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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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3781 | 2025-10-06 |
A Self-Renewing Biomimetic Skeletal Muscle Construct Engineered using Induced Myogenic Progenitor Cells
2024-Jan, Advanced functional materials
IF:18.5Q1
DOI:10.1002/adfm.202300571
PMID:40677964
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研究论文 | 本研究开发了一种使用诱导肌源性祖细胞构建的具有自我更新能力的仿生骨骼肌结构 | 首次利用诱导肌源性祖细胞构建包含自更新干细胞和排列整齐肌管的仿生肌肉结构,能够模拟体内骨骼肌修复过程 | NA | 开发能够模拟骨骼肌再生和对齐的体外系统,用于基础研究和再生医学 | 诱导肌源性祖细胞和人类成肌细胞 | 组织工程 | 肌肉疾病 | 静电纺丝、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3782 | 2025-10-06 |
Apoptosis recognition receptors regulate skin tissue repair in mice
2023-Dec-21, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.86269
PMID:38127424
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了凋亡细胞识别受体在小鼠皮肤组织修复中的调控机制 | 发现Axl和Timd4两种胞葬受体通过不同机制调控组织修复,其中Axl信号对伤口修复必需但对胞葬作用非必需 | 研究主要基于小鼠模型,人类糖尿病足伤口数据有限 | 探究凋亡细胞识别和清除机制如何调控组织修复 | 小鼠皮肤伤口和人类糖尿病足伤口 | 单细胞生物学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3783 | 2025-10-06 |
Complement C1q essential for aeroallergen sensitization via CSF1R+ conventional dendritic cells type 2
2023-11, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2023.07.016
PMID:37562753
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研究论文 | 本研究揭示了补体C1q通过CSF1R+传统2型树突状细胞在气源性过敏原致敏中的关键作用 | 首次发现C1q特异性富集于肺CSF1R+cDC2s细胞,并证明C1q-LRP1轴在过敏原识别和哮喘发病中的核心机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 阐明CSF1R+cDC2s识别吸入过敏原的分子机制 | 小鼠肺树突状细胞和人类支气管肺泡灌洗样本 | 免疫学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序,基因敲除模型,过敏原激发试验 | NA | 基因表达数据,蛋白质检测数据 | 小鼠模型和人类BAL样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3784 | 2025-10-06 |
Bulk brain tissue cell-type deconvolution with bias correction for single-nuclei RNA sequencing data using DeTREM
2023-Sep-19, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-023-05476-w
PMID:37726653
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研究论文 | 提出了一种名为DeTREM的改进方法,用于校正单核RNA测序数据在脑组织细胞类型反卷积分析中的偏差 | 在MuSiC方法基础上引入偏差校正机制,专门针对单核RNA测序与bulk RNA测序之间的技术差异进行补偿 | 主要针对脑组织数据,在其他组织类型中的适用性需要进一步验证 | 提高使用单核RNA测序参考数据时脑组织细胞类型反卷积的准确性 | 人类脑组织bulk RNA测序数据 | 生物信息学 | 神经系统疾病 | 单核RNA测序, bulk RNA测序 | DeTREM(基于MuSiC的改进算法) | 基因表达数据 | 模拟和真实人类脑组织数据集 | NA | single-nuclei RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
3785 | 2025-10-06 |
CTLA-4 tail fusion enhances CAR-T antitumor immunity
2023-09, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01571-5
PMID:37500885
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研究论文 | 通过融合CTLA-4胞质尾区增强CAR-T细胞的抗肿瘤免疫活性 | 利用CTLA-4胞质尾区的内吞特性重新编程CAR功能,显著提升CAR-T细胞在体内的抗肿瘤效果 | 研究主要聚焦于白血病模型,尚未验证在其他肿瘤类型中的适用性 | 改善CAR-T细胞疗法在肿瘤治疗中的疗效和持久性 | 嵌合抗原受体T细胞(CAR-T) | 免疫工程 | 白血病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | CAR-T细胞工程模型 | 基因表达数据,蛋白质表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3786 | 2025-10-06 |
Disease-associated astrocytes and microglia markers are upregulated in mice fed high fat diet
2023-08-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-39890-0
PMID:37558676
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研究论文 | 本研究通过分析高脂饮食小鼠和阿尔茨海默症患者的基因表达数据,揭示了肥胖、糖尿病与阿尔茨海默症之间的新联系 | 首次发现C4b基因在高脂饮食和阿尔茨海默症中共同上调,并证明其在星形胶质细胞中特异性表达,可能作为肥胖或糖尿病患者早期阿尔茨海默症的潜在标志物 | 研究主要基于小鼠模型和已有数据库,需要进一步人类样本验证 | 探索高脂饮食与阿尔茨海默症发病机制之间的分子联系 | 高脂饮食小鼠和阿尔茨海默症患者的脑组织样本 | 生物信息学 | 阿尔茨海默症 | RNA-seq, scRNA-seq, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 未明确指定样本数量 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
3787 | 2025-10-06 |
An Atlas of the Developing Drosophila Visual System Glia and Subcellular mRNA Localization of Transcripts in Single Cells
2023-Aug-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.06.552169
PMID:37609218
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序构建了果蝇视觉系统胶质细胞发育图谱,并鉴定了亚细胞mRNA定位模式 | 首次在发育中的果蝇视觉系统中全面注释胶质细胞类型,并开发计算方法识别细胞体和细胞突触中特异性定位的mRNA | 研究仅限于果蝇视觉系统胶质细胞,未涉及其他神经系统区域 | 理解胶质细胞的发育轨迹和功能多样性 | 果蝇视觉系统胶质细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞mRNA测序(scRNAseq) | NA | 单细胞转录组数据 | 发育过程中从幼虫到成虫阶段的果蝇视觉系统胶质细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3788 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Identifies Subclusters with Inflammatory Fibroblast Responses in Localized Scleroderma
2023-Jun-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24129796
PMID:37372943
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析识别局限性硬皮病中具有炎症性成纤维细胞反应的亚群 | 首次在局限性硬皮病中鉴定出12个成纤维细胞亚群,发现独特的CXCL2/IRF1炎症亚群和具有CXCL9/10/11表达的肌成纤维细胞样亚群 | 样本量有限(14例患者),主要依赖皮肤组织分析 | 探究局限性硬皮病的成纤维细胞异质性和炎症反应机制 | 局限性硬皮病患者的皮肤组织 | 数字病理学 | 硬皮病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 14例局限性硬皮病患者(儿童和成人)和14例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3789 | 2025-10-06 |
CX3CR1+ Macrophage Facilitates the Resolution of Allergic Lung Inflammation via Interacting CCL26
2023-06-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202209-1670OC
PMID:36790376
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研究论文 | 本研究揭示了CX3CR1+巨噬细胞通过与CCL26相互作用促进过敏性肺部炎症消退的机制 | 首次发现CCL26-CXCR1通路在嗜酸性过敏性肺部炎症消退中的关键作用,并阐明其通过诱导C1q分泌促进嗜酸性粒细胞清除的分子机制 | 研究主要基于动物模型,人类样本验证相对有限 | 探究组织驻留巨噬细胞在嗜酸性肺部炎症消退过程中的细胞机制 | 人类和小鼠的肺泡巨噬细胞、嗜酸性粒细胞、气道上皮细胞 | 免疫学 | 过敏性肺部疾病 | 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术、生物物理和免疫学分析 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据、蛋白质表达数据 | 人类过敏原激发前后BAL样本、小鼠过敏性肺部炎症模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3790 | 2025-10-06 |
A single-cell gene expression atlas of human follicular aspirates: Identification of leukocyte subpopulations and their paracrine factors
2023-04, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202201746RR
PMID:36934419
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建人类卵泡抽吸物基因表达图谱,鉴定白细胞亚群及其旁分泌因子 | 首次在人类排卵期卵泡中系统鉴定10个白细胞亚群,并揭示其通过分泌因子调控颗粒细胞功能的机制 | 样本量较小(仅4名IVF患者),需要在更大群体中验证 | 研究人类排卵期卵泡中白细胞亚群及其与卵泡细胞的相互作用机制 | 人类卵泡抽吸物中的细胞群体 | 单细胞生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | RNA velocity分析 | 单细胞转录组数据 | 4名IVF患者的卵泡抽吸物 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3791 | 2025-10-06 |
Phospho-seq: Integrated, multi-modal profiling of intracellular protein dynamics in single cells
2023-Mar-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.27.534442
PMID:37034703
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研究论文 | 开发了一种名为Phospho-seq的集成方法,用于在单细胞水平同时分析磷酸化蛋白质、染色质可及性和基因表达 | 首次实现了在单细胞水平整合磷酸化蛋白质、染色质可及性和转录组的多模态分析,通过简化的抗体偶联方法创建大型定制抗体panel | NA | 开发能够同时分析细胞信号状态与其他分子模态的集成单细胞分析技术 | 细胞系、诱导多能干细胞和3个月大脑类器官 | 单细胞多组学 | 神经发育疾病 | 单细胞多组学分析 | 桥接整合 | 单细胞多模态数据 | 细胞系、iPSCs和脑类器官样本 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq, 蛋白质组分析 | NA | 整合scATAC-seq和scRNA-seq数据集的多模态分析平台 |
3792 | 2025-10-06 |
CPA-Perturb-seq: Multiplexed single-cell characterization of alternative polyadenylation regulators
2023-Feb-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.09.527751
PMID:36798324
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研究论文 | 开发了CPA-Perturb-seq方法,通过多重单细胞扰动筛选研究多聚腺苷酸化调控机制 | 首次将多重扰动筛选与3'单细胞RNA测序结合,开发了APARENT-Perturb深度学习模型解析调控代码 | 仅研究了42个已知CPA调控因子,可能遗漏其他重要调控因子 | 理解多聚腺苷酸化调控蛋白如何控制polyA位点选择 | 哺乳动物基因的多聚腺苷酸化调控机制 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序,深度学习 | 多任务深度神经网络 | 单细胞转录组数据 | 42个CPA调控因子的多重扰动筛选 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 3' scRNA-seq |
3793 | 2025-10-06 |
Losartan controls immune checkpoint blocker-induced edema and improves survival in glioblastoma mouse models
2023-02-07, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2219199120
PMID:36724255
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研究论文 | 本研究发现在胶质母细胞瘤中免疫检查点抑制剂会诱发脑水肿,而血管紧张素受体阻滞剂氯沙坦可预防此类水肿并改善生存率 | 首次揭示免疫检查点抑制剂引起脑水肿的机制,并发现氯沙坦可作为替代皮质类固醇的有效治疗药物 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化效果需进一步验证 | 探索免疫检查点抑制剂治疗胶质母细胞瘤失败的原因及解决方案 | 胶质母细胞瘤小鼠模型及部分患者 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,活体成像,CD8 T细胞阻断研究 | NA | 基因表达数据,影像数据 | 小鼠模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3794 | 2025-10-06 |
Neonatal hyperoxia induces activated pulmonary cellular states and sex-dependent transcriptomic changes in a model of experimental bronchopulmonary dysplasia
2023-02-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00252.2022
PMID:36537711
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探究高氧暴露对新生小鼠肺发育的影响及其性别依赖性分子机制 | 首次发现高氧诱导产生损伤相关短暂祖细胞(DATPs)和新型AT1细胞亚群,并揭示性别特异性肺再生反应差异 | 动物模型研究结果需在人类临床样本中进一步验证 | 探究高氧暴露在支气管肺发育不良中的性别依赖性分子和细胞编程机制 | 新生小鼠肺组织及人类新生儿肺细胞 | 单细胞组学 | 支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3795 | 2025-10-06 |
Aging compromises human islet beta cell function and identity by decreasing transcription factor activity and inducing ER stress
2022-Oct-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abo3932
PMID:36197983
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了衰老导致人类胰岛β细胞功能衰退和身份特征改变的分子机制 | 首次系统揭示衰老过程中β细胞转录因子网络重组、内质网应激激活与细胞功能衰退的关联机制 | 研究主要基于观察性数据,需要进一步实验验证因果关系 | 探究衰老对人类胰岛β细胞功能和分子特征的影响 | 非糖尿病供体的胰岛β细胞 | 单细胞生物学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序, 转录因子调控网络分析, 高分辨率共聚焦显微镜, 胰岛素分泌检测 | NA | 单细胞转录组数据, 显微镜图像, 生理功能数据 | 覆盖人类大部分生命周期的非糖尿病供体样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3796 | 2025-10-06 |
Temporal transcriptomic analysis using TrendCatcher identifies early and persistent neutrophil activation in severe COVID-19
2022-04-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.157255
PMID:35175937
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研究论文 | 开发了TrendCatcher R软件包用于识别和可视化时间序列转录组数据中的动态基因表达模式和生物过程 | 开发了新的开源工具TrendCatcher,能够识别动态差异表达基因的不同时间模式并可视化生物学通路的时间进程 | NA | 开发时间序列转录组数据分析工具并应用于COVID-19研究 | COVID-19患者外周血转录组数据 | 生物信息学 | COVID-19 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 平滑样条ANOVA模型, 断点搜索策略 | 转录组数据, 单细胞数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
3797 | 2025-10-06 |
Network inference with Granger causality ensembles on single-cell transcriptomics
2022-02-08, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110333
PMID:35139376
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研究论文 | 提出一种基于Granger因果关系集成学习的单细胞转录组基因调控网络推断算法SINGE | 使用基于核的Granger因果关系回归处理不规则伪时间序列,并通过集成回归分析聚合预测结果 | 对个别调控因子表现不佳,且对无信息量的伪时间序列敏感 | 从有序单细胞基因表达数据推断基因调控网络 | 小鼠胚胎干细胞分化过程中的基因表达数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | Granger因果关系回归,集成学习 | 单细胞基因表达数据 | 两个小鼠胚胎干细胞分化数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3798 | 2025-10-06 |
Multiomic analysis reveals decidual-specific transcriptional programing of MAIT cells
2021-12, American journal of reproductive immunology (New York, N.Y. : 1989)
DOI:10.1111/aji.13495
PMID:34411378
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了子宫蜕膜中MAIT细胞的独特转录编程特征 | 首次在单细胞分辨率下系统比较了子宫蜕膜与匹配外周血MAIT细胞的转录组差异,并证实了蜕膜APCs表达MR1分子 | 样本来源仅限于子宫蜕膜组织,未涉及其他妊娠相关组织;功能验证主要基于体外刺激实验 | 探究妊娠期子宫蜕膜中MAIT细胞的转录编程特征和功能特性 | 子宫蜕膜基底層和壁層的单核细胞及匹配的外周血单个核细胞 | 免疫学 | 妊娠相关疾病 | 多组学分析,流式细胞术,CITE-seq,单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据 | 子宫蜕膜组织和匹配的外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq,表位测序 | NA | CITE-seq结合单细胞RNA测序基因表达分析 |
3799 | 2025-10-06 |
Integration of spatial and single-cell transcriptomics localizes epithelial cell-immune cross-talk in kidney injury
2021-06-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.147703
PMID:34003797
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学和单细胞测序技术,揭示了肾脏损伤中上皮细胞与免疫细胞相互作用的时空分布特征 | 首次优化了空间转录组学与单核测序数据的协调分析,将30种主要细胞类型定位到人类肾切除标本中,并在两种小鼠AKI模型中发现了免疫细胞浸润的空间特异性机制 | 研究仅基于人类肾切除标本和两种小鼠AKI模型,需要进一步验证其在其他肾脏疾病中的普适性 | 探索急性肾损伤中细胞类型空间分布特征及免疫细胞浸润机制 | 人类肾切除标本、小鼠缺血/再灌注损伤模型、盲肠结扎穿刺模型 | 空间转录组学 | 急性肾损伤 | 空间转录组学, 单核RNA测序, 单细胞测序, CODEX免疫荧光 | NA | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据, 免疫荧光图像 | 人类肾切除标本1例,两种小鼠AKI模型 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 多重免疫荧光 | NA | NA |
3800 | 2025-10-06 |
CRABP2 promotes peritoneal metastasis in CRC through TGF-β/Smad-mediated EMT signaling and invadopodia formation
2025-Oct, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.111927
PMID:40505846
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研究论文 | 本研究探讨CRABP2通过TGF-β/Smad介导的上皮间质转化信号和侵袭伪足形成促进结直肠癌腹膜转移的机制 | 首次揭示CRABP2作为腹膜转移相关基因通过调控侵袭伪足形成和EMT信号通路促进结直肠癌转移的新机制 | CRABP2在腹膜转移中的具体调控网络仍需进一步验证 | 阐明CRABP2在结直肠癌腹膜转移中的作用机制 | 结直肠癌细胞和患者样本 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 体外实验, 体内实验 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |