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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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3841 | 2025-10-06 |
Regulatory network analysis of Dclk1 gene expression reveals a tuft cell-ILC2 axis that inhibits pancreatic tumor progression
2025-Jun-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115734
PMID:40408246
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示Dclk1基因在胰腺肿瘤中的双相调控机制及保护性簇细胞-ILC2轴 | 首次明确Dclk1+细胞在胰腺肿瘤中的异质性,发现ADM样细胞与簇样细胞的相反作用,并揭示SPIB转录因子和ILC2-CAF旁分泌环路的关键调控机制 | 研究基于小鼠模型,人类胰腺肿瘤中的适用性需进一步验证 | 解析Dclk1基因在胰腺肿瘤进展中的调控网络与细胞功能 | Dclk1报告基因小鼠模型中的胰腺细胞群体 | 单细胞生物学 | 胰腺肿瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3842 | 2025-10-06 |
Tumor suppressors in Sox2-mediated lung cancers promote distinct cell-intrinsic and immunologic remodeling
2025-Jun-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.171364
PMID:40327401
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研究论文 | 本研究探讨了Trp53和Pten肿瘤抑制因子在Sox2介导的非小细胞肺癌中的协同作用机制 | 首次在Sox2高表达背景下揭示Trp53和Pten缺失对肺癌亚型分化、粘蛋白组成和免疫微环境重塑的协同调控作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床样本验证有限 | 阐明肿瘤抑制因子在Sox2介导的肺癌进展中的分子机制 | 非小细胞肺癌小鼠模型和细胞系 | 癌症生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,组织学分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,组织学图像 | 多种基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3843 | 2025-10-06 |
Spatial Multiomics Toward Understanding Neurological Systems
2025-Jun, Journal of mass spectrometry : JMS
IF:1.9Q2
DOI:10.1002/jms.5143
PMID:40360168
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综述 | 本文探讨空间多组学技术在理解神经系统复杂相互作用中的应用与前景 | 提出整合代谢组学、转录组学和蛋白质组学的空间多组学方法,突破传统单组学研究的局限 | 样本制备优化、分子完整性维持和多组学数据整合仍存在挑战 | 通过空间多组学技术增强对神经系统细胞相互作用的理解 | 大脑中的动态生物过程和细胞间相互作用 | 空间多组学 | 阿尔茨海默病,自闭症谱系障碍 | 质谱成像,空间转录组学,空间蛋白质组学,多模态成像 | NA | 空间分子数据,成像数据 | NA | NA | 空间代谢组学,空间转录组学,空间蛋白质组学,多组学整合 | NA | NA |
3844 | 2025-10-06 |
Library-based single-cell analysis of CAR signaling reveals drivers of in vivo persistence
2025-May-21, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101260
PMID:40215972
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析CAR信号传导,揭示了驱动体内持久性的关键因素 | 首次系统性地将多样化的CAR信号输入与转录输出进行单细胞水平映射,识别出与体内持久性相关的独特强直信号特征 | 识别出的强直信号特征在实体瘤中无效,研究结果可能不适用于所有肿瘤类型 | 解码CAR信号传导设计原则,为优化下一代细胞内信号域架构提供指导 | 工程化表达嵌合抗原受体的T细胞 | 单细胞分析 | 液体肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3845 | 2025-10-06 |
Identification of maize genes that condition early systemic infection of sugarcane mosaic virus through single-cell transcriptomics
2025-May-12, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2025.101297
PMID:40045576
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研究论文 | 通过单细胞转录组技术研究甘蔗花叶病毒早期系统侵染玉米的基因调控机制 | 首次在单细胞分辨率下揭示甘蔗花叶病毒早期系统侵染过程中病毒积累与宿主基因表达的共变异模式 | 研究仅关注早期系统侵染阶段(症状显现前),未涉及后期感染过程 | 探究甘蔗花叶病毒早期系统侵染玉米的分子机制和宿主-病毒相互作用 | 甘蔗花叶病毒感染的玉米叶片细胞 | 植物病理学 | 病毒病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | SCMV感染的玉米叶片细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3846 | 2025-10-06 |
Genetics- and age-driven neuroimmune and disc changes underscore herniation susceptibility and pain-associated behaviors in SM/J mice
2025-Apr-25, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ado6847
PMID:40267183
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研究论文 | 本研究通过SM/J小鼠模型揭示了遗传背景和衰老对自发性椎间盘突出易感性及疼痛相关行为的神经免疫机制 | 首次在野生型环境中建立自发性椎间盘突出的小鼠模型,并系统揭示了神经免疫调节和细胞外基质改变在病理过程中的作用 | 研究仅限于SM/J小鼠品系,结果在其他遗传背景中的普适性需要进一步验证 | 探究遗传和年龄因素对椎间盘突出易感性及疼痛行为的神经免疫机制 | SM/J近交系小鼠的腰椎间盘、背根神经节、脊髓和外周血单核细胞 | 神经免疫学 | 椎间盘突出 | 单细胞RNA测序, 飞行时间细胞计数, 转录组分析 | NA | 基因表达数据, 细胞计数数据 | SM/J近交系小鼠群体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3847 | 2025-10-06 |
Accessing genetically defined cell types in the superior colliculus with transgenic mouse lines
2025-Apr-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112194
PMID:40212591
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研究论文 | 本研究利用转基因小鼠品系表征上丘中特定神经元类型,验证分子图谱与形态学分类之间的相关性 | 首次基于单细胞转录组图谱系统评估转基因小鼠品系在上丘特定神经元类型靶向中的适用性 | 仅评估了10个转基因小鼠品系,可能未覆盖所有上丘神经元类型 | 研究上丘神经元亚型的功能特性 | 转基因小鼠的上丘神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学,转基因技术 | NA | 基因表达数据,荧光成像数据 | 10个转基因小鼠品系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3848 | 2025-10-06 |
Altered baseline immunological state and impaired immune response to SARS-CoV-2 mRNA vaccination in lung transplant recipients
2025-Apr-15, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102050
PMID:40187358
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了肺移植受者基线免疫状态异常及其对SARS-CoV-2 mRNA疫苗免疫应答受损的机制 | 首次通过多组学整合分析揭示肺移植受者基线免疫状态与COVID-19重症相似的免疫特征,并直接关联到疫苗应答受损 | 样本量有限,未探讨不同免疫抑制方案对疫苗应答的影响 | 探究肺移植受者对SARS-CoV-2 mRNA疫苗免疫应答减弱的免疫学机制 | 肺移植受者与健康对照者 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序,多组学分析 | NA | 单细胞转录组数据,细胞因子数据,抗体数据 | 肺移植受者与健康对照者(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3849 | 2025-10-06 |
Comparative analysis of nuclei isolation methods for brain single-nucleus RNA sequencing
2025-Mar-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.25.645306
PMID:40196571
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研究论文 | 比较三种不同细胞核分离方法对脑组织单核RNA测序数据质量的影响 | 首次系统评估不同细胞核分离方法对snRNA-seq数据质量的影响,揭示方法依赖性差异 | 研究仅针对脑组织,未涵盖其他组织类型 | 评估不同细胞核分离方法对单核RNA测序数据质量的影响 | 脑组织细胞核 | 单细胞测序 | NA | 单核RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |
3850 | 2025-10-06 |
SUV39H1 maintains cancer stem cell chromatin state and properties in glioblastoma
2025-Mar-10, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.186344
PMID:40059829
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研究论文 | 本研究揭示了组蛋白甲基转移酶SUV39H1在胶质母细胞瘤干细胞维持中的关键作用及其作为治疗靶点的潜力 | 首次发现SUV39H1通过超级增强子介导的激活在胶质母细胞瘤干细胞中特异性高表达,并证明其通过调控染色质可及性维持肿瘤干细胞特性 | NA | 探究SUV39H1在胶质母细胞瘤干细胞维持中的作用机制及治疗潜力 | 胶质母细胞瘤干细胞 | 肿瘤生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,全细胞RNA测序,ATAC测序 | NA | 基因表达数据,染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,ATAC-seq | NA | NA |
3851 | 2025-10-06 |
Systematic evaluation of single-cell multimodal data integration for comprehensive human reference atlas
2025-Mar-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.06.637075
PMID:40093094
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研究论文 | 系统评估单细胞多模态数据整合方法在构建全面人类肾脏参考图谱中的应用 | 开发了可解释的机器学习工具scOMM,首次系统评估了单细胞多模态数据整合策略在复杂组织中的应用效果 | 研究主要聚焦于肾脏皮层组织,在其他组织类型中的适用性需要进一步验证 | 建立稳健的多模态参考图谱生成框架,推进单细胞分析技术发展 | 人类肾脏皮层组织中的细胞核/细胞 | 单细胞组学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 单核ATAC测序 | 机器学习 | 单细胞多模态数据 | 19名捐赠者的119,744个高质量细胞核/细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 单核ATAC-seq | NA | NA |
3852 | 2025-10-06 |
Microglial Responses to Alzheimer's Disease Pathology: Insights From "Omics" Studies
2025-Mar, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24666
PMID:39760224
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综述 | 本文综述了通过多种组学技术研究阿尔茨海默病小鼠模型中微胶质细胞反应的文献 | 整合多种组学技术(转录组学、表观基因组学、空间转录组学等)系统分析AD小鼠模型中微胶质细胞的异质性和分子模式变化 | 主要基于小鼠模型研究,人类组织研究数据有限,机制仍不明确 | 阐明微胶质细胞在阿尔茨海默病发病机制中的作用和分子机制 | 阿尔茨海默病小鼠模型中的微胶质细胞 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 转录组学、表观基因组学、空间转录组学、蛋白质组学、脂质组学、代谢组学 | NA | 组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量组织转录组学 | NA | NA |
3853 | 2025-10-06 |
An international perspective on the future of systemic sclerosis research
2025-Mar, Nature reviews. Rheumatology
DOI:10.1038/s41584-024-01217-2
PMID:39953141
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综述 | 本文从国际视角探讨系统性硬化症研究的未来发展方向 | 整合单细胞RNA测序、空间生物学、人工智能等前沿技术,提出全球合作研究框架 | 未提供具体研究数据,主要基于现有研究进展的展望性分析 | 推动系统性硬化症的机制理解和个性化治疗发展 | 系统性硬化症患者群体 | 自然语言处理 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序、新一代测序、空间生物学、转录组学、基因组学、蛋白质组学、代谢组学、微生物组分析、人工智能 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
3854 | 2025-10-06 |
Multiple Myeloma Insights from Single-Cell Analysis: Clonal Evolution, the Microenvironment, Therapy Evasion, and Clinical Implications
2025-Feb-14, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17040653
PMID:40002248
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综述 | 通过单细胞技术解析多发性骨髓瘤的克隆演化、肿瘤微环境相互作用及治疗耐药机制 | 系统整合单细胞多组学技术揭示多发性骨髓瘤细胞异质性、克隆演化轨迹及肿瘤微环境在治疗抵抗中的作用机制 | 单细胞技术临床应用面临成本高昂、数据复杂性、缺乏标准化分析流程及伦理问题等挑战 | 探讨多发性骨髓瘤的疾病进展机制并推动个体化治疗策略发展 | 多发性骨髓瘤的肿瘤细胞、肿瘤微环境及临床患者 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞转录组学、单细胞基因组学、单细胞多组学 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学 | NA | NA |
3855 | 2025-10-06 |
Suppressing recurrence in Sonic Hedgehog subgroup medulloblastoma using the OLIG2 inhibitor CT-179
2025-Feb-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54861-3
PMID:39904981
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研究论文 | 本研究探讨OLIG2抑制剂CT-179在SHH亚型髓母细胞瘤中抑制肿瘤复发的治疗潜力 | 首次发现脑渗透性口服OLIG2抑制剂CT-179可通过破坏OLIG2二聚化、磷酸化和DNA结合来靶向肿瘤干细胞 | 研究主要基于临床前模型,尚未进行人体临床试验 | 开发针对SHH亚型髓母细胞瘤OLIG2+肿瘤干细胞的特异性治疗方法 | SHH亚型髓母细胞瘤外植体类器官、PDX模型和GEM模型 | 癌症研究 | 髓母细胞瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 多种临床前模型(未明确具体样本数量) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3856 | 2025-10-06 |
BRD4 inhibition rewires cardiac macrophages toward a protective phenotype marked by low MHC class II expression
2025-Feb-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00438.2024
PMID:39716819
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研究论文 | 本研究揭示BRD4抑制剂通过调控心脏巨噬细胞表型转化,减少促炎单核细胞招募并促进修复性表型,从而改善心脏缺血再灌注损伤 | 首次阐明BRD4抑制剂通过细胞自主机制调控心脏巨噬细胞MHC-II表达和NF-κB信号通路,实现巨噬细胞表型重编程 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证 | 探究BET抑制剂改善心脏结构和功能的细胞机制 | 心脏巨噬细胞、单核细胞、心脏成纤维细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 基因敲除 | NA | 基因表达数据 | 小鼠心脏组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
3857 | 2025-10-06 |
Variants and vaccines impact nasal immunity over three waves of SARS-CoV-2
2025-Feb, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-02052-z
PMID:39833605
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析不同SARS-CoV-2变异株和疫苗接种状态对鼻黏膜免疫反应的影响 | 首次系统比较了原始毒株、Delta和Omicron变异株感染下鼻黏膜单细胞水平的免疫反应差异,并揭示了疫苗接种对鼻腔巨噬细胞的激活作用 | 样本量相对有限,未涵盖所有SARS-CoV-2变异株,且主要关注急性感染期 | 探究SARS-CoV-2不同变异株和疫苗接种状态如何影响人类鼻黏膜的细胞免疫反应 | 接种和未接种疫苗的成人Delta和Omicron SARS-CoV-2急性感染者的鼻咽拭子样本 | 单细胞基因组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确具体样本数量,包括接种和未接种疫苗的Delta、Omicron和原始毒株感染者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3858 | 2025-10-06 |
Robust Cluster Prediction Across Data Types Validates Association of Sex and Therapy Response in GBM
2025-Jan-28, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17030445
PMID:39941811
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研究论文 | 利用稳健集成机器学习构建跨数据类型的预测模型,验证胶质母细胞瘤中性别与治疗反应的关联 | 使用注释的“遗留数据”训练能够跨平台(包括RNA-seq和潜在scRNA-seq)进行多目标预测的稳健模型 | 预测特征集仅对女性患者有效,应用于男性患者产生意外结果 | 验证胶质母细胞瘤中性别特异性分型与治疗反应的关联 | 胶质母细胞瘤患者 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 基因微阵列,RNA-seq,scRNA-seq | 稳健集成机器学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 基因微阵列,RNA-seq,单细胞RNA-seq | NA | NA |
3859 | 2025-10-06 |
Low fucosylation defines the glycocalyx of progenitor cells and melanocytes in the human limbal stem cell niche
2025-01-14, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.11.008
PMID:39706176
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研究论文 | 本研究揭示了人角膜缘干细胞微环境中祖细胞和黑色素细胞糖萼的低岩藻糖基化特征 | 首次发现角膜缘祖细胞和黑色素细胞表面存在特异性低岩藻糖基化特征,并证明岩藻糖基化调控对干细胞增殖潜能的重要影响 | 研究主要基于体外实验,需要进一步验证在体内环境中的生理意义 | 探索成人干细胞糖萼的独特组成及其在干细胞自我更新和分化中的调控作用 | 人角膜缘上皮细胞、毛囊上皮和睑板腺导管基底细胞 | 细胞生物学 | 眼科疾病 | 荧光激活细胞分选,单细胞转录组学 | NA | 流式细胞数据,转录组数据 | 人角膜缘组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3860 | 2025-10-06 |
Robust single-nucleus RNA sequencing reveals depot-specific cell population dynamics in adipose tissue remodeling during obesity
2025-Jan-13, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.97981
PMID:39804687
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研究论文 | 开发了一种稳健的单核RNA测序技术,用于研究肥胖期间脂肪组织重塑中的细胞群体动态 | 提出了一种适用于多种组织类型的核分离技术,显著提高了snRNA-seq数据质量,并首次通过整合bulk核RNA-seq识别了按大小和功能分类的脂肪细胞亚群 | 研究主要基于小鼠模型,技术在不同组织类型中的普适性需要进一步验证 | 研究肥胖过程中脂肪组织重塑的细胞动力学机制 | 小鼠脂肪组织中的各种细胞类型,特别是脂肪细胞亚群 | 单细胞测序 | 肥胖 | 单核RNA测序(snRNA-seq), bulk核RNA-seq | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单核RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |