单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
561	2025-05-10	Integrated bioinformatics and experimental verification to dissect the mechanisms and bioactive ingredients of Radix Rehmanniae in treating multiple sclerosis 2025-05-12, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151790 PMID:40233432	研究论文	本研究通过整合生物信息学和实验验证，揭示了地黄治疗多发性硬化症的作用机制和生物活性成分	首次采用网络药理学和单细胞RNA测序技术，结合体外实验验证，系统解析了地黄治疗多发性硬化症的多成分-多靶点作用模式，并鉴定出Echinacoside和Acteoside为主要活性成分	研究主要基于体外实验和生物信息学预测，缺乏体内实验验证	阐明地黄治疗多发性硬化症的机制并鉴定其活性成分	地黄及其活性成分Echinacoside和Acteoside	生物信息学	多发性硬化症	网络药理学、单细胞RNA测序、分子对接	NA	转录组数据、单细胞RNA测序数据	基于GSE数据库的转录组和单细胞RNA测序数据
562	2025-05-10	Single-cell transcriptomics reveals the mechanisms of lung injury induced by galt gene editing in mouse 2025-05-12, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151780 PMID:40233430	研究论文	本研究通过单细胞转录组学揭示了GALT基因编辑在小鼠中引起的肺损伤机制	首次使用CRISPR/Cas9技术构建Galt c.847 + 1G > T突变小鼠模型，并结合单细胞RNA测序技术分析肺组织细胞组成和信号通路变化	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类样本中验证	探究Galt c.847 + 1G > T突变对肺组织的影响及其分子机制	GALT基因编辑小鼠的肺组织	分子生物学	半乳糖血症	CRISPR/Cas9基因编辑、单细胞RNA测序、PCR、Western blotting	小鼠模型	基因表达数据、组织病理学数据	基因编辑小鼠的肺组织样本
563	2025-05-10	Allometry of cell types in planarians by single-cell transcriptomics 2025-May-09, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adm7042 PMID:40333969	research paper	研究通过单细胞RNA测序技术探索了涡虫中细胞类型的异速生长关系	首次利用scRNA-seq技术研究涡虫细胞类型的异速生长，揭示了不同大小涡虫中细胞类型比例的变化及其与能量储存的关系	研究仅针对无性繁殖的涡虫，结果可能不适用于其他生物	探索细胞类型异速生长的分子和细胞机制	无性繁殖的涡虫	单细胞转录组学	NA	scRNA-seq	NA	单细胞转录组数据	不同大小的涡虫样本
564	2025-05-10	Integrating HiTOP and RDoC frameworks part II: shared and distinct biological mechanisms of externalizing and internalizing psychopathology 2025-May-09, Psychological medicine IF:5.9Q1 DOI:10.1017/S0033291725000819 PMID:40340892	研究论文	本研究通过多组学方法探讨了HiTOP框架中的外化和内化精神病理学谱系如何映射到RDoC的分析单元	整合HiTOP和RDoC框架，揭示外化和内化精神病理学的共享和独特生物学机制	研究依赖于基因组关联研究和影像数据，可能未涵盖所有相关生物学机制	理解外化和内化精神病理学的生物学基础	外化(EXT)和内化(INT)精神病理学谱系	精神病理学	精神疾病	多组学方法、全基因组关联研究(GWAS)、单细胞RNA测序、磁共振成像(MRI)	NA	基因组数据、表达数据、影像数据	NA
565	2025-05-10	Defining pathogenic IL-17 and CSF-1 gene expression signatures in chronic graft-versus-host disease 2025-May-08, Blood IF:21.0Q1 DOI:10.1182/blood.2024025337 PMID:39977705	研究论文	该研究通过单细胞测序技术在小鼠血液中定义了慢性移植物抗宿主病（cGVHD）中IL-17和CSF-1的基因表达特征，并验证了这些特征在患者中的适用性	首次在小鼠血液单核细胞中定义了非直观的IL-17和CSF-1特征，并验证了这些特征在cGVHD患者中的存在	研究样本量有限，且特征仅在70%的确诊患者和50%的后续发展患者中检测到	开发能够识别cGVHD患者中可药物干预的免疫失调的生物标志物	慢性移植物抗宿主病（cGVHD）患者和小鼠模型	生物医学研究	慢性移植物抗宿主病	单细胞测序	小鼠模型	基因表达数据	小鼠模型和部分cGVHD患者
566	2025-05-10	Impaired ketogenesis in Leydig Cells drives testicular aging 2025-May-07, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-59591-8 PMID:40328805	研究论文	该研究揭示了睾丸衰老过程中Leydig细胞酮生成受损的关键作用及其机制	首次发现Leydig细胞中酮生成关键酶Hmgcs2表达随年龄下降，并阐明β-羟基丁酸通过Foxo3a延缓细胞衰老的分子机制	研究主要基于小鼠模型，人类睾丸衰老的类似机制仍需验证	探究睾丸衰老的分子机制并寻找潜在治疗靶点	年轻与老年小鼠的Leydig细胞	生殖生物学	睾丸功能障碍	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	小鼠衰老模型	基因表达数据、代谢物浓度数据	年轻与老年小鼠睾丸组织及Leydig细胞
567	2025-05-10	Exploring the Mechanisms of Microenergy Acoustic Pulse Therapy for the Treatment of Female Stress Urinary Incontinence-Part II 2025-May-07, Neurourology and urodynamics IF:1.8Q3 DOI:10.1002/nau.70048 PMID:40338807	research paper	本研究探讨了微能量声脉冲（MAP）疗法在阴道分娩损伤诱导的应激性尿失禁（SUI）大鼠模型中的治疗机制	首次在单细胞分辨率下研究MAP疗法对SUI的治疗效果，揭示了其对细胞衰老的调节和肌肉神经再生的促进作用	研究基于动物模型，结果可能无法直接推广到人类	探索MAP疗法在SUI治疗中的分子机制	阴道分娩损伤诱导的SUI大鼠模型	生物医学研究	应激性尿失禁	单细胞测序、漏尿点压力测量、肌电图、电生理学研究	动物模型	基因表达数据、生理测量数据	未明确说明，但使用了大鼠模型
568	2025-05-10	Inhibition of CTSC contributes to psoriasis inflammation and keratinocyte hyperproliferation by NF-κB signaling pathway 2025-May-07, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.114808 PMID:40339488	研究论文	本研究探讨了CTSC在银屑病中的作用及其机制，发现抑制CTSC可通过NF-κB信号通路促进炎症和角质形成细胞过度增殖	首次揭示了CTSC抑制通过NF-κB通路促进银屑病炎症和角质形成细胞增殖的新机制	研究主要基于体外细胞实验和小鼠模型，尚未在人体中进行验证	探究CTSC在银屑病中的作用及其分子机制	银屑病患者皮肤组织、IMQ诱导的银屑病样小鼠模型、人永生化角质形成细胞(HaCaT)	分子生物学	银屑病	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、siRNA敲降	IMQ诱导的小鼠银屑病样皮炎模型	基因表达数据、细胞增殖数据	银屑病患者皮肤组织、小鼠模型和HaCaT细胞
569	2025-05-10	TGF-β1 induces autophagy and mediates the effect on macrophages differentiation in primary liver cancer 2025-May-07, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.114799 PMID:40339499	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和实验验证，探讨了TGF-β1在原发性肝癌中介导巨噬细胞分化和自噬的作用	首次在原发性肝癌中鉴定了四种不同的肿瘤相关巨噬细胞亚群，并揭示了TGFB1通过自噬信号驱动巨噬细胞表型转换的机制	样本量相对较小（19例单细胞测序数据），且主要基于转录组数据，需要进一步实验验证	探究原发性肝癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性及其分化机制	原发性肝癌患者的肿瘤相关巨噬细胞	肿瘤免疫学	原发性肝癌	scRNA-seq, IPA通路分析	NA	单细胞转录组数据	19例原发性肝癌患者的单细胞数据，428例TCGA数据
570	2025-05-10	Spatial Multi-Omics Reveals the Potential Involvement of SPP1+ Fibroblasts in Determining Metabolic Heterogeneity and Promoting Metastatic Growth of Colorectal Cancer Liver Metastasis 2025-May-07, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.ymthe.2025.05.004 PMID:40340245	研究论文	本研究通过多组学方法探讨了结直肠癌肝转移（CRLM）中关键微观区域的作用，特别是癌症相关成纤维细胞（CAFs）在促进肿瘤进展中的关键角色	发现了SPP1+成纤维细胞在CRLM中的代谢重编程能力和免疫抑制特性，及其与肿瘤细胞的相互作用	样本量较小（12个新鲜手术样本来自2名未治疗患者），可能影响结果的普遍性	为CRLM的诊断和治疗提供分子和代谢水平的见解	结直肠癌肝转移患者的手术样本和冷冻组织样本	数字病理学	结直肠癌	空间转录组学（ST）、空间代谢组学、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫荧光、RT-qPCR、非靶向代谢组学	NA	转录组数据、代谢组数据、单细胞RNA测序数据	12个新鲜手术样本（来自2名患者）和92个冷冻组织样本（来自40名患者）
571	2025-05-10	Integrative bioinformatics and machine learning identify key crosstalk genes and immune interactions in head and neck cancer and Hodgkin lymphoma 2025-May-06, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-99017-5 PMID:40328901	research paper	该研究通过整合生物信息学和机器学习技术，识别头颈癌和霍奇金淋巴瘤中的关键交叉基因和免疫相互作用	首次探索头颈癌和霍奇金淋巴瘤之间的分子交叉作用，并利用机器学习算法筛选关键生物标志物	研究依赖于公开数据集，未进行实验验证	阐明头颈癌和霍奇金淋巴瘤的共享分子机制，识别潜在诊断生物标志物和治疗靶点	头颈鳞状细胞癌(HNSCC)和霍奇金淋巴瘤(HL)	生物信息学	头颈癌, 霍奇金淋巴瘤	RNA测序, 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 加权基因共表达网络分析(WGCNA)	LASSO回归, 随机森林, SVM-RFE	RNA测序数据, 单细胞RNA测序数据	NA
572	2025-05-10	Recurrence of acute allergic asthma depends on the role of ILC2 driven by Il1rl1 signaling 2025-May-06, Cell communication and signaling : CCS IF:8.2Q1 DOI:10.1186/s12964-025-02220-0 PMID:40329299	研究论文	研究通过建立急性过敏性哮喘复发小鼠模型，揭示了ILC2s通过Il1rl1信号通路在哮喘复发中的关键作用	首次发现ILC2s通过Il1rl1信号通路驱动急性过敏性哮喘的复发，并验证了Il1rl1缺失可显著抑制哮喘复发	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类患者中验证	探索哮喘复发的细胞和分子机制，寻找预防哮喘恶化的新治疗策略	急性过敏性哮喘小鼠模型	免疫学	哮喘	单细胞转录组学、流式细胞术、基因敲除实验	小鼠模型	转录组数据、流式细胞数据	NA
573	2025-05-10	Investigating the mechanisms by which low NAT1 expression in tumor cells contributes to chemo-resistance in colorectal cancer 2025-May-06, Clinical epigenetics IF:4.8Q1 DOI:10.1186/s13148-025-01882-4 PMID:40329330	研究论文	研究低NAT1表达在结直肠癌细胞中如何导致化疗耐药性的机制	揭示了NAT1在调节化疗敏感性、细胞代谢和血管生成中的多方面作用，并提出了NAT1作为生物标志物和治疗靶点的潜力	研究主要基于体外实验和生物信息学分析，临床前和临床验证仍需进一步研究	评估NAT1在介导结直肠癌化疗耐药性中的作用，寻找克服这一临床挑战的新策略	结直肠癌细胞系CaCO2和HCT116，以及肿瘤组织和邻近正常组织	癌症研究	结直肠癌	生物信息学分析、代谢组学、下一代测序（NGS）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、Cellchat检测、Western blot	NA	基因表达数据、代谢数据、蛋白质数据	结直肠癌细胞系和肿瘤组织样本
574	2025-05-10	Fenofibrate inhibits activation of cGAS-STING pathway by alleviating mitochondrial damage to attenuate inflammatory response in diabetic dry eye 2025-May-06, Free radical biology & medicine DOI:10.1016/j.freeradbiomed.2025.05.383 PMID:40339725	研究论文	本研究探讨了cGAS-STING信号通路在糖尿病干眼病(DDE)中的作用，并研究了非诺贝特酸的治疗效果及其机制	首次揭示了cGAS-STING信号通路在DDE发病机制中的关键作用，并发现非诺贝特通过减轻线粒体损伤抑制该通路，为DDE治疗提供了新策略	研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，尚未进行人体临床试验	探究cGAS-STING信号通路在DDE中的作用及非诺贝特酸的治疗机制	糖尿病干眼病(DDE)小鼠模型和永生化人角膜上皮细胞(HCE-T)	分子病理学	糖尿病干眼病	单细胞RNA测序	STZ诱导的DDE小鼠模型	RNA测序数据	未明确说明样本数量，使用了GEO数据库数据和实验模型
575	2025-05-10	RNA research for drug discovery: Recent advances and critical insight 2025-May-05, Gene IF:2.6Q2 DOI:10.1016/j.gene.2025.149342 PMID:39983851	综述	本文综述了RNA研究在药物发现领域的最新进展和关键见解	强调了RNA研究在开发新型治疗药物中的关键作用，包括ASOs、mRNA疗法和RNAi等重大发现	RNA稳定性、递送和脱靶效应等挑战仍然存在，需要持续创新和伦理考量	探讨RNA研究在药物发现中的现状和前景	RNA生物学及其在治疗应用中的复杂性	药物发现	多种疾病	高通量测序、单细胞RNA测序、表观转录组学	NA	RNA序列数据	NA
576	2025-05-10	Propionate alleviates diabetes-induced cardiac fibrosis in mice via regulating Serpinf1 2025-05-05, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151641 PMID:40203653	研究论文	本研究探讨了丙酸盐对糖尿病小鼠心脏纤维化的治疗作用及其机制	发现丙酸盐通过上调Serpinf1基因表达，抑制Wnt信号通路异常激活，改善糖尿病心脏纤维化	研究仅限于小鼠模型，尚未在人体中进行验证	探究丙酸盐对糖尿病心脏纤维化的治疗效果及分子机制	链脲佐菌素诱导的糖尿病小鼠模型和原代小鼠心脏成纤维细胞	心血管疾病	糖尿病心肌病	单细胞RNA测序、shRNA敲低实验	小鼠糖尿病模型	RNA测序数据、生化检测数据	未明确说明小鼠数量
577	2025-05-10	Lipopolysaccharide alters cell communication at the maternal-fetal interface revealed by single-cell RNA-sequencing 2025-May-04, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.143939 PMID:40328399	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了脂多糖（LPS）诱导的炎症对母胎界面细胞组成、细胞间相互作用及关键信号通路的影响	首次利用单细胞RNA测序技术揭示了LPS如何改变母胎界面的细胞通讯及信号通路	研究仅关注了LPS诱导的炎症效应，未涉及其他类型细菌感染的影响	探究LPS诱导的炎症对母胎界面细胞通讯的影响	母胎界面组织中的各类细胞	单细胞测序	妊娠相关疾病	scRNA-Seq	NA	RNA测序数据	未明确说明样本数量，涉及多种细胞类型包括子宫内膜上皮细胞、基质细胞、成纤维细胞等
578	2025-05-10	Delivery of Itgb1-siRNA by triptolide-modified and anti-Flt1 peptide-guided ionizable cationic LNPs for targeted therapy of corneal neovascularization 2025-May-03, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society IF:10.5Q1 DOI:10.1016/j.jconrel.2025.113811 PMID:40324532	研究论文	本研究开发了一种新型的Itgb1-siRNA载药系统，用于治疗角膜新生血管	结合了抗Flt1肽引导和雷公藤甲素修饰的可离子化阳离子脂质纳米颗粒（icLNPs），提高了靶向性和抗炎效果	研究仅在小鼠模型中进行，尚未进行人体临床试验	开发一种新型、非侵入性且有效的角膜新生血管治疗方法	角膜新生血管（CoNV）	生物医学工程	眼科疾病	单细胞测序、siRNA递送系统	小鼠模型	实验数据	小鼠模型
579	2025-05-10	Single-cell RNA sequencing in the study of human retinal organoids 2025-May-02, Experimental eye research IF:3.0Q1 DOI:10.1016/j.exer.2025.110417 PMID:40320034	review	本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在人类视网膜类器官（ROs）研究中的应用	scRNA-seq技术能够识别不同的细胞群体、揭示发育轨迹和视网膜疾病的分子特征，为视网膜神经发生、细胞多样性及退行性疾病的病理生理学提供新见解	NA	研究视网膜发育、细胞相互作用及疾病机制	人类视网膜类器官（ROs）	digital pathology	retinal degenerative diseases	scRNA-seq	NA	RNA sequencing data	NA
580	2025-05-10	Integrative epidemiology and immunotranscriptomics uncover a risk and potential mechanism for cutaneous lymphoma unmasking or progression with dupilumab therapy 2025-May, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jaci.2024.10.028 PMID:39521279	研究论文	本研究通过流行病学和免疫转录组学方法，探讨了dupilumab治疗与皮肤T细胞淋巴瘤（CTCL）发生或进展的风险及潜在机制	首次结合FDA不良事件报告系统（FAERS）和大规模RNA测序数据，揭示了dupilumab可能通过IL-13受体阻断机制促进CTCL的潜在风险	研究基于FAERS数据库的回顾性分析，存在报告偏倚，且缺乏实验验证	评估dupilumab与CTCL关联的安全信号并探究其潜在机制	使用dupilumab治疗的患者及CTCL病例	免疫学与肿瘤学	皮肤T细胞淋巴瘤（CTCL）	RNA测序（包括bulk和单细胞RNA测序）	NA	药物不良事件报告数据、转录组数据	FAERS数据库中181,575份dupilumab相关不良事件报告（其中606例为肿瘤报告）