单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27897 篇文献，本页显示第 4241 - 4260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4241 | 2025-03-01 |
Transcriptome Landscape of Cancer-Associated Fibroblasts in Human PDAC
2025-Feb-28, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202415196
PMID:40019403
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研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序分析，全面描绘了人类胰腺导管腺癌（PDAC）肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞（CAFs）的转录组景观 | 识别了包括新发现的CAF亚型在内的九种不同的CAF亚型，并揭示了CAF亚型之间的分化可塑性及其与临床不良结果的关联 | NA | 研究胰腺导管腺癌（PDAC）肿瘤微环境中癌症相关成纤维细胞（CAFs）的转录组特征及其动态转换 | 人类胰腺导管腺癌（PDAC）肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞（CAFs） | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 4242 | 2025-03-01 |
The bone marrow NK cell profile predicts MRD negativity in patients with multiple myeloma treated with daratumumab-based therapy
2025-Feb-28, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024026455
PMID:40019438
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学、流式细胞术和功能实验，探讨了多发性骨髓瘤（MM）患者诊断时和治疗期间骨髓中自然杀伤（NK）细胞的变化 | 揭示了诊断时CD16+细胞毒性NK细胞比例降低与达雷妥尤单抗治疗下细胞因子产生减少和NK细胞脱颗粒能力下降的相关性，并发现CD16+骨髓NK细胞比例低的患者在接受达雷妥尤单抗治疗后达到MRD阴性的可能性降低 | 研究结果主要基于CASSIOPEIA试验的数据，可能不适用于其他治疗方案或患者群体 | 探讨骨髓NK细胞在多发性骨髓瘤患者接受达雷妥尤单抗治疗中的预测作用 | 多发性骨髓瘤患者 | 免疫治疗 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞转录组学、流式细胞术、功能实验 | NA | 细胞数据 | CASSIOPEIA试验中的多发性骨髓瘤患者 |
| 4243 | 2025-03-01 |
Elucidating prognostic significance of purine metabolism in colorectal cancer through integrating data from transcriptomic, immunohistochemical, and single-cell RNA sequencing analysis
2025-Feb-27, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.70010
PMID:40017120
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研究论文 | 本研究通过整合转录组、免疫组化和单细胞RNA测序数据，探讨了嘌呤代谢在结直肠癌中的预后意义 | 首次通过免疫组化验证嘌呤代谢作为结直肠癌预后标志物的临床相关性，并发现五个嘌呤代谢相关基因的低表达与不良预后相关 | 嘌呤代谢反应的可逆性可能影响研究结果的稳定性 | 评估嘌呤代谢在结直肠癌中的临床相关性及其作为预后标志物的潜力 | 结直肠癌患者 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 转录组分析、免疫组化(IHC)、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据、免疫组化数据、单细胞RNA测序数据 | 结直肠癌患者亚组（包括野生型TP53、突变型TP53和微卫星稳定表型） |
| 4244 | 2025-03-01 |
The spatial landscape of cancer hallmarks reveals patterns of tumor ecological dynamics and drug sensitivity
2025-Feb-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.115229
PMID:39864059
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研究论文 | 本文通过空间转录组学技术，探索了10种癌症类型中63个未经治疗的原发性肿瘤的癌症标志物空间分布，揭示了肿瘤生态动力学模式和药物敏感性 | 首次展示了癌症标志物在肿瘤空间中的组织化分布，并发现肿瘤亚克隆之间的基因组距离与标志物活性差异相关，甚至导致克隆-标志物特化 | 研究样本量相对较小，仅涉及63个肿瘤样本和33名膀胱癌患者，可能限制了结果的普遍性 | 探索肿瘤生态动力学和药物敏感性，以改善对肿瘤生态的理解并帮助识别新的药物生物标志物 | 10种癌症类型中63个未经治疗的原发性肿瘤和33名膀胱癌患者 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 63个原发性肿瘤样本和33名膀胱癌患者 |
| 4245 | 2025-03-01 |
Pde4b-regulated cAMP signaling pathway in the AUDGABA-S1TrSst circuit underlies acute-stress-induced anxiety-like behavior
2025-Feb-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115253
PMID:39891910
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研究论文 | 本文研究了急性应激诱导的焦虑样行为的神经和分子机制，发现S1Tr区域的GABA能生长抑素神经元在这一过程中起关键作用 | 揭示了急性应激通过AUD-S1Tr投射中的Pde4b调控的cAMP信号通路影响S1Tr神经元活动，从而调控焦虑行为的分子机制 | 研究主要聚焦于小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 探索急性应激诱导焦虑行为的神经和分子机制 | 小鼠的S1Tr区域GABA能生长抑素神经元 | 神经科学 | 焦虑症 | 单细胞测序、空间转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 4246 | 2025-03-01 |
Single-cell multi-omics analysis identifies SPP1+ macrophages as key drivers of ferroptosis-mediated fibrosis in ligamentum flavum hypertrophy
2025-Feb-25, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-025-00746-6
PMID:40001138
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学分析揭示了SPP1+巨噬细胞在铁死亡介导的黄韧带肥厚纤维化中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序和多组学整合分析，揭示了SPP1+巨噬细胞通过SPP1-CD44轴调控高铁死亡评分成纤维细胞的铁死亡，从而促进黄韧带肥厚纤维化的机制 | 研究主要基于单细胞测序和动物模型，临床样本验证仍需进一步扩大 | 探讨黄韧带肥厚纤维化的细胞和分子机制 | 人类黄韧带样本和小鼠模型 | 数字病理 | 腰椎管狭窄症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量RNA测序（bulk RNA-seq）、孟德尔随机化（MR） | NA | 单细胞RNA测序数据、批量RNA测序数据 | 人类黄韧带样本和小鼠模型 |
| 4247 | 2025-03-01 |
Molecular profiling of skin cells identifies distinct cellular signatures in radiation-induced skin injury across various stages in the murine dataset
2025-Feb-25, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-025-00596-w
PMID:40001256
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，详细分析了辐射诱导皮肤损伤（RISI）在不同阶段的分子特征，揭示了细胞亚群和分子机制 | 首次使用单细胞RNA测序技术全面解析辐射诱导皮肤损伤的细胞亚群和分子机制，揭示了循环角质形成细胞、分泌乳头状成纤维细胞和淋巴内皮细胞在RISI中的关键作用 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 增强对辐射诱导皮肤损伤的分子机制的理解，为治疗提供新的靶点 | C57BL/6小鼠的皮肤细胞 | 数字病理学 | 皮肤损伤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、RT-PCR、多重免疫荧光染色 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 71,412个细胞，来自C57BL/6小鼠的皮肤样本 |
| 4248 | 2025-03-01 |
Endothelial Cell Phenotypic Plasticity in Cardiovascular Physiology and Disease: Mechanisms and Therapeutic Prospects
2025-Feb-24, American journal of hypertension
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/ajh/hpaf027
PMID:39989120
|
研究论文 | 本文探讨了内皮细胞在心血管生理和疾病中的表型可塑性机制及其治疗前景 | 利用单细胞RNA测序技术深入揭示了内皮细胞的分子多样性和转录异质性，并探讨了内皮细胞表型转换在心血管疾病中的作用 | 文章未明确提及具体的研究样本量或实验设计的局限性 | 研究内皮细胞的表型可塑性及其在心血管疾病中的机制，以开发靶向治疗策略 | 内皮细胞及其在不同血管床和发育阶段的表型转换 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 4249 | 2025-03-01 |
Advances and Challenges in Modeling Autosomal Dominant Polycystic Kidney Disease: A Focus on Kidney Organoids
2025-Feb-19, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13020523
PMID:40002937
|
综述 | 本文综述了常染色体显性多囊肾病（ADPKD）模型的最新进展，特别是肾脏类器官构建技术的创新，以及这些技术在疾病机制研究和药物发现中的应用 | 利用iPSC衍生的ADPKD类器官模型，结合微流体生物反应器培养系统和单细胞转录组学等新兴技术，提供了更直接的病理表型观察和疾病机制探索 | 当前技术存在血管化和成熟度不足的问题，限制了模型的准确性 | 总结ADPKD类器官构建的最新进展，探讨当前技术的局限性，并提出未来突破的关键问题 | 常染色体显性多囊肾病（ADPKD） | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 微流体生物反应器培养系统, 单细胞转录组学 | iPSC衍生的ADPKD类器官模型 | NA | NA |
| 4250 | 2025-03-01 |
The Endothelial Cell-Related Genes EIF1 and HSPA1B Contribute to the Pathogenesis of Alzheimer's Disease by Modulating Peripheral Immunoinflammatory Responses
2025-Feb-16, Brain sciences
IF:2.7Q3
DOI:10.3390/brainsci15020205
PMID:40002537
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研究论文 | 本文通过分析单细胞RNA测序数据，揭示了内皮细胞相关基因EIF1和HSPA1B在阿尔茨海默病（AD）发病机制中的作用，特别是通过调节外周免疫炎症反应 | 首次识别出内皮细胞相关基因EIF1和HSPA1B与AD进展相关，并揭示了它们通过调节外周免疫炎症反应参与AD发病机制的潜在分子机制 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，需要进一步实验验证这些基因在AD中的具体作用机制 | 探讨内皮细胞相关基因在阿尔茨海默病发病机制中的作用 | 内皮细胞相关基因EIF1和HSPA1B | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归和随机森林算法 | RNA测序数据 | 单细胞RNA测序数据集GSE157827及队列外周血RNA测序数据 |
| 4251 | 2025-03-01 |
EGFR-Mutant Lung Adenocarcinoma Cell-Derived Exosomal miR-651-5p Induces CD8+ T Cell Apoptosis via Downregulating BCL2 Expression
2025-Feb-15, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13020482
PMID:40002895
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研究论文 | 本文研究了EGFR突变型肺腺癌细胞通过外泌体miR-651-5p诱导CD8+ T细胞凋亡的机制，并探讨了miR-651-5p拮抗剂在增强PD-1抑制剂疗效中的作用 | 揭示了EGFR突变型肺腺癌细胞通过外泌体miR-651-5p诱导CD8+ T细胞凋亡的新机制，并提出了miR-651-5p拮抗剂与PD-1抑制剂联合治疗的新策略 | 研究主要基于体外实验和小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证其效果 | 探讨EGFR突变型非小细胞肺癌（NSCLC）患者对PD-1或PD-L1抑制剂疗效不佳的机制，并寻找新的治疗策略 | EGFR突变型肺腺癌细胞、CD8+ T细胞、外泌体miR-651-5p | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 小RNA测序、单细胞测序、流式细胞术、小鼠模型 | 小鼠模型 | RNA测序数据、流式细胞数据 | 临床标本、小鼠模型 |
| 4252 | 2025-03-01 |
Assessing the Causal Relationship Between Plasma Proteins and Pulmonary Fibrosis: A Systematic Analysis Based on Mendelian Randomization
2025-Feb-14, Biology
DOI:10.3390/biology14020200
PMID:40001968
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研究论文 | 本研究利用孟德尔随机化方法评估血浆蛋白与肺纤维化之间的因果关系，并识别潜在药物靶点 | 首次系统性地通过孟德尔随机化方法分析血浆蛋白与肺纤维化的因果关系，并结合多种生物信息学方法评估靶点的生物学功能和药理潜力 | 研究依赖于已有的GWAS和pQTL数据，可能受限于数据的质量和样本量 | 探索血浆蛋白与肺纤维化之间的因果关系，识别潜在药物靶点 | 血浆蛋白和肺纤维化 | 生物信息学 | 肺纤维化 | 孟德尔随机化、富集分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络、药物预测、分子对接、单细胞测序 | NA | 基因组数据、蛋白质数据 | 血浆蛋白数据样本量35,559，肺纤维化相关GWAS数据样本量469,126 |
| 4253 | 2025-03-01 |
Towards the Prediction of Responses to Cancer Immunotherapy: A Multi-Omics Review
2025-Feb-12, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life15020283
PMID:40003691
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综述 | 本文综述了利用多组学特征预测肿瘤免疫治疗反应的最新进展 | 强调了TMB、新抗原、MSI和突变特征在预测ICI反应中的重要性，整合了bulk和单细胞RNA测序以增强对肿瘤免疫微环境的理解 | 需要大规模和多样化的临床数据集，多组学数据的标准化，以及模型的可解释性 | 预测肿瘤免疫治疗反应 | 肿瘤患者 | 机器学习 | 癌症 | 高通量技术，如肿瘤突变负荷（TMB）、基因表达谱和DNA甲基化谱 | 传统机器学习和深度学习框架 | 多组学数据 | NA |
| 4254 | 2025-03-01 |
Single-cell data-driven design of armed oncolytic virus to boost cooperative innate-adaptive immunity against cancer
2025-Feb-05, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2024.12.017
PMID:39674886
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析，设计并构建了一种表达五个非冗余功能基因的武装溶瘤病毒OV-5A，以增强对癌症的先天-适应性免疫反应 | 利用单细胞RNA测序数据驱动的设计方法，开发了一种新型武装溶瘤病毒OV-5A，并展示了其在多种模型中的有效免疫反应 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在大量患者中进行临床试验 | 开发更有效的溶瘤病毒疗法，以增强对癌症的免疫反应 | 癌症患者和多种小鼠模型 | 癌症免疫治疗 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 多种小鼠模型、外周血单核细胞-患者来源的异种移植模型、类器官-免疫细胞共培养系统和患者组织切片 |
| 4255 | 2025-03-01 |
BNT162b2 COVID-19 vaccination elicits the expansion of CD16+CD8+ T cells endowed with natural killer cell features
2025-Jan-31, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.01.024
PMID:39894227
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研究论文 | 本文研究了BNT162b2 COVID-19疫苗接种后，CD16+CD8+ T细胞的扩展及其具有自然杀伤细胞特征的功能 | 揭示了BNT162b2 mRNA疫苗接种后，CD16+CD8+ T细胞的扩展及其具有自然杀伤细胞特征的功能，这是对新型疫苗免疫系统影响的深入理解 | 研究样本量较小，仅包括30名健康个体，且未涉及不同人群或长期效果的评估 | 旨在表征BNT162b2 mRNA疫苗接种后出现的非常规T细胞亚群 | 30名接受BNT162b2 mRNA疫苗接种的健康个体的外周血 | 免疫学 | COVID-19 | 多参数流式细胞术和单细胞转录组分析 | NA | 外周血样本 | 30名健康个体 |
| 4256 | 2025-03-01 |
Dynamic Immune Response Landscapes of Avian Peripheral Blood Post-Vaccination Against Infectious Bronchitis Virus Infection
2025-Jan-30, Vaccines
IF:5.2Q1
DOI:10.3390/vaccines13020146
PMID:40006693
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序技术，全面分析了接种H120减毒活疫苗后鸡外周血单核细胞的体内动态变化，揭示了抗病毒适应性免疫反应启动阶段的特定免疫细胞群体及其分子网络 | 首次在单细胞水平上使用高通量单细胞转录组测序技术，详细描绘了鸡接种IBV疫苗后外周血单核细胞的动态免疫反应景观 | 研究仅限于特定病原体自由鸡，且仅分析了接种后两周内的免疫反应动态 | 研究鸡接种IBV疫苗后的免疫反应动态，为未来疫苗的合理设计、现有疫苗效力的增强以及免疫程序的优化提供理论支持 | 特定病原体自由鸡的外周血单核细胞 | 生物信息学 | 禽传染性支气管炎 | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 29,846个鸡外周血单核细胞 |
| 4257 | 2025-03-01 |
Phospholipase C Beta 2 as a Key Regulator of Tumor Progression and Epithelial-Mesenchymal Transition via PI3K/AKT Signaling in Renal Cell Carcinoma
2025-Jan-26, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13020304
PMID:40002717
|
研究论文 | 本研究探讨了磷脂酶C Beta 2在肾细胞癌（RCC）中通过PI3K/AKT信号通路调节上皮-间质转化（EMT）的作用 | 揭示了磷脂酶C Beta 2在RCC中的具体表达模式和分子机制，特别是其通过PI3K/AKT信号通路调节EMT的作用 | 研究中使用的细胞系和样本量可能限制了结果的普遍性 | 探索磷脂酶C Beta 2在RCC进展中的调控功能及其作为治疗靶点的潜力 | 肾细胞癌（RCC） | 生物信息学 | 肾癌 | scRNA-seq, 转录组测序, RT-PCR, 免疫荧光, 救援实验, Western blotting | NA | 基因表达数据, 细胞实验数据 | RCC样本和细胞系 |
| 4258 | 2025-03-01 |
Novel Insights into the Pathogenesis of Inflammatory Bowel Diseases
2025-Jan-26, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13020305
PMID:40002718
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综述 | 本文综述了炎症性肠病（IBD）发病机制的最新进展，探讨了关键机制及预防和个性化治疗的潜在途径 | 整合了多组学分析、单细胞转录组学和纵向队列研究的结果，聚焦于免疫调节、肠道微生物群动态及环境因素对疾病发生和进展的影响 | 尽管近期进展支持了新治疗策略的开发，但深入理解IBD发病机制的复杂动态仍具挑战性 | 旨在综合IBD发病机制的最新进展，探索预防和个性化治疗的潜在途径 | 炎症性肠病（IBD），包括克罗恩病和溃疡性结肠炎 | NA | 炎症性肠病 | 多组学分析、单细胞转录组学、纵向队列研究 | NA | NA | NA |
| 4259 | 2025-03-01 |
CellChat for systematic analysis of cell-cell communication from single-cell transcriptomics
2025-Jan, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01045-4
PMID:39289562
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CellChat的计算工具，用于从单细胞转录组数据中推断和分析细胞间通讯网络 | CellChat v2版本增加了额外的比较功能、扩展的配体-受体对数据库以及丰富的功能注释，并引入了交互式CellChat Explorer | 需要基本的R语言和单细胞数据分析知识，但不需专门的生物信息学培训 | 系统分析细胞间通讯网络，识别不同生物条件下细胞间通讯的变化 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组测序 | 简化质量作用模型 | 单细胞转录组数据 | NA |
| 4260 | 2025-03-01 |
Gestational diabetes induces autistic-like behaviors in offspring by disrupting the GABAergic system
2025, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2025.1538115
PMID:40012680
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研究论文 | 本研究探讨了妊娠糖尿病（GDM）如何通过影响GABA能系统诱导后代出现自闭症样行为 | 首次通过单细胞转录组学和代谢组学分析揭示了GDM对后代GABA能系统的影响，并发现GAD2启动子区域的DNA超甲基化导致GAD2表达减少 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 探讨妊娠糖尿病对后代神经发育的影响及其机制 | 妊娠糖尿病小鼠模型及其雄性后代 | 神经科学 | 自闭症 | 单细胞转录组学、代谢组学、c-Fos染色 | 小鼠模型 | 行为数据、基因表达数据、代谢数据 | 未明确说明样本数量，但使用了妊娠糖尿病小鼠模型及其雄性后代 |