单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 29328 篇文献，本页显示第 381 - 400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2025-07-02 |
Gene Regulatory Programs that Specify Age-Related Differences during Thymocyte Development
2024-Jun-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.14.599011
PMID:38948840
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研究论文 | 本研究构建了新生和成年小鼠T细胞发育程序的转录和表观遗传图谱，揭示了不同基因调控程序的个体发育及其与年龄相关表型和功能差异的联系 | 识别了一个从发育最早阶段就随年龄分化的基因模块，揭示了新生小鼠在早期胸腺细胞发育过程中具有更开放的染色质状态，并利用CRISPR扰动方法结合单细胞RNA测序发现了一个保守的转录调控因子 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类或其他物种中验证 | 探究T细胞发育过程中年龄相关差异的基因调控程序 | 新生和成年小鼠的T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序、CRISPR扰动 | NA | 转录组数据、表观遗传数据 | 新生和成年小鼠的T细胞样本 |
| 382 | 2025-07-02 |
Single-cell and spatiotemporal profile of ovulation in the mouse ovary
2024-Jun-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.20.594719
PMID:38826447
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，详细描绘了小鼠卵巢排卵过程中的时空细胞图谱 | 首次在单细胞分辨率下详细描绘了排卵过程的精确时间窗口，并鉴定了排卵依赖的细胞状态基因标记 | 研究仅针对小鼠模型，人类卵巢排卵过程可能存在差异 | 解析排卵过程中卵巢细胞类型的时空动态变化 | 小鼠卵巢细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 配对小鼠卵巢样本（具体数量未明确说明） |
| 383 | 2025-07-02 |
Integrating spatial and single-cell transcriptomics reveals tumor heterogeneity and intercellular networks in colorectal cancer
2024-05-10, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06598-6
PMID:38729966
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研究论文 | 通过整合空间转录组学和单细胞转录组学技术，揭示了结直肠癌肿瘤微环境中的肿瘤异质性和细胞间网络 | 结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，首次在结直肠癌中揭示了肿瘤异质性和细胞间相互作用的空间特征 | 研究样本量较小（仅3对肿瘤-正常-血液样本），且空间转录组数据分辨率有限 | 探究结直肠癌肿瘤微环境中的细胞异质性和细胞间相互作用 | 结直肠癌患者的肿瘤组织、正常组织和血液样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | scRNA-seq, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 3对结直肠癌患者的肿瘤-正常-血液样本（共41,700个细胞) |
| 384 | 2025-07-02 |
Modeling acute myocardial infarction and cardiac fibrosis using human induced pluripotent stem cell-derived multi-cellular heart organoids
2024-05-01, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06703-9
PMID:38693114
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研究论文 | 本研究利用人类诱导多能干细胞生成多细胞心脏类器官，模拟急性心肌梗死和心脏纤维化 | 使用多细胞心脏类器官（HOs）模拟成人心脏疾病，包括心肌梗死和心脏纤维化，克服了单细胞模型无法复现复杂心脏疾病的局限 | 类器官模型可能无法完全复现体内心脏的所有生理和病理特征 | 开发临床相关的心脏疾病体外模型，用于疾病研究和药物筛选 | 人类诱导多能干细胞（hiPSCs）生成的多细胞心脏类器官 | 干细胞与再生医学 | 心血管疾病 | 免疫组化、流式细胞术、q-PCR、单细胞RNA测序 | 心脏类器官模型 | 细胞和分子数据 | NA |
| 385 | 2025-07-02 |
A randomized, placebo-controlled trial of the BTK inhibitor zanubrutinib in hospitalized patients with COVID-19 respiratory distress: immune biomarker and clinical findings
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1369619
PMID:39906744
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研究论文 | 一项关于BTK抑制剂zanubrutinib在COVID-19呼吸窘迫住院患者中的随机、安慰剂对照试验，评估其免疫生物标志物和临床效果 | 评估新一代BTK抑制剂zanubrutinib在SARS-CoV-2感染患者中的效果，特别是对免疫反应和炎症信号的影响 | zanubrutinib在临床恢复方面未显示出优于安慰剂的效果，可能与大多数患者同时使用类固醇和抗病毒治疗有关 | 评估zanubrutinib在COVID-19呼吸窘迫患者中的免疫调节作用和临床效果 | SARS-CoV-2感染的住院患者，包括需要住院治疗但无需机械通气的患者（队列1）和机械通气≤24小时的患者（队列2） | 医学研究 | COVID-19 | 随机对照试验，单细胞转录组分析 | NA | 临床数据，生物标志物数据 | 队列1：63名患者（zanubrutinib组30名，安慰剂组33名）；队列2：4名患者 |
| 386 | 2025-07-02 |
SINGLE CELL DISSECTION OF DEVELOPMENTAL ORIGINS AND TRANSCRIPTIONAL HETEROGENEITY IN B-CELL ACUTE LYMPHOBLASTIC LEUKEMIA
2023-Dec-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.04.569954
PMID:38106088
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序技术分析了89个B细胞急性淋巴细胞白血病样本，揭示了肿瘤内异质性及白血病细胞起源 | 首次使用单细胞RNA测序技术解析B-ALL的发育起源和转录异质性，并与正常B细胞发育参考图谱进行比较 | 样本量相对有限(89例)，且部分亚型样本数量可能不足 | 改进B-ALL的临床和基因组分类，提高治疗结果预测准确性 | B细胞急性淋巴细胞白血病(B-ALL)样本 | digital pathology | B细胞急性淋巴细胞白血病 | scRNA-seq(单细胞RNA测序) | NA | 单细胞转录组数据 | 89个B-ALL样本 |
| 387 | 2025-07-02 |
MitoTracer facilitates the identification of informative mitochondrial mutations for precise lineage reconstruction
2023-Nov-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.22.568285
PMID:38045409
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研究论文 | 本文介绍了一种名为MitoTracer的开源计算算法，用于准确识别克隆信息性线粒体突变并从单细胞RNA-seq或ATAC-seq样本中推断进化谱系 | MitoTracer算法能够自动化识别信息性线粒体突变，并在多种单细胞测序平台上表现出优于现有方法的性能 | NA | 开发一种工具以捕获真实的线粒体突变信息并追踪细胞间的谱系关系 | 单细胞RNA-seq或ATAC-seq样本中的线粒体突变 | 生物信息学 | 癌症 | scRNA-seq, scATAC-seq | NA | 单细胞测序数据 | NA |
| 388 | 2025-07-02 |
Spatial proteo-transcriptomic profiling reveals the molecular landscape of borderline ovarian tumors and their invasive progression
2023-Nov-13, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2023.11.13.23298409
PMID:38014221
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research paper | 该研究通过空间蛋白质组学和空间转录组学的整合，揭示了卵巢交界性肿瘤（SBT）向低级别浆液性癌（LGSC）及其转移的分子演化过程 | 首次结合空间蛋白质组学和空间转录组学技术，系统解析了SBT向LGSC转化的分子机制，并识别了关键的分子标记物如NOVA2 | 研究样本可能有限，且未涉及其他类型的卵巢肿瘤 | 阐明卵巢交界性肿瘤向侵袭性癌转化的分子机制 | 卵巢交界性肿瘤（SBT）及其进展为低级别浆液性癌（LGSC）的样本 | digital pathology | ovarian cancer | spatial proteomics, spatial transcriptomics | NA | proteomic data, transcriptomic data | 未明确提及具体样本数量，但涉及SBT、SBT-MP、LGSC及其转移样本 |
| 389 | 2025-07-02 |
Single-Nucleus Transcriptome Profiling of Dorsolateral Prefrontal Cortex: Mechanistic Roles for Neuronal Gene Expression, Including the 17q21.31 Locus, in PTSD Stress Response
2023-10-01, The American journal of psychiatry
DOI:10.1176/appi.ajp.20220478
PMID:37491937
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研究论文 | 首次使用单核RNA测序技术研究创伤后应激障碍(PTSD)和重度抑郁症(MDD)患者背外侧前额叶皮层(DLPFC)的细胞类型特异性转录组病理学 | 首次在PTSD研究中应用单核RNA测序技术，揭示了细胞类型特异性的基因表达机制 | 样本量相对较小(11名PTSD患者、10名MDD患者和11名对照)，且仅研究了DLPFC区域 | 阐明PTSD和MDD在细胞类型特异性水平上的转录组病理学机制 | 人脑背外侧前额叶皮层(DLPFC)组织 | 神经科学 | 精神疾病 | 单核RNA测序(snRNA-seq), 诱导多能干细胞(iPSC)技术 | NA | RNA测序数据 | 47个DLPFC样本(约575K细胞核)，包括11名PTSD患者、10名MDD患者和11名对照 |
| 390 | 2025-07-01 |
PIK3R1 and G0S2 are human placenta-specific imprinted genes associated with germline-inherited maternal DNA methylation
2025-Dec, Epigenetics
IF:2.9Q2
DOI:10.1080/15592294.2025.2523191
PMID:40568952
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研究论文 | 本研究发现了两个人类胎盘特异性印记基因PIK3R1和G0S2，它们与种系遗传的母源DNA甲基化相关 | 发现了两个新的胎盘特异性印记基因，并揭示了它们与种系遗传的母源DNA甲基化的关联 | 未能发现这些基因在宫内生长受限或先兆子痫样本与对照组之间的差异 | 扩展胎盘特异性印记基因的列表并研究其特性 | 人类胎盘特异性印记基因PIK3R1和G0S2 | 基因组学 | NA | 全基因组筛查、单细胞RNA测序、甲基化分析 | NA | 甲基化数据、RNA-seq数据 | 多种体细胞组织、胎盘样本 |
| 391 | 2025-07-01 |
Development and Validation of a Flow-Dependent Endothelialized 3D Model of Intracranial Atherosclerotic Disease
2025-Aug, Translational stroke research
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s12975-024-01310-4
PMID:39537986
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研究论文 | 开发并验证了一种基于流动依赖的内皮化3D颅内动脉粥样硬化疾病模型 | 通过患者特异性神经影像数据创建可内皮化的中脑动脉模型，结合计算流体动力学和单细胞RNA测序技术，揭示了流动依赖的内皮基因表达和细胞亚群 | 模型依赖于特定患者的影像数据，可能无法完全覆盖所有ICAD病例的多样性 | 开发用于研究颅内动脉粥样硬化疾病(ICAD)的实验模型，以促进新疗法的开发 | 颅内动脉粥样硬化疾病(ICAD)和中脑动脉(MCA) | 数字病理学 | 心血管疾病 | CT血管造影, 计算流体动力学, 单细胞RNA测序, 共聚焦显微镜 | 3D生物模型 | 影像数据, 基因表达数据 | 使用SAMMPRIS临床试验的影像数据 |
| 392 | 2025-07-01 |
Role of stem-like cells in chemotherapy resistance and relapse in pediatric T-cell acute lymphoblastic leukemia
2025-Jun-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61222-1
PMID:40579412
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了儿童T细胞急性淋巴细胞白血病中干细胞样细胞在化疗抵抗和复发中的作用 | 首次在T-ALL中通过单细胞RNA测序发现具有干细胞特征的耐药细胞亚群，并证实其在诊断时比例虽小但在复发时显著扩增 | 样本量相对较小（13对匹配样本和5个非复发样本），且仅针对儿科患者 | 探究T-ALL复发和化疗抵抗的分子机制 | 儿童T细胞急性淋巴细胞白血病患者样本 | 肿瘤生物学 | T细胞急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 18个样本（13对匹配诊断/复发样本+5个非复发诊断样本） |
| 393 | 2025-07-01 |
Single-cell and spatial analyses of the GDF family in tumors, with a focus on the prognostic and biological role of GDF15 in hepatocellular carcinoma
2025-Jun-27, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-025-01431-9
PMID:40579699
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学分析GDF家族在肿瘤中的作用，特别关注GDF15在肝细胞癌中的预后和生物学作用 | 首次基于单细胞和空间转录组学对GDF亚家族进行系统性泛癌分析，并重点揭示了GDF15在肝细胞癌肿瘤微环境中的功能和免疫治疗适用性 | 研究主要基于转录组数据，缺乏蛋白质水平的验证，且功能实验仅限于肝细胞癌细胞系 | 探究GDF亚家族在多种癌症中的表达模式及其与预后的关系，特别关注GDF15在肝细胞癌中的作用机制 | 33种癌症类型（重点研究肝细胞癌）的转录组数据和肝细胞癌细胞系 | 肿瘤生物学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学、功能获得和功能缺失实验 | NA | 转录组数据、单细胞数据、空间转录组数据 | 33种癌症类型（具体样本量未明确说明） |
| 394 | 2025-07-01 |
ETMR stem-like state and chemo-resistance are supported by perivascular cells at single-cell resolution
2025-Jun-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-60442-9
PMID:40562749
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了胚胎性多层玫瑰花结肿瘤（ETMR）的肿瘤微环境异质性和细胞间通讯 | 揭示了PDGFRβ周细胞作为肿瘤微环境中的关键通讯伙伴，通过细胞外基质介导的相互作用支持肿瘤干细胞信号传导 | 研究主要基于体外模型和小鼠模型，人类样本的临床转化需要进一步验证 | 探究ETMR肿瘤的异质性及其与微环境的相互作用机制 | 人类和小鼠的原代ETMR肿瘤细胞、体外培养细胞及3D前脑类器官模型 | 肿瘤生物学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序、免疫组化、空间转录组学 | 3D类器官模型 | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 约25万个原代人类和小鼠ETMR细胞 |
| 395 | 2025-07-01 |
Integrating single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq, and Mendelian randomization to elucidate the role of HLA-DPA1 expression levels and non-classical monocytes in the pathogenesis of idiopathic pulmonary arterial hypertension
2025-Jun-20, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.145284
PMID:40545078
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序、全基因组关联研究、表达数量性状位点和单细胞eQTL数据，研究HLA-DPA1表达水平及非经典单核细胞在特发性肺动脉高压发病机制中的作用 | 首次整合多种组学数据揭示HLA-DPA1在非经典单核细胞中的表达与特发性肺动脉高压的因果关系 | 研究样本量未明确说明，且机制研究仍需进一步实验验证 | 阐明HLA-DPA1表达水平及非经典单核细胞在特发性肺动脉高压发病中的作用机制 | 特发性肺动脉高压患者的单核细胞亚群 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | scRNA-seq, GWAS, eQTL, sc-eQTL, bulk RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 未明确说明（包含IPAH患者和健康对照的PBMC及肺组织样本） |
| 396 | 2025-07-01 |
Reduction of NFX1-123 and HPV 16 E6 and E7 Decreased Telomerase and CENP-F in Cervical Cancer Cell Lines
2025-Jun-19, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17122044
PMID:40563693
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研究论文 | 研究NFX1-123与HPV 16 E6和E7在宫颈癌细胞系中对端粒酶和CENP-F的调控作用 | 首次探讨NFX1-123在HPV相关癌症中对端粒酶活性的调控作用 | 研究仅基于细胞系和TCGA数据库，未涉及体内实验 | 揭示NFX1-123与HPV 16致癌基因在RNA调控、细胞周期和致癌途径中的共同作用 | 宫颈癌细胞系CaSki和SiHa | 癌症研究 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | CaSki和SiHa细胞系及TCGA数据库中的原发性肿瘤样本 |
| 397 | 2025-07-01 |
Spatial Transcriptomics Reveals Regional and Temporal Dynamics of Gene Expression in the Mouse Brain Across Development and Aging
2025-Jun-18, Biology
DOI:10.3390/biology14060717
PMID:40563967
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析了小鼠大脑在三个关键时间点的基因表达动态，揭示了大脑发育和衰老过程中区域特异性的基因表达变化 | 首次直接比较了大脑发育和衰老过程中的分子变化，并提供了空间转录组学的参考数据 | 研究仅基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类 | 探究健康发育和衰老过程中大脑的转录组变化及其分子机制 | 小鼠大脑 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 三个时间点的小鼠大脑样本（P21、3个月、28个月） |
| 398 | 2025-07-01 |
Multi-omics analyses of the heterogenous immune microenvironment in triple-negative breast cancer implicate UQCRFS1 potentiates tumor progression
2025-Jun-16, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-025-00672-1
PMID:40524231
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研究论文 | 通过多组学分析三阴性乳腺癌（TNBC）异质性免疫微环境，发现UQCRFS1促进肿瘤进展 | 揭示了TNBC中免疫微环境的异质性，鉴定了IL32high Treg在肿瘤逃逸中的作用，并建立了基于五个关键基因的恶性细胞指数（MCI）模型 | 样本量较小（仅9名TNBC初治患者），需要更大规模的验证 | 探究TNBC肿瘤免疫微环境的异质性及其与肿瘤进展的关系 | 三阴性乳腺癌（TNBC）患者的肿瘤免疫微环境 | 肿瘤免疫学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组、蛋白质组学、qRT-PCR、Western blotting | LASSO-Cox回归模型 | 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据、蛋白质组数据 | 9名TNBC初治患者的单细胞RNA测序数据 |
| 399 | 2025-07-01 |
A multi-omics resource of B cell activation reveals genetic mechanisms for immune-mediated diseases
2025-Jun-14, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.05.22.25328104
PMID:40475139
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研究论文 | 本研究通过多组学方法分析了B细胞激活状态，揭示了免疫介导疾病的遗传机制 | 首次系统性地研究了B细胞在不同激活条件下的基因调控动态，并发现了与免疫介导疾病相关的遗传风险变异 | 样本量相对较小（26名健康女性捐赠者），且仅针对特定人群 | 阐明B细胞激活状态在免疫介导疾病中的作用机制 | B细胞及其在不同激活条件下的基因表达和染色质可及性 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq (CITE-seq), ATAC-seq | NA | 基因组数据, 转录组数据, 表观遗传数据 | 26名健康女性捐赠者的B细胞 |
| 400 | 2025-07-01 |
Single-cell RNA sequencing uncovers cellular geterogeneity of granulosa cells and provides a signature for follicular development in chicken
2025-Jun-11, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2025.105430
PMID:40516295
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示鸡颗粒细胞的异质性，并为卵泡发育提供特征标记 | 首次在鸡中应用单细胞RNA测序技术鉴定颗粒细胞类型，揭示其异质性，并构建了颗粒细胞在卵泡发育过程中的发育轨迹 | 研究仅针对鸡的颗粒细胞，未涉及其他禽类物种 | 探究鸡卵泡发育过程中颗粒细胞的功能分化和异质性 | 鸡的颗粒细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 两个发育阶段的颗粒细胞样本（HF-GC和PHF-GC阶段） |