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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 4401 - 4420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4401 | 2025-10-06 |
Single-Cell Analysis Clarifies Pathological Heterogeneity in Tenosynovial Giant Cell Tumor and Identifies Biomarkers for Predicting Disease Recurrence
2025-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202415835
PMID:40126353
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析弥漫型和局限型腱鞘巨细胞瘤的病理异质性，并鉴定预测疾病复发的生物标志物 | 首次在单细胞水平揭示D-TGCT中独特的肿瘤细胞亚群通过COL6A3-(ITGAV+ITGB8)相互作用调控成纤维细胞分化，并发现ROR1和PRKD1作为预测复发的生物标志物 | NA | 阐明腱鞘巨细胞瘤的病理异质性机制并寻找预测疾病复发的生物标志物 | 人类弥漫型和局限型腱鞘巨细胞瘤病变组织 | 单细胞组学 | 腱鞘巨细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4402 | 2025-10-06 |
CeiTEA: Adaptive Hierarchy of Single Cells with Topological Entropy
2025-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202503539
PMID:40245302
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研究论文 | 提出基于拓扑熵的自适应层次聚类算法CeiTEA，用于分析单细胞RNA测序数据中的细胞层次结构 | 通过最小化拓扑熵构建多叉划分树，结合自下而上的层次构建和自上而下的局部多样化策略 | NA | 解决现有聚类方法难以捕捉细胞类型复杂层次结构的问题 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型和亚型 | 生物信息学 | 肿瘤异质性 | 单细胞RNA测序 | 自适应层次聚类算法 | 单细胞RNA测序数据 | 模拟和真实世界scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4403 | 2025-10-06 |
CellNEST reveals cell-cell relay networks using attention mechanisms on spatial transcriptomics
2025-Jul, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02721-3
PMID:40481363
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研究论文 | 开发了基于注意力机制的空间转录组学工具CellNEST，用于检测细胞间中继网络通信 | 提出新型中继网络通信检测方法，能够识别配体-受体-配体-受体级联通信模式 | 未在摘要中明确说明 | 解码细胞间通信模式，解决现有方法假阳性率高、无法检测单个细胞间信号的问题 | 人类淋巴结、肺腺癌、结直肠癌和胰腺癌组织 | 空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 注意力机制神经网络 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4404 | 2025-10-06 |
Understanding disease-associated metabolic changes in human colonic epithelial cells using the iColonEpithelium metabolic reconstruction
2025-Jul, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013253
PMID:40609069
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研究论文 | 本研究构建了首个结肠上皮细胞特异性基因组尺度代谢模型iColonEpithelium，用于解析炎症性肠病相关的代谢变化 | 创建了首个结肠上皮细胞特异性代谢模型，包含独特的转运反应区室用于模拟与肠道微生物组的代谢相互作用 | 仅提供初步概念验证，需要进一步实验验证和模型完善 | 理解人类结肠上皮细胞在疾病状态下的代谢变化 | 人类结肠上皮细胞 | 代谢组学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序，基因组尺度代谢建模 | 基因组尺度代谢模型 | 基因表达数据 | 克罗恩病和溃疡性结肠炎样本的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4405 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Uncovers La Ribonucleoprotein 6 (LARP6) as a Dual Regulator of Proliferation and Immune Infiltration in Triple-Negative Breast Cancer
2025-Jul, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70709
PMID:40635123
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析发现LARP6在三阴性乳腺癌中作为增殖和免疫浸润的双重调节因子 | 首次发现LARP6在三阴性乳腺癌中特异性高表达，并揭示其在细胞增殖和肿瘤免疫微环境中的双重调控作用 | 研究基于已发表的数据库，需要进一步实验验证LARP6的具体作用机制 | 识别三阴性乳腺癌特异性标志物并探索其生物学功能 | 乳腺癌细胞和肿瘤微环境中的免疫细胞 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 基因集富集分析, 生存分析, TriCycle分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过260,000个细胞，来自ER阳性、HER2阳性和三阴性乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4406 | 2025-10-06 |
[Analysis of the number, type, and functional heterogeneity of senescent cells in the radiation-induced skin wounds in mice]
2025-Jun-20, Zhonghua shao shang yu chuang mian xiu fu za zhi
|
研究论文 | 本研究通过实验和生物信息学分析探讨了辐射诱导小鼠皮肤伤口中衰老细胞的数量、类型和功能异质性 | 首次系统揭示了辐射诱导皮肤损伤中多种细胞类型的衰老特征及其功能异质性，发现了衰老细胞积累的剂量和时间依赖性规律 | 研究样本量有限，仅使用转基因小鼠模型，未验证其他动物模型或人类样本 | 探究辐射诱导皮肤伤口中衰老细胞的特征和功能异质性 | p16-diphtheria toxin receptor-tdTomato转基因小鼠和公开的大鼠单细胞转录组数据 | 细胞生物学 | 放射性皮肤损伤 | 免疫荧光法、流式细胞术、单细胞转录组测序、生物信息学分析 | NA | 实验数据、单细胞转录组数据 | 49只转基因小鼠（40只用于主要实验，9只用于流式分析）和公开的大鼠单细胞数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4407 | 2025-10-06 |
Conserved patterns of transcriptional dysregulation, heterogeneity, and cell states in clear cell kidney cancer
2025-01-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.115169
PMID:39792555
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研究论文 | 通过单细胞转录组学分析肾透明细胞癌的转录调控模式和细胞状态异质性 | 首次在肾透明细胞癌中系统识别保守的转录失调模式、上游调控因子及与转移潜能相关的14q染色体缺失的亚克隆转录后果 | 样本量相对有限（75例多区域活检），未涉及其他癌症类型的比较分析 | 解析肾透明细胞癌中肿瘤和基质细胞组分的转录程序及其与肿瘤异质性的关系 | 肾透明细胞癌肿瘤组织和正常肾脏组织 | 单细胞转录组学 | 肾癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 75例多区域活检样本（来自肾肿瘤和正常肾脏） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4408 | 2025-10-06 |
Recent developments and new directions in the use of natural products for the treatment of inflammatory bowel disease
2024-Sep, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2024.155812
PMID:38905845
|
综述 | 系统回顾天然产物治疗炎症性肠病的最新研究进展 | 整合现代技术（如宏基因组学、单细胞测序、靶点识别和药物递送系统）推动天然产物在IBD治疗中的应用 | 天然产物在临床转化和药物开发方面仍面临挑战 | 探索天然产物治疗炎症性肠病的新方向 | 多酚、生物碱、萜类、醌类等天然产物 | NA | 炎症性肠病 | 宏基因组学, 单细胞测序, 靶点识别技术, 药物递送系统 | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4409 | 2025-10-06 |
RAS/RAF landscape in monoclonal plasma cell conditions
2024-07-11, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023022295
PMID:38643494
|
研究论文 | 通过分析10,000多名浆细胞疾病患者的RAS/RAF基因突变情况，揭示了该通路在多发性骨髓瘤等疾病中的突变特征 | 首次在如此大规模浆细胞疾病队列中系统描述RAS/RAF突变谱，并通过单细胞测序证实突变发生在不同亚克隆中 | 研究基于常规测序面板，可能未覆盖所有相关突变 | 描述浆细胞疾病中RAS/RAF通路的突变特征和临床意义 | 10,000多名不同浆细胞疾病患者 | 基因组学 | 多发性骨髓瘤 | 二代测序，单细胞测序 | NA | 基因组测序数据 | >10,000名患者，其中29名患者进行了单细胞测序 | NA | 单细胞测序，二代测序 | NA | NA |
| 4410 | 2025-10-06 |
Deciphering distinct pathogenic mechanisms of ankylosing spondylitis and systemic sclerosis via shared biomarkers ZSWIM6 and CCL3L3: Insights from an integrative bioinformatics approach
2025-12, Autoimmunity
IF:3.3Q3
DOI:10.1080/08916934.2024.2445557
PMID:39727004
|
研究论文 | 通过整合生物信息学方法鉴定强直性脊柱炎和系统性硬化症的共享生物标志物ZSWIM6和CCL3L3，揭示其不同的致病机制 | 首次发现ZSWIM6和CCL3L3作为AS和SSc的共享生物标志物，并通过多组学数据分析揭示其在两种自身免疫疾病中的不同分子机制 | 研究主要基于公共数据库的RNA-seq数据，需要进一步实验验证生物标志物的功能机制 | 探索强直性脊柱炎和系统性硬化症不同炎症发病机制的分子基础 | 强直性脊柱炎和系统性硬化症患者的外周血单核细胞和骨髓血样本 | 生物信息学 | 自身免疫疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 生物信息学分析 | SVM递归特征消除, CIBERSORT免疫细胞分析 | 基因表达数据 | 来自GEO数据集GSE73754、GSE19617和GSE194315的多个样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 4411 | 2025-10-06 |
Mature tertiary lymphoid structures linked to HPV status and anti-PD-1 based chemoimmunotherapy response in head and neck squamous cell carcinoma
2025-Dec, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2025.2528109
PMID:40621740
|
研究论文 | 本研究探讨成熟三级淋巴结构与HPV状态及抗PD-1化疗免疫治疗反应在头颈鳞状细胞癌中的关联 | 首次揭示成熟三级淋巴结构的组成特征及其与HPV阳性肿瘤和化疗免疫治疗反应的关联 | 研究样本来源和数量未明确说明，需要进一步验证 | 研究三级淋巴结构在头颈鳞状细胞癌化疗免疫治疗中的作用机制 | 头颈鳞状细胞癌患者样本 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞转录组测序,空间转录组学,多光谱免疫组化,流式细胞术,ELISA | NA | 转录组数据,病理切片图像,单细胞数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 4412 | 2025-10-06 |
PerturbSeq.db: An Integrated Repository for Comprehensive Analysis of Single-cell Perturbation Data
2025-Sep-01, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2025.169209
PMID:40381983
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研究论文 | 介绍了一个整合单细胞扰动数据的综合数据库PerturbSeq.db | 开发了首个全面整合和统一处理单细胞扰动数据的数据库，采用统一处理流程确保数据一致性 | 未提及具体的数据更新频率和长期维护计划 | 解决单细胞扰动研究领域数据可访问性和整合性的挑战 | 单细胞扰动数据集，包括遗传和化学干预数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞测序数据 | 189个数据集来自77项研究，涵盖约50种不同细胞系或组织 | NA | single-cell RNA-seq, single-cell ATAC-seq | NA | NA |
| 4413 | 2025-10-06 |
Reference Vector-guided Evolutionary Algorithm for cluster analysis of single-cell transcriptomes
2025-Sep, Computer methods and programs in biomedicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.cmpb.2025.108873
PMID:40499345
|
研究论文 | 提出一种基于参考向量引导的进化算法RVEA-CAST，用于单细胞转录组数据的聚类分析 | 首次将单细胞转录组聚类问题建模为多目标优化问题，并设计了三个问题感知的变异算子 | 仅在十个真实scRNA-seq数据集上验证，需要更多数据集验证通用性 | 解决单细胞RNA测序数据的聚类分析问题 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 参考向量引导的进化算法 | 基因表达数据 | 十个真实scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4414 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis reveals distinct immune characteristics of hepatocellular carcinoma in HBV-positive vs. HBV-negative cases
2025-Sep, Molecular and clinical oncology
IF:1.4Q4
DOI:10.3892/mco.2025.2871
PMID:40636452
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较HBV阳性和阴性肝细胞癌的免疫特征差异 | 首次在单细胞水平揭示HBV感染如何改变肝细胞癌肿瘤微环境中免疫细胞的组成和状态 | 未完全阐明HBV诱导肿瘤微环境改变的具体分子机制 | 探究HBV感染对肝细胞癌免疫微环境的影响 | HBV阳性和阴性肝细胞癌患者的肿瘤样本 | 单细胞组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4415 | 2025-10-06 |
Construction and validation of a lipid metabolism-related genes prognostic signature for skin cutaneous melanoma
2025-Aug-15, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152115
PMID:40460484
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研究论文 | 构建并验证了皮肤黑色素瘤中脂质代谢相关基因的预后特征模型 | 首次基于脂质代谢相关基因建立皮肤黑色素瘤预后特征模型，并通过单细胞RNA测序和体内外实验验证关键基因CCNA2的功能 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步临床验证 | 研究脂质代谢相关基因在皮肤黑色素瘤中的预后价值和功能作用 | 皮肤黑色素瘤患者 | 生物信息学 | 皮肤黑色素瘤 | mRNA测序，单细胞RNA测序，NMF聚类分析，WGCNA，LASSO回归，Cox回归 | 预后风险模型，列线图 | 基因表达数据，临床数据 | TCGA和GEO数据库中的多个队列（包括GSE65904，GSE54467，GSE72056） | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4416 | 2025-10-06 |
Cancer-associated fibroblasts and metabolic reprogramming predict pathologic response to neoadjuvant PD-1 blockade in resected non-small cell lung cancer
2025-Aug, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-025-01067-4
PMID:40358847
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了癌症相关成纤维细胞和代谢重编程在非小细胞肺癌新辅助免疫治疗病理反应预测中的作用 | 首次发现甲硫氨酸循环可作为T细胞分化和良好病理反应的预测因子，并鉴定出与免疫检查点抑制剂反应相关的基质特征 | 研究基于已发表的单细胞数据集和本地队列，样本量有限，需要进一步实验验证机制 | 探索非小细胞肺癌患者对新辅助PD-1阻断免疫治疗产生耐药性的潜在机制 | 可切除局部晚期非小细胞肺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析 | NA | 转录组数据，单细胞数据 | 本地III期NSCLC队列+4个公共ICI转录组队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4417 | 2025-10-06 |
ATF3 Deficiency Exacerbates Ageing-Induced Atherosclerosis and Clinical Intervention Strategy
2025-Jul-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202502249
PMID:40641410
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研究论文 | 本研究揭示了ATF3在血管平滑肌细胞衰老和动脉粥样硬化中的保护作用及其分子机制 | 发现ATF3-ATG7正反馈放大环路调控自噬，并首次提出特唑嗪可通过稳定ATF3 mRNA延缓血管衰老 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证尚需进一步研究 | 识别血管平滑肌细胞衰老调控因子并开发衰老相关动脉粥样硬化的临床干预策略 | 人动脉粥样硬化颈动脉、血管平滑肌细胞、SMC特异性ATF3敲除小鼠 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, CUT&Tag-seq, m6A表观转录组分析, 高通量虚拟筛选 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据, 蛋白质相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 表观遗传学分析 | NA | NA |
| 4418 | 2025-10-06 |
Androgen Receptor Governs Tip Cell Formation in Cerebrovascular Malformations
2025-Jul-11, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.326471
PMID:40641462
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了雄激素受体在脑血管畸形尖端细胞形成中的关键作用 | 发现了不依赖雄激素的AR介导的内皮细胞出芽新模式，并验证了AR降解剂ARD-2585的治疗潜力 | 样本量相对有限（13例患者样本），且主要基于小鼠模型验证 | 探究脑血管畸形中异常血管生成的调控机制 | 人类脑血管畸形样本（脑海绵状畸形和脑动静脉畸形）及相应小鼠模型 | 单细胞转录组学 | 脑血管畸形 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析，体外功能实验，动物模型验证 | NA | 单细胞转录组数据 | 13例人类脑血管畸形样本（10例脑海绵状畸形，3例脑动静脉畸形）和13例对照脑样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4419 | 2025-10-06 |
Integration of scRNA-seq and bulk tissue RNA-seq data to identify cancer-associated fibroblast-related gene RGMA as a potential treatment target for esophageal cancer
2025-Jul-11, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01660-8
PMID:40643758
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和bulk组织RNA测序数据，鉴定出癌症相关成纤维细胞相关基因RGMA作为食管癌的潜在治疗靶点 | 首次发现RGMA在食管癌中作为肿瘤抑制基因的功能，并揭示其通过调控Akt信号通路和肿瘤促进性趋化因子影响癌症相关成纤维细胞分化的新机制 | 未提供临床实验数据，研究主要基于细胞系和动物模型 | 鉴定食管癌中癌症相关成纤维细胞相关基因并探索其治疗潜力 | 食管癌组织、ECA109细胞系、癌症相关成纤维细胞和正常成纤维细胞 | 生物信息学 | 食管癌 | scRNA-seq, bulk RNA-seq, WGCNA, RT-qPCR, western blot, 体外和体内实验 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | TCGA-ESCA队列数据集GSE196756及实验验证样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4420 | 2025-10-06 |
Modulation of infiltrating CD206-positive macrophages restricts progression of pulmonary lymphangioleiomyomatosis (LAM)
2025-Jul-10, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.00084-2025
PMID:40639874
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析发现肺淋巴管平滑肌瘤病(LAM)中CD206阳性M2样巨噬细胞促进疾病进展，并验证靶向该巨噬细胞的治疗潜力 | 首次揭示LAM细胞通过CXCL12招募并极化M2样巨噬细胞的机制，并证明靶向CD206阳性巨噬细胞可抑制疾病进展 | 临床前研究结果需在人体试验中验证，样本量有限 | 探索LAM疾病进展机制并寻找新的治疗靶点 | 肺淋巴管平滑肌瘤病患者标本和TSC2缺陷细胞 | 单细胞生物学 | 淋巴管平滑肌瘤病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫荧光染色, 体外共培养 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据, 图像数据 | 人肺LAM标本和临床前小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | Visium | Visium空间转录组平台 |