micro- and macro-states in chronic myeloid leukemia
2025-May-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.14.653262
PMID:40661452
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研究论文 | 通过纵向单细胞RNA测序揭示慢性髓系白血病微观和宏观状态的演化过程 | 建立理论框架解释离散疾病表型在单细胞尺度隐藏而在聚合宏观水平显现的机制 | NA | 探索单细胞与批量转录组学中癌症特异性信息内容,解析疾病定义状态如何从嘈杂单细胞数据中产生 | 慢性髓系白血病(CML)进展过程 | 单细胞组学 | 慢性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | 状态转换理论 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
562 | 2025-10-05 |
Spatiotemporal profiling reveals the impact of caloric restriction on mammalian brain aging
2025-May-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.04.652093
PMID:40654944
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研究论文 | 通过时空分析揭示热量限制对哺乳动物大脑衰老的影响机制 | 首次整合单细胞核基因组学与空间转录组学技术,在区域特异性和细胞类型特异性分辨率下系统解析热量限制的抗衰老机制 | 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类中验证;样本量相对有限(36个大脑) | 阐明热量限制对大脑衰老的分子和细胞作用机制 | 小鼠大脑组织 | 空间转录组学 | 神经退行性疾病 | 单细胞核基因组学, 空间转录组学 | NA | 基因组数据, 空间转录组数据 | 36个小鼠大脑(超过500,000个细胞),12个脑切片 | NA | 单细胞核基因组学, 空间转录组学 | NA | NA |
563 | 2025-10-05 |
p63 co-opts the skin Krt8-to-Krt5 transition for enamel organ development
2025-Apr-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.11.637463
PMID:39990386
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了p63在釉质器官发育中调控Krt8向Krt5过渡的机制 | 首次发现p63在釉质器官发育中借用皮肤发育的Krt8-to-Krt5过渡机制 | 研究仅基于小鼠切牙模型,早期p63敲除小鼠的发育停滞限制了更全面功能研究 | 探究p63在釉质器官细胞分化中的具体作用机制 | 小鼠切牙釉质器官上皮细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 轨迹重建, 比较转录组分析, 染色质可及性分析 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | 小鼠切牙样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
564 | 2025-10-05 |
3D spatial transcriptomics reveals the molecular structure of input and output pathways in the mouse olfactory bulb
2025-Apr-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.19.639192
PMID:40060607
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研究论文 | 利用3D空间转录组学技术重建小鼠嗅球的解剖和分子组织,揭示嗅觉通路的分子结构 | 首次使用3D空间转录组学技术绘制了嗅球的全面分子图谱,揭示了嗅球对称性组织的新原理 | 研究仅限于小鼠模型,未在其他物种中验证 | 研究脊椎动物大脑对称性组织的分子基础 | 小鼠嗅球组织 | 空间转录组学 | NA | 3D空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 近一千个分子特征不同的肾小球 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
565 | 2025-10-05 |
Multi-omics analysis of parthanatos related molecular subgroup and prognostic model development in stomach adenocarcinoma
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0332988
PMID:41004487
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研究论文 | 通过多组学分析研究胃腺癌中parthanatos相关分子亚型并开发预后模型 | 首次系统研究parthanatos相关基因在胃腺癌中的作用,建立了基于PRG的新型预后特征,并通过单细胞RNA测序和体外实验验证关键基因COL8A1的功能 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 探索parthanatos相关基因在胃腺癌中的分子特征和预后价值 | 胃腺癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 胃腺癌 | 多组学分析,转录组学,基因组学,单细胞RNA测序,western blot,集落形成,CCK-8,Transwell实验 | 机器学习算法,无监督聚类 | 转录组数据,基因组数据,临床数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,多组学分析 | NA | NA |
566 | 2025-10-05 |
Integration of Single-Cell RNA and Bulk RNA Sequencing Reveals Cellular Heterogeneity and Identifies Survival-Associated Regulatory Networks in Glioblastoma
2025 Jan-Dec, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.70025
PMID:40804738
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序揭示胶质母细胞瘤细胞异质性并识别与生存相关的调控网络 | 首次结合单细胞和bulk转录组数据识别生存相关细胞状态,发现超级增强子调控网络在胶质母细胞瘤中的关键作用 | NA | 识别胶质母细胞瘤预后生物标志物和治疗靶点 | 胶质母细胞瘤肿瘤微环境中的细胞异质性 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | Scissor算法,WGCNA分析,CellChat分析 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
567 | 2025-10-05 |
Insights gained from single-cell analysis of chimeric antigen receptor T-cell immunotherapy in cancer
2023-11-08, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1186/s40779-023-00486-4
PMID:37941075
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综述 | 探讨单细胞分析在嵌合抗原受体T细胞免疫疗法中的应用与进展 | 系统总结单细胞测序技术如何优化CAR-T细胞疗法的受体设计、基因修饰和制造条件 | NA | 分析CAR-T免疫疗法在临床实践中失败的原因及单细胞测序技术带来的突破 | 嵌合抗原受体T细胞免疫疗法 | 单细胞分析 | 血液系统恶性肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
568 | 2025-10-05 |
Netrin-1 blockade inhibits tumour growth and EMT features in endometrial cancer
2023-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06367-z
PMID:37532934
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研究论文 | 本研究评估了netrin-1阻断剂NP137在子宫内膜癌中的抗肿瘤效果及其对上皮间质转化的抑制作用 | 首次报道netrin-1阻断在子宫内膜癌中的临床应用,并发现其能同时诱导肿瘤消退和抑制EMT | I期临床试验样本量较小(14例患者),需要更大规模研究验证 | 评估netrin-1阻断作为子宫内膜癌治疗策略的有效性和作用机制 | 子宫内膜癌小鼠模型和14例晚期子宫内膜癌患者 | 癌症研究 | 子宫内膜癌 | RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据, 转录组数据 | 14例患者(临床试验)加上小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
569 | 2025-10-05 |
Cryopreservation and post-thaw characterization of dissociated human islet cells
2022, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0263005
PMID:35081145
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研究论文 | 本研究优化了分散人胰岛细胞的冷冻保存方法,并验证了冻存后细胞的功能特性 | 开发了迭代分级冷冻方法,首次系统评估了冻存后胰岛细胞的分子和功能表型完整性 | 研究仅针对分散的胰岛细胞,未评估完整胰岛组织的冷冻保存效果 | 优化胰岛细胞冷冻保存技术,为糖尿病研究和治疗提供细胞来源 | 分散的人胰岛细胞 | 细胞生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序,膜片钳电生理学 | NA | 基因表达数据,电生理数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
570 | 2025-10-05 |
Daytime SHP2 inhibitor dosing, when immune cell numbers are elevated, shrinks neurofibromas
2025-Dec, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202503359
PMID:40992926
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研究论文 | 本研究探讨SHP2抑制剂在特定给药时间下对神经纤维瘤体积及免疫微环境的影响 | 发现SHP2抑制剂仅在白昼给药时(髓系细胞浸润较少时段)能有效缩小肿瘤,并揭示其疗效依赖于靶向单核细胞来源的巨噬细胞 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未验证人体适用性 | 探究SHP2抑制剂对神经纤维瘤体积和免疫微环境的调控机制 | 神经纤维瘤小鼠模型及其肿瘤微环境中的免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 神经纤维瘤 | 流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
571 | 2025-10-05 |
Lichenoid graft-versus-host disease shows a high interferon score, with IFNAR1 inhibition preventing skin inflammation
2025-Oct, Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology : JEADV
IF:8.4Q1
DOI:10.1111/jdv.20760
PMID:40439472
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了苔藓样移植物抗宿主病的干扰素特征,并证明IFNAR1抗体可预防皮肤炎症 | 首次通过单细胞分辨率揭示lGVHD的干扰素特征,并验证IFNAR1阻断的治疗潜力 | 人类样本量较小(n=3),小鼠模型需进一步验证 | 解析苔藓样GVHD的免疫机制并评估I型干扰素通路阻断的治疗效果 | 人类lGVHD皮肤样本和小鼠ccGVHD模型 | 单细胞基因组学 | 移植物抗宿主病 | scRNA-Seq, bulk RNA-Seq, qPCR, 微阵列 | 小鼠GVHD模型 | 基因表达数据 | 人类样本:3例lGVHD+4例对照(scRNA-Seq),13例lGVHD+10例对照(qPCR);小鼠公开数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
572 | 2025-10-05 |
The bone marrow immune ecosystem shapes daratumumab acquired resistance in plasma cell myeloma
2025-Oct, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-025-02712-5
PMID:40750676
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和数字空间分析仪探索多发性骨髓瘤患者对达雷妥尤单抗获得性耐药的骨髓免疫生态系统机制 | 首次揭示骨髓免疫生态系统通过IFN-γ激活MYC通路导致达雷妥尤单抗获得性耐药的新机制 | 样本量有限,主要基于配对样本分析,需要更大规模验证 | 探究多发性骨髓瘤对达雷妥尤单抗获得性耐药的免疫机制 | 多发性骨髓瘤患者治疗前后配对样本 | 单细胞测序分析 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序, 数字空间分析 | 单细胞调控网络推断 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 配对样本分析,4个外部队列验证(GSE24080, GSE136337, GSE57317, coMMpass) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 数字空间分析仪 | NA |
573 | 2025-10-05 |
SPP1 exacerbates ischemic stroke by promoting ferroptosis induced brain injury
2025-Oct-01, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152627
PMID:40957318
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研究论文 | 本研究揭示SPP1通过PI3K/AKT信号通路加剧铁死亡诱导的脑损伤,从而恶化缺血性卒中 | 首次发现SPP1通过调控PI3K/AKT信号通路促进铁死亡在缺血性卒中中的作用机制 | 研究主要基于细胞和动物模型,尚未在临床患者中验证 | 探究SPP1在缺血性卒中中铁死亡机制中的作用及潜在治疗靶点 | HT22细胞系和小鼠MCAO/R模型 | 神经科学 | 缺血性卒中 | 单细胞测序, Western blot, 蛋白组学分析, 免疫荧光, 电子显微镜 | NA | 蛋白质表达数据, 细胞成像, 分子信号通路数据 | 细胞系和小鼠模型,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
574 | 2025-10-05 |
Computational Analysis of Exosome-Derived Signature in TNBC: Integrating Single-Cell and Bulk Transcriptomics for Prognosis Prediction
2025-Oct, Clinical and translational science
DOI:10.1111/cts.70368
PMID:40994257
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量转录组数据,开发了三阴性乳腺癌外泌体衍生预后标志物 | 首次将外泌体相关基因与单细胞分析结合,构建了能够预测免疫治疗反应的新型预后标志物 | 需要进一步验证EDPS与外泌体生物学的直接关系 | 探索外泌体相关基因在三阴性乳腺癌预后预测中的作用 | 三阴性乳腺癌患者样本 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | 机器学习,单变量Cox回归 | 基因表达数据 | 10个TNBC样本的31,140个细胞,TCGA和METABRIC队列 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
575 | 2025-10-05 |
How Single-Cell Transcriptomics of Hydractinia Is Informing the Evolution of Cnidarian Sensory Systems
2025-Sep-26, Integrative and comparative biology
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/icb/icaf090
PMID:40504553
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研究论文 | 通过单细胞转录组技术构建水螅虫细胞图谱,研究刺胞动物感觉系统的进化 | 构建了更新的成年水螅虫单细胞转录组图谱,探索细胞类型特异性标记和再生机制 | NA | 研究水螅虫的细胞生物学和感觉系统进化 | 水螅虫(Hydractinia symbiolongicarpus 和 H. echinata)的成年群体 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序,CRISPR/Cas9基因编辑,shRNA敲低,转基因报告系统 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
576 | 2025-10-05 |
Shedding Light on Patterns of Unconventional Expression of Opsin Genes in Hydra vulgaris
2025-Sep-26, Integrative and comparative biology
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/icb/icaf100
PMID:40581592
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研究论文 | 本研究通过分析水螅的单细胞RNA测序数据,揭示了视蛋白基因在神经元和非神经元细胞类型中的非常规表达模式 | 首次系统描绘了水螅中视蛋白基因在细胞类型和分化状态间的表达谱,发现非神经元细胞中视蛋白表达的广泛存在 | 基于已发表的测序数据进行分析,缺乏实验验证 | 探究刺胞动物中非神经元细胞视蛋白表达的普遍性 | 淡水水螅(Hydra vulgaris) | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序, ATAC-seq | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 已发表单细胞测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
577 | 2025-10-05 |
Chromosomal instability degrades developmental phenotypes essential for anti-GD2 immunotherapy outcomes in high-risk neuroblastoma
2025-Sep-26, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102375
PMID:41015032
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研究论文 | 本研究通过分析840个神经母细胞瘤样本,揭示了染色体不稳定性特别是11q缺失通过降解发育表型影响高危神经母细胞瘤抗GD2免疫治疗效果的机制 | 首次将胎儿期肾上腺单细胞RNA测序与临床预后关联,发现11q染色体缺失通过降解去甲肾上腺素能和代谢表型影响免疫治疗效果 | 仅分析了19对活检样本进行克隆进化研究,样本量相对有限 | 探索高危神经母细胞瘤抗GD2免疫治疗效果的基因组学相关因素 | 840个高危神经母细胞瘤肿瘤样本和19对活检样本 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,基因组分析 | NA | 基因组数据,单细胞RNA测序数据 | 840个肿瘤样本,19对活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
578 | 2025-10-05 |
Integrated single-cell transcriptomics and Mendelian randomization identify neutrophil-associated biomarker genes in colorectal cancer
2025-Sep-25, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03452-9
PMID:40996626
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研究论文 | 通过整合单细胞转录组学和孟德尔随机化方法识别结直肠癌中中性粒细胞相关的生物标志物基因 | 首次结合单细胞RNA测序、孟德尔随机化和共定位分析系统鉴定中性粒细胞相关基因在结直肠癌中的因果作用 | 研究依赖于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 揭示中性粒细胞浸润在结直肠癌中的作用机制并识别关键基因 | 结直肠癌患者的中性粒细胞和基因表达数据 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 共定位分析, 免疫组化验证 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 来自GEO数据库(GSE231559)和BioBank Japan(BBJ-a-107)的多个队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
579 | 2025-10-05 |
Identification of immunosuppressive CD4+ T-cell subtype and construction of prognostic model for hepatocellular carcinoma
2025-Sep-25, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03556-2
PMID:40996677
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序鉴定肝细胞癌中免疫抑制性CD4+ T细胞亚型并构建预后模型 | 首次鉴定SPP1+TNFRSF18+ CD4+ T细胞作为肝细胞癌免疫逃避的关键驱动因素,并构建了基于九基因的预后模型 | 样本量相对较小(16例HCC患者),需要在更大队列中进一步验证 | 阐明CD4+ T细胞在肝细胞癌免疫逃避中的作用机制并开发预后预测工具 | 肝细胞癌患者组织样本和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,分子对接,分子动力学模拟 | LASSO Cox回归模型 | 单细胞RNA测序数据,基因表达数据 | 16例HCC患者(GSE149614),TCGA-LIHC队列,GSE109211验证队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
580 | 2025-10-05 |
Tabersonine inhibits inflammation and apoptosis through the JAK1/STAT3 signaling pathway to alleviate LPS-induced acute lung injury
2025-Sep-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-17885-3
PMID:40998926
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研究论文 | 本研究探讨了塔博赛宁通过JAK1/STAT3信号通路抑制炎症和细胞凋亡,缓解LPS诱导的急性肺损伤的作用机制 | 首次通过网络药理学预测结合实验验证,发现塔博赛宁通过靶向JAK1/STAT3通路发挥治疗急性肺损伤的作用 | 研究主要基于小鼠模型和细胞实验,尚未进行临床验证 | 探究塔博赛宁治疗急性肺损伤的分子机制 | LPS诱导的急性肺损伤小鼠模型和RAW264.7巨噬细胞系 | 分子生物学 | 急性肺损伤 | 网络药理学分析、单细胞转录组分析、分子对接、Western blot、流式细胞术、TUNEL染色 | 动物模型、细胞模型 | 基因表达数据、蛋白质数据、细胞表型数据 | 未明确说明具体样本数量,使用小鼠模型和细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | GSE225664单细胞转录组数据集 |